4HXOA

Brd4 bromodomain 1 complex with 3-{[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)methyl]sulfanyl}[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine inhibitor
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 43
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxoA01
4UYHA 4J1PA 5EQ1A 5LVRA 2YEMA 5DKHA 3QZSA 4O78A 4UYEA 3U5NA 4J3IA 2G4AA 4UIUA 3UV4A 2MJVB 3P1DA 2D9EA 4QNSA 4LR6A 3MXFA 4NR6A 5DY7A 3NXBA 5A5RA 4N4IA 5CQ5A 4QSRA 4QSSA 3LQHA 5FB1A 5I7XA 4QSQA 5L8TA 4HBXA 4LZ2A 5CPEA 5I40A 4YADA 4IOQA 3ZYUA 5HFQA 3LQIA 1EQFA 4NUEA 4NR5A 4MEQA 4UYGA 3UVWA 2E3KA 3LJWA 4IOOA 5DYCA 3P1FA 5FBXA 4HBWA 3RCWA 4E96A 2RNYA 4YY6A 2YDWA 4HBVA 3U5KA 5G4RA 4ZW1A 3O36A 2DVVA 4O76A 2RFJA 2GRCA 5L99A 5EGUA 5A82A 4YBSA 4PY6A 2R10A 5H1TA 4UYDA 2L85A 4QUUA 5DW1A 5F1LA 3FKMX 3JVMA 2OSSA 2E7OA 2H60A 4OUFA 4YC9A 5L97A 4FLPA 4HXNA 4A9FA 4A9EA 5ENJA 3UVDA 4BW1A 5CFWA 5FG4A 2I8NA 2RS9B 5CUAA 4QSTA 5E7DA 4IR4A 5EVAA 4YYMA 5EV9A 4OGIA 4NUDA 4BHWA 2YEKA 4XUBA 4WHWA 4QYDA 3K2JA 5CY9A 4MR4A 5A5NA 4GPJA 5E9KA 5FG6A 4HBYA 5EPBA 5EP7A 4A9JA 5FE0A 4QEWA 5E0RA 5ENFA 5HRVA 4KV1A 5E9LA 4TTEA 4YYKA 4IR3A 5CUCA 3QZVA 4CUUA 4YYNA 4MEOA 5A5QA 4CUPA 3UVXA 4QZSA 4Q0OA 5IGNA 5ENGA 5D26A 4YBTA 5FFVA 3UW9A 5LKTA 5FE8A 1ZS5A 4J0RA 5CQ6A 5DKCA 3UVYA 5F1HA 4XUAA 5IBNA 5E9VA 1E6IA 4HXSA 5DKDA 4ALGA 2L84A 5F25A 5D3PA 3G0JA 4NR9A 4ZC9A 5D3SA 4HXRA 4QR4A 4TU4A 4QSXA 4BW3A 4N4GA 5CQ3A 3UV2A 4ALHA 4YYHA 5IGKA 2R0VA 5EPRA 5ETDA 5H85A 4F3IA 3LXJA 4RVRA 5H1UA 4QBMA 5CUBA 5FH7A 5KO4A 5DYAA 5I83A 5C89A 5EWHA 2WP1A 4TU6A 2R0YA 5H1VA 2D82A 5LKZA 1WUMA 5CS8A 5E9MA 4N4FA 4MR3A 5HRWA 4HXLA 3HMFA 5D3RA 5A5PA 5FE4A 3P5OA 5EWVA 3D7CA 5A5OA 4MR5A 5KTUA 2YYNA 5EWDA 5AMEA 4UIYA 5C4QA 5F2PA 4NQNA 5ENCA 5HQ7A 5HCLA 5HFRA 4LYIA 4O70A 4QYLA 1N72A 5F5ZA 2WP2A 5EU1A 5HEMA 5G4SA 4Q0NA 5TB6A 3O33A 5E9IA 5DFDA 4AKNA 4N3WA 3AADA 3MB4A 3DWYA 4MR6A 2RNXA 4WHUA 4QUTA 5CQ7A 3Q2EA 5CUGA 5II1A 5BT4A 5LUUA 4C66A 4YYJA 3JVKA 4TQNA 4A9LA 5AMFA 5F60A 4HXKA 5FE7A 5J0DA 3I3JA 4XY8A 4NYWA 5TCMA 5I88A 4NRBA 5I7YA 2L5EA 5HLSA 5DW2A 2DVSA 3IU6A 5A83A 4CUQA 4HXOA 5KTXA 5JI8A 4O74A 5LJ1A 4O7FA 5BT3A 4XYAA 5JWMA 4LC2A 5I1QA 5DYXA 4YYGA 2RI7A 5KU3A 4A9NA 4IORA 4Z93A 4O7BA 5BT5A 4YBMA 5LVQA 3HMHA 5L98A 1X0JA 2DATA 5A5SA 3ONIA 2DVQA 3U5JA 5L96A 3U5LA 5KTWA 3O35A 3SVGA 5HJCA 5HM0A 3HMEA 3GG3A 5DX4A 4NUCA 4QEUA 5F61A 4UYFA 5FE3A 4CFLA 5FG5A 4NR8A 4O72A 3S92A 5A7CA 5LJ2A 5DFCA 3JVJA 4LZRA 4NYXA 4LRGA 4WIVA 2OUOA 5C85A 4YABA 4NR4A 4O71A 5EISA 5E3GA 4YATA 4QC3A 4CLBA 4A9KA 5ENBA 4CURA 5FE5A 4KCXA 4PCIA 5D7XA 5IIDA 4HXPA 4TT6A 4OGJA 3U5OA 3Q2FA 4KV4A 3TLPA 4YYDA 4IR5A 4A9IA 4Z6HA 4A9MA 5FH6A 5HELA 1JM4B 5I86A 3MUKA 4LYWA 5LKXA 4CFKA 5F63A 4CUTA 5EM3A 4UIXA 4BW4A 4HXMA 4PS5A 4QC1A 5CQTA 5A81A 4O7AA 2F6JA 5DLXA 4QSWA 4O77A 5E73A 4O7CA 2R0SA 5A85A 4Z1SA 5CGPA 5EK9A 5D3TA 5FE9A 3LQJA 4TZ2A 5C8GA 4MENA 4NXJA 5IGLA 4J0SA 2LSPB 3UV5A 2YELA 4LDFA 5IG6A 5D0CA 2YW5A 2E7NA 3MB3A 5CTLA 5F3AA 5EWWA 5KHMA 2NXBA 4YYIA 5I80A 5CQ8A 4LZSA 4QB3A 3P1CA 5F62A 3P1EA 5FE1A 5FE6A 3S91A 5CRZA 3SVHA 5FFYA 5L8UA 2N9GA 4YH3A 3AQAA 4QSVA 1JSPB 4QY4A 5II2A 2I7KA 4TZ8A 4UIWA 5EWCA 5ENEA 5FDZA 5CUDA 5EI4A 2YQDA 4YK0A 4PKLA 5CQAA 4A9HA 4QR5A 4Y03A 5FFWA 2FSAA 4NS5A 4QR3A 4DONA 4TT2A 3O34A 4NRCA 4MEPA 5CU8A 3IU5A 5CRMA 5D3HA 5DFBA 5ETBA 3MQMA 5C7NA 3U5MA 5K29A 5DBMA 4YH4A 5EICA 5EA1A 5CUEA 2DWWA 4Z1QA 4ZQLA 5C87A 5D25A 5IGMA 3G0LA 5ACYA 5FE2A 4YAXA 4TYLA 5FH8A 4UITA 4NR7A 4CUSA 5LKUA 4O7EA 4BJXA 4N4HA 2RNWA 4IR6A 3QZTA 4NQMA 4UYFB 4X2IA 4Z6IA 5D3LA 3JVLA 1F68A 5AD2A 5EPSA 5D3NA 5ENHA 1WUGA 5FB0A 5I29A 4YY4A 5D3JA 5E9YA 4UIVA 5AD3A 4BW2A 4QEVA 5E74A 5CP5A 4O75A 2RO1A 5HENA 4CL9A 5D24A 5ENIA 2F6NA 5CZGA 3O37A 4PCEA 5HRXA 4TS8A 4C67A 5CQ4A 2OO1A 5F36A 5DLZA 5HQ5A 4TT4A 4QSUA 5E3DA 5DYUA 3MULA 4XY9A 4NYVA 4QSPA 4UIZA 5I89A 4NRAA 2DVRA 5COIA 3DAIA 2DKWA 4PTBA 3SVFA 5HQ6A 3U5PA 4LYSA 4A9OA 5LJ0A 2KTBB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UYHA 4J1PA 5EQ1A 5LVRA 2YEMA 5DKHA 3QZSA 4O78A 4UYEA 3U5NA 4J3IA 2G4AA 4UIUA 3UV4A 2MJVB 3P1DA 2D9EA 4QNSA 4LR6A 3MXFA 4NR6A 5DY7A 3NXBA 5A5RA 4N4IA 5CQ5A 4QSRA 4QSSA 3LQHA 5FB1A 5I7XA 4QSQA 5L8TA 4HBXA 4LZ2A 5CPEA 5I40A 4YADA 4IOQA 3ZYUA 5HFQA 3LQIA 1EQFA 4NUEA 4NR5A 4MEQA 4UYGA 3UVWA 2E3KA 3LJWA 4IOOA 5DYCA 3P1FA 5FBXA 4HBWA 3RCWA 4E96A 2RNYA 4YY6A 2YDWA 4HBVA 3U5KA 5G4RA 4ZW1A 3O36A 2DVVA 4O76A 2RFJA 2GRCA 5L99A 5EGUA 5A82A 4YBSA 4PY6A 2R10A 5H1TA 4UYDA 2L85A 4QUUA 5DW1A 5F1LA 3FKMX 3JVMA 2OSSA 3ERRA 2E7OA 2H60A 4OUFA 4YC9A 5L97A 4FLPA 4HXNA 4A9FA 4A9EA 5ENJA 3UVDA 4BW1A 5CFWA 5FG4A 2I8NA 2RS9B 5CUAA 4QSTA 5E7DA 4IR4A 5EVAA 4YYMA 5EV9A 4OGIA 4NUDA 4BHWA 2YEKA 4XUBA 4WHWA 4QYDA 3K2JA 5CY9A 4MR4A 5A5NA 4GPJA 5E9KA 5FG6A 4HBYA 5EPBA 5EP7A 4A9JA 5FE0A 4QEWA 5E0RA 5ENFA 5HRVA 4KV1A 5E9LA 4TTEA 4YYKA 4IR3A 5CUCA 3QZVA 4CUUA 4YYNA 4MEOA 5A5QA 4CUPA 3UVXA 4QZSA 4Q0OA 5IGNA 5ENGA 5D26A 4YBTA 5FFVA 3UW9A 5LKTA 5FE8A 4AI6A 1ZS5A 4J0RA 5CQ6A 5DKCA 3UVYA 5F1HA 3D1BA 4AKIA 4XUAA 5IBNA 5E9VA 1E6IA 4HXSA 5DKDA 4ALGA 2L84A 5F25A 5D3PA 3G0JA 4NR9A 4ZC9A 5D3SA 4HXRA 4QR4A 4TU4A 4QSXA 4BW3A 4N4GA 5CQ3A 3UV2A 4ALHA 4YYHA 5IGKA 2R0VA 5EPRA 5ETDA 5H85A 4F3IA 3LXJA 4RVRA 5H1UA 4QBMA 5CUBA 5FH7A 5KO4A 5DYAA 5I83A 5C89A 3VKGA 5EWHA 2WP1A 4TU6A 2R0YA 5H1VA 2D82A 5LKZA 1WUMA 5CS8A 5E9MA 4N4FA 4MR3A 5HRWA 4HXLA 3HMFA 5D3RA 5A5PA 5FE4A 3P5OA 5EWVA 3D7CA 5A5OA 4MR5A 5KTUA 2YYNA 5EWDA 5AMEA 4UIYA 5C4QA 5F2PA 4NQNA 5ENCA 5HQ7A 5HCLA 5HFRA 4LYIA 4O70A 4QYLA 1N72A 5F5ZA 2WP2A 5EU1A 4AKGA 5HEMA 5G4SA 4Q0NA 5TB6A 3O33A 5E9IA 5DFDA 4AKNA 4N3WA 3AADA 3MB4A 3DWYA 4MR6A 2RNXA 4WHUA 4QUTA 5CQ7A 3Q2EA 5CUGA 5II1A 5BT4A 5LUUA 4C66A 4YYJA 3JVKA 4TQNA 4A9LA 5AMFA 5F60A 4HXKA 5FE7A 5J0DA 3I3JA 4XY8A 4NYWA 5TCMA 5I88A 4NRBA 5I7YA 2L5EA 5HLSA 5DW2A 2DVSA 3IU6A 5A83A 4CUQA 4HXOA 1ZKRA 5JI8A 5KTXA 4O74A 5LJ1A 4O7FA 5BT3A 4XYAA 5JWMA 4LC2A 5I1QA 5DYXA 4YYGA 2RI7A 5KU3A 4A9NA 4IORA 4Z93A 4O7BA 5BT5A 4YBMA 5LVQA 3D1DA 3HMHA 5L98A 1X0JA 2DATA 5A5SA 3ONIA 2DVQA 3U5JA 5L96A 3U5LA 5KTWA 3O35A 3SVGA 5HJCA 5HM0A 3HMEA 3GG3A 5DX4A 4NUCA 4QEUA 5F61A 4UYFA 5FE3A 4CFLA 5FG5A 4NR8A 4O72A 3S92A 5A7CA 5LJ2A 5DFCA 3JVJA 4LZRA 4NYXA 4LRGA 4WIVA 2OUOA 5C85A 4YABA 4NR4A 4O71A 5EISA 5E3GA 4YATA 4QC3A 4CLBA 4A9KA 5ENBA 4CURA 5FE5A 4KCXA 4PCIA 5D7XA 5IIDA 4HXPA 4TT6A 4OGJA 3U5OA 3Q2FA 4KV4A 3TLPA 4YYDA 4IR5A 4A9IA 4Z6HA 4A9MA 5FH6A 5HELA 1JM4B 4AKHA 5I86A 3MUKA 4LYWA 5LKXA 4CFKA 5F63A 4CUTA 5EM3A 4UIXA 4BW4A 4HXMA 4PS5A 4QC1A 5CQTA 5A81A 4O7AA 2F6JA 5DLXA 4QSWA 4O77A 5E73A 4O7CA 2R0SA 5A85A 4Z1SA 5CGPA 5EK9A 5D3TA 5FE9A 3LQJA 4TZ2A 5C8GA 4MENA 4NXJA 5IGLA 4J0SA 2LSPB 3UV5A 2YELA 4LDFA 5IG6A 5D0CA 2YW5A 2E7NA 3MB3A 5CTLA 3VKHA 5F3AA 5EWWA 5KHMA 2NXBA 4YYIA 5I80A 5CQ8A 4LZSA 4QB3A 3P1CA 5F62A 3P1EA 5FE1A 5FE6A 3S91A 5CRZA 3SVHA 5FFYA 5L8UA 2N9GA 4YH3A 3AQAA 4QSVA 1JSPB 4QY4A 5II2A 2I7KA 4TZ8A 4UIWA 5EWCA 5ENEA 5FDZA 5CUDA 5EI4A 2YQDA 4YK0A 4PKLA 5CQAA 4A9HA 4QR5A 4Y03A 5FFWA 2FSAA 4NS5A 4QR3A 4DONA 4TT2A 3O34A 4NRCA 4MEPA 5CU8A 3IU5A 5CRMA 5D3HA 5DFBA 5ETBA 3MQMA 5C7NA 3U5MA 5K29A 5DBMA 4YH4A 5EICA 5EA1A 5CUEA 2DWWA 4Z1QA 4ZQLA 5C87A 5D25A 5IGMA 3G0LA 5ACYA 5FE2A 4YAXA 4TYLA 5FH8A 4UITA 4NR7A 4CUSA 5LKUA 4O7EA 4BJXA 4N4HA 2RNWA 4IR6A 3QZTA 4NQMA 4UYFB 4X2IA 4Z6IA 5D3LA 3JVLA 1F68A 5AD2A 5EPSA 5D3NA 5ENHA 2EJNA 1WUGA 5FB0A 5I29A 4YY4A 1PUOA 5D3JA 5E9YA 4UIVA 5AD3A 4BW2A 4QEVA 5E74A 5CP5A 4O75A 2RO1A 5HENA 4CL9A 5D24A 5ENIA 2F6NA 5CZGA 3O37A 4PCEA 5HRXA 4TS8A 4C67A 5CQ4A 2OO1A 5F36A 5DLZA 5HQ5A 4TT4A 4QSUA 5E3DA 5DYUA 3MULA 4XY9A 4NYVA 4QSPA 4UIZA 5I89A 4NRAA 2DVRA 5COIA 3DAIA 2DKWA 4PTBA 3SVFA 5HQ6A 3U5PA 4LYSA 4A9OA 5LJ0A 2KTBB
chains in the Genus database with same CATH topology
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