4HXOA

Brd4 bromodomain 1 complex with 3-{[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)methyl]sulfanyl}[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine inhibitor
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
b'MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment-Based Drug Discovery of 2-Thiazolidinones as Inhibitors of the Histone Reader BRD4 Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Protein binding/inhibitor
total genus 43
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4hxoA01
5HQ6A 4UIZA 3UVDA 5CUGA 4LZ2A 4QYLA 5FFWA 5LVQA 3Q2FA 5E9MA 4HXNA 5E74A 4ZQLA 5FFYA 5K29A 4LYSA 5D3SA 3LQHA 4XY8A 4QUTA 5KTUA 5LJ1A 5F3AA 4NXJA 5A5PA 5CUCA 3O36A 5C87A 4NRCA 2E7NA 5FE8A 5A83A 1JM4B 5H1VA 5I86A 4O72A 4QSSA 4OGJA 4NR9A 5D3RA 5L8TA 4NYWA 5LKXA 4A9LA 3LJWA 5CUAA 3QZSA 5E9IA 5DW1A 3ZYUA 4NR5A 4MR3A 4BW1A 4A9OA 4MENA 2RNWA 5ENFA 2FSAA 5CQAA 5FFVA 3D7CA 5COIA 2R0SA 5D26A 5EVAA 4UIWA 5FE1A 3QZTA 4QC1A 4J0SA 4NS5A 5EI4A 2H60A 3TLPA 5A5RA 4A9MA 5CQ6A 4CURA 5E9LA 4QR5A 5I1QA 4O76A 4UITA 5CQ3A 4O77A 5F36A 4UIUA 5F2PA 4CL9A 4N4GA 4LR6A 5AD3A 4QB3A 5CUBA 2G4AA 5IGNA 5KTWA 3K2JA 4DONA 5CRZA 3U5JA 4QEUA 2RO1A 4QC3A 5CFWA 4CLBA 4CUQA 2E7OA 5HLSA 4HBXA 3MB3A 4UYFA 5L98A 5A5QA 5DYCA 4N4HA 4LDFA 5AD2A 3DWYA 5I29A 3SVGA 5EWCA 5CGPA 3HMFA 5EV9A 5EU1A 2DVVA 5CS8A 4AKNA 5DYXA 3S92A 4Q0OA 5F62A 4HXPA 4YABA 1JSPB 3O37A 1WUMA 5CQ7A 5E3DA 4BHWA 5LKUA 2YYNA 5D7XA 5DYUA 2DVSA 5A81A 4O75A 4O7BA 5HQ5A 5ETDA 3IU6A 5H1TA 2DVRA 3UVYA 5HRXA 4KV4A 4Z6HA 3LXJA 5DFDA 5II1A 5G4RA 4YYDA 4IR6A 5C7NA 3G0JA 5HEMA 4WIVA 3O34A 4J3IA 3HMEA 3AQAA 4QEVA 4LYIA 5EM3A 4YBMA 5JI8A 4A9NA 5A5NA 2YDWA 1F68A 4UYHA 5HELA 5DLXA 3O33A 4UYEA 3JVMA 4TZ2A 4CUTA 5L96A 5DFCA 2DWWA 3NXBA 5CQ8A 5FE7A 2YELA 3AADA 5F60A 5CQ5A 4MR5A 5E3GA 3U5KA 5HCLA 5I89A 4YYKA 2F6NA 2D82A 4TTEA 4TT2A 5DX4A 4OGIA 4UYGA 4QSXA 5FE9A 5EWHA 4HXKA 4NYVA 5L99A 3GG3A 5HFRA 4HXOA 2YQDA 1WUGA 5CP5A 5D3JA 5TCMA 4BW4A 4IOOA 5CU8A 2OO1A 4YYIA 5AMFA 4YBSA 4O7CA 2N9GA 4PKLA 5ENIA 4NR6A 4MEOA 3P1DA 4QSQA 4LYWA 4UIVA 4YK0A 4TZ8A 2RNYA 2RI7A 5FE4A 5DKDA 3P5OA 5I7XA 5CY9A 5CRMA 2YW5A 5ENJA 4ALHA 5A7CA 5DW2A 5ENBA 5ENEA 5ACYA 5LKZA 5D0CA 4MR4A 3MULA 5D24A 5DBMA 5EPBA 3U5OA 4GPJA 4OUFA 5G4SA 5EQ1A 2DVQA 4J0RA 2KTBB 4QUUA 5FB1A 4QR4A 4C67A 5A85A 5EICA 4QNSA 1EQFA 3S91A 2RS9B 5FB0A 3UVWA 4NR4A 5D3NA 5KHMA 5BT4A 2L85A 5HRVA 4QSPA 4TT4A 5FE3A 5ENHA 4A9EA 3FKMX 4KCXA 4LC2A 4TS8A 5HQ7A 4Z6IA 5KO4A 3UV2A 4QZSA 5BT3A 4ZW1A 4XY9A 2D9EA 2R0YA 3O35A 2YEMA 4O7FA 4YH3A 5TB6A 3U5PA 3U5MA 4ALGA 3UVXA 4Z1SA 5E73A 1N72A 4YY6A 5LVRA 4BJXA 5DFBA 5FE6A 4TU4A 4KV1A 4BW3A 5L8UA 4BW2A 4CUUA 4N4IA 4WHUA 5EGUA 3ONIA 5I80A 4QYDA 4HXSA 5FDZA 3G0LA 1ZS5A 4A9KA 5DKHA 1X0JA 4HXLA 5IGKA 5LKTA 2DKWA 4YYGA 2L84A 4NUDA 4QEWA 5F25A 3HMHA 5DYAA 4NQNA 4A9IA 5EWWA 5CUEA 4NUEA 3UW9A 4A9FA 4TT6A 5A82A 5F1HA 4YYNA 4YYMA 4CUPA 5H85A 4YAXA 5FE5A 4XUAA 4QSVA 5D25A 4QY4A 2OUOA 5A5OA 3QZVA 5CUDA 5E9YA 2RFJA 5D3TA 4IR4A 4LZRA 4Z93A 4HXMA 5FG6A 4HBWA 3JVKA 4A9JA 4CUSA 2GRCA 5HJCA 4QBMA 3Q2EA 2YEKA 2MJVB 4XUBA 2I7KA 4QSTA 5FG5A 4E96A 5A5SA 5LJ2A 3P1EA 3U5NA 4O7EA 4NYXA 5FBXA 4YADA 4YYHA 3LQJA 3LQIA 3RCWA 4NQMA 5FH8A 4TU6A 5FG4A 5IBNA 2R0VA 4O78A 1E6IA 4C66A 5I88A 4ZC9A 3I3JA 5EP7A 4TQNA 4NR8A 4NUCA 5I83A 5EA1A 4QR3A 5C8GA 5DLZA 5F61A 3UV4A 4NR7A 4UYFB 5IGLA 5KTXA 5I40A 2NXBA 3P1CA 5EWDA 4RVRA 5CPEA 5C4QA 4YC9A 5IG6A 4PTBA 5HENA 4YY4A 2LSPB 2WP1A 4MEQA 5FE2A 3MXFA 5L97A 4PCIA 5IGMA 4YBTA 3DAIA 4CFKA 4LZSA 4MEPA 5H1UA 4UIXA 3P1FA 4N4FA 5FE0A 5D3HA 3MB4A 5CQTA 5IIDA 4UIYA 5EK9A 5HFQA 5E0RA 4Z1QA 3MQMA 5ETBA 4PCEA 3SVHA 4J1PA 4IOQA 5DY7A 4NRBA 2OSSA 5EISA 3U5LA 4HBYA 4F3IA 5F63A 4QSUA 3MUKA 4YYJA 4O71A 5CTLA 4UYDA 5HRWA 4PS5A 4MR6A 4QSWA 5ENGA 2E3KA 4Q0NA 3JVJA 4O7AA 4X2IA 5BT5A 4NRAA 5I7YA 5C89A 3SVFA 2WP2A 2DATA 5F1LA 4FLPA 5D3LA 4WHWA 5LUUA 5DKCA 5E7DA 5E9VA 2F6JA 5E9KA 4IORA 4O74A 4TYLA 4IR3A 4A9HA 5HM0A 5LJ0A 5II2A 3UV5A 3JVLA 5D3PA 4HBVA 4QSRA 5EWVA 4N3WA 5CQ4A 5C85A 5J0DA 4YATA 5F5ZA 5EPSA 2I8NA 5AMEA 2RNXA 4YH4A 4LRGA 4PY6A 5CZGA 5EPRA 5FH7A 3IU5A 5JWMA 5KU3A 5FH6A 4IR5A 4O70A 2R10A 4XYAA 4HXRA 4CFLA 5ENCA 2L5EA 4Y03A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HQ6A 4UIZA 3UVDA 5CUGA 4LZ2A 4QYLA 5FFWA 5LVQA 3Q2FA 5E9MA 4HXNA 5E74A 4ZQLA 5FFYA 5K29A 4LYSA 5D3SA 3LQHA 4XY8A 4QUTA 5KTUA 5LJ1A 5F3AA 4NXJA 5A5PA 5CUCA 3O36A 5C87A 4NRCA 2E7NA 5FE8A 5A83A 1JM4B 5H1VA 5I86A 4O72A 4QSSA 4OGJA 4NR9A 5D3RA 5L8TA 4NYWA 5LKXA 4A9LA 3LJWA 5CUAA 3QZSA 5E9IA 5DW1A 3ZYUA 4NR5A 4MR3A 4BW1A 4A9OA 4MENA 2RNWA 5ENFA 2FSAA 5CQAA 5FFVA 3D7CA 5COIA 2R0SA 5D26A 5EVAA 4UIWA 5FE1A 3QZTA 4QC1A 4J0SA 4NS5A 5EI4A 2H60A 3TLPA 5A5RA 4A9MA 5CQ6A 4CURA 5E9LA 4QR5A 5I1QA 4O76A 4UITA 5CQ3A 4O77A 5F36A 4UIUA 5F2PA 4CL9A 4N4GA 4LR6A 5AD3A 4QB3A 5CUBA 2G4AA 5IGNA 5KTWA 3K2JA 4DONA 5CRZA 3U5JA 4QEUA 2RO1A 4QC3A 5CFWA 4CLBA 4CUQA 2E7OA 5HLSA 4HBXA 3MB3A 4UYFA 5L98A 5A5QA 5DYCA 4N4HA 4LDFA 5AD2A 3DWYA 5I29A 3SVGA 5EWCA 5CGPA 3HMFA 5EV9A 5EU1A 2DVVA 5CS8A 4AKNA 5DYXA 3S92A 4Q0OA 5F62A 4HXPA 4YABA 1JSPB 3O37A 1WUMA 5CQ7A 5E3DA 4BHWA 5LKUA 2YYNA 5D7XA 5DYUA 2DVSA 5A81A 4O75A 4O7BA 5HQ5A 5ETDA 3IU6A 5H1TA 2DVRA 3UVYA 5HRXA 4KV4A 4Z6HA 3LXJA 5DFDA 5II1A 5G4RA 4YYDA 4IR6A 1ZKRA 5C7NA 3G0JA 5HEMA 4WIVA 3O34A 4AKGA 4J3IA 3HMEA 3AQAA 4QEVA 4LYIA 5EM3A 4YBMA 5JI8A 4A9NA 5A5NA 2YDWA 1F68A 4UYHA 5HELA 5DLXA 3O33A 4UYEA 3JVMA 4TZ2A 4CUTA 5L96A 5DFCA 2DWWA 3NXBA 5CQ8A 5FE7A 2YELA 3AADA 5F60A 5CQ5A 4MR5A 5E3GA 3U5KA 5HCLA 5I89A 4YYKA 2F6NA 2D82A 4TTEA 4TT2A 5DX4A 4OGIA 4UYGA 4QSXA 5FE9A 5EWHA 4HXKA 4NYVA 5L99A 3GG3A 5HFRA 4HXOA 2YQDA 1WUGA 5CP5A 5D3JA 5TCMA 4BW4A 4IOOA 5CU8A 2OO1A 4YYIA 5AMFA 4YBSA 4O7CA 2N9GA 4PKLA 5ENIA 4NR6A 4MEOA 3P1DA 4QSQA 4LYWA 4UIVA 4YK0A 4TZ8A 2RNYA 2RI7A 5FE4A 5DKDA 3P5OA 5I7XA 5CY9A 4AKIA 5CRMA 2YW5A 5ENJA 4ALHA 5A7CA 5DW2A 5ENBA 5ENEA 5ACYA 5LKZA 5D0CA 4MR4A 3MULA 5D24A 5DBMA 5EPBA 3U5OA 4GPJA 4OUFA 5G4SA 5EQ1A 2DVQA 4J0RA 2KTBB 4QUUA 5FB1A 4QR4A 4C67A 5A85A 5EICA 4QNSA 1EQFA 3S91A 2RS9B 5FB0A 3UVWA 4NR4A 5D3NA 5KHMA 5BT4A 2L85A 5HRVA 4QSPA 4TT4A 5FE3A 5ENHA 4A9EA 3FKMX 4KCXA 4LC2A 4TS8A 5HQ7A 4Z6IA 5KO4A 3UV2A 4QZSA 5BT3A 4ZW1A 4XY9A 2D9EA 2R0YA 3O35A 2YEMA 4O7FA 4YH3A 5TB6A 3U5PA 3U5MA 4ALGA 3UVXA 4Z1SA 5E73A 1N72A 4YY6A 5LVRA 4BJXA 5DFBA 5FE6A 4TU4A 4KV1A 4BW3A 5L8UA 4BW2A 4CUUA 4N4IA 4WHUA 5EGUA 3ONIA 5I80A 4QYDA 4HXSA 4AKHA 5FDZA 3G0LA 1ZS5A 4A9KA 5DKHA 1X0JA 4HXLA 5IGKA 5LKTA 2DKWA 4YYGA 2L84A 4NUDA 4QEWA 5F25A 3HMHA 5DYAA 4NQNA 4A9IA 5EWWA 5CUEA 4NUEA 3UW9A 4A9FA 4TT6A 5A82A 3ERRA 5F1HA 4YYNA 4YYMA 4CUPA 5H85A 4YAXA 5FE5A 4XUAA 4QSVA 5D25A 4QY4A 2OUOA 5A5OA 3QZVA 5CUDA 5E9YA 2RFJA 5D3TA 4IR4A 4LZRA 4Z93A 4HXMA 5FG6A 4HBWA 3JVKA 4A9JA 4CUSA 2GRCA 5HJCA 4QBMA 3Q2EA 2YEKA 2MJVB 4XUBA 2I7KA 4QSTA 5FG5A 4E96A 5A5SA 5LJ2A 3P1EA 3U5NA 4O7EA 4NYXA 5FBXA 4YADA 4YYHA 3LQJA 3LQIA 3RCWA 4NQMA 5FH8A 4TU6A 5FG4A 5IBNA 3VKHA 2R0VA 4O78A 1E6IA 4C66A 5I88A 4ZC9A 3I3JA 5EP7A 4TQNA 4NR8A 4NUCA 5I83A 5EA1A 4QR3A 5C8GA 5DLZA 5F61A 3UV4A 4NR7A 4UYFB 5IGLA 5KTXA 5I40A 2NXBA 3P1CA 5EWDA 4RVRA 5CPEA 5C4QA 4YC9A 5IG6A 4PTBA 5HENA 4YY4A 2LSPB 2WP1A 4MEQA 5FE2A 3MXFA 5L97A 4PCIA 5IGMA 4YBTA 3DAIA 4CFKA 4LZSA 4MEPA 5H1UA 4UIXA 3P1FA 4N4FA 5FE0A 5D3HA 3MB4A 5CQTA 5IIDA 4UIYA 1PUOA 3D1BA 5EK9A 5HFQA 5E0RA 4Z1QA 3MQMA 5ETBA 4PCEA 3SVHA 4J1PA 4IOQA 5DY7A 4NRBA 2OSSA 5EISA 3U5LA 4HBYA 4F3IA 5F63A 4QSUA 3MUKA 4YYJA 4O71A 5CTLA 4UYDA 5HRWA 4PS5A 4MR6A 4QSWA 3D1DA 5ENGA 2E3KA 4Q0NA 3JVJA 4O7AA 4X2IA 5BT5A 4NRAA 5I7YA 5C89A 3SVFA 2WP2A 2DATA 5F1LA 4FLPA 5D3LA 4WHWA 5LUUA 5DKCA 5E7DA 5E9VA 2F6JA 5E9KA 4IORA 4O74A 4TYLA 4IR3A 4A9HA 5HM0A 5LJ0A 5II2A 3UV5A 3JVLA 5D3PA 4HBVA 4QSRA 5EWVA 4N3WA 5CQ4A 2EJNA 5C85A 5J0DA 4YATA 5F5ZA 5EPSA 2I8NA 5AMEA 2RNXA 4AI6A 4YH4A 4LRGA 4PY6A 5CZGA 5EPRA 5FH7A 3VKGA 3IU5A 5JWMA 5KU3A 5FH6A 4IR5A 4O70A 2R10A 4XYAA 4HXRA 4CFLA 5ENCA 2L5EA 4Y03A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HQ6 A;  4UIZ A;  3UVD A;  5CUG A;  4LZ2 A;  4QYL A;  5FFW A;  5LVQ A;  3Q2F A;  5E9M A;  4HXN A;  5E74 A;  4ZQL A;  5FFY A;  5K29 A;  4LYS A;  5D3S A;  3LQH A;  4XY8 A;  4QUT A;  5KTU A;  5LJ1 A;  5F3A A;  4NXJ A;  5A5P A;  5CUC A;  3O36 A;  5C87 A;  4NRC A;  2E7N A;  5FE8 A;  5A83 A;  1JM4 B;  5H1V A;  5I86 A;  4O72 A;  4QSS A;  4OGJ A;  4NR9 A;  5D3R A;  5L8T A;  4NYW A;  5LKX A;  4A9L A;  3LJW A;  5CUA A;  3QZS A;  5E9I A;  5DW1 A;  3ZYU A;  4NR5 A;  4MR3 A;  4BW1 A;  4A9O A;  4MEN A;  2RNW A;  5ENF A;  2FSA A;  5CQA A;  5FFV A;  3D7C A;  5COI A;  2R0S A;  5D26 A;  5EVA A;  4UIW A;  5FE1 A;  3QZT A;  4QC1 A;  4J0S A;  4NS5 A;  5EI4 A;  2H60 A;  3TLP A;  5A5R A;  4A9M A;  5CQ6 A;  4CUR A;  5E9L A;  4QR5 A;  5I1Q A;  4O76 A;  4UIT A;  5CQ3 A;  4O77 A;  5F36 A;  4UIU A;  5F2P A;  4CL9 A;  4N4G A;  4LR6 A;  5AD3 A;  4QB3 A;  5CUB A;  2G4A A;  5IGN A;  5KTW A;  3K2J A;  4DON A;  5CRZ A;  3U5J A;  4QEU A;  2RO1 A;  4QC3 A;  5CFW A;  4CLB A;  4CUQ A;  2E7O A;  5HLS A;  4HBX A;  3MB3 A;  4UYF A; 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