4N4HA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha in complex with histone h3.1k36me3
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
188
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKERAIDLVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGAASAQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
total genus 66
structure length 188
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4hA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4hA02
4QEWA 5EWVA 5HCLA 5L8UA 4QC1A 5DFBA 3U5NA 4IUUA 4PTBA 2NXBA 2DKWA 2XDPA 5D3TA 3MXFA 2RHIA 4LD6A 4WHUA 3U5JA 4HBYA 4YYDA 5CFWA 2K3YA 3JVJA 5CUCA 4XY8A 3OYNA 5CUDA 2LCCA 2RO0A 5HQ6A 4UC4A 3IU6A 3U5MA 4PLIA 2OUOA 3LXJA 4YBTA 4ZQLA 5BT3A 3ASKA 3OYDA 4YYGA 5EV9A 5KTXA 1SSFA 5FRMA 5CUGA 5D6WA 4BE1A 5ENHA 4Z6HA 5E3DA 1N72A 3QIIA 5H1TA 2E7NA 3GOXA 5E0RA 3FKMX 2EQMA 5HLSA 4LYSA 4LZRA 5HJCA 4E7KA 3KUFA 4DONA 2IG0A 5LKUA 4QEUA 4PLLA 3PFSA 3HMFA 5EPSA 2DVVA 4N3WA 1OZ2A 5M9OA 4ZTFA 4TT2A 2R5MA 5FE9A 4OUFA 4MR4A 4OGJA 5DKDA 4ZC9A 5ENCA 4O7BA 5CP5A 3MP8A 3LX7A 5CQ6A 4BDZA 4C5GA 4PCIA 5F62A 5IBNA 4YYNA 5CRMA 2DIQA 4NR7A 4YYJA 1WJRA 4IUPA 5LKZA 3OYJA 3NTHA 3DLMA 4NRAA 3OS0A 4QSRA 4O70A 4C67A 4QSTA 4A9LA 2X35A 5EWHA 2JZ2A 3LLRA 4Q5WA 2KTBB 4C5EA 5EPRA 1E6IA 5FFVA 4B9WA 5CTLA 3SVHA 3HMHA 3O37A 5E7DA 5F60A 3OQ5A 5II2A 5EM3A 4YBSA 4QYDA 5C85A 2K3XA 3MEAA 4Z1SA 4QR4A 4NR4A 5FE7A 5KE2A 5BT4A 5D3RA 3M9QA 5EU1A 4A9JA 3O34A 4NRBA 5FRNA 2R0YA 3P1DA 5F3AA 3MP1A 3LGFA 3E9GA 5E9VA 2LTOA 4QSVA 1WUGA 4UYEA 5D3PA 5A82A 5J39A 4MEOA 5I7YA 2D9EA 5I89A 2HQEA 5IGKA 5LJ1A 5E9LA 4QVZA 2RI7A 4O72A 5DBMA 3QKJA 5CUEA 3NTIA 5FH7A 3S3OA 3NTKA 4TYLA 4YADA 3OB9A 5HELA 3UT1A 4QC3A 4IKFA 4QEVA 5D0CA 4LZSA 4E7IA 4TTEA 4YY6A 2WACA 4C5HA 4IUTA 3SVGA 4YYIA 5IN1A 4BW4A 4A4FA 3UV4A 5KTUA 5D25A 5FG5A 5IGMA 2O4XA 4NYXA 2B8AA 4QR3A 5A7CA 5H1VA 5KHMA 2EQUA 5EWCA 4O78A 3O8VA 5E9IA 2E3KA 2DAQA 2WP1A 5IAYA 5AD3A 5FH8A 4NUEA 5ENEA 4QYLA 2RJFA 3P1EA 5HQ7A 5TB6A 2EKOA 5A85A 3UW9A 4IUVA 2EQKA 4TZ8A 2BUDA 4BDYA 4IR3A 4BHWA 5C7NA 3OYFA 5F36A 5LJ0A 5I1QA 4Z02A 3SD4A 4C66A 4PCEA 3MEWA 4QSPA 5DLXA 4ZW1A 3LYIA 5KCHA 3FDRA 4J0SA 5EPBA 5L99A 2I8NA 4Z93A 5IIDA 5D6YA 2DVSA 4HXOA 3PNWC 4YABA 5DYCA 4UIUA 3UVDA 5DW2A 2F5KA 3L2QA 4QNSA 4TU4A 2H60A 5ENFA 5L8TA 4CUTA 3UWNA 4HBVA 4N4HA 2E6NA 3OY9A 4HXMA 3S92A 3DAIA 4O7CA 2RJEA 3H8ZA 3K2JA 4A4GA 2F6NA 3ONIA 5FE8A 4CUUA 5DYXA 5D3SA 5H1UA 4HXLA 3OYGA 3S3NA 5DKCA 2OSSA 5L98A 4N4GA 5I7XA 2RHUA 1F68A 4II1A 4CUQA 5E74A 2DVQA 5D3HA 4X34A 4ALGA 2LDMA 4NR9A 2DIGA 1EQFA 2RJCA 4NR6A 5LUUA 5EK9A 4YK0A 4N4FA 5F25A 3UVXA 3OMGA 2YDWA 3LQJA 5CQ8A 4QQDA 5FROA 4FL6A 2I7KA 5LKXA 4LYIA 3G0JA 4O76A 5A83A 4QSWA 3QBYA 4O71A 3AADA 4QBMA 3EAEA 2NLUA 3L42A 4QB3A 4Z1QA 2L8DA 5DW1A 4E7HA 4IOOA 5FE0A 4QY4A 4A9KA 3O35A 4QZSA 4KCXA 5D3JA 2D82A 4IORA 4BJXA 4NUCA 5F2PA 4ALHA 1WJSA 2GF7A 3OYAA 3QZSA 4E96A 5E9YA 5A5OA 3UVWA 2M16A 2L5EA 4QR5A 2PQWA 4RG2A 5CUAA 5F1LA 5EISA 5I86A 4IR5A 3C4SA 3LJWA 4BW1A 5D26A 1WGSA 4XUBA 4WHWA 5E9KA 5FE2A 4OVAA 2G4AA 5KE3A 4O7EA 5IG6A 4YATA 2DWWA 3DWYA 4A9NA 5CGPA 3OA6A 4UYDA 2X4WA 4BW3A 4TS8A 3U5PA 1JSPB 5JWMA 2R5AA 3H6ZA 3ME9A 2YQDA 4MEPA 2FHDA 4MR5A 4PY6A 3BDLA 4F3IA 4MR6A 1XNIA 4E7JA 5CRZA 3P1FA 4KV4A 4UYFA 3META 5HRXA 1X0JA 4WIVA 4QSUA 4HBXA 2RNXA 5FE1A 4A4EA 2MWPA 4PS5A 3ZYUA 2RHZA 4PKLA 5DYAA 5EP7A 3MP6A 3OYKA 3MEUA 2YW5A 5HRVA 5A5SA 2YEKA 5C8GA 2X4YA 4Q0NA 4O77A 4FU6A 3TLPA 4UYHA 2RI5A 2G3RA 4BD3A 5EWWA 4XYAA 4AKNA 5EA1A 3U5LA 2YELA 2LVMA 1N27A 4YBMA 3OYCA 4QSXA 5AD2A 3FLGA 5FH6A 5FFYA 3U5KA 5HFRA 4X2IA 2N9GA 2RO1A 4NR5A 4CL9A 4YH4A 3S6WA 5HFQA 4A4HA 2OO1A 3UVYA 2F6JA 5ACYA 4NRCA 5E73A 2RFJA 5F1HA 3OS2A 3OYLA 5CUBA 4YYHA 4GPJA 5L96A 5CQ7A 3NXBA 4LRGA 5AMEA 4YYKA 5F5ZA 5I88A 4BE2A 4FLPA 3L2VA 5C0MA 5CPEA 2RNYA 5ENGA 5D6XA 3ZEHA 2FSAA 3FEOA 3OYBA 3LQIA 3HMEA 5FFWA 4NS5A 4J1PA 2VYTA 4QUTA 3OYEA 5H85A 3MO8A 2RS9B 5A5QA 5L97A 4XUAA 2YRVA 4ZTJA 4MENA 5FE3A 3MEVA 5HQ5A 2D9TA 5IGLA 4A9OA 3JVLA 4UIVA 2XK0A 4GY5A 4Y03A 5HEMA 3U5OA 5DKHA 2R58A 4YAXA 2R57A 4PL6A 5LKTA 3LH0A 4QQ6A 2HQXA 3L2RA 4TQNA 4A9MA 2LRQA 4YC9A 2R10A 5C87A 4TT4A 3OMCA 5D7XA 2CKKA 4UIYA 3G0LA 1RI0A 3F70A 5FB0A 3LGLA 2RNWA 5KO4A 4IUQA 3OYHA 3P8HA 4E7LA 5II1A 5A81A 5F63A 2MWOA 1JM4B 5D3NA 4XY9A 3IU5A 5HENA 4TZ2A 5HM0A 4CUPA 5DY7A 5K29A 5I80A 4CLBA 4RVRA 5ENJA 4CFKA 1OI1A 2R0VA 2GRCA 2WP2A 4NR8A 4Q0OA 4MR3A 5KH6A 4NYVA 4BW2A 3P8DA 4Z6IA 5DFDA 4A9FA 5CY9A 2QQSA 4CRIA 4NQNA 5FG4A 3AQAA 2DVRA 2RHYA 3E9FA 1MHNA 5DX4A 4UIXA 3MULA 5G4RA 4HXNA 4O7AA 4QUUA 5FE6A 1KHCA 5A5PA 4LZ2A 4UIZA 5HRWA 5DFCA 5I29A 4O74A 5DYUA 5EVAA 3Q1JA 5E3GA 2JTFA 5FDZA 5A5RA 5FE5A 5LVRA 5CZGA 2RI2A 2RHXA 4B9XA 2X4XA 3MQMA 1WJQA 2BKDN 2YEMA 4A9EA 5DLZA 4J3IA 3S91A 2LSPB 4QW2A 3P5OA 4IR4A 4CFLA 2L3RA 5AMFA 5C4QA 2E7OA 2L85A 5FB1A 2L89A 2R0SA 5ENBA 3L2WA 5EICA 4LR6A 2DATA 5D24A 3JVMA 4TT6A 5CU8A 5KU3A 4HCZA 3OS1A 4EDUA 4C5IA 1ZS5A 5CQ5A 4HXSA 4NYWA 4LC2A 3OYIA 2RJDA 2M1HA 2L84A 5LJ2A 5EWDA 5JI8A 5LVQA 3CEYA 3UV5A 1OZ3A 1H3ZA 3DB3A 2P0KA 5I40A 5CIUA 3QZTA 4MEQA 4LYWA 3DB4A 4YY4A 5IGNA 4QQGA 3LQHA 5E9MA 3MB3A 3SVFA 5C89A 1WUMA 4A9HA 2EQJA 5FE4A 3GG3A 3PMTA 3QJ6A 5FG6A 5ENIA 5CS8A 3S3MA 4UIWA 4NQMA 5EI4A 5G4SA 3MB4A 4UYGA 5TCMA 4CUSA 3RCWA 3OYMA 4UYFB 2GFUA 3P1CA 5C6SA 4BACA 5CQTA 4YYMA 2QQRA 4IR6A 3Q2EA 5F61A 4BE0A 5EGUA 3O36A 5J0DA 4IOQA 4NXJA 4YH3A 3Q2FA 3QZVA 4LDFA 5BT5A 5EQ1A 4KV1A 3FC3A 5CQAA 5ETBA 4J0RA 5CQ3A 4O7FA 5KCOA 2O4XB 4CURA 3JVKA 4HBWA 5I83A 5KTWA 4A9IA 2BIVA 2M0OA 5J26A 3D7CA 4HXKA 3PMIA 4QSSA 4OGIA 5FBXA 2EFIA 3MUKA 4TU6A 4UITA 2RI3A 4HXPA 3I3JA 2YYNA 5ETDA 3UV2A 2E5QA 4HXRA 3L2UA 5CQ4A 5A5NA 4IURA 4QSQA 2MJVB 4NUDA 2GFAA 3O33A 4N4IA 5D3LA 5COIA 1G5VA 4L59A 1OYXA 4O75A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JJ9A 4QEWA 1M90R 4C92C 4QC1A 2FG0A 1M1GA 1QLYA 1GCPA 4KUIA 1CKAA 3U5JA 4HBYA 5CFWA 1GFCA 1KD1R 3CCLA 3OYNA 5CUDA 5HY6A 2QG9B 3IU6A 2ZPIB 4YBTA 3OSSC 3ASKA 1N9RA 3VV0A 3OS5A 5IHNA 4PJOE 5D6WA 2CZ1B 2E1HA 4Z6HA 2OTLA 3HKSA 3QIIA 5LJ3g 5H1TA 2RF0A 3EG1A 4LZRA 4E7KA 2FL7A 3KUFA 5LKUA 1XJWB 2B86A 2R5MA 5FE9A 5GANd 4OGJA 1YI2T 3J7AF 4O7BA 1ZUYA 2ED0A 1D1BA 5CQ6A 1YWPA 1TUDA 2JMAA 4YYNA 2YLCA 2DF6A 4IUPA 2HKNA 4Y28E 2D8JA 4NRAA 1BIBA 4O70A 2YUNA 1VQOQ 4C67A 3CD6Q 4QSTA 4A9LA 3LLRA 1SHGA 4LNPA 3VS6A 2D6FA 5EPRA 1E6IA 1K73C 4M7AE 2P0PA 3HMHA 2O31A 5E7DA 5II2A 5EM3A 4BI8B 4D6WA 3CCSQ 1RLQC 1SRMA 2LC4A 4M7DG 2P84A 4PJOD 4NR4A 4C8QA 3VS5A 5BT4A 3JSCA 3M9QA 4M78C 2QDYB 2R0YA 4FIBA 4B6MA 2DTOA 4F7UE 5E9VA 3CPWS 1QVGS 2LX7A 5A82A 4Z8AA 3CMAA 2P4RA 1OQKA 1TOVA 2DNUA 4QVZA 2RI7A 4O72A 5DBMA 2F5TX 5CUEA 3OW2P 3NTKA 2LCSA 4JJBA 1X2KA 1C1AA 3A8HB 3FJPA 4E7IA 2O9VA 1GCQC 4WF2A 4YYIA 2MPXC 3M0TA 2A08A 2ED1A 3BY7A 1K9AA 3TSWA 5KTUA 5IGMA 3CCQA 1M90U 2O4XA 2B8AA 5LJ3h 1Q82C 1KG1A 2EQUA 1QQJA 1YCSB 3JCMW 1YIJA 4JRIA 2H3EB 1FMVA 4QKUA 4NUEA 2RJFA 5TB6A 2SEMA 1KD1U 1W4SA 2C0IA 4TZ8A 2EJGA 1UECA 3M55A 4BHWA 3RMSA 5F36A 1T0JA 3SD4A 5L23A 1PKSA 5KYXB 3L1AA 4QSPA 2LZ6B 4ZW1A 2NUTB 1QVPA 1X6OA 5A0GA 3AHUA 3VS2A 3SHWA 1G3TA 4E2FB 1M5Q1 2RA2A 2V1QA 2YT6A 1AVZC 2H60A 4F16A 7AT1B 4CUTA 3JV3A 3CCJA 3OY9A 3S92A 2CSIA 3DAIA 2D0NA 2L3QA 2RJEA 1ZX6A 1OV3A 5H1UA 1IZ6A 4HXLA 3S3NA 1VQNQ 1TWBA 1F68A 3HHTB 4XAXB 1ZBXA 2J7IA 4LUEA 1YJ9A 1PWTA 2PUKB 1VQMA 4NR6A 3CCLQ 2LQKA 4HVVA 3LWHA 3LQJA 4QQDA 1GXIE 4M77E 2KROA 3U23A 1VQOT 3CD6T 4LYIA 3G0JA 4O76A 1KQ2A 3CBPA 2NLUA 2V8IA 4C92E 3JB9F 3CPWP 4Z1QA 2LJ1A 4E7HA 3CCST 4BUGA 3M4GA 1FX7A 4KCXA 2QTXA 4FYYB 2VC8A 4NUCA 1RLPC 4PKCC 5E9YA 5LJ5d 2M16A 4RG2A 1Y96B 3TVTA 2QAZA 3O5ZA 5I86A 2PTKA 1QW1A 3SB2A 4BW1A 3QYHB 5GMKe 4XQ3A 1ZA1B 2G4AA 5KE3A 5GAN8 1NLPC 5IG6A 4YATA 3H0IA 2HMAA 4AG1C 2X4WA 2AZVA 1VYVA 1RAFB 4BW3A 4TS8A 2OTJA 1MMGA 2XD0A 5HK3A 2IVWA 5GANj 1Q81R 4LDYA 2ESWA 4F3IA 5GAN4 4HCCA 4MR6A 1ZSZB 1XNIA 1MMAA 3HPWA 3M0RA 3GBQA 4J7FA 4UYFA 1PSFA 3CCEA 4WTOB 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 2O4X B;  4CUR A;  3JVK A;  4HBW A;  5I83 A;  5KTW A;  4A9I A;  2BIV A;  2M0O A;  5J26 A;  3D7C A;  4HXK A;  3PMI A;  4QSS A;  4OGI A;  5FBX A;  2EFI A;  3MUK A;  4TU6 A;  4UIT A;  2RI3 A;  4HXP A;  3I3J A;  2YYN A;  5ETD A;  3UV2 A;  2E5Q A;  4HXR A;  3L2U A;  5CQ4 A;  5A5N A;  4IUR A;  4QSQ A;  2MJV B;  4NUD A;  2GFA A;  3O33 A;  4N4I A;  5D3L A;  5COI A;  1G5V A;  4L59 A;  1OYX A;  4O75 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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