4N4HA

Crystal structure of the bromo-pwwp of the mouse zinc finger mynd-type containing 11 isoform alpha in complex with histone h3.1k36me3
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
209
structure length
188
Chain Sequence
QEMGTYLRFIVSRMKERAIDLVPTIQEKVNEGKYRSYEEFKADAQLLLHNTVIFYGAASAQADIARMLYKDTCHELDELQLCKNCFYLSNARPDNWFCYPCIPNHELVWAKMKGFGFWPAKVMQKEDNQVDVRFFGHHHQRAWIPSENIQDITVNVHRLHVKRSMGWKKACDELELHQRFLREGRFWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transcription
source organism Mus musculus
publication title ZMYND11 links histone H3.3K36me3 to transcription elongation and tumour suppression
pubmed doi rcsb
molecule keywords Zinc finger MYND domain-containing protein 11
total genus 66
structure length 188
sequence length 209
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
A PF00855 PWWP PWWP domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4n4hA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 4n4hA02
5HENA 2D82A 4QSXA 2YELA 5I89A 3MB3A 1ZS5A 3MP1A 2G3RA 4NYWA 5LKUA 4YYDA 3U5PA 3L2QA 4C5EA 5EPSA 5CQ5A 2R0SA 4QC1A 3P8HA 2WP2A 4QVZA 4IOOA 3Q2EA 2YYNA 4DONA 2N9GA 3OYIA 4TU4A 3OYFA 2DKWA 4LYIA 5EP7A 4LRGA 2RI2A 5FG4A 4YADA 2EQMA 5J26A 4MENA 5E9YA 5ETBA 5LJ2A 3OYJA 4Z6HA 3MEWA 5LVQA 5L8UA 4BE0A 2RO1A 5EWVA 5ENHA 4O78A 4CFKA 2QQRA 2X4YA 1X0JA 5D6YA 5LKZA 5CUAA 5DYUA 5LUUA 4FL6A 2RNXA 2F6JA 5FB1A 3LQHA 4NR8A 4QEWA 2RJDA 3U5OA 3MQMA 4XUAA 4XY8A 1OZ2A 4YBTA 2NXBA 4N3WA 3G0LA 5D7XA 3OMCA 4O7AA 4UYGA 3OS1A 5CUCA 3SVFA 4YYJA 4QYDA 2MJVB 4NR7A 3JVJA 4UIVA 3L2WA 1G5VA 4OUFA 4NS5A 3AQAA 5ENJA 3S3MA 3IU5A 2R0YA 5ENFA 5A5NA 3DB4A 4QEUA 4BE1A 5KE3A 5F5ZA 4KV4A 4F3IA 2M1HA 3DB3A 2X4WA 4C5HA 4YK0A 4UIWA 3QJ6A 4X34A 1F68A 2DATA 4L59A 5HRVA 3NTKA 3S3NA 5CS8A 5BT3A 5FE5A 2EQUA 4IURA 5A5PA 2O4XA 4QQ6A 4C5GA 5HFQA 3HMHA 3U5LA 4IR3A 2BUDA 4Z1SA 4C66A 2OSSA 4QSQA 4MR4A 2R5MA 3CEYA 4CURA 4WHWA 4HXLA 5EI4A 4BW1A 5IGMA 4N4GA 4IOQA 4QY4A 4CL9A 2L89A 2RHIA 4HXMA 3K2JA 4HXPA 4NQMA 4TTEA 5IGKA 3FDRA 2L5EA 5FE1A 2R0VA 3LQIA 2RS9B 2YEKA 3LGLA 3OQ5A 5A5QA 4BJXA 5M9OA 4YYNA 4PTBA 4XYAA 4A9FA 5TB6A 5C89A 5I7YA 4J0RA 2EKOA 3MO8A 4ZTFA 4UIUA 4QEVA 5DBMA 5EK9A 3S6WA 3UT1A 5A82A 5FRNA 5DLZA 5I7XA 3L2RA 3O36A 5C8GA 1KHCA 5E3DA 5CQAA 5ETDA 5EU1A 5EICA 5DW1A 4TS8A 3UVYA 4TQNA 5E0RA 5F60A 4LYSA 5FE0A 3EAEA 5H1TA 2RO0A 5J0DA 3LH0A 5DFDA 5EWDA 4A9LA 5I80A 5JI8A 5DY7A 2LTOA 2LVMA 4O74A 2VYTA 5EWCA 5C6SA 4NRAA 4B9WA 5FG5A 4O7FA 4BW4A 2LSPB 5HELA 3TLPA 5C85A 4NUDA 4CRIA 4TT6A 5CUBA 5FG6A 5BT4A 5F63A 1OZ3A 4UIYA 4MEOA 3L2UA 5A85A 5LJ0A 5AMFA 5KTXA 5DYXA 3PMTA 5FE8A 5FE3A 5EGUA 5A5OA 5CZGA 5E9MA 4QSUA 4N4FA 5HQ5A 5H85A 5DFCA 2L85A 4UC4A 4X2IA 4NYXA 3MUKA 3L42A 4HCZA 4YYGA 5CGPA 5C0MA 5II2A 3FC3A 5CY9A 3JVKA 3UV2A 5AD3A 4E7LA 3DWYA 4Z1QA 5D3HA 5E3GA 1EQFA 4QR3A 5L98A 2RJEA 4QQDA 3U5JA 5CRZA 4YYIA 4PKLA 3O35A 3O33A 5I40A 5C4QA 5IGNA 3QBYA 5DYAA 5ENGA 5FRMA 3OMGA 4KV1A 5EPBA 4YBSA 4QSWA 4A9EA 2LCCA 4A9NA 4CUPA 4HBWA 5FFYA 4MEPA 5H1UA 3MEUA 4Z02A 2YEMA 5EQ1A 4HXSA 4YATA 5DW2A 4NXJA 5KE2A 4OVAA 3OYCA 2DIGA 4Z93A 5HLSA 4UYHA 5D3PA 5D3JA 4A9JA 2JZ2A 2XK0A 3D7CA 3OYBA 4NRBA 4HXKA 5CP5A 2HQEA 5CUDA 4UYFB 4IR4A 4N4IA 4B9XA 4A4FA 4II1A 5HJCA 5LKTA 5CQ3A 5CQTA 3OYDA 4NR4A 4XY9A 4GPJA 5FH8A 2DVVA 5FH6A 5D6XA 5H1VA 1JM4B 3GG3A 4LZ2A 4QYLA 4CFLA 5FFWA 3P1EA 3NXBA 3UV5A 4IUTA 3BDLA 4PS5A 3OY9A 4YYKA 4HXRA 3S91A 5E7DA 4NR6A 5FE6A 4O7EA 3UVWA 4NQNA 3M9QA 4O71A 2DAQA 5HRXA 4FU6A 2RHXA 5IGLA 3OYAA 4TU6A 5L97A 4XUBA 5A81A 2EQKA 4E7KA 3FLGA 5D26A 2K3YA 3Q1JA 4J3IA 5F61A 5L8TA 1WJSA 4UYEA 5DKHA 2X4XA 4CUSA 4ZQLA 3OYEA 3QZTA 5KCOA 5LVRA 4LR6A 4HXNA 3IU6A 5TCMA 2I7KA 3DLMA 5HFRA 3KUFA 4QZSA 3UW9A 4A9HA 2LRQA 5I1QA 5EVAA 2QQSA 5FE2A 1XNIA 3QZVA 5G4RA 3LGFA 5D24A 5FDZA 3DAIA 5A5SA 2DVRA 3UVDA 3SVHA 4O75A 2GFUA 4QR4A 5DX4A 5A5RA 4PY6A 3MP8A 3P8DA 4HBVA 4UITA 4J0SA 2RNYA 5LJ1A 4E96A 2IG0A 3MXFA 4ALHA 5AD2A 5CQ4A 4IUQA 1WUMA 2M16A 3META 3OB9A 5F25A 5HCLA 4CLBA 2E7OA 5CQ8A 5DKCA 5EM3A 5F1HA 4IR6A 5A83A 2M0OA 3E9FA 3PNWC 3OS0A 4O77A 4A4GA 3HMEA 4QBMA 4QR5A 5IBNA 2WACA 4CUTA 2R5AA 5F3AA 4N4HA 5II1A 4UIZA 5IIDA 4FLPA 5BT5A 4QSPA 1H3ZA 2RI5A 3MP6A 4YYMA 4A4EA 2RFJA 4J1PA 4QUTA 4Q0OA 4RG2A 4NR9A 4PL6A 4YY6A 2NLUA 2BKDN 5EV9A 5IN1A 5KCHA 4NRCA 5E73A 4YAXA 3SVGA 4O70A 4E7IA 1OYXA 2RHYA 2G4AA 3F70A 5KH6A 2YDWA 2E6NA 3MEVA 5D6WA 5FBXA 3O8VA 3UWNA 4PLLA 5D3NA 3FEOA 5CU8A 2OUOA 4QB3A 5F2PA 4BW2A 3LJWA 4KCXA 5CQ6A 5HEMA 4PCIA 5CTLA 3QIIA 2EQJA 5I29A 3GOXA 2PQWA 4HXOA 3NTIA 4YYHA 5ENBA 2BIVA 2GFAA 4O7BA 1OI1A 1WJRA 3MEAA 4CUUA 4BACA 4BE2A 4A9OA 2MWPA 5D25A 5A7CA 2EFIA 5DFBA 5D3LA 2JTFA 2E3KA 2GF7A 3OYLA 4UYDA 5KO4A 3OYKA 4ZC9A 2O4XB 5AMEA 4Q0NA 3QZSA 2L3RA 4C67A 3JVMA 5CQ7A 4A9MA 1MHNA 5F36A 5COIA 3OYNA 4YC9A 5CRMA 5ENCA 5IG6A 5E9LA 5HQ6A 4NUCA 3OA6A 4BDYA 2YQDA 4MR5A 4PCEA 4TT2A 3SD4A 3P1FA 2DWWA 5ENEA 5CIUA 5I88A 2D9TA 5EPRA 4IUVA 4HBYA 3H6ZA 2K3XA 2R57A 4C5IA 4NUEA 5E9VA 3HMFA 3U5KA 1E6IA 5CFWA 2F6NA 4O76A 3P5OA 2FHDA 5CUGA 2DIQA 4A4HA 3OYMA 4GY5A 4E7HA 2B8AA 4NYVA 4QNSA 5KTWA 4OGIA 5ACYA 3FKMX 2F5KA 2P0KA 2X35A 5IAYA 4TYLA 4QQGA 5D3TA 5E9KA 4AKNA 4A9IA 4Q5WA 5F62A 1SSFA 3G0JA 2DVQA 3MULA 4WIVA 2L8DA 5FH7A 5F1LA 3LLRA 4QW2A 5KTUA 3AADA 3Q2FA 4YH3A 5E74A 4QSSA 4MR6A 3UVXA 5I86A 5D0CA 3RCWA 5FE9A 3O37A 3S3OA 4TT4A 5KHMA 1WGSA 2E5QA 4IKFA 4PLIA 3L2VA 3PFSA 5KU3A 1RI0A 5LKXA 3U5NA 4O72A 4YY4A 2FSAA 4NR5A 5FFVA 4TZ8A 2YW5A 5JWMA 4OGJA 4Y03A 2L84A 3I3JA 5DLXA 4IORA 1N27A 4LZSA 4ZW1A 3S92A 5EWHA 4QSVA 5FE4A 4TZ2A 5L99A 2I8NA 3U5MA 4HBXA 5K29A 2LDMA 3ONIA 4IUPA 4IR5A 3P1CA 4LD6A 5D3SA 3LX7A 5FROA 2E7NA 2KTBB 4QSTA 4EDUA 4IUUA 4BD3A 4UIXA 2H60A 1JSPB 3QKJA 4YBMA 4QC3A 4A9KA 2RJCA 2RHUA 4UYFA 5CUEA 1WUGA 3C4SA 4CUQA 2YRVA 2RJFA 5C7NA 2RI7A 3E9GA 5J39A 3OYHA 5L96A 4MR3A 3JVLA 3ASKA 2OO1A 3ZEHA 4BHWA 2HQXA 4E7JA 4YABA 3H8ZA 4LDFA 2DVSA 2RNWA 2D9EA 5ENIA 5EWWA 5HRWA 5EA1A 4BW3A 3ZYUA 2RHZA 2CKKA 5E9IA 4ZTJA 3LXJA 5CPEA 4ALGA 3LYIA 1N72A 5FE7A 4LZRA 3OS2A 4LYWA 5DYCA 3LQJA 3ME9A 5HQ7A 2R10A 4QUUA 2WP1A 2MWOA 5EISA 4YH4A 3UV4A 3O34A 3P1DA 4MEQA 4RVRA 2R58A 3MB4A 4LC2A 5D3RA 4O7CA 4Z6IA 5DKDA 5HM0A 1WJQA 4QSRA 2RI3A 3NTHA 4WHUA 2XDPA 3PMIA 5C87A 4BDZA 5FB0A 5G4SA 5I83A 3OYGA 2GRCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O9VA 2D82A 5FU7B 3TEEA 1VQ7A 5LKUA 3ZL7C 2CT4A 5CVIA 1NPRA 4C5EA 4QC1A 3P8HA 4OMOA 3PE0A 1XJWB 4IOOA 3Q2EA 2SEMA 4K11A 2LCLA 3OYIA 2N9GA 3VU3C 2YUQA 1WDXA 3OYFA 1YIJT 1NJIU 1S1NA 2OTJT 2EQMA 4MENA 1H8KA 1V76A 2QK0A 2VUBA 4F7UA 5GANf 3GIBA 2EWNA 4RCCA 2RO1A 2KMTA 3CPWA 4CFKA 2QQRA 1X0JA 5D6YA 5LKZA 3EGUA 4PJOD 1OPKA 1QW1A 3LQHA 4QEWA 2KT1A 4OP0A 3LWHA 2RJDA 3U5OA 3I56T 1FXXA 1HJDA 1OEBA 2NXBA 1C1AA 2NWMA 4Y28E 4N3WA 3OMCA 2OAWA 2ROLA 1AWOA 4O7AA 3CMAA 4UYGA 2OTLQ 4HT8A 3SVFA 4OB3B 1YITT 1BIAA 3IQLA 3CXCA 5LJ3h 3EG9A 1OPLA 5A5NA 4QEUA 3L2ZA 4KV4A 5DLQE 3DB3A 4KH0B 4M75B 4X34A 4C5HA 4EMKB 1QP3A 2DATA 3EFOB 4XTZA 3M0QA 4M75G 2DD4A 5FE5A 1KHIA 3CCJQ 1VQKA 5HFQA 5IHKA 1M3AA 3QDRB 3UA6A 2BUDA 4Z1SA 4OMNA 3CMEQ 1K1ZA 1EZZB 1JBMA 1M8VA 1IREB 2F2VA 4BW1A 4PNOA 1U1SA 2DRKA 5EC7A 3CCVA 4CL9A 1NJIC 2I0NA 2A37A 2RHIA 3MHXA 4E47A 5LJ5h 3OYYA 1Q95G 4R55A 1RLPC 3NMZC 4PTBA 4XYAA 4A9FA 1H92A 2CP7A 5DBMA 3UT1A 5A82A 4HKEA 1OX8A 4M7AE 1S72Q 5GANe 2QA4Q 3GLXA 2RQRA 1B34A 5ETDA 5EU1A 1PKTA 3CC7A 4ZN3A 3I55Q 2CUDA 1IO6A 3CCLQ 1QWFA 1ACMB 3QZ5B 5FE0A 1RAAB 1WI7A 5J0DA 2OTLT 5EWDA 1T3LA 4A9LA 2ECZA 2RQUA 1Q86R 5LJ3j 5DY7A 2LVMA 2L3QA 2DL8A 2VYTA 4M78E 1JJ2A 5FG5A 2KXCA 1Q82R 1GCQC 1TUDA 5HELA 2HD0A 3CBPA 1PUOA 1M1GA 1YNZA 3FJPA 5CUBA 2QDYB 1AWWA 2HQHA 1OZ3A 2V8IA 3L2UA 2DZ9A 5A85A 3CCJT 3X20B 5DYXA 1W1FA 2EJ9A 2FZGB 5KYNA 2B86A 3CMET 2KYMA 2FG0A 2J06A 5I22A 5LJ5j 5CGPA 3CCEA 2DMOA 3JVKA 3UV2A 1JU5C 3OBWA 1YJ9Q 4E7LA 2AT1B 4M7DE 5KYXB 1EQFA 2LP5A 3QO3A 1V29B 5L98A 1NEBA 2V1RA 1K0SA 3VUZA 5IGNA 3QBYA 5A0GA 2C0IA 1G3YA 1YJNA 1M4ZA 5FRMA 1KD1U 1S72T 4OMQA 2RA2A 2QAZA 4CC7A 1VQ4A 2E5KA 3I55T 2VASA 2ZZDA 3CCLT 5GAMj 4XTWA 3JB9J 2YEMA 2E41A 4HXSA 4YATA 3JB9G 3RUXA 2DIGA 3SFMA 5D3JA 2XK0A 3D7CA 3A8GB 2EGEA 2HQEA 4N4IA 1RAGB 1WXTA 1HSQA 3OYDA 4FYYB 4BI4A 1VYVA 5GMKl 3JB9F 1M9SA 1BBZA 4ELYC 1TUGB 1VQNA 2Y90A 2Y4YA 3NXBA 4IUTA 3BDLA 3PGGA 3OY9A 1QVGA 5E7DA 4NR6A 5FE6A 5KYWA 3UPUA 4JUVA 2A08A 1QVGS 2EVRA 3U23A 3OYAA 4BY6C 2AZVA 4PJLA 3QWYA 5D26A 2K3YA 5F61A 2KRSA 4DBHA 3OYEA 1BI3A 1NBEB 4OGCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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