5HJCA

Brd3 second bromodomain in complex with histone h3 acetylation at k18
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
KLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein/peptide
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
publication title Molecular Coupling of Histone Crotonylation and Active Transcription by AF9 YEATS Domain
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5hjcA00
4ZW1A 2E7OA 4Z6HA 5CRZA 5DLXA 4NR4A 4LZRA 4BW3A 4NRAA 5LUUA 5E9MA 4YYKA 5COIA 3UVDA 5C87A 2YELA 4NUDA 4MR4A 4HXKA 5E74A 5ENBA 5HEMA 5CFWA 5A81A 4YADA 5ENIA 1WUMA 5DYXA 4QZSA 4OGIA 4UYGA 4MR3A 5ENCA 5ETBA 4UYFB 5D3LA 4IR3A 5A83A 4QR3A 4AKNA 5EP7A 5H1UA 4HXNA 3UV5A 4QBMA 5H1TA 4KV4A 5AMEA 3P1FA 4HXOA 4J0RA 4QSTA 4A9LA 4Z6IA 4UYEA 5C89A 5FG4A 5EI4A 1N72A 5HFQA 3FKMX 2RNXA 3AQAA 4LC2A 2R0YA 2R0VA 4YATA 5FH8A 4A9EA 5FE0A 5E9IA 5EISA 5HLSA 5DBMA 4O7EA 4NR7A 5LVQA 4IR6A 4O7AA 2E3KA 2L5EA 4F3IA 3SVGA 4NR5A 2DVSA 2L84A 4QC3A 5F3AA 4A9NA 5FE5A 5EICA 4NR8A 5DKHA 4A9JA 5E3DA 3P1EA 5CZGA 4WIVA 5HQ6A 3JVLA 5D7XA 5FG5A 3LQJA 5CTLA 4A9OA 4PS5A 4A9MA 5I80A 5EM3A 4QEWA 4UIZA 4QYDA 5D3SA 5KTWA 5CUAA 4KCXA 3JVMA 4YBTA 5DLZA 4CUSA 4UITA 5I86A 5EGUA 4A9KA 3QZTA 5D3JA 4LZSA 5EPRA 4O71A 4A9HA 4QNSA 3MB3A 2YYNA 3AADA 4ZC9A 4TTEA 2I7KA 4TU6A 5LJ0A 5HENA 5IBNA 4E96A 5FE9A 5A5QA 3I3JA 4ALGA 4XUAA 5D26A 3U5OA 5CUBA 2H60A 4NR6A 2D9EA 5HJCA 4QSUA 5HM0A 5ENHA 4UIVA 2WP2A 5A5NA 4NRBA 4QEVA 4Q0NA 4YYGA 2OSSA 4Y03A 4CLBA 3QZVA 5IGKA 5I89A 5IIDA 4HXLA 3UVYA 5CUDA 4BW2A 4YYHA 4IORA 5CQ7A 5G4SA 5EK9A 5I83A 5FFYA 2RNYA 5FBXA 4CUUA 2KTBB 5E7DA 3MQMA 4LRGA 2F6JA 3U5PA 2MJVB 4CURA 2DWWA 5AMFA 4O74A 5D0CA 4QEUA 4YABA 2YEKA 4HXSA 5FH6A 4ALHA 3MUKA 5CQTA 1JM4B 4RVRA 4CUPA 2I8NA 4DONA 5A5RA 2LSPB 5ETDA 4N4GA 5A85A 4UIUA 4QSRA 4UYDA 4HBWA 1WUGA 4NUCA 4TZ2A 5EVAA 3IU6A 5F25A 1X0JA 3RCWA 5CS8A 5F62A 4YAXA 5FFVA 5LJ2A 2FSAA 5E9LA 4GPJA 4HXMA 5CQ8A 5H1VA 2RI7A 4O7CA 2R10A 2RFJA 5E0RA 5DYUA 3DWYA 2D82A 4UYFA 5DKCA 4QC1A 4O75A 5EWDA 3HMFA 2YEMA 4HBXA 3K2JA 3P1CA 5E9YA 5D3RA 2DVQA 5ENJA 3O35A 4MR6A 5D25A 5L99A 5IG6A 4C66A 4BW1A 3O33A 5HCLA 4IR4A 3S92A 4YH3A 5II1A 3UW9A 5CP5A 3U5KA 5IGMA 4HBVA 4J1PA 5D3NA 4QUUA 5FE7A 4Z93A 5D3PA 3Q2EA 5HQ5A 1ZS5A 5EWWA 4HXRA 4CUQA 4TU4A 3NXBA 4O7FA 5KO4A 4MR5A 5FH7A 4YYNA 5CQ5A 4PTBA 5II2A 5CGPA 5F1LA 4O70A 5C7NA 5F60A 4O72A 4CUTA 3UV2A 4LYIA 4HXPA 1F68A 4QSQA 5FDZA 3LQIA 4WHUA 5ACYA 2DATA 5CUEA 4TT6A 4MEPA 5L97A 5L96A 5DW2A 5EWVA 5L8UA 4J0SA 5DX4A 4TT4A 5LKZA 5CUGA 3SVHA 3SVFA 5LKTA 5LJ1A 4CFKA 4TS8A 5I7XA 3O36A 3LJWA 5F63A 5TCMA 4LYSA 5A82A 5C8GA 4Z1SA 3DAIA 4NXJA 3TLPA 5KU3A 4MEOA 4O76A 4TQNA 1EQFA 5DYCA 5CPEA 5FE2A 4PCIA 4XY9A 4LZ2A 5EPSA 4IR5A 5E3GA 4NQMA 4QSSA 5BT5A 4CL9A 4O77A 5LKUA 2DVVA 3D7CA 5I88A 5I7YA 5D3HA 4Q0OA 4LDFA 5ENFA 5EWCA 2YQDA 2RS9B 4TYLA 5EU1A 4QR5A 3U5MA 3O34A 4Z1QA 4BW4A 4NYWA 5BT4A 5CUCA 4N4FA 3O37A 4QUTA 4XUBA 4PKLA 4OUFA 5DFBA 2RNWA 5F2PA 5L98A 5D3TA 5IGLA 5LKXA 2N9GA 4BJXA 2NXBA 2F6NA 5F36A 3Q2FA 3S91A 4YBMA 5FG6A 3UV4A 4QSXA 4YY6A 3JVJA 5E9VA 5J0DA 5EA1A 4YC9A 5A5PA 5L8TA 2E7NA 5EQ1A 5ENEA 3U5LA 2YW5A 5FE6A 5FE1A 5G4RA 4NUEA 5F1HA 3IU5A 5JI8A 3LXJA 5FFWA 4PCEA 4QYLA 4UIYA 5DFCA 5K29A 4O7BA 4MENA 4A9FA 4QB3A 2RO1A 3P1DA 3UVXA 5D24A 5TB6A 3G0LA 4N4HA 5DY7A 5CQ6A 2R0SA 4TT2A 5EV9A 4QSWA 4IOOA 5F5ZA 4O78A 5A5SA 4BHWA 3P5OA 3U5JA 5LVRA 4FLPA 4YYDA 4UIXA 4YH4A 5BT3A 5A5OA 4NS5A 4PY6A 3MXFA 1E6IA 1JSPB 5KTXA 5IGNA 4QSVA 4IOQA 5CRMA 5ENGA 2GRCA 2DKWA 4NRCA 4UYHA 5FB1A 5CY9A 5CQ4A 4N4IA 5KHMA 2G4AA 4J3IA 5HRVA 4X2IA 5FE8A 3G0JA 4LYWA 4NYVA 3HMEA 4QSPA 5HELA 4QR4A 5HRXA 5FB0A 3ZYUA 5HRWA 5AD3A 4NR9A 4QY4A 5E73A 3MB4A 2DVRA 3JVKA 3QZSA 4N3WA 5H85A 4C67A 5DYAA 2YDWA 5KTUA 5A7CA 3MULA 5I29A 4ZQLA 3U5NA 4MEQA 4UIWA 5C85A 3UVWA 3LQHA 4OGJA 4XY8A 5E9KA 3GG3A 4WHWA 5JWMA 4KV1A 2OUOA 4YY4A 4CFLA 4TZ8A 3HMHA 4HBYA 5CQ3A 5DKDA 5HFRA 5I1QA 5DFDA 2OO1A 5CU8A 4YYMA 4A9IA 4YYJA 5F61A 5EPBA 5HQ7A 5EWHA 4YBSA 5AD2A 4NQNA 5CQAA 4YK0A 5FE4A 5FE3A 5C4QA 4XYAA 3ONIA 5DW1A 4NYXA 2WP1A 5I40A 2L85A 4YYIA 4LR6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZW1A 2E7OA 4Z6HA 5CRZA 5DLXA 4NR4A 4LZRA 4BW3A 4NRAA 5LUUA 5E9MA 4YYKA 5COIA 3UVDA 5C87A 2YELA 4NUDA 4MR4A 4HXKA 5E74A 5ENBA 5HEMA 5CFWA 5A81A 4YADA 5ENIA 1WUMA 5DYXA 4QZSA 4OGIA 4UYGA 4MR3A 5ENCA 5ETBA 4UYFB 5D3LA 4IR3A 5A83A 4QR3A 4AKNA 5EP7A 5H1UA 4HXNA 3UV5A 4QBMA 5H1TA 4KV4A 5AMEA 3P1FA 4HXOA 4J0RA 4QSTA 4A9LA 4Z6IA 4UYEA 5C89A 5FG4A 5EI4A 1N72A 5HFQA 3FKMX 2RNXA 3AQAA 4LC2A 2R0YA 2R0VA 4YATA 5FH8A 4A9EA 5FE0A 5E9IA 5EISA 5HLSA 5DBMA 4O7EA 4NR7A 5LVQA 4IR6A 4O7AA 2E3KA 2L5EA 4F3IA 3SVGA 4NR5A 2DVSA 2L84A 4QC3A 5F3AA 4A9NA 5FE5A 5EICA 4NR8A 5DKHA 4A9JA 5E3DA 3P1EA 5CZGA 4WIVA 5HQ6A 3JVLA 1PUOA 5D7XA 5FG5A 3LQJA 5CTLA 4A9OA 4PS5A 4A9MA 5I80A 5EM3A 4QEWA 4UIZA 4QYDA 5D3SA 5KTWA 5CUAA 4KCXA 3JVMA 4YBTA 5DLZA 4CUSA 4UITA 5I86A 2EJNA 5EGUA 4A9KA 3QZTA 5D3JA 4LZSA 5EPRA 4O71A 4A9HA 3D1BA 4QNSA 3MB3A 2YYNA 3AADA 4ZC9A 4TTEA 2I7KA 4TU6A 5LJ0A 5HENA 5IBNA 4E96A 5FE9A 5A5QA 3I3JA 4ALGA 4XUAA 5D26A 3U5OA 5CUBA 2H60A 4NR6A 2D9EA 5HJCA 4QSUA 5HM0A 5ENHA 4UIVA 2WP2A 5A5NA 4NRBA 4QEVA 4Q0NA 4YYGA 2OSSA 4Y03A 4CLBA 3QZVA 5IGKA 5I89A 5IIDA 4HXLA 3UVYA 5CUDA 4BW2A 4YYHA 4IORA 5CQ7A 5G4SA 5EK9A 5I83A 5FFYA 2RNYA 5FBXA 4CUUA 2KTBB 5E7DA 3MQMA 4LRGA 2F6JA 3U5PA 2MJVB 4CURA 2DWWA 5AMFA 4O74A 5D0CA 4QEUA 4YABA 2YEKA 4HXSA 5FH6A 4ALHA 3MUKA 5CQTA 3ERRA 1JM4B 4RVRA 4AKIA 4CUPA 2I8NA 4DONA 5A5RA 2LSPB 5ETDA 4N4GA 5A85A 4UIUA 4QSRA 4UYDA 4HBWA 1WUGA 4NUCA 4TZ2A 5EVAA 3IU6A 5F25A 1X0JA 3RCWA 5CS8A 5F62A 4YAXA 5FFVA 5LJ2A 2FSAA 5E9LA 4GPJA 4HXMA 5CQ8A 5H1VA 2RI7A 4O7CA 2R10A 2RFJA 5E0RA 5DYUA 3DWYA 2D82A 4UYFA 5DKCA 4QC1A 4O75A 5EWDA 3HMFA 2YEMA 4HBXA 3K2JA 3P1CA 5E9YA 5D3RA 2DVQA 5ENJA 3O35A 4MR6A 5D25A 5L99A 5IG6A 4C66A 4BW1A 3O33A 5HCLA 4IR4A 3S92A 4YH3A 5II1A 3UW9A 5CP5A 3U5KA 5IGMA 4HBVA 4J1PA 5D3NA 4QUUA 5FE7A 4Z93A 5D3PA 3Q2EA 5HQ5A 1ZS5A 5EWWA 4HXRA 4CUQA 4TU4A 3NXBA 4O7FA 5KO4A 4MR5A 5FH7A 4YYNA 5CQ5A 4PTBA 5II2A 5CGPA 5F1LA 4O70A 5C7NA 5F60A 4O72A 4CUTA 3UV2A 4LYIA 4HXPA 1F68A 4QSQA 5FDZA 3LQIA 4WHUA 5ACYA 2DATA 5CUEA 4TT6A 4MEPA 5L97A 5L96A 5DW2A 5EWVA 5L8UA 4J0SA 5DX4A 4TT4A 5LKZA 5CUGA 3SVHA 3SVFA 5LKTA 5LJ1A 4CFKA 4TS8A 5I7XA 3O36A 3LJWA 5F63A 5TCMA 4LYSA 5A82A 5C8GA 4Z1SA 3DAIA 4NXJA 3TLPA 5KU3A 4MEOA 1ZKRA 4O76A 4TQNA 1EQFA 5DYCA 5CPEA 5FE2A 4PCIA 4XY9A 4LZ2A 5EPSA 4IR5A 5E3GA 4NQMA 4QSSA 5BT5A 4CL9A 4O77A 5LKUA 2DVVA 3D7CA 5I88A 5I7YA 5D3HA 4Q0OA 4LDFA 5ENFA 5EWCA 2YQDA 2RS9B 4TYLA 5EU1A 4QR5A 3U5MA 3O34A 4Z1QA 4BW4A 4NYWA 5BT4A 5CUCA 4N4FA 3O37A 4QUTA 4XUBA 4PKLA 4OUFA 5DFBA 2RNWA 5F2PA 5L98A 5D3TA 5IGLA 5LKXA 2N9GA 4BJXA 2NXBA 2F6NA 4AKHA 5F36A 3Q2FA 3S91A 4YBMA 5FG6A 3UV4A 4QSXA 4YY6A 3JVJA 5E9VA 5J0DA 5EA1A 4YC9A 5A5PA 5L8TA 2E7NA 5EQ1A 5ENEA 3U5LA 2YW5A 5FE6A 5FE1A 5G4RA 4NUEA 5F1HA 3IU5A 5JI8A 3LXJA 5FFWA 4PCEA 4QYLA 4UIYA 5DFCA 5K29A 4O7BA 4MENA 4A9FA 4QB3A 2RO1A 3P1DA 3UVXA 5D24A 5TB6A 3G0LA 4N4HA 5DY7A 5CQ6A 2R0SA 4TT2A 5EV9A 4QSWA 4IOOA 5F5ZA 4O78A 5A5SA 4BHWA 3P5OA 3U5JA 5LVRA 4FLPA 4YYDA 4UIXA 4YH4A 5BT3A 5A5OA 4NS5A 4PY6A 3MXFA 1E6IA 1JSPB 5KTXA 5IGNA 4QSVA 4IOQA 5CRMA 3VKGA 5ENGA 2GRCA 2DKWA 4NRCA 4UYHA 5FB1A 3VKHA 5CY9A 5CQ4A 4N4IA 5KHMA 2G4AA 4J3IA 5HRVA 4X2IA 5FE8A 3G0JA 4LYWA 4NYVA 3HMEA 3D1DA 4QSPA 5HELA 4QR4A 5HRXA 5FB0A 3ZYUA 5HRWA 5AD3A 4NR9A 4QY4A 5E73A 3MB4A 2DVRA 3JVKA 3QZSA 4N3WA 5H85A 4C67A 5DYAA 2YDWA 5KTUA 5A7CA 3MULA 4AI6A 5I29A 4ZQLA 3U5NA 4MEQA 4UIWA 5C85A 3UVWA 3LQHA 4OGJA 4XY8A 5E9KA 3GG3A 4WHWA 5JWMA 4KV1A 2OUOA 4YY4A 4CFLA 4TZ8A 3HMHA 4HBYA 5CQ3A 5DKDA 5HFRA 5I1QA 5DFDA 2OO1A 5CU8A 4YYMA 4A9IA 4YYJA 5F61A 5EPBA 5HQ7A 5EWHA 4YBSA 5AD2A 4AKGA 4NQNA 5CQAA 4YK0A 5FE4A 5FE3A 5C4QA 4XYAA 3ONIA 5DW1A 4NYXA 2WP1A 5I40A 2L85A 4YYIA 4LR6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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