5I7YA

Brd9 in complex with cpd4 ((e)-3-(6-(but-2-en-1-yl)-7-oxo-6,7-dihydro-1h-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)-n,n-dimethylbenzamide)
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
101
structure length
101
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
publication title Diving into the Water: Inducible Binding Conformations for BRD4, TAF1(2), BRD9, and CECR2 Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 101
sequence length 101
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i7yA00
5AD2A 4Z1QA 5FE6A 5FG5A 4QSTA 2N9GA 4IR3A 2RI7A 4CURA 4PTBA 4AKNA 2LSPB 5AMFA 2I8NA 5A5RA 4PCEA 5JI8A 4ZQLA 5DFDA 2RO1A 3HMEA 4QBMA 4QZSA 3DWYA 4NYXA 3P1EA 4IR6A 5E7DA 4YC9A 3JVLA 5E3GA 5A5NA 5HLSA 4O76A 5D3LA 2DWWA 5HCLA 4CLBA 3O35A 5H1TA 4NR5A 5LUUA 5CY9A 4N4HA 3LQHA 4X2IA 5BT4A 5AMEA 5I29A 5EVAA 3HMHA 4QY4A 4HXOA 5II1A 4NR4A 5LKXA 5A5OA 5EU1A 2F6NA 3UV2A 5LVQA 4IOOA 5F5ZA 5HQ6A 4RVRA 5IG6A 4A9MA 5L96A 4PCIA 5F62A 5FE2A 4J1PA 4Y03A 5F63A 2G4AA 5HELA 5A5PA 3U5OA 1E6IA 4XYAA 4UIZA 4MR5A 4UIVA 4YBTA 4XUAA 3UVXA 4Z1SA 3U5JA 4NQNA 3P1CA 4PY6A 5D7XA 5J0DA 4CFLA 4TT4A 5CU8A 5HFQA 2YEKA 5F61A 5HENA 4E96A 3U5KA 5CUAA 5D3RA 4CL9A 4TYLA 4KCXA 5CFWA 4BW4A 5FFYA 5D25A 5FH7A 2L85A 4C66A 3QZSA 4UYHA 5D3NA 2RS9B 5D3TA 4BJXA 4O7EA 4O77A 5DFBA 3IU5A 4UITA 4QUTA 5F2PA 3HMFA 5L8TA 5KU3A 4IR4A 4ZC9A 4A9NA 1ZS5A 5C8GA 4ALGA 4XY8A 4NR7A 5HQ7A 5ETBA 5HRXA 5EPRA 5CRZA 5IGNA 4HXMA 5ACYA 5AD3A 5CUEA 5DY7A 5D26A 2YDWA 4BW1A 2DVQA 4NR9A 5I88A 4A9FA 5H1VA 4QYLA 4YYKA 5EWWA 5F25A 5C89A 3SVGA 5ETDA 5C7NA 4O72A 4NRBA 4CFKA 4N4IA 5FE0A 4BW3A 4UIWA 4TU4A 2YEMA 3JVKA 4IORA 4A9KA 5E9VA 2DVRA 4NYWA 5I86A 4F3IA 5KHMA 4LR6A 4HXNA 3Q2EA 5FE7A 5EICA 2H60A 4QC1A 3QZVA 5FE3A 2WP2A 4YYGA 5I7XA 3IU6A 5EGUA 2MJVB 5FFVA 4HBXA 2YW5A 5FE9A 5CGPA 5IGMA 4GPJA 2L5EA 4CUSA 5BT3A 5EPBA 4YBSA 5FH8A 4LRGA 3O33A 5CUCA 5E3DA 2L84A 4HXKA 4KV1A 4QR4A 3ONIA 1WUGA 4Z93A 5DLZA 4LYWA 4N3WA 5ENFA 2F6JA 3UV5A 4YYIA 3DAIA 5F3AA 4O7CA 5DFCA 2FSAA 5DBMA 4QB3A 5HFRA 4MR3A 2DVVA 4NRCA 4YYHA 4YY6A 5CP5A 4HXLA 4QC3A 5LKUA 4Z6IA 3U5PA 5ENEA 2KTBB 4QSSA 3ZYUA 5HM0A 5D0CA 5EWDA 4NUEA 4LZRA 5G4SA 5D24A 4CUQA 4QUUA 5D3SA 4IR5A 4TTEA 4YAXA 5F36A 4YYJA 4LYIA 5DYCA 3QZTA 4QSVA 5EWVA 3I3JA 5C85A 5HRWA 3SVFA 4UYGA 5EA1A 4HXRA 3G0JA 4MR6A 5FE4A 3UVYA 4MEOA 5KO4A 4UYEA 5EI4A 3MULA 5CQ6A 5DYAA 5CQ8A 5TCMA 5HJCA 2RNYA 3S92A 5DW1A 3D7CA 4HBYA 4LC2A 5JWMA 2WP1A 5E9LA 4TQNA 2E3KA 3LXJA 5ENHA 4QEUA 4LZ2A 4QYDA 5DYUA 5A5QA 5LJ1A 4Q0NA 4HBVA 4NYVA 4CUPA 5L99A 4NR6A 4TZ8A 4O78A 4QNSA 3UVDA 4PKLA 5E73A 4NUCA 4QSPA 5CQTA 5DKHA 3RCWA 2DKWA 2DVSA 2NXBA 4A9IA 5FB0A 4A9JA 4CUUA 5H85A 5FE5A 4BW2A 4O7BA 4UYFA 4A9OA 4A9HA 4J0SA 4WHUA 4YYNA 4WHWA 5CQ3A 2OUOA 4NRAA 5H1UA 5D3HA 5D3JA 2OSSA 5ENCA 5E9KA 4YABA 5FBXA 5HEMA 2YYNA 5LJ2A 4MEPA 3U5MA 5DX4A 5E9IA 4CUTA 4J3IA 4UIUA 4O70A 4O74A 5CTLA 3O37A 3MQMA 4NR8A 4PS5A 4YATA 5HQ5A 3O34A 5EWHA 5I1QA 2R0YA 5A7CA 5EWCA 5ENGA 2R0VA 5IIDA 3MB4A 5L97A 2YQDA 3U5LA 1F68A 4OGJA 4UYFB 4OGIA 4WIVA 5D3PA 5CQ7A 2GRCA 5DKCA 5L8UA 5F1HA 4YH3A 5F60A 4UIYA 5FE8A 1N72A 3MB3A 5E9YA 4UYDA 5FDZA 3O36A 5HRVA 1X0JA 5I83A 3LQJA 4LDFA 5EISA 4MR4A 4DONA 4TU6A 5BT5A 5FFWA 5EP7A 4YH4A 4TT2A 5DW2A 4QSXA 3JVMA 5E9MA 4YBMA 4YYMA 4O75A 4IOQA 5COIA 5LVRA 4Q0OA 2D82A 3G0LA 3LQIA 4A9EA 4N4FA 4ZW1A 2OO1A 4O7AA 4BHWA 5DYXA 2RNXA 2R0SA 4MEQA 1EQFA 5I7YA 5LKZA 5FH6A 3Q2FA 5EK9A 4HXSA 4NXJA 4ALHA 2RNWA 5KTWA 2I7KA 5C87A 4QSUA 4QR5A 5LJ0A 5LKTA 5CUGA 2RFJA 5CUDA 5A82A 2D9EA 4QSQA 4KV4A 3S91A 5A85A 3AADA 5K29A 5I89A 5IBNA 5DKDA 4TZ2A 5DLXA 4YADA 4NS5A 4YY4A 3UVWA 5FG4A 4HXPA 5CQ5A 2R10A 5I40A 5CQAA 3MUKA 4TS8A 3FKMX 2E7OA 4FLPA 4XUBA 4YYDA 3SVHA 4LZSA 3TLPA 5EV9A 4NQMA 5CQ4A 5CRMA 4QR3A 2DATA 1JM4B 3U5NA 5ENJA 3LJWA 4QSWA 4TT6A 5II2A 4QEVA 4O7FA 5CZGA 3P5OA 5I80A 4O71A 5A81A 3UV4A 5ENIA 5TB6A 4J0RA 5F1LA 5FG6A 5ENBA 5CS8A 5E0RA 5EM3A 5A5SA 3K2JA 5G4RA 5A83A 5C4QA 5E74A 5IGKA 3MXFA 3P1FA 4NUDA 4Z6HA 1JSPB 4QSRA 4N4GA 4HBWA 3P1DA 5FB1A 2E7NA 4QEWA 4LYSA 3AQAA 4YK0A 3NXBA 2YELA 5IGLA 4UIXA 4C67A 5CPEA 5L98A 5FE1A 5EQ1A 3UW9A 1WUMA 5KTUA 5KTXA 4OUFA 3GG3A 4A9LA 4MENA 5CUBA 3JVJA 5EPSA 4XY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AD2A 4Z1QA 5FE6A 4AKHA 5FG5A 4QSTA 2N9GA 4IR3A 2RI7A 4CURA 4PTBA 4AKNA 2LSPB 5AMFA 2I8NA 3D1BA 5A5RA 4PCEA 5JI8A 4ZQLA 5DFDA 2RO1A 3HMEA 4QBMA 4QZSA 3DWYA 4NYXA 3P1EA 4IR6A 5E7DA 4YC9A 3JVLA 5E3GA 5A5NA 5HLSA 4O76A 5D3LA 2DWWA 5HCLA 4CLBA 3O35A 5H1TA 4NR5A 5LUUA 5CY9A 4N4HA 3LQHA 4X2IA 5BT4A 5AMEA 5I29A 5EVAA 3HMHA 4AKIA 4QY4A 4HXOA 5II1A 4NR4A 5LKXA 5A5OA 5EU1A 2F6NA 3UV2A 5LVQA 4IOOA 5F5ZA 5HQ6A 4RVRA 5IG6A 4A9MA 5L96A 4PCIA 5F62A 5FE2A 4J1PA 4Y03A 5F63A 2G4AA 5HELA 5A5PA 3U5OA 1E6IA 4XYAA 4UIZA 4MR5A 4UIVA 4YBTA 4XUAA 3UVXA 4Z1SA 3U5JA 4NQNA 3P1CA 4PY6A 5D7XA 5J0DA 4CFLA 4TT4A 5CU8A 3VKGA 5HFQA 2YEKA 5F61A 5HENA 1ZKRA 4E96A 3U5KA 5CUAA 5D3RA 4CL9A 4TYLA 4KCXA 5CFWA 4BW4A 5FFYA 5D25A 5FH7A 2L85A 4C66A 3QZSA 4UYHA 5D3NA 2RS9B 5D3TA 4BJXA 4O7EA 4O77A 5DFBA 3IU5A 4UITA 4QUTA 5F2PA 3HMFA 5L8TA 5KU3A 4IR4A 4ZC9A 4A9NA 1ZS5A 5C8GA 4ALGA 4XY8A 4NR7A 5HQ7A 5ETBA 5HRXA 5EPRA 5CRZA 5IGNA 4HXMA 5ACYA 5AD3A 5CUEA 5DY7A 5D26A 2YDWA 4BW1A 2DVQA 4NR9A 5I88A 4A9FA 5H1VA 4QYLA 4YYKA 5EWWA 5F25A 5C89A 3SVGA 5ETDA 5C7NA 4O72A 4NRBA 4CFKA 4N4IA 5FE0A 4BW3A 4UIWA 4TU4A 2YEMA 3JVKA 4IORA 4A9KA 5E9VA 2DVRA 4NYWA 5I86A 4F3IA 5KHMA 4LR6A 4HXNA 3Q2EA 5FE7A 5EICA 2H60A 4QC1A 3QZVA 5FE3A 2WP2A 4YYGA 5I7XA 3IU6A 5EGUA 2MJVB 5FFVA 4HBXA 2YW5A 5FE9A 5CGPA 5IGMA 4GPJA 2L5EA 4CUSA 5BT3A 5EPBA 4YBSA 5FH8A 4LRGA 3O33A 5CUCA 5E3DA 2L84A 4HXKA 4KV1A 4QR4A 3ONIA 1WUGA 4Z93A 5DLZA 4LYWA 4N3WA 5ENFA 2F6JA 3UV5A 4YYIA 3DAIA 5F3AA 4O7CA 5DFCA 2FSAA 5DBMA 4QB3A 5HFRA 4MR3A 2DVVA 4NRCA 4YYHA 4YY6A 5CP5A 4HXLA 4QC3A 5LKUA 4Z6IA 3U5PA 5ENEA 2KTBB 4QSSA 3ZYUA 5HM0A 5D0CA 5EWDA 4NUEA 4LZRA 5G4SA 5D24A 4CUQA 4QUUA 5D3SA 4IR5A 4TTEA 4YAXA 5F36A 4YYJA 4LYIA 5DYCA 3QZTA 4QSVA 5EWVA 3I3JA 5C85A 5HRWA 3SVFA 4UYGA 5EA1A 4HXRA 3G0JA 4MR6A 5FE4A 3UVYA 4AKGA 4MEOA 5KO4A 4UYEA 5EI4A 3MULA 5CQ6A 5DYAA 5CQ8A 5TCMA 5HJCA 2RNYA 3S92A 5DW1A 3D7CA 4HBYA 4LC2A 5JWMA 2WP1A 5E9LA 4TQNA 2E3KA 3LXJA 5ENHA 4QEUA 4LZ2A 4QYDA 5DYUA 5A5QA 5LJ1A 4Q0NA 4HBVA 4NYVA 4CUPA 5L99A 4NR6A 4TZ8A 4O78A 4QNSA 3UVDA 4PKLA 5E73A 4NUCA 4QSPA 5CQTA 3VKHA 5DKHA 3RCWA 2DKWA 2DVSA 2NXBA 4A9IA 5FB0A 4A9JA 4CUUA 5H85A 5FE5A 4BW2A 4O7BA 4UYFA 4A9OA 4A9HA 4J0SA 4WHUA 4YYNA 4WHWA 5CQ3A 2OUOA 4NRAA 5H1UA 5D3HA 3ERRA 5D3JA 2OSSA 5ENCA 5E9KA 4YABA 5FBXA 5HEMA 2YYNA 5LJ2A 4MEPA 3U5MA 5DX4A 5E9IA 4CUTA 4J3IA 4UIUA 4O70A 4O74A 5CTLA 3O37A 3MQMA 4NR8A 4PS5A 4YATA 3D1DA 3O34A 5EWHA 5HQ5A 5I1QA 2R0YA 5A7CA 5EWCA 5ENGA 2R0VA 5IIDA 3MB4A 5L97A 2YQDA 3U5LA 1F68A 4OGJA 4UYFB 4OGIA 4WIVA 5D3PA 5CQ7A 2GRCA 5DKCA 5L8UA 5F1HA 4YH3A 5F60A 4UIYA 5FE8A 1N72A 3MB3A 5E9YA 4UYDA 5FDZA 3O36A 5HRVA 1X0JA 5I83A 3LQJA 4LDFA 5EISA 4MR4A 4DONA 4TU6A 4AI6A 5BT5A 5FFWA 5EP7A 4YH4A 4TT2A 5DW2A 4QSXA 3JVMA 5E9MA 4YBMA 4YYMA 4O75A 4IOQA 5COIA 5LVRA 4Q0OA 2D82A 3G0LA 3LQIA 4A9EA 4N4FA 4ZW1A 2OO1A 4O7AA 4BHWA 5DYXA 2RNXA 2R0SA 4MEQA 1EQFA 5I7YA 5LKZA 5FH6A 3Q2FA 5EK9A 4HXSA 4NXJA 4ALHA 2RNWA 5KTWA 2I7KA 5C87A 4QSUA 4QR5A 5LJ0A 5LKTA 5CUGA 2RFJA 5CUDA 5A82A 2D9EA 4QSQA 4KV4A 3S91A 5A85A 3AADA 5K29A 5I89A 5IBNA 5DKDA 4TZ2A 5DLXA 4YADA 4NS5A 4YY4A 3UVWA 5FG4A 4HXPA 5CQ5A 2R10A 5I40A 5CQAA 3MUKA 4TS8A 3FKMX 2E7OA 4FLPA 4XUBA 4YYDA 3SVHA 4LZSA 3TLPA 5EV9A 4NQMA 5CQ4A 5CRMA 4QR3A 2DATA 1JM4B 3U5NA 5ENJA 3LJWA 4QSWA 4TT6A 5II2A 4QEVA 2EJNA 4O7FA 5CZGA 3P5OA 5I80A 4O71A 5A81A 3UV4A 5ENIA 5TB6A 4J0RA 5F1LA 5FG6A 5ENBA 5CS8A 5E0RA 5EM3A 5A5SA 3K2JA 5G4RA 5A83A 5C4QA 5E74A 5IGKA 3MXFA 3P1FA 4NUDA 4Z6HA 1JSPB 4QSRA 4N4GA 4HBWA 3P1DA 5FB1A 2E7NA 4QEWA 4LYSA 3AQAA 4YK0A 3NXBA 2YELA 5IGLA 4UIXA 4C67A 5CPEA 5L98A 5FE1A 5EQ1A 3UW9A 1WUMA 5KTUA 5KTXA 4OUFA 3GG3A 4A9LA 1PUOA 4MENA 5CUBA 3JVJA 5EPSA 4XY9A
chains in the Genus database with same CATH topology
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