4XUAA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with e11919 baz2-icr analogue
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xuaA00
3LJWA 5KTWA 5I89A 3MUKA 4QZSA 3I3JA 4F3IA 4NR7A 4Z1QA 3JVLA 3P1DA 4LC2A 4NQNA 4BW4A 3UVDA 4QC3A 3UW9A 4NXJA 4UIYA 5LKZA 4ZC9A 1JM4B 4X2IA 4A9OA 5A5RA 3LQIA 3S92A 2RNWA 5F60A 4YYNA 4Y03A 5EICA 5D3HA 3IU5A 3HMFA 4UYFB 4A9MA 4N4IA 5I80A 5HRVA 5AD3A 1EQFA 4E96A 4N4GA 4DONA 1E6IA 5E3DA 5DLZA 4HBXA 2RFJA 5D25A 3O34A 5F63A 3G0LA 5ENEA 5IG6A 4LRGA 5A5QA 5FE5A 3U5KA 3QZTA 4NRCA 4OUFA 4O75A 5AMEA 5EWCA 4NQMA 5KO4A 4UITA 4UIXA 5D26A 5LVRA 2G4AA 2FSAA 5EK9A 3ONIA 5BT4A 5A85A 5FG6A 5D3SA 3Q2FA 5DKCA 3U5LA 4BHWA 5LKXA 3O37A 2R0VA 5L97A 4C66A 4UIZA 5I29A 5IGMA 5LKUA 5FE2A 4CURA 5ENIA 5D3JA 5E3GA 5CU8A 2RI7A 5D3LA 4BW3A 4HXLA 5HLSA 3S91A 5DKDA 4IOOA 5G4SA 5ENJA 4O77A 4A9JA 5D3PA 5DFBA 5ACYA 5FE0A 4QR4A 3MULA 4BW2A 4WIVA 5L8TA 5ENGA 4ALHA 4HXRA 4QYDA 3UV5A 4C67A 4HBVA 4LZ2A 5FE7A 3JVMA 4QEWA 5DYXA 5ENCA 4O7CA 3ZYUA 1JSPB 5F36A 5D0CA 3NXBA 5EISA 2RNXA 3U5MA 5H85A 4XUBA 4YBSA 5FFYA 5CZGA 5HCLA 5DLXA 4A9KA 4QUTA 4BJXA 5C4QA 5FFWA 5I88A 4J1PA 4MR5A 5FE4A 3LQJA 4UIWA 5DW2A 5DYAA 5BT5A 5C8GA 4Q0OA 5CQAA 4HXKA 4NRAA 4J0SA 2D82A 5HM0A 4NR5A 4ALGA 3MQMA 5II2A 4N4HA 5A5OA 5D3TA 5DFDA 5CQTA 5FH8A 5C7NA 5F5ZA 5EU1A 2L84A 5KTUA 2YW5A 4TQNA 2DWWA 4QSVA 5FH7A 2F6JA 3GG3A 5CUBA 3Q2EA 5F3AA 5FG4A 4YYKA 4Z6IA 5DYUA 4TZ8A 5CFWA 2OSSA 3K2JA 3JVJA 3UVXA 2H60A 2LSPB 1F68A 5LJ1A 5CTLA 5EPBA 3UV4A 5HQ5A 5I7YA 4YYJA 3G0JA 4MEQA 5CRMA 4QY4A 1N72A 5D7XA 5EWWA 4KCXA 5HJCA 5HRWA 3HMEA 4LYWA 5EM3A 4O7BA 2RNYA 4QSQA 4A9NA 5EP7A 5A5PA 4RVRA 4J0RA 5J0DA 4CLBA 4MR6A 5L98A 3LXJA 5L99A 4LDFA 5ENHA 5CQ7A 2L5EA 4OGIA 3AADA 4UYEA 2YQDA 4O70A 4NR8A 4QSSA 4CUUA 2KTBB 5EI4A 2OUOA 3O33A 5LVQA 5COIA 5E9VA 5CQ3A 3UV2A 5CUEA 4UIUA 5FB1A 4FLPA 5FE8A 4YYIA 4HXMA 2E7OA 5F1HA 5D24A 4QSTA 4TU4A 4NS5A 4UYDA 5FH6A 4HXOA 5CQ8A 2DKWA 5F25A 5AD2A 3QZVA 4YY6A 4UIVA 3JVKA 2D9EA 5IIDA 4PCEA 4UYFA 4XYAA 4IR4A 2YEKA 5E0RA 4NR4A 3MXFA 4HXSA 2DATA 5DX4A 5JI8A 5IGLA 2N9GA 4ZW1A 5IGKA 5E7DA 4NR6A 2DVQA 5A83A 5D3NA 5D3RA 4YYGA 2DVVA 4QB3A 2DVRA 2I8NA 4QR3A 5EVAA 5EWVA 5CS8A 5HQ6A 4UYHA 3P1EA 5I40A 5DKHA 1X0JA 4TYLA 5I7XA 4YH4A 5CUDA 5FG5A 5K29A 4A9IA 2NXBA 4LZRA 5F61A 5LJ0A 5I83A 5IBNA 3MB4A 4O7EA 2YEMA 5CUAA 4O78A 5CUCA 5EQ1A 4TT2A 4YYHA 4A9EA 2I7KA 5L96A 4IR3A 4PY6A 5ENBA 3DWYA 4NYWA 5FE6A 4PS5A 4QUUA 4CFLA 4A9LA 5KHMA 5ETBA 4HXNA 5KTXA 5E9LA 2WP2A 5CGPA 5CUGA 2YYNA 4YAXA 5BT3A 3QZSA 5C85A 4Z6HA 5HELA 5HENA 4QBMA 4YH3A 5H1TA 3U5OA 4HBYA 5CQ5A 3UVYA 5HFRA 5KU3A 2RS9B 4YADA 5EPRA 3UVWA 5II1A 5DY7A 3O36A 4NYVA 5JWMA 3HMHA 4XY8A 4YC9A 5E9MA 5AMFA 5FFVA 3LQHA 5DBMA 4NYXA 5TCMA 5FDZA 2YELA 5TB6A 4N3WA 4XY9A 5CRZA 5C89A 3D7CA 3SVGA 5DFCA 4MR4A 4YBTA 2GRCA 4WHUA 4CL9A 5L8UA 4MR3A 5H1UA 5FE1A 4IR5A 5ENFA 4O7FA 4CUSA 4QSXA 4QYLA 3RCWA 2MJVB 4CUTA 3O35A 4QNSA 3SVFA 2E7NA 4OGJA 5E9YA 4A9FA 4CUQA 4NRBA 2R0SA 5IGNA 2OO1A 5CQ4A 3U5JA 5FE3A 4YATA 4QEUA 4HXPA 4PKLA 5HEMA 3P1CA 5CQ6A 4O72A 5ETDA 4QR5A 4TT6A 4O76A 5CPEA 4QSRA 4QSWA 4YK0A 5G4RA 5HFQA 4TTEA 3IU6A 5E74A 4KV4A 4LZSA 5A82A 4NUCA 3TLPA 5LJ2A 5A7CA 5EGUA 4AKNA 4LYSA 1ZS5A 4PTBA 5I1QA 3FKMX 4IR6A 5F1LA 2E3KA 5HQ7A 3U5NA 4YBMA 5CY9A 4MEOA 4CUPA 5FE9A 4MEPA 5EWDA 4IOQA 4HBWA 4LYIA 5FB0A 5I86A 4YABA 5EV9A 4LR6A 4Z93A 3SVHA 4TU6A 2R0YA 4YY4A 2L85A 4Q0NA 4O74A 5CP5A 4TS8A 5DW1A 4QSUA 5E9IA 5A5NA 4BW1A 5C87A 5A5SA 5E9KA 3U5PA 4Z1SA 4XUAA 4WHWA 3AQAA 4UYGA 5H1VA 4CFKA 3P1FA 1WUGA 4TT4A 5EPSA 2RO1A 4QC1A 4ZQLA 5FBXA 5HRXA 2R10A 4MENA 4N4FA 5F62A 2YDWA 3DAIA 4NR9A 3P5OA 4TZ2A 5F2PA 4O7AA 4GPJA 4QEVA 1WUMA 5DYCA 2DVSA 4PCIA 4KV1A 4NUEA 5E73A 5EWHA 2F6NA 4J3IA 4O71A 4YYMA 4A9HA 5LKTA 5LUUA 4QSPA 4NUDA 4IORA 3MB3A 2WP1A 4YYDA 5EA1A 5A81A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LJWA 5KTWA 5I89A 3MUKA 4QZSA 3I3JA 4F3IA 4NR7A 4Z1QA 3JVLA 3P1DA 4LC2A 4NQNA 4BW4A 3UVDA 4QC3A 3UW9A 4NXJA 4UIYA 5LKZA 4ZC9A 1JM4B 4X2IA 4A9OA 5A5RA 3LQIA 3S92A 2RNWA 5F60A 4YYNA 4Y03A 5EICA 5D3HA 3IU5A 3HMFA 4UYFB 4A9MA 3ERRA 4N4IA 5I80A 5HRVA 5AD3A 1EQFA 4E96A 4N4GA 4DONA 1E6IA 5E3DA 5DLZA 4HBXA 2RFJA 5D25A 3O34A 5F63A 3G0LA 5ENEA 5IG6A 4LRGA 5A5QA 5FE5A 3U5KA 3QZTA 4NRCA 4OUFA 4O75A 5AMEA 5EWCA 4NQMA 5KO4A 4UITA 4UIXA 5D26A 2EJNA 5LVRA 2G4AA 2FSAA 5EK9A 3ONIA 5BT4A 5A85A 5FG6A 5D3SA 3Q2FA 5DKCA 3U5LA 4BHWA 5LKXA 3O37A 2R0VA 5L97A 4C66A 4UIZA 5I29A 5IGMA 5LKUA 5FE2A 4CURA 5ENIA 5D3JA 5E3GA 5CU8A 2RI7A 5D3LA 4BW3A 4HXLA 5HLSA 3S91A 5DKDA 4IOOA 5G4SA 5ENJA 4O77A 4A9JA 4AKHA 5D3PA 5DFBA 5ACYA 5FE0A 4QR4A 3MULA 4BW2A 4WIVA 5L8TA 5ENGA 4ALHA 4HXRA 4QYDA 3UV5A 4C67A 4HBVA 4LZ2A 5FE7A 3JVMA 4QEWA 5DYXA 5ENCA 4O7CA 3ZYUA 1JSPB 5F36A 5D0CA 3NXBA 5EISA 2RNXA 3U5MA 5H85A 4XUBA 4YBSA 5FFYA 5CZGA 5HCLA 5DLXA 4A9KA 4QUTA 4BJXA 5C4QA 5FFWA 5I88A 4J1PA 4MR5A 5FE4A 3LQJA 4UIWA 5DW2A 5DYAA 5BT5A 5C8GA 4Q0OA 5CQAA 4HXKA 4NRAA 4J0SA 2D82A 5HM0A 4NR5A 4ALGA 3MQMA 5II2A 4N4HA 5A5OA 5D3TA 5DFDA 5CQTA 5FH8A 5C7NA 5F5ZA 5EU1A 2L84A 5KTUA 2YW5A 4TQNA 2DWWA 4QSVA 5FH7A 4AI6A 2F6JA 3GG3A 5CUBA 3Q2EA 5F3AA 5FG4A 4YYKA 4Z6IA 5DYUA 4TZ8A 5CFWA 2OSSA 3K2JA 3JVJA 3UVXA 2H60A 4AKIA 2LSPB 1F68A 5LJ1A 5CTLA 5EPBA 3UV4A 5HQ5A 5I7YA 4YYJA 3G0JA 4MEQA 5CRMA 4QY4A 1N72A 5D7XA 5EWWA 4KCXA 5HJCA 5HRWA 3HMEA 4LYWA 5EM3A 3VKHA 4O7BA 2RNYA 4QSQA 4A9NA 5EP7A 5A5PA 4RVRA 4J0RA 5J0DA 4CLBA 4MR6A 5L98A 3LXJA 5L99A 4LDFA 5ENHA 5CQ7A 2L5EA 4OGIA 3AADA 4UYEA 2YQDA 4O70A 4NR8A 4QSSA 4CUUA 2KTBB 5EI4A 2OUOA 3O33A 5LVQA 5COIA 5E9VA 5CQ3A 3UV2A 5CUEA 4UIUA 5FB1A 4FLPA 5FE8A 4YYIA 4HXMA 2E7OA 5F1HA 5D24A 4QSTA 4TU4A 4NS5A 4UYDA 5FH6A 4HXOA 5CQ8A 2DKWA 5F25A 5AD2A 3QZVA 4YY6A 4UIVA 3JVKA 2D9EA 5IIDA 4PCEA 1ZKRA 4UYFA 4XYAA 4IR4A 2YEKA 5E0RA 4NR4A 3MXFA 4HXSA 2DATA 5DX4A 5JI8A 5IGLA 2N9GA 4ZW1A 5IGKA 5E7DA 4NR6A 2DVQA 5A83A 5D3NA 5D3RA 4YYGA 2DVVA 4QB3A 2DVRA 2I8NA 4QR3A 5EVAA 5EWVA 5CS8A 5HQ6A 4UYHA 3P1EA 5I40A 5DKHA 1X0JA 4TYLA 5I7XA 4YH4A 5CUDA 5FG5A 5K29A 4A9IA 2NXBA 4LZRA 5F61A 5LJ0A 5I83A 5IBNA 3MB4A 4O7EA 2YEMA 5CUAA 4O78A 5CUCA 5EQ1A 4TT2A 4YYHA 4A9EA 2I7KA 5L96A 4IR3A 4PY6A 5ENBA 3DWYA 4NYWA 5FE6A 4PS5A 4QUUA 4CFLA 4A9LA 5KHMA 5ETBA 4HXNA 5KTXA 5E9LA 2WP2A 5CGPA 5CUGA 2YYNA 3VKGA 4YAXA 5BT3A 3QZSA 5C85A 3D1DA 4Z6HA 5HELA 5HENA 4QBMA 4YH3A 5H1TA 3U5OA 4HBYA 5CQ5A 3UVYA 5HFRA 5KU3A 2RS9B 4YADA 5EPRA 3UVWA 5II1A 5DY7A 3O36A 4NYVA 5JWMA 3HMHA 4XY8A 4YC9A 5E9MA 5AMFA 5FFVA 3LQHA 5DBMA 4NYXA 5TCMA 5FDZA 2YELA 5TB6A 4N3WA 4XY9A 5CRZA 5C89A 3D7CA 3SVGA 5DFCA 4MR4A 4YBTA 2GRCA 4WHUA 4CL9A 5L8UA 4MR3A 5H1UA 5FE1A 4IR5A 5ENFA 4O7FA 4CUSA 4QSXA 4QYLA 3RCWA 2MJVB 3D1BA 3O35A 4CUTA 4QNSA 3SVFA 1PUOA 2E7NA 4OGJA 5E9YA 4A9FA 4CUQA 4NRBA 2R0SA 5IGNA 2OO1A 5CQ4A 3U5JA 5FE3A 4YATA 4QEUA 4HXPA 4PKLA 5HEMA 3P1CA 4AKGA 5CQ6A 4O72A 5ETDA 4QR5A 4TT6A 4O76A 5CPEA 4QSRA 4QSWA 4YK0A 5G4RA 5HFQA 4TTEA 3IU6A 5E74A 4KV4A 4LZSA 5A82A 4NUCA 3TLPA 5LJ2A 5A7CA 5EGUA 4AKNA 4LYSA 1ZS5A 4PTBA 5I1QA 3FKMX 4IR6A 5F1LA 2E3KA 5HQ7A 3U5NA 4YBMA 5CY9A 4MEOA 4CUPA 5FE9A 4MEPA 5EWDA 4IOQA 4HBWA 4LYIA 5FB0A 5I86A 4YABA 5EV9A 4LR6A 4Z93A 3SVHA 4TU6A 2R0YA 4YY4A 2L85A 4Q0NA 4O74A 5CP5A 4TS8A 5DW1A 4QSUA 5E9IA 5A5NA 4BW1A 5C87A 5A5SA 5E9KA 3U5PA 4Z1SA 4XUAA 4WHWA 3AQAA 4UYGA 5H1VA 4CFKA 3P1FA 1WUGA 4TT4A 5EPSA 2RO1A 4QC1A 4ZQLA 5FBXA 5HRXA 2R10A 4MENA 4N4FA 5F62A 2YDWA 3DAIA 4NR9A 3P5OA 4TZ2A 5F2PA 4O7AA 4GPJA 4QEVA 1WUMA 5DYCA 2DVSA 4PCIA 4KV1A 4NUEA 5E73A 5EWHA 2F6NA 4J3IA 4O71A 4YYMA 4A9HA 5LKTA 5LUUA 4QSPA 4NUDA 4IORA 3MB3A 2WP1A 4YYDA 5EA1A 5A81A
chains in the Genus database with same CATH topology
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