4XUAA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with e11919 baz2-icr analogue
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xuaA00
2I7KA 4NYVA 4XUBA 5H1TA 5H1VA 2DKWA 5D3TA 3P1FA 4CUTA 4A9EA 4NR6A 4J0RA 3LQJA 4X2IA 5H85A 5AMEA 5A7CA 5FE8A 3D7CA 4UIYA 5HLSA 4LRGA 4O78A 3UW9A 4O77A 5FE9A 4YBSA 5HCLA 4HXPA 2YDWA 4O7BA 4PCEA 3MB4A 1ZS5A 4IOQA 5ENEA 4QR3A 5HELA 4LZRA 4FLPA 4NS5A 4YAXA 4O7FA 5AD3A 4HBXA 5D26A 4NR5A 2I8NA 1WUMA 5D24A 5IG6A 3K2JA 5LVRA 4NYWA 4A9MA 5LJ1A 5CTLA 2R10A 4O74A 4NYXA 5CQ7A 3U5JA 5D3SA 5E9LA 3U5MA 5C4QA 5IGLA 3O35A 5BT4A 3AADA 4AKNA 4O71A 5LKUA 4C66A 5CQAA 5CY9A 5F5ZA 3MULA 4LZSA 5L96A 5EP7A 4NQMA 5D3PA 5A5OA 5DKCA 4YH3A 1E6IA 4WHUA 1EQFA 4KV4A 5A5QA 4QYLA 5E3GA 4C67A 4N4FA 4MR6A 5ENBA 5LKXA 3LQIA 5L8UA 3O37A 5L8TA 5CQ8A 5KTXA 5K29A 3G0LA 3S92A 3MUKA 3P1CA 4HBYA 4O75A 4QZSA 4UYFA 4O7CA 5CFWA 5CU8A 2MJVB 5EPRA 4HXNA 4Z6HA 4HXMA 4QEWA 5BT3A 4NUCA 4O7AA 4PS5A 4QSRA 5L97A 3P1DA 4TT2A 5CUCA 2D9EA 4N3WA 2E7NA 4O76A 2WP1A 5IBNA 3G0JA 2RFJA 4QBMA 5EWWA 3UV5A 5A5RA 4Z93A 5ENHA 5HENA 4NQNA 2R0YA 3IU6A 4TZ8A 4LDFA 5I7XA 3ONIA 4A9IA 4TT6A 3ZYUA 5A5NA 4MR5A 5CQ3A 4F3IA 3SVHA 3UV2A 4QSSA 1X0JA 4Q0OA 5ENGA 2G4AA 3DWYA 5E0RA 2KTBB 2L5EA 3UV4A 4UYHA 2YELA 4Z6IA 4QSWA 4CFKA 4MEQA 4GPJA 3HMFA 5F1LA 3Q2FA 5DX4A 5FE6A 5F60A 4NUEA 5E9IA 5D3NA 5ENFA 3TLPA 4QUTA 4YK0A 2F6NA 4YYMA 4IR5A 2RO1A 2E3KA 5AD2A 5CQ4A 5I80A 4CUSA 4CUQA 4Z1QA 4QR5A 5FE2A 5ETDA 2D82A 4N4IA 4Z1SA 5CQTA 2R0SA 5C87A 5HM0A 3HMEA 5FFVA 2WP2A 2DATA 5HQ7A 5CUBA 5KHMA 3O33A 2RS9B 5FG6A 4ZW1A 4O7EA 4XY9A 4YABA 5FH6A 3O36A 4QYDA 2YQDA 4XY8A 5CRZA 5E9VA 5HQ6A 2H60A 4QY4A 5COIA 3LXJA 5DKHA 4LYIA 4TZ2A 4HXKA 4OGIA 5EK9A 2E7OA 4A9NA 2RI7A 4WHWA 2YW5A 2FSAA 5A5SA 4MR3A 3JVJA 4YY4A 4YYDA 5A81A 5DLXA 4QSTA 5EVAA 5FBXA 2OO1A 5F36A 4UIXA 5HRXA 3UVWA 3SVFA 5FFWA 4QSQA 5KTUA 5G4RA 4IR4A 3HMHA 3AQAA 3Q2EA 4IOOA 4YYKA 4A9FA 2YEMA 3U5LA 5HFRA 4QR4A 2YYNA 5F62A 5TCMA 5DYUA 5A85A 5II2A 3U5NA 4WIVA 2N9GA 3NXBA 4YH4A 4BW3A 4YBMA 4DONA 2LSPB 4ALGA 2L84A 1WUGA 4HXLA 5FFYA 5EPBA 5CGPA 4NUDA 5FDZA 3QZSA 4J3IA 4PY6A 5EICA 5CS8A 5EWDA 5ENIA 4NRCA 4QEUA 5LKTA 4J1PA 4NRAA 4BW1A 4CUPA 2DWWA 5D3HA 4LZ2A 4LC2A 5ENCA 5FG4A 5LJ0A 2L85A 2GRCA 4E96A 5H1UA 4XUAA 5EWVA 1N72A 4MR4A 4N4GA 4O70A 4CLBA 3FKMX 3U5PA 5CUAA 5DY7A 5I7YA 3SVGA 5HRVA 4QNSA 5DYAA 5F3AA 4LR6A 4TYLA 5I83A 4TS8A 4UYGA 5D25A 3MQMA 1JSPB 4PCIA 2RNXA 4YATA 5ENJA 5G4SA 5C89A 5D3JA 3I3JA 5CQ5A 5CUEA 5HEMA 5FE5A 4ZQLA 2DVVA 3P1EA 5DYCA 5A82A 2DVQA 4UYEA 5IGKA 2RNYA 3DAIA 4TQNA 4RVRA 5KU3A 4NR4A 5HFQA 5E74A 3MB3A 5CRMA 4TTEA 3LQHA 5DFBA 5F63A 5CP5A 5F1HA 4IR3A 4BW2A 4QSPA 5AMFA 5E9YA 5CZGA 4IR6A 4MEPA 5EGUA 5EISA 4CL9A 5L99A 4O72A 4YY6A 5E73A 5JWMA 5EWHA 5KO4A 5LKZA 5HQ5A 4CUUA 4PTBA 5EA1A 4QC1A 5TB6A 4ALHA 4BJXA 4YYIA 5EPSA 4KCXA 3MXFA 5CQ6A 5CUGA 5JI8A 3UVYA 4A9LA 2YEKA 4QSXA 4YBTA 5C85A 4OGJA 4Y03A 3U5OA 5C7NA 5F2PA 4NR9A 5CPEA 5F25A 5ETBA 4TT4A 5LUUA 4QSUA 5HRWA 4N4HA 5F61A 5EWCA 4UIVA 4KV1A 4XYAA 5I89A 4BW4A 4YC9A 5FE3A 3QZVA 3S91A 5HJCA 5FB0A 3JVKA 4UITA 5DW1A 4BHWA 4A9JA 5KTWA 3UVDA 4TU6A 5DKDA 5EI4A 5FH8A 4MENA 2RNWA 4UIUA 4UYDA 3JVMA 5EQ1A 4NRBA 4A9OA 3UVXA 3P5OA 5A5PA 5I86A 3JVLA 4PKLA 5L98A 5DFCA 4QEVA 5DBMA 5I88A 5FH7A 5FE1A 4YADA 3QZTA 2OUOA 4NXJA 4UIWA 3RCWA 4QSVA 5J0DA 5BT5A 4A9HA 5IIDA 5C8GA 5FE0A 4UYFB 4Q0NA 4MEOA 3U5KA 5DFDA 5I40A 3GG3A 4J0SA 4TU4A 2F6JA 4LYWA 3LJWA 5D3RA 2NXBA 5E7DA 5FE7A 5E3DA 5DLZA 5E9MA 5IGNA 5E9KA 4HBVA 4OUFA 5LJ2A 5CUDA 5EU1A 4QC3A 3IU5A 5D7XA 4QB3A 4HXOA 4QUUA 5II1A 5LVQA 4LYSA 4UIZA 4HXRA 5D3LA 4CURA 5EV9A 5I1QA 5I29A 2R0VA 5FG5A 3O34A 5IGMA 5DYXA 4YYHA 4CFLA 1F68A 2DVSA 4YYNA 4IORA 4HBWA 4HXSA 5DW2A 4YYGA 4NR7A 5ACYA 2DVRA 5EM3A 1JM4B 5FB1A 4A9KA 5FE4A 5A83A 2OSSA 4NR8A 5D0CA 4ZC9A 4YYJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I7KA 4NYVA 4XUBA 5H1TA 5H1VA 2DKWA 5D3TA 3P1FA 4CUTA 4A9EA 4NR6A 4J0RA 3LQJA 4X2IA 5H85A 5AMEA 5A7CA 5FE8A 3D7CA 4UIYA 5HLSA 4LRGA 4O78A 3UW9A 4O77A 5FE9A 4YBSA 5HCLA 4HXPA 2YDWA 4O7BA 4PCEA 3MB4A 1ZS5A 4IOQA 5ENEA 4QR3A 5HELA 4LZRA 4FLPA 4NS5A 4YAXA 4O7FA 5AD3A 4HBXA 5D26A 4NR5A 2I8NA 1WUMA 5D24A 5IG6A 3K2JA 5LVRA 4NYWA 4A9MA 5LJ1A 5CTLA 2R10A 4O74A 4NYXA 5CQ7A 3U5JA 5D3SA 5E9LA 3U5MA 5C4QA 4AKGA 5IGLA 3O35A 5BT4A 3AADA 4AKNA 4O71A 5LKUA 4C66A 5CQAA 5CY9A 5F5ZA 3MULA 4LZSA 5L96A 5EP7A 4NQMA 5D3PA 5A5OA 5DKCA 4YH3A 1E6IA 4WHUA 1EQFA 4KV4A 5A5QA 4QYLA 5E3GA 4C67A 4N4FA 4MR6A 5ENBA 5LKXA 3LQIA 5L8UA 3O37A 5L8TA 5CQ8A 5KTXA 5K29A 3G0LA 3S92A 3MUKA 3P1CA 4HBYA 4O75A 4QZSA 4UYFA 4O7CA 5CFWA 5CU8A 2MJVB 5EPRA 4HXNA 2EJNA 4Z6HA 4HXMA 4QEWA 5BT3A 4NUCA 4O7AA 4PS5A 4QSRA 5L97A 3P1DA 4TT2A 5CUCA 2D9EA 4N3WA 2E7NA 4O76A 2WP1A 5IBNA 3G0JA 2RFJA 4QBMA 5EWWA 3UV5A 5A5RA 4Z93A 5ENHA 5HENA 4NQNA 2R0YA 3D1BA 3IU6A 4TZ8A 4LDFA 5I7XA 3ONIA 4A9IA 4TT6A 3ZYUA 5A5NA 4MR5A 5CQ3A 4F3IA 3SVHA 3UV2A 4QSSA 1X0JA 3VKHA 4Q0OA 5ENGA 2G4AA 3DWYA 5E0RA 2KTBB 2L5EA 3UV4A 4UYHA 2YELA 4Z6IA 4QSWA 4CFKA 4MEQA 4GPJA 3HMFA 5F1LA 3Q2FA 5DX4A 5FE6A 5F60A 4NUEA 5E9IA 5D3NA 5ENFA 3TLPA 4QUTA 4YK0A 2F6NA 4YYMA 4AKHA 4IR5A 2RO1A 2E3KA 5AD2A 5CQ4A 5I80A 4CUSA 4CUQA 4Z1QA 4QR5A 5FE2A 5ETDA 2D82A 4N4IA 4Z1SA 5CQTA 2R0SA 5C87A 5HM0A 3HMEA 5FFVA 2WP2A 2DATA 5HQ7A 5CUBA 5KHMA 3O33A 2RS9B 5FG6A 4ZW1A 4O7EA 3VKGA 4XY9A 4YABA 5FH6A 3O36A 4QYDA 2YQDA 4XY8A 5CRZA 5E9VA 5HQ6A 2H60A 4QY4A 5COIA 3LXJA 5DKHA 4LYIA 4TZ2A 4HXKA 4OGIA 5EK9A 2E7OA 4A9NA 2RI7A 4WHWA 2YW5A 2FSAA 5A5SA 4MR3A 3JVJA 4YY4A 4YYDA 5A81A 5DLXA 4QSTA 5EVAA 5FBXA 2OO1A 5F36A 4UIXA 5HRXA 3UVWA 3SVFA 5FFWA 4QSQA 5KTUA 5G4RA 4IR4A 3HMHA 3AQAA 3Q2EA 4IOOA 4YYKA 4A9FA 2YEMA 3U5LA 5HFRA 4QR4A 2YYNA 5F62A 5TCMA 5DYUA 5A85A 5II2A 3U5NA 4WIVA 2N9GA 3NXBA 4YH4A 4BW3A 4YBMA 4DONA 2LSPB 4ALGA 2L84A 1WUGA 4HXLA 5FFYA 5EPBA 5CGPA 4NUDA 5FDZA 3QZSA 4J3IA 4PY6A 5EICA 5CS8A 5EWDA 5ENIA 4NRCA 4QEUA 5LKTA 4J1PA 4NRAA 4BW1A 4CUPA 2DWWA 5D3HA 4LZ2A 4LC2A 5ENCA 5FG4A 5LJ0A 2L85A 2GRCA 4E96A 5H1UA 4XUAA 5EWVA 1N72A 4MR4A 4N4GA 4O70A 4CLBA 3FKMX 3U5PA 5CUAA 5DY7A 5I7YA 3SVGA 5HRVA 4QNSA 5DYAA 5F3AA 4LR6A 4TYLA 5I83A 4TS8A 4UYGA 5D25A 3MQMA 1JSPB 4PCIA 2RNXA 4YATA 5ENJA 5G4SA 5C89A 5D3JA 3I3JA 5CQ5A 5CUEA 5HEMA 5FE5A 4ZQLA 2DVVA 3P1EA 5DYCA 5A82A 2DVQA 4UYEA 5IGKA 2RNYA 3DAIA 4TQNA 4RVRA 5KU3A 4NR4A 5HFQA 3D1DA 5E74A 3MB3A 5CRMA 4TTEA 3LQHA 5DFBA 5F63A 5CP5A 5F1HA 4IR3A 4BW2A 4QSPA 5AMFA 5E9YA 5CZGA 4IR6A 4MEPA 5EGUA 5EISA 4CL9A 5L99A 4O72A 4YY6A 5E73A 5JWMA 5EWHA 5KO4A 5LKZA 5HQ5A 4CUUA 4PTBA 5EA1A 4QC1A 5TB6A 4ALHA 4BJXA 4YYIA 5EPSA 4KCXA 3MXFA 5CQ6A 5CUGA 5JI8A 3UVYA 4A9LA 2YEKA 4QSXA 4YBTA 5C85A 1PUOA 4OGJA 4Y03A 3U5OA 5C7NA 5F2PA 4NR9A 5CPEA 5F25A 5ETBA 4TT4A 5LUUA 4QSUA 5HRWA 4N4HA 5F61A 5EWCA 4UIVA 4KV1A 4XYAA 5I89A 4BW4A 4YC9A 5FE3A 3QZVA 3S91A 5HJCA 5FB0A 3JVKA 4UITA 5DW1A 4BHWA 3ERRA 4A9JA 5KTWA 3UVDA 4TU6A 5DKDA 5EI4A 5FH8A 4MENA 2RNWA 4UIUA 4UYDA 3JVMA 5EQ1A 4NRBA 4A9OA 3UVXA 3P5OA 5A5PA 5I86A 3JVLA 4PKLA 5L98A 5DFCA 4QEVA 5DBMA 5I88A 5FH7A 5FE1A 4YADA 3QZTA 2OUOA 4NXJA 4UIWA 3RCWA 4QSVA 5J0DA 5BT5A 4A9HA 5IIDA 5C8GA 5FE0A 4AI6A 4UYFB 4Q0NA 4MEOA 3U5KA 5DFDA 5I40A 3GG3A 4J0SA 4TU4A 2F6JA 4LYWA 3LJWA 5D3RA 2NXBA 5E7DA 5FE7A 5E3DA 5DLZA 5E9MA 5IGNA 5E9KA 4HBVA 4OUFA 5LJ2A 5CUDA 1ZKRA 5EU1A 4QC3A 3IU5A 5D7XA 4QB3A 4HXOA 4QUUA 5II1A 5LVQA 4LYSA 4UIZA 4HXRA 5D3LA 4CURA 5EV9A 5I1QA 5I29A 2R0VA 5FG5A 3O34A 4AKIA 5IGMA 5DYXA 4YYHA 4CFLA 1F68A 2DVSA 4YYNA 4IORA 4HBWA 4HXSA 5DW2A 4YYGA 4NR7A 5ACYA 2DVRA 5EM3A 1JM4B 5FB1A 4A9KA 5FE4A 5A83A 2OSSA 4NR8A 5D0CA 4ZC9A 4YYJA
chains in the Genus database with same CATH topology
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