4XUAA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with e11919 baz2-icr analogue
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xuaA00
2DVRA 5A81A 5FE8A 4O7BA 5F3AA 4O77A 4A9KA 2R0SA 4O70A 4PKLA 5CQ5A 4A9FA 2RNYA 3LQIA 3O35A 2DVSA 5CGPA 4IR5A 1JSPB 4LZ2A 5DW2A 5L99A 4QR3A 3P5OA 2WP1A 4LDFA 4YYJA 4HXRA 5DFDA 4QEUA 5I80A 5LKUA 2L84A 5CRZA 3K2JA 1WUMA 4UYFB 5D3PA 4A9OA 4HXSA 5HEMA 4PCEA 4Z6HA 5A5RA 5C87A 5IGKA 2R0YA 4LYWA 3MB3A 4GPJA 4QNSA 4HXPA 4PCIA 5CUDA 4O7EA 5KTWA 2YQDA 5ETBA 4NR7A 4YY6A 5LJ1A 4MR3A 5CQ3A 5F63A 5F2PA 5G4RA 4O74A 4MR4A 4MR5A 4IR4A 3JVMA 5HELA 5H1VA 2F6NA 4HXNA 2DVQA 3TLPA 3G0JA 5E9YA 5E9KA 5I40A 4Z93A 5F1HA 5FG6A 4A9HA 5LKTA 4XY9A 5BT4A 4QSRA 5CU8A 5D3NA 3JVKA 3ZYUA 4NR4A 1F68A 5EPSA 5I83A 5BT5A 4QSUA 3JVLA 5CZGA 3AADA 2RS9B 5HRVA 4MEPA 2DKWA 5JI8A 4Q0NA 4TT2A 5KU3A 4CUPA 4HXOA 3FKMX 5I7YA 4NUDA 5E0RA 5ENEA 5C85A 4ALGA 4NQNA 4KCXA 5EI4A 5A5SA 5HQ6A 5L98A 2DWWA 4QSTA 2YELA 3MB4A 4J0SA 4A9IA 5H1TA 5EPBA 5D3RA 2YYNA 2YEKA 4LYSA 5HENA 5LVQA 5EP7A 4YYNA 5HQ5A 5AMEA 4A9MA 5EWCA 5I88A 4XUAA 4YH4A 5DLZA 2NXBA 4QSSA 2RI7A 5A82A 5ENFA 4WHWA 5CPEA 4NS5A 3U5KA 2L85A 3U5MA 4QR5A 5AD3A 3HMFA 3UW9A 5IGLA 4YC9A 5I86A 3HMHA 5HLSA 4J3IA 4O71A 2E7OA 4QB3A 5FH8A 3MQMA 4A9LA 4QUTA 4NR9A 2RFJA 5CQTA 5KTXA 2YW5A 4MENA 4YATA 5C7NA 5FE6A 5EM3A 4Z1QA 2OO1A 3S91A 5E9MA 4N4GA 4CFLA 5HRXA 5F62A 5CQ8A 1X0JA 3DWYA 3NXBA 4YK0A 4QSWA 3SVGA 5E3GA 5LVRA 4YBTA 4Q0OA 5FE1A 4XUBA 5DFCA 4QC3A 5ENCA 4UYGA 4HBVA 3U5OA 4HBXA 4N4IA 4QSPA 5F36A 5FE7A 3O36A 5D3TA 3UVWA 5L8TA 4HXLA 5A5QA 5A85A 5CP5A 4Y03A 3LQJA 4UIWA 5FB1A 5I29A 4ALHA 4NR6A 4WHUA 4UITA 4QY4A 5II2A 4CLBA 4HBWA 5D25A 2YDWA 4NRCA 5E9IA 2G4AA 5L8UA 4QR4A 4YAXA 5D3JA 4NR8A 2FSAA 4CL9A 4O72A 3I3JA 5CUAA 5F61A 5ACYA 5E74A 3IU6A 4YYMA 5CQ4A 4NRBA 4BHWA 5D3HA 5I7XA 5FE2A 3UVDA 3S92A 3QZTA 3HMEA 5C89A 5ENBA 4CUSA 4UIXA 2OSSA 5LKXA 5IG6A 5IBNA 5FE5A 4N4FA 4YBMA 5CFWA 3P1EA 5EPRA 5DFBA 4QZSA 4CFKA 4C66A 2F6JA 5CRMA 5HJCA 5CUGA 5IGNA 5FG4A 3U5LA 5HCLA 2DVVA 5D24A 5ENHA 5LJ0A 4LR6A 3RCWA 5FBXA 5KHMA 5IGMA 5H85A 4QYDA 4NYVA 4UIYA 5E3DA 3UV4A 3D7CA 5D0CA 5FG5A 3MXFA 4PTBA 4NYXA 4CUUA 1ZS5A 3U5PA 2RNWA 2KTBB 3ONIA 4KV4A 3LXJA 5ENGA 3U5NA 4YADA 4YYDA 4MEOA 3SVFA 4UYEA 5CQ6A 4TZ2A 5CY9A 3Q2EA 4TU6A 5AMFA 2N9GA 5DBMA 3U5JA 4O7FA 5F5ZA 3G0LA 5CTLA 5A5NA 3MULA 4NUCA 4E96A 4QUUA 5J0DA 5LUUA 5II1A 5E9LA 4FLPA 5ENJA 5D3LA 4OUFA 4CUQA 2I8NA 4TZ8A 5ETDA 4A9NA 5EVAA 4YABA 5E73A 4O75A 2L5EA 4OGIA 5TB6A 4J1PA 4BW1A 5F25A 3UV5A 5FE4A 5IIDA 2RO1A 5F60A 5JWMA 3QZVA 4LC2A 2R10A 4NR5A 5TCMA 5EA1A 5DLXA 5D26A 5HM0A 5FE0A 5DX4A 4TT6A 4TS8A 3O34A 4HXMA 5G4SA 4UIVA 4O78A 3Q2FA 4YBSA 5F1LA 3P1DA 4QEWA 3UVYA 5E7DA 4Z1SA 3UV2A 5EWDA 5CUEA 5CUBA 5A83A 4C67A 3P1FA 4NQMA 4A9JA 4PS5A 4UYDA 5DYXA 4O7AA 4TQNA 5KO4A 4UYFA 1EQFA 3AQAA 4MEQA 5CUCA 4YYGA 5EWWA 5BT3A 3P1CA 4BJXA 4QBMA 4CURA 4IR6A 5EISA 5HQ7A 2RNXA 2DATA 5A5PA 5I89A 4NYWA 4HBYA 5KTUA 4BW4A 5CQ7A 1E6IA 5DYAA 4NXJA 4DONA 4ZQLA 4N3WA 3O33A 5C8GA 5HFQA 4YYHA 5FDZA 5FE9A 4OGJA 4IOQA 5AD2A 5L97A 5D7XA 4PY6A 4J0RA 5CQAA 2E7NA 2MJVB 4MR6A 4BW2A 4BW3A 5LJ2A 5DYUA 2LSPB 4QSXA 4LZRA 4WIVA 4A9EA 5C4QA 4IORA 5FFYA 3MUKA 5DW1A 5DKCA 4TTEA 1JM4B 5FE3A 5E9VA 5K29A 2YEMA 3DAIA 4RVRA 4X2IA 3O37A 5EV9A 4UYHA 5EWHA 5DYCA 4LYIA 5CS8A 2GRCA 4UIUA 2R0VA 4XYAA 4Z6IA 4YH3A 5FFVA 5EK9A 5EU1A 2D82A 3GG3A 4YYKA 3QZSA 4UIZA 4YY4A 5DY7A 3LQHA 4TT4A 5I1QA 5EWVA 4ZW1A 5HRWA 4NUEA 4TYLA 2D9EA 5FH6A 5DKHA 3JVJA 5ENIA 5A7CA 2H60A 4HXKA 4NRAA 5LKZA 3SVHA 4CUTA 5D3SA 2OUOA 4QSQA 4LZSA 5FB0A 1WUGA 4AKNA 5A5OA 4O76A 2WP2A 4YYIA 5COIA 5H1UA 3LJWA 2E3KA 3UVXA 4QYLA 4TU4A 4QC1A 4XY8A 4KV1A 2I7KA 5L96A 4ZC9A 4F3IA 4QEVA 5DKDA 5EICA 5HFRA 3IU5A 1N72A 4QSVA 4LRGA 4N4HA 4IOOA 5EQ1A 5FFWA 5FH7A 4O7CA 5EGUA 4IR3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DVRA 5A81A 5FE8A 4O7BA 5F3AA 4O77A 4A9KA 2R0SA 4O70A 4PKLA 5CQ5A 4A9FA 2RNYA 3LQIA 3O35A 2DVSA 5CGPA 4IR5A 1JSPB 4LZ2A 5DW2A 5L99A 4AKHA 4QR3A 3P5OA 2WP1A 4LDFA 4YYJA 4HXRA 5DFDA 4QEUA 5I80A 5LKUA 2L84A 5CRZA 3K2JA 1WUMA 4UYFB 5D3PA 4A9OA 4HXSA 5HEMA 4PCEA 4Z6HA 5A5RA 5C87A 5IGKA 2R0YA 4LYWA 3MB3A 4GPJA 4QNSA 4HXPA 4PCIA 5CUDA 4O7EA 4AI6A 5KTWA 2YQDA 5ETBA 4NR7A 4YY6A 5LJ1A 4MR3A 5CQ3A 5F63A 5F2PA 5G4RA 4O74A 4MR4A 4MR5A 4IR4A 3JVMA 5HELA 5H1VA 2F6NA 4HXNA 2DVQA 3TLPA 3G0JA 5E9YA 5E9KA 5I40A 4Z93A 5F1HA 5FG6A 4A9HA 3D1DA 5LKTA 4XY9A 5BT4A 4QSRA 5CU8A 5D3NA 3JVKA 3ZYUA 4NR4A 1F68A 5EPSA 5I83A 5BT5A 4QSUA 3JVLA 5CZGA 3AADA 2RS9B 5HRVA 4MEPA 2DKWA 5JI8A 4Q0NA 4TT2A 5KU3A 4CUPA 4HXOA 3FKMX 5I7YA 4NUDA 5E0RA 5ENEA 5C85A 4ALGA 4NQNA 4KCXA 5EI4A 5A5SA 5HQ6A 5L98A 2DWWA 4QSTA 2YELA 3MB4A 3ERRA 3VKGA 4J0SA 4A9IA 5H1TA 5EPBA 5D3RA 2YYNA 2YEKA 4LYSA 5HENA 5LVQA 5EP7A 4YYNA 5HQ5A 5AMEA 4A9MA 5EWCA 5I88A 4XUAA 4YH4A 5DLZA 2NXBA 4QSSA 2RI7A 5A82A 5ENFA 4WHWA 5CPEA 4NS5A 3U5KA 2L85A 3U5MA 1PUOA 4QR5A 5AD3A 3HMFA 3UW9A 5IGLA 4YC9A 5I86A 3HMHA 5HLSA 4J3IA 4O71A 2E7OA 4QB3A 5FH8A 3MQMA 4A9LA 4QUTA 4NR9A 2RFJA 5CQTA 5KTXA 2YW5A 4MENA 4YATA 5C7NA 5FE6A 5EM3A 4Z1QA 2OO1A 3S91A 5E9MA 4N4GA 4CFLA 5HRXA 5F62A 5CQ8A 1X0JA 3DWYA 3NXBA 4YK0A 4QSWA 3SVGA 5E3GA 5LVRA 4YBTA 4Q0OA 5FE1A 4XUBA 5DFCA 4QC3A 5ENCA 4UYGA 4HBVA 3U5OA 4HBXA 4N4IA 4QSPA 5F36A 5FE7A 3O36A 5D3TA 3UVWA 5L8TA 4HXLA 5A5QA 5A85A 5CP5A 4Y03A 3LQJA 4UIWA 5FB1A 5I29A 4ALHA 4NR6A 4WHUA 4UITA 4QY4A 5II2A 4CLBA 4HBWA 5D25A 4AKIA 2YDWA 4NRCA 5E9IA 2G4AA 5L8UA 4QR4A 4YAXA 5D3JA 4NR8A 2FSAA 4CL9A 4O72A 3I3JA 5CUAA 5F61A 5ACYA 5E74A 3IU6A 4YYMA 5CQ4A 4NRBA 4BHWA 5D3HA 5I7XA 5FE2A 3UVDA 3S92A 3QZTA 3HMEA 5C89A 5ENBA 4CUSA 4UIXA 2OSSA 5LKXA 5IG6A 5IBNA 5FE5A 4N4FA 4YBMA 5CFWA 3P1EA 5EPRA 5DFBA 4QZSA 4CFKA 4C66A 2F6JA 5CRMA 5HJCA 5CUGA 5IGNA 5FG4A 3U5LA 5HCLA 2DVVA 5D24A 5ENHA 5LJ0A 4LR6A 3RCWA 5FBXA 5KHMA 5IGMA 5H85A 4AKGA 4QYDA 4NYVA 4UIYA 5E3DA 3UV4A 3D7CA 5D0CA 5FG5A 3MXFA 4PTBA 4NYXA 4CUUA 1ZS5A 3U5PA 2RNWA 2KTBB 3ONIA 4KV4A 3LXJA 5ENGA 3U5NA 4YADA 4YYDA 4MEOA 3SVFA 4UYEA 5CQ6A 4TZ2A 5CY9A 3Q2EA 4TU6A 5AMFA 2N9GA 5DBMA 3U5JA 4O7FA 5F5ZA 3G0LA 5CTLA 5A5NA 3MULA 4NUCA 4E96A 4QUUA 5J0DA 5LUUA 5II1A 5E9LA 4FLPA 5ENJA 5D3LA 4OUFA 4CUQA 2I8NA 4TZ8A 5ETDA 4A9NA 5EVAA 4YABA 5E73A 4O75A 2L5EA 4OGIA 5TB6A 4J1PA 4BW1A 5F25A 3UV5A 5FE4A 5IIDA 2RO1A 5F60A 5JWMA 3QZVA 4LC2A 2R10A 4NR5A 5TCMA 5EA1A 5DLXA 5D26A 5HM0A 5FE0A 5DX4A 4TT6A 4TS8A 3O34A 4HXMA 5G4SA 4UIVA 4O78A 3Q2FA 4YBSA 5F1LA 3P1DA 4QEWA 3UVYA 5E7DA 4Z1SA 3UV2A 5EWDA 5CUEA 5CUBA 5A83A 4C67A 3P1FA 4NQMA 4A9JA 4PS5A 4UYDA 5DYXA 4O7AA 4TQNA 5KO4A 4UYFA 1EQFA 3AQAA 4MEQA 5CUCA 4YYGA 5EWWA 5BT3A 3P1CA 4BJXA 4QBMA 4CURA 4IR6A 5EISA 5HQ7A 2RNXA 2DATA 5A5PA 5I89A 4NYWA 4HBYA 5KTUA 4BW4A 5CQ7A 1E6IA 5DYAA 4NXJA 4DONA 4ZQLA 3VKHA 4N3WA 3O33A 5C8GA 5HFQA 4YYHA 5FDZA 5FE9A 4OGJA 4IOQA 5AD2A 5L97A 5D7XA 4PY6A 4J0RA 5CQAA 2E7NA 2MJVB 4MR6A 4BW2A 4BW3A 5LJ2A 5DYUA 2LSPB 4QSXA 4LZRA 4WIVA 4A9EA 5C4QA 4IORA 5FFYA 3MUKA 5DW1A 5DKCA 4TTEA 1JM4B 5FE3A 5E9VA 5K29A 2YEMA 3DAIA 4RVRA 4X2IA 3O37A 5EV9A 4UYHA 5EWHA 5DYCA 4LYIA 5CS8A 2GRCA 4UIUA 2R0VA 4XYAA 4Z6IA 4YH3A 5FFVA 5EK9A 5EU1A 2D82A 3GG3A 4YYKA 3QZSA 4UIZA 4YY4A 5DY7A 3LQHA 4TT4A 5I1QA 5EWVA 4ZW1A 5HRWA 4NUEA 4TYLA 2D9EA 5FH6A 5DKHA 3JVJA 5ENIA 5A7CA 2H60A 4HXKA 4NRAA 5LKZA 3SVHA 4CUTA 5D3SA 2OUOA 4QSQA 4LZSA 5FB0A 1WUGA 4AKNA 5A5OA 4O76A 2WP2A 4YYIA 5COIA 2EJNA 5H1UA 3LJWA 2E3KA 3UVXA 3D1BA 4QYLA 4TU4A 4QC1A 4XY8A 4KV1A 2I7KA 5L96A 4ZC9A 4F3IA 4QEVA 5DKDA 5EICA 1ZKRA 5HFRA 3IU5A 1N72A 4QSVA 4LRGA 4N4HA 4IOOA 5EQ1A 5FFWA 5FH7A 4O7CA 5EGUA 4IR3A
chains in the Genus database with same CATH topology
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