4XUAA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with e11919 baz2-icr analogue
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xuaA00
5I7XA 5D0CA 4KV1A 5D26A 2R10A 4MEOA 4XY8A 5E9VA 5E9KA 2DVVA 4ZW1A 5FE3A 4CLBA 5KTWA 4TTEA 5EWDA 4HXKA 4A9EA 4J0SA 5DYCA 5EU1A 4QC3A 4A9NA 2I8NA 5JWMA 5LVRA 5DBMA 5A5OA 5FB1A 4CUPA 3O35A 4NR9A 4QSVA 5EISA 5EV9A 4O74A 4QEVA 4IOQA 5DYAA 5K29A 5CQTA 5KU3A 2DVRA 3QZTA 2OUOA 4O76A 4YH3A 4UIUA 3JVKA 4TU6A 4NYXA 3HMFA 5DFCA 3SVHA 5CUDA 4PCIA 2L5EA 2RI7A 4NYWA 4NRAA 2RNXA 5LVQA 4Q0NA 3U5OA 4ZC9A 4PY6A 2D82A 3HMHA 4UYDA 4CUSA 5IGMA 2YYNA 5DYXA 4QNSA 3QZSA 2G4AA 4LR6A 1JSPB 3UVYA 3LQHA 4J0RA 5EPBA 2YDWA 4IORA 5CRMA 4NR4A 2E7NA 5FG6A 4BHWA 4IR4A 4PCEA 4NQNA 5ETBA 4WHWA 5ENFA 5A85A 4BW1A 2D9EA 3O33A 4A9JA 4TT2A 5AMFA 4HXOA 5D25A 5KO4A 4XY9A 4PKLA 4KCXA 2I7KA 5D3JA 5DFDA 5CPEA 4YATA 4MENA 5H1VA 5G4RA 2DWWA 4N4HA 5J0DA 5EWWA 5CQ6A 5E7DA 5CQ7A 2RO1A 4C67A 4YABA 4O77A 3AQAA 3ONIA 5LKTA 1JM4B 4NYVA 5EPSA 5FH8A 5L8TA 4BW2A 2L85A 5CFWA 3S91A 4YYNA 2YEMA 4TT6A 5ENGA 5DLZA 4QSUA 5HQ5A 4IR6A 5F2PA 4CUTA 2FSAA 4O7CA 5HELA 5C8GA 3UVDA 4A9IA 5BT5A 4IOOA 2NXBA 4YYKA 4UIYA 3U5PA 4TT4A 5CQ5A 5D3SA 5A5SA 3IU6A 4FLPA 5HRVA 5DYUA 3O37A 4NUCA 4YBMA 5COIA 4TQNA 4YYJA 4NS5A 3HMEA 4YY4A 5CUGA 5C89A 3D7CA 3P1CA 5H85A 2OSSA 5DFBA 4YYIA 2RNWA 5E9YA 4UYFB 4QSWA 2RNYA 5FE8A 4UIXA 5I89A 4TYLA 2LSPB 4MEPA 4QSSA 3UVWA 4ZQLA 3GG3A 4UIWA 5ENBA 3UVXA 4TU4A 4YK0A 4Z6IA 3DAIA 5EWCA 5FE5A 4Q0OA 4N3WA 5II2A 4O71A 5DW2A 4CUUA 4YYMA 5I80A 4LDFA 4OGIA 5D3NA 4HBYA 4O70A 5CUCA 3LQJA 3K2JA 4LZRA 3JVJA 4NQMA 4NR6A 4KV4A 4F3IA 3AADA 5FE4A 4NXJA 5FH6A 4HXMA 5EWHA 5L8UA 4Z1SA 4MR3A 4Z1QA 5ENIA 5FH7A 5LJ0A 3LJWA 4QZSA 5IBNA 4A9MA 3UW9A 5L99A 5C4QA 2DATA 5D3TA 3MQMA 3O34A 4AKNA 2E7OA 4CFLA 4ALGA 3MUKA 2YELA 4O78A 5KTXA 5A82A 5E0RA 5II1A 4QUTA 4O7AA 2R0SA 4YBSA 5CZGA 4BW3A 5L97A 3DWYA 2N9GA 2MJVB 5A83A 5E3GA 5CP5A 5A5RA 3JVMA 4YY6A 5E9IA 5HRWA 4QSRA 5E74A 5F25A 5CU8A 5BT3A 5L96A 2YW5A 4NR5A 5LKXA 4NRBA 4A9FA 4HBWA 4MEQA 5FE0A 5F63A 2OO1A 4UYEA 4TZ8A 5L98A 4QR5A 4YYHA 5ENJA 3MB3A 2KTBB 3P5OA 5HFQA 3MB4A 4UITA 5CTLA 3QZVA 4A9KA 4QYDA 4YAXA 2RS9B 5HQ7A 5ACYA 1X0JA 5F1HA 3U5NA 5FFVA 5DY7A 3U5MA 5EPRA 4X2IA 5HENA 5EWVA 5DKCA 2WP1A 5FG5A 2YQDA 3SVFA 5I40A 4HBVA 3JVLA 3P1FA 1E6IA 4HXNA 4NUEA 4E96A 3U5JA 4GPJA 4UIVA 4NR8A 5CGPA 4QEWA 5LKUA 4YADA 4A9OA 4LYIA 2YEKA 4QSPA 5CQ4A 5H1TA 4HXSA 3UV5A 5D3PA 4C66A 3MXFA 5ENCA 4N4IA 4YH4A 3U5LA 4O7EA 5DKDA 5FDZA 5I29A 4CURA 5CS8A 4OGJA 4QY4A 4XUBA 5HEMA 3Q2EA 5DW1A 5DLXA 3SVGA 5FBXA 5C85A 5D3HA 2R0VA 5IGKA 2F6NA 5FB0A 4HXRA 5A5NA 5F5ZA 5HQ6A 5FFWA 4O7FA 5E73A 4CUQA 5D3RA 5C87A 5A5QA 5CQAA 5TCMA 5E9LA 5JI8A 5LUUA 3IU5A 5CQ3A 3LXJA 4A9LA 5CRZA 1N72A 4RVRA 5EM3A 1EQFA 5CUEA 4O72A 4PS5A 4WIVA 5FE9A 4O7BA 4LRGA 4MR5A 5IGNA 5C7NA 5F60A 4J3IA 5A81A 4J1PA 4QR3A 4NUDA 5EVAA 3MULA 5F3AA 3I3JA 4QC1A 5EICA 4BW4A 4CL9A 5LJ1A 5EGUA 5TB6A 4N4FA 5BT4A 5EI4A 4LC2A 4DONA 3Q2FA 4HXPA 2H60A 2RFJA 5HJCA 5I86A 2DVQA 4BJXA 4MR6A 1WUMA 4LYSA 3G0LA 4TS8A 2WP2A 5D3LA 5D7XA 5FE7A 3U5KA 5H1UA 5LJ2A 4HXLA 4IR3A 5D24A 4XYAA 4QUUA 5FE6A 5ETDA 5KHMA 5F61A 4LZSA 3UV2A 4QSXA 4UYFA 5E9MA 3P1DA 5F62A 4QEUA 5IGLA 4Z93A 4OUFA 5AD2A 5IIDA 5CUBA 2L84A 5AMEA 4QSQA 3TLPA 5FFYA 5A7CA 4QR4A 3P1EA 5I83A 4YYGA 3O36A 5KTUA 5HLSA 4LZ2A 5G4SA 3FKMX 5HCLA 5HRXA 5A5PA 4IR5A 5DX4A 3S92A 5IG6A 4MR4A 4QB3A 5F36A 5LKZA 5I7YA 4NR7A 5EK9A 2DVSA 4YBTA 3G0JA 3UV4A 4QBMA 4Y03A 5I88A 1F68A 5FE1A 3NXBA 4UYHA 4HBXA 3LQIA 2DKWA 4PTBA 5EA1A 4QSTA 5HFRA 4ALHA 4WHUA 5E3DA 4QYLA 4A9HA 4LYWA 4UIZA 5EP7A 5HM0A 5CQ8A 2F6JA 5AD3A 4N4GA 5FE2A 2E3KA 4Z6HA 4CFKA 5F1LA 2R0YA 4YC9A 4O75A 5CY9A 5CUAA 2GRCA 5EQ1A 5ENEA 4XUAA 3RCWA 4TZ2A 4NRCA 5DKHA 4UYGA 5I1QA 5ENHA 1WUGA 5FG4A 3ZYUA 4YYDA 1ZS5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I7XA 5D0CA 4KV1A 5D26A 2R10A 4MEOA 4XY8A 5E9VA 5E9KA 2DVVA 4ZW1A 5FE3A 4CLBA 5KTWA 4TTEA 5EWDA 4HXKA 4A9EA 4J0SA 5DYCA 5EU1A 4QC3A 4A9NA 2I8NA 5JWMA 5LVRA 5DBMA 5A5OA 5FB1A 4CUPA 3O35A 4NR9A 4QSVA 5EISA 5EV9A 3VKHA 4O74A 4QEVA 4IOQA 5DYAA 5K29A 5CQTA 5KU3A 2DVRA 3QZTA 2OUOA 4O76A 4YH3A 4UIUA 3JVKA 4TU6A 4NYXA 3HMFA 5DFCA 3SVHA 5CUDA 4PCIA 2L5EA 2RI7A 4NYWA 4NRAA 2RNXA 5LVQA 4Q0NA 3U5OA 4ZC9A 4PY6A 2D82A 3HMHA 4UYDA 4CUSA 5IGMA 2YYNA 5DYXA 4QNSA 3QZSA 2G4AA 4LR6A 1JSPB 3UVYA 3LQHA 4J0RA 5EPBA 2YDWA 2EJNA 4IORA 5CRMA 4NR4A 2E7NA 5FG6A 4BHWA 4IR4A 4PCEA 4NQNA 5ETBA 4WHWA 5ENFA 5A85A 4BW1A 2D9EA 1PUOA 3O33A 4A9JA 4TT2A 5AMFA 4HXOA 5D25A 5KO4A 4XY9A 4PKLA 4KCXA 2I7KA 5D3JA 5DFDA 5CPEA 4YATA 4MENA 5H1VA 5G4RA 2DWWA 4N4HA 5J0DA 5EWWA 4AKIA 5CQ6A 5E7DA 5CQ7A 2RO1A 4C67A 4YABA 3D1DA 4O77A 3AQAA 3ONIA 5LKTA 1JM4B 4NYVA 5EPSA 5FH8A 5L8TA 4BW2A 2L85A 5CFWA 3S91A 4YYNA 2YEMA 4TT6A 5ENGA 5DLZA 4QSUA 5HQ5A 4IR6A 5F2PA 4CUTA 2FSAA 4O7CA 5HELA 5C8GA 3UVDA 4A9IA 5BT5A 4IOOA 2NXBA 4YYKA 4UIYA 3U5PA 4TT4A 5CQ5A 5D3SA 5A5SA 3IU6A 4FLPA 5HRVA 5DYUA 3O37A 4NUCA 4YBMA 3ERRA 5COIA 4TQNA 4YYJA 4NS5A 3HMEA 4YY4A 5CUGA 5C89A 3D7CA 3P1CA 5H85A 1ZKRA 2OSSA 5DFBA 4YYIA 2RNWA 5E9YA 4UYFB 4QSWA 2RNYA 5FE8A 4UIXA 5I89A 4TYLA 2LSPB 4MEPA 4QSSA 3UVWA 4ZQLA 3GG3A 4UIWA 5ENBA 3UVXA 4TU4A 4YK0A 4Z6IA 3DAIA 5EWCA 5FE5A 4AKHA 4Q0OA 4N3WA 5II2A 4O71A 3VKGA 5DW2A 4CUUA 4YYMA 5I80A 4LDFA 4OGIA 5D3NA 4HBYA 4O70A 5CUCA 3LQJA 3K2JA 4LZRA 3JVJA 4NQMA 4NR6A 4KV4A 4F3IA 3AADA 5FE4A 4NXJA 5FH6A 4HXMA 5EWHA 5L8UA 4Z1SA 4MR3A 4Z1QA 5ENIA 5FH7A 5LJ0A 3LJWA 4QZSA 5IBNA 4A9MA 3UW9A 5L99A 5C4QA 2DATA 5D3TA 3MQMA 3O34A 4AKNA 2E7OA 4CFLA 4ALGA 3MUKA 2YELA 4O78A 5KTXA 5A82A 5E0RA 5II1A 4QUTA 4O7AA 2R0SA 4YBSA 5CZGA 4BW3A 5L97A 3DWYA 2N9GA 2MJVB 5A83A 5E3GA 5CP5A 5A5RA 3JVMA 4YY6A 5E9IA 5HRWA 4QSRA 5E74A 5F25A 5CU8A 5BT3A 5L96A 2YW5A 4NR5A 5LKXA 4NRBA 4A9FA 4HBWA 4MEQA 5FE0A 5F63A 2OO1A 4UYEA 4TZ8A 5L98A 4QR5A 4YYHA 5ENJA 3MB3A 2KTBB 3P5OA 5HFQA 3MB4A 4UITA 5CTLA 3QZVA 4A9KA 4QYDA 4YAXA 2RS9B 5HQ7A 5ACYA 1X0JA 5F1HA 3U5NA 5FFVA 4AKGA 5DY7A 3U5MA 5EPRA 4X2IA 5HENA 5EWVA 5DKCA 2WP1A 5FG5A 2YQDA 3SVFA 5I40A 4HBVA 3JVLA 3P1FA 1E6IA 4HXNA 4NUEA 4E96A 3U5JA 4GPJA 4UIVA 4NR8A 5CGPA 4QEWA 5LKUA 4YADA 4A9OA 4LYIA 2YEKA 4QSPA 5CQ4A 5H1TA 4HXSA 3UV5A 5D3PA 4C66A 3MXFA 5ENCA 4N4IA 4YH4A 3U5LA 4O7EA 5DKDA 5FDZA 5I29A 4CURA 5CS8A 4OGJA 4QY4A 4XUBA 5HEMA 4AI6A 3Q2EA 5DW1A 5DLXA 3SVGA 5FBXA 5C85A 5D3HA 2R0VA 5IGKA 2F6NA 5FB0A 4HXRA 5A5NA 5F5ZA 5HQ6A 5FFWA 4O7FA 5E73A 4CUQA 5D3RA 5C87A 5A5QA 5CQAA 5TCMA 5E9LA 5JI8A 5LUUA 3IU5A 5CQ3A 3LXJA 4A9LA 5CRZA 1N72A 4RVRA 5EM3A 1EQFA 5CUEA 4O72A 4PS5A 4WIVA 5FE9A 4O7BA 4LRGA 4MR5A 5IGNA 5C7NA 5F60A 3D1BA 4J3IA 5A81A 4J1PA 4QR3A 4NUDA 5EVAA 3MULA 5F3AA 3I3JA 4QC1A 5EICA 4BW4A 4CL9A 5LJ1A 5EGUA 5TB6A 4N4FA 5BT4A 5EI4A 4LC2A 4DONA 3Q2FA 4HXPA 2H60A 2RFJA 5HJCA 5I86A 2DVQA 4BJXA 4MR6A 1WUMA 4LYSA 3G0LA 4TS8A 2WP2A 5D3LA 5D7XA 5FE7A 3U5KA 5H1UA 5LJ2A 4HXLA 4IR3A 5D24A 4XYAA 4QUUA 5FE6A 5ETDA 5KHMA 5F61A 4LZSA 3UV2A 4QSXA 4UYFA 5E9MA 3P1DA 5F62A 4QEUA 5IGLA 4Z93A 4OUFA 5AD2A 5IIDA 5CUBA 2L84A 5AMEA 4QSQA 3TLPA 5FFYA 5A7CA 4QR4A 3P1EA 5I83A 4YYGA 3O36A 5KTUA 5HLSA 4LZ2A 5G4SA 3FKMX 5HCLA 5HRXA 5A5PA 4IR5A 5DX4A 3S92A 5IG6A 4MR4A 4QB3A 5F36A 5LKZA 5I7YA 4NR7A 5EK9A 2DVSA 4YBTA 3G0JA 3UV4A 4QBMA 4Y03A 5I88A 1F68A 5FE1A 3NXBA 4UYHA 4HBXA 3LQIA 2DKWA 4PTBA 5EA1A 4QSTA 5HFRA 4ALHA 4WHUA 5E3DA 4QYLA 4A9HA 4LYWA 4UIZA 5EP7A 5HM0A 5CQ8A 2F6JA 5AD3A 4N4GA 5FE2A 2E3KA 4Z6HA 4CFKA 5F1LA 2R0YA 4YC9A 4O75A 5CY9A 5CUAA 2GRCA 5EQ1A 5ENEA 4XUAA 3RCWA 4TZ2A 4NRCA 5DKHA 4UYGA 5I1QA 5ENHA 1WUGA 5FG4A 3ZYUA 4YYDA 1ZS5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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