4XUAA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with e11919 baz2-icr analogue
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
b'SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Structure Enabled Design of BAZ2-ICR, A Chemical Probe Targeting the Bromodomains of BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4xuaA00
4NS5A 4Y03A 5F25A 4QUTA 3QZVA 5A83A 4NYWA 5DYUA 1N72A 5I83A 5A5OA 4FLPA 2OSSA 5CQ8A 5EWDA 3JVJA 3U5NA 1F68A 2E3KA 5KU3A 5D24A 5FE0A 4O70A 2LSPB 4CURA 2WP1A 4YH4A 5HEMA 4UYEA 5HLSA 4UIUA 5FE7A 4HXSA 4UYGA 5CRMA 5A5SA 5HRWA 4QR4A 2YW5A 5EP7A 2OUOA 4F3IA 1WUMA 3P1FA 4BW1A 4QSRA 5F61A 4XYAA 4N3WA 5D3SA 5F2PA 5LKUA 4WHWA 4OGJA 5I86A 3LXJA 4UYHA 3U5KA 4LZSA 4LC2A 3U5MA 3QZTA 4MR3A 5A5RA 2DVSA 3JVMA 1JM4B 5BT4A 4A9NA 4MENA 4QSSA 2H60A 5FG6A 5L96A 5EWCA 5CY9A 3G0JA 4QY4A 4ALGA 2R0SA 5ACYA 3AQAA 3LJWA 3MULA 5EWWA 5FBXA 4TYLA 5CUAA 4PCIA 3MB3A 5HQ5A 5I88A 5D7XA 2G4AA 3S91A 4A9IA 4O75A 4QSWA 5DY7A 3SVGA 4HXKA 5D0CA 5FE3A 4QB3A 3SVHA 5EVAA 3P5OA 4PKLA 5FB0A 4YY4A 2OO1A 5F1HA 5EISA 4C66A 4YYDA 4O7AA 3P1DA 4UITA 4WIVA 2YEKA 4O78A 4BW4A 5IGMA 4DONA 3S92A 4RVRA 5CQ7A 5FH6A 4OUFA 5DFCA 5D3HA 5DLZA 5BT5A 5CUGA 4IORA 4A9EA 5A5QA 2DVRA 2YEMA 2KTBB 4O71A 5CQ5A 4YYNA 5KTWA 3UW9A 5EPRA 2RNXA 4YADA 5A5PA 3O37A 3P1EA 5H85A 5I29A 2L5EA 4N4GA 4UIWA 3GG3A 5CQTA 5AD3A 4QEWA 5EA1A 5C89A 3HMHA 5EICA 4QSUA 4YYIA 5C85A 3DAIA 4TU6A 5DFDA 4IR3A 5ENCA 5IBNA 4QSVA 3U5LA 5F3AA 4MR6A 5D3JA 4NR4A 3Q2EA 4TT6A 5D3NA 4Z93A 4XY9A 5CTLA 4MR4A 2RFJA 4J0RA 4NR5A 5LJ1A 5DKDA 5F62A 5D3LA 5JI8A 3NXBA 3UVYA 4TT2A 2R0YA 5CFWA 3AADA 4UIXA 4CFLA 4YYMA 5AD2A 4QC1A 4YAXA 5ENBA 4ALHA 5HQ6A 3JVKA 5CS8A 4A9LA 4GPJA 4NUCA 4ZC9A 3RCWA 5E3GA 3U5JA 2MJVB 4HBYA 5FFWA 5C87A 5EPSA 5F60A 5HFQA 5EV9A 5H1VA 4O72A 4YC9A 3LQHA 4TZ8A 4HXPA 4BJXA 5ENIA 4UYDA 5FDZA 4CUUA 5C7NA 5CUCA 4MEOA 1WUGA 2DVVA 5DFBA 5HRVA 2D82A 5L98A 4TZ2A 4HXLA 5LJ0A 4TQNA 5LUUA 4AKNA 4CUSA 5DLXA 3O33A 4NR9A 5DYCA 5EK9A 4X2IA 4WHUA 5LKZA 4QSTA 4A9MA 5G4SA 4O7CA 4Z1SA 4IR4A 5EGUA 4NYVA 5J0DA 2N9GA 5IG6A 4E96A 4NUDA 5CUBA 4A9HA 2RO1A 4LZ2A 4HXOA 5E9IA 4A9FA 5HCLA 3IU5A 5D26A 3MXFA 2RNYA 5A82A 5LKXA 1X0JA 4CFKA 2L85A 4QR5A 5CZGA 4TS8A 5DX4A 5LKTA 4YYJA 4N4IA 2YDWA 5ENGA 4A9KA 5KO4A 4YABA 3DWYA 4YBMA 4QUUA 4J1PA 5I7XA 5F36A 5D3RA 5ENFA 5C4QA 5LVRA 4TT4A 2WP2A 4O7FA 4UIYA 3TLPA 2DATA 5F1LA 5FE5A 5I89A 5D3TA 4YATA 4LDFA 4QSQA 5HELA 5I80A 4UIVA 5AMFA 4HBWA 5F5ZA 5I1QA 1E6IA 4J3IA 5FFYA 3UV5A 4TU4A 4CUQA 5CQ4A 5AMEA 5E74A 4NR8A 4BW3A 1JSPB 5H1TA 5E9KA 5DYAA 4XUBA 3U5OA 1EQFA 4LYWA 5G4RA 5IGLA 2L84A 3O36A 4QSXA 2RI7A 5F63A 5CQ6A 5FE2A 3MB4A 4NRBA 4Z6HA 5H1UA 5CRZA 3QZSA 2YYNA 2R0VA 4MR5A 4IOOA 4NQMA 4N4HA 4QNSA 5K29A 4TTEA 5E9VA 5FH8A 5E73A 5E0RA 5FG4A 3O34A 5LJ2A 5L97A 4IOQA 5CQ3A 5CUEA 4O76A 4NRAA 4NQNA 3Q2FA 4CL9A 4LR6A 5A85A 5EWHA 3G0LA 4NUEA 4UYFB 5C8GA 4XUAA 4LYSA 5JWMA 4O7BA 5FH7A 5FFVA 3UVWA 3UVXA 2NXBA 2E7OA 5IGKA 2RNWA 4N4FA 2D9EA 2F6JA 4QYLA 5ETDA 5FE4A 4PY6A 3O35A 5EI4A 2I7KA 5BT3A 4ZQLA 4BW2A 5A7CA 4YK0A 5ETBA 5TCMA 4OGIA 4IR5A 4QYDA 5D25A 5TB6A 5E3DA 5E9YA 4PCEA 5DYXA 5KTUA 5HENA 4PTBA 4LYIA 5FG5A 5II1A 3MUKA 5E9MA 4HXNA 5CPEA 5DW2A 5LVQA 4KV4A 4LZRA 5IIDA 3D7CA 4NXJA 4Z6IA 4QSPA 5COIA 5DKCA 3JVLA 5E7DA 5IGNA 5FB1A 3SVFA 3HMFA 5I7YA 4Q0OA 2GRCA 4QEUA 4MEPA 2DKWA 4YYKA 4NR6A 5ENJA 4HBVA 5HM0A 5CU8A 4CLBA 3P1CA 4YYGA 5D3PA 5L8UA 5KHMA 5DKHA 5A5NA 4A9JA 5FE1A 3HMEA 2DWWA 5EWVA 2I8NA 4CUPA 4O7EA 2R10A 4QC3A 4NR7A 4YYHA 4O77A 5I40A 5E9LA 3LQJA 4QBMA 4UYFA 4QZSA 2E7NA 5FE9A 5EQ1A 1ZS5A 4XY8A 4HXMA 4QEVA 4HXRA 5HQ7A 5FE8A 5II2A 4LRGA 5ENEA 4CUTA 4YBTA 2YQDA 4KCXA 2FSAA 3U5PA 4A9OA 3ZYUA 4PS5A 4NYXA 2RS9B 4J0SA 2DVQA 4BHWA 5HRXA 3K2JA 5CGPA 3FKMX 4QR3A 4YBSA 3UV2A 2F6NA 3ONIA 5CQAA 5EU1A 3UVDA 4ZW1A 2YELA 4MEQA 5ENHA 5HFRA 4IR6A 4O74A 3MQMA 4HBXA 5CP5A 3I3JA 5L99A 4YH3A 5HJCA 4Z1QA 4YY6A 5A81A 3LQIA 5CUDA 5EPBA 4KV1A 5L8TA 4Q0NA 4C67A 5DBMA 3UV4A 4UIZA 3IU6A 4NRCA 5KTXA 5EM3A 5DW1A 5FE6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NS5A 4Y03A 5F25A 4QUTA 3QZVA 5A83A 4NYWA 5DYUA 1N72A 5I83A 5A5OA 4FLPA 2OSSA 5CQ8A 5EWDA 3JVJA 3U5NA 1F68A 2E3KA 5KU3A 5D24A 5FE0A 4O70A 2LSPB 4CURA 2WP1A 4YH4A 5HEMA 4UYEA 5HLSA 4UIUA 5FE7A 4HXSA 4UYGA 5CRMA 5A5SA 3ERRA 5HRWA 4QR4A 4AKHA 2YW5A 5EP7A 2OUOA 4F3IA 1WUMA 3P1FA 4BW1A 4QSRA 1ZKRA 5F61A 4XYAA 4N3WA 5D3SA 5F2PA 5LKUA 4WHWA 4OGJA 5I86A 3LXJA 4UYHA 3U5KA 4LZSA 4LC2A 3U5MA 3QZTA 4MR3A 5A5RA 2DVSA 3JVMA 1JM4B 5BT4A 4A9NA 4MENA 4QSSA 2H60A 5FG6A 5L96A 5EWCA 5CY9A 3G0JA 4QY4A 4ALGA 2R0SA 5ACYA 3AQAA 3LJWA 3MULA 5EWWA 5FBXA 4TYLA 5CUAA 4PCIA 3MB3A 5HQ5A 5I88A 5D7XA 2G4AA 3S91A 4A9IA 4O75A 4QSWA 5DY7A 3SVGA 4HXKA 5D0CA 5FE3A 4QB3A 3SVHA 5EVAA 3P5OA 4PKLA 5FB0A 4YY4A 2OO1A 5F1HA 5EISA 4C66A 4YYDA 4O7AA 3P1DA 4UITA 4WIVA 2YEKA 4O78A 4BW4A 5IGMA 4DONA 3S92A 4RVRA 5CQ7A 5FH6A 4OUFA 5DFCA 5D3HA 5DLZA 5BT5A 5CUGA 4IORA 4A9EA 5A5QA 2DVRA 2YEMA 2KTBB 4O71A 5CQ5A 4YYNA 5KTWA 3UW9A 5EPRA 2RNXA 4YADA 5A5PA 3O37A 3P1EA 5H85A 5I29A 2L5EA 4N4GA 4UIWA 3GG3A 5CQTA 5AD3A 4QEWA 5EA1A 5C89A 3HMHA 5EICA 4QSUA 4YYIA 5C85A 3DAIA 4TU6A 5DFDA 4IR3A 5ENCA 5IBNA 4QSVA 3U5LA 5F3AA 4MR6A 5D3JA 4NR4A 3Q2EA 4TT6A 5D3NA 4Z93A 4XY9A 5CTLA 4MR4A 2RFJA 4J0RA 4NR5A 5LJ1A 5DKDA 5F62A 5D3LA 5JI8A 3NXBA 3UVYA 4TT2A 2R0YA 5CFWA 3AADA 4UIXA 4CFLA 4YYMA 5AD2A 4QC1A 4YAXA 5ENBA 4ALHA 5HQ6A 3JVKA 5CS8A 4A9LA 4GPJA 4NUCA 4ZC9A 3RCWA 5E3GA 3U5JA 2MJVB 4HBYA 5FFWA 5C87A 5EPSA 5F60A 5HFQA 5EV9A 5H1VA 4O72A 4YC9A 3LQHA 4TZ8A 4HXPA 4BJXA 5ENIA 4UYDA 5FDZA 4CUUA 5C7NA 5CUCA 4MEOA 1WUGA 2DVVA 5DFBA 5HRVA 2D82A 5L98A 4TZ2A 4HXLA 5LJ0A 4TQNA 5LUUA 4AKNA 4CUSA 5DLXA 3O33A 4NR9A 5DYCA 5EK9A 4X2IA 4WHUA 5LKZA 4QSTA 4A9MA 2EJNA 5G4SA 4O7CA 4Z1SA 4IR4A 5EGUA 4NYVA 5J0DA 2N9GA 5IG6A 4E96A 4NUDA 5CUBA 4A9HA 2RO1A 4LZ2A 4HXOA 5E9IA 4A9FA 5HCLA 3IU5A 5D26A 3MXFA 2RNYA 5A82A 5LKXA 1X0JA 4CFKA 2L85A 4QR5A 5CZGA 4TS8A 5DX4A 5LKTA 4YYJA 4N4IA 2YDWA 5ENGA 4A9KA 5KO4A 4YABA 4AKGA 3DWYA 4YBMA 4QUUA 4J1PA 5I7XA 5F36A 5D3RA 5ENFA 5C4QA 5LVRA 4TT4A 2WP2A 4O7FA 4UIYA 3TLPA 2DATA 5F1LA 5FE5A 5I89A 5D3TA 4YATA 4LDFA 4QSQA 5HELA 5I80A 4UIVA 5AMFA 4HBWA 4AKIA 5F5ZA 5I1QA 1E6IA 4J3IA 5FFYA 3UV5A 4TU4A 4CUQA 5CQ4A 5AMEA 5E74A 4NR8A 4BW3A 1JSPB 5H1TA 5E9KA 5DYAA 4XUBA 3U5OA 1EQFA 4LYWA 5G4RA 5IGLA 2L84A 3O36A 4QSXA 2RI7A 5F63A 5CQ6A 5FE2A 3MB4A 4NRBA 4Z6HA 5H1UA 1PUOA 5CRZA 3QZSA 2YYNA 2R0VA 4MR5A 4IOOA 4NQMA 4N4HA 4QNSA 5K29A 3VKHA 4TTEA 5E9VA 5FH8A 5E73A 5E0RA 5FG4A 3O34A 5LJ2A 5L97A 4IOQA 5CQ3A 5CUEA 4O76A 4NRAA 4NQNA 3Q2FA 4CL9A 4LR6A 5A85A 5EWHA 3G0LA 4NUEA 4UYFB 5C8GA 4XUAA 4LYSA 5JWMA 4O7BA 5FH7A 5FFVA 3UVWA 3UVXA 2NXBA 2E7OA 5IGKA 2RNWA 4N4FA 2D9EA 2F6JA 4QYLA 5ETDA 5FE4A 4PY6A 3O35A 5EI4A 2I7KA 5BT3A 4ZQLA 4BW2A 5A7CA 4YK0A 5ETBA 5TCMA 4OGIA 4IR5A 4QYDA 5D25A 5TB6A 5E3DA 5E9YA 3VKGA 4PCEA 5DYXA 5KTUA 5HENA 4PTBA 4LYIA 5FG5A 5II1A 3MUKA 5E9MA 4HXNA 5CPEA 5DW2A 5LVQA 4KV4A 4LZRA 5IIDA 3D7CA 4NXJA 4Z6IA 4QSPA 5COIA 5DKCA 3JVLA 5E7DA 5IGNA 5FB1A 3SVFA 3HMFA 5I7YA 4Q0OA 2GRCA 4QEUA 4MEPA 2DKWA 4YYKA 4NR6A 5ENJA 4HBVA 3D1BA 5HM0A 5CU8A 4CLBA 3P1CA 4YYGA 5D3PA 5L8UA 5KHMA 5DKHA 5A5NA 4A9JA 3D1DA 5FE1A 3HMEA 2DWWA 5EWVA 2I8NA 4CUPA 4O7EA 2R10A 4QC3A 4NR7A 4YYHA 4O77A 5I40A 5E9LA 3LQJA 4QBMA 4UYFA 4QZSA 2E7NA 5FE9A 5EQ1A 1ZS5A 4XY8A 4HXMA 4QEVA 4HXRA 5HQ7A 5FE8A 5II2A 4LRGA 5ENEA 4CUTA 4YBTA 2YQDA 4KCXA 2FSAA 3U5PA 4A9OA 3ZYUA 4PS5A 4NYXA 2RS9B 4J0SA 2DVQA 4BHWA 5HRXA 3K2JA 5CGPA 3FKMX 4QR3A 4YBSA 3UV2A 2F6NA 3ONIA 5CQAA 5EU1A 3UVDA 4ZW1A 2YELA 4MEQA 5ENHA 5HFRA 4IR6A 4O74A 3MQMA 4HBXA 5CP5A 3I3JA 5L99A 4YH3A 5HJCA 4Z1QA 4YY6A 5A81A 3LQIA 5CUDA 5EPBA 4KV1A 5L8TA 4Q0NA 4C67A 5DBMA 4AI6A 3UV4A 4UIZA 3IU6A 4NRCA 5KTXA 5EM3A 5DW1A 5FE6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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