4LZ2A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2a
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
100
structure length
100
Chain Sequence
LTFCEIILMEMESHDAAWPFLEPVNPRLVSGYRRIIKNPMDFSTMRERLLRGGYTSSEEFAADALLVFDNCQTFNEDDSEVGKAGHIMRRFFESRWEEFY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2A
publication title Molecular basis of histone tail recognition by human TIP5 PHD finger and bromodomain of the chromatin remodeling complex NoRC.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 35
structure length 100
sequence length 100
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4lz2A00
3RCWA 5CY9A 4Z1SA 4QYLA 3MXFA 5KTUA 5L8UA 5IBNA 5F2PA 4LZRA 4IR6A 5DW2A 5A82A 5EM3A 5FFYA 3FKMX 4QC1A 5A85A 5FE6A 3IU5A 3O36A 4HXMA 5E9LA 4LR6A 5TB6A 5FE1A 1X0JA 4UYGA 5ENIA 3O33A 5LKXA 5I83A 5FFVA 4UYFB 3SVHA 5KTWA 5FE7A 5I89A 3P5OA 3U5JA 5D3RA 5LUUA 5A5SA 4C67A 4QSRA 4QR3A 5A83A 5CTLA 5EVAA 5FE9A 5IGLA 5CQ4A 5CQ8A 4YYKA 5EQ1A 2NXBA 5DLXA 4KV1A 4LZ2A 5ENJA 5CFWA 5E73A 5EPBA 3JVKA 5D3HA 5D25A 5HQ5A 4QSVA 4HXLA 3SVGA 4DONA 4UYEA 5D3JA 5DFCA 5E9IA 4O7BA 4N3WA 3P1DA 5IGKA 3LXJA 4J0RA 5C8GA 4PCEA 3Q2EA 5CQ7A 5L97A 4NS5A 5HELA 4QY4A 4HXPA 3U5OA 3JVJA 5DKCA 2D82A 5DFBA 5A5QA 3UVXA 5L99A 5E9KA 2F6JA 4HBVA 5EI4A 2YDWA 4BHWA 4QSUA 4IORA 3LJWA 5F3AA 5HRVA 5E9VA 5LJ1A 2R0SA 4NR9A 5FE3A 2L5EA 4QUTA 3S92A 2OO1A 5A81A 5E9MA 3JVMA 5JWMA 5TCMA 4YYDA 3DAIA 3UVDA 5D26A 4CUUA 3HMEA 3AQAA 5ETBA 2E3KA 2YYNA 3I3JA 4MR3A 4ZQLA 5CUDA 5AD3A 3UVWA 3UV4A 5CQ5A 5HRXA 5EWCA 4OGIA 4AKNA 5F5ZA 4YATA 4YABA 5HCLA 4HBYA 5DBMA 5IIDA 3O37A 4HBWA 4LYWA 5EA1A 4ALGA 2RI7A 4Y03A 5CS8A 4QYDA 4N4GA 4RVRA 5FBXA 3QZSA 5FG4A 2DKWA 4O76A 5I1QA 5I86A 5C85A 4KCXA 4A9IA 1EQFA 4N4FA 4YBTA 4NYVA 5DFDA 5I40A 4NUCA 5HEMA 4IOQA 4A9NA 5EWDA 4QZSA 4QBMA 5CQ3A 5FE0A 5CUEA 4ZC9A 4TZ2A 3ONIA 5AMFA 4MR5A 4A9JA 3LQHA 3QZTA 5FH8A 2RFJA 4YYHA 5EICA 4NYXA 3O34A 5IGNA 2I7KA 4MR4A 4A9OA 2H60A 4O77A 4YH4A 4XYAA 2DWWA 4BW3A 4UIZA 4BW2A 4UIVA 3SVFA 4YH3A 4BW4A 2F6NA 4NQMA 5AMEA 4O7EA 4CL9A 5CZGA 5CUAA 4UITA 4KV4A 5F25A 3MQMA 3LQJA 4XY8A 3IU6A 3G0LA 4WHWA 5E0RA 5EWVA 4QNSA 2RNXA 4NR4A 3AADA 5DKDA 5EGUA 3S91A 5FE2A 5DYAA 4TZ8A 4IR3A 3UV2A 2I8NA 3TLPA 5HQ6A 2R10A 2LSPB 5C4QA 5F62A 4CUPA 4X2IA 5DYCA 4LDFA 5LKUA 4TTEA 4J0SA 5BT4A 4TT6A 5D3LA 5IG6A 5JI8A 5D3TA 5H1TA 5DYXA 5EP7A 5HLSA 2G4AA 4QSSA 4IR5A 5ENBA 5E9YA 4UIYA 4NR5A 4YYMA 5CUCA 5ENEA 4QSWA 5DY7A 4MEOA 5HENA 5F63A 5EPSA 4F3IA 5LJ0A 5LVRA 1F68A 5F36A 4J3IA 4O72A 5L96A 2YW5A 4YAXA 5DX4A 5CQTA 5D7XA 4NRBA 5A5OA 2RS9B 2R0YA 5II2A 2R0VA 3ZYUA 4TS8A 4BW1A 5AD2A 5EK9A 4UIWA 5IGMA 4GPJA 4E96A 5FG6A 4O7CA 4QEWA 4TT4A 4OUFA 5I80A 2WP2A 5ENGA 5KO4A 3MB3A 5CU8A 2DVSA 5F1HA 4HXOA 4N4IA 2RO1A 4CFKA 4MENA 3U5LA 3K2JA 5L8TA 4YBSA 4UIUA 4IOOA 5H1UA 3JVLA 4A9HA 3HMHA 5K29A 5KU3A 5CUBA 3D7CA 4HBXA 5ACYA 4NYWA 5FG5A 2WP1A 2L84A 5CPEA 4LC2A 2MJVB 3P1EA 3UW9A 2OSSA 4YBMA 5HM0A 4TQNA 5FB0A 1JSPB 4HXKA 3P1CA 5I7YA 4UYDA 5ETDA 4QEVA 4QUUA 5D3SA 4Z6HA 2N9GA 2DVRA 4NUDA 5EV9A 5D24A 5KTXA 2RNWA 5LKTA 4TT2A 4Q0NA 4NQNA 4XUBA 5COIA 4PY6A 4O78A 4WHUA 4NR8A 5D3NA 5CUGA 4YADA 2KTBB 2YEKA 4Z6IA 4CURA 5II1A 1JM4B 4PS5A 5HFQA 5BT3A 5ENFA 5A5NA 4BJXA 5DW1A 4Q0OA 3UV5A 2YELA 5H85A 1WUMA 5FE4A 4NRAA 5CRZA 5EWWA 4XY9A 4YYJA 3MB4A 2DVVA 4QEUA 5F61A 4CUTA 4PTBA 2L85A 3NXBA 3HMFA 2RNYA 4YK0A 1WUGA 4O74A 1N72A 4YYNA 5E7DA 2E7OA 2DATA 4FLPA 5CQ6A 5A7CA 4IR4A 4QSXA 4LZSA 4NUEA 5H1VA 5HJCA 4Z1QA 5LKZA 5EWHA 5LVQA 4A9MA 4CUSA 4QB3A 5E74A 5C7NA 3G0JA 3GG3A 5G4RA 4QR4A 5FE5A 4MEPA 3Q2FA 4TU4A 5E3DA 3MULA 5D3PA 4A9EA 4PCIA 5FFWA 3P1FA 4J1PA 4YC9A 4NRCA 5HRWA 4ZW1A 5KHMA 2OUOA 1ZS5A 5BT5A 5DLZA 2FSAA 4N4HA 5EU1A 4C66A 4NR6A 4QSPA 2E7NA 4YYIA 1E6IA 4TU6A 5HFRA 4O7FA 5I7XA 5EPRA 5F1LA 5FB1A 5EISA 4A9KA 3U5PA 4Z93A 4YY6A 5FDZA 5LJ2A 2GRCA 4PKLA 5CRMA 4CFLA 4ALHA 4XUAA 4UYHA 5E3GA 4UYFA 4NXJA 5I88A 5CP5A 4YYGA 4CUQA 4LRGA 4O75A 4O70A 4TYLA 4MEQA 4LYSA 4A9FA 5HQ7A 3O35A 5ENCA 5D0CA 4HXRA 5J0DA 3DWYA 4OGJA 3U5KA 5I29A 4QSQA 5ENHA 4A9LA 2DVQA 5DKHA 5CQAA 3UVYA 4HXSA 4QR5A 3QZVA 5G4SA 4O7AA 4QSTA 2D9EA 3U5MA 3LQIA 5DYUA 4HXNA 4UIXA 4WIVA 2YQDA 4QC3A 5C87A 5F60A 5L98A 5CGPA 3MUKA 4YY4A 4LYIA 4O71A 5A5RA 4CLBA 5FH7A 5FH6A 4NR7A 2YEMA 3U5NA 4MR6A 5A5PA 5C89A 5FE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RCWA 5CY9A 4Z1SA 4QYLA 3MXFA 5KTUA 5L8UA 5IBNA 5F2PA 4LZRA 4IR6A 5DW2A 5A82A 5EM3A 5FFYA 3FKMX 4QC1A 5A85A 5FE6A 3IU5A 3O36A 4HXMA 5E9LA 4LR6A 5TB6A 5FE1A 1X0JA 4UYGA 5ENIA 3O33A 5LKXA 5I83A 5FFVA 4UYFB 3SVHA 5KTWA 5FE7A 5I89A 3P5OA 3U5JA 5D3RA 5LUUA 5A5SA 4C67A 4QSRA 4QR3A 5A83A 5CTLA 5EVAA 5FE9A 5IGLA 5CQ4A 5CQ8A 4YYKA 5EQ1A 2NXBA 5DLXA 4KV1A 4LZ2A 5ENJA 5CFWA 5E73A 5EPBA 3JVKA 5D3HA 5D25A 5HQ5A 4QSVA 4HXLA 3SVGA 4DONA 4UYEA 5D3JA 5DFCA 5E9IA 4O7BA 4N3WA 3P1DA 5IGKA 3LXJA 4J0RA 5C8GA 4PCEA 3Q2EA 5CQ7A 5L97A 4NS5A 5HELA 4QY4A 4HXPA 3U5OA 3JVJA 5DKCA 2D82A 5DFBA 5A5QA 3UVXA 5L99A 5E9KA 2F6JA 4HBVA 5EI4A 2YDWA 4BHWA 4QSUA 4IORA 3LJWA 5F3AA 5HRVA 5E9VA 5LJ1A 2R0SA 4NR9A 5FE3A 2L5EA 4QUTA 3S92A 2OO1A 5A81A 5E9MA 3JVMA 5JWMA 5TCMA 4YYDA 3DAIA 3UVDA 5D26A 4CUUA 3HMEA 3AQAA 5ETBA 2E3KA 3I3JA 2YYNA 3D1BA 4MR3A 4ZQLA 5CUDA 5AD3A 3UVWA 3UV4A 5CQ5A 5HRXA 5EWCA 1ZKRA 4OGIA 4AKNA 5F5ZA 4YATA 4YABA 5HCLA 4HBYA 5DBMA 5IIDA 3O37A 4HBWA 4LYWA 5EA1A 4ALGA 2RI7A 4Y03A 5CS8A 4QYDA 4N4GA 4RVRA 5FBXA 3QZSA 5FG4A 2DKWA 4O76A 5I1QA 5I86A 5C85A 2EJNA 4KCXA 4A9IA 1EQFA 4N4FA 4YBTA 4NYVA 5DFDA 5I40A 4NUCA 5HEMA 4IOQA 4A9NA 5EWDA 4QZSA 4QBMA 5CQ3A 5FE0A 5CUEA 4ZC9A 4TZ2A 3ONIA 5AMFA 4MR5A 4A9JA 3LQHA 3QZTA 5FH8A 2RFJA 4YYHA 5EICA 4NYXA 3O34A 5IGNA 2I7KA 3VKHA 4MR4A 4A9OA 2H60A 4O77A 4YH4A 4XYAA 2DWWA 4BW3A 4UIZA 4BW2A 4UIVA 3SVFA 4YH3A 4BW4A 2F6NA 4NQMA 5AMEA 4O7EA 4CL9A 5CZGA 5CUAA 4UITA 4KV4A 5F25A 3MQMA 3LQJA 4XY8A 3IU6A 3G0LA 4WHWA 5E0RA 5EWVA 4QNSA 2RNXA 4NR4A 3AADA 5DKDA 5EGUA 3S91A 5FE2A 5DYAA 4TZ8A 4IR3A 3UV2A 2I8NA 3TLPA 5HQ6A 2R10A 2LSPB 5C4QA 1PUOA 5F62A 4CUPA 4X2IA 5DYCA 4LDFA 5LKUA 4TTEA 4J0SA 5BT4A 4TT6A 5D3LA 5IG6A 5JI8A 5D3TA 5H1TA 5DYXA 5EP7A 5HLSA 2G4AA 4QSSA 4IR5A 5ENBA 5E9YA 4UIYA 4NR5A 4YYMA 5CUCA 5ENEA 4QSWA 5DY7A 4MEOA 5HENA 5F63A 5EPSA 4F3IA 5LJ0A 5LVRA 1F68A 5F36A 4J3IA 4O72A 5L96A 2YW5A 4YAXA 4AKGA 5DX4A 5CQTA 5D7XA 4NRBA 5A5OA 2RS9B 2R0YA 5II2A 2R0VA 3ZYUA 4TS8A 4AKHA 4BW1A 5AD2A 5EK9A 4UIWA 5IGMA 4GPJA 4E96A 5FG6A 4O7CA 4QEWA 4TT4A 4OUFA 5I80A 2WP2A 5ENGA 5KO4A 3MB3A 5CU8A 2DVSA 5F1HA 4HXOA 4N4IA 2RO1A 4CFKA 4MENA 4AKIA 3U5LA 3K2JA 5L8TA 4YBSA 4UIUA 4IOOA 5H1UA 3JVLA 4A9HA 3HMHA 5K29A 5KU3A 5CUBA 3D7CA 4HBXA 5ACYA 4NYWA 5FG5A 2WP1A 2L84A 5CPEA 4LC2A 2MJVB 3P1EA 3UW9A 2OSSA 4YBMA 5HM0A 4TQNA 5FB0A 1JSPB 4HXKA 3P1CA 5I7YA 4UYDA 4AI6A 5ETDA 4QEVA 4QUUA 5D3SA 4Z6HA 2N9GA 2DVRA 4NUDA 5EV9A 5D24A 5KTXA 2RNWA 5LKTA 4TT2A 4Q0NA 4NQNA 4XUBA 5COIA 4PY6A 4O78A 4WHUA 4NR8A 5D3NA 5CUGA 4YADA 2KTBB 2YEKA 4Z6IA 4CURA 5II1A 1JM4B 4PS5A 5HFQA 5BT3A 5ENFA 5A5NA 4BJXA 5DW1A 4Q0OA 3UV5A 2YELA 5H85A 1WUMA 5FE4A 4NRAA 5CRZA 5EWWA 4XY9A 4YYJA 3MB4A 2DVVA 4QEUA 5F61A 4CUTA 4PTBA 2L85A 3NXBA 3HMFA 2RNYA 4YK0A 1WUGA 4O74A 1N72A 4YYNA 5E7DA 2E7OA 2DATA 4FLPA 5CQ6A 5A7CA 4IR4A 4QSXA 4LZSA 4NUEA 5H1VA 5HJCA 4Z1QA 5LKZA 5EWHA 5LVQA 4A9MA 4CUSA 4QB3A 5E74A 5C7NA 3GG3A 3G0JA 5G4RA 4QR4A 5FE5A 4MEPA 3Q2FA 3D1DA 4TU4A 5E3DA 3MULA 5D3PA 4A9EA 4PCIA 5FFWA 3P1FA 4J1PA 4YC9A 4NRCA 5HRWA 4ZW1A 5KHMA 2OUOA 1ZS5A 5BT5A 3VKGA 5DLZA 2FSAA 4N4HA 5EU1A 4C66A 4NR6A 4QSPA 2E7NA 4YYIA 1E6IA 4TU6A 5HFRA 4O7FA 5I7XA 5EPRA 5F1LA 5FB1A 5EISA 4A9KA 3U5PA 4Z93A 4YY6A 5FDZA 5LJ2A 2GRCA 4PKLA 5CRMA 4CFLA 4ALHA 4XUAA 4UYHA 5E3GA 4UYFA 4NXJA 5I88A 5CP5A 4YYGA 4CUQA 4LRGA 4O75A 4O70A 4TYLA 4MEQA 4LYSA 4A9FA 5HQ7A 3O35A 5ENCA 5D0CA 4HXRA 5J0DA 3DWYA 4OGJA 3U5KA 5I29A 4QSQA 5ENHA 4A9LA 2DVQA 5DKHA 5CQAA 3UVYA 3ERRA 4HXSA 4QR5A 3QZVA 5G4SA 4O7AA 4QSTA 2D9EA 3U5MA 3LQIA 5DYUA 4HXNA 4UIXA 4WIVA 2YQDA 4QC3A 5C87A 5F60A 5L98A 5CGPA 3MUKA 4YY4A 4LYIA 4O71A 5A5RA 4CLBA 5FH7A 5FH6A 4NR7A 2YEMA 3U5NA 4MR6A 5A5PA 5C89A 5FE8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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