4A9OA

N-terminal bromodomain of human brd2 with 5 ethyl-3-methyl-4-phenyl-1, 2-oxazole
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
RVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/inhibitor
molecule keywords BROMODOMAIN CONTAINING 2
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 2: Optimization of Phenylisoxazole Sulfonamides.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9oA00
5CRZA 4AKNA 5DW1A 5E9KA 4A9FA 3O35A 5E3GA 4MR4A 4QR4A 4TU4A 4XY9A 5HENA 3LQIA 4NUCA 5D3JA 4FLPA 4MEQA 5CUEA 4TZ2A 5FE7A 3ZYUA 4O72A 5D26A 4TT6A 5HRVA 4NQMA 4NRCA 3O37A 5ENIA 3ONIA 2RO1A 5CUCA 5AD3A 4MR3A 3O33A 3P5OA 4QNSA 4YH4A 5F1HA 1JSPB 5I1QA 5HQ5A 4YK0A 4OGJA 4YC9A 5IBNA 5E3DA 5EU1A 4TT2A 3QZVA 4NR5A 2L85A 4A9JA 3UVXA 5BT5A 4PCEA 4O74A 5I29A 2E3KA 4QZSA 5L97A 4N4GA 5HFRA 2R0YA 2RFJA 5CUBA 4XUAA 5ENGA 5ENHA 5D3LA 5JWMA 5HLSA 3U5KA 2DVQA 3G0LA 3P1DA 5KU3A 3NXBA 4UYHA 5L8TA 4YBTA 4O76A 4J0RA 5CP5A 4NXJA 3K2JA 4MEPA 2WP1A 5FFWA 4CFKA 4HXLA 4A9OA 5CY9A 2F6NA 5A5QA 5CQ6A 5LVQA 5G4SA 4IR3A 4LYIA 4OUFA 4HXNA 4YY4A 5H85A 5E9MA 5HFQA 5F25A 5A5RA 5DYCA 3U5OA 3AADA 5CQ3A 4Z93A 5FH7A 5HQ7A 4UIUA 2R0SA 3U5JA 2DWWA 3S91A 4A9LA 4QSUA 3Q2FA 4NR8A 5L99A 4IORA 4CFLA 5I83A 3LQJA 2YELA 3LQHA 4UIYA 4X2IA 4YYHA 5LJ2A 4WHUA 2E7NA 4IR5A 4NR4A 5KTUA 4NR9A 5ENJA 2RS9B 5AD2A 4A9HA 5IGNA 2DVRA 4BW4A 5H1VA 5HEMA 3LXJA 5D3RA 4YBMA 2NXBA 5E74A 4YY6A 4QSPA 4CL9A 4ALHA 4QC1A 4UIXA 5FE2A 5FE9A 4Z1QA 2RNWA 4MEOA 5CQ7A 4NS5A 4LZSA 4QSTA 2R10A 4LYWA 3SVGA 5CUGA 4UYFB 2LSPB 2KTBB 4QR5A 5F5ZA 4A9KA 5DFDA 5A7CA 5IGLA 5CRMA 4QUUA 5FB1A 5A5PA 4YYNA 5F61A 2DVSA 5FG4A 2YYNA 4C66A 5LKXA 4KV1A 4YAXA 4BJXA 4UYEA 1ZS5A 5A5OA 4PS5A 2RNYA 4J3IA 2DKWA 3U5PA 5KTXA 3UVYA 5K29A 4QSWA 4TT4A 5D0CA 5FE4A 4IOOA 4Z6IA 5FE1A 5FH8A 5KHMA 5I7XA 5E9LA 5DBMA 5F62A 4CUPA 5KTWA 5DFCA 5I89A 4UIWA 5CQTA 2YEKA 4QR3A 4WHWA 4HXOA 4YBSA 5ENCA 5E9VA 5EV9A 1N72A 4TQNA 4HBVA 5EA1A 2G4AA 4O78A 3QZSA 5C4QA 4UYGA 5F3AA 4O70A 4HXRA 3QZTA 4A9MA 5A5SA 5FG6A 5FB0A 5E7DA 4BHWA 4A9EA 4ZW1A 4CUUA 5I40A 3U5LA 4QSRA 5F2PA 5EM3A 4TS8A 4DONA 5DYAA 4C67A 3TLPA 4GPJA 3U5MA 4A9NA 5EGUA 5H1UA 4ZC9A 3AQAA 5CQ8A 5IG6A 4O71A 3UVWA 5E9YA 5I80A 4LZRA 2DATA 4QEVA 5EPSA 5FE8A 4IR6A 5D3TA 5EPRA 5BT4A 2RNXA 5CU8A 4O7CA 5IGMA 1JM4B 3Q2EA 5G4RA 5AMFA 2D9EA 4YYKA 5ETDA 5F36A 5LKZA 2YW5A 4QSSA 5D3HA 4CUSA 4NRBA 3O36A 4A9IA 5FE3A 3MUKA 2L84A 5LJ1A 4CURA 4BW2A 5LJ0A 4Q0NA 3O34A 5HM0A 5TCMA 3MULA 4LZ2A 5EWWA 5E9IA 4NYXA 5FH6A 4UIZA 2OO1A 4XY8A 5E0RA 3S92A 4Q0OA 2E7OA 5EVAA 2F6JA 2H60A 5EWDA 4HBYA 3P1FA 4HXPA 5D24A 5EP7A 3UVDA 5EICA 4N3WA 5IIDA 4OGIA 4HXMA 3MB4A 2L5EA 5D7XA 5EWCA 4KV4A 4Z1SA 3LJWA 4TZ8A 4QSVA 5DKHA 3UV5A 3HMEA 5AMEA 4F3IA 4YYJA 3HMHA 5JI8A 1WUMA 5C7NA 3DWYA 5FFVA 5ENEA 1EQFA 3SVFA 4QUTA 4YABA 4RVRA 5II2A 5DLXA 5D3NA 2OSSA 5HRWA 4LRGA 5CGPA 4NUDA 5HQ6A 5CS8A 5CZGA 5EK9A 5FBXA 5ENBA 5HCLA 4QSXA 5DYUA 3DAIA 4NR7A 5EI4A 5C85A 4IR4A 4O7AA 5DKCA 2I8NA 4BW1A 4YYMA 4PY6A 4YADA 3UW9A 5F63A 5C89A 3P1CA 3JVJA 4HBXA 5A81A 2D82A 2N9GA 2DVVA 4MENA 5D3PA 4CUQA 4QBMA 5A83A 4HXSA 4MR5A 1F68A 4O77A 5L98A 3JVKA 3FKMX 2YQDA 3GG3A 4O7FA 3JVLA 4E96A 3UV4A 4QSQA 5D3SA 5HELA 2OUOA 2WP2A 5E73A 4N4HA 4UIVA 4QC3A 4WIVA 5A5NA 4UITA 2R0VA 4NRAA 5CQ4A 4YATA 1X0JA 3MQMA 4ALGA 3UV2A 5IGKA 5DLZA 5HRXA 4QB3A 5DKDA 5I88A 4LC2A 5FDZA 5LVRA 2YEMA 5DW2A 4Z6HA 4N4IA 4QEUA 3JVMA 5CUDA 4MR6A 5L8UA 2YDWA 4N4FA 4UYDA 5EISA 5DX4A 5F60A 4NYVA 5D25A 5LKUA 2FSAA 4J1PA 3IU5A 5FE6A 5ENFA 4O7EA 5I7YA 4HBWA 5EPBA 3SVHA 5H1TA 3MXFA 5EWVA 2MJVB 3D7CA 1WUGA 5II1A 5BT3A 5COIA 5CQ5A 5L96A 5LKTA 4PKLA 4YYIA 5CTLA 5ACYA 4NUEA 3I3JA 4XYAA 5EWHA 5CFWA 5FE0A 4Y03A 4J0SA 4PCIA 5C8GA 5TB6A 5KO4A 3RCWA 4QYDA 4PTBA 4BW3A 4CUTA 2GRCA 4IOQA 5LUUA 4LYSA 4QEWA 5CQAA 5FE5A 4LDFA 4TYLA 1E6IA 4NYWA 5A82A 4ZQLA 2RI7A 5EQ1A 3P1EA 4UYFA 5DFBA 5I86A 3MB3A 4KCXA 5CPEA 4YYDA 4HXKA 4TU6A 5DYXA 3U5NA 5DY7A 4TTEA 5F1LA 4LR6A 5CUAA 5J0DA 4O7BA 4NQNA 4CLBA 5HJCA 4YYGA 4NR6A 3HMFA 4QY4A 5A85A 4QYLA 5FFYA 3G0JA 4YH3A 4O75A 4XUBA 5C87A 5ETBA 3IU6A 5FG5A 2I7KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CRZA 4AKNA 5DW1A 5E9KA 4A9FA 3O35A 5E3GA 4MR4A 4QR4A 4TU4A 4XY9A 5HENA 3LQIA 4NUCA 5D3JA 4FLPA 4MEQA 5CUEA 4TZ2A 5FE7A 3ZYUA 4O72A 5D26A 4TT6A 5HRVA 4NQMA 4NRCA 3O37A 5ENIA 3ONIA 2RO1A 5CUCA 5AD3A 4MR3A 3O33A 3P5OA 3VKGA 4QNSA 4YH4A 5F1HA 1JSPB 5I1QA 5HQ5A 4YK0A 4OGJA 4YC9A 5IBNA 5E3DA 5EU1A 4TT2A 3QZVA 4NR5A 2L85A 4A9JA 3UVXA 5BT5A 4PCEA 4O74A 5I29A 2E3KA 4QZSA 5L97A 4N4GA 5HFRA 2R0YA 2RFJA 5CUBA 4XUAA 5ENGA 5ENHA 5D3LA 5JWMA 5HLSA 3U5KA 2DVQA 3G0LA 3P1DA 5KU3A 3NXBA 4UYHA 5L8TA 4YBTA 4O76A 4J0RA 5CP5A 4NXJA 3K2JA 4AKGA 4MEPA 2WP1A 5FFWA 4CFKA 4HXLA 4A9OA 5CY9A 2F6NA 5A5QA 5CQ6A 5LVQA 5G4SA 4IR3A 4LYIA 4OUFA 4HXNA 4YY4A 5H85A 5E9MA 5HFQA 3VKHA 5F25A 5A5RA 5DYCA 3U5OA 3AADA 5CQ3A 4Z93A 5FH7A 5HQ7A 4UIUA 2R0SA 3U5JA 2DWWA 3S91A 4A9LA 4QSUA 3Q2FA 4NR8A 5L99A 4IORA 4CFLA 5I83A 3LQJA 2YELA 3LQHA 4UIYA 4X2IA 4YYHA 5LJ2A 4WHUA 2E7NA 4IR5A 4NR4A 5KTUA 4NR9A 5ENJA 2RS9B 5AD2A 4A9HA 5IGNA 2DVRA 4BW4A 5H1VA 5HEMA 3LXJA 5D3RA 4YBMA 2NXBA 5E74A 4YY6A 4QSPA 4CL9A 4ALHA 4QC1A 4UIXA 5FE2A 5FE9A 4Z1QA 2RNWA 4MEOA 5CQ7A 4NS5A 4LZSA 4QSTA 2R10A 4LYWA 3SVGA 5CUGA 4UYFB 2LSPB 2KTBB 4QR5A 5F5ZA 4A9KA 5DFDA 5A7CA 5IGLA 5CRMA 4QUUA 5FB1A 5A5PA 4YYNA 5F61A 2DVSA 5FG4A 2YYNA 4C66A 5LKXA 4KV1A 4YAXA 4BJXA 4UYEA 1ZS5A 5A5OA 4PS5A 2RNYA 4J3IA 2DKWA 3U5PA 5KTXA 3D1DA 3UVYA 5K29A 4QSWA 4TT4A 5D0CA 5FE4A 4IOOA 4Z6IA 5FE1A 5FH8A 5KHMA 5I7XA 5E9LA 5DBMA 5F62A 4CUPA 5KTWA 5DFCA 5I89A 4UIWA 5CQTA 2YEKA 4QR3A 4WHWA 4HXOA 4YBSA 5ENCA 5E9VA 5EV9A 3ERRA 1N72A 4TQNA 4HBVA 5EA1A 2G4AA 4O78A 3QZSA 5C4QA 4UYGA 5F3AA 4O70A 4HXRA 3QZTA 4A9MA 5A5SA 5FG6A 5FB0A 5E7DA 4BHWA 4A9EA 4ZW1A 4CUUA 5I40A 3U5LA 4QSRA 5F2PA 5EM3A 4TS8A 4DONA 5DYAA 4C67A 3TLPA 4GPJA 3U5MA 4A9NA 5EGUA 5H1UA 2EJNA 4ZC9A 4AI6A 3AQAA 5CQ8A 5IG6A 4O71A 3UVWA 5E9YA 5I80A 4LZRA 2DATA 4QEVA 5EPSA 5FE8A 4IR6A 5D3TA 5EPRA 5BT4A 2RNXA 5CU8A 4O7CA 5IGMA 1JM4B 3Q2EA 5G4RA 5AMFA 2D9EA 4YYKA 5ETDA 5F36A 5LKZA 2YW5A 4QSSA 5D3HA 4CUSA 4NRBA 3O36A 4A9IA 5FE3A 3MUKA 2L84A 5LJ1A 4CURA 4BW2A 5LJ0A 4Q0NA 3O34A 5HM0A 5TCMA 3MULA 4LZ2A 1ZKRA 5EWWA 5E9IA 4NYXA 5FH6A 4UIZA 2OO1A 4XY8A 5E0RA 3S92A 4Q0OA 2E7OA 5EVAA 2F6JA 2H60A 5EWDA 4HBYA 3P1FA 4HXPA 5D24A 5EP7A 3UVDA 5EICA 4N3WA 5IIDA 4OGIA 4HXMA 3MB4A 2L5EA 5D7XA 5EWCA 4KV4A 4Z1SA 3LJWA 4TZ8A 4QSVA 5DKHA 3UV5A 3HMEA 5AMEA 4F3IA 4YYJA 3HMHA 5JI8A 1WUMA 5C7NA 3DWYA 5FFVA 5ENEA 1EQFA 3SVFA 4QUTA 4YABA 4RVRA 5II2A 5DLXA 5D3NA 2OSSA 5HRWA 4LRGA 5CGPA 4NUDA 5HQ6A 5CS8A 5CZGA 5EK9A 5FBXA 5ENBA 5HCLA 4QSXA 5DYUA 3DAIA 4NR7A 5EI4A 5C85A 4IR4A 4O7AA 5DKCA 2I8NA 4BW1A 4YYMA 4PY6A 4YADA 3UW9A 5F63A 5C89A 3P1CA 3JVJA 4HBXA 5A81A 2D82A 2N9GA 2DVVA 4MENA 5D3PA 4AKHA 4CUQA 4QBMA 5A83A 4HXSA 4MR5A 1F68A 4O77A 5L98A 3JVKA 3FKMX 2YQDA 3GG3A 4O7FA 3JVLA 4E96A 3UV4A 4QSQA 5D3SA 5HELA 2OUOA 2WP2A 5E73A 4N4HA 4UIVA 4QC3A 4WIVA 5A5NA 4UITA 2R0VA 4NRAA 5CQ4A 4YATA 1X0JA 3MQMA 4ALGA 3UV2A 5IGKA 5DLZA 5HRXA 1PUOA 4QB3A 5DKDA 5I88A 4LC2A 5FDZA 5LVRA 2YEMA 5DW2A 4Z6HA 4N4IA 4QEUA 3JVMA 5CUDA 4MR6A 5L8UA 2YDWA 4N4FA 4UYDA 5EISA 5DX4A 5F60A 4NYVA 5D25A 5LKUA 2FSAA 4J1PA 3IU5A 5FE6A 5ENFA 4O7EA 5I7YA 4HBWA 5EPBA 3SVHA 5H1TA 4AKIA 3MXFA 5EWVA 2MJVB 3D7CA 1WUGA 5II1A 5BT3A 5COIA 5CQ5A 5L96A 5LKTA 4PKLA 4YYIA 5CTLA 5ACYA 4NUEA 3I3JA 4XYAA 5EWHA 5CFWA 5FE0A 3D1BA 4Y03A 4J0SA 4PCIA 5C8GA 5TB6A 5KO4A 3RCWA 4QYDA 4PTBA 4BW3A 4CUTA 2GRCA 4IOQA 5LUUA 4LYSA 4QEWA 5CQAA 5FE5A 4LDFA 4TYLA 1E6IA 4NYWA 5A82A 4ZQLA 2RI7A 5EQ1A 3P1EA 4UYFA 5DFBA 5I86A 3MB3A 4KCXA 5CPEA 4YYDA 4HXKA 4TU6A 5DYXA 3U5NA 5DY7A 4TTEA 5F1LA 4LR6A 5CUAA 5J0DA 4O7BA 4NQNA 4CLBA 5HJCA 4YYGA 4NR6A 3HMFA 4QY4A 5A85A 4QYLA 5FFYA 3G0JA 4YH3A 4O75A 4XUBA 5C87A 5ETBA 3IU6A 5FG5A 2I7KA
chains in the Genus database with same CATH topology
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