4CUSA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-4 n09496
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-4 N09496
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cusA00
4QNSA 4HXSA 5I80A 4QEVA 5C4QA 4QC3A 3JVKA 4NRCA 4UYFA 1ZS5A 5JI8A 5HM0A 5A82A 1EQFA 2L5EA 4LR6A 5AD2A 2YELA 5E9MA 2RFJA 5CQ8A 4TS8A 5I7YA 4XY8A 4IOQA 4HBYA 5DYXA 4UIUA 4LC2A 5ENGA 5FFYA 4NXJA 2G4AA 4ALGA 5FB0A 5C89A 4YC9A 3S92A 2DWWA 5EWVA 3Q2EA 4A9HA 2I8NA 3LQJA 5D3TA 4NUCA 4O78A 4O71A 4UITA 5FG4A 3UV4A 5HQ7A 5D25A 4Z1QA 4QZSA 4UYFB 3O35A 3DAIA 5E0RA 5LKZA 5D7XA 3K2JA 5L8UA 5D3LA 4HXPA 3MB3A 5HFQA 3LQIA 4KCXA 5DW1A 4RVRA 2OUOA 4QR3A 4IR4A 4QB3A 3JVJA 4QEWA 5CTLA 4YADA 4YYMA 2RNWA 5E9IA 4TYLA 2YW5A 4NR6A 2OO1A 5KTWA 4N4IA 2DVRA 4YBMA 5HRXA 2R0YA 3ONIA 3UVWA 2E7OA 4CUUA 5DFCA 5FH8A 4FLPA 4NUEA 4OGIA 5L97A 4NRAA 5CRMA 5C8GA 4UYHA 5F61A 4LZRA 3QZTA 5H1VA 4Q0NA 5F1HA 5F3AA 5J0DA 4YY6A 4UYGA 5F1LA 3G0LA 5CZGA 4F3IA 4YK0A 4O7EA 5DFDA 5F62A 4MEQA 4YH4A 4Z6HA 5BT4A 3MB4A 5A5RA 3O33A 5E74A 4HBVA 5ENEA 3U5KA 1JSPB 4N4FA 5AMFA 3QZSA 2YEKA 2DVVA 3P5OA 5DYUA 5HLSA 5ACYA 4J1PA 5E7DA 5A5OA 4KV1A 5FE8A 4YAXA 4LZSA 5EP7A 4YYHA 4QBMA 5DX4A 4LYSA 3RCWA 4E96A 4UIZA 3AQAA 4YYKA 5I86A 4HXRA 5CQ3A 5EWHA 5CQ6A 5E9YA 4A9NA 4CUQA 5FDZA 5EI4A 4MEOA 5KTUA 3TLPA 4YY4A 4LRGA 4BHWA 5EA1A 5IIDA 4ZQLA 5EWCA 5EPBA 5HELA 5E9VA 4UIVA 4OGJA 5L99A 5D3HA 5CU8A 4IR6A 5LVQA 2DKWA 5L96A 4XUBA 5F60A 3U5NA 4UIWA 4HXKA 4CFLA 4CUTA 5ETBA 2L85A 5EWWA 2LSPB 4CUSA 5BT3A 4J3IA 2GRCA 5C87A 4QYDA 3FKMX 4QSRA 5FE5A 4NR4A 2D82A 4TT6A 5E9LA 2DVQA 5D26A 4NYWA 4NR5A 2NXBA 3MQMA 4NS5A 4TT2A 5CQAA 5KU3A 5I40A 4N4GA 2N9GA 2RNXA 5DY7A 4XY9A 4CUPA 5DBMA 5FE3A 5I88A 4CLBA 5LUUA 5CQ7A 4PCIA 4UYEA 4A9LA 4QSQA 4YABA 4YH3A 5A7CA 4HBWA 3ZYUA 2RI7A 4IORA 5D0CA 5IGNA 5E3GA 3P1FA 4HXNA 4MR4A 4X2IA 5FE1A 5CUBA 3S91A 5LJ1A 5LKUA 2YYNA 5C7NA 5LKXA 5IGLA 5CUAA 5CQ5A 5ENBA 5KTXA 2RS9B 4NQNA 1JM4B 5FB1A 4QSWA 3I3JA 4HBXA 4TU4A 5EV9A 3UV5A 5CS8A 2RNYA 5EVAA 5FE4A 4QY4A 1E6IA 4DONA 5IG6A 4QSSA 5DKCA 3UVXA 4CURA 4J0SA 4PTBA 3LQHA 5JWMA 2F6NA 5CQ4A 4TTEA 4YYNA 5FFWA 4YATA 4UIYA 4O72A 5DKDA 4QSTA 4O7FA 3LJWA 3MUKA 3HMEA 5CQTA 5DKHA 4N3WA 5H85A 3U5MA 2DVSA 4Q0OA 4MR5A 3JVLA 3U5LA 5D3PA 5II1A 5LVRA 4PY6A 4N4HA 5EQ1A 5DLXA 3HMFA 3NXBA 3O36A 3AADA 3HMHA 4YYGA 4IR3A 5DFBA 3IU6A 5HRWA 4AKNA 4NYXA 4BW4A 2R0SA 4QR4A 5EWDA 4ALHA 5ENFA 3D7CA 3UW9A 4GPJA 3U5JA 5IGKA 5K29A 5CFWA 3SVHA 4XYAA 5FBXA 3U5PA 3O34A 3DWYA 5ENHA 3JVMA 5HJCA 5I29A 5EPSA 4IR5A 5A5SA 5FE0A 5HCLA 4TZ2A 4NYVA 4C66A 2YEMA 5CP5A 4WIVA 5A83A 3LXJA 2YQDA 5CUCA 4MR3A 4Z1SA 2E7NA 2WP1A 5L8TA 5COIA 5CUGA 4MENA 5I1QA 4HXMA 5A5NA 5E73A 2DATA 2L84A 4QYLA 3UVYA 5KHMA 4BW3A 4OUFA 5LJ2A 5DYAA 4ZW1A 1X0JA 4J0RA 5CUEA 2YDWA 5DW2A 4ZC9A 5D3SA 4Z6IA 4NRBA 4MEPA 3GG3A 4MR6A 2FSAA 2OSSA 4YYIA 5EPRA 2RO1A 4YYDA 5FE7A 1N72A 3MULA 5D3RA 5IGMA 4O7CA 4O70A 4A9FA 4O77A 5A81A 4IOOA 1WUMA 4LYWA 3P1DA 2E3KA 2WP2A 4C67A 5TCMA 4CL9A 4LYIA 4QUUA 5ENIA 4QC1A 5AMEA 5FG5A 5HQ6A 5I7XA 1F68A 4Y03A 5A5QA 4QUTA 2D9EA 4HXLA 2KTBB 4QSXA 4A9KA 4QSUA 5FH6A 5F2PA 3P1CA 4PKLA 3G0JA 4TZ8A 4Z93A 4UYDA 5CUDA 5D24A 3U5OA 5G4RA 2H60A 2R10A 5FG6A 2R0VA 5ETDA 5D3JA 5A85A 3SVFA 4KV4A 4TQNA 5EU1A 4A9IA 5EICA 4WHWA 5CPEA 5DYCA 5H1UA 5HQ5A 5EISA 4A9JA 5EM3A 5HFRA 5CY9A 3UV2A 5F5ZA 5AD3A 3P1EA 4XUAA 4WHUA 4A9OA 5ENJA 4YBSA 5L98A 5EGUA 5HENA 4QSVA 4O76A 4BW1A 5HRVA 4O7AA 5FE6A 5IBNA 5BT5A 3UVDA 4LZ2A 5FH7A 4A9MA 4PS5A 2MJVB 5C85A 5A5PA 5D3NA 4YBTA 3O37A 4LDFA 5E3DA 3Q2FA 5FE2A 5TB6A 4NR8A 4NUDA 4HXOA 5G4SA 2F6JA 5LKTA 5EK9A 1WUGA 5E9KA 4NR7A 3IU5A 5CGPA 5II2A 4NR9A 4YYJA 5FE9A 2I7KA 4QSPA 5LJ0A 4TT4A 5H1TA 4BJXA 5CRZA 4TU6A 5I83A 4QEUA 3MXFA 5F36A 4O7BA 3QZVA 5ENCA 4CFKA 5HEMA 4UIXA 5DLZA 4NQMA 5KO4A 5FFVA 4A9EA 5I89A 5F63A 4O74A 5F25A 4O75A 4BW2A 4QR5A 3SVGA 4PCEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QNSA 4HXSA 5I80A 4QEVA 5C4QA 4QC3A 3JVKA 4NRCA 4UYFA 1ZS5A 5JI8A 5HM0A 5A82A 1EQFA 2L5EA 4LR6A 5AD2A 2YELA 5E9MA 2RFJA 5CQ8A 4TS8A 5I7YA 4XY8A 4IOQA 4HBYA 5DYXA 4UIUA 4LC2A 5ENGA 5FFYA 4NXJA 2G4AA 4ALGA 5FB0A 5C89A 4YC9A 3S92A 2DWWA 5EWVA 3Q2EA 4A9HA 2I8NA 3LQJA 5D3TA 4NUCA 4O78A 4O71A 4UITA 5FG4A 3UV4A 5HQ7A 5D25A 4Z1QA 4QZSA 4UYFB 3O35A 3DAIA 5E0RA 5LKZA 5D7XA 3K2JA 5L8UA 5D3LA 4HXPA 3MB3A 5HFQA 3LQIA 4KCXA 5DW1A 4RVRA 2OUOA 4QR3A 4IR4A 4QB3A 3JVJA 4QEWA 3ERRA 5CTLA 4YADA 2RNWA 4YYMA 5E9IA 4TYLA 2YW5A 4NR6A 2OO1A 5KTWA 4AKGA 4N4IA 2DVRA 4YBMA 5HRXA 2R0YA 3ONIA 3UVWA 2E7OA 4CUUA 5DFCA 5FH8A 4FLPA 4NUEA 4OGIA 5L97A 4NRAA 5CRMA 5C8GA 4UYHA 5F61A 4LZRA 3QZTA 5H1VA 4Q0NA 5F1HA 5F3AA 5J0DA 4YY6A 4UYGA 5F1LA 3G0LA 5CZGA 4F3IA 4YK0A 4O7EA 5DFDA 5F62A 4MEQA 4YH4A 4Z6HA 5BT4A 3MB4A 5A5RA 3O33A 5E74A 4HBVA 5ENEA 3U5KA 1JSPB 4N4FA 5AMFA 3QZSA 2YEKA 2DVVA 3P5OA 5DYUA 5HLSA 5ACYA 4J1PA 5E7DA 5A5OA 4KV1A 5FE8A 4YAXA 4LZSA 5EP7A 4YYHA 4QBMA 5DX4A 4LYSA 3RCWA 4E96A 4UIZA 3AQAA 4YYKA 5I86A 4HXRA 5CQ3A 4AI6A 5EWHA 5CQ6A 5E9YA 4A9NA 4CUQA 5FDZA 5EI4A 4MEOA 5KTUA 3TLPA 4YY4A 4LRGA 4BHWA 5EA1A 5IIDA 4ZQLA 5EWCA 5EPBA 5HELA 5E9VA 4UIVA 4OGJA 5L99A 5D3HA 5CU8A 4IR6A 5LVQA 2DKWA 5L96A 4XUBA 5F60A 3VKHA 3U5NA 4UIWA 4HXKA 4CFLA 4CUTA 5ETBA 2L85A 5EWWA 2LSPB 4CUSA 5BT3A 4J3IA 2GRCA 5C87A 4QYDA 3FKMX 4QSRA 5FE5A 4NR4A 2D82A 4TT6A 5E9LA 2DVQA 5D26A 4NYWA 4NR5A 4AKIA 2NXBA 3MQMA 4NS5A 4TT2A 5CQAA 5KU3A 5I40A 4N4GA 2N9GA 2RNXA 5DY7A 4XY9A 4CUPA 5DBMA 5FE3A 5I88A 4CLBA 5LUUA 5CQ7A 4PCIA 4UYEA 4A9LA 4QSQA 4YABA 4YH3A 5A7CA 4HBWA 3ZYUA 2RI7A 4IORA 5D0CA 5IGNA 5E3GA 3P1FA 4HXNA 4MR4A 4X2IA 5FE1A 5CUBA 3S91A 5LJ1A 5LKUA 2YYNA 5C7NA 5LKXA 5IGLA 5CUAA 5CQ5A 5ENBA 5KTXA 2RS9B 4NQNA 1JM4B 5FB1A 4QSWA 3I3JA 4HBXA 4TU4A 5EV9A 3UV5A 5CS8A 2RNYA 5EVAA 5FE4A 4QY4A 1E6IA 4DONA 5IG6A 4QSSA 5DKCA 3UVXA 4CURA 4J0SA 4PTBA 3LQHA 5JWMA 2F6NA 5CQ4A 4TTEA 4YYNA 5FFWA 4YATA 4UIYA 4O72A 5DKDA 4QSTA 4O7FA 3LJWA 3MUKA 1PUOA 3HMEA 5CQTA 5DKHA 4N3WA 5H85A 3U5MA 2DVSA 4Q0OA 4MR5A 3JVLA 3U5LA 5D3PA 5II1A 5LVRA 4PY6A 4N4HA 5EQ1A 5DLXA 3HMFA 3NXBA 3O36A 3AADA 3HMHA 4YYGA 4IR3A 5DFBA 3IU6A 5HRWA 4AKNA 4NYXA 4BW4A 2R0SA 4QR4A 5EWDA 4ALHA 5ENFA 3D7CA 3UW9A 4GPJA 3U5JA 5IGKA 5K29A 5CFWA 3SVHA 4XYAA 5FBXA 3U5PA 3O34A 3DWYA 5ENHA 3JVMA 5HJCA 5I29A 5EPSA 4IR5A 5A5SA 5FE0A 5HCLA 4TZ2A 4NYVA 4C66A 2YEMA 5CP5A 4WIVA 5A83A 3LXJA 2YQDA 5CUCA 4MR3A 4Z1SA 2E7NA 2WP1A 5L8TA 5COIA 5CUGA 4MENA 5I1QA 4HXMA 5A5NA 5E73A 2DATA 2L84A 4QYLA 3UVYA 5KHMA 4BW3A 4OUFA 5LJ2A 5DYAA 4ZW1A 1X0JA 4J0RA 2EJNA 5CUEA 2YDWA 5DW2A 4ZC9A 3VKGA 5D3SA 4Z6IA 4NRBA 4MEPA 3GG3A 4MR6A 2FSAA 2OSSA 4YYIA 5EPRA 2RO1A 4YYDA 5FE7A 1N72A 3MULA 5D3RA 5IGMA 4O7CA 4O70A 4A9FA 4O77A 5A81A 4IOOA 1WUMA 4LYWA 3P1DA 2E3KA 2WP2A 4C67A 5TCMA 4CL9A 4LYIA 4QUUA 5ENIA 4QC1A 5AMEA 4AKHA 5FG5A 5HQ6A 5I7XA 1F68A 4Y03A 5A5QA 4QUTA 2D9EA 4HXLA 2KTBB 4QSXA 4A9KA 4QSUA 5FH6A 5F2PA 3P1CA 4PKLA 3G0JA 4TZ8A 4Z93A 4UYDA 5CUDA 5D24A 3U5OA 5G4RA 2H60A 2R10A 5FG6A 2R0VA 5ETDA 5D3JA 5A85A 3SVFA 4KV4A 4TQNA 5EU1A 4A9IA 5EICA 4WHWA 5CPEA 5DYCA 5H1UA 5HQ5A 5EISA 4A9JA 5EM3A 5HFRA 5CY9A 3UV2A 5F5ZA 5AD3A 3P1EA 4XUAA 4WHUA 4A9OA 5ENJA 4YBSA 5L98A 5EGUA 5HENA 4QSVA 4O76A 4BW1A 5HRVA 4O7AA 5FE6A 5IBNA 5BT5A 3UVDA 4LZ2A 5FH7A 4A9MA 4PS5A 2MJVB 1ZKRA 5C85A 5A5PA 5D3NA 4YBTA 3O37A 4LDFA 5E3DA 3Q2FA 5FE2A 5TB6A 4NR8A 4NUDA 4HXOA 5G4SA 2F6JA 5LKTA 5EK9A 1WUGA 5E9KA 4NR7A 3D1DA 3IU5A 5CGPA 3D1BA 5II2A 4NR9A 4YYJA 5FE9A 2I7KA 4QSPA 5LJ0A 4TT4A 5H1TA 4BJXA 5CRZA 4TU6A 5I83A 4QEUA 3MXFA 5F36A 4O7BA 3QZVA 5ENCA 4CFKA 5HEMA 4UIXA 5DLZA 4NQMA 5KO4A 5FFVA 4A9EA 5I89A 5F63A 4O74A 5F25A 4O75A 4BW2A 4QR5A 3SVGA 4PCEA
chains in the Genus database with same CATH topology
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