4CUSA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-4 n09496
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-4 N09496
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cusA00
4TU6A 2YELA 4UIXA 4XUAA 5EPSA 3AADA 5F60A 4HXRA 5FE4A 4N4FA 4YYJA 4PCEA 5A5RA 4BW1A 5IGMA 5HCLA 4O7AA 3O33A 5ETDA 2G4AA 5HFRA 3LQIA 4XY9A 4YH4A 5DFDA 4IORA 1EQFA 5EU1A 4HXOA 1X0JA 2RS9B 2YEMA 4UITA 4NR5A 4MR6A 3Q2FA 5C89A 5CQ6A 2NXBA 5FG6A 5CPEA 5EGUA 3U5KA 5E7DA 4A9JA 4QY4A 4A9IA 3IU5A 5F36A 4NXJA 4YYGA 3U5PA 5I40A 5A83A 3I3JA 5DFBA 5LKTA 5D3PA 4YY6A 3O36A 4QSWA 2YQDA 2DATA 5AD3A 5COIA 5E73A 3UVWA 5E9IA 5LVQA 4CL9A 2DVSA 4N4HA 4CURA 5DBMA 5CTLA 3Q2EA 4QC1A 4AKNA 5ACYA 5D3JA 3O37A 5A5NA 5E0RA 5I29A 4IR6A 5IGLA 3K2JA 5HQ5A 5DW1A 5ENBA 4BJXA 5EI4A 2E3KA 5E9YA 4XUBA 4LYWA 4QR5A 4CUPA 5G4RA 5AD2A 4TTEA 5ENFA 5A81A 4YAXA 5FE6A 4IR3A 5IGNA 5E9KA 4MR5A 5I80A 5HEMA 4LRGA 5CFWA 3SVHA 3U5MA 1WUGA 3U5OA 4O71A 3P5OA 5CY9A 5DFCA 4UYDA 4Y03A 4NRBA 4ALHA 4LZRA 4QEVA 5FE9A 5A85A 4TT4A 5DYAA 4QSPA 2R0SA 5FDZA 5D3TA 5J0DA 4YADA 5KHMA 5LKUA 4UIZA 5HRXA 5CQTA 2H60A 5F62A 4PCIA 5CQ7A 5EVAA 4A9MA 3LQHA 5BT4A 5CUCA 3P1FA 5FFWA 4DONA 4OGJA 5ETBA 5ENIA 4LDFA 5FB1A 4J3IA 2D9EA 4J0RA 2DVVA 4RVRA 4XYAA 5JI8A 4TT6A 4UIUA 4HXKA 5D3RA 5FE0A 2DKWA 5EQ1A 4MR4A 3U5JA 4CLBA 2E7OA 5EPRA 2WP1A 4UIWA 2I7KA 5ENJA 4TQNA 3QZVA 4NUCA 2N9GA 4IR5A 3QZTA 4QSXA 4UYGA 5D3NA 5CQ3A 3IU6A 4O7EA 5LUUA 4NR4A 4CUTA 4HBXA 4QR3A 4NS5A 3GG3A 2R0YA 5I7YA 4NRCA 5KTWA 3MQMA 4MR3A 2I8NA 5ENEA 5EWHA 5FBXA 5KO4A 5CS8A 3MB3A 3U5LA 4YYKA 4ZW1A 2MJVB 3ONIA 5I88A 4QUUA 3UVXA 4WIVA 4QSUA 5II2A 3P1DA 5EV9A 2F6JA 3DAIA 4QR4A 5CUBA 2RI7A 5CUEA 5DW2A 3ZYUA 4QSRA 5CZGA 4YBSA 4YYDA 5FE3A 5E3GA 5EWCA 4YYHA 5EP7A 3JVJA 4HXNA 5D3HA 4O74A 4YH3A 5HRWA 4Z1SA 2D82A 5I7XA 5D3LA 5L98A 5D25A 4NR7A 3FKMX 4QBMA 5HFQA 4Q0NA 5CRMA 4XY8A 5FE1A 5A7CA 4KV1A 4TS8A 4BW4A 5C7NA 4O78A 5D0CA 5H85A 4IOQA 3LQJA 3UW9A 5LKZA 2YEKA 4YK0A 5FB0A 3O35A 5D3SA 2RFJA 5EM3A 4YABA 4TT2A 3MULA 4F3IA 5DYXA 2YW5A 4Z6IA 3MB4A 4IOOA 4NR6A 4LYIA 3P1CA 5CQ4A 5TCMA 5L8TA 4QYLA 5HQ7A 5F1LA 5F5ZA 4MEOA 5F2PA 5D26A 5K29A 5IG6A 4N4IA 2DWWA 4C67A 4WHWA 4MENA 4YC9A 4Z93A 3LJWA 5F1HA 2WP2A 5F3AA 5F25A 5E9MA 4O70A 5L99A 4QUTA 4GPJA 5CQ5A 5ENCA 5FG5A 4CUQA 3HMFA 4QSVA 5JWMA 4LZ2A 5A5SA 5FE8A 5E9LA 5FFYA 5DKDA 5E9VA 5F63A 4YYNA 4O75A 4ZQLA 4TU4A 4LC2A 3S92A 5FH8A 2OUOA 4O77A 4PY6A 5CRZA 1N72A 3G0JA 4O76A 5A5QA 4A9LA 4YYIA 2FSAA 5FE7A 5H1VA 3TLPA 4PS5A 4BW3A 3P1EA 3QZSA 4O7FA 5C4QA 2OO1A 5F61A 5DYCA 5DKHA 4NYXA 5L97A 4NRAA 5I89A 4PKLA 3LXJA 4HBYA 5II1A 4N3WA 4YBTA 5DLXA 1ZS5A 4HXPA 4QSQA 3UV2A 2L85A 4HXLA 4TYLA 5C85A 5ENGA 5BT3A 5CQAA 3DWYA 4NYVA 2YDWA 4QNSA 5LJ2A 3JVMA 5L8UA 3O34A 4HBVA 5CGPA 5EWVA 5DY7A 2KTBB 5I83A 4OGIA 1WUMA 2R10A 2GRCA 4OUFA 5DKCA 3HMEA 2F6NA 4O7BA 5FE2A 3JVKA 4UIYA 3SVGA 5BT5A 5CUAA 4CUSA 5LKXA 4FLPA 3SVFA 3HMHA 4Q0OA 5HRVA 5CP5A 3RCWA 4C66A 5IGKA 4O72A 4LZSA 4QZSA 4QSTA 4BHWA 5AMEA 1E6IA 4UYEA 5FG4A 2LSPB 5A5OA 4UYHA 2RNXA 4UIVA 5LJ1A 5C8GA 1JSPB 2RNYA 4NUDA 5EK9A 2E7NA 2DVQA 5H1TA 5E3DA 3U5NA 4J0SA 5AMFA 4NUEA 4BW2A 3MUKA 5DLZA 2L5EA 4MEQA 3UVYA 5DYUA 5D24A 4YBMA 5HJCA 4CFLA 2L84A 5H1UA 5FE5A 4E96A 4Z1QA 5I86A 5EWWA 5IBNA 4A9EA 4WHUA 5LVRA 3G0LA 5FH6A 4QSSA 5E74A 2OSSA 4YY4A 5A5PA 3NXBA 4YATA 5KTXA 4LR6A 5HELA 5I1QA 4O7CA 5LJ0A 4HBWA 4IR4A 4NR9A 4UYFB 5ENHA 5KTUA 5C87A 4A9HA 5KU3A 5FFVA 4TZ8A 5EWDA 4TZ2A 5FH7A 4QB3A 4A9NA 4ALGA 3UV5A 4X2IA 5TB6A 3MXFA 5CU8A 4J1PA 4QEWA 4PTBA 5DX4A 4YYMA 2DVRA 4NR8A 5L96A 2RO1A 4LYSA 4CFKA 3D7CA 2R0VA 4QC3A 5CUDA 3AQAA 4HXMA 5HM0A 4MEPA 3S91A 5A82A 5HLSA 2YYNA 4A9OA 4Z6HA 3JVLA 4NYWA 4UYFA 4ZC9A 1F68A 4A9KA 4N4GA 5IIDA 5CUGA 4HXSA 2RNWA 4KCXA 4KV4A 4NQNA 5EISA 5G4SA 4NQMA 4CUUA 5HENA 3UV4A 1JM4B 4QYDA 5EA1A 5HQ6A 5CQ8A 4A9FA 5EPBA 5D7XA 3UVDA 4QEUA 5EICA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TU6A 2YELA 4UIXA 4XUAA 5EPSA 3AADA 5F60A 4HXRA 5FE4A 4N4FA 4YYJA 4PCEA 5A5RA 4BW1A 5IGMA 5HCLA 3D1DA 4O7AA 3O33A 5ETDA 2G4AA 5HFRA 3LQIA 4XY9A 4YH4A 5DFDA 4IORA 1EQFA 5EU1A 4HXOA 1X0JA 2RS9B 2YEMA 4UITA 4NR5A 4MR6A 3Q2FA 5C89A 5CQ6A 2NXBA 5FG6A 5CPEA 5EGUA 3U5KA 5E7DA 4A9JA 4QY4A 4A9IA 3IU5A 5F36A 4NXJA 4YYGA 3U5PA 5I40A 5A83A 3I3JA 5DFBA 5LKTA 5D3PA 4YY6A 3O36A 4QSWA 2YQDA 2DATA 5AD3A 5COIA 5E73A 3UVWA 5E9IA 5LVQA 4CL9A 2DVSA 4N4HA 4CURA 5DBMA 5CTLA 3Q2EA 4QC1A 4AKNA 5ACYA 5D3JA 3O37A 5A5NA 5E0RA 5I29A 4IR6A 5IGLA 3K2JA 5HQ5A 5DW1A 5ENBA 4BJXA 5EI4A 2E3KA 5E9YA 4XUBA 4LYWA 4QR5A 4CUPA 5G4RA 5AD2A 4TTEA 5ENFA 5A81A 4YAXA 5FE6A 4IR3A 5IGNA 5E9KA 4MR5A 5I80A 5HEMA 4LRGA 5CFWA 3SVHA 3U5MA 1WUGA 3U5OA 4O71A 3P5OA 5CY9A 5DFCA 4UYDA 4Y03A 4NRBA 4ALHA 4LZRA 4QEVA 5FE9A 5A85A 4TT4A 5DYAA 4QSPA 2R0SA 5FDZA 5D3TA 5J0DA 4YADA 5KHMA 3D1BA 5LKUA 4UIZA 5HRXA 5CQTA 2H60A 5F62A 4PCIA 5CQ7A 5EVAA 4A9MA 3LQHA 5BT4A 5CUCA 3P1FA 5FFWA 4DONA 4OGJA 5ETBA 5ENIA 4LDFA 5FB1A 4J3IA 2D9EA 4J0RA 2DVVA 4RVRA 4XYAA 5JI8A 4TT6A 4UIUA 4HXKA 5D3RA 5FE0A 2DKWA 5EQ1A 4MR4A 3U5JA 4CLBA 2E7OA 5EPRA 2WP1A 4UIWA 2I7KA 5ENJA 4TQNA 3QZVA 4NUCA 2N9GA 4IR5A 3QZTA 4QSXA 4UYGA 5D3NA 5CQ3A 3IU6A 4O7EA 5LUUA 4NR4A 4CUTA 4HBXA 4QR3A 4NS5A 3GG3A 2R0YA 5I7YA 4NRCA 5KTWA 4AI6A 3MQMA 4MR3A 2I8NA 5ENEA 5EWHA 5FBXA 5KO4A 5CS8A 3MB3A 3U5LA 4YYKA 4ZW1A 2MJVB 3ONIA 5I88A 4QUUA 3UVXA 4WIVA 4QSUA 5II2A 3P1DA 4AKIA 5EV9A 2F6JA 3DAIA 4QR4A 5CUBA 2RI7A 5CUEA 5DW2A 3ZYUA 4QSRA 5CZGA 4YBSA 4YYDA 5FE3A 5E3GA 5EWCA 4YYHA 5EP7A 3JVJA 4HXNA 5D3HA 4O74A 4YH3A 5HRWA 4Z1SA 2D82A 5I7XA 5D3LA 5L98A 5D25A 4NR7A 4AKHA 3FKMX 4QBMA 5HFQA 4Q0NA 5CRMA 4XY8A 5FE1A 5A7CA 4KV1A 4TS8A 4BW4A 5C7NA 4O78A 5D0CA 5H85A 4IOQA 3LQJA 3UW9A 5LKZA 2YEKA 4YK0A 5FB0A 3O35A 5D3SA 2RFJA 5EM3A 4YABA 4TT2A 3MULA 4F3IA 5DYXA 2YW5A 1PUOA 4Z6IA 3MB4A 4IOOA 4NR6A 4LYIA 3P1CA 5CQ4A 5TCMA 5L8TA 4QYLA 5HQ7A 5F1LA 5F5ZA 4MEOA 5F2PA 5D26A 5K29A 5IG6A 4N4IA 2DWWA 4C67A 4WHWA 4MENA 4YC9A 4Z93A 3LJWA 5F1HA 2WP2A 5F3AA 5F25A 5E9MA 4O70A 5L99A 4QUTA 4GPJA 5CQ5A 5ENCA 5FG5A 4CUQA 3HMFA 4QSVA 5JWMA 4LZ2A 5A5SA 5FE8A 5E9LA 5FFYA 5DKDA 5E9VA 5F63A 4YYNA 4O75A 4ZQLA 4TU4A 4LC2A 3S92A 5FH8A 3VKHA 2OUOA 4O77A 4PY6A 5CRZA 1N72A 3G0JA 4O76A 5A5QA 4A9LA 4YYIA 2FSAA 5FE7A 5H1VA 3TLPA 4PS5A 4BW3A 3P1EA 3QZSA 4O7FA 5C4QA 2OO1A 5F61A 5DYCA 5DKHA 4NYXA 5L97A 4NRAA 5I89A 1ZKRA 4PKLA 3LXJA 4HBYA 5II1A 4N3WA 2EJNA 4YBTA 5DLXA 1ZS5A 4HXPA 4QSQA 3UV2A 2L85A 4HXLA 4TYLA 5C85A 5ENGA 5BT3A 5CQAA 3DWYA 4NYVA 2YDWA 4QNSA 5LJ2A 3JVMA 5L8UA 3O34A 4HBVA 5CGPA 5EWVA 5DY7A 2KTBB 5I83A 4OGIA 1WUMA 2R10A 2GRCA 4OUFA 5DKCA 3HMEA 2F6NA 4O7BA 5FE2A 3JVKA 4UIYA 3SVGA 5BT5A 5CUAA 4CUSA 5LKXA 4FLPA 3SVFA 3HMHA 4Q0OA 5HRVA 5CP5A 3RCWA 4C66A 3VKGA 5IGKA 4O72A 4LZSA 4QZSA 4QSTA 4BHWA 5AMEA 1E6IA 4UYEA 5FG4A 2LSPB 5A5OA 4UYHA 2RNXA 4UIVA 5LJ1A 5C8GA 1JSPB 2RNYA 4NUDA 5EK9A 2E7NA 2DVQA 5H1TA 5E3DA 3U5NA 4J0SA 5AMFA 4NUEA 4BW2A 3MUKA 5DLZA 2L5EA 4MEQA 3UVYA 5DYUA 5D24A 4YBMA 5HJCA 4CFLA 2L84A 5H1UA 5FE5A 4E96A 4Z1QA 5I86A 5EWWA 5IBNA 4A9EA 4WHUA 5LVRA 3G0LA 5FH6A 4QSSA 5E74A 2OSSA 4YY4A 5A5PA 3NXBA 4YATA 5KTXA 4LR6A 5HELA 5I1QA 4O7CA 5LJ0A 4HBWA 4IR4A 4NR9A 4UYFB 5ENHA 5KTUA 5C87A 4A9HA 5KU3A 5FFVA 4TZ8A 5EWDA 4TZ2A 5FH7A 4QB3A 4A9NA 4ALGA 3UV5A 4X2IA 5TB6A 3MXFA 5CU8A 4J1PA 4QEWA 4PTBA 5DX4A 4YYMA 2DVRA 4NR8A 5L96A 2RO1A 4LYSA 4CFKA 3D7CA 2R0VA 4QC3A 5CUDA 3AQAA 4HXMA 5HM0A 4MEPA 3S91A 5A82A 5HLSA 2YYNA 4A9OA 4Z6HA 3JVLA 4AKGA 4NYWA 4UYFA 3ERRA 4ZC9A 1F68A 4A9KA 4N4GA 5IIDA 5CUGA 4HXSA 2RNWA 4KCXA 4KV4A 4NQNA 5EISA 5G4SA 4NQMA 4CUUA 5HENA 3UV4A 1JM4B 4QYDA 5EA1A 5HQ6A 5CQ8A 4A9FA 5EPBA 5D7XA 3UVDA 4QEUA 5EICA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TU6 A;  2YEL A;  4UIX A;  4XUA A;  5EPS A;  3AAD A;  5F60 A;  4HXR A;  5FE4 A;  4N4F A;  4YYJ A;  4PCE A;  5A5R A;  4BW1 A;  5IGM A;  5HCL A;  4O7A A;  3O33 A;  5ETD A;  2G4A A;  5HFR A;  3LQI A;  4XY9 A;  4YH4 A;  5DFD A;  4IOR A;  1EQF A;  5EU1 A;  4HXO A;  1X0J A;  2RS9 B;  2YEM A;  4UIT A;  4NR5 A;  4MR6 A;  3Q2F A;  5C89 A;  5CQ6 A;  2NXB A;  5FG6 A;  5CPE A;  5EGU A;  3U5K A;  5E7D A;  4A9J A;  4QY4 A;  4A9I A;  3IU5 A;  5F36 A;  4NXJ A;  4YYG A;  3U5P A;  5I40 A;  5A83 A;  3I3J A;  5DFB A;  5LKT A;  5D3P A;  4YY6 A;  3O36 A;  4QSW A;  2YQD A;  2DAT A;  5AD3 A;  5COI A;  5E73 A;  3UVW A;  5E9I A;  5LVQ A;  4CL9 A;  2DVS A;  4N4H A;  4CUR A;  5DBM A;  5CTL A;  3Q2E A;  4QC1 A;  4AKN A;  5ACY A;  5D3J A;  3O37 A;  5A5N A;  5E0R A;  5I29 A;  4IR6 A;  5IGL A;  3K2J A;  5HQ5 A;  5DW1 A;  5ENB A;  4BJX A;  5EI4 A;  2E3K A;  5E9Y A;  4XUB A;  4LYW A;  4QR5 A;  4CUP A;  5G4R A;  5AD2 A;  4TTE A;  5ENF A;  5A81 A;  4YAX A;  5FE6 A;  4IR3 A;  5IGN A;  5E9K A;  4MR5 A;  5I80 A;  5HEM A;  4LRG A; 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