2D82A

Target structure-based discovery of small molecules that block human p53 and creb binding protein (cbp) association
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GSHMRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Target structure-based discovery of small molecules that block human p53 and CREB binding protein association
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 29
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2005-12-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2d82A00
4TT4A 4XYAA 5CS8A 5E0RA 5IGKA 4NUDA 5EK9A 2RNWA 4CUTA 4KCXA 5TB6A 4E96A 4UYDA 4NUEA 5I7YA 4AKNA 5F60A 5A7CA 4O7EA 5A5QA 5E3DA 3MQMA 2DVQA 4CFKA 4HXRA 4UIUA 5EVAA 5II1A 3JVKA 2D82A 4YYKA 5CUEA 4TYLA 2OSSA 5EWCA 5FH6A 5HQ7A 3O33A 4MEQA 3U5KA 5FBXA 2DKWA 5FE3A 5F2PA 4BW4A 5CUGA 4NR9A 5A81A 4IORA 5AD3A 5DW2A 4LRGA 4QSWA 5BT4A 5FG6A 5EWHA 4LZ2A 4QR4A 5BT5A 5HRXA 5EWDA 4WIVA 2R0YA 4QSSA 4YY4A 4TT2A 5DLZA 5HFRA 2DVRA 2DATA 4HXOA 4TQNA 3MXFA 3UW9A 4A9MA 3JVJA 5ETBA 5C8GA 5L8TA 4QZSA 5DYXA 5ENCA 4YYDA 5ACYA 4QUUA 5K29A 5EP7A 3U5JA 3Q2FA 4QC1A 5I83A 5D24A 5I29A 4O7FA 4QSPA 5HQ6A 4NRCA 4NRBA 2G4AA 4QSVA 3LQHA 5C7NA 5II2A 5AMFA 5EM3A 4QR5A 1N72A 5F5ZA 5FE9A 5HQ5A 4LC2A 3ONIA 1F68A 4CUUA 4PCEA 5CQTA 5LJ2A 4QBMA 5CZGA 5AMEA 5CQ5A 2F6JA 2I8NA 5G4SA 5F61A 5C4QA 3U5OA 5KO4A 5F25A 3S92A 2WP2A 5LKZA 4QEVA 4ALGA 5ENGA 4NR4A 2LSPB 5EPRA 3O37A 5F3AA 5FH8A 4CL9A 5CUBA 3IU5A 4N4GA 5HCLA 5CRMA 4QEUA 2MJVB 3U5NA 5E9KA 5KHMA 5DYUA 4YBSA 3O36A 4PTBA 4YYMA 5BT3A 4MEPA 5HRVA 3UVYA 3DWYA 3TLPA 4A9EA 5D3RA 4NR5A 5EU1A 5FFYA 4ALHA 4O7AA 4NYVA 3P1CA 5H85A 4J0SA 5IIDA 4YC9A 5A82A 2GRCA 5E74A 4Z6HA 4YK0A 5FE2A 4QR3A 4A9FA 4BJXA 1E6IA 5FE5A 5D3SA 4O77A 4O72A 2RO1A 5EWVA 2RFJA 3U5LA 4TU4A 3UVXA 3MUKA 3QZVA 2FSAA 4QB3A 4HXLA 4NRAA 5J0DA 5I1QA 5E9LA 5EWWA 4QYDA 5LVRA 4TZ2A 4YBMA 5DFCA 4YABA 4YADA 2YEMA 5G4RA 5CQ6A 5A5PA 4CURA 1JSPB 4QEWA 4Z93A 4YYGA 4J3IA 2R0VA 4MR5A 4NXJA 5A83A 4IOOA 5IGMA 3HMHA 5D3TA 3P1FA 5F1HA 5HENA 4HBVA 4HXMA 4YH4A 4UYGA 5ENEA 3P5OA 4N3WA 5D25A 4LZRA 5C85A 4IR6A 4NR7A 3UV4A 4O70A 5ENBA 4A9LA 5EQ1A 5E9YA 4MR3A 4HBXA 4KV1A 4Y03A 4DONA 5LKUA 3O34A 4WHWA 5ETDA 3RCWA 5I7XA 3O35A 2WP1A 5CU8A 4A9KA 5LJ1A 3G0LA 4LR6A 4LYIA 5L97A 5COIA 4XUAA 4TTEA 5CFWA 5EICA 2YQDA 3LQJA 4PCIA 2D9EA 5CQ8A 4OGJA 2DVSA 2N9GA 3U5PA 4ZW1A 5KTUA 5E9MA 5LKXA 4Z6IA 4NR8A 4HXSA 4TZ8A 4TS8A 4QSQA 5CUDA 5L99A 5EA1A 4O75A 2L85A 5FE4A 3LQIA 4HBYA 5A5OA 4MR4A 2R0SA 2E3KA 5FDZA 5E9VA 5I86A 3SVHA 5DYAA 4YY6A 4RVRA 4UYEA 4MR6A 5F1LA 4CFLA 4BW1A 5DYCA 5I88A 3U5MA 5CTLA 4HXPA 4A9JA 5E9IA 4UYFB 3UVDA 2DVVA 3P1DA 3P1EA 2E7OA 4UITA 4TT6A 3I3JA 3JVLA 2KTBB 4YH3A 5LVQA 2L5EA 4QSXA 3K2JA 4IR4A 4Z1QA 2RNXA 4IOQA 2OO1A 5HFQA 3UV5A 3NXBA 5E7DA 4IR5A 5HJCA 2RS9B 5DKHA 5D0CA 5EGUA 5IGLA 5E3GA 5DKCA 4WHUA 2F6NA 4BW2A 4A9IA 5HELA 3G0JA 5KTXA 4QSTA 5FB0A 5CQ4A 5FE1A 1ZS5A 5H1UA 4LYWA 4YATA 4O74A 4NQNA 5FG5A 5LKTA 2YEKA 2OUOA 4LYSA 3QZTA 4CLBA 4QYLA 2YW5A 4BHWA 5IG6A 4YYHA 3HMEA 5DY7A 3GG3A 5CQAA 5JWMA 4NUCA 5DKDA 2YELA 3D7CA 4Q0OA 5D3JA 4A9OA 5CPEA 4YBTA 5H1VA 5FB1A 5F36A 4N4HA 4Q0NA 5I80A 4UIVA 5FFWA 3MB4A 5A85A 5LUUA 5EPBA 1JM4B 5FH7A 5FFVA 2YDWA 5DX4A 5L98A 4ZQLA 3LXJA 5D3HA 4BW3A 5DW1A 4PKLA 5EV9A 4N4FA 4XY9A 4A9NA 4O71A 4PS5A 4LDFA 5C89A 3ZYUA 4IR3A 5ENFA 5DFDA 3HMFA 4YYNA 3FKMX 5C87A 3MB3A 4QSUA 5DLXA 4O76A 4Z1SA 1WUMA 3JVMA 4NR6A 5HEMA 5HLSA 4J1PA 4QC3A 5F62A 4UIZA 4YYIA 4OUFA 5CUCA 2I7KA 4N4IA 5A5NA 4X2IA 4XY8A 5FE6A 5A5SA 5ENJA 5H1TA 5CQ7A 5DFBA 2L84A 3MULA 2YYNA 5CGPA 4CUSA 4PY6A 5CP5A 3AADA 4O78A 4FLPA 5IGNA 5CUAA 5EI4A 5E73A 4F3IA 4O7CA 3Q2EA 4CUPA 3QZSA 4TU6A 4GPJA 5L96A 2DWWA 4NYWA 5LJ0A 1WUGA 4YAXA 3DAIA 4ZC9A 5JI8A 2RI7A 4QUTA 4YYJA 3IU6A 4HXNA 5D7XA 5KTWA 4XUBA 5CY9A 5FE7A 2H60A 5DBMA 4QSRA 4O7BA 4HBWA 5D26A 3SVGA 4OGIA 5D3PA 5CQ3A 5CRZA 1EQFA 5ENIA 4LZSA 4C66A 5F63A 3AQAA 3UVWA 4NYXA 4J0RA 4UIWA 5D3NA 2NXBA 5I40A 5ENHA 1X0JA 2R10A 4HXKA 4NQMA 2E7NA 5IBNA 4UYHA 4UIYA 5I89A 3UV2A 5FE0A 5HM0A 5FG4A 4C67A 4CUQA 5EPSA 5L8UA 5D3LA 4MEOA 3S91A 4MENA 4A9HA 4QY4A 5AD2A 5A5RA 4UYFA 4QNSA 5EISA 4UIXA 2RNYA 5TCMA 5FE8A 5HRWA 4NS5A 3SVFA 5KU3A 3LJWA 4KV4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TT4A 4XYAA 5CS8A 5E0RA 5IGKA 4NUDA 5EK9A 2RNWA 4CUTA 4KCXA 5TB6A 4E96A 4UYDA 4NUEA 5I7YA 4AKNA 5F60A 5A7CA 4O7EA 5A5QA 5E3DA 3MQMA 2DVQA 4CFKA 4HXRA 4UIUA 5EVAA 5II1A 3JVKA 2D82A 4YYKA 5CUEA 4TYLA 2OSSA 5EWCA 5FH6A 5HQ7A 3O33A 4MEQA 3U5KA 5FBXA 2DKWA 5FE3A 5F2PA 4BW4A 5CUGA 4NR9A 5A81A 4IORA 5AD3A 5DW2A 4LRGA 4QSWA 5BT4A 5FG6A 5EWHA 4LZ2A 4QR4A 5BT5A 5HRXA 5EWDA 4WIVA 2R0YA 4QSSA 4YY4A 4TT2A 5DLZA 5HFRA 2DVRA 4AI6A 2DATA 4HXOA 4TQNA 3MXFA 3UW9A 4A9MA 3VKHA 3JVJA 5ETBA 5C8GA 5L8TA 4QZSA 5DYXA 5ENCA 4YYDA 5ACYA 4QUUA 5K29A 5EP7A 3U5JA 3Q2FA 4QC1A 5I83A 5D24A 5I29A 4O7FA 4QSPA 5HQ6A 4NRCA 4NRBA 2G4AA 4QSVA 3LQHA 5C7NA 5II2A 5AMFA 5EM3A 4QR5A 1N72A 5F5ZA 5FE9A 5HQ5A 4LC2A 3ONIA 1F68A 4CUUA 4PCEA 5CQTA 5LJ2A 4QBMA 5CZGA 5AMEA 5CQ5A 2F6JA 2I8NA 5G4SA 5F61A 5C4QA 3U5OA 3ERRA 5F25A 5KO4A 3S92A 2WP2A 5LKZA 4QEVA 4ALGA 5ENGA 4NR4A 2LSPB 5EPRA 3O37A 5F3AA 5FH8A 4CL9A 5CUBA 3IU5A 4N4GA 5HCLA 5CRMA 4QEUA 2MJVB 3U5NA 5E9KA 5KHMA 5DYUA 4YBSA 3O36A 4PTBA 4YYMA 5BT3A 4MEPA 5HRVA 3UVYA 3DWYA 3TLPA 4A9EA 5D3RA 4NR5A 5EU1A 5FFYA 4ALHA 4O7AA 4NYVA 3P1CA 5H85A 4J0SA 5IIDA 4YC9A 5A82A 2GRCA 5E74A 4Z6HA 4YK0A 5FE2A 4QR3A 4A9FA 4BJXA 1E6IA 5FE5A 5D3SA 4O77A 4O72A 2RO1A 5EWVA 2RFJA 3U5LA 4TU4A 3UVXA 3MUKA 3QZVA 2FSAA 4QB3A 4HXLA 4NRAA 5J0DA 5I1QA 5E9LA 5EWWA 4QYDA 5LVRA 4TZ2A 4YBMA 5DFCA 4YABA 4YADA 2YEMA 5G4RA 5CQ6A 5A5PA 4CURA 1JSPB 4QEWA 4Z93A 4YYGA 4J3IA 2R0VA 4MR5A 4NXJA 5A83A 4IOOA 5IGMA 3HMHA 5D3TA 3P1FA 5F1HA 5HENA 4HBVA 4HXMA 4YH4A 4UYGA 5ENEA 3P5OA 4N3WA 5D25A 4LZRA 5C85A 4IR6A 4NR7A 3UV4A 4O70A 5ENBA 4A9LA 5EQ1A 5E9YA 4MR3A 4HBXA 4KV1A 4Y03A 4DONA 5LKUA 3O34A 4WHWA 5ETDA 3RCWA 5I7XA 3O35A 2WP1A 5CU8A 4A9KA 5LJ1A 3G0LA 4LR6A 4LYIA 5L97A 5COIA 4XUAA 4TTEA 5CFWA 5EICA 2YQDA 3LQJA 4PCIA 2D9EA 5CQ8A 4OGJA 2DVSA 2N9GA 3D1BA 3U5PA 4ZW1A 5KTUA 5E9MA 1PUOA 5LKXA 4Z6IA 4NR8A 4HXSA 4TZ8A 4TS8A 4QSQA 5CUDA 5L99A 5EA1A 1ZKRA 4O75A 2L85A 5FE4A 3LQIA 4HBYA 5A5OA 4MR4A 2R0SA 2E3KA 5FDZA 5E9VA 5I86A 3SVHA 5DYAA 4YY6A 4RVRA 4UYEA 4MR6A 5F1LA 4CFLA 4BW1A 5DYCA 5I88A 4AKHA 3U5MA 5CTLA 4HXPA 4A9JA 5E9IA 4UYFB 3UVDA 2DVVA 4AKIA 3P1DA 3P1EA 2E7OA 4UITA 4TT6A 3I3JA 3JVLA 2KTBB 4YH3A 5LVQA 2L5EA 4QSXA 3K2JA 4IR4A 4Z1QA 2RNXA 4IOQA 2OO1A 5HFQA 3UV5A 3NXBA 5E7DA 4IR5A 5HJCA 2RS9B 5DKHA 5D0CA 5EGUA 5IGLA 5E3GA 5DKCA 4WHUA 2F6NA 4BW2A 4A9IA 5HELA 3G0JA 5KTXA 4QSTA 5FB0A 5CQ4A 5FE1A 1ZS5A 5H1UA 4LYWA 4YATA 4O74A 4NQNA 5FG5A 5LKTA 2YEKA 2OUOA 4LYSA 3QZTA 4CLBA 4QYLA 2YW5A 4BHWA 5IG6A 4YYHA 3HMEA 5DY7A 3GG3A 2EJNA 5CQAA 5JWMA 4NUCA 5DKDA 2YELA 3D7CA 4Q0OA 5D3JA 4A9OA 5CPEA 4YBTA 5H1VA 5FB1A 5F36A 4N4HA 4Q0NA 5I80A 4UIVA 5FFWA 3MB4A 5A85A 5LUUA 5EPBA 1JM4B 5FH7A 5FFVA 2YDWA 5DX4A 5L98A 4ZQLA 3D1DA 3LXJA 5D3HA 4BW3A 5DW1A 4PKLA 5EV9A 4N4FA 4XY9A 4A9NA 4O71A 4PS5A 4LDFA 5C89A 3ZYUA 4IR3A 5ENFA 5DFDA 3HMFA 4YYNA 3FKMX 5C87A 3MB3A 4QSUA 5DLXA 4O76A 4Z1SA 1WUMA 3JVMA 4NR6A 5HEMA 3VKGA 5HLSA 4J1PA 4QC3A 5F62A 4UIZA 4YYIA 4OUFA 5CUCA 2I7KA 4N4IA 5A5NA 4X2IA 4XY8A 5FE6A 5A5SA 5ENJA 5H1TA 5CQ7A 5DFBA 2L84A 3MULA 2YYNA 4AKGA 5CGPA 4CUSA 4PY6A 5CP5A 3AADA 4O78A 4FLPA 5IGNA 5CUAA 5EI4A 5E73A 4F3IA 4O7CA 3Q2EA 4CUPA 3QZSA 4TU6A 4GPJA 5L96A 2DWWA 4NYWA 5LJ0A 1WUGA 4YAXA 3DAIA 4ZC9A 5JI8A 2RI7A 4QUTA 4YYJA 3IU6A 4HXNA 5D7XA 5KTWA 4XUBA 5CY9A 5FE7A 2H60A 5DBMA 4QSRA 4O7BA 4HBWA 5D26A 3SVGA 4OGIA 5D3PA 5CQ3A 5CRZA 1EQFA 5ENIA 4LZSA 4C66A 5F63A 3AQAA 3UVWA 4NYXA 4J0RA 4UIWA 5D3NA 2NXBA 5I40A 5ENHA 1X0JA 2R10A 4HXKA 4NQMA 2E7NA 5IBNA 4UYHA 4UIYA 5I89A 3UV2A 5FE0A 5HM0A 5FG4A 4C67A 4CUQA 5EPSA 5L8UA 5D3LA 4MEOA 3S91A 4MENA 4A9HA 4QY4A 5AD2A 5A5RA 4UYFA 4QNSA 5EISA 4UIXA 2RNYA 5TCMA 5FE8A 5HRWA 4NS5A 3SVFA 5KU3A 3LJWA 4KV4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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