2GRCA

1.5 a structure of bromodomain from human brg1 protein, a central atpase of swi/snf remodeling complex
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
EKLSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural ramification for acetyl-lysine recognition by the bromodomain of human BRG1 protein, a central ATPase of the SWI/SNF remodeling complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable global transcription activator SNF2L4
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 3.6.1.-:
pdb deposition date 2006-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2grcA00
4IOQA 4YATA 3SVGA 4YYKA 5FE2A 4TTEA 5AD2A 5FFWA 5E74A 4A9LA 2DWWA 4NYXA 4BW2A 5D3HA 5DKCA 4QEVA 3UVXA 4MEQA 4UYGA 5D7XA 4UIUA 4QSPA 5FH6A 3JVLA 2D9EA 2YQDA 3LJWA 5G4SA 1EQFA 5J0DA 5D3SA 5DY7A 5HENA 2I8NA 4NRCA 5CUDA 3TLPA 4QB3A 4UYHA 4NRAA 5AMFA 4CUSA 2E7OA 4QC3A 5A81A 4YY4A 2YELA 4CUUA 3P5OA 2D82A 4OGJA 4UYDA 5FB0A 5EWVA 5E9KA 5F60A 4BJXA 5BT5A 4YBTA 4Y03A 4UYEA 5DLZA 5D3LA 5D26A 3LQIA 4QR3A 5EVAA 5CP5A 5A5QA 3QZVA 5DFDA 2H60A 2KTBB 5DKHA 3U5OA 4ZQLA 5G4RA 2R0YA 4HBXA 5FFYA 3UV5A 4CUPA 4BW4A 5LJ0A 5CQ8A 5FB1A 5IIDA 5FE0A 4KV1A 4LDFA 4QYDA 5LJ1A 5I89A 4MR3A 5FE5A 4LC2A 4PKLA 4TYLA 5HQ6A 5HEMA 5D24A 2F6JA 5D25A 2RFJA 3MQMA 5FFVA 3O36A 4IR5A 5EK9A 2RS9B 5CUAA 5EGUA 2WP1A 4LR6A 5ENIA 2LSPB 5IGNA 2DVQA 4Z93A 4IR4A 4ZW1A 5E9VA 5KU3A 4NYWA 3MULA 5A5RA 5EQ1A 4CUQA 4YH3A 3S91A 5CQ3A 3P1FA 5L96A 5HFRA 4ZC9A 5H1TA 5A85A 4UIVA 5FE7A 5COIA 5LKZA 3O35A 4J0RA 3LXJA 5BT3A 5BT4A 5CUEA 2DATA 5F25A 5FE1A 3UVDA 5ENJA 3QZTA 3U5KA 4LRGA 5EWCA 4HBWA 4HXRA 5KTWA 4N4IA 5EM3A 5HLSA 5EWHA 5II1A 5FE9A 4HBVA 5I29A 2YW5A 5H85A 4O77A 4YYDA 4QSRA 5E3DA 4O7AA 5HJCA 5I40A 5DYUA 5ENGA 4N4HA 5K29A 2RNXA 3UVWA 5EPRA 4YAXA 3MXFA 5EISA 4QNSA 4UITA 4Z6HA 4YYGA 2YDWA 5F5ZA 5LKTA 5CY9A 5FE3A 5ENEA 5DFBA 5CQ4A 5L8TA 4E96A 4TQNA 4YYIA 5D3NA 3HMEA 2OO1A 3RCWA 5C87A 4MR4A 4HXNA 4QSWA 4HXSA 2MJVB 4NUCA 2E3KA 4YH4A 5AD3A 5FG6A 4CL9A 2L5EA 3I3JA 4HXPA 3P1DA 4O72A 5DKDA 4XUAA 4TZ2A 4J3IA 5D3TA 4GPJA 3U5JA 4TZ8A 4NUDA 4O76A 4CURA 5HQ5A 4PCEA 5D0CA 4UYFA 3UVYA 5EICA 4XY8A 4LYIA 3G0JA 4CFLA 2OSSA 5IG6A 5CFWA 2G4AA 3QZSA 2R0SA 4YK0A 5ETBA 5LJ2A 2OUOA 4O75A 5EWDA 5FH8A 3LQHA 5CS8A 4IOOA 4O7BA 5EU1A 5A5OA 4TT2A 5H1UA 5JI8A 4PY6A 4A9JA 4LYSA 4PCIA 5E3GA 5LUUA 3S92A 4QC1A 4QSXA 5L97A 4J0SA 4O74A 4Z6IA 4WHWA 3SVFA 3JVKA 3O37A 5JWMA 5CPEA 5II2A 4NUEA 4BW3A 5EPSA 4X2IA 3P1CA 4CLBA 3SVHA 3O34A 4Z1QA 5FH7A 5C89A 5E9LA 5TCMA 5HCLA 5KTXA 5KO4A 5CRMA 5TB6A 4A9OA 3MB4A 4UYFB 5CZGA 4FLPA 5HM0A 4PTBA 4NYVA 5A82A 5FE6A 3FKMX 4QR5A 5DYCA 3AQAA 4KCXA 3JVMA 3NXBA 5F36A 1JSPB 5F1HA 4QSSA 2YYNA 2YEMA 4IORA 4NS5A 4QEWA 2DVRA 5F2PA 5I7YA 5DW1A 4TU4A 5I83A 4QSVA 4NRBA 4KV4A 1ZS5A 4LZRA 3Q2EA 4YBMA 2R0VA 4XY9A 5ETDA 5KTUA 4RVRA 5CUBA 4NQMA 5FDZA 1F68A 2F6NA 5A5NA 4IR3A 4MEOA 4ALGA 5A5SA 5F1LA 4TT4A 4XYAA 3DAIA 4QEUA 4QSUA 4A9FA 4UIWA 4A9EA 5IGKA 4C67A 2RO1A 5DLXA 4Z1SA 2RNYA 5FBXA 4J1PA 5ENFA 4YYMA 4CUTA 2RI7A 5CU8A 4O7EA 1WUGA 4IR6A 3UV4A 3ZYUA 4HBYA 4UIYA 5IGMA 1X0JA 3U5NA 2DKWA 4TT6A 3P1EA 3HMFA 5F61A 4OUFA 5D3RA 3MB3A 4QSQA 4O7CA 5EP7A 5E0RA 2DVSA 5DFCA 4LZ2A 5ACYA 4CFKA 5DYAA 5I1QA 2RNWA 4NXJA 5EI4A 5L99A 4QZSA 4XUBA 5I86A 5CTLA 4UIZA 4YABA 5DW2A 5AMEA 5HQ7A 4YYNA 2L85A 5E9YA 4O70A 4YADA 4QR4A 4HXKA 2DVVA 4ALHA 4WHUA 5HFQA 5ENHA 5FG5A 4TU6A 4NQNA 5L8UA 1N72A 2GRCA 2WP2A 5C85A 5A83A 5E9MA 4UIXA 5CQTA 5CQAA 4LYWA 4YY6A 1JM4B 4Q0OA 5F3AA 3AADA 4A9NA 4NR4A 4F3IA 2E7NA 5HRWA 3U5LA 5I7XA 4MEPA 5I80A 5ENBA 5C4QA 4MENA 3K2JA 4TS8A 5E73A 5F62A 4YYHA 4O71A 3Q2FA 4LZSA 4MR5A 4PS5A 5I88A 4QY4A 3HMHA 5E9IA 2L84A 5LVQA 1E6IA 5ENCA 3U5PA 4N4GA 5IBNA 4C66A 5HRXA 3UV2A 5E7DA 5CGPA 5CQ6A 4QUTA 5L98A 2I7KA 3U5MA 3IU5A 2NXBA 4A9HA 4A9MA 5LVRA 3IU6A 2FSAA 4QUUA 3MUKA 5HELA 2YEKA 4HXMA 4QSTA 4QBMA 4QYLA 5KHMA 5EWWA 3O33A 5CRZA 3UW9A 5DX4A 4O78A 5FE4A 5CUGA 5CQ5A 5HRVA 5CQ7A 3LQJA 5A5PA 5FG4A 4DONA 5LKXA 2R10A 5D3JA 5IGLA 4OGIA 4YC9A 4AKNA 5D3PA 4A9KA 5H1VA 4HXOA 5EA1A 5CUCA 5DBMA 3G0LA 5EV9A 4NR9A 4O7FA 4BW1A 3DWYA 5A7CA 4YBSA 4HXLA 4Q0NA 2N9GA 4N3WA 4NR5A 3D7CA 4NR8A 5EPBA 5C8GA 4NR6A 4MR6A 5FE8A 3GG3A 1WUMA 3ONIA 4NR7A 5DYXA 4N4FA 3JVJA 4BHWA 4YYJA 4A9IA 5C7NA 5LKUA 4WIVA 5F63A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IOQA 4YATA 3SVGA 4YYKA 5FE2A 4TTEA 5AD2A 5FFWA 1PUOA 5E74A 4A9LA 2DWWA 4NYXA 4BW2A 5D3HA 5DKCA 4QEVA 3UVXA 4MEQA 4UYGA 5D7XA 4UIUA 4QSPA 5FH6A 3JVLA 2D9EA 2YQDA 3LJWA 5G4SA 1EQFA 5J0DA 5D3SA 5DY7A 5HENA 2I8NA 4NRCA 5CUDA 3TLPA 4QB3A 4UYHA 4NRAA 5AMFA 4CUSA 2E7OA 4QC3A 5A81A 4YY4A 2YELA 4CUUA 3P5OA 2D82A 4OGJA 4UYDA 5FB0A 5EWVA 5E9KA 5F60A 4BJXA 5BT5A 4YBTA 4Y03A 4UYEA 5DLZA 5D3LA 5D26A 3LQIA 4QR3A 5EVAA 5CP5A 5A5QA 3QZVA 5DFDA 2H60A 2KTBB 5DKHA 3U5OA 4ZQLA 5G4RA 2R0YA 4HBXA 5FFYA 3UV5A 4CUPA 2EJNA 4BW4A 5LJ0A 5CQ8A 5FB1A 5IIDA 5FE0A 4KV1A 4LDFA 4QYDA 5LJ1A 5I89A 4MR3A 5FE5A 4LC2A 4PKLA 4TYLA 5HQ6A 5HEMA 5D24A 2F6JA 5D25A 2RFJA 3MQMA 5FFVA 3O36A 4IR5A 5EK9A 2RS9B 5CUAA 5EGUA 2WP1A 4LR6A 5ENIA 2LSPB 5IGNA 2DVQA 4Z93A 4IR4A 4ZW1A 5E9VA 5KU3A 4NYWA 3MULA 5A5RA 5EQ1A 4CUQA 4YH3A 3S91A 5CQ3A 3P1FA 5L96A 5HFRA 3D1BA 4ZC9A 5H1TA 5A85A 4UIVA 5FE7A 5COIA 5LKZA 3O35A 4J0RA 3LXJA 5BT3A 5BT4A 5CUEA 2DATA 5F25A 5FE1A 4AKIA 3UVDA 5ENJA 3QZTA 3U5KA 4LRGA 5EWCA 4HBWA 4HXRA 5KTWA 4N4IA 5EM3A 5HLSA 5EWHA 5II1A 5FE9A 4HBVA 5I29A 2YW5A 5H85A 4O77A 4YYDA 4QSRA 5E3DA 4O7AA 5HJCA 5I40A 5DYUA 5ENGA 4N4HA 5K29A 2RNXA 3UVWA 5EPRA 4YAXA 3MXFA 5EISA 4QNSA 4UITA 4Z6HA 4YYGA 2YDWA 5F5ZA 5LKTA 5CY9A 5FE3A 5ENEA 5DFBA 5CQ4A 5L8TA 4E96A 4TQNA 4YYIA 5D3NA 3HMEA 2OO1A 3RCWA 5C87A 4MR4A 4HXNA 4QSWA 4HXSA 2MJVB 4NUCA 2E3KA 4YH4A 5AD3A 5FG6A 4CL9A 2L5EA 3I3JA 4HXPA 3P1DA 4O72A 5DKDA 4XUAA 4TZ2A 4J3IA 5D3TA 4GPJA 3U5JA 4TZ8A 4NUDA 4O76A 4CURA 5HQ5A 4PCEA 5D0CA 4UYFA 3UVYA 5EICA 4XY8A 4LYIA 3G0JA 4CFLA 2OSSA 5IG6A 5CFWA 2G4AA 3QZSA 2R0SA 4YK0A 5ETBA 5LJ2A 2OUOA 4O75A 5EWDA 5FH8A 3LQHA 5CS8A 4IOOA 4O7BA 5EU1A 5A5OA 4TT2A 5H1UA 5JI8A 4PY6A 4A9JA 4LYSA 4PCIA 5E3GA 5LUUA 3S92A 4QC1A 4QSXA 5L97A 4J0SA 4O74A 4Z6IA 4WHWA 3SVFA 3JVKA 3O37A 5JWMA 5CPEA 5II2A 4NUEA 4BW3A 5EPSA 4X2IA 3P1CA 4CLBA 3SVHA 3O34A 4Z1QA 4AI6A 5FH7A 5C89A 5E9LA 5TCMA 5HCLA 5KTXA 5KO4A 5CRMA 5TB6A 4A9OA 3MB4A 4UYFB 5CZGA 4FLPA 5HM0A 4PTBA 4NYVA 5A82A 1ZKRA 5FE6A 3FKMX 4QR5A 5DYCA 3AQAA 4KCXA 3JVMA 3NXBA 5F36A 1JSPB 5F1HA 4QSSA 2YYNA 4AKHA 2YEMA 4IORA 4NS5A 4QEWA 2DVRA 5F2PA 5I7YA 5DW1A 4TU4A 5I83A 4QSVA 4NRBA 4KV4A 1ZS5A 4LZRA 3Q2EA 4YBMA 2R0VA 4XY9A 3D1DA 5ETDA 5KTUA 4RVRA 5CUBA 4NQMA 5FDZA 1F68A 2F6NA 5A5NA 4IR3A 4MEOA 4ALGA 5A5SA 5F1LA 4TT4A 4XYAA 3DAIA 4QEUA 4QSUA 4A9FA 4UIWA 4A9EA 5IGKA 4C67A 2RO1A 5DLXA 4Z1SA 2RNYA 5FBXA 4J1PA 5ENFA 4YYMA 4CUTA 2RI7A 5CU8A 4O7EA 1WUGA 4AKGA 4IR6A 3UV4A 3ZYUA 4HBYA 4UIYA 5IGMA 1X0JA 3U5NA 2DKWA 4TT6A 3P1EA 3HMFA 5F61A 4OUFA 5D3RA 3MB3A 4QSQA 4O7CA 5EP7A 5E0RA 2DVSA 5DFCA 4LZ2A 5ACYA 4CFKA 5DYAA 5I1QA 2RNWA 4NXJA 5EI4A 5L99A 4QZSA 4XUBA 5I86A 5CTLA 4UIZA 4YABA 5DW2A 5AMEA 5HQ7A 4YYNA 2L85A 5E9YA 4O70A 4YADA 3VKHA 4QR4A 4HXKA 2DVVA 4ALHA 4WHUA 5HFQA 5ENHA 5FG5A 4TU6A 4NQNA 5L8UA 1N72A 2GRCA 2WP2A 5C85A 5A83A 5E9MA 4UIXA 5CQTA 5CQAA 4LYWA 4YY6A 1JM4B 4Q0OA 5F3AA 3AADA 4A9NA 4NR4A 4F3IA 2E7NA 5HRWA 3U5LA 5I7XA 4MEPA 5I80A 5ENBA 5C4QA 4MENA 3K2JA 4TS8A 5E73A 5F62A 4YYHA 4O71A 3Q2FA 4LZSA 4MR5A 4PS5A 5I88A 4QY4A 3HMHA 5E9IA 2L84A 5LVQA 1E6IA 5ENCA 3U5PA 4N4GA 5IBNA 4C66A 5HRXA 3UV2A 5E7DA 5CGPA 5CQ6A 4QUTA 5L98A 2I7KA 3U5MA 3IU5A 2NXBA 4A9HA 4A9MA 5LVRA 3IU6A 2FSAA 4QUUA 3VKGA 3MUKA 5HELA 2YEKA 4HXMA 4QSTA 4QBMA 4QYLA 5KHMA 5EWWA 3O33A 5CRZA 3UW9A 5DX4A 4O78A 5FE4A 5CUGA 5CQ5A 5HRVA 5CQ7A 3LQJA 5A5PA 5FG4A 4DONA 5LKXA 2R10A 5D3JA 5IGLA 4OGIA 4YC9A 4AKNA 5D3PA 4A9KA 5H1VA 4HXOA 5EA1A 5CUCA 5DBMA 3G0LA 5EV9A 4NR9A 4O7FA 4BW1A 3DWYA 5A7CA 4YBSA 4HXLA 4Q0NA 2N9GA 4N3WA 4NR5A 3D7CA 4NR8A 5EPBA 5C8GA 4NR6A 4MR6A 5FE8A 3GG3A 1WUMA 3ONIA 4NR7A 5DYXA 4N4FA 3JVJA 3ERRA 4BHWA 4YYJA 4A9IA 5C7NA 5LKUA 4WIVA 5F63A
chains in the Genus database with same CATH topology
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