2RNXA

The structural basis for site-specific lysine-acetylated histone recognition by the bromodomains of the human transcriptional co-activators pcaf and cbp
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
GSHMSKEPRDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLIDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural Basis of Site-Specific Histone Recognition by the Bromodomains of Human Coactivators PCAF and CBP/p300
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/nuclear protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Histone acetyltransferase PCAF
total genus 31
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2008-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 2rnxA00
4NR9A 5ETBA 5EP7A 4QSQA 4XUAA 3U5MA 2DATA 3LQHA 4LYIA 1ZS5A 4CFKA 4CURA 5H1TA 5E9VA 5JWMA 4XY8A 4OUFA 5I89A 4UIVA 3SVHA 4MEPA 5I7YA 5CPEA 4TYLA 4UIYA 5ENEA 5L99A 3MB3A 4YY4A 5EISA 4HXRA 5HLSA 5D3LA 2R10A 5EVAA 5JI8A 4MR5A 4NQMA 4YK0A 5DBMA 2RI7A 4NRBA 4UYGA 4QEWA 4QUUA 5I29A 5AD3A 4NYWA 5FH7A 4YC9A 5F3AA 5CQ8A 5A5RA 5CTLA 5DKCA 5CFWA 5CQTA 5F25A 2YW5A 5HQ7A 4UIXA 5KO4A 2I7KA 4A9HA 5DLXA 2E7OA 5F36A 5HFRA 4IR3A 4TT2A 5F1LA 4ZW1A 2F6NA 3LXJA 3TLPA 4A9FA 4RVRA 2WP2A 3QZVA 4Z93A 5E0RA 3MQMA 5HJCA 5G4RA 5HFQA 2YQDA 5L8UA 4MEQA 5E9LA 5LKUA 4MEOA 2L85A 4N4HA 4TTEA 2N9GA 3I3JA 5ENFA 4FLPA 4O7FA 5I7XA 3NXBA 4O72A 5LJ0A 1WUGA 3O33A 4A9KA 5D0CA 5CQ3A 5AD2A 2GRCA 2OUOA 5D3TA 3HMEA 5CZGA 4BW3A 5FDZA 5L98A 5KTWA 2DVQA 4CUTA 5K29A 5I40A 5L97A 5DLZA 4YH4A 4YBMA 3UW9A 2OSSA 4DONA 5C89A 4TZ2A 4QEVA 4Z6IA 4YATA 5FG4A 5DFCA 5EWVA 4ALGA 5H85A 2RS9B 3LJWA 5CUCA 5CUBA 4CFLA 2RNWA 4NUDA 3P1CA 5LKXA 4QSVA 5LUUA 3UV5A 5FG6A 5HCLA 4MR6A 3SVFA 5DW2A 1EQFA 3S92A 3IU6A 4LYWA 5EWCA 3D7CA 4YH3A 4TS8A 5FH8A 4IOQA 3O36A 5D3JA 3UV2A 5LKZA 3UVXA 4CUPA 4TZ8A 5C87A 1E6IA 2NXBA 4NQNA 5J0DA 5FE8A 5FE4A 3ZYUA 3UVWA 5EU1A 2YEMA 5CU8A 5KHMA 3JVJA 5EPBA 5HQ5A 4KCXA 4Y03A 1N72A 3K2JA 4TT4A 5I86A 3O37A 4C67A 4WHUA 4GPJA 2DVRA 4MR3A 5IGMA 2DVVA 3P1DA 4NR7A 5DY7A 3JVKA 5E9IA 2WP1A 3IU5A 4QYDA 4WIVA 2H60A 5CQ7A 5BT4A 4OGJA 5HRXA 3LQIA 4A9JA 5KTUA 3QZSA 5EICA 5FE6A 4F3IA 5IBNA 5C7NA 3UVYA 5DX4A 4PKLA 5DKDA 5FFYA 4PY6A 3JVLA 5I1QA 5E3DA 5EPSA 4QR5A 5E3GA 4QSXA 4NUEA 4YYMA 5D3PA 4KV1A 5EWHA 5A81A 5EA1A 4UYFA 5D3RA 4UYEA 5CQAA 5EQ1A 4BW1A 5HRVA 5LKTA 5A82A 4ZQLA 5A85A 5G4SA 4YADA 4NYXA 4UIWA 3JVMA 3U5JA 5FH6A 3U5LA 4HXOA 4YYJA 2DVSA 4UYHA 5HRWA 4O76A 4QSWA 5DFBA 4O70A 4YBSA 5D25A 4YYHA 3O35A 5IGLA 3HMFA 5FB1A 4CLBA 5F61A 4YYIA 4N3WA 3U5OA 5FE1A 2FSAA 4LRGA 4LZRA 2R0VA 4BHWA 5A7CA 3U5KA 4N4IA 5F60A 4PTBA 3UV4A 2L5EA 5A5OA 5C85A 5IGKA 4NR5A 5II1A 3AADA 4PS5A 4QB3A 2RNYA 4QSTA 4A9OA 3P1EA 5II2A 5EWDA 2L84A 5AMEA 2RO1A 4IR5A 2MJVB 4N4GA 4YAXA 4HBWA 4OGIA 5COIA 5I80A 5A5SA 5EV9A 5DYUA 4A9MA 5ACYA 4CUSA 5CP5A 5HQ6A 5ETDA 5D3SA 3S91A 2R0SA 4CL9A 3MULA 4WHWA 2OO1A 5IG6A 4QSSA 5BT3A 4HBXA 4Z1QA 2DWWA 5E9YA 1JSPB 4NRAA 4NRCA 4YYGA 4UYDA 4UITA 4ALHA 5LJ2A 4O71A 2RNXA 3DAIA 4NR8A 2G4AA 4Z6HA 5D26A 3Q2EA 2DKWA 5D3NA 5HEMA 4IOOA 4UIZA 3G0LA 4O78A 3ONIA 3O34A 5EPRA 3SVGA 5EK9A 4O7BA 5E74A 3QZTA 5H1VA 5FFVA 4C66A 3MB4A 3GG3A 4XY9A 5FE0A 5ENCA 5FE7A 3U5PA 5F5ZA 3HMHA 4MR4A 4ZC9A 4YBTA 5CGPA 2D9EA 5E7DA 4QC3A 5A5PA 5LJ1A 5DYAA 5FE2A 4LDFA 4CUQA 4O74A 5ENJA 5EM3A 4QC1A 4QZSA 5CQ6A 5BT5A 4QBMA 4J3IA 4QSUA 5CRMA 4HXNA 4IORA 4PCIA 3P5OA 2E7NA 4HXSA 4HBVA 2D82A 4YABA 4HXKA 4QR4A 1X0JA 3UVDA 5F2PA 5F63A 4NUCA 4YYNA 4MENA 5DKHA 5FE9A 3LQJA 4TU4A 1JM4B 5A5NA 4QR3A 2YYNA 4O7CA 5CUAA 3MUKA 2YELA 4A9LA 5IGNA 4XYAA 4UIUA 4TU6A 5DW1A 4LZ2A 3RCWA 2E3KA 5D3HA 4Q0OA 5A83A 5I83A 5CQ4A 4HBYA 5DFDA 2R0YA 5HM0A 4QSRA 4O7EA 1WUMA 2F6JA 5F1HA 4QYLA 2YEKA 5ENIA 5ENBA 4CUUA 5H1UA 2LSPB 4PCEA 4LC2A 4LYSA 5CUDA 5TCMA 4NS5A 3FKMX 5HELA 5CQ5A 3U5NA 5KTXA 5HENA 4A9IA 5FG5A 4A9EA 5C8GA 4IR4A 5CS8A 4LR6A 2YDWA 3AQAA 5E73A 4O77A 5LVQA 4J1PA 4QY4A 4QSPA 5D24A 4J0RA 4IR6A 4QUTA 5F62A 5DYCA 4X2IA 4O7AA 5EI4A 4E96A 4O75A 5IIDA 4HXLA 3Q2FA 4UYFB 4HXMA 4TT6A 5EWWA 5D7XA 5C4QA 2RFJA 5L8TA 4KV4A 4N4FA 4J0SA 5FE5A 3DWYA 4A9NA 4QNSA 4AKNA 4LZSA 5TB6A 5CRZA 5CUEA 4NXJA 5AMFA 3P1FA 5FBXA 2KTBB 5CY9A 1F68A 5ENHA 5FFWA 5A5QA 4YYDA 4NR4A 4BW4A 4XUBA 5CUGA 5EGUA 2I8NA 4YY6A 5KU3A 4HXPA 3G0JA 4BJXA 4QEUA 5FE3A 5I88A 4Q0NA 4Z1SA 4BW2A 5LVRA 4TQNA 5DYXA 4NR6A 5FB0A 5ENGA 5E9KA 4YYKA 5E9MA 3MXFA 4NYVA 5L96A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NR9A 5ETBA 5EP7A 4QSQA 4XUAA 3U5MA 2DATA 3LQHA 4LYIA 1ZS5A 4CFKA 4CURA 5H1TA 5E9VA 5JWMA 4XY8A 4OUFA 5I89A 4UIVA 3SVHA 4MEPA 5I7YA 5CPEA 4TYLA 4UIYA 5ENEA 5L99A 3MB3A 4YY4A 5EISA 4HXRA 5HLSA 5D3LA 2R10A 5EVAA 5JI8A 4MR5A 4NQMA 4YK0A 5DBMA 2RI7A 4NRBA 4UYGA 4QEWA 4QUUA 5I29A 5AD3A 4NYWA 5FH7A 4YC9A 5F3AA 5CQ8A 5A5RA 5CTLA 5DKCA 5CFWA 5CQTA 5F25A 2YW5A 5HQ7A 4UIXA 5KO4A 2I7KA 4A9HA 5DLXA 2E7OA 5F36A 5HFRA 4IR3A 4TT2A 5F1LA 4ZW1A 2F6NA 3LXJA 3TLPA 4A9FA 4RVRA 2WP2A 3QZVA 4Z93A 5E0RA 3MQMA 5HJCA 5G4RA 5HFQA 2YQDA 5L8UA 4MEQA 5E9LA 5LKUA 4MEOA 2L85A 4N4HA 4TTEA 2N9GA 3I3JA 5ENFA 4FLPA 4O7FA 5I7XA 3NXBA 4O72A 5LJ0A 1WUGA 3O33A 4A9KA 5D0CA 5CQ3A 5AD2A 3VKHA 2GRCA 2OUOA 5D3TA 3HMEA 5CZGA 4BW3A 5FDZA 5L98A 5KTWA 2DVQA 4CUTA 5K29A 5I40A 5L97A 5DLZA 4YH4A 4YBMA 3UW9A 2OSSA 4DONA 5C89A 4TZ2A 4QEVA 4Z6IA 4YATA 5FG4A 5DFCA 5EWVA 4ALGA 5H85A 2RS9B 3LJWA 2EJNA 5CUCA 5CUBA 4CFLA 2RNWA 4NUDA 3P1CA 5LKXA 4QSVA 5LUUA 3UV5A 5FG6A 5HCLA 4MR6A 3SVFA 5DW2A 1EQFA 3S92A 3IU6A 4LYWA 5EWCA 3D7CA 4YH3A 4TS8A 5FH8A 4IOQA 3O36A 5D3JA 3UV2A 5LKZA 3UVXA 4CUPA 4TZ8A 5C87A 4AKIA 1E6IA 2NXBA 4NQNA 5J0DA 5FE8A 5FE4A 3ZYUA 3UVWA 5EU1A 2YEMA 5CU8A 5KHMA 3JVJA 5EPBA 5HQ5A 4KCXA 4Y03A 1N72A 3K2JA 4AKGA 4TT4A 5I86A 3O37A 4C67A 3ERRA 4WHUA 4GPJA 2DVRA 4MR3A 5IGMA 2DVVA 3P1DA 4NR7A 5DY7A 3JVKA 5E9IA 2WP1A 3IU5A 4QYDA 4WIVA 2H60A 5CQ7A 5BT4A 4OGJA 5HRXA 3LQIA 4A9JA 5KTUA 3QZSA 5EICA 5FE6A 4F3IA 5IBNA 5C7NA 3UVYA 5DX4A 4PKLA 5DKDA 5FFYA 4PY6A 3JVLA 5I1QA 5E3DA 5EPSA 4QR5A 5E3GA 4QSXA 4NUEA 4YYMA 5D3PA 4KV1A 5EWHA 5A81A 5EA1A 4UYFA 5D3RA 4UYEA 5CQAA 5EQ1A 4BW1A 5HRVA 5LKTA 5A82A 4ZQLA 5A85A 5G4SA 4YADA 4NYXA 4UIWA 3JVMA 3U5JA 5FH6A 3U5LA 4HXOA 3D1DA 4YYJA 2DVSA 4UYHA 5HRWA 4O76A 4QSWA 5DFBA 4O70A 4YBSA 5D25A 4YYHA 3O35A 5IGLA 3HMFA 5FB1A 4CLBA 5F61A 4YYIA 4N3WA 3U5OA 5FE1A 2FSAA 4LRGA 4LZRA 2R0VA 4BHWA 5A7CA 3U5KA 4N4IA 5F60A 4PTBA 3UV4A 2L5EA 5A5OA 5C85A 5IGKA 4NR5A 5II1A 3AADA 4PS5A 4QB3A 2RNYA 4QSTA 4A9OA 3P1EA 5II2A 5EWDA 2L84A 5AMEA 2RO1A 4IR5A 2MJVB 4N4GA 4YAXA 4HBWA 4OGIA 5COIA 5I80A 5A5SA 5EV9A 5DYUA 4A9MA 5ACYA 4CUSA 5CP5A 5HQ6A 5ETDA 5D3SA 3S91A 2R0SA 4CL9A 3MULA 4WHWA 2OO1A 5IG6A 4QSSA 5BT3A 4HBXA 4Z1QA 2DWWA 5E9YA 1JSPB 4NRAA 4NRCA 4YYGA 4UYDA 4UITA 4ALHA 5LJ2A 4O71A 2RNXA 3DAIA 4NR8A 2G4AA 4Z6HA 5D26A 3Q2EA 2DKWA 5D3NA 5HEMA 4IOOA 4UIZA 3G0LA 4O78A 3ONIA 3O34A 5EPRA 3SVGA 5EK9A 4O7BA 5E74A 3QZTA 5H1VA 5FFVA 4C66A 3MB4A 3GG3A 4XY9A 5FE0A 5ENCA 5FE7A 3U5PA 5F5ZA 3HMHA 4MR4A 4ZC9A 4YBTA 5CGPA 2D9EA 5E7DA 4QC3A 5A5PA 5LJ1A 5DYAA 4AI6A 5FE2A 4LDFA 4CUQA 4O74A 5ENJA 5EM3A 4QC1A 4QZSA 5CQ6A 5BT5A 4QBMA 4J3IA 4QSUA 5CRMA 4HXNA 4IORA 4PCIA 3P5OA 2E7NA 4HXSA 4HBVA 2D82A 4YABA 4HXKA 4QR4A 1X0JA 3UVDA 5F2PA 5F63A 4NUCA 4YYNA 4MENA 5DKHA 5FE9A 3LQJA 4TU4A 1JM4B 5A5NA 4QR3A 2YYNA 4O7CA 5CUAA 3MUKA 2YELA 4A9LA 5IGNA 4XYAA 4UIUA 4TU6A 5DW1A 4LZ2A 3RCWA 2E3KA 5D3HA 4Q0OA 5A83A 5I83A 4AKHA 3VKGA 5CQ4A 4HBYA 5DFDA 2R0YA 5HM0A 4QSRA 4O7EA 1WUMA 2F6JA 5F1HA 4QYLA 2YEKA 5ENIA 5ENBA 4CUUA 5H1UA 2LSPB 4PCEA 4LC2A 4LYSA 5CUDA 5TCMA 4NS5A 3FKMX 5HELA 5CQ5A 3U5NA 5KTXA 5HENA 3D1BA 4A9IA 5FG5A 4A9EA 5C8GA 4IR4A 5CS8A 4LR6A 2YDWA 3AQAA 5E73A 4O77A 5LVQA 4J1PA 4QY4A 4QSPA 5D24A 4J0RA 4IR6A 4QUTA 5F62A 5DYCA 4X2IA 4O7AA 5EI4A 4E96A 4O75A 5IIDA 4HXLA 1PUOA 3Q2FA 4UYFB 4HXMA 4TT6A 5EWWA 5D7XA 5C4QA 1ZKRA 2RFJA 5L8TA 4KV4A 4N4FA 4J0SA 5FE5A 3DWYA 4A9NA 4QNSA 4AKNA 4LZSA 5TB6A 5CRZA 5CUEA 4NXJA 5AMFA 3P1FA 5FBXA 2KTBB 5CY9A 1F68A 5ENHA 5FFWA 5A5QA 4YYDA 4NR4A 4BW4A 4XUBA 5CUGA 5EGUA 2I8NA 4YY6A 5KU3A 4HXPA 3G0JA 4BJXA 4QEUA 5FE3A 5I88A 4Q0NA 4Z1SA 4BW2A 5LVRA 4TQNA 5DYXA 4NR6A 5FB0A 5ENGA 5E9KA 4YYKA 5E9MA 3MXFA 4NYVA 5L96A
chains in the Genus database with same CATH topology
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