4TT6A

Crystal structure of atad2a bromodomain double mutant n1063a-y1064a in apo form
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEAAPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
molecule tags Gene regulation
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tt6A00
3JVMA 5ENIA 4BJXA 2MJVB 4MEOA 2GRCA 5HRVA 4NR8A 5D3JA 4WHUA 3UVYA 4O77A 3U5PA 4A9FA 2I8NA 4NRCA 4NUDA 5D3SA 3O33A 5DKDA 4O7CA 3SVGA 1X0JA 5D3PA 2KTBB 2RS9B 4AKNA 3UV4A 3P1DA 5LUUA 5E3GA 4NUEA 5FFYA 4Q0NA 5F1LA 5IGLA 4NYWA 3LXJA 5FG5A 4BW4A 4LZ2A 4QR4A 5JI8A 4TT2A 4BW3A 5LVRA 4QR3A 5IGKA 2OUOA 4J0RA 4XY9A 5AD3A 5D0CA 4QSQA 4KV1A 5D25A 5F1HA 3FKMX 5A5QA 4QEUA 5FE9A 5IGMA 3HMFA 3MQMA 4LYSA 3JVJA 5A5OA 3ZYUA 4GPJA 4TU6A 5DLZA 5EQ1A 5LKTA 4YBSA 4E96A 4N3WA 5KO4A 3LQIA 3Q2FA 4IORA 4Z1SA 4LYIA 4HXKA 4QZSA 5DFCA 5HJCA 5E9KA 5I86A 4BHWA 4IOOA 5C89A 3AQAA 4TQNA 5CFWA 5AMFA 5E74A 4N4HA 5COIA 4UYFA 4NXJA 5I83A 4QBMA 4YATA 5HLSA 4YYJA 3S92A 5G4RA 5G4SA 2D9EA 4NR9A 2DKWA 4NR6A 4QEWA 4HXOA 2OSSA 4PCIA 5KTXA 5F60A 3LQHA 4QSUA 3LJWA 5I7XA 4LDFA 2WP2A 4O7FA 4TT4A 5EWCA 4CFKA 4F3IA 5CQ6A 2OO1A 4Z6HA 2NXBA 4IR6A 5FE5A 4Z93A 5EPRA 4MR6A 4LZRA 4O78A 4C67A 4TYLA 3P1CA 4CUQA 4QEVA 4TZ8A 5BT5A 5ETBA 1WUGA 5HRXA 5KHMA 5EP7A 4FLPA 5CUBA 5FE3A 3O35A 4IR3A 4TT6A 4CURA 5CQ5A 5EV9A 4YY4A 3DWYA 4IOQA 5EA1A 5TCMA 2R0SA 4A9MA 1E6IA 5AD2A 3U5LA 3G0LA 5F62A 4UYGA 5FE2A 5LVQA 3UW9A 4HXMA 5A5RA 4QSXA 5F2PA 5CUCA 4N4GA 5KTUA 3UVXA 4HXPA 5FG6A 4YABA 5EPSA 5TB6A 5E9MA 4LRGA 5ENEA 3P1FA 3MULA 4NRBA 4O71A 3U5JA 3U5NA 5FE7A 2R10A 4UIWA 5DKCA 5I89A 5JWMA 2RNWA 4YYGA 3SVFA 5E9VA 4UIXA 5CQ4A 5ENCA 4WIVA 4A9OA 5I7YA 4UITA 4Z6IA 4J1PA 4YC9A 5CTLA 5LKZA 4MR5A 4NQMA 4UYHA 4NUCA 4QYLA 4IR5A 5A82A 4PCEA 5CUEA 2YELA 4PTBA 4QYDA 5J0DA 5ENJA 4LR6A 4YYIA 4A9EA 5EK9A 4X2IA 5L97A 5EPBA 3TLPA 5DFBA 4Q0OA 2DWWA 4IR4A 3JVKA 2RNXA 2WP1A 4RVRA 5FH6A 5CPEA 4QR5A 5CRZA 5LJ2A 5L8UA 4QY4A 4NS5A 5EGUA 4UYDA 4YYKA 5CY9A 4NQNA 4MEPA 5HM0A 2R0YA 5CQ3A 4HXLA 5CS8A 5FE0A 5A5PA 4QSRA 4O7AA 4NYVA 5A83A 5LJ0A 5F25A 5I88A 4LZSA 2YYNA 4QSTA 5D3TA 4LC2A 3SVHA 5A81A 4O74A 5EU1A 5FG4A 4CUPA 5LKXA 2L85A 3HMHA 1ZS5A 3MB4A 5DY7A 5ENHA 4QSWA 5D3NA 5DW2A 3JVLA 5DLXA 3S91A 4QSVA 4Z1QA 5H1UA 4QSSA 5DYAA 5IIDA 5DW1A 5DX4A 4O7EA 5EWWA 4ZC9A 4KV4A 5EWHA 1WUMA 4HXRA 5DYXA 4TU4A 5KU3A 2RO1A 4A9KA 3MUKA 3NXBA 5CU8A 5E7DA 2H60A 4A9NA 3I3JA 2E3KA 4CUSA 5E9IA 5C85A 2E7NA 4UYFB 4OGIA 5CRMA 5BT4A 3IU6A 4TZ2A 5ENFA 4N4IA 5A5SA 4UIVA 4TS8A 5FBXA 1JSPB 2G4AA 3O36A 3P5OA 2FSAA 4YY6A 4C66A 5FE8A 5HQ5A 2RI7A 5HFQA 5A5NA 5A7CA 4UYEA 4O75A 4QB3A 3U5KA 4DONA 3UV5A 4ALGA 2F6JA 2DVVA 5D3LA 4YH3A 5C4QA 5ETDA 5L8TA 4NR4A 5HEMA 5EICA 4HXSA 5L99A 3P1EA 4HXNA 2DVSA 5HQ6A 4OGJA 5C8GA 4CL9A 5F36A 5L96A 4YYHA 2YQDA 4J3IA 5E9LA 4OUFA 2YEMA 4CUTA 4NYXA 4A9IA 5ACYA 2DATA 5BT3A 4YYNA 5DFDA 2DVQA 5ENGA 5HFRA 5F63A 1JM4B 3MXFA 4O70A 5IG6A 3QZSA 3QZVA 5FE6A 5EVAA 5E73A 4N4FA 5KTWA 4HBWA 5F61A 5FH7A 5DYCA 4QSPA 4YK0A 4YH4A 5EI4A 4XY8A 4MENA 4NRAA 4ZQLA 5IGNA 5FE1A 3UVDA 5D24A 2RNYA 4Y03A 3RCWA 5I29A 5AMEA 5CQTA 3O34A 3DAIA 5K29A 3K2JA 1EQFA 5FH8A 3U5OA 4TTEA 5ENBA 5H85A 5D7XA 2F6NA 4HBXA 5CQ7A 3LQJA 4WHWA 3UV2A 5DYUA 5H1VA 5C7NA 5FB1A 4NR5A 4MEQA 4ZW1A 4BW1A 5E3DA 3AADA 5CUAA 5F3AA 5A85A 4YBMA 3D7CA 4QUUA 4PKLA 4A9JA 4O72A 5D26A 4ALHA 5II1A 5HQ7A 3U5MA 2LSPB 5FFWA 5CQAA 5FDZA 5HENA 4XUBA 2YDWA 1N72A 4YYMA 4O76A 4BW2A 4QC1A 5EWVA 2L84A 5FB0A 5D3RA 4A9LA 4CFLA 3MB3A 5CP5A 3Q2EA 2RFJA 4MR3A 3UVWA 3G0JA 4UIUA 4YAXA 5EM3A 5L98A 5H1TA 4J0SA 5I40A 2YEKA 4XUAA 5CUDA 5EISA 3HMEA 2D82A 5HELA 3ONIA 2DVRA 5II2A 2E7OA 2N9GA 1F68A 5E9YA 4UIYA 4O7BA 2YW5A 5F5ZA 4QC3A 5LJ1A 5HRWA 5CGPA 4UIZA 5CZGA 5E0RA 4CUUA 5CUGA 5D3HA 5C87A 5IBNA 4YYDA 4XYAA 4HBYA 4A9HA 4QUTA 5EWDA 4YADA 5DBMA 4PS5A 4PY6A 3IU5A 5FE4A 4KCXA 5I80A 5HCLA 5I1QA 3GG3A 4YBTA 5CQ8A 4NR7A 2I7KA 2L5EA 4CLBA 4MR4A 5LKUA 4HBVA 4LYWA 5DKHA 5FFVA 4QNSA 2R0VA 3QZTA 3O37A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JVMA 5ENIA 4BJXA 2MJVB 4MEOA 2GRCA 5HRVA 4NR8A 5D3JA 4WHUA 3UVYA 4O77A 3U5PA 4A9FA 2I8NA 4NRCA 4NUDA 5D3SA 3O33A 5DKDA 4O7CA 3SVGA 1X0JA 5D3PA 2KTBB 2RS9B 4AKNA 3UV4A 3P1DA 5LUUA 5E3GA 4NUEA 5FFYA 4Q0NA 5F1LA 5IGLA 4NYWA 3LXJA 5FG5A 4BW4A 4LZ2A 4QR4A 5JI8A 4TT2A 4BW3A 5LVRA 4QR3A 5IGKA 2OUOA 4J0RA 4XY9A 5AD3A 5D0CA 4QSQA 4KV1A 5D25A 5F1HA 3FKMX 5A5QA 4QEUA 5FE9A 5IGMA 1ZKRA 3HMFA 3MQMA 4LYSA 3JVJA 5A5OA 3ZYUA 4GPJA 4TU6A 5DLZA 5EQ1A 5LKTA 4YBSA 4E96A 4N3WA 5KO4A 3LQIA 3Q2FA 4IORA 3ERRA 4Z1SA 4LYIA 4HXKA 4QZSA 5DFCA 5HJCA 5E9KA 5I86A 4BHWA 4IOOA 5C89A 3AQAA 4TQNA 5CFWA 5AMFA 5E74A 4N4HA 5COIA 4UYFA 4NXJA 5I83A 4QBMA 4YATA 5HLSA 4YYJA 3S92A 5G4RA 5G4SA 2D9EA 4NR9A 2DKWA 4NR6A 4QEWA 4HXOA 2OSSA 4PCIA 5KTXA 5F60A 3LQHA 4QSUA 3LJWA 5I7XA 4LDFA 2WP2A 4O7FA 4TT4A 5EWCA 4CFKA 4F3IA 5CQ6A 2OO1A 4Z6HA 2NXBA 4IR6A 5FE5A 4Z93A 5EPRA 4MR6A 4LZRA 4O78A 4C67A 4TYLA 3P1CA 4CUQA 4QEVA 4TZ8A 5BT5A 5ETBA 1WUGA 5HRXA 5KHMA 5EP7A 4FLPA 5CUBA 5FE3A 3O35A 4IR3A 4TT6A 4CURA 5CQ5A 5EV9A 4YY4A 3DWYA 4IOQA 5EA1A 5TCMA 2R0SA 4A9MA 1E6IA 5AD2A 3U5LA 3G0LA 5F62A 4UYGA 5FE2A 5LVQA 3UW9A 4HXMA 5A5RA 4QSXA 5F2PA 5CUCA 4N4GA 5KTUA 3UVXA 4HXPA 5FG6A 4YABA 5EPSA 5TB6A 5E9MA 4LRGA 5ENEA 3P1FA 3MULA 4NRBA 4O71A 3U5JA 3U5NA 5FE7A 2R10A 4UIWA 5DKCA 5I89A 5JWMA 2RNWA 4YYGA 3SVFA 5E9VA 4UIXA 5CQ4A 5ENCA 4WIVA 4A9OA 3D1DA 4UITA 5I7YA 4Z6IA 4J1PA 4YC9A 4AKGA 5CTLA 5LKZA 4MR5A 4NQMA 3D1BA 4UYHA 4NUCA 4QYLA 4IR5A 5A82A 4PCEA 5CUEA 2YELA 4PTBA 4QYDA 5J0DA 5ENJA 4LR6A 4YYIA 4A9EA 5EK9A 4X2IA 5L97A 5EPBA 3TLPA 5DFBA 4Q0OA 2DWWA 4IR4A 3JVKA 2RNXA 2WP1A 4RVRA 5FH6A 5CPEA 4QR5A 5CRZA 5LJ2A 1PUOA 5L8UA 4QY4A 4NS5A 5EGUA 4UYDA 4YYKA 5CY9A 4NQNA 4MEPA 5HM0A 2R0YA 5CQ3A 4HXLA 5CS8A 5FE0A 5A5PA 4QSRA 4O7AA 4NYVA 3VKHA 5A83A 5LJ0A 5F25A 5I88A 4LZSA 2YYNA 4QSTA 5D3TA 4LC2A 3SVHA 5A81A 4O74A 5EU1A 5FG4A 4CUPA 5LKXA 2L85A 3HMHA 1ZS5A 3MB4A 5DY7A 5ENHA 4QSWA 5D3NA 5DW2A 3JVLA 5DLXA 3S91A 4QSVA 4Z1QA 5H1UA 4QSSA 5DYAA 5IIDA 5DW1A 5DX4A 4O7EA 5EWWA 4ZC9A 4KV4A 5EWHA 1WUMA 4HXRA 5DYXA 4TU4A 5KU3A 2RO1A 4A9KA 3MUKA 3NXBA 5CU8A 5E7DA 2H60A 4A9NA 3I3JA 2E3KA 4CUSA 5E9IA 5C85A 2E7NA 4UYFB 4OGIA 5CRMA 5BT4A 3IU6A 4TZ2A 5ENFA 4N4IA 5A5SA 4UIVA 4TS8A 5FBXA 1JSPB 2G4AA 3O36A 3P5OA 2FSAA 4YY6A 4C66A 5FE8A 5HQ5A 2RI7A 5HFQA 5A5NA 5A7CA 4UYEA 4O75A 4QB3A 3U5KA 4DONA 3UV5A 4ALGA 2F6JA 2DVVA 5D3LA 4YH3A 5C4QA 5ETDA 5L8TA 4NR4A 5HEMA 5EICA 4HXSA 5L99A 3P1EA 4HXNA 2DVSA 5HQ6A 4OGJA 5C8GA 4CL9A 5F36A 2EJNA 5L96A 4YYHA 2YQDA 4J3IA 5E9LA 4OUFA 2YEMA 4CUTA 4NYXA 4AI6A 4A9IA 3VKGA 5ACYA 2DATA 5BT3A 4YYNA 5DFDA 2DVQA 5ENGA 5HFRA 5F63A 1JM4B 3MXFA 4O70A 5IG6A 3QZSA 3QZVA 5FE6A 5EVAA 5E73A 4N4FA 5KTWA 4HBWA 5F61A 5FH7A 5DYCA 4QSPA 4YK0A 4YH4A 5EI4A 4XY8A 4MENA 4NRAA 4ZQLA 5IGNA 5FE1A 3UVDA 5D24A 2RNYA 4Y03A 3RCWA 5I29A 5AMEA 5CQTA 3O34A 3DAIA 5K29A 3K2JA 4AKIA 1EQFA 5FH8A 3U5OA 4TTEA 5ENBA 5H85A 5D7XA 2F6NA 4HBXA 5CQ7A 3LQJA 4WHWA 3UV2A 5DYUA 5H1VA 5C7NA 4AKHA 5FB1A 4NR5A 4MEQA 4ZW1A 4BW1A 5E3DA 3AADA 5CUAA 5F3AA 5A85A 4YBMA 3D7CA 4QUUA 4PKLA 4A9JA 4O72A 5D26A 4ALHA 5II1A 5HQ7A 3U5MA 2LSPB 5FFWA 5CQAA 5FDZA 5HENA 4XUBA 2YDWA 1N72A 4YYMA 4O76A 4BW2A 4QC1A 5EWVA 2L84A 5FB0A 5D3RA 4A9LA 4CFLA 3MB3A 5CP5A 3Q2EA 2RFJA 4MR3A 3UVWA 3G0JA 4UIUA 4YAXA 5EM3A 5L98A 5H1TA 4J0SA 5I40A 2YEKA 4XUAA 5CUDA 5EISA 3HMEA 2D82A 5HELA 3ONIA 2DVRA 5II2A 2E7OA 2N9GA 1F68A 5E9YA 4UIYA 4O7BA 2YW5A 5F5ZA 4QC3A 5LJ1A 5HRWA 5CGPA 4UIZA 5CZGA 5E0RA 4CUUA 5CUGA 5D3HA 5C87A 5IBNA 4YYDA 4XYAA 4HBYA 4A9HA 4QUTA 5EWDA 4YADA 4PY6A 4PS5A 5DBMA 3IU5A 5FE4A 4KCXA 5I80A 5HCLA 5I1QA 3GG3A 4YBTA 5CQ8A 4NR7A 2I7KA 2L5EA 4CLBA 4MR4A 5LKUA 4HBVA 4LYWA 5DKHA 5FFVA 4QNSA 2R0VA 3QZTA 3O37A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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