4A9KA

Bromodomain of human crebbp with n-(4-hydroxyphenyl)acetamide
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords CREB-BINDING PROTEIN
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9kA00
4HXNA 4YADA 4Z6HA 3JVKA 5EPRA 3IU6A 4HXLA 4QB3A 5ENJA 5D3LA 5ENBA 4UIZA 4QSQA 5A5QA 5IIDA 2L5EA 5FE7A 4A9HA 4Z6IA 4QR5A 5KTUA 2YEMA 5TCMA 4NUEA 2R10A 4XY9A 4YBMA 3ONIA 4NQNA 5C87A 4OUFA 4TS8A 5HEMA 5IGLA 5CUDA 3LQHA 4HBWA 4WIVA 4PCEA 5A83A 4C66A 2RI7A 5C8GA 4UYGA 3QZVA 4X2IA 4UITA 3S92A 5D3TA 4UYFB 4MR5A 5E9KA 2RO1A 5JWMA 5CUAA 5EPSA 5CPEA 5C89A 4NYWA 4CLBA 4QSVA 2L84A 4PKLA 5A82A 5I1QA 4NR4A 5DFCA 4MEOA 5EI4A 4ZC9A 3S91A 5CQ7A 3SVGA 4HXRA 3P1DA 5EK9A 3AQAA 5EPBA 5HRVA 5HQ7A 4PY6A 5F61A 5KU3A 5FB1A 5HJCA 5FE3A 3UV5A 4TYLA 5FDZA 5CGPA 4Z93A 4TZ2A 4HBVA 4KCXA 5FB0A 2DVQA 5I29A 5A5RA 5FFYA 2YQDA 4O77A 5HENA 3SVHA 3D7CA 5A5NA 4O75A 4QSTA 4LZ2A 5DW2A 5K29A 2I7KA 5G4RA 5ACYA 3SVFA 5A5PA 5EWWA 5AMFA 4A9OA 3HMEA 4LR6A 5LUUA 3FKMX 3O35A 5C4QA 5F62A 5DX4A 5AD2A 4NR5A 5TB6A 5D3JA 5C85A 5ENEA 5ENIA 4CFLA 2H60A 1EQFA 3HMHA 5A81A 5CP5A 4HXSA 4YYIA 2DATA 3HMFA 5AMEA 5HELA 5D0CA 5FE9A 4NYXA 3UVWA 1JM4B 5FE5A 4XUAA 4BHWA 5LKTA 5A5SA 1ZS5A 5FE2A 3ZYUA 4YYGA 3UVYA 5FE8A 4N4HA 5D3PA 4FLPA 5EICA 4DONA 2DWWA 5DKHA 4YATA 4MR6A 3UW9A 5H85A 4N4GA 4UIVA 5CUBA 5DY7A 2OSSA 5HRWA 5CQ6A 4J1PA 4ZW1A 4AKNA 5EP7A 4IOOA 5FE0A 4J0SA 5CUEA 4IR6A 5DW1A 5L8UA 5ENHA 3U5PA 4CUSA 4NRAA 4OGJA 5D3HA 3TLPA 3LJWA 5DFBA 1WUGA 4CUPA 4GPJA 2LSPB 3UV2A 2YELA 4YH3A 4J3IA 3MB3A 2RS9B 5DFDA 5F3AA 4UYHA 5E9MA 4LZRA 5KTWA 4QUTA 5DLZA 3MB4A 3U5OA 1WUMA 4TU6A 5FH6A 4QC3A 4O74A 4QYDA 4TU4A 5D3NA 4WHWA 4HXOA 4RVRA 4TT2A 2D9EA 5CQ5A 5L99A 2L85A 4NYVA 5AD3A 5E0RA 5EVAA 4MR3A 5IBNA 4YAXA 4KV1A 5CY9A 4LDFA 5HCLA 4YY6A 5CRZA 4ALGA 3P5OA 5HQ6A 4NR8A 4N4FA 4CL9A 4J0RA 5D3RA 5ETDA 2FSAA 2WP2A 4Q0OA 4NXJA 4O70A 4CUQA 4Z1QA 4CFKA 5E9VA 4HBXA 5LKZA 4QBMA 3O36A 5E73A 4O72A 4MENA 5A7CA 2DVVA 3Q2EA 4C67A 4YYHA 4YBSA 5EV9A 4Q0NA 5DLXA 4QNSA 5CS8A 4HXKA 5EU1A 5H1VA 2KTBB 5I40A 2YDWA 3DWYA 5FFVA 5E3GA 5IG6A 5LKXA 4UIXA 3MULA 4QSPA 3MXFA 4TT4A 5E74A 5E9LA 5EWCA 4XY8A 5DYCA 5DBMA 5E9YA 5F63A 4IORA 4QYLA 4OGIA 3QZTA 4N4IA 5II1A 4IR3A 4XYAA 3G0JA 5F5ZA 2I8NA 4QEUA 4QY4A 4QEVA 4ALHA 3LQIA 2WP1A 4QEWA 3NXBA 5F36A 1N72A 5I83A 5FE1A 5COIA 4NUDA 2E3KA 5DYXA 5I89A 2YYNA 4QZSA 2R0VA 4UYEA 4IR5A 4QSUA 5LJ2A 2R0YA 5L8TA 1JSPB 2DKWA 5CQAA 4F3IA 5D24A 4LYIA 3Q2FA 4UIYA 4CUTA 4NQMA 3JVMA 4A9EA 4QR3A 4MEQA 4NRCA 3O34A 5I88A 3MQMA 5ENCA 4A9LA 1E6IA 4Z1SA 5FH8A 5CTLA 4BW2A 5IGNA 3U5MA 2F6JA 2GRCA 5A85A 5DYUA 5HQ5A 5CRMA 4A9MA 2RNWA 5ENFA 5I7XA 4PS5A 4UYDA 5I80A 4UIWA 4YY4A 3UV4A 4HXMA 4ZQLA 3K2JA 5FG5A 3LQJA 4XUBA 5FG4A 4LRGA 5BT4A 4TTEA 5IGKA 4QUUA 2E7OA 4YC9A 3QZSA 5CQ8A 3O33A 5J0DA 4MR4A 3IU5A 3GG3A 3DAIA 4YYNA 2RNXA 2RNYA 5L97A 4BW4A 5A5OA 5EA1A 4BW3A 4QSXA 2OO1A 4HBYA 5D7XA 5FE6A 5H1UA 4YH4A 5D25A 4N3WA 1F68A 3RCWA 2DVSA 5E9IA 5F2PA 4YK0A 4QSWA 3MUKA 4A9KA 5FG6A 4O7FA 4YYMA 4BW1A 5FFWA 4IR4A 5FE4A 2YEKA 5CQTA 5KTXA 4IOQA 3P1CA 4QR4A 2E7NA 3I3JA 4YABA 5F1LA 5EGUA 5IGMA 5CUGA 4O71A 4Y03A 4O7EA 5HRXA 5LJ0A 5L98A 5EWHA 5EWDA 5JI8A 3JVJA 5EISA 2R0SA 5CZGA 4O7AA 4NRBA 4HXPA 1X0JA 5EQ1A 4LYWA 5BT5A 2NXBA 4O76A 5HM0A 4YYKA 3U5KA 5EM3A 4MEPA 4A9IA 5ENGA 5HLSA 5LKUA 4NR9A 3U5NA 5CQ4A 5EWVA 4KV4A 4CUUA 5F60A 4TT6A 3LXJA 5G4SA 5E3DA 4QSRA 5HFRA 2N9GA 4YYDA 5F25A 5II2A 5I86A 4NR7A 4NUCA 4A9FA 5LVRA 5LVQA 5F1HA 2D82A 2DVRA 4E96A 3AADA 2MJVB 5DYAA 3JVLA 3UVXA 4QSSA 4O7BA 5CU8A 2YW5A 4BJXA 4PCIA 5BT3A 5E7DA 3UVDA 5DKDA 4YYJA 4LYSA 5I7YA 3U5LA 5ETBA 3U5JA 4NR6A 4PTBA 4WHUA 5KHMA 5H1TA 5C7NA 5KO4A 3P1EA 5CFWA 5FH7A 2F6NA 5D3SA 5CUCA 5FBXA 2RFJA 4O78A 4A9JA 4A9NA 4TZ8A 4NS5A 5D26A 2OUOA 4TQNA 4UIUA 5HFQA 4QC1A 3P1FA 4LC2A 5LJ1A 4CURA 3O37A 2G4AA 4O7CA 5L96A 5DKCA 3G0LA 5CQ3A 4UYFA 4LZSA 4YBTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXNA 4YADA 4Z6HA 3VKGA 3JVKA 5EPRA 3ERRA 3IU6A 4HXLA 4QB3A 5ENJA 5D3LA 5ENBA 4UIZA 4QSQA 5A5QA 5IIDA 2L5EA 5FE7A 4A9HA 4Z6IA 4QR5A 5KTUA 2YEMA 5TCMA 4NUEA 2R10A 4XY9A 4YBMA 3ONIA 4NQNA 5C87A 4OUFA 4TS8A 5HEMA 5IGLA 5CUDA 3LQHA 4HBWA 4WIVA 4PCEA 5A83A 4C66A 2RI7A 5C8GA 3D1BA 4UYGA 3QZVA 4X2IA 4UITA 3S92A 5D3TA 4UYFB 4MR5A 5E9KA 2RO1A 5JWMA 4AKIA 5CUAA 5EPSA 5CPEA 5C89A 4NYWA 4CLBA 4QSVA 2L84A 4PKLA 5A82A 5I1QA 4NR4A 5DFCA 4MEOA 5EI4A 4ZC9A 3S91A 5CQ7A 3SVGA 4HXRA 3P1DA 5EK9A 3AQAA 5EPBA 5HRVA 5HQ7A 4PY6A 5F61A 5KU3A 5FB1A 5HJCA 5FE3A 3UV5A 4TYLA 5FDZA 5CGPA 4Z93A 4TZ2A 4HBVA 4KCXA 5FB0A 2DVQA 5I29A 5A5RA 5FFYA 2YQDA 4O77A 5HENA 3SVHA 3D7CA 5A5NA 4O75A 4QSTA 4LZ2A 5DW2A 5K29A 2I7KA 5G4RA 5ACYA 3SVFA 5A5PA 5EWWA 5AMFA 4A9OA 3HMEA 4LR6A 5LUUA 3FKMX 3O35A 5C4QA 5F62A 5DX4A 5AD2A 4NR5A 5TB6A 5D3JA 5C85A 5ENEA 5ENIA 4CFLA 2H60A 1EQFA 3HMHA 5A81A 5CP5A 4HXSA 4YYIA 2DATA 3HMFA 5AMEA 5HELA 5D0CA 5FE9A 1PUOA 4NYXA 3UVWA 1JM4B 5FE5A 4XUAA 4AI6A 4BHWA 5LKTA 5A5SA 1ZS5A 5FE2A 3ZYUA 4YYGA 3UVYA 5FE8A 4N4HA 5D3PA 4FLPA 5EICA 4DONA 2DWWA 5DKHA 4YATA 4MR6A 3UW9A 5H85A 4N4GA 4UIVA 5CUBA 5DY7A 2OSSA 5HRWA 5CQ6A 4J1PA 4ZW1A 4AKNA 5EP7A 4IOOA 4AKGA 5FE0A 4J0SA 5CUEA 4IR6A 5DW1A 5L8UA 5ENHA 3U5PA 4CUSA 4NRAA 1ZKRA 4OGJA 5D3HA 3TLPA 3LJWA 5DFBA 1WUGA 4CUPA 4GPJA 2LSPB 3UV2A 2YELA 4YH3A 4J3IA 3MB3A 2RS9B 5DFDA 5F3AA 4UYHA 5E9MA 4LZRA 5KTWA 4QUTA 5DLZA 3MB4A 3U5OA 1WUMA 4TU6A 5FH6A 4QC3A 4O74A 4QYDA 4TU4A 5D3NA 4WHWA 4HXOA 4RVRA 4TT2A 2D9EA 5CQ5A 5L99A 2L85A 4NYVA 5AD3A 5E0RA 5EVAA 4MR3A 5IBNA 4YAXA 4KV1A 5CY9A 4LDFA 5HCLA 4YY6A 5CRZA 4ALGA 3P5OA 5HQ6A 4NR8A 4N4FA 4CL9A 4J0RA 3D1DA 5D3RA 5ETDA 2FSAA 2WP2A 4Q0OA 4NXJA 4O70A 4CUQA 4Z1QA 4CFKA 5E9VA 4HBXA 5LKZA 4QBMA 3O36A 5E73A 4O72A 4MENA 5A7CA 2DVVA 3Q2EA 4C67A 4YYHA 4YBSA 5EV9A 4Q0NA 5DLXA 4QNSA 5CS8A 4HXKA 5EU1A 5H1VA 2KTBB 5I40A 2YDWA 3DWYA 5FFVA 5E3GA 5IG6A 5LKXA 4UIXA 3MULA 4QSPA 3MXFA 4TT4A 5E74A 5E9LA 5EWCA 4XY8A 5DYCA 5DBMA 5E9YA 5F63A 4IORA 4QYLA 4OGIA 3QZTA 4N4IA 5II1A 4IR3A 4XYAA 3G0JA 5F5ZA 2I8NA 4QEUA 4QY4A 4QEVA 4ALHA 3LQIA 2WP1A 4QEWA 3NXBA 5F36A 1N72A 5I83A 5FE1A 5COIA 4NUDA 2E3KA 5DYXA 5I89A 2YYNA 4QZSA 2R0VA 4UYEA 4IR5A 4QSUA 5LJ2A 2R0YA 5L8TA 1JSPB 2DKWA 5CQAA 4F3IA 5D24A 4LYIA 3Q2FA 4UIYA 4CUTA 4NQMA 3JVMA 4A9EA 4QR3A 4MEQA 4NRCA 3O34A 5I88A 3MQMA 5ENCA 4A9LA 1E6IA 4Z1SA 5FH8A 5CTLA 4BW2A 5IGNA 3U5MA 2F6JA 2GRCA 5A85A 5DYUA 5HQ5A 5CRMA 4A9MA 2RNWA 5ENFA 5I7XA 4PS5A 4UYDA 5I80A 4UIWA 4YY4A 3UV4A 4HXMA 4ZQLA 3K2JA 5FG5A 3LQJA 4XUBA 5FG4A 4LRGA 5BT4A 4TTEA 5IGKA 4QUUA 2E7OA 4YC9A 3QZSA 5CQ8A 3O33A 5J0DA 4MR4A 3IU5A 3GG3A 3DAIA 4YYNA 2RNXA 2RNYA 5L97A 4BW4A 5A5OA 5EA1A 4AKHA 4BW3A 4QSXA 2OO1A 4HBYA 5D7XA 5FE6A 5H1UA 4YH4A 5D25A 4N3WA 1F68A 3RCWA 2DVSA 5E9IA 5F2PA 4YK0A 4QSWA 3MUKA 4A9KA 5FG6A 4O7FA 4YYMA 4BW1A 5FFWA 4IR4A 5FE4A 2YEKA 5CQTA 5KTXA 4IOQA 3P1CA 4QR4A 2E7NA 3I3JA 4YABA 5F1LA 5EGUA 5IGMA 5CUGA 4O71A 4Y03A 4O7EA 5HRXA 5LJ0A 5L98A 5EWHA 5EWDA 5JI8A 3JVJA 5EISA 2R0SA 5CZGA 4O7AA 4NRBA 4HXPA 1X0JA 5EQ1A 4LYWA 5BT5A 2NXBA 4O76A 5HM0A 4YYKA 3U5KA 3VKHA 5EM3A 4MEPA 4A9IA 5ENGA 5HLSA 5LKUA 4NR9A 3U5NA 5CQ4A 5EWVA 4KV4A 4CUUA 5F60A 4TT6A 3LXJA 5G4SA 5E3DA 4QSRA 5HFRA 2N9GA 4YYDA 5F25A 5II2A 5I86A 4NR7A 4NUCA 4A9FA 5LVRA 5LVQA 5F1HA 2D82A 2DVRA 4E96A 3AADA 2MJVB 5DYAA 3JVLA 3UVXA 4QSSA 4O7BA 5CU8A 2YW5A 4BJXA 4PCIA 5BT3A 5E7DA 3UVDA 5DKDA 4YYJA 4LYSA 5I7YA 3U5LA 5ETBA 3U5JA 4NR6A 4PTBA 4WHUA 5KHMA 5H1TA 5C7NA 5KO4A 3P1EA 5CFWA 5FH7A 2F6NA 5D3SA 5CUCA 5FBXA 2RFJA 4O78A 4A9JA 4A9NA 4TZ8A 4NS5A 5D26A 2OUOA 4TQNA 4UIUA 5HFQA 4QC1A 3P1FA 4LC2A 5LJ1A 4CURA 3O37A 2G4AA 4O7CA 2EJNA 5L96A 5DKCA 3G0LA 5CQ3A 4UYFA 4LZSA 4YBTA
chains in the Genus database with same CATH topology
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