4A9LA

N-terminal bromodomain of human brd4 with 1,3-dimethyl-6-(morpholine- 4-sulfonyl)-1,2,3,4-tetrahydroquinazolin-2-one
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 1: Inhibitor Binding Modes and Implications for Lead Discovery.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
total genus 42
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9lA01
5D3TA 5G4SA 5DYCA 3D7CA 5CFWA 5D3HA 5ENIA 5D3RA 5L98A 5E9LA 2L85A 4YYGA 5DBMA 5BT5A 4QC3A 5I89A 1WUMA 5CRZA 5C87A 4YY4A 4YC9A 5CQ6A 2RNWA 3Q2EA 5CQ5A 5E74A 5IGLA 4J0RA 5DW1A 5CZGA 3TLPA 5CUDA 4YBMA 5JI8A 4IR6A 5DYUA 4O74A 5EWHA 3DAIA 2G4AA 4XUBA 5AD2A 4O7FA 4YYNA 5HENA 4NS5A 5FB0A 4BW3A 4O75A 5ENHA 2OUOA 5J0DA 4PS5A 5CUCA 4CUUA 2DWWA 5FE8A 1EQFA 4QUTA 4LYWA 5DKDA 5DYXA 4MR4A 4PKLA 5CQ8A 5KHMA 5EV9A 5FG6A 5L99A 1JM4B 5I88A 4AKNA 5HFQA 5HRWA 4LDFA 2YEMA 5DLZA 4QR3A 4QEVA 4IR5A 4YATA 5E73A 4QSSA 5FE1A 3QZVA 4GPJA 4QB3A 5F1HA 5HELA 4ZQLA 4MR6A 4Y03A 5EWWA 5I83A 3SVGA 4UYGA 4WHWA 4KCXA 5H1UA 5BT3A 4QC1A 4LR6A 4UITA 5A5OA 4BHWA 4CUQA 4HXLA 2DVQA 4HXRA 5DW2A 4PTBA 4LC2A 5FG4A 5A5SA 5EPRA 5LJ2A 4NR9A 5F36A 4XY8A 4CLBA 5E3GA 5AMEA 5FE3A 4O70A 5F60A 5DKCA 4IORA 5LVQA 4LZ2A 3NXBA 5FG5A 5F61A 3LQIA 2DKWA 4YAXA 4YK0A 4NRCA 3U5PA 2E7OA 1JSPB 4QSRA 4YH3A 3MXFA 4UYFA 4QBMA 4WHUA 4O76A 2H60A 4Z93A 5EPSA 5I7YA 2I8NA 4MEOA 4NUEA 5I1QA 3UVDA 4YADA 5JWMA 5IBNA 3LJWA 4QR5A 1X0JA 3MQMA 4ALHA 3S91A 2F6NA 4ZW1A 4QEUA 2L84A 4A9OA 4TZ2A 4O7BA 4HXSA 2YW5A 4CURA 4YYKA 5ENCA 3O34A 3IU6A 5G4RA 4O77A 3AQAA 1E6IA 5CQ7A 5HM0A 4YYDA 4HXOA 4XYAA 3GG3A 5CUAA 4QY4A 4LYIA 5HEMA 4TU4A 5COIA 4WIVA 3AADA 3DWYA 5LVRA 3UVXA 3MB4A 5ENBA 5FBXA 5HCLA 3LQHA 2R0SA 5E9YA 2YYNA 4NUDA 2L5EA 5LUUA 5CUGA 5DY7A 4UIWA 5IIDA 4LYSA 5D25A 5C7NA 4OUFA 3JVKA 3U5KA 4CUTA 4UIUA 4CUPA 2MJVB 5HRXA 3P1DA 4A9HA 5DX4A 4UYDA 2RNYA 5EU1A 5CS8A 4O7CA 5D3NA 5BT4A 5IGNA 4A9MA 4YYJA 3I3JA 5D24A 4IOOA 4NYVA 1WUGA 3QZTA 2R0VA 4NR6A 2RNXA 4Q0NA 5D3LA 2NXBA 4F3IA 4YBSA 3UV2A 5IGKA 5E7DA 5AD3A 5CPEA 5FE9A 4NR7A 5DFDA 4MENA 4QZSA 5FFVA 5II1A 4CFKA 2WP2A 5IGMA 5HQ7A 4J1PA 3O37A 5E9IA 4UYHA 4QYLA 5EA1A 4PY6A 4QNSA 4TS8A 4MR5A 3LXJA 4HXPA 5E9VA 5D0CA 4BW4A 5A5QA 2RO1A 5LKZA 4N4HA 4A9FA 4CFLA 4TT4A 5L96A 4NR5A 3O35A 4UIZA 5H85A 2RS9B 4TTEA 4QUUA 1N72A 4OGJA 5I80A 5I86A 4YABA 5A5NA 4YYMA 4QSPA 3MB3A 5EWVA 5CU8A 4CUSA 2RFJA 2DVRA 4HBVA 4ALGA 5K29A 4LZSA 2R0YA 5II2A 4NQMA 5E9MA 4HBXA 5CRMA 5HRVA 5H1TA 5LJ0A 4Z1QA 3U5JA 5C8GA 2YEKA 5LKTA 5F2PA 2LSPB 3U5MA 5A5RA 4X2IA 2N9GA 2DATA 4YYHA 2F6JA 5ETBA 2DVVA 5HFRA 5I40A 5KTUA 5HJCA 4NQNA 5CQAA 5L97A 3ZYUA 5CP5A 4NYXA 5A85A 5E9KA 5CTLA 5IG6A 5D26A 5CQ3A 4N4GA 4UIXA 4E96A 1F68A 4QSXA 5ACYA 5F3AA 4A9KA 4Z1SA 3U5LA 5A5PA 4J0SA 4PCEA 4NR8A 5ENEA 2E7NA 3O36A 3S92A 3P5OA 5CY9A 4UYFB 4HBWA 5LJ1A 2E3KA 4UYEA 4FLPA 5ENFA 5F63A 4RVRA 5E0RA 4Z6HA 4A9JA 5E3DA 4QEWA 3UV4A 4NUCA 4LZRA 5F25A 3K2JA 4KV1A 2D82A 5FH6A 4HXKA 3UVYA 5FDZA 4YBTA 3P1EA 5FFYA 5L8UA 4TT6A 5FE4A 4KV4A 4TU6A 5A83A 4OGIA 5DLXA 5FE6A 4TZ8A 5HQ6A 5FH7A 4IR3A 5EI4A 2WP1A 3Q2FA 4NR4A 3HMEA 5I7XA 4O7EA 5DFCA 4O71A 4C67A 3SVFA 3P1CA 3UV5A 4TYLA 5KTXA 5EQ1A 5LKUA 5D3JA 4NRBA 4MEPA 3G0JA 3HMFA 5EISA 3MULA 4CL9A 4J3IA 4A9NA 4ZC9A 2YELA 4IOQA 5FH8A 3SVHA 5EPBA 5D3SA 4Z6IA 3UVWA 5FE5A 4N4FA 5KU3A 5CQTA 3U5NA 4Q0OA 5CUBA 3IU5A 5EK9A 2D9EA 5C85A 4YY6A 3LQJA 5EGUA 5HLSA 5I29A 4NYWA 2I7KA 4BW1A 5C89A 4XUAA 2OO1A 4HXMA 2RI7A 4PCIA 4QR4A 3JVJA 5KO4A 5FE2A 5TB6A 3O33A 5F5ZA 4N3WA 4TQNA 4LRGA 1ZS5A 5TCMA 3FKMX 4A9IA 5DYAA 4NRAA 5L8TA 4QSTA 3U5OA 5FE0A 3P1FA 4C66A 5FFWA 3UW9A 4QSWA 5FB1A 5CUEA 5EICA 5ENJA 4HBYA 5EWDA 4N4IA 4QSVA 2R10A 3G0LA 4MR3A 5C4QA 3JVLA 5LKXA 2OSSA 4UIYA 3JVMA 5EP7A 5A7CA 4YYIA 5A82A 4O72A 4XY9A 4A9LA 4BJXA 2DVSA 5CQ4A 2FSAA 5HQ5A 4DONA 3RCWA 4QYDA 4HXNA 4YH4A 5DKHA 5KTWA 4TT2A 3ONIA 4NXJA 3HMHA 5FE7A 5EM3A 4QSUA 2GRCA 3MUKA 5D3PA 5F1LA 5ETDA 4BW2A 2YDWA 4QSQA 4MEQA 5H1VA 5EWCA 5F62A 2YQDA 3QZSA 4O7AA 2KTBB 5EVAA 5ENGA 5A81A 4IR4A 5DFBA 5CGPA 5AMFA 5D7XA 4A9EA 4O78A 4UIVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D3TA 5G4SA 5DYCA 3D7CA 5CFWA 5D3HA 5ENIA 5D3RA 5L98A 5E9LA 2L85A 4YYGA 5DBMA 5BT5A 4QC3A 5I89A 1WUMA 5CRZA 5C87A 4YY4A 4YC9A 5CQ6A 2RNWA 3Q2EA 5CQ5A 5E74A 5IGLA 4J0RA 5DW1A 5CZGA 3TLPA 5CUDA 4YBMA 5JI8A 4IR6A 5DYUA 4O74A 5EWHA 3DAIA 2G4AA 4XUBA 5AD2A 4O7FA 4YYNA 5HENA 1ZKRA 4NS5A 5FB0A 4BW3A 4O75A 5ENHA 2OUOA 5J0DA 4PS5A 5CUCA 4CUUA 2DWWA 5FE8A 1EQFA 4QUTA 4LYWA 5DKDA 5DYXA 4MR4A 4PKLA 5CQ8A 5KHMA 5EV9A 5FG6A 5L99A 1JM4B 5I88A 4AKNA 5HFQA 5HRWA 2EJNA 2YEMA 4LDFA 5DLZA 4QR3A 4QEVA 4IR5A 4YATA 5E73A 4QSSA 5FE1A 3QZVA 4GPJA 4QB3A 5F1HA 5HELA 4ZQLA 4MR6A 4Y03A 5EWWA 5I83A 3SVGA 4UYGA 4WHWA 4KCXA 5H1UA 5BT3A 4QC1A 4LR6A 4UITA 5A5OA 4BHWA 4CUQA 4HXLA 2DVQA 4HXRA 5DW2A 4PTBA 4LC2A 5FG4A 5A5SA 5EPRA 5LJ2A 4NR9A 5F36A 4XY8A 4CLBA 5E3GA 5AMEA 5FE3A 4O70A 5F60A 5DKCA 4IORA 5LVQA 4LZ2A 3NXBA 5FG5A 5F61A 3LQIA 2DKWA 4YAXA 3VKHA 4YK0A 4NRCA 3U5PA 2E7OA 1JSPB 4QSRA 4YH3A 3MXFA 4UYFA 4QBMA 4WHUA 4O76A 2H60A 4Z93A 5EPSA 5I7YA 2I8NA 4MEOA 4NUEA 5I1QA 3UVDA 4YADA 5JWMA 5IBNA 3LJWA 4QR5A 1X0JA 3MQMA 4ALHA 3S91A 2F6NA 4ZW1A 4QEUA 2L84A 4A9OA 3D1DA 4TZ2A 4O7BA 4HXSA 2YW5A 4CURA 4YYKA 5ENCA 1PUOA 3O34A 3IU6A 5G4RA 4O77A 3AQAA 1E6IA 5CQ7A 5HM0A 4YYDA 4HXOA 4XYAA 3GG3A 5CUAA 4QY4A 4LYIA 5HEMA 4TU4A 5COIA 4WIVA 3AADA 3DWYA 5LVRA 3UVXA 3MB4A 5ENBA 5FBXA 5HCLA 3LQHA 2R0SA 5E9YA 2YYNA 4NUDA 2L5EA 5LUUA 5CUGA 5DY7A 4UIWA 5IIDA 4LYSA 5D25A 5C7NA 4OUFA 3JVKA 3U5KA 4CUTA 4UIUA 4CUPA 2MJVB 5HRXA 3P1DA 4A9HA 5DX4A 4UYDA 2RNYA 5EU1A 5CS8A 4O7CA 5D3NA 5BT4A 5IGNA 4A9MA 4YYJA 3I3JA 4AI6A 5D24A 4IOOA 4NYVA 1WUGA 3QZTA 2R0VA 4NR6A 2RNXA 4Q0NA 5D3LA 2NXBA 4F3IA 4YBSA 3UV2A 5IGKA 5E7DA 5AD3A 5CPEA 5FE9A 4NR7A 5DFDA 4MENA 4QZSA 5FFVA 5II1A 4CFKA 2WP2A 4AKHA 5IGMA 5HQ7A 4J1PA 3O37A 5E9IA 4UYHA 4QYLA 5EA1A 4PY6A 4QNSA 4TS8A 4MR5A 3LXJA 4HXPA 5E9VA 5D0CA 4BW4A 5A5QA 2RO1A 5LKZA 4N4HA 4A9FA 4CFLA 4TT4A 5L96A 4NR5A 3O35A 4UIZA 5H85A 3ERRA 2RS9B 4AKIA 4TTEA 4QUUA 1N72A 4OGJA 5I80A 5I86A 4YABA 5A5NA 4YYMA 4QSPA 3MB3A 5EWVA 5CU8A 4CUSA 2RFJA 2DVRA 4HBVA 4ALGA 5K29A 4LZSA 2R0YA 5II2A 4NQMA 5E9MA 4HBXA 5CRMA 5HRVA 5H1TA 5LJ0A 4Z1QA 3U5JA 5C8GA 2YEKA 5LKTA 5F2PA 2LSPB 3U5MA 5A5RA 4X2IA 2N9GA 2DATA 4YYHA 2F6JA 5ETBA 2DVVA 5HFRA 5I40A 5KTUA 5HJCA 4NQNA 5CQAA 5L97A 3ZYUA 5CP5A 4NYXA 5A85A 5E9KA 5CTLA 5IG6A 5D26A 5CQ3A 4N4GA 4UIXA 4E96A 1F68A 4QSXA 5ACYA 5F3AA 4A9KA 4Z1SA 3U5LA 5A5PA 4J0SA 4PCEA 4NR8A 5ENEA 2E7NA 3O36A 3S92A 3P5OA 5CY9A 4UYFB 4HBWA 5LJ1A 2E3KA 4UYEA 4FLPA 5ENFA 5F63A 4RVRA 5E0RA 4Z6HA 4A9JA 5E3DA 4QEWA 3UV4A 4NUCA 4LZRA 5F25A 3K2JA 4KV1A 2D82A 5FH6A 4HXKA 3UVYA 5FDZA 4YBTA 3P1EA 5FFYA 5L8UA 4TT6A 5FE4A 4KV4A 4TU6A 5A83A 4OGIA 5DLXA 5FE6A 4TZ8A 5HQ6A 5FH7A 4IR3A 5EI4A 2WP1A 3Q2FA 4NR4A 3HMEA 5I7XA 4O7EA 5DFCA 4O71A 4C67A 3SVFA 3P1CA 3UV5A 4TYLA 5KTXA 5EQ1A 5LKUA 5D3JA 4NRBA 4MEPA 3VKGA 3G0JA 3HMFA 5EISA 3MULA 4CL9A 4J3IA 4A9NA 4ZC9A 2YELA 4IOQA 5FH8A 3SVHA 5EPBA 5D3SA 4Z6IA 3UVWA 5FE5A 4N4FA 5KU3A 5CQTA 3U5NA 4Q0OA 5CUBA 3IU5A 5EK9A 2D9EA 5C85A 4YY6A 3LQJA 5EGUA 5HLSA 5I29A 4NYWA 2I7KA 4BW1A 5C89A 4XUAA 2OO1A 4HXMA 2RI7A 4PCIA 4QR4A 3JVJA 5KO4A 5FE2A 5TB6A 3O33A 5F5ZA 4N3WA 4TQNA 4LRGA 1ZS5A 5TCMA 3FKMX 4A9IA 5DYAA 4NRAA 5L8TA 4QSTA 3U5OA 5FE0A 3P1FA 4C66A 5FFWA 3UW9A 4QSWA 5FB1A 5CUEA 5EICA 5ENJA 4HBYA 5EWDA 4N4IA 4QSVA 2R10A 3G0LA 4MR3A 5C4QA 3JVLA 5LKXA 2OSSA 4UIYA 3JVMA 5EP7A 5A7CA 4YYIA 5A82A 4O72A 4XY9A 4A9LA 4BJXA 2DVSA 5CQ4A 2FSAA 5HQ5A 4DONA 3RCWA 4QYDA 4HXNA 4YH4A 5DKHA 5KTWA 4TT2A 3ONIA 4NXJA 3HMHA 5FE7A 5EM3A 4QSUA 2GRCA 3MUKA 5D3PA 5F1LA 5ETDA 4BW2A 2YDWA 4QSQA 4AKGA 4MEQA 5H1VA 5EWCA 5F62A 2YQDA 3QZSA 4O7AA 2KTBB 5EVAA 3D1BA 5ENGA 5A81A 4IR4A 5DFBA 5CGPA 5AMFA 5D7XA 4A9EA 4O78A 4UIVA
chains in the Genus database with same CATH topology
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