4A9NA

N-terminal bromodomain of human brd2 with n-cyclopropyl-5-(3,5- dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-methylbenzene-1-sulfonamide
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
112
structure length
112
Chain Sequence
VTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/inhibitor
molecule keywords BROMODOMAIN CONTAINING 2
publication title Fragment-Based Discovery of Bromodomain Inhibitors Part 2: Optimization of Phenylisoxazole Sulfonamides.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 112
sequence length 112
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4a9nA00
3G0JA 4YAXA 5FH7A 5AD2A 4UIZA 4ZQLA 5DLXA 5TCMA 4QSWA 3ONIA 4MEPA 4BW1A 5II2A 5CZGA 4CUPA 4UYGA 3MB4A 4QB3A 4LYSA 2YDWA 2OUOA 3P1CA 5FFYA 5AMFA 3P1FA 4QEVA 5CS8A 4N4GA 4A9IA 3SVFA 5CUAA 5I7YA 5LUUA 5D7XA 5ENCA 5F61A 5COIA 4YYKA 5E9VA 5CQ5A 5I29A 5D0CA 5A5SA 4UYFB 5D3SA 4KV4A 4LDFA 5CU8A 3SVHA 5CQ8A 5D3JA 4IR3A 4YK0A 5CQ4A 4YYDA 5H1VA 2RNXA 4YBSA 4YBMA 5E74A 4ALGA 5I86A 4TT6A 5II1A 5CQ7A 4IOOA 4YY6A 5A82A 5FFWA 4HXPA 3NXBA 5DKCA 5FE5A 2DATA 4QSPA 4NYVA 5ETDA 5FE4A 4KV1A 2OSSA 5I89A 3UVDA 2RS9B 1WUGA 5D26A 5F25A 2R0SA 4YH4A 5HLSA 2WP2A 4WHWA 5IG6A 5FFVA 4BJXA 5CRZA 5DFCA 5ENGA 4O70A 4TU4A 4O78A 2L84A 2N9GA 4XY8A 3O36A 2WP1A 4QSSA 4MENA 4YYGA 4ALHA 4WHUA 2MJVB 5KTUA 5E9LA 4TS8A 4QBMA 4AKNA 5AD3A 4GPJA 5DYAA 5E9MA 5CQAA 5EWHA 3U5NA 4IR4A 3I3JA 4UIUA 5EPBA 5DFDA 4TQNA 5E0RA 4E96A 2I7KA 2DVVA 5ENEA 2D82A 5DY7A 3JVLA 3O33A 5EQ1A 5CRMA 2YQDA 4O76A 3GG3A 4ZW1A 5KU3A 5G4RA 4QR3A 4YABA 4IORA 2L5EA 2R0YA 4RVRA 5A5NA 2R10A 3O35A 5E9IA 5H1TA 4LZ2A 4N4FA 2YELA 5E9YA 5HEMA 5L98A 1JSPB 5FE2A 4MR4A 5HQ6A 4CFLA 5EM3A 5DFBA 2DWWA 5F2PA 4HXLA 5EWCA 4QSRA 5D25A 5HQ5A 4N4HA 4WIVA 4CFKA 2RNYA 2E7NA 4Q0OA 4NUCA 5CUCA 2YW5A 4PY6A 4YYHA 2DVRA 1JM4B 5LKUA 3Q2FA 5IGLA 3IU5A 4QUTA 4LRGA 5CY9A 4Z6IA 4UYHA 5EA1A 2RNWA 5EWDA 4BW4A 5I80A 5ENIA 4O7FA 3UV4A 4N3WA 2FSAA 5ETBA 4QSQA 4UYDA 5DYUA 5LJ2A 4LZRA 3JVJA 5FE9A 4J0RA 5FE0A 5I1QA 4A9EA 5A5QA 4C67A 5BT5A 5L99A 5CPEA 5HJCA 5HRWA 5IGMA 5BT3A 5D24A 3S92A 3UVXA 4UIVA 5LKZA 5DW1A 5JWMA 5EISA 4DONA 4YC9A 5I88A 4HXOA 5L97A 4X2IA 5A7CA 2F6NA 4UIYA 4UIXA 5EV9A 4QNSA 3IU6A 2KTBB 4NRBA 4F3IA 5FB1A 4IOQA 4NR9A 1F68A 3TLPA 4QC3A 5ACYA 5LJ0A 3O34A 4YH3A 5L8UA 4NR5A 4PKLA 5LKTA 3MQMA 4PS5A 3UV5A 5EP7A 5E7DA 5E3DA 5DKDA 5IBNA 1X0JA 5CP5A 5HFQA 5E9KA 4NUDA 4LR6A 5FH8A 4A9MA 4HXKA 4NS5A 3QZVA 4NYWA 4Q0NA 5E3GA 5I7XA 5FE6A 5F60A 4TYLA 5DBMA 2F6JA 5A83A 2RI7A 4XY9A 5DW2A 4CL9A 3ZYUA 2I8NA 4N4IA 4MEOA 4BW2A 2RFJA 5LVRA 4O74A 5FG6A 3HMHA 3U5KA 5C87A 4YYJA 3JVKA 5IIDA 5EPRA 4UIWA 4A9HA 4XUBA 4LC2A 4CUSA 2D9EA 5D3NA 4CUQA 3MB3A 4HBYA 5KTXA 4O7AA 5FG5A 4MR6A 4CUUA 4BHWA 5TB6A 5DYXA 3UVWA 4OUFA 4PCIA 4A9JA 5F5ZA 5D3HA 4CLBA 5CUDA 5F63A 5L96A 4O72A 4TT2A 2GRCA 3HMFA 4XUAA 4QEWA 5KO4A 4YYNA 3U5JA 3FKMX 5A85A 5FBXA 2OO1A 4MR3A 5CTLA 2L85A 5AMEA 4Z1SA 2NXBA 4LYIA 5FDZA 2YEMA 3SVGA 5D3RA 5ENBA 4J1PA 4HXMA 4NR7A 4LZSA 4QSUA 5DLZA 2DVSA 2R0VA 4O7CA 4A9KA 3O37A 5IGKA 5F62A 5LKXA 4NR6A 4NYXA 4HBWA 4Z93A 4O71A 4NR8A 3U5OA 4HXNA 5HELA 4KCXA 1E6IA 2DKWA 4QY4A 4Y03A 4O7BA 3UW9A 4A9NA 5D3LA 5EICA 2YEKA 4YADA 5F1LA 1EQFA 5C85A 3G0LA 5I40A 5HQ7A 3LJWA 4C66A 5A5OA 3U5LA 5G4SA 4Z1QA 5FE7A 4QR5A 5EVAA 5KTWA 5HENA 4YATA 5C4QA 2YYNA 5CUGA 5A5PA 4QZSA 4OGJA 4CUTA 4ZC9A 4QR4A 5E73A 5ENFA 4NR4A 3U5PA 2E7OA 4TTEA 5CUBA 3LXJA 5EU1A 5DKHA 3AQAA 4A9LA 3DAIA 2H60A 5FE1A 4YYMA 4NQMA 3MXFA 4NUEA 5CGPA 5EK9A 2E3KA 3UVYA 4NQNA 4TU6A 4QUUA 5KHMA 4PCEA 5F36A 3P5OA 4NRCA 5HM0A 5CQ3A 4BW3A 3S91A 5D3TA 3DWYA 5K29A 5C8GA 3JVMA 5CFWA 5H85A 4TZ2A 5BT4A 5I83A 2G4AA 4O77A 4YYIA 4QYDA 3RCWA 4HBVA 4A9OA 5FE8A 5DYCA 3MUKA 5HRXA 4YY4A 5H1UA 4IR6A 2RO1A 3MULA 4CURA 4HXSA 4QSXA 3QZSA 4O7EA 2DVQA 4IR5A 5HCLA 5FG4A 5D3PA 4XYAA 5A81A 4NRAA 4QEUA 5JI8A 5EI4A 4OGIA 5L8TA 5A5RA 4TZ8A 3LQHA 3D7CA 5LJ1A 3K2JA 3HMEA 3P1DA 4TT4A 4UYFA 4UITA 5FB0A 4QSVA 5ENJA 5DX4A 5F3AA 4YBTA 5HFRA 1WUMA 5F1HA 4J3IA 5EWVA 5LVQA 4LYWA 4QYLA 5EGUA 5HRVA 3AADA 5EWWA 4MEQA 4QC1A 3U5MA 4O75A 3LQIA 3P1EA 5IGNA 5CUEA 4QSTA 5ENHA 5EPSA 1N72A 4NXJA 4PTBA 5CQTA 2LSPB 3QZTA 5C7NA 4HXRA 5CQ6A 1ZS5A 5FE3A 3UV2A 4HBXA 4FLPA 5FH6A 3LQJA 4MR5A 4Z6HA 4UYEA 5C89A 3Q2EA 5J0DA 4A9FA 4J0SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G0JA 4YAXA 5FH7A 5AD2A 4UIZA 4ZQLA 5DLXA 5TCMA 4QSWA 3ONIA 4MEPA 4BW1A 5II2A 5CZGA 4CUPA 4UYGA 3MB4A 4QB3A 4LYSA 2YDWA 2OUOA 3P1CA 5FFYA 5AMFA 3P1FA 4QEVA 5CS8A 4N4GA 4A9IA 3SVFA 5CUAA 5I7YA 5LUUA 5D7XA 5ENCA 5F61A 5COIA 4YYKA 5E9VA 5CQ5A 5I29A 5D0CA 5A5SA 4UYFB 5D3SA 4KV4A 4LDFA 5CU8A 3SVHA 5CQ8A 5D3JA 4IR3A 4AKIA 4YK0A 5CQ4A 4YYDA 5H1VA 2RNXA 4YBSA 4YBMA 5E74A 4ALGA 5I86A 4TT6A 5II1A 5CQ7A 4IOOA 4YY6A 5A82A 4AI6A 5FFWA 4HXPA 3NXBA 5DKCA 5FE5A 2DATA 4QSPA 4NYVA 5ETDA 5FE4A 4KV1A 2OSSA 5I89A 3UVDA 2RS9B 3ERRA 4AKHA 1WUGA 5D26A 1ZKRA 5F25A 2R0SA 4YH4A 5HLSA 2WP2A 4WHWA 5IG6A 5FFVA 4BJXA 5CRZA 5DFCA 5ENGA 4O70A 4TU4A 4O78A 2L84A 2N9GA 4XY8A 3O36A 2WP1A 4QSSA 4MENA 4YYGA 4ALHA 4WHUA 2MJVB 5KTUA 5E9LA 4TS8A 4QBMA 4AKNA 5AD3A 3D1DA 4GPJA 5DYAA 5E9MA 5CQAA 5EWHA 3U5NA 4IR4A 3I3JA 4UIUA 5EPBA 5DFDA 4TQNA 5E0RA 4E96A 2I7KA 2DVVA 5ENEA 2D82A 5DY7A 3JVLA 3O33A 5EQ1A 5CRMA 2YQDA 4O76A 3GG3A 4ZW1A 5KU3A 5G4RA 4QR3A 4YABA 4IORA 2L5EA 2R0YA 4RVRA 5A5NA 2R10A 3O35A 5E9IA 5H1TA 4LZ2A 4N4FA 2YELA 5E9YA 5HEMA 5L98A 1JSPB 5FE2A 4MR4A 5HQ6A 4CFLA 5EM3A 5DFBA 2DWWA 5F2PA 4HXLA 5EWCA 4QSRA 5D25A 5HQ5A 4N4HA 4WIVA 4CFKA 2RNYA 2E7NA 4Q0OA 4NUCA 5CUCA 2YW5A 4PY6A 4YYHA 2DVRA 1JM4B 5LKUA 3Q2FA 5IGLA 3IU5A 4QUTA 4LRGA 5CY9A 4Z6IA 4UYHA 5EA1A 2RNWA 5EWDA 4BW4A 5I80A 5ENIA 4O7FA 3UV4A 4N3WA 2FSAA 5ETBA 4QSQA 4UYDA 5DYUA 5LJ2A 4LZRA 3JVJA 5FE9A 4J0RA 5FE0A 5I1QA 4A9EA 5A5QA 4C67A 5BT5A 5L99A 5CPEA 5HJCA 5HRWA 5IGMA 5BT3A 5D24A 3S92A 3UVXA 4UIVA 5LKZA 5DW1A 5JWMA 5EISA 4DONA 4YC9A 5I88A 4HXOA 5L97A 4X2IA 5A7CA 2F6NA 4UIYA 4UIXA 5EV9A 4QNSA 3IU6A 2KTBB 4NRBA 4F3IA 5FB1A 4IOQA 4NR9A 1F68A 3TLPA 4QC3A 5ACYA 5LJ0A 3O34A 4YH3A 5L8UA 4NR5A 4PKLA 5LKTA 3MQMA 4PS5A 3UV5A 5EP7A 5E7DA 5E3DA 5DKDA 5IBNA 1X0JA 5CP5A 5HFQA 5E9KA 4NUDA 4LR6A 5FH8A 4A9MA 4HXKA 4NS5A 3QZVA 4NYWA 4Q0NA 5E3GA 5I7XA 5FE6A 5F60A 4TYLA 5DBMA 2F6JA 5A83A 2RI7A 4XY9A 5DW2A 4CL9A 3ZYUA 2I8NA 4N4IA 4MEOA 4BW2A 2RFJA 5LVRA 4O74A 5FG6A 3HMHA 3U5KA 5C87A 4YYJA 3JVKA 5IIDA 5EPRA 4UIWA 4A9HA 4XUBA 4LC2A 4CUSA 2D9EA 5D3NA 4CUQA 3MB3A 4HBYA 5KTXA 4O7AA 5FG5A 4MR6A 4CUUA 4BHWA 5TB6A 3VKHA 1PUOA 5DYXA 3UVWA 4OUFA 4PCIA 4A9JA 5F5ZA 5D3HA 4CLBA 5CUDA 5F63A 5L96A 4O72A 4TT2A 2GRCA 3HMFA 4XUAA 4QEWA 5KO4A 4YYNA 3U5JA 3FKMX 5A85A 5FBXA 2OO1A 4MR3A 5CTLA 2L85A 5AMEA 4Z1SA 3D1BA 2NXBA 4LYIA 5FDZA 2YEMA 3SVGA 5D3RA 5ENBA 4J1PA 4HXMA 4NR7A 4LZSA 4QSUA 5DLZA 2DVSA 2R0VA 4O7CA 4A9KA 3O37A 5IGKA 5F62A 5LKXA 4NR6A 4NYXA 4HBWA 4Z93A 4O71A 4NR8A 3U5OA 4HXNA 5HELA 4KCXA 1E6IA 2DKWA 4QY4A 4Y03A 4O7BA 3UW9A 4A9NA 5D3LA 5EICA 2YEKA 4YADA 5F1LA 1EQFA 5C85A 3G0LA 5I40A 5HQ7A 3LJWA 2EJNA 4C66A 5A5OA 3U5LA 5G4SA 4Z1QA 5FE7A 4QR5A 5EVAA 5KTWA 5HENA 4YATA 5C4QA 2YYNA 5CUGA 5A5PA 4QZSA 4OGJA 4CUTA 4ZC9A 4QR4A 5E73A 5ENFA 4NR4A 3U5PA 2E7OA 4TTEA 5CUBA 3LXJA 5EU1A 5DKHA 3AQAA 4A9LA 3DAIA 2H60A 5FE1A 4YYMA 4NQMA 3MXFA 4NUEA 5CGPA 5EK9A 2E3KA 3UVYA 4NQNA 4TU6A 4QUUA 5KHMA 4PCEA 5F36A 3P5OA 4NRCA 5HM0A 5CQ3A 4BW3A 3S91A 5D3TA 3DWYA 5K29A 5C8GA 3JVMA 5CFWA 5H85A 4TZ2A 5BT4A 5I83A 2G4AA 4O77A 4YYIA 4QYDA 3RCWA 4HBVA 4A9OA 5FE8A 5DYCA 3MUKA 5HRXA 4YY4A 5H1UA 4AKGA 4IR6A 2RO1A 3VKGA 3MULA 4CURA 4HXSA 4QSXA 3QZSA 4O7EA 2DVQA 4IR5A 5HCLA 5FG4A 5D3PA 4XYAA 5A81A 4NRAA 4QEUA 5JI8A 5EI4A 4OGIA 5L8TA 5A5RA 4TZ8A 3LQHA 3D7CA 5LJ1A 3K2JA 3HMEA 3P1DA 4TT4A 4UYFA 4UITA 5FB0A 4QSVA 5ENJA 5DX4A 5F3AA 4YBTA 5HFRA 1WUMA 5F1HA 4J3IA 5EWVA 5LVQA 4LYWA 4QYLA 5EGUA 5HRVA 3AADA 5EWWA 4MEQA 4QC1A 3U5MA 4O75A 3LQIA 3P1EA 5IGNA 5CUEA 4QSTA 5ENHA 5EPSA 1N72A 4NXJA 4PTBA 5CQTA 2LSPB 3QZTA 5C7NA 4HXRA 5CQ6A 1ZS5A 5FE3A 3UV2A 4HBXA 4FLPA 5FH6A 3LQJA 4MR5A 4Z6HA 4UYEA 5C89A 3Q2EA 5J0DA 4A9FA 4J0SA
chains in the Genus database with same CATH topology
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