4CUQA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-2 n09594
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-2 N09594
rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cuqA00
4HBXA 4O7AA 4MEPA 5I1QA 3D7CA 5EICA 5HEMA 3JVJA 5FB1A 5E9KA 2YQDA 5EU1A 3O37A 5L98A 5ENCA 4NUEA 3MQMA 4A9IA 5DFBA 4YBTA 4CUQA 2RFJA 3FKMX 5F36A 4KV4A 5JWMA 2OSSA 5CTLA 5A85A 5DBMA 5HELA 3UVYA 4XYAA 5CY9A 5LKUA 5TB6A 4QSQA 5E3GA 5A5PA 5DKHA 4QSVA 5I40A 4CLBA 5LKXA 2DVQA 5EPBA 3UVWA 4YATA 4IR5A 5HQ6A 5EVAA 3ONIA 5BT3A 4RVRA 2DATA 5I7YA 5H85A 4LYSA 4LDFA 2YW5A 4IR4A 4O77A 5FE0A 4YYKA 4N3WA 5C87A 5HRVA 4TZ2A 5CU8A 4Z6HA 2D9EA 5D3RA 4F3IA 4CUPA 5EWWA 3SVFA 1ZS5A 3DAIA 5E74A 4QSWA 3U5PA 4O72A 3LXJA 4NRCA 5II2A 4CFLA 5DKCA 4QSXA 5DYXA 4Z1SA 5FE8A 2GRCA 2RNXA 3O36A 5L99A 5DLXA 5D24A 3G0JA 5ENFA 4CURA 4UITA 4NR5A 4QNSA 5DW1A 5A82A 5KO4A 5HRWA 1N72A 3QZSA 4NUCA 4QSRA 5F3AA 5EGUA 4TT6A 5DLZA 4QUUA 4UYGA 5D26A 2R0YA 5FE9A 5LUUA 3SVHA 5FH7A 4LRGA 5AMEA 5ENBA 5FFVA 4PCIA 5D3TA 4HXNA 4ZC9A 4A9EA 5E9IA 2YDWA 2E7OA 3QZVA 4HXOA 5A5OA 5F5ZA 3K2JA 5IGKA 4MR5A 4NYWA 5CRMA 4UYEA 4A9MA 5EQ1A 3DWYA 5FBXA 4NR6A 4HBYA 5E3DA 4TT2A 5ENHA 4TZ8A 5C7NA 5EWDA 5ETBA 2YEKA 2DKWA 2YYNA 4HXSA 4UIZA 5ACYA 1EQFA 5CUCA 5D3NA 5FE1A 2F6JA 4BW4A 4HBWA 4FLPA 1JM4B 3UVDA 5EK9A 5CUAA 2WP2A 4A9NA 5DX4A 5CZGA 4UYDA 4KCXA 4Q0OA 5HJCA 3IU6A 4TYLA 5EWVA 4LZSA 4UYFA 5E7DA 4UIYA 4TQNA 5F1HA 4Z6IA 4MR4A 4O76A 5FE6A 2F6NA 3NXBA 4QY4A 3UW9A 4OGJA 5AD3A 5ENGA 4NS5A 4A9OA 4KV1A 5DY7A 4YABA 2YELA 4O7CA 5C85A 5FDZA 2NXBA 4QB3A 4ZW1A 4NQMA 5JI8A 3AADA 5F61A 5CQ8A 5HCLA 3O33A 4C67A 5CFWA 4O7BA 3LQJA 4YYHA 5IGLA 5CPEA 5E73A 5G4SA 5I89A 5H1UA 5L96A 4O7EA 5C4QA 3LQIA 5BT4A 5HQ7A 4J0SA 3UV2A 5F25A 3UV4A 1F68A 4A9FA 4J3IA 3JVMA 2OUOA 4QUTA 5CGPA 2YEMA 4NR9A 5E9YA 5F63A 5LVRA 5DW2A 5A83A 5AMFA 5A5NA 4A9JA 5TCMA 2E7NA 5CQTA 5EA1A 4TS8A 5EWCA 4LZRA 5FG5A 2KTBB 4WIVA 5FG6A 5HENA 5K29A 3MULA 4HXLA 4OGIA 4QEWA 4PTBA 4A9HA 5CQ6A 4YY6A 4QC1A 5ETDA 5IG6A 5L8UA 5HLSA 4WHUA 4TU6A 3U5KA 3ZYUA 1WUMA 5DYUA 4PS5A 4NXJA 4QZSA 4YH3A 5CUEA 3RCWA 5F62A 2R0SA 2DVRA 5FE4A 4YYMA 3JVKA 5F1LA 5H1TA 4QR3A 3O34A 4YC9A 5E9VA 5D3LA 5FG4A 4NRAA 5A5SA 5FE2A 5DYCA 2L84A 2L5EA 4TTEA 3P1CA 4O78A 4ALGA 4NQNA 4YYGA 3MB4A 5ENEA 3O35A 4MEOA 4NR8A 2WP1A 5C8GA 4NYXA 4Y03A 3HMFA 5I29A 3IU5A 4UYHA 5D3PA 5C89A 5DYAA 4O70A 5CRZA 5A7CA 2FSAA 5FE7A 4TU4A 5CS8A 2L85A 1WUGA 4N4GA 5J0DA 5LJ2A 4IORA 2D82A 4QYLA 5EISA 4Q0NA 4CL9A 3U5LA 5HFRA 2R0VA 5I86A 5LKZA 5D0CA 4IOOA 2DVSA 4HXPA 1E6IA 4XY8A 5L97A 4PY6A 5I80A 4LR6A 5F60A 5HM0A 3S91A 4YH4A 5H1VA 4QEVA 2RNWA 5D25A 5E9LA 5CQAA 4QYDA 5KHMA 4HXRA 4O71A 5EPRA 5EP7A 4PCEA 5KTWA 5IIDA 4MENA 5IGNA 4O74A 4BW2A 5EWHA 2I8NA 4YAXA 2MJVB 3UVXA 4YYDA 5D7XA 4N4IA 4QSPA 5FH6A 4N4HA 4QSTA 3LQHA 5IGMA 4TT4A 3Q2FA 4Z93A 5DFCA 5A5RA 3I3JA 4QEUA 5CQ7A 4HXKA 4XUBA 4CFKA 3AQAA 2LSPB 5KTXA 4HXMA 2G4AA 4UIXA 3U5OA 4AKNA 3Q2EA 4MEQA 3LJWA 5D3SA 3U5MA 2DWWA 4UIVA 3MB3A 5BT5A 4LZ2A 5F2PA 5KU3A 5A5QA 4O7FA 4QR5A 4WHWA 3U5NA 4YYJA 5D3HA 5G4RA 4LYIA 2DVVA 2OO1A 5FE5A 4QC3A 4MR3A 4LYWA 5ENIA 4ALHA 5CQ4A 4CUTA 3HMHA 5CUBA 3P1FA 5I83A 3S92A 4DONA 4C66A 5I88A 3P5OA 4YY4A 4BW1A 4YBMA 5CQ3A 5FH8A 3P1EA 4HBVA 3U5JA 5I7XA 3GG3A 5L8TA 5EPSA 4QR4A 3HMEA 1JSPB 4NR7A 2H60A 4NR4A 4UYFB 5LJ1A 5LJ0A 3P1DA 2I7KA 4GPJA 3TLPA 5LVQA 5HQ5A 4MR6A 4LC2A 4NYVA 5FE3A 5II1A 4Z1QA 4A9LA 3JVLA 4UIWA 2RS9B 4BJXA 5E0RA 3G0LA 5COIA 5CQ5A 5IBNA 4N4FA 3MUKA 4CUUA 5DKDA 3UV5A 4A9KA 5AD2A 4PKLA 5EV9A 4QSUA 4BHWA 4XUAA 2E3KA 5E9MA 5HFQA 4YBSA 2N9GA 5A81A 4YYIA 4XY9A 4NUDA 5FFYA 5DFDA 4CUSA 2RI7A 3QZTA 4X2IA 4IR6A 4UIUA 4OUFA 4IR3A 4QSSA 4J1PA 5CUGA 5EI4A 5EM3A 5LKTA 4YK0A 5FB0A 4QBMA 5CUDA 4ZQLA 4E96A 2R10A 5CP5A 2RNYA 4YADA 3SVGA 4BW3A 4YYNA 3MXFA 5KTUA 5HRXA 5ENJA 1X0JA 5D3JA 4O75A 5FFWA 4IOQA 4J0RA 2RO1A 4NRBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HBXA 4O7AA 4MEPA 5I1QA 3D7CA 5EICA 5HEMA 3JVJA 5FB1A 5E9KA 2YQDA 5EU1A 3O37A 5L98A 5ENCA 4NUEA 3MQMA 4A9IA 5DFBA 4YBTA 4CUQA 2RFJA 3FKMX 5F36A 4KV4A 5JWMA 2OSSA 5CTLA 5A85A 5DBMA 5HELA 3UVYA 4XYAA 5CY9A 5LKUA 5TB6A 4QSQA 5E3GA 5A5PA 5DKHA 4QSVA 5I40A 4CLBA 5LKXA 1ZKRA 2DVQA 5EPBA 3UVWA 4YATA 4IR5A 5HQ6A 5EVAA 3ONIA 5BT3A 4RVRA 2DATA 5I7YA 5H85A 4LYSA 4LDFA 2YW5A 4IR4A 4O77A 5FE0A 4YYKA 4N3WA 5C87A 5HRVA 4TZ2A 5CU8A 4Z6HA 2D9EA 5D3RA 4F3IA 4CUPA 5EWWA 3SVFA 1ZS5A 3DAIA 5E74A 4QSWA 3U5PA 4O72A 3LXJA 4NRCA 5II2A 4CFLA 5DKCA 4QSXA 5DYXA 4Z1SA 5FE8A 2GRCA 2RNXA 3O36A 5L99A 5DLXA 5D24A 3G0JA 5ENFA 4CURA 4UITA 4NR5A 4QNSA 5DW1A 5A82A 5KO4A 5HRWA 1N72A 3QZSA 4NUCA 4QSRA 5F3AA 5EGUA 4TT6A 5DLZA 4QUUA 4UYGA 5D26A 2R0YA 5FE9A 5LUUA 3SVHA 5FH7A 4LRGA 5AMEA 5ENBA 5FFVA 4PCIA 5D3TA 4HXNA 4ZC9A 4A9EA 5E9IA 2YDWA 2E7OA 3QZVA 4HXOA 5A5OA 5F5ZA 3K2JA 5IGKA 4MR5A 4NYWA 5CRMA 4UYEA 4A9MA 5EQ1A 3DWYA 5FBXA 4NR6A 4HBYA 5E3DA 4TT2A 5ENHA 4TZ8A 5C7NA 5EWDA 5ETBA 2YEKA 2DKWA 2YYNA 4HXSA 4UIZA 5ACYA 3D1DA 1EQFA 5CUCA 5D3NA 5FE1A 2F6JA 4BW4A 4AKGA 4HBWA 4FLPA 1JM4B 3UVDA 5EK9A 5CUAA 2WP2A 4A9NA 5DX4A 5CZGA 4UYDA 4KCXA 4Q0OA 5HJCA 3IU6A 4TYLA 5EWVA 4LZSA 4UYFA 5E7DA 4UIYA 1PUOA 4TQNA 5F1HA 4Z6IA 4MR4A 4O76A 5FE6A 2F6NA 3NXBA 4QY4A 3UW9A 4OGJA 5AD3A 5ENGA 4NS5A 2EJNA 4A9OA 4KV1A 5DY7A 4YABA 2YELA 4O7CA 5C85A 5FDZA 2NXBA 4QB3A 4ZW1A 4NQMA 5JI8A 3AADA 5F61A 5CQ8A 5HCLA 3O33A 4C67A 5CFWA 3VKHA 4O7BA 3LQJA 4YYHA 5IGLA 5CPEA 5E73A 5G4SA 5I89A 5H1UA 5L96A 4O7EA 5C4QA 3LQIA 5BT4A 5HQ7A 4J0SA 3UV2A 5F25A 3UV4A 1F68A 4A9FA 4J3IA 3JVMA 2OUOA 4QUTA 5CGPA 2YEMA 4NR9A 5E9YA 5F63A 5LVRA 5DW2A 5A83A 5AMFA 5A5NA 4A9JA 5TCMA 2E7NA 5CQTA 5EA1A 4TS8A 5EWCA 4LZRA 5FG5A 2KTBB 4WIVA 5FG6A 5HENA 5K29A 3MULA 4HXLA 4OGIA 4QEWA 4PTBA 4A9HA 5CQ6A 4YY6A 4QC1A 5ETDA 5IG6A 5L8UA 5HLSA 4WHUA 4TU6A 3U5KA 3ZYUA 3D1BA 1WUMA 5DYUA 4PS5A 4NXJA 4QZSA 4YH3A 5CUEA 3RCWA 5F62A 2R0SA 2DVRA 5FE4A 4YYMA 3JVKA 5F1LA 5H1TA 4QR3A 3O34A 4YC9A 5E9VA 5D3LA 5FG4A 4NRAA 5A5SA 5FE2A 5DYCA 2L84A 2L5EA 4TTEA 3P1CA 4O78A 4ALGA 4NQNA 4YYGA 3MB4A 5ENEA 3O35A 4MEOA 4NR8A 2WP1A 5C8GA 4NYXA 4Y03A 3HMFA 5I29A 3IU5A 4UYHA 5D3PA 5C89A 5DYAA 4O70A 5CRZA 5A7CA 2FSAA 5FE7A 4TU4A 5CS8A 2L85A 1WUGA 4N4GA 5J0DA 5LJ2A 4IORA 2D82A 4QYLA 5EISA 4Q0NA 4CL9A 3U5LA 5HFRA 2R0VA 5I86A 5LKZA 5D0CA 4IOOA 2DVSA 4HXPA 1E6IA 4XY8A 5L97A 4PY6A 5I80A 4LR6A 5F60A 5HM0A 3S91A 4YH4A 5H1VA 4AKIA 3ERRA 4QEVA 2RNWA 5D25A 5E9LA 5CQAA 4QYDA 5KHMA 4HXRA 4O71A 5EPRA 5EP7A 4PCEA 5KTWA 5IIDA 4MENA 5IGNA 4O74A 4BW2A 5EWHA 2I8NA 4YAXA 2MJVB 3UVXA 4YYDA 5D7XA 4N4IA 4QSPA 5FH6A 4N4HA 4QSTA 3LQHA 5IGMA 4TT4A 3Q2FA 4Z93A 5DFCA 5A5RA 3I3JA 4QEUA 5CQ7A 4HXKA 4XUBA 4CFKA 3AQAA 2LSPB 5KTXA 4HXMA 2G4AA 4UIXA 3U5OA 4AKNA 3Q2EA 4MEQA 3LJWA 5D3SA 3U5MA 3VKGA 2DWWA 4UIVA 3MB3A 5BT5A 4LZ2A 5F2PA 5KU3A 5A5QA 4O7FA 4QR5A 4WHWA 3U5NA 4YYJA 5D3HA 5G4RA 4LYIA 2DVVA 2OO1A 5FE5A 4QC3A 4MR3A 4LYWA 5ENIA 4ALHA 5CQ4A 4CUTA 3HMHA 5CUBA 3P1FA 5I83A 3S92A 4DONA 4C66A 5I88A 3P5OA 4YY4A 4BW1A 4YBMA 5CQ3A 5FH8A 3P1EA 4HBVA 3U5JA 5I7XA 3GG3A 5L8TA 5EPSA 4QR4A 3HMEA 1JSPB 4NR7A 2H60A 4NR4A 4UYFB 5LJ1A 5LJ0A 3P1DA 2I7KA 4GPJA 3TLPA 5LVQA 5HQ5A 4MR6A 4LC2A 4NYVA 5FE3A 5II1A 4Z1QA 4A9LA 3JVLA 4UIWA 2RS9B 4BJXA 5E0RA 3G0LA 5COIA 5CQ5A 5IBNA 4N4FA 3MUKA 4CUUA 5DKDA 3UV5A 4A9KA 5AD2A 4PKLA 5EV9A 4AI6A 4QSUA 4BHWA 4XUAA 2E3KA 5E9MA 5HFQA 4YBSA 2N9GA 5A81A 4YYIA 4XY9A 4NUDA 5FFYA 5DFDA 4CUSA 2RI7A 3QZTA 4X2IA 4IR6A 4UIUA 4OUFA 4IR3A 4QSSA 4J1PA 5CUGA 5EI4A 5EM3A 5LKTA 4AKHA 4YK0A 5FB0A 4QBMA 5CUDA 4ZQLA 4E96A 2R10A 5CP5A 2RNYA 4YADA 3SVGA 4BW3A 4YYNA 3MXFA 5KTUA 5HRXA 5ENJA 1X0JA 5D3JA 4O75A 5FFWA 4IOQA 4J0RA 2RO1A 4NRBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4HBX A;  4O7A A;  4MEP A;  5I1Q A;  3D7C A;  5EIC A;  5HEM A;  3JVJ A;  5FB1 A;  5E9K A;  2YQD A;  5EU1 A;  3O37 A;  5L98 A;  5ENC A;  4NUE A;  3MQM A;  4A9I A;  5DFB A;  4YBT A;  4CUQ A;  2RFJ A;  3FKM X;  5F36 A;  4KV4 A;  5JWM A;  2OSS A;  5CTL A;  5A85 A;  5DBM A;  5HEL A;  3UVY A;  4XYA A;  5CY9 A;  5LKU A;  5TB6 A;  4QSQ A;  5E3G A;  5A5P A;  5DKH A;  4QSV A;  5I40 A;  4CLB A;  5LKX A;  2DVQ A;  5EPB A;  3UVW A;  4YAT A;  4IR5 A;  5HQ6 A;  5EVA A;  3ONI A;  5BT3 A;  4RVR A;  2DAT A;  5I7Y A;  5H85 A;  4LYS A;  4LDF A;  2YW5 A;  4IR4 A;  4O77 A;  5FE0 A;  4YYK A;  4N3W A;  5C87 A;  5HRV A;  4TZ2 A;  5CU8 A;  4Z6H A;  2D9E A;  5D3R A;  4F3I A;  4CUP A;  5EWW A;  3SVF A;  1ZS5 A;  3DAI A;  5E74 A;  4QSW A;  3U5P A;  4O72 A;  3LXJ A;  4NRC A;  5II2 A;  4CFL A;  5DKC A;  4QSX A;  5DYX A;  4Z1S A;  5FE8 A;  2GRC A;  2RNX A;  3O36 A;  5L99 A;  5DLX A;  5D24 A;  3G0J A;  5ENF A;  4CUR A;  4UIT A;  4NR5 A;  4QNS A;  5DW1 A;  5A82 A;  5KO4 A;  5HRW A;  1N72 A;  3QZS A;  4NUC A;  4QSR A;  5F3A A; 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