4CUSA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-4 n09496
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-4 N09496
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cusA00
5C4QA 4UYEA 3U5MA 2YEKA 2YW5A 4QR5A 4IR3A 4FLPA 4UYFA 5D3TA 5EU1A 4UIZA 5HJCA 4YY6A 5C8GA 5HRVA 4LZ2A 4LYSA 3MUKA 4QR3A 4LDFA 5KO4A 4TU4A 4NRCA 5TCMA 2E7OA 5BT4A 4O70A 4NS5A 5FE7A 4DONA 5I29A 4A9LA 5E9YA 4UIUA 2NXBA 5D3PA 4YK0A 5HQ5A 3LXJA 5FE4A 5L99A 4A9HA 4CUPA 4YAXA 4IR4A 5CP5A 5CQ8A 4UIYA 3O37A 4QNSA 5EWWA 4PTBA 5FE9A 5ENHA 4KV1A 3P1DA 5G4SA 4A9OA 3G0LA 4MR4A 5E74A 5LVRA 3MB4A 4HXRA 4LRGA 4J1PA 4N4IA 4NR8A 2YEMA 2N9GA 2OSSA 4UYFB 5ENJA 4C67A 2E7NA 5EPRA 4UIVA 4YYJA 4NR7A 5H1UA 4QC1A 5FE1A 4UYGA 5EWDA 5CTLA 5KTUA 4NRBA 3MB3A 4QBMA 5ENFA 5CUBA 3P1CA 4TT2A 3GG3A 5EISA 3UVWA 5I83A 5FFWA 2E3KA 4CURA 4O78A 4OUFA 4GPJA 5J0DA 2DKWA 3UV2A 4NXJA 2DATA 3LJWA 5L98A 4ALHA 4NUDA 5D3RA 4HXMA 5CUAA 5HELA 5HLSA 5AMEA 4O72A 5LKXA 5E9VA 4BW3A 3LQIA 4QYLA 5E0RA 5FG6A 1ZS5A 2YELA 4QSRA 3Q2EA 4BW1A 4TZ2A 4NYXA 5DX4A 4IR5A 3U5KA 4QSSA 4MENA 2R0SA 5A85A 5EQ1A 5F60A 4YBSA 5DYAA 4N4GA 5EPSA 2OO1A 4O7CA 3SVGA 5IGLA 5FFYA 3TLPA 5A5OA 5CY9A 4QEUA 3ONIA 5HQ7A 3ZYUA 5A5PA 5IGMA 3UVXA 5FE6A 5JI8A 5TB6A 5HRXA 4QUTA 5E3GA 5F3AA 5LJ2A 3JVJA 2F6JA 5C87A 3G0JA 5D3LA 5D3JA 5DKCA 3AQAA 5L8TA 4XY9A 2I7KA 4XUBA 4CFKA 4TZ8A 5F36A 4YATA 2DVRA 4C66A 1N72A 5F1HA 5KTXA 5CPEA 5HQ6A 5AD2A 3U5PA 4HXPA 3O34A 3UW9A 5L97A 5HRWA 1EQFA 3O33A 5FBXA 4BJXA 5FB0A 1JSPB 5F5ZA 2DWWA 2WP1A 4YY4A 3IU6A 5EA1A 5ETBA 5A5QA 5DLXA 4Q0OA 5HFQA 4YADA 5FG4A 4HXNA 5CZGA 4Z1QA 4QYDA 5HENA 5CU8A 5FDZA 5I1QA 5COIA 4NYWA 4PKLA 4Z1SA 4O7BA 5DFDA 4N4HA 5E3DA 5K29A 5ETDA 4TT6A 4NQMA 5L8UA 4CUTA 3HMEA 4NRAA 4TU6A 5LKZA 3K2JA 5DW2A 4YH4A 5AMFA 2DVQA 5D26A 4IORA 4XYAA 4WHWA 4XUAA 5CUCA 5CQ3A 5IIDA 3MXFA 4BW2A 4MR5A 4PY6A 4OGIA 3U5JA 4E96A 4TTEA 5A5RA 4X2IA 5FE0A 5CQTA 5HM0A 4CLBA 4O71A 5DYCA 4A9IA 5AD3A 4HBYA 5EM3A 4QUUA 5I7YA 5EGUA 3HMFA 4QSTA 4KV4A 5LJ0A 5EP7A 5FFVA 2WP2A 3S92A 3SVHA 5F1LA 2DVSA 2DVVA 5ENBA 1E6IA 4Z93A 4HXLA 5F62A 4QSWA 5DKDA 4J0SA 4UITA 4QSPA 5E9KA 4A9EA 2MJVB 4HXKA 5BT3A 5C89A 5FB1A 4N3WA 2FSAA 5F61A 5FG5A 5II2A 4ZW1A 5E7DA 5CRMA 5C7NA 2R0YA 5D24A 4HXOA 4KCXA 3JVMA 5FE2A 3S91A 4YC9A 3O36A 4IOQA 5I88A 4XY8A 4A9NA 4J0RA 4NQNA 4QC3A 3LQJA 4LYWA 4O74A 4TS8A 5I7XA 4PCEA 4NR6A 4LR6A 4TT4A 5CUDA 5CFWA 2F6NA 3I3JA 5FE8A 5DLZA 2RNXA 5ENEA 2G4AA 4TYLA 4YYMA 4CUUA 1F68A 2D82A 2D9EA 3JVKA 5CS8A 4UIXA 3FKMX 4O76A 4Q0NA 4O77A 4J3IA 5DFCA 5A81A 3NXBA 3P1FA 3U5LA 3IU5A 5EWVA 4A9JA 5HCLA 5KTWA 4LZRA 3MULA 4YYKA 4MEPA 5EK9A 5A7CA 4QEVA 4NR9A 4LYIA 5D0CA 4CUQA 5H1VA 5D3SA 2L5EA 4PCIA 5DY7A 3UV5A 2KTBB 4NYVA 4A9FA 5LKUA 4PS5A 4OGJA 5LVQA 4ALGA 5IGNA 5KU3A 4YYIA 4HXSA 3UV4A 5C85A 5KHMA 5CQ4A 3O35A 5E9LA 5EWCA 5DYXA 5A5SA 5IG6A 5D25A 5A83A 2RS9B 3Q2FA 2RO1A 4TQNA 5FH7A 3HMHA 5F63A 4NR4A 5CQ5A 5ENCA 4RVRA 3UVYA 4QB3A 3U5NA 5LJ1A 4WIVA 4QSXA 5CQAA 5H85A 5CQ7A 1X0JA 4UIWA 5ENIA 5F2PA 5BT5A 2LSPB 5HFRA 4YABA 5EWHA 4CFLA 4ZQLA 4ZC9A 2H60A 4A9MA 4AKNA 4QR4A 4QY4A 5EPBA 3JVLA 5EI4A 5CRZA 4BW4A 2RNWA 5DKHA 2YDWA 4HBVA 2R0VA 4IOOA 4O75A 4BHWA 5A82A 2GRCA 4O7AA 4QSQA 5EVAA 2L85A 3UVDA 5CUGA 5HEMA 4YYHA 2I8NA 5E73A 5I89A 4HBXA 4QZSA 4Y03A 4Z6IA 5CUEA 5EV9A 4NUEA 5E9IA 4CL9A 5E9MA 4O7EA 5FE3A 5I40A 5D7XA 2YQDA 5II1A 1WUMA 3DAIA 5D3NA 4F3IA 4NR5A 4QSUA 4MR3A 4YYGA 4UYHA 4LZSA 4YBTA 3P5OA 5D3HA 5EICA 5F25A 4CUSA 5LKTA 4A9KA 4YBMA 5FH8A 3D7CA 4IR6A 4UYDA 2L84A 2RFJA 4LC2A 3AADA 2RNYA 5DFBA 1JM4B 4MEQA 3DWYA 5A5NA 5I86A 4MR6A 3QZSA 5ACYA 5H1TA 5DW1A 5FE5A 3RCWA 5JWMA 4YH3A 4YYNA 2YYNA 2R10A 5ENGA 3SVFA 2RI7A 4MEOA 5CQ6A 5L96A 5IBNA 3MQMA 5DBMA 4WHUA 4QEWA 5IGKA 4Z6HA 4NUCA 4YYDA 3P1EA 1WUGA 4O7FA 4HBWA 5G4RA 5FH6A 3LQHA 2OUOA 3QZTA 5DYUA 3U5OA 5I80A 5CGPA 4N4FA 3QZVA 4QSVA 5LUUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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