4CUUA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-6 n09645
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-6 N09645
rcsb
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cuuA00
2WP1A 4O78A 5E3DA 4BW3A 5AD3A 4ZC9A 4XY9A 4O7EA 3LJWA 5DYCA 5CQAA 4QSUA 4YYHA 2OO1A 3LQJA 5EPBA 5J0DA 5D3JA 5D3NA 5IBNA 2I7KA 5DYXA 2H60A 4YBSA 4MENA 4O7CA 5I40A 5FH8A 4J0RA 4A9JA 4IR3A 4O75A 5C89A 4A9KA 3I3JA 5LUUA 5CUCA 5DKCA 4KV4A 5HRVA 4Q0NA 3G0LA 4A9HA 5FH6A 1ZS5A 5HJCA 5CU8A 4MEPA 1JSPB 3AQAA 2KTBB 5F63A 4A9FA 3IU6A 5ENEA 4XUBA 2RFJA 4ZW1A 4LR6A 4MR4A 2YDWA 5HQ5A 2DVRA 5CUGA 5CUDA 4NR5A 5BT3A 3LQIA 5KTWA 5DY7A 5HM0A 4CUPA 4QSTA 5DKDA 4LZ2A 5FBXA 4N4HA 2RNYA 4Z6HA 4ALGA 4O77A 3U5MA 5D25A 4UYGA 3HMHA 4ALHA 5ENJA 3QZVA 4QB3A 5DLXA 3HMFA 2RNXA 4HXMA 5DFDA 3UVWA 4LYSA 4J0SA 5F25A 3U5NA 3G0JA 5CUBA 5IGNA 4QY4A 5D3PA 4N4IA 4AKNA 4CFLA 4XUAA 4OGJA 4TZ8A 2E7OA 2E7NA 4CUSA 5EWVA 4ZQLA 3K2JA 3LQHA 2DATA 3S92A 4YADA 5HQ6A 4YYGA 4NYXA 4YH3A 3U5LA 5A5RA 4UIZA 4QBMA 4QSQA 4NR8A 3UVYA 4NR4A 5IIDA 5CFWA 4GPJA 3UV5A 5HCLA 5D3SA 4QC3A 5FE9A 4YYJA 5CPEA 4YYIA 3ONIA 5EPSA 5CP5A 5CRZA 4RVRA 3FKMX 4F3IA 4HBWA 4YH4A 4MEOA 2L84A 5E9IA 5KU3A 2R0VA 1X0JA 4NXJA 2YYNA 3MB4A 4C67A 5EWDA 5DYUA 3Q2FA 4NQMA 4YYKA 5A82A 4QSRA 5AMEA 5KTUA 4QYDA 4TTEA 5A83A 4LYWA 4HBVA 4IR4A 3MB3A 4TZ2A 5FFVA 4O74A 5E9KA 4YYDA 2YEKA 4LZRA 4O76A 5EISA 5A85A 5I86A 5EP7A 4QYLA 4X2IA 4PCEA 5CQ7A 5II2A 3O37A 4QEVA 4BW4A 4CUUA 5L97A 5AMFA 5C4QA 5EU1A 2DVVA 4Z93A 2LSPB 4OUFA 5E9VA 3U5PA 2DWWA 4FLPA 5ENGA 5JWMA 5FE8A 4PTBA 5CTLA 2YELA 5EWWA 4TT2A 4TT6A 2RS9B 3UVDA 4YABA 5HRWA 4KV1A 5COIA 3JVMA 5FE3A 4O7FA 4WHUA 4XYAA 3MUKA 4NS5A 3O36A 3QZTA 4NUCA 4HXLA 1E6IA 4HXRA 4NUEA 5CGPA 2GRCA 5IGKA 5HEMA 5C8GA 2R0YA 5BT5A 5A5QA 4PCIA 5EA1A 5HRXA 3JVJA 4CUTA 3JVLA 5DYAA 4O7AA 5F1HA 5FE2A 2RO1A 4YC9A 5F1LA 5F2PA 5I1QA 4IR5A 4BW2A 4HXNA 5LKTA 5E0RA 4YBMA 3MULA 4MEQA 5L96A 3NXBA 2D82A 5F60A 3P1EA 5IGMA 4CL9A 5BT4A 4TU6A 5H85A 2DKWA 5FFYA 4MR3A 2D9EA 5FE7A 3DAIA 4PY6A 1N72A 4NRBA 5L99A 3SVGA 4O7BA 5ACYA 5EGUA 5L98A 5C87A 5CY9A 2R0SA 4MR6A 4CUQA 1F68A 4O71A 4QSXA 3JVKA 3MXFA 5IGLA 5E3GA 4IORA 2YQDA 5HLSA 4UYDA 5CQ8A 5ENFA 4A9IA 5F3AA 4LDFA 1EQFA 2F6NA 5ENCA 3S91A 3LXJA 5I80A 4YYMA 2L85A 5E74A 5EM3A 5CUEA 4TYLA 5LJ0A 4CURA 5L8UA 5FE4A 2YW5A 5ETBA 4YATA 4QSWA 5DLZA 4LYIA 4WHWA 4A9LA 5I7YA 4BHWA 4N4FA 3QZSA 5A5PA 2OUOA 5D3RA 5FFWA 4UIUA 5F61A 4KCXA 4YY6A 5TCMA 4O70A 5E9YA 4CLBA 4NYWA 5E7DA 5HQ7A 3RCWA 2FSAA 3U5JA 4UIYA 4Q0OA 3Q2EA 5D3TA 4HXKA 5DBMA 5ENHA 5E9LA 3GG3A 5CQ5A 4A9NA 5LKUA 5E73A 5LVRA 4NQNA 4TT4A 5FG4A 4A9MA 5A5NA 5LKXA 5EPRA 2E3KA 3SVFA 5FE0A 5HFQA 4UIWA 1WUGA 5HENA 5F5ZA 5DKHA 5HELA 2DVQA 5L8TA 3P1DA 3DWYA 5FDZA 3O35A 5EK9A 5H1VA 5DFBA 5FB1A 5I83A 4YBTA 5G4SA 2N9GA 4HXSA 4LRGA 5CQ6A 4Z1QA 3UV2A 2NXBA 5TB6A 4QUUA 4UYEA 3UV4A 5ETDA 5EICA 5D3LA 4N4GA 5FH7A 2G4AA 5I29A 5EWCA 2L5EA 4QR4A 5LJ2A 4PS5A 2RI7A 3HMEA 5KHMA 4NR6A 5E9MA 4O72A 5EWHA 4QUTA 4IOQA 4Z1SA 4NR9A 5A81A 4BJXA 4N3WA 5D3HA 5CUAA 5HFRA 4Z6IA 3O34A 4UYFA 4J1PA 5KTXA 3SVHA 4LZSA 5DFCA 4YAXA 5H1TA 3P1CA 4E96A 5JI8A 5LJ1A 1JM4B 4QR5A 5FG5A 5AD2A 2R10A 5A5SA 4Y03A 4WIVA 5FE5A 4NRAA 3AADA 4IR6A 2YEMA 4YK0A 5I88A 4NUDA 4UIVA 5D26A 4XY8A 3TLPA 4DONA 5LVQA 5A7CA 5ENIA 5CQ4A 4NR7A 5EI4A 4QNSA 4HBXA 4TQNA 4QEWA 2I8NA 4PKLA 4MR5A 5C7NA 4BW1A 5EVAA 3O33A 5CS8A 4NYVA 5FB0A 4UYHA 4QSPA 4HXPA 4C66A 5IG6A 4QZSA 5KO4A 2DVSA 5DW1A 5F62A 5D24A 3ZYUA 5D7XA 5FE1A 5G4RA 5D0CA 4TU4A 4QSVA 5II1A 4UITA 4YY4A 4OGIA 5CZGA 4IOOA 2OSSA 4J3IA 4A9OA 4YYNA 4QR3A 5LKZA 3D7CA 5DX4A 4QEUA 3P5OA 2RNWA 5F36A 4TS8A 5ENBA 3MQMA 4HXOA 3U5KA 4A9EA 5EQ1A 4UIXA 5K29A 5C85A 4QC1A 3UW9A 3P1FA 4LC2A 3U5OA 5EV9A 5CQ3A 5I7XA 5CRMA 4CFKA 3IU5A 4NRCA 2MJVB 4UYFB 5H1UA 5I89A 1WUMA 5DW2A 4HBYA 5A5OA 5CQTA 3UVXA 5FE6A 4QSSA 2F6JA 2WP2A 5FG6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WP1A 4O78A 5E3DA 4BW3A 5AD3A 4ZC9A 4XY9A 4O7EA 3D1DA 3LJWA 5DYCA 5CQAA 4QSUA 4YYHA 2OO1A 3LQJA 5EPBA 5J0DA 5D3JA 5D3NA 5IBNA 2I7KA 5DYXA 2H60A 4YBSA 4MENA 4O7CA 5I40A 5FH8A 4J0RA 4A9JA 4IR3A 4O75A 5C89A 4A9KA 3I3JA 5LUUA 5CUCA 5DKCA 4KV4A 5HRVA 4Q0NA 3G0LA 4A9HA 5FH6A 1ZS5A 5HJCA 5CU8A 4MEPA 1JSPB 3AQAA 2KTBB 5F63A 1ZKRA 4A9FA 3IU6A 5ENEA 4XUBA 2RFJA 4ZW1A 4LR6A 4MR4A 2YDWA 5HQ5A 2DVRA 5CUGA 5CUDA 4NR5A 5BT3A 3LQIA 5KTWA 5DY7A 5HM0A 4CUPA 4QSTA 5DKDA 4LZ2A 5FBXA 4N4HA 2RNYA 4Z6HA 4ALGA 4O77A 3U5MA 5D25A 4UYGA 3HMHA 4ALHA 5ENJA 3QZVA 4QB3A 5DLXA 3HMFA 2RNXA 4HXMA 5DFDA 3UVWA 4LYSA 4J0SA 5F25A 4AI6A 3U5NA 3G0JA 5CUBA 5IGNA 4QY4A 5D3PA 4N4IA 4AKNA 4CFLA 4AKIA 4XUAA 4OGJA 4TZ8A 2E7OA 2E7NA 4CUSA 5EWVA 4ZQLA 3K2JA 3LQHA 2DATA 3S92A 4YADA 5HQ6A 4YYGA 4NYXA 4YH3A 3U5LA 5A5RA 4UIZA 4QBMA 4QSQA 4NR8A 3UVYA 4NR4A 5IIDA 5CFWA 4GPJA 3UV5A 5HCLA 5D3SA 4QC3A 5FE9A 4YYJA 5CPEA 4YYIA 3ONIA 5EPSA 5CP5A 5CRZA 4RVRA 3FKMX 4F3IA 4HBWA 4YH4A 4MEOA 2L84A 5E9IA 5KU3A 2R0VA 1X0JA 4NXJA 2YYNA 3MB4A 4C67A 5EWDA 5DYUA 3Q2FA 4NQMA 4YYKA 5A82A 4QSRA 5AMEA 5KTUA 4QYDA 4TTEA 1PUOA 5A83A 4LYWA 4HBVA 4IR4A 3MB3A 4TZ2A 5FFVA 4O74A 5E9KA 4YYDA 2YEKA 4LZRA 4O76A 5EISA 5A85A 5I86A 5EP7A 4QYLA 4X2IA 4PCEA 5CQ7A 5II2A 3O37A 4QEVA 4BW4A 4CUUA 5L97A 5AMFA 5C4QA 3VKGA 5EU1A 2DVVA 4Z93A 2LSPB 4OUFA 5E9VA 3U5PA 2DWWA 4FLPA 5ENGA 5JWMA 5FE8A 4PTBA 5CTLA 2YELA 5EWWA 4TT2A 4TT6A 2RS9B 3UVDA 4YABA 5HRWA 4KV1A 5COIA 3JVMA 5FE3A 4O7FA 3VKHA 4WHUA 4XYAA 3MUKA 4NS5A 3O36A 3QZTA 4NUCA 4HXLA 1E6IA 4HXRA 4NUEA 5CGPA 2GRCA 5IGKA 5HEMA 5C8GA 2R0YA 5BT5A 5A5QA 4PCIA 5EA1A 5HRXA 3JVJA 4CUTA 3JVLA 5DYAA 4O7AA 5F1HA 5FE2A 4AKGA 2RO1A 4YC9A 5F1LA 5F2PA 5I1QA 4IR5A 4BW2A 4HXNA 5LKTA 5E0RA 4YBMA 3MULA 4MEQA 5L96A 3NXBA 2D82A 5F60A 3P1EA 5IGMA 4CL9A 5BT4A 4TU6A 5H85A 2DKWA 5FFYA 4MR3A 2D9EA 5FE7A 3DAIA 4PY6A 1N72A 4NRBA 5L99A 3SVGA 4O7BA 5ACYA 5EGUA 5L98A 5C87A 5CY9A 2R0SA 4MR6A 4CUQA 1F68A 4O71A 4QSXA 3JVKA 3MXFA 5IGLA 5E3GA 4IORA 2YQDA 5HLSA 4UYDA 5CQ8A 5ENFA 3ERRA 5F3AA 4LDFA 1EQFA 2F6NA 5ENCA 3S91A 4A9IA 3LXJA 5I80A 4YYMA 2L85A 5E74A 5EM3A 5CUEA 4TYLA 5LJ0A 4CURA 5L8UA 5FE4A 2YW5A 5ETBA 4YATA 4QSWA 5DLZA 4LYIA 4WHWA 4A9LA 5I7YA 4BHWA 4N4FA 3QZSA 5A5PA 2OUOA 5D3RA 5FFWA 4UIUA 5F61A 4KCXA 4YY6A 5TCMA 3D1BA 4O70A 5E9YA 4CLBA 4NYWA 5E7DA 5HQ7A 3RCWA 2FSAA 3U5JA 4UIYA 4Q0OA 3Q2EA 5D3TA 4HXKA 5DBMA 5ENHA 5E9LA 3GG3A 5CQ5A 4A9NA 5LKUA 5E73A 5LVRA 4NQNA 4TT4A 5FG4A 4A9MA 5A5NA 5LKXA 5EPRA 2E3KA 3SVFA 5FE0A 5HFQA 4UIWA 1WUGA 5HENA 5F5ZA 5DKHA 5HELA 2DVQA 5L8TA 3P1DA 3DWYA 5FDZA 3O35A 5EK9A 5H1VA 5DFBA 5FB1A 5I83A 4YBTA 5G4SA 2N9GA 4HXSA 4LRGA 5CQ6A 4Z1QA 2EJNA 3UV2A 2NXBA 5TB6A 4QUUA 4UYEA 3UV4A 5ETDA 5EICA 5D3LA 4N4GA 5FH7A 2G4AA 5I29A 5EWCA 2L5EA 4QR4A 5LJ2A 4PS5A 2RI7A 3HMEA 5KHMA 4NR6A 5E9MA 4O72A 5EWHA 4QUTA 4IOQA 4Z1SA 4NR9A 5A81A 4BJXA 4N3WA 5D3HA 5CUAA 5HFRA 4Z6IA 3O34A 4UYFA 4J1PA 5KTXA 3SVHA 4LZSA 5DFCA 4YAXA 5H1TA 3P1CA 4E96A 5JI8A 5LJ1A 1JM4B 4QR5A 5FG5A 5AD2A 2R10A 5A5SA 4Y03A 4WIVA 5FE5A 4NRAA 3AADA 4IR6A 2YEMA 4YK0A 5I88A 4NUDA 4UIVA 5D26A 4XY8A 3TLPA 4DONA 5LVQA 5A7CA 5ENIA 5CQ4A 4NR7A 5EI4A 4QNSA 4HBXA 4TQNA 4QEWA 2I8NA 4PKLA 4MR5A 5C7NA 4BW1A 5EVAA 3O33A 5CS8A 4NYVA 4AKHA 5FB0A 4UYHA 4QSPA 4HXPA 4C66A 5IG6A 4QZSA 5KO4A 2DVSA 5DW1A 5F62A 5D24A 3ZYUA 5D7XA 5FE1A 5G4RA 5D0CA 4TU4A 4QSVA 5II1A 4UITA 4YY4A 4OGIA 5CZGA 4IOOA 2OSSA 4J3IA 4A9OA 4YYNA 4QR3A 5LKZA 3D7CA 5DX4A 4QEUA 3P5OA 2RNWA 5F36A 4TS8A 5ENBA 3MQMA 4HXOA 3U5KA 4A9EA 5EQ1A 4UIXA 5K29A 5C85A 4QC1A 3UW9A 3P1FA 4LC2A 3U5OA 5EV9A 5CQ3A 5I7XA 5CRMA 4CFKA 3IU5A 4NRCA 2MJVB 4UYFB 5H1UA 5I89A 1WUMA 5DW2A 4HBYA 5A5OA 5CQTA 3UVXA 5FE6A 4QSSA 2F6JA 2WP2A 5FG6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WP1 A;  4O78 A;  5E3D A;  4BW3 A;  5AD3 A;  4ZC9 A;  4XY9 A;  4O7E A;  3LJW A;  5DYC A;  5CQA A;  4QSU A;  4YYH A;  2OO1 A;  3LQJ A;  5EPB A;  5J0D A;  5D3J A;  5D3N A;  5IBN A;  2I7K A;  5DYX A;  2H60 A;  4YBS A;  4MEN A;  4O7C A;  5I40 A;  5FH8 A;  4J0R A;  4A9J A;  4IR3 A;  4O75 A;  5C89 A;  4A9K A;  3I3J A;  5LUU A;  5CUC A;  5DKC A;  4KV4 A;  5HRV A;  4Q0N A;  3G0L A;  4A9H A;  5FH6 A;  1ZS5 A;  5HJC A;  5CU8 A;  4MEP A;  1JSP B;  3AQA A;  2KTB B;  5F63 A;  4A9F A;  3IU6 A;  5ENE A;  4XUB A;  2RFJ A;  4ZW1 A;  4LR6 A;  4MR4 A;  2YDW A;  5HQ5 A;  2DVR A;  5CUG A;  5CUD A;  4NR5 A;  5BT3 A;  3LQI A;  5KTW A;  5DY7 A;  5HM0 A;  4CUP A;  4QST A;  5DKD A;  4LZ2 A;  5FBX A;  4N4H A;  2RNY A;  4Z6H A;  4ALG A;  4O77 A;  3U5M A;  5D25 A;  4UYG A;  3HMH A;  4ALH A;  5ENJ A;  3QZV A;  4QB3 A;  5DLX A;  3HMF A;  2RNX A;  4HXM A;  5DFD A;  3UVW A;  4LYS A;  4J0S A;  5F25 A;  3U5N A;  3G0J A;  5CUB A;  5IGN A;  4QY4 A;  5D3P A;  4N4I A;  4AKN A;  4CFL A;  4XUA A;  4OGJ A;  4TZ8 A;  2E7O A;  2E7N A; 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