4MEOA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with a 2-methyl-quinoline ligand
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Novel Small-Molecule Inhibitors of BRD4 Using Structure-Based Virtual Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4meoA01
4QSUA 1X0JA 4J3IA 2R0SA 4O7CA 5I86A 4UIYA 4Z1SA 5EWHA 4NYWA 2I7KA 4NR7A 5E9IA 4CFLA 3UV5A 4BW2A 5EM3A 5IGLA 5DW1A 5D3TA 5FG5A 4AKNA 3Q2EA 5EWDA 4YYGA 4GPJA 4O71A 5DLZA 5KU3A 5CQ8A 5F5ZA 2DVQA 3AADA 5LVQA 5EISA 5C85A 5EPSA 3U5KA 4QSWA 4ALHA 3U5PA 5ETBA 5AD3A 5EI4A 3LQJA 5DX4A 4WHUA 3JVKA 4TYLA 4O7EA 5EWCA 5A5OA 2YEMA 4LZ2A 4O72A 5ENBA 5G4SA 4KV1A 4PY6A 4HXOA 4N4FA 2H60A 4QBMA 5F1LA 3G0JA 5EA1A 4NUDA 2KTBB 2WP2A 4N4GA 1EQFA 3Q2FA 5HFQA 4CL9A 4WIVA 4HXNA 4XUAA 4A9OA 4NR8A 3UVYA 5CUCA 5IGKA 5DYCA 3TLPA 4N4IA 5D3HA 5CZGA 4NUCA 4YY6A 3D7CA 5ENCA 5FFWA 5ENGA 5CQ6A 3HMFA 5CQ5A 5KTXA 4C66A 4YABA 4BJXA 3AQAA 5DKDA 5FFVA 4IR5A 2GRCA 4IR6A 4UYFA 2NXBA 5A5QA 3UW9A 4MENA 2LSPB 4NR9A 4HXKA 4HXSA 4OUFA 5L98A 3SVFA 3JVJA 2F6NA 4TQNA 5F63A 5FE6A 4UITA 5HQ5A 4NRAA 4KCXA 4UYGA 4F3IA 2E3KA 3MB3A 4CUUA 4CUPA 4WHWA 5CUDA 5HQ7A 5KO4A 4IR4A 5EK9A 5CUAA 4CURA 5LJ2A 5LKXA 2G4AA 5HRVA 4MR4A 4TTEA 5CRMA 4UYEA 4TS8A 2YYNA 4NRCA 4TU4A 5C4QA 5L97A 5H1TA 4QUUA 5LUUA 4UIWA 3P1DA 5CU8A 4YYKA 4YYNA 5I80A 4BW1A 4QUTA 5D3PA 4Z6HA 4Z1QA 5ENHA 4MR6A 2OO1A 4QSVA 5E3DA 3U5MA 4O74A 3P5OA 5A5RA 5ACYA 3LJWA 4MEOA 4CUTA 5CRZA 2RO1A 4YATA 2R0VA 5IIDA 5FE7A 4QNSA 5E0RA 5F61A 4J1PA 5BT4A 4BW3A 3G0LA 5DY7A 4YK0A 3HMHA 5FFYA 3I3JA 5FE0A 5FB1A 4TT6A 5FE9A 5KHMA 5F36A 5E74A 1ZS5A 2DKWA 5DBMA 4QC1A 5C8GA 5I29A 5HELA 4YY4A 5D3NA 3NXBA 5FE2A 4X2IA 5A5PA 4MR5A 4PKLA 3U5NA 5HFRA 4YYHA 3U5LA 4Z6IA 4Q0NA 3UVWA 4NR6A 4NYVA 4HBVA 4CUSA 4TT4A 5EGUA 3S92A 5EP7A 5AMEA 5ENEA 4A9NA 5HJCA 4YYJA 5LJ1A 3IU5A 5ENIA 5FG6A 4QYDA 4TT2A 4YC9A 5CQAA 4QSTA 5EVAA 5DFDA 2OSSA 5FH8A 5IBNA 4N4HA 5A5SA 4QR3A 3O35A 5EPBA 5E9YA 2D82A 5LKZA 3P1CA 5FB0A 1JSPB 5D26A 2FSAA 5CQ7A 4E96A 4O76A 4J0RA 3LXJA 4QSPA 4MEQA 3MB4A 1E6IA 2DVVA 5CQ3A 2DVRA 5EWVA 2DVSA 5F62A 4O78A 5CGPA 4NUEA 4TZ2A 3HMEA 5COIA 5F2PA 4CUQA 3K2JA 2N9GA 4UIVA 3JVMA 2RNXA 4PCIA 5C87A 5DYUA 4A9HA 4UIUA 4LC2A 5BT5A 3U5JA 5DFCA 5L8UA 5E9MA 2YW5A 4PCEA 4ZQLA 5A5NA 4YYIA 5HLSA 5JI8A 2YQDA 4YBTA 4LZSA 5A85A 5HRWA 5D3SA 4QC3A 4O70A 2RNYA 3U5OA 5CUBA 3UV2A 4BHWA 5D0CA 5KTUA 2L5EA 5HCLA 4PS5A 5E73A 5CTLA 5F3AA 4QZSA 5EU1A 1JM4B 5FBXA 4O7AA 4CLBA 4IOOA 4O77A 5HEMA 2RI7A 2E7OA 5I7XA 5HRXA 5I89A 4QSSA 5I40A 5D7XA 5HM0A 4YADA 4LYIA 5FH6A 5CUGA 4YAXA 4QSQA 3LQHA 2MJVB 2F6JA 3JVLA 4IORA 5LKUA 4C67A 4A9KA 5LKTA 4DONA 4IOQA 5HENA 4Z93A 4ZC9A 5CQ4A 5A7CA 4XY8A 3P1EA 5FE8A 4A9LA 2DWWA 5AMFA 2OUOA 2E7NA 2YELA 5DKHA 5L8TA 2D9EA 4NXJA 3QZSA 5D3LA 3P1FA 5D24A 5ENFA 5DLXA 1N72A 5DW2A 3DAIA 4YH4A 3O37A 4LR6A 4YYMA 5E9VA 5E7DA 5DYXA 4YH3A 5CUEA 5I7YA 5KTWA 3UVXA 4QSXA 4UYFB 3SVGA 3O36A 5CPEA 3O34A 5DYAA 5EPRA 4QEWA 4O75A 3MUKA 5CP5A 5DKCA 3QZVA 4LZRA 3MXFA 5K29A 4NS5A 3MQMA 2R0YA 4KV4A 5IGNA 4QYLA 4Q0OA 4HBYA 4HBXA 4YYDA 4OGIA 5J0DA 5TB6A 5LJ0A 2RS9B 4UYHA 4XY9A 5CFWA 2RFJA 5L96A 5ETDA 4NR5A 5A83A 5H1UA 5HQ6A 4QR5A 4A9EA 5FE3A 5FH7A 5II1A 5C7NA 4QR4A 5CS8A 5EICA 5LVRA 1WUGA 4NYXA 4O7FA 4ZW1A 4HXPA 4A9FA 5EQ1A 4MEPA 3ONIA 4QY4A 5FE1A 2L84A 3QZTA 5I88A 4Y03A 3UV4A 2WP1A 3S91A 4IR3A 4TZ8A 4QB3A 4UIZA 5D3JA 5F60A 2I8NA 4ALGA 5IGMA 3SVHA 5ENJA 4A9MA 4O7BA 4J0SA 2YDWA 5D3RA 4NRBA 3RCWA 2R10A 5A82A 5FG4A 4HXMA 5FE4A 3ZYUA 4FLPA 5JWMA 3IU6A 4HBWA 4HXRA 3MULA 5H1VA 4CFKA 1F68A 4RVRA 5CY9A 1WUMA 4LYWA 2L85A 4NQNA 2YEKA 5AD2A 4XUBA 4LYSA 5FDZA 5D25A 3FKMX 4QEVA 4NR4A 2DATA 4QEUA 3GG3A 3DWYA 5G4RA 4A9IA 3LQIA 5E3GA 4YBSA 4YBMA 4LRGA 5EV9A 4QSRA 5E9KA 5TCMA 5L99A 5EWWA 5CQTA 4OGJA 5IG6A 5C89A 4A9JA 4NQMA 5FE5A 4N3WA 4UYDA 4PTBA 5A81A 2RNWA 4HXLA 5H85A 5DFBA 4LDFA 4TU6A 4MR3A 5F1HA 5F25A 5I83A 3UVDA 4UIXA 5II2A 5BT3A 5E9LA 5I1QA 3O33A 4XYAA 4BW4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSUA 1X0JA 4J3IA 2R0SA 4O7CA 5I86A 4UIYA 3ERRA 4Z1SA 5EWHA 4NYWA 2I7KA 4NR7A 5E9IA 4CFLA 3UV5A 4BW2A 5EM3A 5IGLA 5DW1A 5D3TA 5FG5A 4AKNA 3Q2EA 5EWDA 4YYGA 4GPJA 4O71A 5DLZA 5KU3A 5CQ8A 5F5ZA 2DVQA 3AADA 5LVQA 5EISA 5C85A 5EPSA 3U5KA 4QSWA 4ALHA 3U5PA 5ETBA 5AD3A 5EI4A 3LQJA 5DX4A 4WHUA 3JVKA 4TYLA 4O7EA 5EWCA 5A5OA 2YEMA 4LZ2A 4O72A 5ENBA 5G4SA 4KV1A 4PY6A 4HXOA 4N4FA 2H60A 4QBMA 5F1LA 3G0JA 5EA1A 4NUDA 2KTBB 2WP2A 4N4GA 1EQFA 3Q2FA 5HFQA 4CL9A 4WIVA 4HXNA 4XUAA 4A9OA 4NR8A 3VKHA 3UVYA 5CUCA 5IGKA 5DYCA 3TLPA 4N4IA 5D3HA 5CZGA 4NUCA 4YY6A 3D7CA 5ENCA 5FFWA 5ENGA 5CQ6A 3HMFA 5CQ5A 5KTXA 4C66A 4YABA 4BJXA 3AQAA 5DKDA 5FFVA 4IR5A 2GRCA 4IR6A 4UYFA 2NXBA 5A5QA 3UW9A 4MENA 2LSPB 4NR9A 4HXKA 4HXSA 4OUFA 5L98A 3SVFA 3JVJA 2F6NA 4TQNA 5F63A 5FE6A 4UITA 5HQ5A 4NRAA 4KCXA 4UYGA 4F3IA 2E3KA 3MB3A 4CUUA 4CUPA 4WHWA 5CUDA 5HQ7A 5KO4A 4IR4A 5EK9A 5CUAA 4CURA 5LJ2A 5LKXA 2G4AA 5HRVA 4MR4A 4TTEA 5CRMA 4UYEA 4TS8A 2YYNA 3D1BA 4NRCA 4TU4A 5C4QA 5L97A 5H1TA 4QUUA 5LUUA 4UIWA 3P1DA 5CU8A 4YYKA 4YYNA 5I80A 4BW1A 4QUTA 5D3PA 4Z6HA 4Z1QA 5ENHA 4MR6A 2OO1A 4QSVA 5E3DA 3U5MA 4O74A 3P5OA 5A5RA 5ACYA 3LJWA 4MEOA 4CUTA 5CRZA 2RO1A 4YATA 2R0VA 5IIDA 5FE7A 4QNSA 5E0RA 5F61A 4J1PA 5BT4A 4BW3A 3G0LA 5DY7A 4YK0A 3HMHA 5FFYA 3I3JA 5FE0A 5FB1A 4TT6A 5FE9A 5KHMA 5F36A 5E74A 1ZS5A 2DKWA 5DBMA 4QC1A 5C8GA 5I29A 5HELA 4YY4A 5D3NA 3NXBA 5FE2A 4X2IA 5A5PA 4MR5A 4PKLA 3U5NA 5HFRA 4YYHA 3U5LA 4Z6IA 4Q0NA 3UVWA 4NR6A 4NYVA 4HBVA 4CUSA 4TT4A 5EGUA 3S92A 5EP7A 5AMEA 5ENEA 4A9NA 5HJCA 4YYJA 5LJ1A 3IU5A 5ENIA 5FG6A 4QYDA 4TT2A 4YC9A 5CQAA 4QSTA 5EVAA 5DFDA 2OSSA 5FH8A 5IBNA 4N4HA 5A5SA 4AKGA 4QR3A 3O35A 5EPBA 5E9YA 2D82A 5LKZA 3P1CA 2EJNA 5FB0A 1JSPB 5D26A 2FSAA 5CQ7A 4E96A 4O76A 4J0RA 3LXJA 4QSPA 4MEQA 3MB4A 1E6IA 2DVVA 5CQ3A 2DVRA 5EWVA 2DVSA 5F62A 4O78A 5CGPA 4NUEA 4TZ2A 3HMEA 5COIA 5F2PA 4CUQA 3K2JA 2N9GA 4UIVA 3JVMA 2RNXA 4PCIA 5C87A 5DYUA 4A9HA 4UIUA 4LC2A 5BT5A 3U5JA 5DFCA 5L8UA 5E9MA 2YW5A 4PCEA 4AI6A 4ZQLA 5A5NA 4YYIA 5HLSA 5JI8A 2YQDA 4YBTA 4LZSA 5A85A 5HRWA 3VKGA 5D3SA 4QC3A 4O70A 2RNYA 3U5OA 5CUBA 3UV2A 4BHWA 5D0CA 5KTUA 2L5EA 5HCLA 4PS5A 5E73A 5CTLA 5F3AA 4QZSA 5EU1A 1JM4B 5FBXA 4O7AA 4CLBA 4IOOA 4O77A 5HEMA 2RI7A 2E7OA 5I7XA 5HRXA 5I89A 4QSSA 5I40A 5D7XA 5HM0A 4YADA 4LYIA 5FH6A 5CUGA 4YAXA 4QSQA 3LQHA 2MJVB 2F6JA 3JVLA 4IORA 5LKUA 4C67A 4A9KA 5LKTA 4DONA 4IOQA 5HENA 4Z93A 4ZC9A 5CQ4A 5A7CA 4XY8A 3P1EA 5FE8A 4A9LA 2DWWA 5AMFA 2OUOA 2E7NA 2YELA 5DKHA 5L8TA 2D9EA 4NXJA 3QZSA 5D3LA 3P1FA 4AKIA 5D24A 5ENFA 5DLXA 1N72A 5DW2A 3DAIA 4YH4A 3O37A 4LR6A 4YYMA 5E9VA 5E7DA 5DYXA 4YH3A 5CUEA 5I7YA 5KTWA 3UVXA 4QSXA 4UYFB 3SVGA 3O36A 5CPEA 3O34A 5DYAA 5EPRA 4QEWA 4O75A 3MUKA 5CP5A 5DKCA 3QZVA 4LZRA 3MXFA 5K29A 4NS5A 3MQMA 2R0YA 4KV4A 5IGNA 4QYLA 4Q0OA 4HBYA 4HBXA 4YYDA 4OGIA 5J0DA 5TB6A 1PUOA 5LJ0A 2RS9B 4UYHA 4XY9A 5CFWA 2RFJA 5L96A 5ETDA 4AKHA 4NR5A 5A83A 5H1UA 5HQ6A 4QR5A 4A9EA 5FE3A 5FH7A 5II1A 5C7NA 4QR4A 5CS8A 5EICA 5LVRA 1WUGA 4NYXA 4O7FA 4ZW1A 4HXPA 4A9FA 5EQ1A 4MEPA 3ONIA 4QY4A 5FE1A 2L84A 3QZTA 5I88A 4Y03A 3UV4A 2WP1A 3S91A 1ZKRA 4IR3A 4TZ8A 4QB3A 4UIZA 5D3JA 5F60A 2I8NA 4ALGA 3D1DA 5IGMA 3SVHA 5ENJA 4A9MA 4O7BA 4J0SA 2YDWA 5D3RA 4NRBA 3RCWA 2R10A 5A82A 5FG4A 4HXMA 5FE4A 3ZYUA 4FLPA 5JWMA 3IU6A 4HBWA 4HXRA 3MULA 5H1VA 4CFKA 1F68A 4RVRA 5CY9A 1WUMA 4LYWA 2L85A 4NQNA 2YEKA 5AD2A 4XUBA 4LYSA 5FDZA 5D25A 3FKMX 4QEVA 4NR4A 2DATA 4QEUA 3GG3A 3DWYA 5G4RA 4A9IA 3LQIA 5E3GA 4YBSA 4YBMA 4LRGA 5EV9A 4QSRA 5E9KA 5TCMA 5L99A 5EWWA 5CQTA 4OGJA 5IG6A 5C89A 4A9JA 4NQMA 5FE5A 4N3WA 4UYDA 4PTBA 5A81A 2RNWA 4HXLA 5H85A 5DFBA 4TU6A 4LDFA 4MR3A 5F1HA 5F25A 5I83A 3UVDA 4UIXA 5II2A 5BT3A 5E9LA 5I1QA 3O33A 4XYAA 4BW4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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