4NQNA

Crystal structure of the bromodomain of human brd9 in complex with a triazolo-phthalazine ligand
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
ESTPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSKERLLALKRSM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the bromodomain of human BRD9 in complex with a triazolo-phthalazine ligand
rcsb
molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
total genus 41
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nqnA00
5CUEA 2GRCA 5D7XA 4PY6A 5II2A 4QR5A 5KU3A 4A9EA 3HMEA 5HRWA 5H1UA 3LQJA 5ENGA 5C8GA 4HXSA 4YAXA 4N3WA 4QSUA 5D3HA 5E9IA 4E96A 5L8UA 2RNXA 5E9VA 3UW9A 4LYSA 5HQ6A 4O75A 5CUDA 4TS8A 5DFBA 4NXJA 2DWWA 4WHWA 2OUOA 5A5RA 4LYWA 5CRMA 4BW2A 4NR5A 5LKXA 4LZ2A 4PTBA 1JSPB 3FKMX 5A83A 5ENJA 5HRVA 2WP2A 2NXBA 4QNSA 3SVHA 2L85A 4MEQA 5ENEA 2OO1A 4UYFB 2RFJA 5J0DA 2R0SA 4YADA 5AD3A 5LKZA 5CQ3A 4IR5A 4TYLA 2D9EA 5FB1A 4QZSA 4YYNA 4Z6HA 4C67A 5HFQA 5A5SA 5EI4A 5IGKA 1F68A 5DLZA 5E9KA 4A9OA 5G4RA 5I40A 4UYDA 4YYMA 4MR4A 5CP5A 5FFWA 5CUCA 3S91A 4QB3A 4YY6A 5EM3A 5ENFA 4NR8A 4YYJA 4UYFA 5I80A 4O70A 4UIVA 2I8NA 3D7CA 5F60A 5CUBA 4YYIA 3P1EA 4HXKA 4MR6A 5CQ6A 4CL9A 3TLPA 4F3IA 1X0JA 5LVRA 3RCWA 4UYGA 4HBVA 4IR3A 4O72A 5FH6A 4QSWA 5EVAA 2YELA 4QC1A 5EISA 4J3IA 4O7FA 2E7OA 2H60A 2RI7A 5HRXA 2R10A 3O34A 4O7BA 4O7EA 4A9KA 4O74A 5A5OA 4Z1QA 4A9LA 4CUPA 4IOOA 5LVQA 5FE5A 3UVDA 4CFLA 5FB0A 5C7NA 2OSSA 5FG4A 5EWCA 5LUUA 5I86A 4NR7A 5EP7A 5EK9A 4O7CA 5CPEA 2L5EA 2KTBB 1JM4B 3O37A 4YC9A 1WUGA 4NUCA 5KTUA 1E6IA 5JI8A 4WIVA 5FE8A 3MULA 4QUUA 3U5OA 5AMFA 5CQ7A 5F25A 4UIZA 4YABA 5BT3A 4GPJA 4IR6A 4BW3A 2D82A 5EICA 4A9MA 5CUAA 5CQ4A 5EGUA 5AD2A 5I88A 3ONIA 4UYEA 2RS9B 2YEMA 4O76A 3NXBA 4Z6IA 4C66A 5D3NA 4NUDA 5FH7A 5CU8A 5E0RA 4YK0A 1ZS5A 4NR9A 5DYCA 5E73A 5HELA 5DBMA 3HMHA 5I83A 5CQ8A 2I7KA 5BT5A 5LJ0A 5ENHA 5FDZA 5D3SA 4ZQLA 5IGLA 4YYHA 4TU6A 3G0JA 4MEOA 5HQ7A 3JVLA 4PCIA 4MR5A 4PKLA 5CQAA 5FE3A 5TCMA 5KO4A 4N4IA 5DYUA 2YQDA 2F6JA 3U5PA 5C87A 4QSVA 2RNYA 4MEPA 5E9LA 4YYDA 5CQ5A 5EU1A 5I1QA 2N9GA 5F1LA 5E3DA 5F61A 5E3GA 4CURA 4FLPA 5A5NA 5EV9A 5EWDA 4QEWA 4N4HA 2RO1A 5L97A 5DYXA 5DLXA 4NQMA 4XUBA 5ENIA 2YDWA 5H1VA 5HFRA 5KTWA 3MXFA 3UVWA 3P1DA 5K29A 5A81A 4QR3A 4TZ2A 2R0VA 4J0RA 5FH8A 3QZSA 3P5OA 4N4GA 4HXOA 4PCEA 3U5LA 5AMEA 4UIYA 4XY8A 4ALHA 3AQAA 5FE9A 4N4FA 4LDFA 4YH3A 5IIDA 5DX4A 5F1HA 4Z1SA 4NYXA 3QZTA 5D3PA 4HBWA 4NRCA 3IU6A 4TQNA 4TU4A 5F62A 4OUFA 5ETBA 5DW1A 5HM0A 3DAIA 5L8TA 3G0LA 5DY7A 4QSXA 5D3TA 5F36A 4A9NA 5H1TA 4A9HA 4NRBA 2YEKA 4OGIA 5IGNA 5FE0A 4QR4A 4QSRA 4HXMA 5IGMA 5D24A 5EQ1A 4QSSA 4UYHA 3O35A 4QBMA 5EPRA 4NR4A 4O77A 2E3KA 3GG3A 3JVMA 4O71A 5CQTA 3ZYUA 4TTEA 4O78A 4BW4A 3U5MA 4Z93A 2DATA 4IOQA 4YBSA 4LYIA 5E7DA 3IU5A 4J1PA 4UIUA 5A5QA 5I7XA 4CUTA 5F63A 5D3RA 5FE6A 4YBMA 5L96A 4AKNA 5HQ5A 5HCLA 4UITA 4HBXA 4MENA 5CFWA 4A9IA 5E9MA 5EPBA 5A5PA 5LKUA 5FE7A 4BW1A 4NS5A 4NYVA 2YW5A 5E74A 4CUUA 5BT4A 5CY9A 5DKCA 5F3AA 4X2IA 4QSPA 1WUMA 4YATA 5CS8A 5F5ZA 5TB6A 3LQIA 4OGJA 5DW2A 4XY9A 2G4AA 5ACYA 5FE4A 5DKHA 4IR4A 3O33A 4A9JA 4QEUA 4LC2A 3LQHA 4DONA 5FE2A 4MR3A 5KHMA 3SVFA 4UIWA 5LJ2A 3UV4A 4QY4A 4J0SA 2DKWA 3P1CA 3HMFA 4Q0OA 2DVVA 4XUAA 4HXPA 4HXNA 3SVGA 4WHUA 4QSQA 5F2PA 3MB4A 5C89A 4BHWA 3MB3A 5C4QA 4YY4A 3K2JA 4QYDA 5FG6A 2YYNA 4KV1A 5HENA 5D3LA 4YYKA 2LSPB 2R0YA 4HXLA 4TZ8A 4NUEA 3AADA 4CFKA 5D3JA 5EWVA 3U5KA 5D0CA 4KCXA 4TT2A 4IORA 2WP1A 5IBNA 3JVJA 4Q0NA 4ZC9A 5A82A 5A7CA 5KTXA 3LXJA 4PS5A 2L84A 5DFCA 3JVKA 3I3JA 5FBXA 5JWMA 5LKTA 5IG6A 4TT4A 5HEMA 4NQNA 3UV5A 5I29A 3P1FA 4NR6A 3UVYA 5DFDA 4HBYA 5L99A 5I89A 4CUQA 3MUKA 5D25A 5D26A 4A9FA 3UV2A 4QC3A 5FFYA 4LZSA 3U5JA 4QUTA 5DYAA 4QEVA 3Q2EA 5ETDA 5CTLA 1EQFA 5CUGA 3QZVA 4KV4A 4CLBA 5E9YA 2RNWA 4YBTA 4HXRA 4QSTA 4BJXA 5CGPA 5I7YA 3DWYA 4ALGA 5HJCA 4XYAA 5FE1A 4YH4A 4CUSA 5FG5A 2MJVB 5CRZA 5ENCA 3S92A 3U5NA 4RVRA 2DVSA 5EA1A 5EWHA 5LJ1A 4LZRA 4UIXA 2E7NA 4ZW1A 5COIA 4O7AA 4QYLA 4LR6A 4NYWA 2DVQA 3LJWA 5EWWA 3MQMA 1N72A 4NRAA 5A85A 4LRGA 5DKDA 5EPSA 2FSAA 3Q2FA 5II1A 2DVRA 5FFVA 2F6NA 5L98A 3O36A 5H85A 3UVXA 5HLSA 5C85A 5CZGA 5ENBA 5G4SA 4Y03A 4YYGA 4TT6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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