4NR4A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
FKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
rcsb
molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 42
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr4A00
3O34A 5FFYA 4TYLA 5FE5A 3UVDA 4O71A 3MXFA 4LYSA 4CUUA 3SVHA 5E3GA 5E0RA 3O36A 2E7NA 4CUSA 5L96A 4O7BA 2LSPB 2I7KA 4NYWA 5I1QA 4O7EA 4UITA 5EPSA 5TB6A 5ENJA 4NS5A 2R0VA 2WP1A 3HMEA 4C67A 4KV4A 2YEKA 4NQNA 4PY6A 4N4IA 4J3IA 5FH8A 5KTXA 4TT2A 5K29A 5AMFA 2H60A 5EA1A 3O37A 5CQ7A 4OGIA 4YABA 4IR6A 4CL9A 5ENIA 4YYKA 4HBVA 4Z6HA 5C87A 5A85A 5D3JA 5EPBA 4A9OA 5A7CA 5I7YA 4UIWA 4HXLA 4CUQA 3DWYA 4YH4A 4UYFB 4Y03A 5CU8A 4YC9A 3TLPA 5FG5A 4LZRA 1F68A 5KU3A 1E6IA 5DYUA 5HM0A 5F25A 4LYWA 2RNWA 5HRVA 5E9YA 4QEUA 3DAIA 2L5EA 4YYHA 4XY8A 4Z6IA 4NRAA 5EWHA 4RVRA 4HBWA 2YYNA 4HXRA 4IR4A 4TT4A 5A5QA 5CQ5A 5EICA 3RCWA 5F61A 3P1DA 4MR5A 4IOQA 5FDZA 3UV2A 2G4AA 3U5KA 4YY4A 4TS8A 5FB0A 3S92A 5ENHA 3NXBA 4QZSA 4HXPA 4LZ2A 5DFBA 5E9MA 5E7DA 4NR9A 4YH3A 5E9LA 5H1VA 4TZ2A 2DKWA 4TU4A 5FBXA 4YYDA 5LUUA 5HELA 5L8UA 5CGPA 5HENA 4YYIA 5IGNA 4HXKA 2I8NA 4NQMA 5LJ0A 4YK0A 5A5RA 2YQDA 4PKLA 5H1UA 5I89A 4BW1A 5EWWA 5F1LA 5HQ5A 5CQ4A 4HXNA 2RS9B 4LRGA 4NR4A 4PS5A 2E7OA 2FSAA 4YBSA 5FFVA 4XUAA 4NUEA 5A5SA 4IR5A 5FE9A 4BJXA 3JVMA 4X2IA 5EU1A 4NRCA 4QSSA 5F62A 3UV4A 2OUOA 3MULA 4LDFA 5CUEA 1N72A 4UIVA 2RNXA 3QZTA 4QYLA 4QB3A 2OSSA 4QY4A 3QZVA 5TCMA 5FE8A 5HEMA 2YW5A 5F60A 2DVVA 4O77A 5JI8A 5D3HA 5ETDA 5L8TA 5BT3A 5DYCA 4N4FA 4TU6A 5D3LA 5AMEA 5H1TA 4UYDA 5F3AA 5F63A 5FB1A 4O70A 4MEPA 5KTUA 5KTWA 4MR6A 4N4GA 4YYMA 3P1FA 5HFQA 1JM4B 5ENGA 4BW3A 5C7NA 4UIZA 5E9IA 4ALHA 3UW9A 5LJ1A 2YELA 2D82A 3UV5A 5CP5A 5KHMA 3MB4A 3SVGA 3LQHA 4MEOA 5F1HA 4O76A 5F36A 4WHWA 2L85A 3UVXA 4CLBA 3U5PA 3LQJA 5FE2A 4OGJA 2L84A 5FE1A 4QSUA 5FG4A 4NUDA 4YYNA 3P5OA 4YYJA 4O7FA 4QEVA 5EK9A 5CFWA 3HMHA 1WUMA 5ETBA 3FKMX 4HBYA 3ONIA 3UVYA 5FH6A 4NR7A 4AKNA 4QR4A 2DWWA 5LKZA 4C66A 3AQAA 4A9HA 3G0LA 5CUAA 5ACYA 4IR3A 2KTBB 3Q2EA 5COIA 4CFLA 3D7CA 4XY9A 2N9GA 4PCIA 5I7XA 1EQFA 5DFCA 4YBTA 5DYXA 3S91A 2RI7A 3U5NA 5D0CA 5DBMA 4A9EA 5G4RA 4QSTA 5CQ6A 5G4SA 3LXJA 5A81A 5I88A 5D3NA 4QC1A 5EQ1A 5LKTA 4LZSA 5D3TA 4HBXA 5CQ8A 4J1PA 1ZS5A 4BW4A 5DKHA 5D26A 5CUCA 5A82A 4MEQA 5HCLA 5HQ6A 5FE0A 5FG6A 4O78A 5HJCA 5I86A 4QSQA 5EGUA 4BW2A 5C4QA 3MQMA 4HXOA 5HLSA 4O75A 5BT4A 4UYGA 5C85A 3LQIA 3O33A 5DKDA 5I40A 5IGMA 3QZSA 5DLZA 5A83A 5I80A 2E3KA 3O35A 4O7AA 5DX4A 4A9LA 5ENBA 4QSWA 5CQAA 2YDWA 5EPRA 5EI4A 5CRMA 4PCEA 4A9MA 3U5OA 5CZGA 3GG3A 4YY6A 5LKUA 5E9KA 4NRBA 2RFJA 5IG6A 4Z1SA 4QC3A 3G0JA 5F2PA 4Z93A 5E73A 2GRCA 3JVKA 5IGLA 4E96A 4IOOA 5LVRA 5FH7A 4NR5A 5DW2A 4TZ8A 2WP2A 5CUDA 5IGKA 3UVWA 4UYFA 3MUKA 4IORA 4MENA 5E74A 5L97A 5EWCA 3K2JA 4NXJA 4QSVA 4A9JA 5AD2A 5AD3A 4ZQLA 4J0SA 4OUFA 5E9VA 4CUTA 4LYIA 3I3JA 5CQTA 2OO1A 4J0RA 4YATA 5ENEA 5IBNA 5FFWA 4MR3A 5D3PA 5EWDA 5A5PA 4LR6A 3P1CA 4NR6A 4NR8A 5C8GA 3IU6A 5EV9A 1WUGA 4CUPA 4QR3A 4CURA 4N4HA 4QEWA 5L99A 4A9NA 5F5ZA 3Q2FA 4UYHA 5IIDA 5BT5A 4ALGA 4KCXA 4YBMA 5DW1A 3IU5A 4MR4A 5DLXA 5CUGA 5II1A 5A5NA 1X0JA 4TT6A 5EP7A 5C89A 4QUUA 3U5MA 4HXMA 2DATA 4HXSA 4Q0OA 2D9EA 4YYGA 5EVAA 5CS8A 5J0DA 4PTBA 4QR5A 4WIVA 4XUBA 3SVFA 5H85A 4DONA 4YAXA 4TQNA 5CTLA 5D3SA 4QNSA 2R0YA 5E3DA 4YADA 4QBMA 5DY7A 4N3WA 4Z1QA 5II2A 5CUBA 5I29A 5L98A 5FE3A 4CFKA 5DKCA 5DFDA 4BHWA 4NYVA 3JVJA 5FE7A 5D7XA 3U5LA 4QSPA 4ZW1A 2DVRA 5LJ2A 5FE6A 4UYEA 4GPJA 5EISA 4A9IA 2F6NA 2R10A 5HFRA 3P1EA 4WHUA 4QYDA 4XYAA 4A9FA 4QSXA 4UIYA 5D3RA 4FLPA 2RO1A 2F6JA 4UIXA 4A9KA 5EWVA 4O72A 4UIUA 5DYAA 5FE4A 5A5OA 2NXBA 4TTEA 5HRXA 3LJWA 4LC2A 5CQ3A 5CRZA 4Q0NA 5CY9A 3U5JA 4KV1A 4O74A 2DVSA 2MJVB 2DVQA 5KO4A 2RNYA 3JVLA 2R0SA 5CPEA 5I83A 5D25A 5LKXA 1JSPB 4O7CA 5ENFA 5HQ7A 3ZYUA 5LVQA 3HMFA 3MB3A 2YEMA 5JWMA 4NUCA 5ENCA 5EM3A 5HRWA 4F3IA 4ZC9A 4NYXA 5D24A 4QSRA 3AADA 4QUTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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