4NR6A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an oxazepin ligand
Total Genus 42

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an oxazepin ligand
rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr6A00
4QBMA 5IG6A 2DVVA 2YEKA 3G0LA 4N4HA 5FFYA 3P5OA 2L84A 5FE8A 5JWMA 2E7NA 4QC1A 5CQ4A 4LYIA 5FFWA 3MB3A 4BHWA 5D3SA 4QR5A 5DY7A 5DYXA 2F6NA 4QYDA 5ENBA 4AKNA 5L8UA 4O72A 4HBXA 3O34A 2RI7A 4NR8A 3MQMA 4HXPA 4UYDA 5I88A 4Z6HA 4TZ2A 5D25A 4YYMA 5EP7A 4PCIA 5A7CA 4YYNA 5HLSA 5K29A 5CY9A 4O77A 5ENCA 2GRCA 5CQ8A 4QR3A 4CLBA 5HM0A 4YADA 5EPRA 5A81A 5FE5A 5KHMA 5HRXA 4IOQA 4NRAA 5LKUA 5CTLA 3D7CA 5H85A 4O75A 2E7OA 4UIWA 4HXMA 5DYCA 5F62A 2OUOA 5A83A 4UIUA 1X0JA 4LRGA 4WHWA 5E73A 1E6IA 4IR5A 4YYKA 1F68A 4O7FA 5AMFA 5EPBA 5I1QA 5I29A 4UIYA 2YDWA 4Z93A 5HRVA 5EU1A 2R0YA 5HQ6A 5C7NA 4MR5A 2YQDA 5L98A 4A9HA 5LUUA 3TLPA 5ACYA 4CUQA 4YABA 4CUPA 5IBNA 3AQAA 5LJ2A 5ENHA 5EI4A 4XUBA 4Z1SA 3P1DA 5HJCA 4XY9A 4J1PA 5EWVA 5C85A 5D0CA 2G4AA 4NYWA 5A82A 5J0DA 4O76A 5D3JA 3IU6A 5JI8A 4YC9A 4WHUA 5FE9A 5E3GA 4ALGA 3MB4A 4HXSA 5DYUA 3UW9A 3UV2A 5II2A 4YYGA 1EQFA 5COIA 5IGLA 5D3NA 4LZRA 4YAXA 4A9IA 5A5SA 5EM3A 5TB6A 4TS8A 4NUCA 4A9MA 3QZTA 4A9KA 4UYFA 4UYFB 4NQMA 3U5OA 2DWWA 4CURA 5EPSA 3UVYA 4LYWA 3ZYUA 2D9EA 5ENFA 4Q0NA 4O7CA 5E9MA 4HXKA 4QEWA 2R10A 3HMHA 4UIXA 4HXLA 5ETBA 3JVMA 4MR3A 5EWWA 4QEVA 5C87A 5D3RA 5FE4A 5G4RA 5EK9A 1WUGA 4QSRA 5F3AA 4KCXA 5CRZA 3LQHA 5EWCA 4PTBA 3IU5A 4MR4A 5FH8A 3P1CA 4HXOA 4TT6A 4QY4A 2I8NA 4TZ8A 4XY8A 4CUUA 4BW3A 4F3IA 4X2IA 5AMEA 5KTXA 3O37A 2DATA 2DVRA 5ENJA 5I7YA 2OSSA 4O7EA 2H60A 5DW1A 4LZSA 5F60A 5A5NA 5DYAA 4DONA 4HBWA 5HENA 4QUUA 5DBMA 1JSPB 5D3TA 2R0SA 5F2PA 5CP5A 3G0JA 2RS9B 4YK0A 5DKDA 5DFCA 5A5PA 5E9KA 4MEQA 3GG3A 5L99A 5I89A 3U5KA 4QUTA 4NXJA 2E3KA 4N4IA 3JVLA 1JM4B 5D3HA 4N3WA 5DLXA 4IORA 4Q0OA 4TQNA 5EWHA 5LJ0A 2MJVB 5D24A 4XYAA 5L8TA 2YELA 3JVKA 4BW2A 4NQNA 4TT4A 5F1HA 5E9YA 5L96A 4A9OA 5HFRA 5C4QA 5AD2A 5A5RA 4O7AA 3UVXA 5FG4A 4YYDA 5LKXA 5I86A 4TU6A 4O71A 4IR3A 4A9JA 4TU4A 4NR6A 5HCLA 2L85A 4PS5A 5FB1A 2WP1A 4A9LA 5CRMA 4A9FA 3SVFA 4NR7A 5CQ7A 5DFBA 5LVQA 4QSQA 5CQAA 2NXBA 5H1TA 3QZVA 5F36A 3P1FA 4NYVA 5CUCA 4C67A 5H1UA 3LQJA 3S91A 4UIZA 4QSSA 5E0RA 4FLPA 3K2JA 2YYNA 4IOOA 4KV1A 4E96A 3S92A 3LJWA 1N72A 5FE0A 4YY6A 5HELA 3I3JA 4UIVA 5C8GA 5CQTA 5FFVA 5CS8A 5BT4A 4UITA 4YYHA 4QSUA 3LQIA 5HQ5A 4PCEA 2WP2A 3FKMX 3UVWA 5D26A 5F25A 5LJ1A 4NS5A 4QSPA 4J3IA 4CFLA 5I40A 5FH6A 4QSWA 5KTUA 3U5MA 4QZSA 4QEUA 3UV5A 4QNSA 4O74A 4A9NA 5DLZA 3SVGA 4O70A 5ENEA 5CUAA 4QC3A 5KU3A 4QSVA 5FB0A 5CUBA 4UYEA 3NXBA 4YH3A 3UV4A 5CPEA 4NYXA 2RO1A 3MXFA 5D7XA 4J0SA 5LVRA 4QYLA 5DKCA 3U5PA 2DVSA 5FE2A 4ZQLA 4CUTA 5FDZA 2KTBB 2FSAA 5FBXA 4YBTA 2N9GA 5F1LA 5E9VA 5FE1A 5DW2A 4QR4A 5F63A 1ZS5A 4HBVA 2L5EA 5ETDA 5ENGA 5CQ3A 5IGKA 5AD3A 2LSPB 4HXNA 3JVJA 4A9EA 5H1VA 5EWDA 4YY4A 5II1A 5CU8A 4YBSA 4KV4A 5TCMA 4BW1A 5I83A 4PY6A 5LKZA 4O78A 5HFQA 3U5NA 4NRCA 5ENIA 2DVQA 4N4GA 3HMFA 4NUEA 5HQ7A 3O33A 4QSTA 5DX4A 5EQ1A 5FE6A 5D3LA 5CZGA 2RNYA 4QB3A 4C66A 5C89A 2RNWA 4TT2A 5CUEA 2YW5A 5A5QA 5DFDA 4YATA 4OGJA 4XUAA 4CFKA 5E7DA 5FG6A 4IR6A 5E9IA 5FE3A 4MR6A 4LC2A 3P1EA 5EICA 5CFWA 5BT3A 2R0VA 4NR4A 4J0RA 4YBMA 4LYSA 4TYLA 4NUDA 1WUMA 4HXRA 2RNXA 4BW4A 5CUDA 3Q2FA 4MEPA 5A85A 5LKTA 2I7KA 4ALHA 5IIDA 5F5ZA 4MEOA 4WIVA 3ONIA 4Y03A 4N4FA 4RVRA 4NRBA 4MENA 5CUGA 4Z1QA 5KO4A 3HMEA 4NR9A 2RFJA 2D82A 5E9LA 4GPJA 5L97A 4YYJA 5IGNA 3LXJA 2F6JA 5E74A 5EVAA 5FG5A 5G4SA 4BJXA 4YYIA 4OGIA 3MULA 4ZW1A 3U5JA 4UYHA 5EV9A 5IGMA 5CQ6A 5EA1A 5I80A 2OO1A 5KTWA 4QSXA 5A5OA 3DWYA 3MUKA 3Q2EA 3QZSA 4IR4A 3RCWA 4TTEA 5EISA 4O7BA 5CQ5A 5I7XA 3O36A 5DKHA 4PKLA 5E3DA 4UYGA 3UVDA 4CL9A 2YEMA 5EGUA 5F61A 4OUFA 5BT5A 4LR6A 4LZ2A 4YH4A 3AADA 5HEMA 5FE7A 5CGPA 5FH7A 5D3PA 3U5LA 4CUSA 3O35A 3SVHA 4NR5A 4ZC9A 3DAIA 4LDFA 5HRWA 4HBYA 4Z6IA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QBMA 5IG6A 2DVVA 2YEKA 3G0LA 4N4HA 5FFYA 3P5OA 2L84A 5FE8A 5JWMA 2E7NA 4QC1A 5CQ4A 4LYIA 5FFWA 4AKHA 3MB3A 2EJNA 4BHWA 5D3SA 4QR5A 5DY7A 5DYXA 2F6NA 4QYDA 5ENBA 4AKNA 5L8UA 4O72A 4HBXA 3O34A 2RI7A 4NR8A 3MQMA 4HXPA 4UYDA 5I88A 4Z6HA 4TZ2A 5D25A 4YYMA 5EP7A 4PCIA 5A7CA 4YYNA 5HLSA 5K29A 5CY9A 1ZKRA 4O77A 5ENCA 2GRCA 5CQ8A 4QR3A 4CLBA 5HM0A 4YADA 5EPRA 5A81A 5FE5A 5KHMA 5HRXA 4IOQA 4NRAA 5LKUA 5CTLA 3D7CA 5H85A 4O75A 2E7OA 4UIWA 4HXMA 5DYCA 5F62A 2OUOA 5A83A 4UIUA 1X0JA 4LRGA 4WHWA 5E73A 1E6IA 4IR5A 4YYKA 1F68A 4O7FA 5AMFA 5EPBA 5I1QA 5I29A 4UIYA 2YDWA 4Z93A 5HRVA 5EU1A 2R0YA 5HQ6A 5C7NA 4MR5A 2YQDA 5L98A 4A9HA 5LUUA 3TLPA 5ACYA 4CUQA 4YABA 4CUPA 5IBNA 3AQAA 5LJ2A 5ENHA 5EI4A 4XUBA 4Z1SA 3P1DA 5HJCA 4XY9A 4J1PA 5EWVA 5C85A 5D0CA 2G4AA 4NYWA 5A82A 5J0DA 4O76A 5D3JA 3IU6A 5JI8A 4YC9A 4WHUA 5FE9A 5E3GA 4ALGA 3MB4A 4HXSA 5DYUA 3UW9A 3UV2A 5II2A 4YYGA 1EQFA 5COIA 5IGLA 5D3NA 4LZRA 4YAXA 4A9IA 5A5SA 5EM3A 5TB6A 4TS8A 4NUCA 4A9MA 3QZTA 4A9KA 4UYFA 4UYFB 4NQMA 3U5OA 2DWWA 4CURA 5EPSA 3UVYA 4LYWA 3ZYUA 2D9EA 5ENFA 4Q0NA 4O7CA 5E9MA 4HXKA 4QEWA 2R10A 3HMHA 4UIXA 4HXLA 5ETBA 3JVMA 4MR3A 5EWWA 4QEVA 5C87A 5D3RA 5FE4A 5G4RA 5EK9A 1WUGA 4QSRA 5F3AA 4KCXA 5CRZA 3LQHA 5EWCA 4PTBA 3IU5A 4MR4A 5FH8A 3P1CA 4HXOA 4TT6A 4QY4A 2I8NA 4TZ8A 4XY8A 4CUUA 3D1BA 4BW3A 4F3IA 4X2IA 5AMEA 5KTXA 3O37A 2DATA 2DVRA 5ENJA 5I7YA 2OSSA 4O7EA 2H60A 5DW1A 4LZSA 5F60A 5A5NA 5DYAA 4DONA 4HBWA 5HENA 4QUUA 5DBMA 1JSPB 5D3TA 2R0SA 5F2PA 5CP5A 3G0JA 3VKHA 2RS9B 4YK0A 5DKDA 5DFCA 5A5PA 5E9KA 4MEQA 3GG3A 5L99A 5I89A 3U5KA 4QUTA 4NXJA 2E3KA 4N4IA 3JVLA 1JM4B 5D3HA 4N3WA 5DLXA 4IORA 4Q0OA 4TQNA 5EWHA 5LJ0A 2MJVB 5D24A 4XYAA 5L8TA 2YELA 3JVKA 4BW2A 4NQNA 4TT4A 5F1HA 5E9YA 5L96A 4A9OA 5HFRA 5C4QA 5AD2A 5A5RA 4O7AA 3UVXA 5FG4A 4YYDA 5LKXA 5I86A 4TU6A 4O71A 4IR3A 4A9JA 4TU4A 4NR6A 5HCLA 2L85A 4PS5A 5FB1A 2WP1A 4A9LA 5CRMA 4A9FA 3SVFA 4NR7A 5CQ7A 5DFBA 5LVQA 4QSQA 5CQAA 2NXBA 5H1TA 3QZVA 5F36A 3P1FA 4NYVA 5CUCA 4C67A 5H1UA 3LQJA 3S91A 4UIZA 1PUOA 4QSSA 5E0RA 4FLPA 3K2JA 2YYNA 4IOOA 4KV1A 4E96A 3S92A 3LJWA 1N72A 5FE0A 3D1DA 4YY6A 5HELA 3I3JA 4UIVA 5C8GA 5CQTA 5FFVA 5CS8A 5BT4A 4UITA 4YYHA 4QSUA 3LQIA 5HQ5A 4PCEA 2WP2A 3FKMX 3UVWA 5D26A 5F25A 5LJ1A 4NS5A 4QSPA 4J3IA 4CFLA 5I40A 5FH6A 4QSWA 5KTUA 3U5MA 4QZSA 4AI6A 4QEUA 3UV5A 4QNSA 4O74A 4A9NA 5DLZA 3SVGA 4O70A 5ENEA 5CUAA 4QC3A 5KU3A 4QSVA 5FB0A 5CUBA 4UYEA 3NXBA 4YH3A 3UV4A 5CPEA 4NYXA 2RO1A 3MXFA 5D7XA 4J0SA 5LVRA 4QYLA 5DKCA 3U5PA 4AKIA 2DVSA 5FE2A 4ZQLA 4CUTA 5FDZA 4AKGA 2KTBB 2FSAA 5FBXA 4YBTA 2N9GA 5F1LA 5E9VA 5FE1A 5DW2A 4QR4A 5F63A 1ZS5A 4HBVA 2L5EA 5ETDA 5ENGA 5CQ3A 5IGKA 5AD3A 2LSPB 3VKGA 4HXNA 3JVJA 4A9EA 5H1VA 5EWDA 4YY4A 5II1A 5CU8A 4YBSA 4KV4A 5TCMA 4BW1A 5I83A 4PY6A 5LKZA 4O78A 5HFQA 3U5NA 4NRCA 5ENIA 2DVQA 4N4GA 3HMFA 4NUEA 5HQ7A 3O33A 4QSTA 5DX4A 5EQ1A 5FE6A 5D3LA 5CZGA 2RNYA 4QB3A 4C66A 5C89A 2RNWA 4TT2A 5CUEA 2YW5A 5A5QA 4YATA 5DFDA 4OGJA 4XUAA 4CFKA 5E7DA 5FG6A 4IR6A 5E9IA 5FE3A 4MR6A 4LC2A 3P1EA 5EICA 5CFWA 5BT3A 2R0VA 4NR4A 4J0RA 4YBMA 4LYSA 4TYLA 4NUDA 1WUMA 4HXRA 2RNXA 4BW4A 5CUDA 3Q2FA 4MEPA 5A85A 5LKTA 2I7KA 4ALHA 5IIDA 5F5ZA 4MEOA 4WIVA 3ONIA 4Y03A 4N4FA 4RVRA 4NRBA 4MENA 5CUGA 4Z1QA 5KO4A 3HMEA 4NR9A 2RFJA 2D82A 5E9LA 4GPJA 5L97A 4YYJA 5IGNA 3LXJA 2F6JA 5E74A 5EVAA 5FG5A 5G4SA 4BJXA 4YYIA 4OGIA 3MULA 4ZW1A 3U5JA 4UYHA 5EV9A 5IGMA 5CQ6A 5EA1A 5I80A 2OO1A 5KTWA 4QSXA 5A5OA 3DWYA 3MUKA 3Q2EA 3QZSA 4IR4A 3RCWA 4TTEA 5EISA 4O7BA 5CQ5A 5I7XA 3O36A 5DKHA 4PKLA 5E3DA 4UYGA 3UVDA 4CL9A 2YEMA 5EGUA 5F61A 4OUFA 5BT5A 4LR6A 4LZ2A 4YH4A 3AADA 5HEMA 5FE7A 5CGPA 5FH7A 5D3PA 3U5LA 4CUSA 3O35A 3SVHA 4NR5A 3ERRA 4ZC9A 3DAIA 4LDFA 5HRWA 4HBYA 4Z6IA 2DKWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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