4NR7A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr7A00
5CU8A 5I40A 3MQMA 5E3DA 3P5OA 5I89A 3U5OA 5FDZA 4A9MA 4YABA 3UV4A 4Z6HA 4Z1QA 4NR5A 5ETDA 5HQ6A 5AD3A 5CQ8A 5LKUA 5EWCA 4KV1A 4Z6IA 5DKCA 4WHWA 5EM3A 4YYDA 3JVLA 4WIVA 5CUEA 5HM0A 2GRCA 2MJVB 5EWDA 5CFWA 3P1DA 4LZSA 4QEWA 4CUSA 4YY6A 3G0LA 5FH7A 4HBVA 4YBTA 3UW9A 4UITA 5FG4A 2RS9B 5L99A 4BHWA 2OO1A 5EPRA 5FE5A 4CLBA 2L84A 2YELA 4LZ2A 4E96A 4OGIA 3SVFA 5DLXA 5A5RA 5F60A 2DVSA 4HXMA 4NUEA 5J0DA 5H1VA 5LKZA 5ENEA 5CS8A 5EU1A 4QB3A 4CL9A 4QC1A 5H85A 4TQNA 4N3WA 4MEPA 4NYVA 5ENFA 2DVQA 2R0YA 4YBSA 5C4QA 3LQJA 4IR5A 4QSWA 3RCWA 4CURA 5LVRA 3UVYA 4TZ8A 5EV9A 3D7CA 4HBYA 5DW2A 5HJCA 5A85A 4O70A 4HXSA 4HBXA 4MENA 4N4IA 4LYSA 5F62A 5ACYA 5EWWA 5D3HA 3NXBA 4UIZA 4QC3A 4QYLA 4UYHA 5DFDA 4IR6A 4PCIA 4ZC9A 5E9KA 4TT6A 3U5MA 5EPBA 5FB1A 5BT5A 5DLZA 5CQ3A 5E73A 4O74A 2F6JA 4NXJA 3MULA 4IOOA 4UYGA 4PS5A 5ENIA 5I88A 5D0CA 4HXLA 4O78A 5FH6A 5BT3A 5LJ2A 5D3SA 5CRZA 4Y03A 4TZ2A 5F1HA 4CFKA 5ENGA 3UV5A 2D9EA 4N4HA 4UYFA 5DYAA 4A9NA 4A9IA 2FSAA 3QZTA 3HMHA 4MR4A 5A5NA 5BT4A 4QR5A 2DATA 2E7OA 1F68A 4Q0NA 4NUCA 4UYFB 3IU5A 4BW1A 4MEOA 4QY4A 5ENJA 3LQHA 4LR6A 5I83A 4N4FA 3ZYUA 5F25A 5A5SA 5HEMA 2R0SA 5FB0A 2G4AA 5HRWA 5HENA 2L5EA 2RO1A 3QZSA 2RI7A 4HXRA 5EPSA 4YBMA 4NRBA 3IU6A 3QZVA 2WP2A 4RVRA 5DFCA 2OUOA 5CPEA 4QSUA 1WUMA 5EVAA 5HLSA 5CUCA 4MR6A 4NRCA 5H1UA 5A5OA 5HFQA 4J0SA 4QR3A 5CGPA 4ZW1A 3O35A 2YEMA 4OUFA 5L8TA 1JSPB 5COIA 5LJ1A 3Q2EA 4O7CA 4A9KA 1WUGA 4KV4A 4PTBA 4DONA 5KHMA 5HQ5A 5KTXA 5F5ZA 3UVDA 5FE0A 5IGKA 5JWMA 3LJWA 5CUDA 5CRMA 4YK0A 5IIDA 5C7NA 4A9FA 4YYIA 3SVHA 5KO4A 5E74A 4TU4A 5F2PA 5D3RA 3SVGA 2I8NA 4Z93A 5ETBA 2YEKA 5EISA 5ENHA 5FE4A 5CZGA 5DKDA 5FBXA 2DVVA 2WP1A 3UVWA 5E7DA 2RNXA 5A83A 5D25A 5IBNA 5C87A 4QZSA 3O36A 2NXBA 5DW1A 5AMFA 4O7EA 2N9GA 5E9YA 5LKTA 3LQIA 5FG5A 5HRVA 1E6IA 3DAIA 2I7KA 5CQ5A 4J0RA 5LJ0A 5HCLA 2F6NA 2E3KA 5ENCA 4J3IA 4TU6A 3FKMX 5D24A 5CQ6A 3GG3A 4MR5A 4J1PA 4NR4A 4AKNA 4C67A 4WHUA 4O76A 5I29A 4YYNA 5DX4A 4OGJA 5D26A 4Z1SA 3I3JA 5KTUA 2R10A 4YYKA 4O75A 5CUGA 3AQAA 4XUAA 5L96A 5AMEA 3LXJA 5C89A 4ALHA 4NRAA 2RNYA 4QEUA 4BW3A 5D3PA 4HXKA 4QNSA 5C85A 2D82A 3P1FA 2R0VA 3O34A 1X0JA 5HFRA 5II2A 2DWWA 5D3JA 4YYHA 4ZQLA 4A9JA 4HXNA 2H60A 5ENBA 3HMEA 5DY7A 4XYAA 3UV2A 5CQ4A 4KCXA 4LDFA 5EWHA 5IGLA 4CFLA 4A9LA 5CP5A 3U5PA 4YC9A 4QEVA 1N72A 5H1TA 3MUKA 4YY4A 4QSSA 4QSRA 2DVRA 5F36A 3UVXA 5FE9A 4XY8A 3G0JA 5FE1A 2OSSA 2L85A 3U5NA 5CTLA 5DYCA 5IGNA 3MB3A 3MB4A 5L98A 4HXOA 1ZS5A 3K2JA 4ALGA 5F1LA 5IG6A 5EP7A 5A5PA 3ONIA 4PKLA 5E9LA 5KTWA 4NR6A 5D3NA 5IGMA 4NS5A 5KU3A 5E3GA 5E0RA 2RFJA 4NYXA 4O77A 4QUUA 4YAXA 5F3AA 5A81A 5K29A 3Q2FA 4TT4A 5CQ7A 3P1EA 5HQ7A 3U5KA 4CUUA 3HMFA 4LC2A 4NUDA 5G4SA 5CY9A 5TCMA 1JM4B 2LSPB 4QBMA 3TLPA 4YYGA 4CUTA 4QYDA 5CUBA 3JVJA 5DFBA 5G4RA 5FE6A 4O7AA 5II1A 4NR7A 3S91A 4FLPA 5FH8A 5FFVA 3O33A 5AD2A 5D3LA 5FE7A 4UIWA 4A9HA 4NQNA 5C8GA 4PY6A 5E9VA 4NR9A 4QSXA 4QR4A 5D7XA 4TT2A 4UIXA 5F61A 5LUUA 4A9OA 3DWYA 5EGUA 5FE3A 5E9IA 4UYDA 5EK9A 4YH3A 4YYMA 5EWVA 5A82A 5I7YA 5L8UA 4QSVA 4O7BA 5I1QA 4UIVA 4CUPA 4IOQA 4QSQA 4PCEA 4TS8A 4IR3A 3P1CA 4LZRA 5DYUA 5DBMA 5EQ1A 5LVQA 5LKXA 4NYWA 5A7CA 5F63A 4NR8A 5CQAA 3JVKA 2YYNA 4A9EA 5I86A 4UIUA 2YW5A 5CUAA 4NQMA 4QSTA 4XUBA 5JI8A 3S92A 4LRGA 4Q0OA 4BW4A 5EA1A 5I7XA 1EQFA 3U5JA 4N4GA 5FFWA 2KTBB 2YQDA 5D3TA 2RNWA 4QSPA 4F3IA 4C66A 2DKWA 4IR4A 5FE8A 4QUTA 4BJXA 4MEQA 4UYEA 3O37A 5L97A 4LYWA 4MR3A 4HXPA 4O71A 4HBWA 4YADA 5DYXA 4CUQA 4LYIA 5A5QA 5HRXA 3JVMA 4IORA 3MXFA 4YYJA 5FG6A 5I80A 4BW2A 4TTEA 4X2IA 4YH4A 4GPJA 5HELA 4O7FA 5E9MA 4YATA 5CQTA 5TB6A 5FE2A 4UIYA 2E7NA 3AADA 4XY9A 5DKHA 5EI4A 5FFYA 5EICA 2YDWA 4TYLA 3U5LA 4O72A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CU8A 5I40A 3MQMA 5E3DA 3P5OA 5I89A 3U5OA 5FDZA 4A9MA 4YABA 3UV4A 4Z6HA 4Z1QA 4NR5A 5ETDA 5HQ6A 5AD3A 5CQ8A 5LKUA 5EWCA 4KV1A 4Z6IA 5DKCA 4WHWA 5EM3A 4YYDA 3JVLA 4WIVA 5CUEA 5HM0A 2GRCA 2MJVB 5EWDA 5CFWA 3P1DA 4LZSA 4QEWA 4CUSA 4YY6A 3G0LA 5FH7A 4HBVA 4YBTA 3UW9A 4UITA 5FG4A 2RS9B 5L99A 4BHWA 2OO1A 5EPRA 5FE5A 4CLBA 2L84A 2YELA 4LZ2A 4E96A 4OGIA 3SVFA 5DLXA 5A5RA 5F60A 2DVSA 4HXMA 4NUEA 5J0DA 5H1VA 5LKZA 5ENEA 5CS8A 5EU1A 4QB3A 4CL9A 4QC1A 5H85A 4TQNA 4N3WA 4MEPA 4NYVA 5ENFA 2DVQA 2R0YA 4YBSA 5C4QA 3LQJA 4IR5A 4QSWA 3RCWA 4CURA 5LVRA 4AKHA 3UVYA 4TZ8A 5EV9A 3D7CA 4HBYA 5DW2A 5HJCA 5A85A 4O70A 4HXSA 4HBXA 4MENA 4N4IA 4LYSA 5F62A 5ACYA 5EWWA 5D3HA 3NXBA 4UIZA 4QC3A 4QYLA 4UYHA 5DFDA 4IR6A 4PCIA 4ZC9A 5E9KA 4TT6A 3U5MA 5EPBA 5FB1A 5BT5A 5DLZA 5CQ3A 5E73A 4O74A 2F6JA 4NXJA 3MULA 4IOOA 4UYGA 4PS5A 5ENIA 5I88A 5D0CA 4HXLA 4O78A 5FH6A 5BT3A 5LJ2A 5D3SA 5CRZA 4Y03A 4TZ2A 5F1HA 4CFKA 5ENGA 3UV5A 2D9EA 4N4HA 4UYFA 5DYAA 4A9NA 4A9IA 2FSAA 3QZTA 3HMHA 4MR4A 2EJNA 5A5NA 5BT4A 4QR5A 2DATA 2E7OA 1F68A 4Q0NA 4NUCA 4UYFB 3IU5A 4BW1A 4MEOA 4QY4A 5ENJA 3LQHA 4LR6A 5I83A 4N4FA 3ZYUA 5F25A 5A5SA 5HEMA 2R0SA 5FB0A 2G4AA 5HRWA 5HENA 2L5EA 2RO1A 3QZSA 2RI7A 4HXRA 5EPSA 4YBMA 4NRBA 3IU6A 3QZVA 2WP2A 4RVRA 5DFCA 2OUOA 5CPEA 4QSUA 1WUMA 5EVAA 5HLSA 5CUCA 4MR6A 4NRCA 5H1UA 5A5OA 5HFQA 4J0SA 4QR3A 5CGPA 4ZW1A 3O35A 2YEMA 4OUFA 5L8TA 1JSPB 5COIA 5LJ1A 3Q2EA 4O7CA 4A9KA 1WUGA 4KV4A 4PTBA 4DONA 5KHMA 5HQ5A 5KTXA 5F5ZA 3UVDA 5FE0A 5IGKA 5JWMA 3LJWA 4AI6A 5CUDA 5CRMA 4YK0A 5IIDA 5C7NA 4A9FA 4YYIA 3SVHA 5KO4A 5E74A 4TU4A 5F2PA 5D3RA 3SVGA 2I8NA 4Z93A 5ETBA 2YEKA 5EISA 5ENHA 5FE4A 5CZGA 5DKDA 5FBXA 2DVVA 2WP1A 3UVWA 5E7DA 2RNXA 5A83A 5D25A 5IBNA 5C87A 4QZSA 3O36A 2NXBA 5DW1A 5AMFA 4O7EA 2N9GA 5E9YA 5LKTA 3LQIA 5FG5A 5HRVA 1E6IA 3DAIA 2I7KA 5CQ5A 4J0RA 5LJ0A 5HCLA 2F6NA 2E3KA 5ENCA 4J3IA 4TU6A 3FKMX 5D24A 5CQ6A 3GG3A 4MR5A 4J1PA 4NR4A 4AKNA 4C67A 4WHUA 4O76A 5I29A 3D1BA 4YYNA 5DX4A 4OGJA 5D26A 4Z1SA 3I3JA 5KTUA 2R10A 4YYKA 4O75A 5CUGA 3AQAA 4XUAA 5L96A 5AMEA 3LXJA 5C89A 4ALHA 4NRAA 2RNYA 4QEUA 4BW3A 5D3PA 4HXKA 4QNSA 5C85A 3VKGA 2D82A 3P1FA 2R0VA 3O34A 1X0JA 5HFRA 5II2A 2DWWA 5D3JA 4YYHA 4ZQLA 4A9JA 4HXNA 2H60A 5ENBA 3HMEA 5DY7A 4XYAA 3UV2A 5CQ4A 4KCXA 4LDFA 1PUOA 5EWHA 5IGLA 4CFLA 4A9LA 5CP5A 3U5PA 4YC9A 4QEVA 1N72A 5H1TA 3D1DA 3MUKA 4YY4A 4QSSA 4QSRA 2DVRA 5F36A 3UVXA 5FE9A 4XY8A 3G0JA 5FE1A 2OSSA 2L85A 3U5NA 5CTLA 5DYCA 5IGNA 3MB3A 3MB4A 5L98A 4HXOA 1ZS5A 3K2JA 4ALGA 5F1LA 5IG6A 5EP7A 5A5PA 3ONIA 4PKLA 5E9LA 5KTWA 4NR6A 5D3NA 5IGMA 4NS5A 5KU3A 5E3GA 5E0RA 2RFJA 4NYXA 4O77A 4QUUA 4YAXA 5F3AA 5A81A 5K29A 3Q2FA 4TT4A 5CQ7A 3P1EA 5HQ7A 3U5KA 4CUUA 3HMFA 4LC2A 4NUDA 5G4SA 5CY9A 5TCMA 1JM4B 2LSPB 4QBMA 3TLPA 4YYGA 4CUTA 4QYDA 5CUBA 3JVJA 5DFBA 5G4RA 5FE6A 4O7AA 5II1A 4NR7A 3S91A 4FLPA 5FH8A 3ERRA 5FFVA 3O33A 5AD2A 5D3LA 5FE7A 4UIWA 4A9HA 4NQNA 5C8GA 4PY6A 5E9VA 4NR9A 4QSXA 4QR4A 5D7XA 4TT2A 4UIXA 5F61A 5LUUA 4A9OA 3DWYA 5EGUA 5FE3A 5E9IA 4UYDA 5EK9A 4YH3A 4YYMA 5EWVA 5A82A 5I7YA 5L8UA 4QSVA 4O7BA 5I1QA 4UIVA 4CUPA 4IOQA 4QSQA 4PCEA 4TS8A 4IR3A 3P1CA 4LZRA 5DYUA 5DBMA 5EQ1A 5LVQA 5LKXA 4NYWA 5A7CA 5F63A 4NR8A 5CQAA 3JVKA 2YYNA 4A9EA 5I86A 4UIUA 4AKIA 2YW5A 5CUAA 4NQMA 4QSTA 4XUBA 5JI8A 3S92A 4LRGA 4Q0OA 4BW4A 5EA1A 5I7XA 1EQFA 3U5JA 4N4GA 5FFWA 2KTBB 2YQDA 5D3TA 2RNWA 4QSPA 4F3IA 4C66A 2DKWA 4IR4A 5FE8A 4QUTA 4BJXA 4MEQA 4UYEA 3O37A 5L97A 4LYWA 4MR3A 4HXPA 4O71A 4HBWA 4YADA 5DYXA 4CUQA 4LYIA 5A5QA 5HRXA 3JVMA 4IORA 3MXFA 4YYJA 5FG6A 3VKHA 5I80A 4BW2A 4TTEA 4X2IA 4YH4A 4GPJA 5HELA 4O7FA 1ZKRA 5E9MA 4YATA 5CQTA 5TB6A 5FE2A 4UIYA 2E7NA 3AADA 4XY9A 4AKGA 5DKHA 5EI4A 5FFYA 5EICA 2YDWA 4TYLA 3U5LA 4O72A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5CU8 A;  5I40 A;  3MQM A;  5E3D A;  3P5O A;  5I89 A;  3U5O A;  5FDZ A;  4A9M A;  4YAB A;  3UV4 A;  4Z6H A;  4Z1Q A;  4NR5 A;  5ETD A;  5HQ6 A;  5AD3 A;  5CQ8 A;  5LKU A;  5EWC A;  4KV1 A;  4Z6I A;  5DKC A;  4WHW A;  5EM3 A;  4YYD A;  3JVL A;  4WIV A;  5CUE A;  5HM0 A;  2GRC A;  2MJV B;  5EWD A;  5CFW A;  3P1D A;  4LZS A;  4QEW A;  4CUS A;  4YY6 A;  3G0L A;  5FH7 A;  4HBV A;  4YBT A;  3UW9 A;  4UIT A;  5FG4 A;  2RS9 B;  5L99 A;  4BHW A;  2OO1 A;  5EPR A;  5FE5 A;  4CLB A;  2L84 A;  2YEL A;  4LZ2 A;  4E96 A;  4OGI A;  3SVF A;  5DLX A;  5A5R A;  5F60 A;  2DVS A;  4HXM A;  4NUE A;  5J0D A;  5H1V A;  5LKZ A;  5ENE A;  5CS8 A;  5EU1 A;  4QB3 A;  4CL9 A;  4QC1 A;  5H85 A;  4TQN A;  4N3W A;  4MEP A;  4NYV A;  5ENF A;  2DVQ A;  2R0Y A;  4YBS A;  5C4Q A;  3LQJ A;  4IR5 A;  4QSW A;  3RCW A;  4CUR A;  5LVR A;  3UVY A;  4TZ8 A;  5EV9 A;  3D7C A;  4HBY A;  5DW2 A;  5HJC A;  5A85 A;  4O70 A;  4HXS A;  4HBX A;  4MEN A;  4N4I A;  4LYS A;  5F62 A;  5ACY A;  5EWW A;  5D3H A;  3NXB A;  4UIZ A;  4QC3 A;  4QYL A; 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