4NR7A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
KKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the bromodomain of human CREBBP in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CREB-binding protein
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nr7A00
3P1EA 5L8UA 5I89A 3MXFA 1X0JA 5I88A 2YELA 2WP1A 3FKMX 5FB1A 4YBSA 5EISA 5F3AA 4O72A 5CQ5A 5FFYA 5EK9A 5LJ1A 4QSRA 2F6NA 5CQ7A 4UYGA 4LC2A 4CL9A 4PKLA 4PS5A 3JVKA 5ENEA 5I7YA 2DATA 4PCEA 5F1LA 5E9LA 2R10A 4QSTA 4MR3A 4A9OA 5IIDA 5FE0A 5F60A 4O74A 5EWCA 5DX4A 4IOQA 2YW5A 5G4RA 2RO1A 4TU4A 4A9LA 5A83A 5FE4A 5HELA 4YYJA 5LKUA 4BW3A 4IR6A 5EWWA 5EA1A 4YK0A 4J0RA 4PY6A 5ENBA 4XYAA 5HFRA 4OGIA 5H1TA 5JWMA 4NRBA 4LDFA 2F6JA 4OUFA 5A82A 5DFCA 3MB3A 5DLXA 4RVRA 3U5NA 2DVVA 5CUAA 5CRMA 4HBYA 5CPEA 5L98A 5F61A 5HENA 4QNSA 4UYFA 4HBXA 5C8GA 5DFBA 2H60A 2E3KA 5HM0A 4BW2A 5D25A 5FFVA 5EV9A 3UVXA 5FE6A 3SVHA 5JI8A 4Z93A 4ALHA 1F68A 4HXOA 4O70A 3U5MA 4ZC9A 5CP5A 3GG3A 4UYFB 3QZVA 2G4AA 4UIZA 3DAIA 5I1QA 4FLPA 4CUTA 4QSUA 3O33A 5H85A 5FG6A 3O34A 5FFWA 3O36A 4YYDA 3D7CA 4NYXA 4UYDA 4NRCA 5CQTA 5A5OA 4XY8A 5A7CA 5HRVA 5D3JA 4TU6A 3RCWA 5ENHA 2YEKA 5DYUA 2OSSA 4O71A 4HXMA 4PCIA 5CGPA 4YYNA 5EM3A 4Z1SA 5AMEA 5I86A 3IU5A 4QY4A 4IR3A 4QR3A 4DONA 5FH8A 2D82A 5EWHA 5A5NA 3S92A 5CS8A 5DFDA 4LZSA 1ZS5A 4J1PA 4UIUA 4QYDA 3P1DA 5LKXA 4LYSA 4NR8A 4E96A 5A85A 4O7CA 5LJ0A 2KTBB 4UIXA 3U5PA 3HMEA 3K2JA 4N4FA 4QUUA 4TT4A 4NUDA 5I40A 4TZ2A 5EPSA 5HRXA 5D3LA 2RI7A 5D3SA 4HXNA 5L97A 5HRWA 4LRGA 4IORA 4BW4A 4Z1QA 5ENCA 4WHWA 5IGMA 5A5PA 5I83A 5EU1A 4CURA 5EQ1A 4QB3A 4A9IA 5D3HA 2RNXA 4XUAA 5LJ2A 5DW1A 4NR9A 4CUUA 5FE8A 4YBMA 4YYKA 5D3NA 5HLSA 2R0VA 3NXBA 5COIA 5I80A 5D3TA 5FE2A 4HBVA 4YC9A 4ZW1A 4ALGA 4X2IA 2I7KA 5FG4A 5CFWA 5AMFA 5IG6A 5E9KA 4O76A 3G0LA 5CQAA 4YATA 3ONIA 2N9GA 4O7FA 5HQ7A 4XY9A 5C89A 3I3JA 5FE5A 4MEPA 5LUUA 2L85A 5H1UA 4Z6HA 4TYLA 2GRCA 5DY7A 5DYXA 5EWDA 4TZ8A 4NXJA 3SVFA 5EICA 4LZ2A 4UIVA 5EWVA 5DYAA 2RNYA 3LXJA 4PTBA 4UIWA 3LQHA 4MR6A 5LVRA 5IBNA 5F1HA 5D0CA 4QC3A 3UV5A 3MB4A 5EI4A 5KTXA 3AQAA 4CFKA 5C87A 3HMFA 5CUEA 5E74A 3Q2FA 3LQIA 5HEMA 3S91A 1WUMA 4QBMA 4IOOA 1N72A 3Q2EA 4NYWA 4WHUA 5F36A 4HXRA 5FB0A 3LJWA 2E7OA 2RNWA 4F3IA 4QR5A 4MEOA 5A5SA 4UIYA 3LQJA 4QSVA 4MEQA 4KV1A 5ETBA 5F63A 5CTLA 4TT6A 4NUEA 4WIVA 4CLBA 4QSWA 5E9YA 4QZSA 5DKCA 3MQMA 2YYNA 5CUDA 4TTEA 2OUOA 2WP2A 3TLPA 5ENFA 5C7NA 2RFJA 5DKHA 5E9IA 4TT2A 5EGUA 5I7XA 4NR7A 4Z6IA 4OGJA 5CUBA 4YYGA 3UVDA 3HMHA 5A81A 1WUGA 5I29A 5ETDA 4YYHA 4NR6A 3G0JA 3O37A 4N4HA 3UV4A 5IGLA 2E7NA 2DVSA 4CFLA 5FE3A 5LKTA 2L84A 4AKNA 4O7AA 5CQ6A 4CUPA 3U5JA 3P5OA 4NYVA 5AD2A 4C67A 5DLZA 1JSPB 4QYLA 3DWYA 3P1CA 4TQNA 4CUQA 2DVQA 2R0SA 4A9EA 4Q0OA 4KCXA 4QSXA 3P1FA 5HJCA 4UYHA 4YY4A 5KHMA 5IGNA 4QEUA 5EP7A 5FBXA 5BT3A 4QEWA 5C4QA 4HXSA 4YH3A 3UV2A 5F62A 5EPRA 4QR4A 5A5RA 1E6IA 5H1VA 4QC1A 5II1A 5D24A 4A9JA 4N3WA 2YDWA 4QSQA 5E73A 5FE1A 5E9VA 4O75A 4XUBA 5EPBA 5HQ5A 5L8TA 5KO4A 5CQ4A 5EVAA 5CQ8A 4NR4A 5HQ6A 3JVJA 5CQ3A 5D26A 5CUGA 5BT4A 5ENJA 4A9KA 5FH7A 5A5QA 2OO1A 4GPJA 5KTWA 4LR6A 3U5OA 4HXPA 4Y03A 2R0YA 5L99A 4BHWA 2NXBA 4O78A 2D9EA 5G4SA 4HBWA 3QZSA 5TCMA 3SVGA 4NQMA 4TS8A 5E3DA 3U5LA 4QEVA 3QZTA 4N4IA 4NRAA 4LYIA 4NR5A 5KTUA 2DWWA 4Q0NA 2DVRA 5DW2A 4IR4A 5CRZA 4KV4A 2FSAA 4YYIA 5ENGA 3IU6A 5DBMA 4QSPA 5E9MA 3AADA 4UYEA 2I8NA 4J3IA 4N4GA 5F5ZA 4QSSA 4O7EA 5TB6A 4UITA 5K29A 5CY9A 5LVQA 4A9FA 4C66A 4LZRA 3JVLA 4QUTA 4YH4A 1EQFA 4HXKA 4YADA 4YYMA 3O35A 5HFQA 5ENIA 4YY6A 3ZYUA 5FE9A 2YEMA 4MR4A 2DKWA 5CZGA 2L5EA 4J0SA 4MR5A 5FH6A 5E0RA 3JVMA 5CU8A 5FDZA 4LYWA 3MUKA 5F25A 3UVWA 5FE7A 4HXLA 4NS5A 5ACYA 4MENA 5FG5A 4YABA 3UVYA 4CUSA 2RS9B 5CUCA 4NQNA 4O77A 5DKDA 5BT5A 4NUCA 5D3RA 5J0DA 5L96A 1JM4B 5LKZA 4A9MA 2YQDA 5E3GA 4YBTA 4A9HA 4IR5A 4A9NA 3U5KA 5D3PA 5HCLA 5D7XA 4ZQLA 5IGKA 3UW9A 5AD3A 5C85A 2MJVB 2LSPB 5DYCA 4BW1A 4YAXA 3MULA 5II2A 4BJXA 4O7BA 5KU3A 5E7DA 5F2PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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