4NYVA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with a quinazolin-one ligand
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
RKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of the Bromodomain of human CREBBP in complex with a quinazolin-one ligand
rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 116
sequence length 116
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2013-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4nyvA00
4Z6IA 3S91A 3UVYA 4QSSA 3Q2EA 5LJ1A 4QC1A 4IR6A 4NR8A 5KO4A 5CQ7A 4YK0A 5D3JA 4QEUA 4HXMA 4QYDA 5ENGA 3AADA 3ONIA 3IU6A 2H60A 4YBMA 4IR4A 4QEWA 5EI4A 4YBTA 4CUSA 3RCWA 3K2JA 5F1HA 5JWMA 4XUAA 5HJCA 5ETDA 4NYVA 2DVRA 5BT5A 3LQIA 5DFBA 1JM4B 5F60A 5DKDA 3UV5A 3ZYUA 5EWHA 4HXPA 4N4HA 5I40A 4QYLA 5KHMA 5ENBA 4RVRA 4O70A 5ENFA 3Q2FA 2NXBA 2DKWA 4HBYA 5CUDA 5EM3A 4O77A 4O76A 3P1FA 5IG6A 4MEOA 4NR4A 4UYFA 4CL9A 5LVQA 5FE6A 5D3PA 5I88A 5I86A 5E9LA 1WUGA 5F36A 4ZQLA 4O72A 3MB3A 5IGLA 5ACYA 4LRGA 4N4FA 5F5ZA 5FFWA 2YYNA 5F63A 4LYWA 4Y03A 3UV2A 4LZ2A 4TZ2A 5LKUA 5I29A 2E7OA 3G0JA 2RI7A 5FB1A 5D3NA 5D24A 4TTEA 5E9VA 4YY4A 3UV4A 2E7NA 2RFJA 4UIXA 5DFDA 5HCLA 3GG3A 4PCIA 3QZVA 4BHWA 4OGJA 4A9MA 5HRWA 4A9NA 2DATA 4QBMA 2WP2A 5CQ6A 5CFWA 5L8TA 3U5MA 4CFKA 5H1TA 5ENCA 2RNXA 4QUUA 4DONA 3U5KA 4YAXA 5DYAA 5CQ8A 4CLBA 4IOQA 5FDZA 2YELA 4NR7A 4QSWA 5C8GA 5HQ5A 4IR3A 5E9IA 5FE4A 3LJWA 5CPEA 5D3TA 5A5OA 5IIDA 2L84A 4A9EA 4PS5A 3JVMA 3P1EA 5CRMA 4N3WA 4PTBA 5IGKA 4A9JA 4O7FA 5I1QA 5DX4A 4N4IA 3D7CA 5EU1A 3UVWA 4OUFA 2L85A 5DLZA 4UYFB 5EV9A 5C89A 4XUBA 3U5NA 4J1PA 5H1VA 5C4QA 1WUMA 4O7EA 4BJXA 2GRCA 4FLPA 2MJVB 4OGIA 4A9KA 4LZRA 4TU6A 3O36A 5ETBA 2YEMA 4LYSA 3LQJA 5D3HA 4UYGA 5A83A 5EICA 4ZC9A 4MENA 5AD2A 4Z1SA 4HBVA 5CU8A 3SVFA 4QR5A 5ENHA 5ENJA 4Z6HA 5FE2A 4Z93A 4BW3A 4HXOA 4NR6A 5LVRA 4YH4A 2RNYA 5EWDA 5LKTA 3DAIA 2L5EA 4YABA 4C67A 1E6IA 2G4AA 2OO1A 4MEQA 4ALGA 5CUGA 5D0CA 4QSRA 2E3KA 2N9GA 4TT4A 5EP7A 4YADA 5CRZA 5A5PA 4QR3A 5I83A 4QSQA 4TQNA 4PKLA 5D3RA 3O35A 5CUBA 4YC9A 5I7XA 2I8NA 5LJ2A 5CS8A 5E9YA 4YYJA 5EVAA 5FG6A 5G4RA 5BT4A 4N4GA 2F6NA 4CUTA 2I7KA 5FE5A 5E3DA 5FE7A 5I7YA 5F62A 3HMEA 4YH3A 5AMFA 1N72A 5DLXA 5EGUA 4NR9A 4NS5A 4ALHA 5TCMA 5DKCA 3LXJA 4XY9A 5CQTA 5EPRA 5IBNA 4YYDA 5IGMA 4TT6A 2DVQA 4KCXA 2DWWA 3P5OA 3TLPA 4ZW1A 5DYUA 3U5PA 5D26A 5EPBA 4CFLA 4UIVA 5D3LA 1X0JA 3U5LA 5A5SA 4O78A 5FE8A 4XYAA 3S92A 4HBXA 1ZS5A 3LQHA 5G4SA 3MUKA 4MEPA 4TT2A 5FG5A 4NUEA 4BW1A 4MR4A 5KU3A 4BW4A 4UIWA 5CP5A 5FFVA 5KTUA 4CUUA 4UIYA 5EPSA 4LDFA 3QZSA 4QEVA 5F2PA 5FFYA 4QC3A 5E3GA 5CQ5A 5A5NA 4IORA 5BT3A 5D25A 3IU5A 5FE9A 5E0RA 2WP1A 4UIZA 4LR6A 5FBXA 5HRXA 4HXRA 4YY6A 4NRCA 4O75A 3NXBA 2YW5A 5AMEA 2KTBB 5CZGA 5HRVA 5D7XA 5J0DA 2DVVA 4GPJA 5D3SA 5A7CA 3HMFA 5HEMA 1EQFA 5EWVA 5A81A 5DY7A 4J3IA 5COIA 5HENA 4PY6A 5H1UA 4X2IA 3P1CA 4O7CA 4A9OA 4CUPA 4HXSA 5L99A 5FE0A 4NRAA 4YATA 4WIVA 5II2A 4WHWA 3P1DA 4YYHA 4TU4A 4QSUA 5H85A 5JI8A 4CURA 5IGNA 5DYCA 5HQ6A 4BW2A 4UIUA 4QSVA 4TS8A 5A5QA 4A9FA 4NQNA 5CUAA 2DVSA 3HMHA 5DBMA 5A82A 4QR4A 5C7NA 5EISA 4LZSA 5DW2A 4UYHA 3O37A 5EWWA 5ENEA 5AD3A 3JVJA 3QZTA 2D82A 4HXKA 4NYXA 3O34A 4NUCA 5FG4A 3U5JA 5DFCA 2YEKA 5E9MA 5EK9A 5HQ7A 4YYNA 2LSPB 5KTXA 4O74A 2R0YA 5CQ4A 2RNWA 4MR3A 4QY4A 4AKNA 4Q0NA 2FSAA 3DWYA 2YDWA 4HXLA 4CUQA 4LC2A 5F1LA 4O7BA 4Z1QA 4PCEA 2RO1A 4KV1A 2R0VA 3I3JA 5C87A 5DKHA 5L98A 4C66A 5CQAA 4NRBA 4O7AA 5FE3A 5I80A 5I89A 3UVDA 5DW1A 3FKMX 4IOOA 5LKXA 4QZSA 4LYIA 3O33A 4A9HA 5HELA 4E96A 4YYKA 5FH7A 5CTLA 5TB6A 4WHUA 5CUCA 5HFRA 4J0RA 4O71A 4UYEA 1F68A 5A5RA 5HFQA 3MULA 2R0SA 5HM0A 5LUUA 4UITA 4TZ8A 4UYDA 4YYMA 5DYXA 4MR5A 2R10A 2RS9B 5F3AA 2F6JA 5E7DA 5FH6A 3MXFA 2OUOA 4HBWA 3JVLA 5F25A 3U5OA 5FH8A 5ENIA 5E74A 5K29A 5EA1A 4KV4A 5HLSA 5II1A 3JVKA 3G0LA 4F3IA 3SVGA 3UVXA 4YYIA 2D9EA 4TYLA 4Q0OA 4YYGA 5FE1A 5E73A 5A85A 2OSSA 3MB4A 3SVHA 4J0SA 5F61A 4QUTA 3AQAA 4QNSA 1JSPB 4NQMA 5CQ3A 4QSTA 3MQMA 4NYWA 5CGPA 5EWCA 5CY9A 5EQ1A 5C85A 4QSXA 5L8UA 4NXJA 5E9KA 5LJ0A 4IR5A 5LKZA 4YBSA 4QB3A 4A9LA 4XY8A 2YQDA 5FB0A 4A9IA 5L96A 4NUDA 4HXNA 5KTWA 4MR6A 4QSPA 3UW9A 4NR5A 5CUEA 5L97A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4Z6IA 3S91A 3UVYA 4QSSA 3Q2EA 5LJ1A 4QC1A 4IR6A 4NR8A 5KO4A 5CQ7A 4YK0A 5D3JA 4QEUA 4HXMA 4QYDA 5ENGA 3AADA 3ONIA 3IU6A 2H60A 4YBMA 4IR4A 4QEWA 5EI4A 4YBTA 4CUSA 3RCWA 3K2JA 5F1HA 5JWMA 4XUAA 5HJCA 5ETDA 4NYVA 2DVRA 5BT5A 3LQIA 5DFBA 1JM4B 5F60A 5DKDA 3UV5A 3ZYUA 5EWHA 4HXPA 4N4HA 5I40A 4QYLA 5KHMA 5ENBA 4RVRA 4O70A 4AKGA 1ZKRA 5ENFA 3Q2FA 3ERRA 2NXBA 2DKWA 4HBYA 5CUDA 5EM3A 4O77A 4O76A 3P1FA 5IG6A 4MEOA 4NR4A 4UYFA 4CL9A 5LVQA 5FE6A 5D3PA 5I88A 5I86A 5E9LA 1WUGA 5F36A 4ZQLA 4O72A 3MB3A 5IGLA 5ACYA 4LRGA 4N4FA 5F5ZA 5FFWA 2YYNA 5F63A 4LYWA 4Y03A 3UV2A 4LZ2A 4TZ2A 5LKUA 5I29A 2E7OA 3G0JA 2RI7A 5FB1A 5D3NA 5D24A 4TTEA 4AKHA 5E9VA 4YY4A 3UV4A 2E7NA 2RFJA 4UIXA 5DFDA 5HCLA 3GG3A 4PCIA 3QZVA 4BHWA 4OGJA 4A9MA 5HRWA 4A9NA 2DATA 4QBMA 2WP2A 5CQ6A 5CFWA 5L8TA 3U5MA 4CFKA 5H1TA 5ENCA 2RNXA 4QUUA 4DONA 3U5KA 4YAXA 5DYAA 5CQ8A 4CLBA 4IOQA 5FDZA 2YELA 4NR7A 4QSWA 5C8GA 5HQ5A 4IR3A 5E9IA 5FE4A 3LJWA 5CPEA 5D3TA 5A5OA 5IIDA 2L84A 4A9EA 4PS5A 3JVMA 3P1EA 3D1BA 5CRMA 4N3WA 4PTBA 5IGKA 4A9JA 4O7FA 5I1QA 5DX4A 4N4IA 3D7CA 5EU1A 3UVWA 4OUFA 1PUOA 2L85A 5DLZA 4UYFB 5EV9A 5C89A 4XUBA 3U5NA 4J1PA 5H1VA 5C4QA 1WUMA 4O7EA 4BJXA 2GRCA 4FLPA 2MJVB 4OGIA 4A9KA 4LZRA 4TU6A 3O36A 5ETBA 2YEMA 4LYSA 3LQJA 5D3HA 4UYGA 5A83A 5EICA 4ZC9A 4MENA 5AD2A 4Z1SA 4HBVA 5CU8A 3SVFA 4QR5A 5ENHA 5ENJA 4Z6HA 5FE2A 4Z93A 4BW3A 4HXOA 4NR6A 5LVRA 4YH4A 2RNYA 5EWDA 5LKTA 3DAIA 2L5EA 4YABA 4C67A 1E6IA 2G4AA 2OO1A 4MEQA 4ALGA 5CUGA 5D0CA 4QSRA 2E3KA 2N9GA 4TT4A 5EP7A 4YADA 5CRZA 5A5PA 4QR3A 5I83A 4QSQA 4AKIA 4TQNA 4PKLA 5D3RA 3O35A 5CUBA 4YC9A 5I7XA 2I8NA 5LJ2A 5CS8A 5E9YA 4YYJA 5EVAA 5FG6A 5G4RA 5BT4A 4N4GA 2F6NA 4CUTA 2I7KA 5FE5A 5E3DA 5FE7A 5I7YA 5F62A 3HMEA 4YH3A 5AMFA 1N72A 5DLXA 5EGUA 4NR9A 4NS5A 4ALHA 5TCMA 5DKCA 3LXJA 4XY9A 5CQTA 5EPRA 5IBNA 4YYDA 5IGMA 4TT6A 2DVQA 4KCXA 2EJNA 2DWWA 3P5OA 3TLPA 4ZW1A 5DYUA 3U5PA 5D26A 5EPBA 4CFLA 4UIVA 5D3LA 1X0JA 3U5LA 5A5SA 4O78A 5FE8A 4XYAA 3S92A 4HBXA 1ZS5A 3LQHA 5G4SA 3MUKA 4MEPA 4TT2A 5FG5A 4NUEA 4BW1A 4MR4A 5KU3A 4BW4A 4UIWA 5CP5A 5FFVA 5KTUA 4CUUA 4UIYA 5EPSA 4LDFA 3QZSA 4QEVA 5F2PA 5FFYA 4QC3A 5E3GA 5CQ5A 5A5NA 4IORA 5BT3A 5D25A 3IU5A 5FE9A 5E0RA 2WP1A 4UIZA 4LR6A 5FBXA 5HRXA 4HXRA 4YY6A 4NRCA 4O75A 3NXBA 3VKHA 2YW5A 5AMEA 2KTBB 5CZGA 5HRVA 5D7XA 5J0DA 2DVVA 4GPJA 5D3SA 5A7CA 3HMFA 5HEMA 1EQFA 5EWVA 5A81A 5DY7A 4J3IA 5COIA 5HENA 4PY6A 5H1UA 4X2IA 3P1CA 4O7CA 4A9OA 4CUPA 4HXSA 5L99A 5FE0A 4NRAA 4YATA 4WIVA 5II2A 4WHWA 3P1DA 4YYHA 4TU4A 4QSUA 5H85A 5JI8A 4CURA 5IGNA 5DYCA 5HQ6A 4BW2A 4UIUA 4QSVA 4TS8A 5A5QA 4A9FA 4NQNA 5CUAA 2DVSA 3HMHA 5DBMA 5A82A 4QR4A 5C7NA 5EISA 4LZSA 5DW2A 4UYHA 3O37A 5EWWA 5ENEA 5AD3A 3JVJA 3QZTA 2D82A 4HXKA 4NYXA 3O34A 4NUCA 5FG4A 3U5JA 5DFCA 2YEKA 5E9MA 5EK9A 5HQ7A 4YYNA 2LSPB 5KTXA 4O74A 2R0YA 5CQ4A 2RNWA 4MR3A 4QY4A 4AKNA 4Q0NA 2FSAA 3DWYA 2YDWA 4HXLA 4CUQA 4LC2A 5F1LA 4O7BA 4Z1QA 4PCEA 2RO1A 4KV1A 2R0VA 3I3JA 5C87A 5DKHA 5L98A 4C66A 5CQAA 4NRBA 4O7AA 5FE3A 5I80A 5I89A 3UVDA 5DW1A 3FKMX 4IOOA 5LKXA 4QZSA 4LYIA 3O33A 4A9HA 5HELA 4E96A 4YYKA 5FH7A 5CTLA 5TB6A 4WHUA 5CUCA 5HFRA 4J0RA 4O71A 4UYEA 1F68A 5A5RA 5HFQA 3MULA 2R0SA 5HM0A 5LUUA 4UITA 4TZ8A 4UYDA 4YYMA 5DYXA 4MR5A 2R10A 2RS9B 5F3AA 2F6JA 5E7DA 5FH6A 3MXFA 2OUOA 4HBWA 3JVLA 5F25A 3U5OA 5FH8A 5ENIA 5E74A 5K29A 5EA1A 4KV4A 5HLSA 5II1A 3JVKA 3G0LA 4F3IA 3SVGA 3UVXA 4YYIA 2D9EA 4TYLA 4Q0OA 4YYGA 5FE1A 5E73A 5A85A 2OSSA 3MB4A 3SVHA 4J0SA 5F61A 4QUTA 3AQAA 4QNSA 4AI6A 1JSPB 4NQMA 5CQ3A 4QSTA 3MQMA 4NYWA 3VKGA 3D1DA 5CGPA 5EWCA 5CY9A 5EQ1A 5C85A 4QSXA 5L8UA 4NXJA 5E9KA 5LJ0A 4IR5A 5LKZA 4YBSA 4QB3A 4A9LA 4XY8A 2YQDA 5FB0A 4A9IA 5L96A 4NUDA 4HXNA 5KTWA 4MR6A 4QSPA 3UW9A 4NR5A 5CUEA 5L97A
chains in the Genus database with same CATH topology
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