4O7EA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with sb-610251-b
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Acetyl-lysine Binding Site of Bromodomain-Containing Protein 4 (BRD4) Interacts with Diverse Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
molecule tags Transcription/inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4o7eA01
5ENGA 5EWHA 4QSTA 5L99A 5EM3A 4CUUA 5EP7A 5CUBA 4YY4A 4O7AA 4O77A 5F62A 4OGJA 5FFYA 4O78A 5DX4A 4YYDA 5EWDA 4QZSA 4QR5A 5HRWA 4O7FA 5D3RA 2DVQA 5AD2A 4UIZA 4LC2A 4NR9A 2G4AA 4QY4A 4YH3A 5HFRA 3QZVA 5CRZA 5EQ1A 4O7BA 3MXFA 5E9VA 5EI4A 4Z6HA 1EQFA 5CUEA 5E7DA 4YY6A 5FH7A 3G0LA 4PY6A 4QB3A 4UIVA 4NRAA 4LYIA 2DWWA 4N4GA 4C67A 5EU1A 4O72A 5KHMA 2GRCA 4QR4A 4Z6IA 5D3PA 4N3WA 4YBMA 4MR6A 4CFKA 4MEOA 3ONIA 5CP5A 1ZS5A 2E7NA 4BJXA 4UITA 5CQ5A 3P5OA 4BW2A 4NUEA 4HXOA 4A9MA 4LRGA 3GG3A 5EVAA 2RNXA 5G4RA 4TQNA 5HQ5A 3HMHA 5D24A 4A9FA 5HCLA 4O7EA 3U5JA 4A9IA 4QYLA 4QC1A 4ZQLA 5AMEA 5ENIA 5H85A 4QEUA 4XUAA 3S91A 5ENCA 5JWMA 5F63A 2DKWA 4O74A 2D82A 4ZC9A 3UV4A 5DW2A 4YAXA 5ENBA 3ZYUA 5LJ0A 5CS8A 5EGUA 4XY8A 4O7CA 3UVDA 4C66A 4NS5A 5ENFA 4MR5A 4Q0OA 5D3HA 5EA1A 5CQ6A 4QC3A 5A5NA 5LVQA 3U5PA 5A5QA 3Q2FA 2F6NA 5F1HA 5H1UA 5E9YA 5A85A 5I7YA 2RS9B 5IIDA 4NYWA 5D7XA 4F3IA 4YADA 3D7CA 2DVVA 4NR7A 4A9KA 4A9HA 5ETBA 5FB0A 5I89A 4PTBA 5FE4A 3U5LA 5D25A 4TT6A 5C7NA 5F60A 3HMEA 5LUUA 5J0DA 2WP1A 4LDFA 5CQAA 5EISA 5LKTA 5L98A 5ACYA 3O34A 5DW1A 2MJVB 4CUSA 4UYGA 3AQAA 4YATA 2RNYA 4N4FA 4LYSA 2YEKA 4Z93A 5E3GA 5HJCA 4A9OA 4BW3A 5FB1A 5A5RA 4NQMA 2YQDA 2RFJA 4QYDA 4BHWA 4IOQA 4TU6A 3K2JA 4UYDA 5F61A 2WP2A 5K29A 1WUMA 4QSPA 5H1VA 4YC9A 2RNWA 4TYLA 2I8NA 4YH4A 5D0CA 5FH8A 4MENA 5CFWA 5DKDA 4XY9A 5DYUA 5IBNA 4HXKA 3O35A 5A5OA 4IORA 4QSUA 4A9LA 5I40A 3SVGA 4LR6A 4MR3A 3MUKA 5HEMA 3U5MA 2DVRA 1N72A 5TB6A 4TZ2A 5FE9A 5F36A 4TTEA 3U5OA 3LXJA 2H60A 5ENJA 4KV4A 5CUAA 3LJWA 5A7CA 4LZ2A 2YDWA 5I80A 5IGKA 5FBXA 4YYMA 5LKZA 5G4SA 4WIVA 5FFVA 5AD3A 5HFQA 4CFLA 5LVRA 2RO1A 5BT3A 2YELA 4J3IA 4UYHA 4CLBA 5L8TA 1JSPB 5C85A 5A5SA 4IR5A 4QSRA 4BW1A 4HBXA 5D3TA 4UYFB 5EPSA 5FE5A 5II1A 2YEMA 4O70A 4YYKA 2DATA 4IR6A 5DYXA 5HQ6A 5C8GA 5DYCA 5E0RA 4NR5A 4HBVA 5FE2A 5CU8A 2OSSA 5HRXA 3NXBA 3UV2A 5I88A 5F25A 4YK0A 2L84A 5IGNA 4MEPA 3UVYA 4LZRA 4Z1SA 5D3SA 5TCMA 4O75A 5FE6A 5LJ2A 4J0RA 5II2A 4NUCA 4NYXA 4ALGA 2YYNA 5DKHA 5HRVA 5CZGA 4WHUA 3UVWA 5CQTA 5I7XA 4TS8A 4QUTA 5C89A 5I86A 2N9GA 3JVKA 4CUTA 5F1LA 5I83A 3U5KA 5KTWA 5D3LA 4NR4A 5CGPA 5ENEA 4DONA 2NXBA 3HMFA 4QEVA 5EICA 4YYHA 4IOOA 4PCIA 5E3DA 3P1CA 4YYIA 3LQIA 4QEWA 2E7OA 5CUCA 5CRMA 2L85A 5FG4A 4Y03A 4CURA 4TT2A 4Q0NA 5AMFA 4YYGA 2L5EA 5HQ7A 5CQ7A 4NRBA 5E74A 5CQ8A 3QZSA 5A81A 4QSQA 4FLPA 5HM0A 5EWVA 3U5NA 4PS5A 4QSWA 4ZW1A 3UVXA 5FG5A 4MEQA 3S92A 3JVMA 3QZTA 3AADA 4PCEA 4UYFA 5FE7A 5DFDA 4CUQA 5FDZA 4HXMA 5DY7A 4QSVA 2E3KA 5FE8A 5A5PA 5CQ4A 3P1DA 4NYVA 3UV5A 5EK9A 1JM4B 5BT5A 4QNSA 4XYAA 5A83A 5DYAA 3MULA 5COIA 3SVFA 5KO4A 5F3AA 4ALHA 4TZ8A 4OUFA 3O37A 5CTLA 3RCWA 4NXJA 5IGMA 5L97A 5L96A 4NRCA 5BT4A 4HXPA 4A9NA 3FKMX 5LJ1A 4TU4A 3JVLA 5EPBA 3O33A 5I1QA 5E9LA 3MB4A 4J1PA 5EWWA 4UIUA 5C87A 3IU5A 4HXNA 5IG6A 3MQMA 5ENHA 4TT4A 4N4IA 4AKNA 5ETDA 4UIXA 5EWCA 4NR8A 5LKUA 4KV1A 2KTBB 5DLZA 4GPJA 4KCXA 4YYNA 4QSXA 2F6JA 2YW5A 5FE1A 5D3JA 2R0SA 5EV9A 4N4HA 5CPEA 3TLPA 4A9JA 5DFCA 5C4QA 4CL9A 5F5ZA 3DWYA 4IR4A 4HBYA 5FFWA 4HBWA 3IU6A 4YBTA 5HENA 5HELA 4IR3A 2R10A 2I7KA 5IGLA 2DVSA 3O36A 4X2IA 5KTUA 4J0SA 4QUUA 3P1EA 4LZSA 4YBSA 5CY9A 2FSAA 1F68A 4QBMA 5D3NA 2OUOA 5L8UA 4HXSA 3SVHA 5D26A 4QSSA 5CUDA 2RI7A 4E96A 4NR6A 4HXLA 5E9IA 4UYEA 3I3JA 3G0JA 5H1TA 4RVRA 5KTXA 5F2PA 3P1FA 2D9EA 4NUDA 5FH6A 4A9EA 5FG6A 4UIWA 5HLSA 3Q2EA 1WUGA 5CUGA 3LQHA 3LQJA 5A82A 3JVJA 2LSPB 4UIYA 2R0VA 5CQ3A 5DFBA 1X0JA 1E6IA 4O71A 4BW4A 4O76A 2OO1A 5DBMA 5EPRA 3UW9A 4QR3A 5DLXA 4PKLA 5FE3A 4HXRA 4OGIA 5JI8A 5LKXA 5E9KA 3MB3A 3DAIA 4WHWA 5KU3A 4YABA 4CUPA 4Z1QA 4XUBA 5E73A 5I29A 4NQNA 4MR4A 4YYJA 5E9MA 5DKCA 5FE0A 4LYWA 2R0YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ENGA 5EWHA 4QSTA 5L99A 3D1BA 5EM3A 4CUUA 5EP7A 5CUBA 4YY4A 4O7AA 4O77A 5F62A 4OGJA 5FFYA 4O78A 5DX4A 4YYDA 5EWDA 4QZSA 4QR5A 5HRWA 4O7FA 5D3RA 2DVQA 5AD2A 4UIZA 4LC2A 4NR9A 2G4AA 4QY4A 4YH3A 5HFRA 3QZVA 5CRZA 5EQ1A 4O7BA 3MXFA 5E9VA 5EI4A 4Z6HA 1EQFA 5CUEA 5E7DA 4YY6A 5FH7A 3G0LA 4PY6A 4QB3A 4UIVA 4NRAA 4LYIA 2DWWA 4N4GA 4C67A 5EU1A 4O72A 5KHMA 2GRCA 4QR4A 4Z6IA 5D3PA 4N3WA 4YBMA 4MR6A 4CFKA 4MEOA 3ONIA 5CP5A 1ZS5A 2E7NA 4BJXA 4UITA 5CQ5A 3P5OA 4BW2A 4NUEA 4HXOA 4A9MA 4LRGA 3GG3A 5EVAA 2RNXA 5G4RA 4TQNA 5HQ5A 3HMHA 5D24A 4A9FA 5HCLA 4O7EA 3U5JA 4A9IA 4QYLA 4QC1A 4ZQLA 5AMEA 5ENIA 5H85A 4QEUA 4XUAA 3S91A 5ENCA 5JWMA 5F63A 2DKWA 4O74A 2D82A 4ZC9A 3UV4A 5DW2A 4YAXA 5ENBA 3ZYUA 5LJ0A 5CS8A 5EGUA 4XY8A 4O7CA 3VKHA 3UVDA 4C66A 4NS5A 5ENFA 4MR5A 4Q0OA 5D3HA 3ERRA 5EA1A 5CQ6A 4QC3A 5A5NA 5LVQA 2EJNA 3U5PA 5A5QA 3Q2FA 2F6NA 5F1HA 5H1UA 5E9YA 5A85A 5I7YA 2RS9B 5IIDA 4NYWA 5D7XA 4F3IA 4YADA 3D7CA 2DVVA 4NR7A 4A9KA 4A9HA 5ETBA 5FB0A 5I89A 4PTBA 5FE4A 3U5LA 5D25A 4TT6A 5C7NA 5F60A 3HMEA 5LUUA 5J0DA 2WP1A 4LDFA 5CQAA 5EISA 5LKTA 5L98A 5ACYA 3O34A 5DW1A 2MJVB 4CUSA 4UYGA 3AQAA 4YATA 2RNYA 4N4FA 4LYSA 2YEKA 4Z93A 5E3GA 5HJCA 4A9OA 4BW3A 5FB1A 5A5RA 4NQMA 2YQDA 2RFJA 4QYDA 4BHWA 4IOQA 4TU6A 3K2JA 4UYDA 5F61A 2WP2A 5K29A 1WUMA 4QSPA 5H1VA 4YC9A 2RNWA 4TYLA 2I8NA 4YH4A 5D0CA 5FH8A 4MENA 5CFWA 5DKDA 4XY9A 5DYUA 5IBNA 4HXKA 3O35A 4AKGA 5A5OA 4IORA 4QSUA 4A9LA 5I40A 3SVGA 4LR6A 4MR3A 3MUKA 5HEMA 3U5MA 2DVRA 1N72A 5TB6A 4TZ2A 5FE9A 5F36A 4TTEA 3U5OA 3LXJA 2H60A 5ENJA 4KV4A 5CUAA 3LJWA 5A7CA 4LZ2A 2YDWA 5I80A 5IGKA 5FBXA 4YYMA 5LKZA 5G4SA 4WIVA 5FFVA 5AD3A 5HFQA 4CFLA 5LVRA 2RO1A 5BT3A 2YELA 4J3IA 4UYHA 4CLBA 5L8TA 1JSPB 5C85A 5A5SA 4IR5A 4QSRA 4BW1A 4HBXA 5D3TA 4UYFB 5EPSA 5FE5A 5II1A 2YEMA 4O70A 4YYKA 2DATA 4IR6A 5DYXA 5HQ6A 5C8GA 5DYCA 5E0RA 4NR5A 4HBVA 5FE2A 5CU8A 2OSSA 5HRXA 3NXBA 3UV2A 5I88A 5F25A 4YK0A 2L84A 5IGNA 4MEPA 3UVYA 4LZRA 4Z1SA 5D3SA 5TCMA 4O75A 5FE6A 5LJ2A 4J0RA 5II2A 4NUCA 4NYXA 4ALGA 2YYNA 5DKHA 5HRVA 5CZGA 4WHUA 3UVWA 5CQTA 5I7XA 4TS8A 4QUTA 5C89A 5I86A 2N9GA 3JVKA 4CUTA 3D1DA 5F1LA 5I83A 3U5KA 5KTWA 5D3LA 4NR4A 5CGPA 5ENEA 4DONA 2NXBA 3HMFA 4QEVA 5EICA 4YYHA 4IOOA 4PCIA 5E3DA 3P1CA 4YYIA 3LQIA 4QEWA 2E7OA 5CUCA 5CRMA 2L85A 5FG4A 4Y03A 4CURA 4TT2A 4Q0NA 5AMFA 4YYGA 2L5EA 5HQ7A 5CQ7A 4NRBA 5E74A 5CQ8A 3QZSA 5A81A 4QSQA 4FLPA 5HM0A 5EWVA 3U5NA 4PS5A 4QSWA 4ZW1A 3UVXA 5FG5A 4MEQA 3S92A 3JVMA 3QZTA 3AADA 4PCEA 4UYFA 5FE7A 5DFDA 4CUQA 5FDZA 4HXMA 5DY7A 4QSVA 2E3KA 5FE8A 5A5PA 5CQ4A 3P1DA 4NYVA 3UV5A 5EK9A 1JM4B 5BT5A 4QNSA 4XYAA 5A83A 5DYAA 3MULA 5COIA 4AKIA 3SVFA 5KO4A 5F3AA 4ALHA 4TZ8A 4OUFA 3O37A 5CTLA 3RCWA 4NXJA 5IGMA 3VKGA 5L97A 5L96A 4NRCA 5BT4A 1ZKRA 4HXPA 4A9NA 3FKMX 5LJ1A 4TU4A 3JVLA 5EPBA 3O33A 5I1QA 5E9LA 1PUOA 3MB4A 4J1PA 5EWWA 4UIUA 5C87A 3IU5A 4HXNA 5IG6A 3MQMA 5ENHA 4TT4A 4N4IA 4AKNA 5ETDA 4UIXA 5EWCA 4NR8A 5LKUA 4KV1A 2KTBB 5DLZA 4GPJA 4KCXA 4YYNA 4QSXA 2F6JA 2YW5A 5FE1A 5D3JA 2R0SA 5EV9A 4N4HA 5CPEA 3TLPA 4A9JA 5DFCA 5C4QA 4CL9A 5F5ZA 3DWYA 4IR4A 4HBYA 5FFWA 4HBWA 3IU6A 4YBTA 5HENA 5HELA 4IR3A 2R10A 2I7KA 5IGLA 2DVSA 3O36A 4X2IA 5KTUA 4J0SA 4QUUA 3P1EA 4LZSA 4YBSA 5CY9A 2FSAA 1F68A 4QBMA 5D3NA 2OUOA 5L8UA 4HXSA 3SVHA 5D26A 4QSSA 5CUDA 2RI7A 4E96A 4NR6A 4HXLA 5E9IA 4UYEA 3I3JA 3G0JA 5H1TA 4RVRA 5KTXA 5F2PA 3P1FA 2D9EA 4NUDA 5FH6A 4A9EA 5FG6A 4UIWA 5HLSA 3Q2EA 1WUGA 5CUGA 3LQHA 3LQJA 5A82A 3JVJA 2LSPB 4UIYA 2R0VA 5CQ3A 5DFBA 1X0JA 1E6IA 4O71A 4BW4A 4O76A 2OO1A 5DBMA 5EPRA 3UW9A 4QR3A 5DLXA 4PKLA 5FE3A 4HXRA 4OGIA 5JI8A 5LKXA 5E9KA 3MB3A 3DAIA 4WHWA 5KU3A 4YABA 4AI6A 4CUPA 4Z1QA 4AKHA 4XUBA 5E73A 5I29A 4NQNA 4MR4A 4YYJA 5E9MA 5DKCA 5FE0A 4LYWA 2R0YA
chains in the Genus database with same CATH topology
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