4QSQA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) with bound dmso
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Signaling protein
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 55
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qsqA00
2RNWA 5A5PA 5FE0A 1JSPB 5G4RA 2F6NA 4QC3A 4XY8A 5D0CA 5F1LA 4J1PA 4CUPA 4MEPA 4NXJA 5C87A 5E9VA 3K2JA 2F6JA 5D3RA 2D82A 4PY6A 3UVXA 5E73A 5FG6A 3HMHA 2OSSA 5DFBA 5CPEA 4YY6A 5I1QA 5DW2A 4PTBA 3LQIA 4A9LA 4HXPA 4WHWA 4O74A 4UIVA 5HQ6A 4O7BA 4TS8A 5EP7A 4O70A 4QSUA 5KTWA 4KV1A 4NYVA 5D25A 4YYMA 2YYNA 3IU5A 5EK9A 5EPSA 5HELA 4N3WA 5H1UA 4TYLA 4LZ2A 5E9YA 1N72A 3JVMA 3S91A 3UW9A 5JI8A 4DONA 5ENIA 4N4GA 5D3NA 4N4IA 5DLZA 4YYDA 5IGKA 5KU3A 4YY4A 3UVYA 5KO4A 4NQMA 3Q2FA 4BJXA 3O33A 3Q2EA 5FH8A 5H1VA 5EWWA 5KTXA 2OO1A 4OUFA 2YDWA 5CUCA 5F63A 4QEVA 5LKXA 5LKZA 4CUSA 5TB6A 2WP2A 5A5QA 4O76A 5CQ8A 3IU6A 4QBMA 4NUCA 5DKHA 4XY9A 5FG4A 4C66A 5JWMA 4NR9A 5HQ5A 1WUMA 5EWCA 3O37A 4YYHA 5A85A 4QSRA 5IG6A 3UVWA 2D9EA 5KHMA 5C8GA 4QSTA 5CP5A 5AMFA 4HBYA 2H60A 5DYCA 4QYLA 4C67A 1EQFA 4MR5A 5HFQA 4Z6HA 4QY4A 3MXFA 2FSAA 2R10A 5E9IA 5I83A 2I7KA 5FH6A 5ENFA 5I40A 4QR3A 5F36A 4O7EA 5FH7A 3FKMX 2DATA 4HXKA 2YELA 5AD3A 3QZSA 4O7AA 4NYXA 5A5NA 4TZ2A 5FBXA 5BT4A 3NXBA 5DKCA 5E3GA 4Z6IA 5HLSA 4IR3A 5EWHA 5I80A 5DYUA 4N4HA 4J0RA 3GG3A 4NYWA 4QR4A 3O35A 4A9JA 5DKDA 5FFVA 4YYJA 4TT2A 3P1DA 5CGPA 5FFYA 5CUEA 3MUKA 5E9MA 5EICA 5EA1A 4MENA 5F60A 5HCLA 5E9KA 4TQNA 4QYDA 4J3IA 4MEOA 4QSXA 5CRZA 4YBMA 4QSSA 1F68A 3U5NA 3LQJA 5LJ1A 5FB0A 5D3LA 5CS8A 4NQNA 4NS5A 4QEWA 5D7XA 5LKUA 5D3JA 5I29A 5EPBA 5DBMA 5DYXA 5F61A 5FE5A 4YH4A 5CQ7A 4Z93A 4QZSA 4CFLA 4UYHA 5DFCA 5FE6A 4PCEA 4NR5A 4KCXA 5L99A 4CL9A 4O72A 4YAXA 5A81A 4XUBA 5E3DA 5I88A 5C85A 4A9EA 3ONIA 4UYGA 2DWWA 2LSPB 4LYSA 5F3AA 5DW1A 5DX4A 5II2A 3D7CA 5FE8A 4A9HA 5CQ5A 5ENCA 4F3IA 3MB3A 4YADA 4HXMA 5CU8A 2I8NA 4QSVA 2R0VA 3JVKA 4MR4A 3G0JA 4NR8A 5ENJA 3UV5A 5A5OA 5F25A 5A7CA 4BW3A 5LKTA 2GRCA 2RS9B 3QZVA 5F1HA 4NUEA 5HENA 5FDZA 5FE2A 5LVRA 4ZQLA 5I89A 4YBSA 4BW1A 5A5RA 5HM0A 4IR5A 4NUDA 4UIWA 3SVFA 5C89A 3MULA 3P5OA 4WHUA 4HXOA 4HBWA 4BW2A 5C7NA 3G0LA 4UYDA 4IORA 5DFDA 2YW5A 5I86A 5I7YA 2E7OA 3DAIA 4MEQA 4ZW1A 4BHWA 4X2IA 5EISA 3TLPA 5CUAA 4XUAA 4QSWA 5D3TA 5TCMA 5A5SA 3MB4A 3I3JA 5ENEA 4E96A 4LDFA 5G4SA 5EQ1A 3HMFA 5FE1A 4TU6A 4A9OA 4Q0OA 2RNXA 4LC2A 5CZGA 4ALGA 2DVRA 5ENBA 2RNYA 5CQAA 2DVSA 3S92A 2DVQA 4Y03A 4NRBA 4YYIA 4QSQA 5ACYA 5FB1A 4QEUA 5CFWA 4O7FA 4HXRA 3AADA 4QC1A 5E9LA 5CUBA 3O34A 3U5JA 3JVLA 4NRAA 5CQTA 5DYAA 4UIUA 4UIXA 5KTUA 2R0YA 5F5ZA 5CQ4A 5EWVA 4MR3A 4TZ8A 2RI7A 3U5MA 4CUUA 5FE4A 5HJCA 5IGMA 5COIA 5CUGA 3HMEA 4ZC9A 5ENGA 5FFWA 4CUTA 2NXBA 1ZS5A 4IR6A 5CQ3A 5II1A 4LYIA 4BW4A 5FE7A 2G4AA 5IBNA 3U5OA 4TT6A 4NRCA 5FE3A 4YYNA 5LJ0A 4TU4A 4IOQA 5E0RA 4YABA 4YK0A 5IGNA 5I7XA 4CLBA 2MJVB 4N4FA 5D3PA 4LYWA 5AMEA 5LJ2A 5CRMA 3RCWA 1WUGA 5L96A 4LR6A 4QNSA 3SVGA 5HEMA 3UVDA 5C4QA 5IGLA 5HQ7A 3MQMA 5HFRA 5L98A 4RVRA 4PCIA 5J0DA 5HRVA 4LRGA 4HXNA 4XYAA 4UIYA 4WIVA 4MR6A 4OGIA 2YQDA 5DY7A 2RO1A 2L85A 5HRXA 5FG5A 5DLXA 4HXSA 5D24A 4O71A 4O7CA 2E7NA 4PS5A 5D26A 3LQHA 5BT5A 4NR6A 5CQ6A 4A9NA 3JVJA 5H85A 4YYKA 4A9KA 5A82A 5EGUA 5EI4A 5H1TA 1X0JA 4CURA 2E3KA 2RFJA 4KV4A 4HXLA 5CTLA 4QUTA 4TTEA 4UYFB 2L84A 5ETDA 3LXJA 4NR7A 4YH3A 5CUDA 5EVAA 2YEKA 4YATA 5EM3A 3ZYUA 4YYGA 5E7DA 4LZSA 4YBTA 5A83A 4UIZA 5LUUA 3O36A 5EU1A 3U5PA 5EWDA 4AKNA 5F2PA 5CY9A 5L97A 4NR4A 4J0SA 2OUOA 5E74A 5K29A 4HBXA 3DWYA 2DKWA 3U5KA 4QUUA 3UV2A 5ETBA 4Z1SA 4O78A 4QR5A 4GPJA 4A9MA 4CUQA 5L8UA 3AQAA 3LJWA 4FLPA 4Z1QA 5EV9A 3SVHA 4QSPA 5L8TA 4CFKA 1E6IA 4O77A 4UITA 5ENHA 3P1EA 2YEMA 5F62A 2R0SA 4LZRA 2N9GA 5BT3A 4ALHA 4IR4A 5HRWA 4A9IA 3QZTA 4IOOA 3U5LA 2KTBB 4YC9A 5D3HA 3UV4A 5AD2A 5FE9A 5D3SA 2DVVA 2WP1A 4PKLA 3P1CA 4UYFA 4QB3A 5IIDA 4O75A 4Q0NA 5EPRA 2L5EA 4HBVA 4OGJA 1JM4B 4A9FA 4UYEA 5LVQA 3P1FA 4TT4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RNWA 5A5PA 5FE0A 1JSPB 5G4RA 2F6NA 4QC3A 4XY8A 5D0CA 5F1LA 4J1PA 4CUPA 4MEPA 4NXJA 5C87A 5E9VA 3K2JA 2F6JA 5D3RA 2D82A 4PY6A 3UVXA 5E73A 5FG6A 3HMHA 2OSSA 5DFBA 5CPEA 4YY6A 5I1QA 5DW2A 4PTBA 3LQIA 4A9LA 4HXPA 4WHWA 4O74A 4UIVA 5HQ6A 4O7BA 4TS8A 5EP7A 4O70A 4QSUA 5KTWA 4KV1A 4NYVA 5D25A 4YYMA 2YYNA 3IU5A 5EK9A 5EPSA 5HELA 4N3WA 5H1UA 4TYLA 4LZ2A 5E9YA 1N72A 3JVMA 3S91A 3UW9A 5JI8A 4DONA 5ENIA 4N4GA 5D3NA 4N4IA 5DLZA 4YYDA 5IGKA 5KU3A 4YY4A 3UVYA 5KO4A 4NQMA 3Q2FA 4BJXA 3O33A 3Q2EA 5FH8A 5H1VA 5EWWA 5KTXA 2OO1A 4OUFA 2YDWA 5CUCA 5F63A 4QEVA 5LKXA 5LKZA 4CUSA 5TB6A 2WP2A 5A5QA 4O76A 5CQ8A 3IU6A 4QBMA 4NUCA 5DKHA 4XY9A 5FG4A 4C66A 5JWMA 4NR9A 5HQ5A 1WUMA 5EWCA 3O37A 4YYHA 5A85A 4QSRA 5IG6A 3UVWA 2D9EA 5KHMA 5C8GA 4QSTA 5CP5A 5AMFA 4HBYA 2H60A 5DYCA 4QYLA 3VKGA 4C67A 1EQFA 4MR5A 5HFQA 4Z6HA 4QY4A 3MXFA 2FSAA 2R10A 5E9IA 5I83A 2I7KA 5FH6A 5ENFA 5I40A 4QR3A 5F36A 4O7EA 5FH7A 3FKMX 2DATA 4HXKA 2YELA 5AD3A 3QZSA 4O7AA 4NYXA 5A5NA 4TZ2A 5FBXA 5BT4A 3NXBA 5DKCA 5E3GA 4Z6IA 5HLSA 4IR3A 5EWHA 5I80A 5DYUA 4N4HA 4J0RA 3GG3A 4NYWA 4QR4A 3O35A 4A9JA 5DKDA 5FFVA 4YYJA 4TT2A 3P1DA 5CGPA 5FFYA 5CUEA 3MUKA 5E9MA 5EICA 5EA1A 4MENA 5F60A 5HCLA 5E9KA 4TQNA 4QYDA 4J3IA 4MEOA 4QSXA 5CRZA 4YBMA 4QSSA 1F68A 4AKHA 3U5NA 3LQJA 5LJ1A 5FB0A 5D3LA 5CS8A 4NQNA 4NS5A 4QEWA 5D7XA 5LKUA 5D3JA 5I29A 5EPBA 5DBMA 5DYXA 5F61A 5FE5A 4YH4A 5CQ7A 4Z93A 4QZSA 4CFLA 4UYHA 1PUOA 5DFCA 5FE6A 4PCEA 4NR5A 4KCXA 5L99A 4CL9A 4O72A 4YAXA 5A81A 4XUBA 5E3DA 5I88A 5C85A 4A9EA 3ONIA 4UYGA 2DWWA 2LSPB 4LYSA 5F3AA 5DW1A 5DX4A 5II2A 3D7CA 5FE8A 4A9HA 5CQ5A 5ENCA 4F3IA 3MB3A 4YADA 4HXMA 5CU8A 2I8NA 4QSVA 2R0VA 3JVKA 4MR4A 3G0JA 4NR8A 5ENJA 3UV5A 5A5OA 5F25A 5A7CA 4BW3A 5LKTA 2GRCA 2RS9B 3QZVA 3VKHA 5F1HA 4NUEA 5HENA 5FDZA 5FE2A 5LVRA 4ZQLA 5I89A 4YBSA 4BW1A 5A5RA 5HM0A 4IR5A 4NUDA 4UIWA 3SVFA 5C89A 3MULA 3P5OA 4WHUA 4HXOA 4HBWA 4BW2A 5C7NA 3G0LA 4UYDA 4IORA 5DFDA 2YW5A 5I86A 5I7YA 2E7OA 3DAIA 4MEQA 4ZW1A 4BHWA 4X2IA 5EISA 3TLPA 5CUAA 4XUAA 4QSWA 5D3TA 5TCMA 5A5SA 3MB4A 3I3JA 5ENEA 4E96A 4LDFA 5G4SA 5EQ1A 3HMFA 5FE1A 4TU6A 4A9OA 4Q0OA 2RNXA 4LC2A 5CZGA 4ALGA 2DVRA 5ENBA 2RNYA 5CQAA 2DVSA 3S92A 2DVQA 4Y03A 4NRBA 4YYIA 4QSQA 5ACYA 5FB1A 4QEUA 5CFWA 4O7FA 4HXRA 3AADA 4QC1A 5E9LA 5CUBA 3O34A 3U5JA 3JVLA 4NRAA 5CQTA 5DYAA 4UIUA 4UIXA 5KTUA 2R0YA 5F5ZA 5CQ4A 5EWVA 4MR3A 4TZ8A 2RI7A 3U5MA 4CUUA 5FE4A 5HJCA 5IGMA 5COIA 5CUGA 3HMEA 4ZC9A 5ENGA 5FFWA 4CUTA 2NXBA 1ZS5A 4IR6A 5CQ3A 5II1A 4LYIA 4BW4A 5FE7A 2G4AA 5IBNA 3U5OA 4TT6A 4NRCA 5FE3A 4YYNA 5LJ0A 4TU4A 4IOQA 5E0RA 4YABA 4YK0A 5IGNA 5I7XA 4CLBA 2MJVB 4N4FA 5D3PA 4LYWA 5AMEA 5LJ2A 5CRMA 3RCWA 1WUGA 5L96A 4LR6A 4QNSA 3SVGA 5HEMA 3UVDA 5C4QA 5IGLA 5HQ7A 3MQMA 2EJNA 3D1DA 5HFRA 5L98A 4RVRA 4PCIA 5J0DA 5HRVA 4LRGA 4HXNA 4XYAA 4UIYA 4WIVA 4MR6A 4OGIA 2YQDA 5DY7A 2RO1A 2L85A 5HRXA 5FG5A 5DLXA 4AKIA 4HXSA 5D24A 4O71A 4O7CA 2E7NA 4PS5A 5D26A 3LQHA 5BT5A 4NR6A 5CQ6A 4A9NA 3JVJA 5H85A 4YYKA 4A9KA 5A82A 3D1BA 5EGUA 5EI4A 5H1TA 1X0JA 4CURA 2E3KA 2RFJA 4KV4A 4HXLA 5CTLA 4QUTA 4TTEA 4UYFB 2L84A 5ETDA 3LXJA 4NR7A 4YH3A 5CUDA 5EVAA 2YEKA 4YATA 5EM3A 3ZYUA 4YYGA 5E7DA 4LZSA 4YBTA 5A83A 4UIZA 5LUUA 3O36A 5EU1A 3U5PA 5EWDA 4AKNA 5F2PA 5CY9A 5L97A 4NR4A 4J0SA 2OUOA 5E74A 5K29A 4HBXA 3DWYA 2DKWA 3U5KA 4QUUA 3UV2A 5ETBA 4Z1SA 4O78A 4QR5A 4GPJA 4A9MA 4CUQA 5L8UA 3AQAA 3LJWA 4FLPA 4Z1QA 5EV9A 3SVHA 4QSPA 5L8TA 4CFKA 1E6IA 4O77A 4UITA 5ENHA 3P1EA 2YEMA 5F62A 2R0SA 4LZRA 2N9GA 1ZKRA 5BT3A 4ALHA 4IR4A 3ERRA 5HRWA 4A9IA 3QZTA 4IOOA 3U5LA 2KTBB 4YC9A 5D3HA 3UV4A 5AD2A 5FE9A 5D3SA 2DVVA 2WP1A 4PKLA 3P1CA 4UYFA 4QB3A 5IIDA 4O75A 4Q0NA 5EPRA 2L5EA 4HBVA 4OGJA 1JM4B 4AKGA 4A9FA 4UYEA 5LVQA 3P1FA 4TT4A 4AI6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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