4QSRA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) with bound mpd
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Signaling protein
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qsrA00
4A9FA 3U5OA 4TZ8A 4IOOA 5ENJA 3S92A 5D3RA 5FBXA 4X2IA 5D3PA 4O72A 4XYAA 5EP7A 5LKZA 4CUUA 5FE8A 4A9EA 4QYDA 5TCMA 4UIYA 3P1FA 5FE4A 5CUGA 5G4RA 5CUCA 1WUMA 5FE6A 5A5QA 3Q2FA 1EQFA 3MB4A 3UW9A 4NR7A 5F62A 2RFJA 5E3GA 2FSAA 4QSUA 5EWCA 5AD2A 4J1PA 5CRZA 5D3SA 4N4HA 4OGIA 4MR6A 4F3IA 4HXRA 5CQAA 5A83A 2LSPB 5CQ3A 5A85A 5BT5A 4A9JA 3RCWA 4HXSA 3LQIA 4NR5A 5I40A 2NXBA 5L8TA 4UIZA 5FH7A 4O7CA 5CUEA 3SVFA 4LR6A 2KTBB 4QBMA 4CUSA 3UV2A 4YYNA 4YABA 5IGLA 4QB3A 4UYDA 5AMFA 5CTLA 5FG5A 4LDFA 4KV4A 5I7YA 5I29A 5CUBA 3MUKA 5EU1A 5F61A 5H85A 4MEOA 5LVQA 5E3DA 5F3AA 4HXPA 4XUBA 4YYMA 5C89A 4BHWA 2RNYA 4BJXA 4N3WA 5EQ1A 5F36A 4CUTA 4YYDA 4LYSA 4QEVA 4CL9A 2R0SA 5CRMA 4YAXA 5BT3A 4NR4A 4YK0A 5DKCA 1JSPB 5CFWA 5DYAA 5BT4A 4QEUA 4E96A 4A9OA 4UYFA 4TT2A 5DYCA 2YDWA 5FG4A 5DW2A 5A7CA 5LUUA 5ENIA 2R0VA 5JWMA 4ALGA 2YQDA 5F5ZA 4Z1SA 2E7OA 5CY9A 4QSPA 4O7EA 5LKXA 4FLPA 4TTEA 3MXFA 5EPRA 5EM3A 2YEKA 4MEQA 4Q0NA 5FE3A 5KO4A 5HELA 4OGJA 2F6NA 5TB6A 5L8UA 1JM4B 5D3LA 3HMFA 4IR5A 4IR3A 3UV4A 3D7CA 5F1HA 5A5OA 3JVLA 4HXKA 3MULA 4HXNA 1E6IA 5C87A 2L85A 4XUAA 5HRVA 4IOQA 2DVSA 4LZRA 4CURA 5F25A 2RI7A 5CGPA 4ZW1A 5HRXA 5DX4A 4NUCA 3P1CA 3U5KA 4YATA 1ZS5A 4A9HA 4TZ2A 4NRBA 5L99A 4HBVA 2E7NA 5CPEA 4YYKA 4Z6IA 4UIWA 4Z93A 5II2A 5FFWA 5IIDA 5F1LA 4N4FA 5DLXA 3ZYUA 3O36A 4UYHA 4WHUA 4O76A 4LYIA 3MB3A 5KTWA 5C8GA 4NQMA 4NUEA 5HFQA 2H60A 5A5SA 2MJVB 5I88A 3MQMA 5KTUA 2OSSA 4QSRA 5LVRA 5L98A 5ENGA 5JI8A 2DVRA 5ACYA 3GG3A 4RVRA 5DBMA 4LYWA 4QSVA 5CU8A 5EA1A 5FDZA 5HFRA 4BW4A 4QR3A 5E9YA 1WUGA 4O70A 4WHWA 3I3JA 5LJ0A 3LJWA 3O34A 5H1TA 4O7AA 2D82A 4KV1A 3AADA 4YC9A 4DONA 4O75A 4UYEA 5A82A 5C85A 5I89A 4MR5A 4NR6A 2WP2A 3NXBA 2RS9B 3LQJA 4O7BA 4Q0OA 4CUPA 3JVJA 5HQ7A 3AQAA 2D9EA 5EV9A 2RO1A 5KTXA 5KU3A 4J0RA 2E3KA 4ZC9A 5A5NA 3UVXA 2GRCA 4HBXA 4YH4A 5F60A 4O78A 4XY9A 5LJ1A 4NR8A 5FE2A 4CFLA 5DW1A 3O37A 5G4SA 4A9IA 5IGMA 5H1UA 5HEMA 5II1A 5EISA 5FFYA 5CQ6A 5EWHA 4IORA 4QSSA 5DKHA 3UV5A 5FB1A 3Q2EA 3UVDA 5HCLA 5C4QA 4QSXA 4J0SA 5DFDA 3DWYA 2G4AA 5HJCA 4HBWA 2YEMA 5D3NA 4NRCA 4IR4A 3IU6A 3U5NA 3P1DA 4YYHA 1X0JA 4TYLA 4YBTA 3JVKA 4TT4A 5ENHA 5H1VA 4QR5A 3U5JA 3HMHA 5IBNA 5AD3A 5ENFA 3UVWA 5ENEA 4NR9A 5I80A 5ENCA 4NS5A 4YBSA 5HENA 5E9MA 4HBYA 4KCXA 4NQNA 5L96A 5EWWA 4TS8A 4CLBA 4CUQA 4PCEA 3U5PA 5L97A 4O7FA 5ENBA 4PCIA 2YW5A 2DVQA 4QEWA 5HLSA 4YYGA 5FE5A 1F68A 2I8NA 4PS5A 5ETDA 2N9GA 4PTBA 5CS8A 4TQNA 5HQ5A 4NYWA 4CFKA 4LRGA 5EGUA 2RNWA 4AKNA 5CQ4A 2OUOA 3QZVA 5K29A 4MEPA 4TU6A 4YADA 5EICA 4MR4A 5A5RA 2DWWA 5I1QA 5DYUA 5FH6A 4MENA 4PKLA 5D3HA 5E9KA 3O35A 4NYXA 5A5PA 4UIVA 3G0LA 5D3TA 4YYIA 3ONIA 5F63A 4QUTA 5AMEA 4HXLA 5A81A 4A9MA 4Z1QA 3LQHA 5D0CA 4ZQLA 3TLPA 5I7XA 5DFCA 5LKTA 4ALHA 4QSTA 4O77A 5COIA 5DYXA 5HQ6A 4TU4A 5E9LA 4LZSA 4NYVA 5EI4A 4A9NA 4QYLA 4O71A 5FH8A 3SVGA 5EPSA 5F2PA 4YY6A 5EPBA 5E9VA 4UIUA 3QZTA 5E7DA 3LXJA 4TT6A 5D25A 5J0DA 4O74A 5I83A 4GPJA 4Z6HA 4UYGA 2RNXA 3O33A 5FE1A 5I86A 2L5EA 2YYNA 3K2JA 5E0RA 3P5OA 4NUDA 5DLZA 3S91A 5DKDA 5DFBA 4NRAA 5D24A 5CQ5A 4QC3A 5FFVA 3P1EA 1N72A 2YELA 4OUFA 5FB0A 3G0JA 4QUUA 2F6JA 2WP1A 5EWVA 5FG6A 5IG6A 5KHMA 4QZSA 5EVAA 5EK9A 3JVMA 3UVYA 4QSWA 2DATA 5E9IA 4BW1A 5D26A 5EWDA 2DKWA 2DVVA 4PY6A 5ETBA 5IGKA 3QZSA 2OO1A 3U5LA 5LKUA 5FE7A 4QY4A 4WIVA 3DAIA 4LC2A 4Y03A 2R10A 5D3JA 4YBMA 5HM0A 3IU5A 4YY4A 5DY7A 5C7NA 5CQTA 4UYFB 5CUDA 4HXOA 4QR4A 4QC1A 4C67A 4A9KA 4C66A 4LZ2A 4UIXA 5FE0A 2I7KA 4QNSA 4IR6A 5CQ7A 4A9LA 4YH3A 4UITA 5CQ8A 5LJ2A 4N4IA 5IGNA 4BW3A 3SVHA 4HXMA 4YYJA 3HMEA 4J3IA 2L84A 4BW2A 3FKMX 4XY8A 5CUAA 5E73A 5FE9A 5HRWA 4N4GA 5CP5A 5D7XA 5E74A 4NXJA 4MR3A 5CZGA 2R0YA 3U5MA 4QSQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A9FA 3U5OA 4TZ8A 4IOOA 5ENJA 3S92A 5D3RA 5FBXA 4X2IA 5D3PA 4O72A 4XYAA 5EP7A 5LKZA 4CUUA 5FE8A 4A9EA 4QYDA 5TCMA 4UIYA 3P1FA 5FE4A 5CUGA 5G4RA 5CUCA 1WUMA 5FE6A 5A5QA 3Q2FA 1EQFA 3MB4A 3UW9A 4NR7A 5F62A 2RFJA 5E3GA 2FSAA 4QSUA 5EWCA 5AD2A 4J1PA 5CRZA 5D3SA 4N4HA 4OGIA 4MR6A 4F3IA 4HXRA 5CQAA 5A83A 2LSPB 5CQ3A 5A85A 5BT5A 4A9JA 3RCWA 4HXSA 3LQIA 4NR5A 5I40A 2NXBA 5L8TA 4UIZA 5FH7A 4O7CA 5CUEA 3SVFA 4LR6A 2KTBB 4QBMA 4CUSA 3UV2A 4YYNA 4YABA 5IGLA 4QB3A 4UYDA 5AMFA 5CTLA 5FG5A 4LDFA 4KV4A 5I7YA 5I29A 5CUBA 3MUKA 5EU1A 5F61A 5H85A 4MEOA 1ZKRA 5LVQA 5E3DA 5F3AA 4HXPA 4XUBA 4YYMA 5C89A 4BHWA 2RNYA 4BJXA 4N3WA 5EQ1A 5F36A 4AI6A 4CUTA 4YYDA 4LYSA 4QEVA 4CL9A 2R0SA 5CRMA 4YAXA 5BT3A 4NR4A 4YK0A 5DKCA 1JSPB 5CFWA 5DYAA 5BT4A 4QEUA 4E96A 4A9OA 4UYFA 4TT2A 5DYCA 2YDWA 5FG4A 5DW2A 5A7CA 5LUUA 5ENIA 2R0VA 5JWMA 4ALGA 2YQDA 5F5ZA 4Z1SA 2E7OA 5CY9A 4QSPA 4O7EA 5LKXA 4FLPA 4TTEA 3MXFA 5EPRA 5EM3A 2YEKA 4MEQA 4Q0NA 5FE3A 5KO4A 5HELA 4OGJA 2F6NA 5TB6A 5L8UA 1JM4B 5D3LA 3HMFA 4IR5A 4IR3A 3UV4A 3D7CA 5F1HA 5A5OA 3JVLA 4HXKA 3MULA 4HXNA 3VKGA 1E6IA 5C87A 2L85A 4XUAA 5HRVA 4IOQA 2DVSA 4LZRA 4CURA 5F25A 2RI7A 5CGPA 4ZW1A 5HRXA 5DX4A 4NUCA 3P1CA 3U5KA 4YATA 1ZS5A 4A9HA 4TZ2A 4NRBA 5L99A 4HBVA 2E7NA 5CPEA 4YYKA 4Z6IA 4UIWA 4Z93A 5II2A 5FFWA 5IIDA 5F1LA 4N4FA 5DLXA 3ZYUA 3O36A 4UYHA 4WHUA 3ERRA 4O76A 4LYIA 3MB3A 5KTWA 5C8GA 4NQMA 4NUEA 5HFQA 2H60A 5A5SA 2MJVB 5I88A 3MQMA 5KTUA 2OSSA 4QSRA 5LVRA 5L98A 5ENGA 5JI8A 2DVRA 5ACYA 3GG3A 4RVRA 5DBMA 4LYWA 4QSVA 5CU8A 5EA1A 5FDZA 5HFRA 4BW4A 4QR3A 5E9YA 1WUGA 4O70A 4WHWA 3I3JA 5LJ0A 3LJWA 3O34A 5H1TA 4O7AA 2D82A 4AKGA 4KV1A 3AADA 4YC9A 4DONA 4O75A 4UYEA 5A82A 5C85A 5I89A 4MR5A 4NR6A 2WP2A 3NXBA 2RS9B 3LQJA 4O7BA 4Q0OA 4CUPA 3JVJA 5HQ7A 3AQAA 2D9EA 5EV9A 2RO1A 5KTXA 5KU3A 4J0RA 2E3KA 4ZC9A 5A5NA 3UVXA 2GRCA 4HBXA 4YH4A 5F60A 4O78A 4XY9A 5LJ1A 4NR8A 5FE2A 4CFLA 5DW1A 3O37A 5G4SA 4A9IA 5IGMA 5H1UA 5HEMA 5II1A 5EISA 5FFYA 5CQ6A 5EWHA 4IORA 4QSSA 5DKHA 3UV5A 5FB1A 3Q2EA 3UVDA 5HCLA 5C4QA 4QSXA 4J0SA 5DFDA 3DWYA 2G4AA 5HJCA 4HBWA 2YEMA 5D3NA 4NRCA 3D1DA 4IR4A 3IU6A 3U5NA 3P1DA 4YYHA 1X0JA 4TYLA 4YBTA 3JVKA 4TT4A 5ENHA 3VKHA 5H1VA 4QR5A 3U5JA 3HMHA 5IBNA 5AD3A 5ENFA 3UVWA 5ENEA 4NR9A 5I80A 5ENCA 4NS5A 4YBSA 5HENA 5E9MA 4HBYA 4KCXA 4NQNA 5L96A 5EWWA 4TS8A 4CLBA 4CUQA 4PCEA 3U5PA 5L97A 4O7FA 5ENBA 4PCIA 2YW5A 2DVQA 4QEWA 5HLSA 4YYGA 5FE5A 1F68A 2I8NA 4PS5A 5ETDA 2N9GA 4PTBA 5CS8A 4TQNA 5HQ5A 4NYWA 4CFKA 4LRGA 5EGUA 2RNWA 4AKNA 5CQ4A 2OUOA 3QZVA 5K29A 4AKIA 4MEPA 4TU6A 4YADA 5EICA 4MR4A 5A5RA 2DWWA 5I1QA 5DYUA 5FH6A 4MENA 4PKLA 5D3HA 5E9KA 3O35A 4NYXA 5A5PA 4UIVA 3G0LA 5D3TA 4YYIA 3ONIA 5F63A 4QUTA 5AMEA 4HXLA 5A81A 4A9MA 4Z1QA 3LQHA 5D0CA 4ZQLA 3TLPA 5I7XA 5DFCA 5LKTA 4ALHA 4QSTA 4O77A 5COIA 5DYXA 5HQ6A 4TU4A 4AKHA 5E9LA 4LZSA 4NYVA 5EI4A 4A9NA 4QYLA 4O71A 5FH8A 3SVGA 5EPSA 5F2PA 4YY6A 5EPBA 5E9VA 4UIUA 3QZTA 5E7DA 3LXJA 4TT6A 5D25A 5J0DA 4O74A 5I83A 4GPJA 4Z6HA 4UYGA 2RNXA 3O33A 5FE1A 5I86A 2L5EA 2YYNA 3K2JA 5E0RA 3P5OA 4NUDA 5DLZA 3S91A 5DKDA 5DFBA 4NRAA 5CQ5A 5D24A 4QC3A 5FFVA 3P1EA 1N72A 2YELA 4OUFA 5FB0A 3G0JA 4QUUA 2F6JA 2WP1A 5EWVA 5FG6A 5IG6A 5KHMA 4QZSA 5EVAA 5EK9A 3JVMA 3UVYA 4QSWA 2DATA 5E9IA 4BW1A 5D26A 5EWDA 2DKWA 2DVVA 4PY6A 5ETBA 5IGKA 3QZSA 2OO1A 3U5LA 5LKUA 5FE7A 4QY4A 4WIVA 3DAIA 4LC2A 2EJNA 4Y03A 2R10A 5D3JA 4YBMA 5HM0A 3IU5A 4YY4A 5DY7A 5C7NA 5CQTA 4UYFB 1PUOA 5CUDA 4HXOA 4QR4A 4QC1A 4C67A 4A9KA 4C66A 4LZ2A 4UIXA 5FE0A 2I7KA 4QNSA 4IR6A 5CQ7A 4A9LA 4YH3A 4UITA 5CQ8A 5LJ2A 4N4IA 5IGNA 4BW3A 3SVHA 4HXMA 4YYJA 3HMEA 4J3IA 2L84A 4BW2A 3FKMX 4XY8A 5CUAA 5E73A 5FE9A 5HRWA 4N4GA 5CP5A 5D7XA 5E74A 4NXJA 4MR3A 5CZGA 2R0YA 3U5MA 3D1BA 4QSQA
chains in the Genus database with same CATH topology
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