4QSVA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) in complex with thymidine
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Structure-based approaches towards identification of fragments for the low-druggability ATAD2 bromodomain
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 56
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qsvA00
5HRVA 4UYHA 3QZSA 4BHWA 3JVLA 4LYSA 4MR3A 2OUOA 4HXNA 2R0SA 5CUEA 4E96A 4OUFA 4HXLA 3JVJA 4J3IA 4NR6A 4PS5A 5IGKA 1E6IA 2L85A 5E9IA 2I7KA 4UYFA 5CS8A 4C66A 4QEUA 5E0RA 4LZRA 5C8GA 5F63A 4CL9A 5HFRA 5EU1A 5I89A 4YY4A 3U5JA 5L97A 3G0LA 3SVFA 5LKUA 3LQIA 4NR5A 5CQ3A 4NYXA 5E3DA 5EWDA 4YYHA 4KCXA 4NXJA 5LKZA 4QSRA 5FH7A 4IR4A 5CRZA 2E7OA 5CQ6A 4HBYA 3D7CA 5I29A 4TTEA 3NXBA 4YK0A 2RNXA 4YABA 5IGLA 4HXOA 2FSAA 4OGIA 5H1TA 3UVYA 4UIVA 3UVDA 3K2JA 5ENIA 3RCWA 5FE8A 4Z93A 3G0JA 5FFYA 4BW3A 5DKDA 5TB6A 5A5SA 5EPRA 4HXSA 4QSWA 5E9YA 3MB4A 4J0SA 3GG3A 5ENEA 4PCEA 5FG6A 4LDFA 2F6JA 5E74A 2RS9B 1EQFA 5HEMA 5EISA 3AQAA 4HBXA 4IR6A 5DFDA 2N9GA 4CLBA 5BT3A 2DATA 3HMHA 5ENGA 5FFVA 4UIYA 5HM0A 5DYXA 4N4FA 5CY9A 3UV2A 4NYVA 2DVQA 5EICA 4PY6A 5I40A 4N3WA 4F3IA 4LC2A 5EA1A 5EWCA 5LVRA 2YEKA 4N4IA 4YBTA 4IR5A 5CFWA 5IGMA 4MEPA 4WIVA 4QSXA 4UITA 5CQ7A 4N4HA 5FG5A 5CQ4A 4NR9A 5A5NA 3U5NA 5A7CA 5KTUA 5FE4A 5A5PA 3HMFA 5I1QA 5G4RA 4QSVA 5II2A 2H60A 5EWVA 4A9MA 4A9LA 4LR6A 5ENCA 4BJXA 4J1PA 4YH3A 5F25A 4TYLA 4MEQA 4LYIA 4QC1A 4YYDA 5JWMA 5FB0A 5I88A 4PTBA 5TCMA 5DKHA 4YBSA 4CUQA 5CPEA 5E9VA 5BT5A 5I80A 5E7DA 4YC9A 4LYWA 2R0YA 5DW1A 4Z1QA 3O35A 4IR3A 4A9NA 4A9HA 4O7FA 3HMEA 4HXPA 5A5QA 3JVKA 5CUDA 4A9OA 4QNSA 3U5KA 3ONIA 3MQMA 3O37A 3U5LA 4IORA 5LJ0A 5A5OA 4YATA 5DLZA 4QR5A 4QSUA 4RVRA 5HJCA 5D3JA 2OSSA 5ACYA 5F36A 5CQ5A 4IOOA 2OO1A 1F68A 4NUEA 5L99A 4XUBA 5FBXA 5L98A 4O7BA 4QSQA 4Y03A 5FG4A 5HQ7A 5CQ8A 5D3TA 3I3JA 4ZQLA 4NRCA 4Q0OA 4C67A 3UVXA 3P1DA 3Q2EA 5ENJA 5L96A 5D3LA 5EVAA 3IU5A 4O71A 4QEWA 5DBMA 5HRXA 4UIXA 4YYJA 2YQDA 4NR7A 5IGNA 4UYFB 3ZYUA 4QY4A 2RFJA 5HQ5A 3U5PA 5KTWA 4CFLA 5CUGA 4HXKA 4NRBA 4Z1SA 5LVQA 5F1LA 4TS8A 5EWHA 5EI4A 4UIZA 4YBMA 3SVHA 4MR4A 2E7NA 3UVWA 4QSTA 3S92A 5IG6A 5DLXA 5FE2A 5FH8A 2RO1A 4CURA 4NQMA 5D3RA 5F2PA 5C4QA 4LRGA 4QR4A 3UV4A 2DKWA 5I86A 2L84A 1N72A 5FE7A 4HBVA 5DYCA 3S91A 4MR6A 5E3GA 3DWYA 5EPSA 5HFQA 5DX4A 4FLPA 4TU4A 4O72A 4TT6A 5D3PA 3P1CA 4KV4A 5DYUA 2I8NA 3O33A 5HRWA 4O75A 5A85A 3P1FA 2YDWA 4ZC9A 2MJVB 3U5OA 5DY7A 4A9JA 4MENA 3MULA 4YH4A 5L8UA 4O70A 5ENBA 5LJ1A 1X0JA 5I7XA 5LKXA 5CZGA 5CU8A 3LJWA 4QZSA 4XYAA 4TU6A 4A9KA 5LJ2A 4O76A 4UYGA 4QYDA 2D82A 4DONA 5KO4A 5FB1A 5KTXA 3DAIA 5AD3A 4AKNA 5J0DA 4QSPA 2DWWA 2RI7A 4PCIA 3U5MA 5AD2A 5DFBA 2DVRA 4TZ2A 4QBMA 4MR5A 4YYNA 3MXFA 4YYGA 3QZVA 4UIWA 5F62A 3UV5A 3O34A 3Q2FA 5CTLA 5H1UA 5KHMA 5FH6A 5DW2A 4NYWA 4O7CA 4J0RA 4O7AA 4HXMA 5D25A 5E73A 2GRCA 3FKMX 5D3HA 4QB3A 4BW2A 4NR4A 5E9LA 5DFCA 5C89A 5FE1A 5HQ6A 2E3KA 3TLPA 4OGJA 5LUUA 5AMEA 5E9MA 3QZTA 2RNYA 5JI8A 4GPJA 3P1EA 4NS5A 2YEMA 4TT2A 5G4SA 3LQJA 5F60A 4O77A 5C7NA 2G4AA 4ALGA 5CQTA 4QEVA 4CUUA 4IOQA 2NXBA 4YYMA 5I7YA 4KV1A 5CP5A 5DYAA 2YYNA 5DKCA 5IIDA 5D7XA 5HENA 4QC3A 4QSSA 4QUTA 4QYLA 1WUMA 3LQHA 5HCLA 4PKLA 5D3NA 4X2IA 1JM4B 4UYEA 4NR8A 5HLSA 5LKTA 5D0CA 4NUDA 4ALHA 4YADA 2WP1A 5ETDA 4HXRA 4O74A 5ENHA 4CUSA 3JVMA 1WUGA 2DVVA 4WHWA 4YAXA 2R0VA 4TT4A 2F6NA 5EV9A 5I83A 5ENFA 5EM3A 3SVGA 4A9EA 5CGPA 1ZS5A 5F1HA 2L5EA 2YW5A 3MUKA 4A9FA 4O78A 4TZ8A 4Z6IA 5EWWA 5D3SA 3LXJA 5CUCA 5HELA 3AADA 5FFWA 4A9IA 5FE3A 5H1VA 4Z6HA 4HBWA 2RNWA 4XY9A 4NQNA 1JSPB 5EQ1A 5ETBA 5KU3A 4YY6A 4UIUA 5H85A 4XY8A 3O36A 5L8TA 4MEOA 4CUPA 2R10A 4QR3A 5FE6A 5D24A 2D9EA 5A82A 5EPBA 2YELA 5K29A 5EP7A 5F3AA 5CRMA 4XUAA 5F5ZA 2DVSA 5EK9A 5A5RA 3MB3A 5D26A 4LZSA 4TQNA 5A81A 4N4GA 5F61A 5BT4A 5II1A 5CQAA 4Q0NA 4NUCA 5CUAA 5A83A 5AMFA 4BW4A 5FE9A 2LSPB 5C87A 4CFKA 5E9KA 4WHUA 4O7EA 4YYKA 4BW1A 5FE0A 5FDZA 4YYIA 5FE5A 5C85A 3P5OA 2WP2A 4NRAA 4ZW1A 3UW9A 3IU6A 4QUUA 5COIA 4UYDA 2KTBB 5IBNA 5CUBA 5EGUA 4LZ2A 4CUTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRVA 4UYHA 3QZSA 4BHWA 3JVLA 4LYSA 4MR3A 2OUOA 4HXNA 2R0SA 5CUEA 4E96A 4OUFA 4HXLA 3JVJA 4J3IA 4NR6A 4PS5A 5IGKA 1E6IA 1ZKRA 2L85A 5E9IA 1PUOA 2I7KA 4UYFA 5CS8A 4C66A 4QEUA 5E0RA 4LZRA 5C8GA 5F63A 4CL9A 5HFRA 5EU1A 5I89A 4YY4A 3U5JA 5L97A 3G0LA 3SVFA 5LKUA 3LQIA 4NR5A 5CQ3A 4NYXA 5E3DA 5EWDA 4YYHA 4KCXA 4NXJA 5LKZA 4QSRA 5FH7A 4IR4A 5CRZA 2E7OA 5CQ6A 4HBYA 3D7CA 5I29A 4TTEA 3NXBA 4YK0A 2RNXA 4YABA 5IGLA 4HXOA 2FSAA 4OGIA 5H1TA 3UVYA 4UIVA 3UVDA 3K2JA 5ENIA 3RCWA 5FE8A 4Z93A 3G0JA 5FFYA 4BW3A 5DKDA 5TB6A 5A5SA 5EPRA 4HXSA 4QSWA 5E9YA 3MB4A 4J0SA 3GG3A 5ENEA 4PCEA 5FG6A 4LDFA 2F6JA 5E74A 2RS9B 1EQFA 5HEMA 5EISA 3AQAA 4HBXA 4IR6A 5DFDA 2N9GA 4CLBA 5BT3A 2DATA 3HMHA 5ENGA 5FFVA 4UIYA 5HM0A 5DYXA 4N4FA 5CY9A 3UV2A 4NYVA 2DVQA 5EICA 4PY6A 5I40A 4N3WA 4F3IA 4LC2A 5EA1A 5EWCA 5LVRA 2YEKA 4N4IA 4YBTA 4IR5A 5CFWA 5IGMA 4MEPA 4WIVA 4QSXA 4UITA 5CQ7A 4N4HA 5FG5A 5CQ4A 4NR9A 5A5NA 3U5NA 5A7CA 5KTUA 5FE4A 5A5PA 3HMFA 5I1QA 5G4RA 4QSVA 5II2A 2H60A 5EWVA 4A9MA 4A9LA 4LR6A 5ENCA 4BJXA 4J1PA 4YH3A 5F25A 4TYLA 4MEQA 4LYIA 4QC1A 4YYDA 5JWMA 5FB0A 5I88A 4PTBA 4AKGA 5TCMA 5DKHA 4YBSA 4CUQA 5CPEA 5E9VA 5BT5A 5I80A 5E7DA 4YC9A 4LYWA 2R0YA 5DW1A 4Z1QA 3O35A 4IR3A 4A9NA 4A9HA 4O7FA 3HMEA 4HXPA 5A5QA 3JVKA 5CUDA 4A9OA 4QNSA 3U5KA 3ONIA 3MQMA 3O37A 3U5LA 4IORA 5LJ0A 5A5OA 4YATA 5DLZA 4QR5A 4QSUA 4RVRA 5HJCA 5D3JA 2OSSA 5ACYA 5F36A 5CQ5A 4IOOA 2OO1A 1F68A 4NUEA 5L99A 4XUBA 5FBXA 5L98A 4O7BA 4QSQA 4Y03A 5FG4A 5HQ7A 5CQ8A 5D3TA 3I3JA 4ZQLA 4NRCA 4Q0OA 4C67A 3UVXA 3P1DA 3Q2EA 5ENJA 5L96A 5D3LA 5EVAA 3IU5A 4O71A 4QEWA 5DBMA 5HRXA 4UIXA 4YYJA 2YQDA 4NR7A 5IGNA 4UYFB 3ZYUA 4QY4A 2RFJA 5HQ5A 3U5PA 5KTWA 4CFLA 5CUGA 4HXKA 4NRBA 4Z1SA 5LVQA 5F1LA 4TS8A 5EWHA 5EI4A 4UIZA 4YBMA 3SVHA 4MR4A 2E7NA 3UVWA 4QSTA 3S92A 5IG6A 5DLXA 5FE2A 5FH8A 2EJNA 2RO1A 4CURA 4NQMA 5D3RA 5F2PA 5C4QA 4LRGA 4QR4A 3UV4A 2DKWA 5I86A 2L84A 1N72A 5FE7A 4HBVA 4AKHA 5DYCA 3S91A 4MR6A 5E3GA 3DWYA 5EPSA 5HFQA 5DX4A 4FLPA 4TU4A 4O72A 4TT6A 5D3PA 3D1DA 3P1CA 4KV4A 5DYUA 2I8NA 3O33A 5HRWA 4O75A 5A85A 3P1FA 2YDWA 4ZC9A 2MJVB 3U5OA 5DY7A 4A9JA 4MENA 3MULA 4YH4A 5L8UA 4O70A 5ENBA 5LJ1A 1X0JA 5I7XA 5LKXA 5CZGA 4AKIA 5CU8A 3LJWA 4QZSA 4XYAA 4TU6A 4A9KA 5LJ2A 3VKGA 4O76A 4UYGA 4QYDA 2D82A 4DONA 5KO4A 5FB1A 5KTXA 3DAIA 5AD3A 4AKNA 5J0DA 4QSPA 2DWWA 2RI7A 4PCIA 3U5MA 3ERRA 5DFBA 5AD2A 2DVRA 4TZ2A 4QBMA 4MR5A 4YYNA 3MXFA 4YYGA 3QZVA 4UIWA 5F62A 3UV5A 3O34A 3Q2FA 5CTLA 5H1UA 5KHMA 5FH6A 5DW2A 4NYWA 4O7CA 4J0RA 4O7AA 4HXMA 5D25A 5E73A 2GRCA 3FKMX 5D3HA 4QB3A 4BW2A 4NR4A 5E9LA 5DFCA 5C89A 5FE1A 5HQ6A 2E3KA 3TLPA 4OGJA 5LUUA 5AMEA 5E9MA 3QZTA 2RNYA 5JI8A 4GPJA 3P1EA 4NS5A 2YEMA 4TT2A 5G4SA 3LQJA 5F60A 4O77A 5C7NA 2G4AA 4ALGA 5CQTA 4QEVA 4CUUA 4IOQA 3VKHA 2NXBA 4YYMA 5I7YA 4KV1A 5CP5A 5DYAA 2YYNA 5DKCA 5IIDA 5D7XA 5HENA 4QC3A 4QSSA 4QUTA 4QYLA 1WUMA 3LQHA 5HCLA 4PKLA 5D3NA 4X2IA 1JM4B 4UYEA 4NR8A 5HLSA 5LKTA 5D0CA 4NUDA 4ALHA 4YADA 2WP1A 5ETDA 4HXRA 4O74A 5ENHA 4CUSA 3JVMA 1WUGA 2DVVA 4WHWA 4YAXA 2R0VA 4TT4A 2F6NA 5EV9A 5I83A 5ENFA 5EM3A 3SVGA 4A9EA 5CGPA 1ZS5A 5F1HA 2L5EA 2YW5A 3MUKA 4A9FA 4O78A 4TZ8A 4Z6IA 5EWWA 5D3SA 3LXJA 5CUCA 5HELA 4AI6A 3AADA 5FFWA 4A9IA 5FE3A 5H1VA 4Z6HA 4HBWA 2RNWA 4XY9A 3D1BA 4NQNA 1JSPB 5EQ1A 5ETBA 5KU3A 4YY6A 4UIUA 5H85A 4XY8A 3O36A 5L8TA 4MEOA 4CUPA 2R10A 4QR3A 5FE6A 5D24A 2D9EA 5A82A 5EPBA 2YELA 5K29A 5EP7A 5F3AA 5CRMA 4XUAA 5F5ZA 2DVSA 5EK9A 5A5RA 3MB3A 5D26A 4LZSA 4TQNA 5A81A 4N4GA 5F61A 5BT4A 5II1A 5CQAA 4Q0NA 4NUCA 5CUAA 5A83A 5AMFA 4BW4A 5FE9A 2LSPB 5C87A 4CFKA 5E9KA 4WHUA 4O7EA 4YYKA 4BW1A 5FE0A 5FDZA 4YYIA 5FE5A 5C85A 3P5OA 2WP2A 4NRAA 4ZW1A 3UW9A 3IU6A 4QUUA 5COIA 4UYDA 2KTBB 5IBNA 5CUBA 5EGUA 4LZ2A 4CUTA
chains in the Genus database with same CATH topology
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