4QUTA

Structure of the bromodomain of human atpase family aaa domain-containing protein 2 (atad2) complexed with histone h4-k(ac)12
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Atad2 is a generalist facilitator of chromatin dynamics in embryonic stem cells.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-07-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4qutA00
5F60A 4QSQA 5FBXA 2I7KA 4YYGA 4QEWA 4UYEA 5I89A 1JM4B 4YBMA 4LYSA 3G0JA 5L96A 4HBVA 5CUBA 5E9LA 5LJ2A 4NR7A 4BW4A 1WUGA 4PKLA 2FSAA 5EV9A 4ALHA 5FE8A 4A9HA 3MUKA 5AMFA 3HMEA 5I86A 5C85A 4ZC9A 3AQAA 4YATA 5CS8A 3ZYUA 4TU6A 5ETDA 4IOQA 3AADA 3FKMX 4MEPA 4LZ2A 4HXNA 4XUBA 3UV4A 2KTBB 4NRCA 4QEUA 1WUMA 4UYFB 5COIA 5DLXA 2WP2A 4NYVA 4LZSA 4UITA 4IR3A 5A81A 5HQ6A 4NR4A 2YEMA 3UVYA 2RNWA 3Q2EA 3K2JA 4YYKA 5A85A 3HMHA 4YH3A 2E7NA 5D3LA 5EWVA 4J0SA 3UV5A 4ALGA 2RNYA 4Q0OA 5F3AA 4UIVA 2YEKA 4PS5A 5CP5A 4AKNA 4O7AA 5LJ1A 2DVQA 4CFLA 4E96A 4MR6A 5D25A 2LSPB 5DYUA 4CURA 5D24A 4HBYA 5DLZA 4QYLA 5FDZA 4O7BA 5CFWA 5TB6A 5JI8A 4LR6A 4HBWA 5AD3A 4CUQA 5FE4A 5FB1A 5ENCA 4J1PA 5HRWA 5ENJA 5E9KA 4QSPA 4QSXA 5FG4A 5ENEA 4BHWA 4LYIA 5ENGA 3P1CA 5EPSA 4QY4A 5D3PA 3JVKA 5H1VA 4UYGA 5KTXA 2L5EA 4NR5A 4YYNA 5DFDA 4QSTA 4LC2A 3LQJA 4QEVA 5I1QA 5CUDA 5ACYA 4A9EA 2WP1A 5A5NA 4IORA 4PY6A 5KTUA 2DVVA 5A82A 4O7EA 5II1A 4QSWA 3O36A 5LKTA 5F36A 5FFVA 5G4RA 5F62A 4MR3A 2RNXA 5CZGA 5LJ0A 2L84A 4TT4A 4MENA 4TZ8A 5L98A 5A7CA 5DYXA 5FG5A 3U5LA 2DVRA 4A9MA 4ZQLA 3LXJA 4N4FA 5BT3A 4QSVA 5HFQA 4YC9A 4NR9A 4UIXA 4J0RA 4Z93A 4KV1A 4O7FA 5EICA 5I29A 3SVFA 3D7CA 5A5PA 3LJWA 3O34A 4Y03A 4N4GA 5DFBA 5C4QA 5F1LA 4QC3A 4UIUA 4QSUA 5ENIA 5D3TA 5F25A 5F5ZA 3JVLA 4IOOA 4QYDA 4A9JA 4CFKA 5E9MA 1X0JA 3SVHA 5CRMA 5CGPA 5HFRA 4QC1A 5CU8A 4PCEA 5CQTA 5FE0A 3P1EA 4O74A 4NUCA 5E9YA 2YELA 5EK9A 3UW9A 5EM3A 5FE1A 5G4SA 3JVMA 3MB4A 4CUTA 3QZSA 5C87A 5FG6A 5FH6A 3MQMA 5ENBA 3UVWA 5HRVA 4NUDA 1N72A 5ETBA 4UIYA 5EISA 3LQHA 4HXLA 4A9KA 3P5OA 5CQ8A 5EWWA 3RCWA 4BW2A 5KU3A 4A9IA 5D3HA 3TLPA 4NUEA 3U5NA 4ZW1A 5CPEA 3MB3A 2E3KA 5I88A 5HM0A 2F6NA 5D3SA 4TZ2A 4Q0NA 5L8UA 5EP7A 5E9VA 5DY7A 5I80A 5IBNA 3DWYA 4YYDA 5IG6A 4QSSA 2N9GA 4QUTA 5E74A 5I40A 2GRCA 4HXKA 4XYAA 4UIWA 5D7XA 4F3IA 5AD2A 5DKDA 5EPRA 5DW2A 5ENHA 5H1UA 4NXJA 5TCMA 2YYNA 5EVAA 5A83A 4MEOA 4O70A 5LKZA 5KTWA 5LKXA 5CQAA 2NXBA 4HXMA 5A5RA 5IGLA 5K29A 4Z1QA 5DBMA 3MXFA 5HEMA 3UV2A 5HELA 2DKWA 3S92A 5E7DA 5FH8A 5EI4A 5HRXA 5CUEA 4CUSA 3HMFA 4GPJA 4IR5A 4OGJA 2RO1A 5BT5A 5ENFA 4NR8A 4QZSA 5EPBA 4CL9A 4WHWA 4O78A 4Z1SA 3SVGA 4O76A 5EWCA 5E3GA 4KCXA 4QUUA 5DKCA 5FE3A 3P1FA 1E6IA 3O33A 5DFCA 5D3NA 4CUUA 5FE2A 5HCLA 4A9LA 5EU1A 5FE5A 5EGUA 5EA1A 4TS8A 4RVRA 5DX4A 4QNSA 4C66A 4N4IA 5F61A 5CRZA 3S91A 5II2A 3I3JA 4YAXA 4YYHA 5I7YA 5CQ5A 2DATA 4LZRA 3U5PA 3DAIA 2G4AA 4XY8A 4QSRA 4TU4A 5IIDA 5I83A 2YW5A 4UYFA 4YBSA 3P1DA 4KV4A 5A5OA 5HLSA 4O75A 3UVXA 5D26A 5E9IA 4BW1A 4QR4A 4N4HA 4A9FA 5A5SA 4CUPA 5FH7A 5HJCA 4Z6HA 2L85A 5IGKA 3Q2FA 4Z6IA 5LVRA 4FLPA 4UYDA 4HXSA 5HQ5A 4O77A 5A5QA 4NR6A 2YDWA 4UIZA 5CQ7A 2R0YA 3U5MA 2R10A 4TYLA 5AMEA 2D9EA 2YQDA 4PTBA 2D82A 5IGNA 5DYAA 5BT4A 4UYHA 4XY9A 5DW1A 3GG3A 5DKHA 5L99A 3UVDA 5E73A 5FB0A 1JSPB 5E3DA 5LVQA 3NXBA 4IR4A 3O35A 4MR5A 5D0CA 4NQNA 4QR5A 3ONIA 3MULA 5CUCA 2MJVB 4TQNA 5LKUA 4MR4A 5E0RA 5EWDA 2I8NA 2R0VA 5H85A 5C8GA 5FE9A 5CQ4A 2H60A 4YABA 4NS5A 5CUGA 5F63A 3U5OA 2RI7A 5L8TA 5D3JA 3O37A 1F68A 5LUUA 4LRGA 5HQ7A 4BJXA 4DONA 4NRBA 4OGIA 2E7OA 4YYMA 2RFJA 4NQMA 5FE6A 4WHUA 5F2PA 4YY6A 4PCIA 5C7NA 2F6JA 4LDFA 5FE7A 4C67A 2DWWA 3QZVA 4O71A 4X2IA 5IGMA 5D3RA 5EQ1A 2OUOA 3IU5A 4XUAA 4YADA 4QR3A 2R0SA 1ZS5A 2OSSA 4TTEA 5J0DA 4MEQA 5C89A 5FFWA 3QZTA 4QB3A 2OO1A 4BW3A 3U5JA 4NYWA 4QBMA 5KO4A 4CLBA 5CUAA 4NRAA 3JVJA 4A9OA 5F1HA 3IU6A 4O7CA 5EWHA 4A9NA 4HXRA 4HXOA 4YYIA 5JWMA 1EQFA 5I7XA 4HBXA 5L97A 3G0LA 5KHMA 5H1TA 2DVSA 4HXPA 4LYWA 3U5KA 4TT6A 5DYCA 5CQ6A 2RS9B 4J3IA 5CQ3A 4IR6A 4OUFA 4YK0A 5CTLA 4TT2A 5FFYA 4NYXA 4O72A 4N3WA 4YH4A 5HENA 4YYJA 4WIVA 4YY4A 4YBTA 5CY9A 3LQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F60A 4QSQA 5FBXA 2I7KA 4YYGA 4QEWA 4UYEA 5I89A 1JM4B 4YBMA 4LYSA 3G0JA 5L96A 4HBVA 5CUBA 5E9LA 5LJ2A 4NR7A 4BW4A 1WUGA 4PKLA 2FSAA 5EV9A 4ALHA 5FE8A 4A9HA 3MUKA 5AMFA 3HMEA 5I86A 5C85A 4ZC9A 3AQAA 4YATA 5CS8A 3ZYUA 4TU6A 5ETDA 4IOQA 3AADA 3FKMX 4MEPA 4LZ2A 2EJNA 4HXNA 4XUBA 3UV4A 2KTBB 4NRCA 4QEUA 1WUMA 4UYFB 5COIA 5DLXA 2WP2A 4NYVA 4LZSA 4UITA 4IR3A 5A81A 5HQ6A 4NR4A 2YEMA 3UVYA 2RNWA 3Q2EA 3K2JA 4YYKA 5A85A 3HMHA 4YH3A 2E7NA 5D3LA 5EWVA 4J0SA 3UV5A 4ALGA 2RNYA 4Q0OA 5F3AA 4UIVA 2YEKA 4PS5A 5CP5A 1ZKRA 4AKNA 4O7AA 5LJ1A 2DVQA 4CFLA 4E96A 4MR6A 5D25A 2LSPB 5DYUA 4CURA 5D24A 4HBYA 5DLZA 3VKHA 4QYLA 5FDZA 4O7BA 5CFWA 5TB6A 5JI8A 4LR6A 4HBWA 5AD3A 4CUQA 5FE4A 5FB1A 5ENCA 4J1PA 5HRWA 5ENJA 5E9KA 4QSPA 4QSXA 5FG4A 5ENEA 4BHWA 4LYIA 5ENGA 3P1CA 5EPSA 4QY4A 5D3PA 3JVKA 5H1VA 4UYGA 5KTXA 2L5EA 4NR5A 4YYNA 5DFDA 4QSTA 4LC2A 3LQJA 4QEVA 5I1QA 5CUDA 5ACYA 4A9EA 2WP1A 5A5NA 4IORA 4PY6A 5KTUA 2DVVA 5A82A 4O7EA 5II1A 4QSWA 3O36A 5LKTA 5F36A 5FFVA 5G4RA 5F62A 4MR3A 2RNXA 5CZGA 5LJ0A 2L84A 4TT4A 4MENA 4TZ8A 5L98A 3ERRA 5A7CA 3VKGA 5DYXA 5FG5A 3U5LA 2DVRA 4A9MA 4ZQLA 3LXJA 4N4FA 5BT3A 4QSVA 5HFQA 4YC9A 4NR9A 4UIXA 4J0RA 4Z93A 4KV1A 4O7FA 5EICA 5I29A 3SVFA 3D7CA 5A5PA 3LJWA 3O34A 4Y03A 4N4GA 5DFBA 5C4QA 5F1LA 4QC3A 4UIUA 4QSUA 5ENIA 5D3TA 5F25A 5F5ZA 3JVLA 4IOOA 4QYDA 4A9JA 4CFKA 5E9MA 1X0JA 3SVHA 5CRMA 5CGPA 5HFRA 4QC1A 5CU8A 4PCEA 5CQTA 5FE0A 3P1EA 4O74A 4NUCA 5E9YA 2YELA 5EK9A 3UW9A 5EM3A 5FE1A 5G4SA 3JVMA 3MB4A 4CUTA 3QZSA 5C87A 5FG6A 5FH6A 3MQMA 5ENBA 3UVWA 5HRVA 4NUDA 1N72A 5ETBA 4UIYA 5EISA 3LQHA 4HXLA 4A9KA 3P5OA 5CQ8A 5EWWA 3RCWA 4BW2A 5KU3A 4A9IA 5D3HA 3TLPA 4NUEA 3U5NA 4ZW1A 5CPEA 3MB3A 2E3KA 5I88A 5HM0A 2F6NA 5D3SA 4TZ2A 4Q0NA 5L8UA 5EP7A 5E9VA 5DY7A 5I80A 3D1BA 5IBNA 3DWYA 4YYDA 5IG6A 4QSSA 4AKGA 2N9GA 4QUTA 5E74A 5I40A 2GRCA 4HXKA 4XYAA 4UIWA 5D7XA 4F3IA 5AD2A 5DKDA 5EPRA 5DW2A 5ENHA 5H1UA 4NXJA 5TCMA 2YYNA 5EVAA 5A83A 4MEOA 4O70A 5LKZA 5KTWA 5LKXA 5CQAA 2NXBA 4HXMA 5A5RA 5IGLA 5K29A 4Z1QA 5DBMA 3MXFA 5HEMA 3UV2A 5HELA 2DKWA 3S92A 5E7DA 5FH8A 5EI4A 5HRXA 5CUEA 4CUSA 3HMFA 4GPJA 4IR5A 4OGJA 2RO1A 5BT5A 5ENFA 4NR8A 4QZSA 5EPBA 4CL9A 4WHWA 4O78A 4Z1SA 3SVGA 4O76A 5EWCA 5E3GA 4KCXA 4QUUA 5DKCA 5FE3A 3P1FA 4AKHA 1E6IA 3O33A 5DFCA 5D3NA 4CUUA 5FE2A 5HCLA 4A9LA 5EU1A 5FE5A 5EGUA 5EA1A 4TS8A 4RVRA 5DX4A 4QNSA 4C66A 4N4IA 5F61A 5CRZA 3S91A 5II2A 3I3JA 4YAXA 4YYHA 5I7YA 5CQ5A 2DATA 4LZRA 3U5PA 3DAIA 2G4AA 4XY8A 4QSRA 4TU4A 5IIDA 5I83A 2YW5A 4UYFA 4YBSA 3P1DA 4KV4A 1PUOA 5A5OA 5HLSA 4O75A 3UVXA 5D26A 5E9IA 4BW1A 4QR4A 4N4HA 4A9FA 5A5SA 4CUPA 5FH7A 5HJCA 4Z6HA 2L85A 5IGKA 3Q2FA 4Z6IA 5LVRA 4FLPA 4UYDA 4HXSA 5HQ5A 4O77A 5A5QA 4NR6A 2YDWA 4UIZA 5CQ7A 2R0YA 3U5MA 2R10A 4TYLA 5AMEA 2D9EA 2YQDA 4PTBA 2D82A 5IGNA 5DYAA 5BT4A 4UYHA 4XY9A 5DW1A 3GG3A 5DKHA 5L99A 3UVDA 5E73A 5FB0A 1JSPB 5E3DA 5LVQA 3NXBA 4IR4A 3O35A 4MR5A 5D0CA 4NQNA 3D1DA 4QR5A 3ONIA 3MULA 5CUCA 2MJVB 4TQNA 5LKUA 4MR4A 5E0RA 5EWDA 2I8NA 2R0VA 5H85A 5C8GA 5FE9A 5CQ4A 2H60A 4YABA 4NS5A 5CUGA 5F63A 3U5OA 2RI7A 5L8TA 5D3JA 3O37A 1F68A 5LUUA 4LRGA 5HQ7A 4BJXA 4DONA 4NRBA 4OGIA 2E7OA 4YYMA 2RFJA 4NQMA 5FE6A 4WHUA 5F2PA 4YY6A 4PCIA 5C7NA 2F6JA 4LDFA 5FE7A 4C67A 2DWWA 3QZVA 4O71A 4X2IA 5IGMA 5D3RA 5EQ1A 2OUOA 3IU5A 4XUAA 4YADA 4QR3A 2R0SA 1ZS5A 2OSSA 4TTEA 5J0DA 4MEQA 5C89A 5FFWA 3QZTA 4QB3A 2OO1A 4BW3A 3U5JA 4NYWA 4QBMA 5KO4A 4CLBA 5CUAA 4NRAA 3JVJA 4A9OA 5F1HA 3IU6A 4O7CA 5EWHA 4AKIA 4A9NA 4HXRA 4HXOA 4YYIA 5JWMA 1EQFA 5I7XA 4HBXA 5L97A 4AI6A 3G0LA 5KHMA 5H1TA 2DVSA 4HXPA 4LYWA 3U5KA 4TT6A 5DYCA 5CQ6A 2RS9B 4J3IA 5CQ3A 4IR6A 4OUFA 4YK0A 5CTLA 4TT2A 5FFYA 4NYXA 4O72A 4N3WA 4YH4A 5HENA 4YYJA 4WIVA 4YY4A 4YBTA 5CY9A 3LQIA
chains in the Genus database with same CATH topology
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