4TTEA

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with methyl 3-amino-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzoate
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Gene regulation
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tteA00
4O76A 5D26A 4NR8A 4O7CA 3SVHA 5ENCA 5L8UA 2NXBA 5IGNA 4UYEA 1JM4B 4BW2A 4YBMA 3UV2A 5CFWA 5F62A 4QR3A 4QSPA 3DAIA 4UIVA 4XUBA 4CL9A 4NR7A 5IG6A 3IU6A 4E96A 4TZ8A 5D0CA 4Q0NA 4XUAA 5HEMA 5CUDA 3P1CA 5KU3A 5I7XA 5F61A 5E0RA 4YY6A 4YYDA 2I8NA 5C8GA 5HQ5A 4CFKA 3O37A 5COIA 4Z1SA 5FFYA 4HBWA 5I83A 4BJXA 3U5MA 5CQ6A 3SVGA 3K2JA 3FKMX 3O33A 5EWWA 5C4QA 4YK0A 5ENJA 5CP5A 4X2IA 4CLBA 4QR4A 5EWVA 5I80A 5FH8A 5I88A 5DYAA 3D7CA 4O7AA 5F63A 5HRWA 5DKHA 5E74A 5FE1A 5DY7A 4FLPA 4LZ2A 5CUGA 2YYNA 4YATA 5D3TA 5F3AA 3HMFA 4DONA 3LQIA 5IIDA 4XY8A 4CUTA 4MEQA 2RI7A 3MXFA 4Z93A 3AADA 4IR4A 4UYGA 5CPEA 3JVJA 5CQ8A 3O34A 5EQ1A 5EPSA 4N4IA 5CY9A 1WUGA 2RFJA 4MR3A 5LKXA 5F25A 2OSSA 4YH3A 3O36A 3UV5A 4LYWA 4HXSA 5F60A 4YBSA 4NR6A 4UYDA 3U5LA 4YYIA 4KCXA 4J3IA 2G4AA 5E9LA 4YC9A 4YBTA 4CUUA 4NYVA 4UIXA 4TTEA 5FE7A 5IBNA 2D82A 5JWMA 5E3DA 4BHWA 4NRCA 5CUCA 3U5JA 2MJVB 5CQAA 5BT3A 3ZYUA 4A9HA 4YYNA 4O74A 3ONIA 5FE2A 2R0SA 4HXRA 5CRMA 5IGLA 2GRCA 4IR5A 5E7DA 3MB3A 4HXPA 4Z1QA 5LUUA 1X0JA 4TS8A 4MEPA 3QZSA 5F1LA 5CQ7A 4CUSA 5AD2A 5DW2A 4IR6A 5LJ1A 5E9YA 4ZW1A 5CQTA 5EV9A 4BW4A 5HQ6A 5LVQA 2R10A 5L97A 4ALHA 5DLXA 5EK9A 5G4RA 5DYUA 4Z6HA 4QBMA 2D9EA 3NXBA 5HQ7A 5AD3A 4A9JA 2RNYA 4QUTA 2YEKA 4QY4A 5ENGA 5ENIA 5EVAA 5EP7A 4UIZA 4IOQA 4TYLA 5HJCA 5D3JA 5D25A 5KTUA 4O75A 2RS9B 2OO1A 5CQ5A 5EGUA 2WP2A 5F36A 5CZGA 3QZTA 4OGIA 4KV4A 4QC3A 5D3NA 5TCMA 3SVFA 4LZSA 4UYHA 4NR9A 5FE0A 3LJWA 4HXNA 5EWCA 4N4HA 3RCWA 5A83A 1EQFA 4N3WA 5H1UA 4TT6A 4HXKA 5EI4A 3LQJA 4WIVA 5C85A 3U5PA 5CTLA 3P1FA 2DWWA 5EU1A 2DVRA 3U5NA 4LZRA 5H1VA 3UVXA 5ACYA 5KO4A 4NUDA 3QZVA 3DWYA 4XYAA 4O7BA 3UVYA 5EA1A 4A9LA 4YABA 2I7KA 5AMEA 2E7NA 2YW5A 4PKLA 3MQMA 3O35A 4YAXA 2YQDA 3Q2EA 4KV1A 2YEMA 4GPJA 4NYWA 5TB6A 5DFDA 5CUAA 2L84A 5L96A 4MEOA 5D3LA 5ENFA 4NR4A 4PCEA 2L5EA 4WHWA 4LRGA 5D24A 3MUKA 5JI8A 4QC1A 5C87A 4A9FA 2YELA 5DX4A 4A9OA 4QNSA 5C7NA 4QSWA 4YH4A 5F5ZA 4Q0OA 4NYXA 4NQMA 5FH6A 4QR5A 5I7YA 2DVVA 3U5OA 5FE8A 4PS5A 5FE5A 4NR5A 1N72A 5ENHA 4UYFB 4QYDA 3G0LA 5DFBA 4BW1A 5DYXA 3S91A 5C89A 5FB1A 4IOOA 2YDWA 3TLPA 5BT5A 4LDFA 4J1PA 4BW3A 5E73A 5AMFA 5F2PA 4CURA 5FG4A 5HFQA 4PTBA 5LJ0A 4LYSA 5E9MA 2DVSA 5K29A 5A5OA 4NUEA 5E9KA 2OUOA 3AQAA 2RNXA 3JVLA 4MR6A 2WP1A 4QEUA 4TQNA 4YYJA 4UIYA 4XY9A 3UV4A 4CUPA 5G4SA 3G0JA 4A9MA 5A5RA 5FG6A 3P1EA 4OGJA 4QSVA 5A82A 5FBXA 3S92A 5DLZA 5CQ3A 4N4FA 5A85A 5A5QA 4N4GA 5D3RA 5HRXA 4HBXA 5KTXA 5ENEA 5DW1A 2KTBB 4TU4A 3P5OA 3Q2FA 5DBMA 3LXJA 4YYKA 1WUMA 4J0SA 4NRAA 2FSAA 4NS5A 3LQHA 5FFWA 5FG5A 5HM0A 3IU5A 5CRZA 4O71A 4HXOA 2DVQA 4RVRA 4PCIA 5H1TA 5HCLA 5E9IA 5CUEA 4QSUA 5FH7A 4YYHA 4QYLA 3MULA 5EPRA 5HLSA 5FDZA 5IGMA 5HENA 4A9KA 5F1HA 4C67A 4HXMA 4NUCA 4ZQLA 5J0DA 4WHUA 2R0VA 4NXJA 4O78A 5I1QA 5II2A 4TU6A 2N9GA 5FE6A 4CUQA 2F6JA 5LJ2A 5CGPA 2L85A 5I86A 4Z6IA 4Y03A 4LR6A 4OUFA 2DKWA 4HXLA 4UIWA 5DKDA 5EWHA 5E9VA 3JVKA 5A5SA 2LSPB 5D3PA 5FE9A 5FB0A 5E3GA 4QB3A 4TZ2A 5BT4A 4UIUA 2F6NA 5CQ4A 5A5PA 5FFVA 5DFCA 2E7OA 4O70A 4HBYA 5HRVA 5EISA 5FE3A 2R0YA 5L98A 4QSRA 5H85A 4UYFA 4HBVA 5ETBA 5A81A 2E3KA 3JVMA 4QSSA 4ZC9A 4TT4A 4QSXA 5A5NA 4AKNA 5EICA 1F68A 4IR3A 5D7XA 4C66A 5LKZA 5ETDA 5EWDA 3GG3A 4MR4A 4J0RA 1JSPB 4YY4A 5EPBA 5II1A 4PY6A 5CUBA 4O72A 4YADA 4MR5A 4NQNA 4UITA 3UVDA 5IGKA 5CS8A 5HELA 4A9EA 5KTWA 5I29A 5KHMA 5A7CA 4YYMA 5ENBA 4QZSA 4O7EA 2DATA 4O7FA 4QEWA 4ALGA 3HMHA 4QEVA 5DYCA 5EM3A 5FE4A 3HMEA 3U5KA 5D3HA 5HFRA 4O77A 5I89A 4NRBA 4A9NA 4QUUA 4TT2A 3MB4A 3UVWA 4A9IA 4QSTA 2RNWA 4LC2A 4YYGA 4MENA 5L99A 3P1DA 1E6IA 5L8TA 5D3SA 3UW9A 2H60A 5LVRA 4F3IA 4QSQA 4CFLA 5LKTA 4LYIA 2RO1A 4IORA 5LKUA 1ZS5A 5DKCA 3I3JA 5CU8A 5I40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O76A 5D26A 4NR8A 4O7CA 3SVHA 5ENCA 5L8UA 2NXBA 5IGNA 4UYEA 1JM4B 4BW2A 4YBMA 3UV2A 5CFWA 3D1DA 5F62A 4QR3A 4QSPA 3DAIA 4UIVA 4XUBA 4CL9A 4NR7A 5IG6A 3IU6A 4E96A 4TZ8A 5D0CA 4Q0NA 4XUAA 5HEMA 5CUDA 3P1CA 5KU3A 5I7XA 5F61A 5E0RA 4YY6A 4YYDA 2I8NA 5C8GA 5HQ5A 4CFKA 3O37A 5COIA 4Z1SA 5FFYA 4HBWA 5I83A 4BJXA 3U5MA 5CQ6A 3SVGA 3K2JA 3FKMX 3O33A 5EWWA 5C4QA 4YK0A 5ENJA 5CP5A 4X2IA 4CLBA 4QR4A 5EWVA 5I80A 5FH8A 5I88A 5DYAA 3D7CA 4O7AA 5F63A 5HRWA 5DKHA 5E74A 5FE1A 5DY7A 4FLPA 4LZ2A 5CUGA 2YYNA 4YATA 5D3TA 5F3AA 3HMFA 4DONA 3LQIA 5IIDA 4XY8A 4CUTA 4MEQA 2RI7A 3MXFA 4Z93A 3AADA 4IR4A 4UYGA 5CPEA 3VKGA 3JVJA 5CQ8A 3O34A 5EQ1A 5EPSA 4N4IA 5CY9A 1WUGA 2RFJA 4MR3A 5LKXA 4AI6A 5F25A 2OSSA 4YH3A 3O36A 3UV5A 4LYWA 4HXSA 5F60A 4YBSA 4NR6A 4UYDA 3U5LA 4YYIA 4KCXA 4J3IA 2G4AA 5E9LA 4YC9A 4YBTA 3D1BA 4CUUA 4NYVA 4UIXA 4TTEA 5FE7A 5IBNA 2D82A 5JWMA 5E3DA 4BHWA 4NRCA 5CUCA 3U5JA 2MJVB 5CQAA 5BT3A 3ZYUA 4A9HA 4YYNA 4O74A 3ONIA 5FE2A 2R0SA 4HXRA 5CRMA 5IGLA 2GRCA 4IR5A 5E7DA 3VKHA 3MB3A 4AKHA 4HXPA 4Z1QA 5LUUA 1X0JA 4TS8A 4MEPA 3QZSA 5F1LA 5CQ7A 4CUSA 5AD2A 5DW2A 4IR6A 5LJ1A 5E9YA 4ZW1A 5CQTA 5EV9A 4BW4A 5HQ6A 5LVQA 2R10A 5L97A 4ALHA 5DLXA 5EK9A 5G4RA 5DYUA 4Z6HA 4QBMA 2D9EA 3NXBA 5HQ7A 5AD3A 4A9JA 2RNYA 4QUTA 3ERRA 2YEKA 4QY4A 5ENGA 5ENIA 5EVAA 5EP7A 4UIZA 4IOQA 4TYLA 5HJCA 5D3JA 5D25A 5KTUA 4O75A 2RS9B 2OO1A 5CQ5A 5EGUA 2WP2A 5F36A 5CZGA 3QZTA 4OGIA 4KV4A 4QC3A 5D3NA 5TCMA 3SVFA 4LZSA 4UYHA 4NR9A 5FE0A 3LJWA 4HXNA 5EWCA 4N4HA 3RCWA 5A83A 1EQFA 4N3WA 5H1UA 4TT6A 4HXKA 5EI4A 1ZKRA 3LQJA 4WIVA 5C85A 3U5PA 5CTLA 3P1FA 2DWWA 5EU1A 2DVRA 3U5NA 4LZRA 5H1VA 3UVXA 5ACYA 5KO4A 4NUDA 3QZVA 3DWYA 4XYAA 4O7BA 3UVYA 5EA1A 4A9LA 4YABA 2I7KA 5AMEA 2E7NA 2YW5A 4PKLA 3MQMA 3O35A 2EJNA 4YAXA 2YQDA 3Q2EA 4KV1A 2YEMA 4GPJA 4NYWA 5TB6A 5DFDA 5CUAA 2L84A 5L96A 4MEOA 5D3LA 5ENFA 4NR4A 4PCEA 2L5EA 4WHWA 4LRGA 5D24A 3MUKA 5JI8A 4QC1A 5C87A 4A9FA 2YELA 5DX4A 4A9OA 4QNSA 5C7NA 4QSWA 4YH4A 5F5ZA 4Q0OA 4NYXA 4NQMA 5FH6A 4QR5A 5I7YA 2DVVA 3U5OA 5FE8A 4PS5A 5FE5A 4NR5A 1N72A 5ENHA 4UYFB 4QYDA 3G0LA 5DFBA 4BW1A 5DYXA 3S91A 5C89A 5FB1A 4IOOA 2YDWA 3TLPA 5BT5A 4LDFA 4J1PA 4BW3A 5E73A 5AMFA 5F2PA 4CURA 5FG4A 5HFQA 4PTBA 5LJ0A 4LYSA 5E9MA 2DVSA 5K29A 5A5OA 4NUEA 5E9KA 2OUOA 3AQAA 2RNXA 3JVLA 4MR6A 2WP1A 4QEUA 4TQNA 4YYJA 4UIYA 4XY9A 3UV4A 4CUPA 5G4SA 3G0JA 4A9MA 5A5RA 5FG6A 3P1EA 4OGJA 4QSVA 5A82A 5FBXA 3S92A 5DLZA 5CQ3A 4N4FA 5A85A 5A5QA 4N4GA 5D3RA 5HRXA 4HBXA 5KTXA 5ENEA 5DW1A 2KTBB 4TU4A 3P5OA 3Q2FA 5DBMA 3LXJA 4YYKA 1WUMA 4J0SA 4NRAA 2FSAA 4NS5A 3LQHA 5FFWA 5FG5A 5HM0A 3IU5A 5CRZA 4O71A 4HXOA 2DVQA 4RVRA 4PCIA 5H1TA 5HCLA 5E9IA 5CUEA 4QSUA 5FH7A 4YYHA 4QYLA 3MULA 5EPRA 5HLSA 5FDZA 5IGMA 5HENA 4A9KA 5F1HA 4C67A 4HXMA 4NUCA 4ZQLA 5J0DA 4WHUA 2R0VA 4NXJA 4O78A 5I1QA 5II2A 4TU6A 2N9GA 5FE6A 4CUQA 2F6JA 5LJ2A 5CGPA 2L85A 5I86A 4Z6IA 4Y03A 4LR6A 4OUFA 2DKWA 4HXLA 4UIWA 5DKDA 5EWHA 5E9VA 3JVKA 5A5SA 2LSPB 4AKIA 5D3PA 5FE9A 5FB0A 5E3GA 4QB3A 4TZ2A 5BT4A 4UIUA 2F6NA 5CQ4A 5A5PA 5FFVA 5DFCA 2E7OA 4O70A 4HBYA 5HRVA 5EISA 5FE3A 2R0YA 5L98A 4QSRA 5H85A 4UYFA 4HBVA 5ETBA 5A81A 2E3KA 3JVMA 4QSSA 4ZC9A 4TT4A 4QSXA 5A5NA 4AKNA 5EICA 1F68A 4IR3A 5D7XA 4C66A 5LKZA 5ETDA 1PUOA 5EWDA 3GG3A 4MR4A 4J0RA 1JSPB 4YY4A 5EPBA 5II1A 4PY6A 5CUBA 4O72A 4YADA 4MR5A 4NQNA 4UITA 3UVDA 5IGKA 5CS8A 5HELA 4A9EA 5KTWA 5I29A 5KHMA 5A7CA 4YYMA 5ENBA 4QZSA 4O7EA 2DATA 4O7FA 4QEWA 4ALGA 3HMHA 4QEVA 5DYCA 5EM3A 5FE4A 3HMEA 3U5KA 5D3HA 5HFRA 4O77A 5I89A 4NRBA 4A9NA 4QUUA 4TT2A 3MB4A 3UVWA 4A9IA 4QSTA 2RNWA 4LC2A 4YYGA 4MENA 5L99A 3P1DA 1E6IA 5L8TA 5D3SA 3UW9A 2H60A 5LVRA 4F3IA 4QSQA 4CFLA 5LKTA 4LYIA 2RO1A 4IORA 4AKGA 5LKUA 1ZS5A 5DKCA 3I3JA 5CU8A 5I40A
chains in the Genus database with same CATH topology
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