4TU4A

Crystal structure of atad2a bromodomain complexed with 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(phenylsulfonyl)amino]benzoicacid
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Gene regulation
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
publication title Observed bromodomain flexibility reveals histone peptide- and small molecule ligand-compatible forms of ATAD2.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2014-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4tu4A00
5LVRA 4PKLA 5I1QA 4MR4A 4J0RA 4A9FA 5LJ1A 4QSXA 4N4IA 5DLZA 2L5EA 3G0LA 4A9HA 4O7EA 4O77A 5EGUA 4QY4A 3U5OA 5LKUA 2OSSA 5E9YA 5ENCA 2YELA 5E9LA 5CUAA 4NR5A 4ALHA 4MEPA 2OO1A 4AKNA 4LRGA 4NRAA 5FH7A 4J3IA 4HBWA 5HCLA 4UIYA 3LQHA 5EM3A 5E9MA 5EPSA 5EU1A 4QSQA 4LZRA 2N9GA 5CQ4A 4NRCA 4HBVA 5L8TA 4LDFA 3U5MA 5IGLA 2DVQA 5HFQA 3LQIA 4QR5A 5HQ5A 5H85A 5TB6A 4O7CA 5IGMA 4QUUA 4QYLA 5EWVA 5EICA 4YYGA 5FH8A 2NXBA 2RNYA 2R0SA 5CQTA 4Z6HA 5DY7A 5FE4A 4YK0A 3MULA 4YY6A 4YYJA 2I7KA 4YYKA 5FE3A 4ZC9A 2DWWA 5CS8A 4O76A 4Z1SA 5ACYA 5I88A 3MB3A 3MQMA 5FE5A 4YH4A 5I40A 4UYHA 5CFWA 5I29A 5I7XA 4GPJA 3SVHA 5A5NA 3UV5A 4LYWA 5CQ5A 4UIXA 5E3DA 2D82A 4HXPA 5ENGA 3O35A 5CQ8A 3UVYA 5EISA 5HQ7A 4O72A 2YYNA 4XUAA 4MENA 5I89A 4Z1QA 5FE6A 5F61A 4XUBA 4O75A 5C4QA 2E3KA 5HLSA 3ZYUA 5C7NA 4MR6A 4YBMA 5FE8A 4QEWA 5E9IA 5DFDA 5D3PA 4QZSA 4O7AA 5EPBA 4NUCA 2G4AA 4CUUA 4F3IA 5FG5A 5EWDA 4NR6A 5DFBA 4NR4A 5DKHA 5E9VA 5KHMA 5HJCA 5L8UA 5EPRA 5LJ0A 4DONA 5HELA 5ENBA 5G4SA 3U5JA 3P1DA 5A5SA 4LR6A 5EP7A 4CLBA 5LKXA 4OGJA 3JVJA 3U5NA 4HXKA 3GG3A 3S92A 5D3NA 5HEMA 3HMHA 3S91A 5KO4A 2GRCA 5ENIA 4A9IA 3AADA 4YADA 5IBNA 4O7FA 5KTWA 4UITA 5BT5A 5L96A 3AQAA 5A5OA 4NXJA 4XY8A 5FH6A 5AMEA 5EV9A 3O37A 2WP1A 4QBMA 5DYUA 3UVWA 2YDWA 5HFRA 4QEUA 4PCEA 4IR3A 2YW5A 4HXNA 3K2JA 4CFLA 4TS8A 5CTLA 3JVKA 5DW2A 4NR9A 5C87A 4TT2A 5D25A 5FFWA 5DLXA 4O7BA 3QZVA 5H1UA 2E7OA 3LXJA 5EVAA 5DX4A 5H1VA 3SVGA 4UYFA 4MR3A 4NR8A 4TZ8A 4IR6A 5D3TA 4IR4A 4CUQA 5F1LA 4N3WA 5DFCA 4UYGA 5CQ6A 5CRMA 4XY9A 4HXOA 5HRXA 3G0JA 4YYMA 2I8NA 4MEOA 4YATA 2DKWA 4TTEA 5FB0A 4NS5A 1JSPB 5CZGA 5COIA 4PY6A 4XYAA 5LKTA 3P1FA 2RNWA 3QZSA 4A9LA 2DVVA 5CQ7A 3P5OA 4CUTA 5AD2A 4QSPA 4BW2A 5BT4A 1N72A 2YQDA 5F5ZA 5IGKA 4PS5A 4HXMA 2R0VA 3U5LA 5A5RA 2F6NA 5A82A 5ETBA 5J0DA 5ENJA 5A83A 4YYNA 4OGIA 4LC2A 4TU4A 1WUMA 5EWHA 5EA1A 5ENHA 4UYDA 5CUDA 4YBSA 4CFKA 3O33A 2DVRA 5F2PA 2D9EA 4PTBA 2DVSA 5EI4A 4ALGA 3UW9A 2E7NA 5ENFA 4BW3A 4YABA 5A7CA 4MEQA 4BW4A 3ONIA 4UIZA 4O78A 5DKCA 4TYLA 5I83A 4YH3A 2H60A 4OUFA 5ENEA 5ETDA 2L85A 5F60A 5KTUA 5HRWA 3U5KA 4YY4A 3NXBA 5FE2A 4O74A 2R0YA 4A9KA 4KV1A 2RS9B 5D3RA 5HQ6A 4WHUA 5AD3A 5F3AA 3JVLA 5IG6A 4UIWA 4HXRA 5FFYA 2F6JA 4QSVA 3Q2FA 5FE1A 5JI8A 3O34A 4IORA 4HBXA 5CUGA 4QYDA 2RNXA 5CQ3A 5DYXA 5JWMA 1WUGA 2RI7A 2L84A 3UVDA 4QR4A 5LKZA 5D0CA 1F68A 3IU5A 5FBXA 4LYSA 3UV2A 5A5QA 4CUSA 1X0JA 5F62A 4NYWA 5FB1A 1EQFA 3TLPA 5L97A 5CRZA 3SVFA 5D26A 5EWWA 5EQ1A 2FSAA 5AMFA 2MJVB 4A9NA 4IOQA 4RVRA 5FE7A 4IR5A 3MXFA 4NR7A 3FKMX 5I80A 4IOOA 4X2IA 4NQNA 3MB4A 4QNSA 4QUTA 2RFJA 3RCWA 4Y03A 3HMEA 5D3HA 4J0SA 5A5PA 5C85A 5FE0A 4O71A 5DW1A 4QSRA 4N4GA 5CP5A 4N4FA 4WIVA 5CPEA 5DYAA 4ZQLA 4TT6A 5G4RA 5D7XA 5A85A 5BT3A 5HRVA 4Z6IA 5TCMA 5IIDA 5E73A 5E9KA 3LQJA 5FFVA 3QZTA 5EK9A 4QSUA 4UYEA 4TU6A 5D3JA 3P1CA 3DAIA 2R10A 5F63A 4QSWA 3DWYA 5CU8A 4PCIA 5HENA 4YBTA 5HM0A 5D24A 4MR5A 3D7CA 5LVQA 4LZSA 3O36A 4CURA 4NUDA 4QR3A 4QSTA 4J1PA 4NQMA 4KCXA 4QC3A 3U5PA 2KTBB 4UIVA 1JM4B 4A9OA 4HBYA 4QC1A 4A9JA 5C8GA 5EWCA 4NRBA 2YEKA 5F36A 5KTXA 3HMFA 4YC9A 4KV4A 4CL9A 5E0RA 5LJ2A 4E96A 4ZW1A 5A81A 4HXLA 5LUUA 5C89A 5CUEA 5CUBA 5F25A 2LSPB 1ZS5A 5CY9A 5E74A 3JVMA 4HXSA 4BHWA 4QSSA 2WP2A 5CQAA 4O70A 4YYHA 3IU6A 5I7YA 4A9MA 4YYDA 5D3LA 5DYCA 5II2A 3LJWA 5E7DA 4QEVA 4UIUA 5CGPA 4Z93A 5DBMA 3Q2EA 4Q0OA 5DKDA 4YAXA 5D3SA 4N4HA 4QB3A 3P1EA 4YYIA 2RO1A 5CUCA 2OUOA 5H1TA 5FE9A 4LZ2A 5IGNA 2YEMA 4BW1A 5KU3A 5L98A 4TQNA 4UYFB 3UVXA 4TT4A 5FG4A 5E3GA 4C67A 5FG6A 5II1A 4WHWA 4FLPA 5L99A 4A9EA 5I86A 3MUKA 4LYIA 1E6IA 4BJXA 4TZ2A 5K29A 4NYVA 4NUEA 3I3JA 5F1HA 2DATA 4Q0NA 4C66A 3UV4A 4CUPA 5FDZA 4NYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LVRA 4PKLA 5I1QA 4MR4A 4J0RA 4A9FA 5LJ1A 4QSXA 4N4IA 5DLZA 2L5EA 3G0LA 4A9HA 4O7EA 4O77A 5EGUA 4QY4A 3U5OA 5LKUA 2OSSA 5E9YA 5ENCA 2YELA 5E9LA 5CUAA 4NR5A 4ALHA 4MEPA 2OO1A 4AKNA 4LRGA 4NRAA 5FH7A 4J3IA 4HBWA 5HCLA 4UIYA 3LQHA 5EM3A 4AI6A 5E9MA 5EPSA 5EU1A 4QSQA 4LZRA 2N9GA 5CQ4A 4NRCA 4HBVA 5L8TA 4LDFA 3U5MA 5IGLA 2DVQA 5HFQA 3LQIA 4QR5A 5HQ5A 5H85A 5TB6A 4O7CA 5IGMA 4QUUA 4QYLA 5EWVA 5EICA 4YYGA 5FH8A 2NXBA 2RNYA 2R0SA 5CQTA 4Z6HA 5DY7A 5FE4A 4YK0A 3MULA 4YY6A 4YYJA 2I7KA 4YYKA 5FE3A 4ZC9A 2DWWA 5CS8A 4O76A 4Z1SA 5ACYA 5I88A 3MB3A 3MQMA 5FE5A 4YH4A 5I40A 4UYHA 5CFWA 5I29A 5I7XA 4GPJA 3SVHA 5A5NA 3UV5A 4LYWA 5CQ5A 4UIXA 5E3DA 2D82A 4HXPA 5ENGA 3O35A 5CQ8A 3UVYA 5EISA 5HQ7A 4O72A 2YYNA 4XUAA 4MENA 5I89A 4Z1QA 5FE6A 5F61A 4XUBA 4O75A 5C4QA 2E3KA 5HLSA 3ZYUA 5C7NA 4MR6A 4YBMA 5FE8A 4QEWA 5E9IA 5DFDA 5D3PA 4QZSA 4O7AA 5EPBA 4NUCA 2G4AA 4CUUA 4F3IA 5FG5A 5EWDA 4NR6A 5DFBA 4NR4A 5DKHA 5E9VA 5KHMA 5HJCA 5L8UA 5EPRA 5LJ0A 1PUOA 4DONA 5HELA 5ENBA 5G4SA 3U5JA 3P1DA 5A5SA 4LR6A 5EP7A 4CLBA 5LKXA 4OGJA 3JVJA 3U5NA 4HXKA 3GG3A 3S92A 5D3NA 5HEMA 3HMHA 3S91A 5KO4A 2GRCA 5ENIA 4A9IA 3AADA 4YADA 5IBNA 4O7FA 5KTWA 4UITA 5BT5A 5L96A 3AQAA 5A5OA 4NXJA 4XY8A 5FH6A 5AMEA 5EV9A 3O37A 2WP1A 4QBMA 5DYUA 3UVWA 2YDWA 5HFRA 4QEUA 4PCEA 4IR3A 2YW5A 4HXNA 3K2JA 4CFLA 3ERRA 4TS8A 5CTLA 3JVKA 5DW2A 4NR9A 5C87A 4TT2A 5D25A 5FFWA 5DLXA 4O7BA 3QZVA 5H1UA 2E7OA 3LXJA 5EVAA 5DX4A 5H1VA 3SVGA 4UYFA 4MR3A 4NR8A 4TZ8A 4IR6A 5D3TA 4IR4A 4CUQA 5F1LA 4N3WA 5DFCA 4UYGA 5CQ6A 5CRMA 4XY9A 4HXOA 5HRXA 3G0JA 4YYMA 2I8NA 4MEOA 4YATA 2DKWA 4TTEA 5FB0A 4NS5A 1JSPB 5CZGA 5COIA 4PY6A 4XYAA 5LKTA 3P1FA 2RNWA 3QZSA 4A9LA 2DVVA 5CQ7A 3P5OA 4CUTA 5AD2A 4QSPA 4BW2A 5BT4A 1N72A 2YQDA 5F5ZA 5IGKA 4PS5A 4HXMA 2R0VA 3U5LA 5A5RA 2F6NA 5A82A 5ETBA 5J0DA 5ENJA 5A83A 4YYNA 4OGIA 4LC2A 4TU4A 1WUMA 5EWHA 5EA1A 5ENHA 4UYDA 5CUDA 4YBSA 4CFKA 3O33A 2DVRA 5F2PA 2D9EA 4PTBA 2DVSA 5EI4A 4ALGA 3UW9A 2E7NA 5ENFA 4BW3A 4YABA 5A7CA 4MEQA 4BW4A 3ONIA 4UIZA 4O78A 5DKCA 4TYLA 5I83A 4YH3A 2H60A 4OUFA 5ENEA 5ETDA 2L85A 5F60A 5KTUA 5HRWA 3U5KA 4YY4A 3NXBA 5FE2A 4O74A 2R0YA 4A9KA 4KV1A 2RS9B 5D3RA 5HQ6A 4WHUA 5AD3A 5F3AA 3JVLA 5IG6A 4UIWA 4HXRA 5FFYA 2F6JA 4QSVA 3VKHA 3Q2FA 5FE1A 5JI8A 3O34A 4IORA 4HBXA 5CUGA 4QYDA 2RNXA 5CQ3A 5DYXA 5JWMA 1WUGA 2RI7A 2L84A 3UVDA 4QR4A 5LKZA 5D0CA 1F68A 3IU5A 5FBXA 4LYSA 3UV2A 5A5QA 4CUSA 1X0JA 5F62A 4NYWA 5FB1A 1EQFA 3TLPA 5L97A 5CRZA 3SVFA 5D26A 5EWWA 5EQ1A 2FSAA 5AMFA 2MJVB 4A9NA 4RVRA 4IOQA 5FE7A 4IR5A 3MXFA 4NR7A 3D1DA 3FKMX 5I80A 4IOOA 4X2IA 4NQNA 3MB4A 4QNSA 4QUTA 2RFJA 3RCWA 4AKHA 4Y03A 3HMEA 5D3HA 4J0SA 5A5PA 5C85A 5FE0A 4O71A 5DW1A 4QSRA 4N4GA 5CP5A 4N4FA 4WIVA 5CPEA 5DYAA 4ZQLA 4TT6A 5G4RA 5D7XA 5A85A 5BT3A 5HRVA 4Z6IA 5TCMA 5IIDA 5E73A 5E9KA 3LQJA 5FFVA 3QZTA 5EK9A 4QSUA 4UYEA 4TU6A 5D3JA 3P1CA 3DAIA 2R10A 5F63A 4QSWA 3DWYA 5CU8A 4PCIA 5HENA 4YBTA 5HM0A 5D24A 4MR5A 3D7CA 5LVQA 4LZSA 3O36A 4CURA 4NUDA 4QR3A 4QSTA 4J1PA 4NQMA 4KCXA 4QC3A 3U5PA 2KTBB 4UIVA 1JM4B 4A9OA 4HBYA 4QC1A 4A9JA 5C8GA 5EWCA 4NRBA 2YEKA 5F36A 5KTXA 3HMFA 4YC9A 4KV4A 4CL9A 5E0RA 5LJ2A 4E96A 3VKGA 4ZW1A 5A81A 4HXLA 5LUUA 5C89A 5CUEA 5CUBA 5F25A 2LSPB 1ZS5A 5CY9A 1ZKRA 5E74A 3JVMA 4HXSA 4BHWA 4QSSA 2WP2A 5CQAA 4O70A 4YYHA 3IU6A 5I7YA 4A9MA 4YYDA 5D3LA 5DYCA 5II2A 3LJWA 5E7DA 4QEVA 4UIUA 5CGPA 4Z93A 5DBMA 3Q2EA 2EJNA 4Q0OA 5DKDA 4YAXA 5D3SA 4N4HA 4QB3A 3P1EA 4YYIA 2RO1A 5CUCA 2OUOA 5H1TA 5FE9A 4LZ2A 5IGNA 2YEMA 4BW1A 4AKGA 5KU3A 5L98A 4TQNA 4UYFB 3UVXA 4TT4A 5FG4A 5E3GA 4C67A 5FG6A 5II1A 4WHWA 4FLPA 5L99A 4A9EA 4AKIA 5I86A 3MUKA 4LYIA 1E6IA 4BJXA 3D1BA 4TZ2A 5K29A 4NYVA 4NUEA 3I3JA 5F1HA 2DATA 4Q0NA 4C66A 3UV4A 4CUPA 5FDZA 4NYXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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