4YY6A

Crystal structure of brd9 bromodomain bound to a butyryllysine peptide
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
102
structure length
102
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A Subset of Human Bromodomains Recognizes Butyryllysine and Crotonyllysine Histone Peptide Modifications.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
total genus 36
structure length 102
sequence length 102
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4yy6A00
3LQHA 4NR7A 4QEUA 2R0YA 5JI8A 5A85A 5KTUA 3O37A 5CQ6A 3IU5A 5D3LA 5ENFA 5EQ1A 5DKDA 4OGJA 3S91A 4O7CA 3U5JA 2DVQA 5F61A 2WP1A 2OUOA 4QEWA 5EWCA 4QSUA 4O71A 4IOOA 2YYNA 4PCEA 5FE0A 4YY6A 4HXNA 1WUMA 5L8UA 4GPJA 4CUPA 3G0LA 5HQ5A 4OUFA 1JSPB 4HXLA 5FG6A 5F60A 1WUGA 3ONIA 4UYEA 3K2JA 4WIVA 5EWVA 2DVVA 5FH7A 5FE5A 4HXRA 4F3IA 4UIUA 2DWWA 3P1DA 4CUUA 5I1QA 4PTBA 2YW5A 4LYSA 4YK0A 4O7AA 3G0JA 5HQ6A 5I83A 4A9KA 5A5NA 3UVDA 5A5SA 5FBXA 3U5OA 5DYAA 3U5LA 5F3AA 5ENIA 4UYDA 4QSXA 5D7XA 5E0RA 4MEOA 5EWWA 5EPSA 2D82A 5G4RA 4A9FA 3QZTA 4IR4A 4LYWA 3ZYUA 4O77A 4CUTA 5KU3A 4QSRA 5CY9A 4NQMA 4IR5A 5CQ8A 4UIZA 3MULA 4LZSA 5E73A 5IBNA 4UYFA 4UYGA 5EP7A 4YYHA 5EGUA 3JVJA 4LZ2A 5FFYA 4N4FA 4KV4A 4BW2A 2DATA 3JVLA 5CP5A 4NRBA 4QBMA 5EICA 5CQ5A 4YYNA 5FE7A 4XY8A 4NXJA 4KV1A 4QYLA 5L98A 2I8NA 5FE9A 4WHWA 3Q2EA 5LJ1A 5CUGA 4UIXA 5EPBA 5CTLA 4O76A 4TU4A 3HMHA 5EV9A 4Z93A 2RNWA 3P5OA 5EWDA 4Z1SA 5KHMA 4Z6IA 5CQ3A 5DX4A 4HXSA 4A9MA 3U5NA 4ZQLA 5IG6A 4O72A 5F63A 5DFBA 4RVRA 4HXKA 5F25A 2YEMA 4NS5A 3P1CA 4YYMA 4N3WA 2H60A 5H1UA 4HBWA 5CQTA 5LKZA 5FG4A 5L96A 1X0JA 2RO1A 5E9LA 4O78A 5ETBA 5I89A 3P1EA 5F62A 5LVQA 5D3TA 5FB1A 4E96A 4TT2A 5E74A 5II2A 4O74A 4NRCA 5IGLA 2RI7A 4HXOA 5FE3A 4IORA 5DBMA 2R0VA 5A82A 4IOQA 4BW1A 2F6NA 2L85A 4YYGA 2R0SA 3QZSA 5E3GA 3UV2A 4YBTA 2WP2A 5DYXA 1JM4B 5H1VA 4BJXA 4XY9A 5I88A 5LKXA 4LRGA 4TS8A 5A81A 4N4HA 3U5MA 4QUTA 5F36A 4QSPA 4CURA 3MB4A 4IR6A 4YABA 4QNSA 5CQ7A 4HXMA 4TQNA 4YAXA 2GRCA 4YADA 5DKHA 5HLSA 5FB0A 3O34A 3SVGA 5D3JA 4A9JA 4QSTA 3MXFA 4O7EA 5L97A 4MEQA 5FFWA 4UIWA 4NUCA 5DY7A 5CRMA 5C4QA 2RNYA 4A9HA 3AADA 2DVRA 4NQNA 5CUBA 4NYWA 5EVAA 4CUSA 5A5QA 4CUQA 5HQ7A 4A9IA 4BW3A 1N72A 4DONA 4MR4A 4PY6A 5IGKA 4TU6A 5CFWA 4YBSA 5A83A 4A9EA 5ACYA 5FE2A 5DYCA 3O35A 5LVRA 3U5PA 3QZVA 4IR3A 4Z1QA 5KTXA 5EU1A 2RFJA 4MEPA 5E9VA 4N4IA 5F2PA 4C66A 5HJCA 3RCWA 4O75A 3GG3A 4LYIA 5F1LA 4QSVA 4PCIA 5FE4A 4QZSA 5A5RA 2RS9B 5CZGA 3AQAA 5HCLA 4MR6A 4ALGA 4NR6A 5C8GA 4YYDA 4X2IA 5HFRA 4NUEA 5DLZA 5FG5A 5C85A 5TCMA 3JVMA 5EM3A 4MENA 4HXPA 3S92A 5CQ4A 2YDWA 2L84A 3MB3A 4O7BA 5FE1A 4BW4A 4HBVA 5C87A 5COIA 4YATA 3DAIA 5D0CA 5A5OA 5H1TA 4XUBA 4Q0NA 5HRXA 2F6JA 5E9YA 4QYDA 4A9NA 5J0DA 5DYUA 5HRWA 5EA1A 4TT6A 4YBMA 3MUKA 3HMEA 4AKNA 5HRVA 3U5KA 5BT5A 4QR4A 5IGMA 4MR5A 5DKCA 4YYIA 4PKLA 4J1PA 5LKUA 4TT4A 5I80A 4O7FA 3LQIA 5LJ2A 5D3NA 1F68A 4QSSA 5F5ZA 4TZ8A 5CUEA 3TLPA 4NUDA 4O70A 4ZW1A 4QY4A 2E7OA 5KTWA 4YC9A 5AMFA 4XUAA 5ENEA 5HELA 3UW9A 4NYVA 4QC1A 5DLXA 5C89A 5I86A 4J0RA 3UV4A 2DVSA 4J3IA 4WHUA 2OSSA 3MQMA 4QR5A 4UIYA 5ETDA 3SVFA 4QEVA 3LXJA 3D7CA 5AD3A 3IU6A 4UITA 5LUUA 5I29A 2L5EA 4KCXA 5L8TA 5EI4A 2I7KA 4LZRA 5FE6A 5I7YA 3LQJA 5KO4A 2E7NA 5I7XA 4QSWA 4PS5A 4LDFA 5E3DA 3SVHA 5LJ0A 4NRAA 4HBXA 5CU8A 4ALHA 4TTEA 5EISA 5CQAA 2KTBB 5D26A 4BHWA 5LKTA 5HENA 2G4AA 5A7CA 2MJVB 2YELA 4YYJA 5FFVA 4NR5A 5AMEA 1ZS5A 5CUCA 2DKWA 4QSQA 5TB6A 5ENBA 3UV5A 3LJWA 5D25A 5CPEA 5HEMA 5II1A 4TZ2A 4ZC9A 4OGIA 5D24A 3UVXA 2R10A 4NR8A 4UIVA 5L99A 5FE8A 5FH8A 5IIDA 4TYLA 2FSAA 2RNXA 4CLBA 4YY4A 2NXBA 5CUDA 5E7DA 5DFCA 4LC2A 4HBYA 5AD2A 3UVWA 5BT3A 3Q2FA 5D3HA 5ENHA 5DW1A 5EPRA 2YEKA 4CL9A 1EQFA 2D9EA 3DWYA 5EWHA 5EK9A 5ENCA 5I40A 4NYXA 4MR3A 5E9MA 5D3SA 5C7NA 5DFDA 5E9IA 5ENJA 5ENGA 4CFKA 3I3JA 4Z6HA 5HFQA 3HMFA 4QB3A 2E3KA 4LR6A 4J0SA 3O33A 4YH4A 5K29A 4Y03A 5H85A 1E6IA 4QR3A 4QC3A 4QUUA 5FH6A 4CFLA 5HM0A 5CUAA 5CS8A 2LSPB 5BT4A 2YQDA 3FKMX 3O36A 4YH3A 4XYAA 5DW2A 5E9KA 4NR9A 4C67A 2OO1A 5D3RA 3NXBA 3JVKA 3P1FA 4YYKA 5G4SA 4A9OA 5JWMA 4UYHA 4NR4A 4N4GA 4FLPA 5IGNA 4A9LA 5CGPA 4Q0OA 5F1HA 5CRZA 2N9GA 5FDZA 5D3PA 4UYFB 3UVYA 5A5PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LQHA 4NR7A 4QEUA 2R0YA 5JI8A 5A85A 5KTUA 3O37A 5CQ6A 3IU5A 5D3LA 5ENFA 5EQ1A 5DKDA 4OGJA 3S91A 4O7CA 3U5JA 2DVQA 5F61A 2WP1A 2OUOA 4QEWA 5EWCA 4QSUA 4O71A 4IOOA 2YYNA 4PCEA 5FE0A 4YY6A 4HXNA 1WUMA 5L8UA 4GPJA 4CUPA 3G0LA 5HQ5A 4OUFA 1JSPB 4HXLA 5FG6A 5F60A 1WUGA 3ONIA 4UYEA 3D1DA 3K2JA 4WIVA 5EWVA 2DVVA 5FH7A 5FE5A 4HXRA 4AI6A 4F3IA 4UIUA 2DWWA 3P1DA 4CUUA 5I1QA 3D1BA 4PTBA 2YW5A 4LYSA 4YK0A 4O7AA 3ERRA 3G0JA 5HQ6A 5I83A 4A9KA 5A5NA 3UVDA 5A5SA 5FBXA 3U5OA 5DYAA 3U5LA 5F3AA 5ENIA 4UYDA 4QSXA 5D7XA 5E0RA 4MEOA 5EWWA 5EPSA 2D82A 5G4RA 4A9FA 3QZTA 4IR4A 4LYWA 3ZYUA 3VKGA 4O77A 4CUTA 5KU3A 4QSRA 5CY9A 4NQMA 4IR5A 5CQ8A 4UIZA 3MULA 4LZSA 5E73A 5IBNA 4UYFA 4UYGA 5EP7A 4YYHA 5EGUA 3JVJA 4LZ2A 5FFYA 4N4FA 4KV4A 4BW2A 2DATA 3JVLA 5CP5A 4NRBA 4QBMA 5EICA 5CQ5A 4YYNA 5FE7A 4XY8A 4NXJA 4KV1A 4QYLA 5L98A 2I8NA 5FE9A 4WHWA 1PUOA 3Q2EA 5LJ1A 5CUGA 4UIXA 5EPBA 5CTLA 4O76A 4TU4A 3HMHA 5EV9A 2RNWA 3P5OA 4Z93A 5EWDA 4Z1SA 5KHMA 4Z6IA 5CQ3A 5DX4A 4HXSA 4A9MA 3U5NA 4ZQLA 5IG6A 4O72A 4AKHA 5F63A 5DFBA 4RVRA 4HXKA 5F25A 2YEMA 4NS5A 3P1CA 4YYMA 4N3WA 2H60A 5H1UA 4HBWA 5CQTA 5LKZA 5FG4A 5L96A 1X0JA 2RO1A 5E9LA 4O78A 5ETBA 5I89A 3P1EA 5F62A 5LVQA 5D3TA 5FB1A 4E96A 4TT2A 5E74A 5II2A 4O74A 4NRCA 5IGLA 2RI7A 4HXOA 5FE3A 4IORA 5DBMA 2R0VA 5A82A 4IOQA 4BW1A 2F6NA 2L85A 4YYGA 2R0SA 3QZSA 5E3GA 3UV2A 4YBTA 2WP2A 5DYXA 1JM4B 5H1VA 4BJXA 4XY9A 5I88A 5LKXA 4LRGA 4TS8A 5A81A 4N4HA 3U5MA 4QUTA 5F36A 4QSPA 4CURA 3MB4A 4IR6A 4YABA 4QNSA 5CQ7A 4HXMA 4TQNA 4YAXA 2GRCA 4YADA 5DKHA 5HLSA 5FB0A 3O34A 3SVGA 5D3JA 4A9JA 4QSTA 3MXFA 4O7EA 5L97A 4MEQA 5FFWA 4UIWA 4NUCA 5DY7A 5CRMA 5C4QA 2RNYA 4A9HA 3AADA 2DVRA 4NQNA 5CUBA 4NYWA 5EVAA 4CUSA 5A5QA 4CUQA 5HQ7A 4A9IA 4BW3A 1N72A 4DONA 4MR4A 4PY6A 5IGKA 4TU6A 5CFWA 4YBSA 5A83A 4A9EA 5ACYA 5FE2A 5DYCA 3O35A 5LVRA 3U5PA 3QZVA 4IR3A 4Z1QA 5KTXA 5EU1A 2RFJA 4MEPA 5E9VA 4N4IA 5F2PA 4C66A 5HJCA 3RCWA 4O75A 3GG3A 4LYIA 5F1LA 4QSVA 4PCIA 5FE4A 4QZSA 5A5RA 2RS9B 5CZGA 3AQAA 5HCLA 4MR6A 4ALGA 4NR6A 5C8GA 4YYDA 4X2IA 5HFRA 4NUEA 5DLZA 5FG5A 5C85A 5TCMA 3JVMA 5EM3A 4MENA 4HXPA 3S92A 5CQ4A 2YDWA 2L84A 3MB3A 4O7BA 5FE1A 4BW4A 4HBVA 5C87A 5COIA 4YATA 3DAIA 5D0CA 5A5OA 4AKGA 5H1TA 4XUBA 4Q0NA 5HRXA 2F6JA 5E9YA 4QYDA 4A9NA 5J0DA 5DYUA 5HRWA 5EA1A 4TT6A 4YBMA 3MUKA 3HMEA 4AKNA 5HRVA 3U5KA 5BT5A 4QR4A 5IGMA 4MR5A 5DKCA 4YYIA 4PKLA 4J1PA 5LKUA 4TT4A 5I80A 4O7FA 3LQIA 5LJ2A 5D3NA 1F68A 4QSSA 5F5ZA 4TZ8A 5CUEA 3TLPA 4NUDA 4O70A 4ZW1A 4QY4A 2E7OA 5KTWA 4YC9A 5AMFA 4XUAA 5ENEA 5HELA 3UW9A 4NYVA 4QC1A 5DLXA 1ZKRA 5C89A 5I86A 4J0RA 3UV4A 2DVSA 4J3IA 4WHUA 2OSSA 3MQMA 4QR5A 4UIYA 5ETDA 3SVFA 4QEVA 3LXJA 3D7CA 5AD3A 3IU6A 4UITA 5LUUA 5I29A 2L5EA 4KCXA 5L8TA 5EI4A 2I7KA 4LZRA 5FE6A 5I7YA 3LQJA 5KO4A 2E7NA 5I7XA 4QSWA 4PS5A 4LDFA 5E3DA 3SVHA 5LJ0A 4NRAA 4HBXA 5CU8A 4ALHA 4TTEA 5EISA 5CQAA 2KTBB 5D26A 4BHWA 5LKTA 5HENA 2G4AA 5A7CA 2MJVB 2YELA 4YYJA 5FFVA 4NR5A 5AMEA 1ZS5A 5CUCA 2DKWA 4QSQA 5TB6A 5ENBA 3UV5A 3LJWA 5D25A 5CPEA 5HEMA 5II1A 4TZ2A 4ZC9A 4OGIA 5D24A 3UVXA 2R10A 4NR8A 4UIVA 5L99A 5FE8A 5FH8A 5IIDA 4TYLA 2FSAA 2RNXA 4CLBA 4YY4A 2NXBA 5CUDA 5E7DA 5DFCA 4LC2A 4HBYA 5AD2A 3UVWA 5BT3A 3Q2FA 5D3HA 5ENHA 5DW1A 5EPRA 2YEKA 4CL9A 1EQFA 2D9EA 3DWYA 5EWHA 5EK9A 5ENCA 5I40A 4NYXA 4MR3A 5E9MA 5D3SA 5C7NA 5DFDA 5E9IA 5ENJA 5ENGA 4CFKA 3I3JA 4Z6HA 5HFQA 3HMFA 4QB3A 2E3KA 4LR6A 4J0SA 3O33A 4YH4A 5K29A 4Y03A 5H85A 1E6IA 4QR3A 4QC3A 4QUUA 3VKHA 5FH6A 4CFLA 5HM0A 5CUAA 5CS8A 2LSPB 2EJNA 2YQDA 5BT4A 3FKMX 3O36A 4YH3A 4XYAA 5DW2A 5E9KA 4NR9A 4C67A 2OO1A 5D3RA 3NXBA 3JVKA 3P1FA 4YYKA 5G4SA 4A9OA 5JWMA 4UYHA 4NR4A 4N4GA 4FLPA 5IGNA 4A9LA 5CGPA 4AKIA 4Q0OA 5F1HA 5CRZA 2N9GA 5FDZA 5D3PA 4UYFB 3UVYA 5A5PA
chains in the Genus database with same CATH topology
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