5E73A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with acetylindole compound uzh47
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The "Gatekeeper" Residue Influences the Mode of Binding of Acetyl Indoles to Bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e73A00
5F1HA 4AKNA 5EQ1A 5II2A 5FH8A 4GPJA 5ENHA 4YY6A 4YBMA 4PS5A 4HBVA 2F6NA 3LXJA 5ENJA 5HM0A 5II1A 4UIUA 4YYIA 3LQJA 3G0LA 5E3DA 2DVSA 5I83A 2L84A 4O7AA 2E7NA 5DLXA 5HENA 5IBNA 5C87A 5I40A 3FKMX 3O36A 4Q0OA 5A5OA 5EPBA 3JVMA 4TYLA 4O71A 4KV4A 5EVAA 3AADA 4NUEA 5CU8A 5DY7A 5H1VA 5C8GA 5F62A 3MULA 4LZSA 5IGNA 4UIWA 4O70A 5CQTA 1X0JA 5DYAA 5C85A 5CUAA 4IR4A 5E3GA 4CUTA 4ZC9A 5A7CA 4YYKA 2RI7A 4NQNA 5D3LA 5DKCA 4NUCA 5E9IA 4LZRA 4HXNA 3P1CA 5LKZA 5JWMA 4QR3A 5FG4A 1N72A 5KTWA 3P1DA 5C4QA 5EK9A 5F25A 5E74A 5FG6A 4J1PA 5DYUA 4A9MA 4O76A 3I3JA 3RCWA 5D3TA 4MEPA 4O7CA 5A5NA 5E9YA 3O33A 2F6JA 5FFYA 1E6IA 5FFVA 5EWHA 3K2JA 5FH6A 5CZGA 4C66A 4NXJA 5DBMA 2L85A 3MB3A 5I80A 3LJWA 4UYHA 5EPSA 5F36A 3ONIA 3QZVA 2R10A 4WHWA 4XY9A 5CTLA 5EWVA 5C7NA 5ENEA 5E7DA 1JSPB 4UITA 4Z93A 5LVQA 4BJXA 4O72A 3NXBA 4QYLA 4HBYA 5L99A 3HMFA 5FFWA 4BW3A 1JM4B 2WP1A 4YAXA 5F2PA 4C67A 3SVHA 4Z1QA 5CUDA 4FLPA 5F5ZA 5EICA 5BT3A 5D25A 5FH7A 4LDFA 5CGPA 2FSAA 4A9FA 4J0RA 4MR3A 4N4HA 3UV2A 5CRMA 5F63A 5HRVA 5F1LA 4YY4A 5DFDA 3AQAA 4TQNA 5EP7A 3S92A 4IORA 4UIVA 4LZ2A 4YBTA 3UW9A 3MQMA 4WIVA 5FE7A 4XY8A 5IG6A 5I29A 5DFBA 4BW1A 2I7KA 4CL9A 5HRWA 5HFQA 4NYVA 2G4AA 4IR3A 5IGKA 5L96A 4A9OA 5CFWA 5EGUA 5A5QA 5A5PA 5A5SA 5G4SA 2YDWA 5CRZA 3JVKA 4ZQLA 4PY6A 4YADA 5FE3A 4QSRA 5TCMA 5HCLA 4MEQA 4QUTA 5FE8A 3DWYA 5FB0A 4NRCA 5HQ5A 5ETDA 5ACYA 4QZSA 4QYDA 4TS8A 4NR4A 4UYFA 2RFJA 5IIDA 2I8NA 5BT4A 4O74A 2OUOA 4OUFA 4YATA 5EA1A 5FDZA 2R0VA 5CQAA 5E0RA 5D3HA 3UVYA 4NR5A 4TTEA 3MB4A 4NR6A 3D7CA 4QB3A 5C89A 4XYAA 5CUCA 3TLPA 4A9HA 4TU6A 3LQIA 4QSSA 4UIZA 4HBXA 5AD2A 5CQ3A 3QZTA 5KU3A 5KHMA 4UYFB 5EISA 5EV9A 4YYMA 5CPEA 5DLZA 4YC9A 5DX4A 5E9MA 2YEKA 4QBMA 5D3PA 4O7FA 4Z6HA 5HQ6A 5F60A 2DKWA 5TB6A 3U5PA 4LYWA 4NR9A 4N4FA 5L8TA 5FE6A 4BW2A 3P5OA 3P1FA 3MXFA 5D0CA 5CP5A 4Y03A 4MR4A 4QSQA 5FB1A 5FBXA 4YYHA 4CURA 4A9JA 4YK0A 5LKXA 5D24A 2YEMA 5H1UA 5F61A 5K29A 5IGLA 4CFKA 5ENCA 5HELA 4BW4A 2D9EA 5CQ7A 5G4RA 4HXKA 4A9NA 4YYGA 4A9EA 5F3AA 2WP2A 2DWWA 5LJ1A 5LKTA 5AMFA 4E96A 5JI8A 4HXLA 4QC3A 4QSWA 5DKHA 5A83A 3ZYUA 4YYNA 3O35A 3SVFA 4O7EA 2L5EA 4QR4A 4LYSA 4PCIA 4A9KA 4OGJA 4NRBA 4MR5A 5I7YA 4QSUA 4TT2A 5DKDA 5DW2A 5BT5A 2D82A 4WHUA 1ZS5A 4YYJA 5DYXA 5HLSA 5FE4A 4CUQA 5CQ6A 2DVQA 1F68A 5CQ8A 5I88A 5HJCA 4HXPA 3P1EA 5LJ0A 4BHWA 5D3RA 1EQFA 2YELA 4LC2A 4HXMA 5EPRA 5CUBA 2DVVA 5I7XA 5LVRA 2OO1A 3G0JA 4X2IA 5AMEA 4XUBA 4F3IA 4UYEA 5H85A 4HXOA 4A9IA 3O34A 4NYWA 5D3SA 3UV4A 4O78A 3U5MA 1WUGA 3Q2EA 5FE1A 5DFCA 5CQ5A 4CUSA 5EM3A 5CQ4A 4OGIA 5EU1A 3U5NA 4N4IA 4QR5A 4HBWA 3QZSA 4QEWA 5E9VA 5CUEA 3SVGA 2NXBA 4UIXA 5CS8A 5FE5A 4XUAA 4ALHA 4CFLA 4PTBA 3IU6A 5KO4A 4Z6IA 2YQDA 3IU5A 4KCXA 2DATA 2RNYA 5KTXA 3DAIA 2RO1A 4UYDA 5EWCA 4NQMA 5L97A 5A85A 3JVLA 2RNXA 4NRAA 3JVJA 4KV1A 4QUUA 4YH4A 5LUUA 4YABA 4QEUA 4CUUA 4IOQA 5LKUA 2OSSA 3HMHA 4QEVA 5HEMA 4O75A 5LJ2A 4UYGA 5ENIA 1WUMA 4IR6A 5ENFA 4ALGA 5EWDA 4O77A 4HXRA 5D3NA 4TT6A 4N4GA 5HFRA 4IOOA 2H60A 5D26A 4UIYA 4NS5A 4CLBA 4QSPA 5A82A 5HQ7A 4Q0NA 4PCEA 4Z1SA 2R0SA 2KTBB 4TZ2A 4J0SA 4QSVA 4RVRA 3U5JA 4LYIA 2GRCA 3UVWA 5EWWA 4LR6A 4TZ8A 3O37A 4NUDA 5I1QA 5I86A 5FE9A 4N3WA 5CY9A 2YYNA 3UVDA 3Q2FA 5EI4A 4HXSA 5CUGA 4CUPA 4YBSA 4QSXA 4NR8A 4A9LA 4MEOA 5ETBA 2N9GA 2MJVB 3U5KA 5H1TA 5J0DA 5A81A 3UV5A 5IGMA 4DONA 4ZW1A 4QY4A 5FE0A 2E3KA 3U5LA 4QSTA 5E73A 2RS9B 4J3IA 2E7OA 5E9LA 5AD3A 4MR6A 5FG5A 2YW5A 3MUKA 3U5OA 4IR5A 3UVXA 3HMEA 4LRGA 4YH3A 4MENA 5ENBA 3LQHA 5KTUA 2DVRA 4TU4A 5L98A 5I89A 5E9KA 4QNSA 5DYCA 4NR7A 4PKLA 2R0YA 5D3JA 2LSPB 4YYDA 5COIA 5L8UA 4QC1A 3S91A 2RNWA 4NYXA 5FE2A 5HRXA 3GG3A 5D7XA 4O7BA 5A5RA 4TT4A 5ENGA 5DW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F1HA 4AKNA 5EQ1A 5II2A 5FH8A 4GPJA 5ENHA 4YY6A 4YBMA 4PS5A 4HBVA 2F6NA 3LXJA 5ENJA 5HM0A 5II1A 4UIUA 4YYIA 3LQJA 3G0LA 5E3DA 2DVSA 5I83A 2L84A 4O7AA 2E7NA 5DLXA 5HENA 5IBNA 5C87A 5I40A 3FKMX 3O36A 4Q0OA 5A5OA 5EPBA 3JVMA 4TYLA 4O71A 4KV4A 5EVAA 3AADA 4NUEA 5CU8A 5DY7A 5H1VA 5C8GA 5F62A 3MULA 4LZSA 5IGNA 4UIWA 4O70A 5CQTA 1X0JA 5DYAA 5C85A 5CUAA 4IR4A 5E3GA 4CUTA 4ZC9A 5A7CA 4YYKA 2RI7A 4NQNA 5D3LA 5DKCA 4NUCA 5E9IA 4LZRA 4HXNA 3P1CA 5LKZA 5JWMA 4QR3A 5FG4A 1N72A 5KTWA 3P1DA 5C4QA 5EK9A 5F25A 5E74A 5FG6A 4J1PA 5DYUA 4A9MA 4O76A 3I3JA 3RCWA 4AKIA 5D3TA 4MEPA 4O7CA 5A5NA 5E9YA 3O33A 2F6JA 5FFYA 1E6IA 5FFVA 5EWHA 3K2JA 5FH6A 5CZGA 4C66A 4NXJA 5DBMA 2L85A 3MB3A 5I80A 3LJWA 4UYHA 5EPSA 5F36A 3ONIA 3QZVA 2R10A 4WHWA 4XY9A 5CTLA 5EWVA 5C7NA 5ENEA 5E7DA 1JSPB 4UITA 4Z93A 3VKGA 5LVQA 4BJXA 4O72A 1ZKRA 3NXBA 4QYLA 4HBYA 5L99A 3HMFA 5FFWA 4BW3A 1JM4B 2WP1A 4YAXA 5F2PA 4C67A 3SVHA 4Z1QA 5CUDA 4FLPA 5F5ZA 5EICA 5BT3A 5D25A 5FH7A 4LDFA 5CGPA 2FSAA 4A9FA 4J0RA 4MR3A 4N4HA 3UV2A 5CRMA 5F63A 5HRVA 5F1LA 4YY4A 5DFDA 3AQAA 4TQNA 5EP7A 3S92A 4IORA 4UIVA 4LZ2A 4YBTA 3UW9A 3MQMA 4WIVA 5FE7A 4XY8A 5IG6A 5I29A 5DFBA 4BW1A 2I7KA 4CL9A 5HRWA 5HFQA 4NYVA 2G4AA 4AKGA 4IR3A 5IGKA 5L96A 4A9OA 5CFWA 5EGUA 5A5QA 5A5PA 5A5SA 5G4SA 2YDWA 5CRZA 3JVKA 4ZQLA 4PY6A 4YADA 5FE3A 4QSRA 5TCMA 5HCLA 4MEQA 4QUTA 5FE8A 3DWYA 5FB0A 4NRCA 5HQ5A 5ETDA 5ACYA 4QZSA 4QYDA 4TS8A 4NR4A 4UYFA 2RFJA 5IIDA 2I8NA 5BT4A 4O74A 2OUOA 4OUFA 4YATA 5EA1A 5FDZA 2R0VA 5CQAA 5E0RA 5D3HA 3UVYA 4NR5A 4TTEA 3MB4A 4NR6A 3D7CA 4QB3A 5C89A 4XYAA 5CUCA 3TLPA 4A9HA 4TU6A 3LQIA 4QSSA 4UIZA 4HBXA 5AD2A 5CQ3A 3QZTA 5KU3A 5KHMA 4UYFB 5EISA 5EV9A 4YYMA 5CPEA 5DLZA 4YC9A 5DX4A 5E9MA 2YEKA 4QBMA 5D3PA 4O7FA 4Z6HA 5HQ6A 5F60A 2DKWA 5TB6A 3U5PA 4LYWA 4NR9A 4N4FA 5L8TA 5FE6A 4BW2A 3P5OA 3P1FA 3MXFA 5D0CA 5CP5A 4Y03A 4MR4A 3ERRA 4QSQA 5FB1A 5FBXA 4YYHA 4CURA 4A9JA 4YK0A 5LKXA 5D24A 2YEMA 5H1UA 5F61A 5K29A 5IGLA 4CFKA 5ENCA 5HELA 4BW4A 2D9EA 5CQ7A 5G4RA 4HXKA 4A9NA 1PUOA 4YYGA 4A9EA 5F3AA 2WP2A 2DWWA 5LJ1A 5LKTA 5AMFA 4E96A 5JI8A 4HXLA 4QC3A 4QSWA 5DKHA 3VKHA 5A83A 3ZYUA 4YYNA 3O35A 3SVFA 4O7EA 2L5EA 4QR4A 4LYSA 4PCIA 4A9KA 4OGJA 4NRBA 4MR5A 5I7YA 4QSUA 4TT2A 5DKDA 5DW2A 5BT5A 2D82A 4WHUA 1ZS5A 4YYJA 5DYXA 5HLSA 5FE4A 4CUQA 5CQ6A 2DVQA 1F68A 5CQ8A 5I88A 5HJCA 4HXPA 3P1EA 5LJ0A 4BHWA 5D3RA 1EQFA 2YELA 4LC2A 4HXMA 5EPRA 5CUBA 2DVVA 5I7XA 5LVRA 2OO1A 3G0JA 4X2IA 5AMEA 4XUBA 4F3IA 4UYEA 5H85A 4HXOA 4A9IA 3O34A 4NYWA 5D3SA 3UV4A 4O78A 3U5MA 1WUGA 3Q2EA 5FE1A 5DFCA 5CQ5A 4CUSA 5EM3A 4AI6A 5CQ4A 4OGIA 5EU1A 3U5NA 4N4IA 4QR5A 4HBWA 3QZSA 4QEWA 5E9VA 5CUEA 3SVGA 2NXBA 4UIXA 5CS8A 5FE5A 4XUAA 4ALHA 4CFLA 4PTBA 3IU6A 5KO4A 4Z6IA 2YQDA 3IU5A 4KCXA 2DATA 2RNYA 5KTXA 3DAIA 2RO1A 4UYDA 3D1BA 5EWCA 4NQMA 5L97A 5A85A 3JVLA 2RNXA 4AKHA 4NRAA 3JVJA 4KV1A 4QUUA 4YH4A 5LUUA 3D1DA 2EJNA 4YABA 4QEUA 4CUUA 4IOQA 5LKUA 2OSSA 3HMHA 4QEVA 5HEMA 4O75A 5LJ2A 4UYGA 5ENIA 1WUMA 4IR6A 5ENFA 4ALGA 5EWDA 4O77A 4HXRA 5D3NA 4TT6A 4N4GA 5HFRA 4IOOA 2H60A 5D26A 4UIYA 4NS5A 4CLBA 4QSPA 5A82A 5HQ7A 4Q0NA 4PCEA 4Z1SA 2R0SA 2KTBB 4TZ2A 4J0SA 4QSVA 4RVRA 3U5JA 4LYIA 2GRCA 3UVWA 5EWWA 4LR6A 4TZ8A 3O37A 4NUDA 5I1QA 5I86A 5FE9A 4N3WA 5CY9A 2YYNA 3UVDA 3Q2FA 5EI4A 4HXSA 5CUGA 4CUPA 4YBSA 4QSXA 4NR8A 4A9LA 4MEOA 5ETBA 2N9GA 2MJVB 3U5KA 5H1TA 5J0DA 5A81A 3UV5A 5IGMA 4DONA 4ZW1A 4QY4A 5FE0A 2E3KA 3U5LA 4QSTA 5E73A 2RS9B 4J3IA 2E7OA 5E9LA 5AD3A 4MR6A 5FG5A 2YW5A 3MUKA 3U5OA 4IR5A 3UVXA 3HMEA 4LRGA 4YH3A 4MENA 5ENBA 3LQHA 5KTUA 2DVRA 4TU4A 5L98A 5I89A 5E9KA 4QNSA 5DYCA 4NR7A 4PKLA 5D3JA 2R0YA 2LSPB 4YYDA 5COIA 5L8UA 4QC1A 3S91A 2RNWA 4NYXA 5FE2A 5HRXA 3GG3A 5D7XA 4O7BA 5A5RA 4TT4A 5ENGA 5DW1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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