5EICA

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp in complex with ayc
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Binding Motifs in the CBP Bromodomain: An Analysis of 20 Crystal Structures of Complexes with Small Molecules.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CREB-binding protein
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 113
sequence length 113
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5eicA00
5I89A 4X2IA 4O72A 4A9NA 5HRXA 5FE5A 5DYAA 4UITA 4O7EA 5FDZA 5CUEA 4HBYA 4LZSA 5FE1A 4MR6A 2YEKA 2YELA 4NXJA 4LDFA 4HXPA 5CTLA 5DKHA 5CU8A 5A81A 5A5NA 5KHMA 5C85A 3ONIA 4HXSA 4FLPA 1X0JA 5A5SA 5I86A 5L97A 5F36A 3SVGA 4UYFB 5FE7A 4CUPA 4QC3A 4NR4A 5A5PA 5FH8A 4ALHA 3LQJA 5BT4A 3JVKA 5CQAA 4YAXA 2RNYA 4QSQA 5FH6A 4A9MA 5I80A 4HXOA 2H60A 4CUSA 4Q0NA 4HXRA 5E3GA 5HQ7A 2E7NA 4UYHA 4CFKA 4ZC9A 3U5OA 5IGMA 4F3IA 1WUMA 3U5KA 3QZTA 2RFJA 3NXBA 3UV5A 3RCWA 4UIXA 5AD3A 4QYLA 5DY7A 2OUOA 4TS8A 5KTXA 3HMHA 4IR4A 3AADA 4A9FA 3LXJA 5F5ZA 5CRZA 5CUDA 4YYIA 5DBMA 5H1TA 4IOOA 3HMEA 4QEVA 4QSUA 3UVDA 4Q0OA 4O77A 5EVAA 2WP2A 5I7XA 5DX4A 5C87A 4UYFA 5HLSA 4QSRA 5CFWA 5HENA 4QR4A 5LKUA 4NS5A 2OSSA 2N9GA 5EA1A 2E3KA 3QZVA 3TLPA 4YYGA 4NR7A 5A83A 5LKTA 4BW3A 5LVRA 4QSPA 4TT2A 4GPJA 5I7YA 5G4RA 5CQTA 4A9OA 2DWWA 4QB3A 4YYMA 3G0JA 5HELA 5LJ1A 4OUFA 5D3TA 5FB1A 1EQFA 4QC1A 3JVMA 5K29A 4TT6A 5II1A 5FFVA 4NUEA 4IR3A 2RO1A 4YYDA 5L8TA 5AD2A 4N4HA 4UYEA 3ZYUA 2E7OA 4NRBA 1JM4B 5CQ4A 4YK0A 4QUTA 5EK9A 5EU1A 5H85A 5FE6A 4J0RA 4BW1A 5FBXA 4CUUA 4PKLA 5A82A 5IIDA 2YEMA 4QZSA 4UIYA 4OGJA 4O70A 5EI4A 5E0RA 4YBTA 5DLXA 5KO4A 2R0SA 4YH4A 3LQIA 5ACYA 4CFLA 3K2JA 4QNSA 5E74A 4CUTA 5DW2A 2L84A 3S91A 4LZRA 4BHWA 3MUKA 3GG3A 4O74A 5EWWA 3MB3A 5HQ5A 2I8NA 4TZ8A 5EICA 5A5OA 5D7XA 5HCLA 4MEOA 4NR9A 3MULA 4HXNA 3UV2A 3MQMA 5AMEA 5E9MA 5ENBA 4QSSA 5DYUA 2YDWA 5F60A 3U5PA 5E9LA 5KTWA 3AQAA 5A7CA 4IR5A 4N3WA 5D25A 4QR5A 4N4FA 5CPEA 4YYHA 5TCMA 3U5JA 2DVQA 2DKWA 4YBSA 5F25A 4LYSA 5HFQA 4A9JA 5FE2A 2DVRA 5E3DA 4O7BA 5J0DA 5L8UA 3O35A 5ENFA 5FFWA 5D3PA 5DFDA 4ALGA 4BW4A 5ETDA 5DKDA 5A85A 5HEMA 5ENIA 5FG5A 5CGPA 5EWCA 5F2PA 5I1QA 4YATA 5LUUA 4QYDA 5CS8A 4TT4A 3P5OA 4TU4A 5C89A 5ENCA 4YYKA 5EPRA 5CRMA 5COIA 3P1EA 5BT3A 2D9EA 5CUCA 4A9LA 4MR3A 4N4GA 4Y03A 5A5RA 4NYWA 5CY9A 2F6NA 4TZ2A 2D82A 4NQMA 2YYNA 3O33A 4J1PA 4XYAA 5EISA 5CUGA 5D0CA 5E73A 5DFBA 5EGUA 5F1HA 2L5EA 4PCIA 4KCXA 5FE3A 2F6JA 5ENGA 4OGIA 4NR8A 4YADA 4Z1SA 2GRCA 4AKNA 4Z6HA 2FSAA 4MR4A 2WP1A 3D7CA 5C4QA 4O7AA 5ENJA 4XY9A 5EPBA 4IORA 5CQ3A 5CUBA 5C8GA 5F1LA 5DKCA 3P1FA 5II2A 4A9KA 5CQ7A 5F3AA 5CUAA 5EV9A 3UVXA 5HRVA 3U5LA 2L85A 5LVQA 5EWVA 4BJXA 4O78A 4UYGA 5DYCA 5DW1A 5DYXA 4QEUA 4LRGA 4ZQLA 5CP5A 3I3JA 4QSTA 5IBNA 4NYVA 4RVRA 5HM0A 4Z1QA 4WIVA 3SVFA 5AMFA 5IGLA 4J3IA 4QR3A 4HBWA 4O71A 3JVLA 5H1UA 4QY4A 4DONA 4C66A 4Z93A 5CQ5A 3DAIA 4LC2A 5D3RA 5D3LA 5JWMA 5LKZA 4HXLA 3HMFA 3P1CA 2I7KA 3Q2FA 5G4SA 2KTBB 5TB6A 5ENHA 4J0SA 3O37A 5FE0A 4O7FA 4UIUA 5E9KA 5FB0A 5LJ0A 5D3NA 4ZW1A 4E96A 4NYXA 5D3JA 4KV1A 5ETBA 4LYIA 3UVWA 4N4IA 4QSXA 5D3HA 4MEPA 4XUAA 4UIWA 3P1DA 5D24A 3LJWA 4LYWA 4CL9A 5EQ1A 3UV4A 3UW9A 2RNXA 4UIZA 4MEQA 4YH3A 5EPSA 5CQ6A 1JSPB 4YYJA 4HBXA 5FG4A 5HJCA 3O34A 5E9IA 4A9HA 4CUQA 3JVJA 4TYLA 5EWDA 5HFRA 5JI8A 2YW5A 4UYDA 3U5MA 5CQ8A 5FE9A 2MJVB 5FE8A 5A5QA 4TTEA 2RI7A 5DFCA 4QUUA 5LKXA 2NXBA 4IR6A 3Q2EA 4HXMA 4XY8A 4PCEA 5L99A 4PY6A 3O36A 4LZ2A 3QZSA 5FFYA 4NRCA 4PTBA 4CURA 5EM3A 4O76A 4PS5A 3FKMX 5L98A 4YC9A 5HQ6A 4LR6A 2RS9B 4YY6A 3U5NA 5F61A 5F63A 4YY4A 4XUBA 4MENA 4C67A 4HXKA 5IGKA 3G0LA 4TQNA 4TU6A 4A9EA 5C7NA 2DVSA 5EP7A 5I40A 5ENEA 4A9IA 2R10A 4O75A 3S92A 5F62A 5FG6A 4YABA 2R0YA 3MXFA 5HRWA 4UIVA 5FH7A 5IG6A 5H1VA 3IU5A 4QEWA 4NRAA 5E7DA 5I29A 1N72A 4NUDA 2G4AA 4YBMA 4HBVA 3DWYA 4MR5A 2RNWA 4NUCA 4WHUA 5D3SA 2OO1A 4QSVA 4QBMA 2DVVA 4QSWA 4NR5A 5E9YA 3SVHA 4KV4A 5KU3A 5E9VA 5I88A 4CLBA 4IOQA 5KTUA 2LSPB 1WUGA 4NR6A 5D26A 1ZS5A 5CZGA 4O7CA 3MB4A 3UVYA 5L96A 5LJ2A 3IU6A 2YQDA 1E6IA 4WHWA 2R0VA 4NQNA 4BW2A 2DATA 4YYNA 5DLZA 5EWHA 4Z6IA 5IGNA 5FE4A 1F68A 5BT5A 3LQHA 5I83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I89A 4X2IA 4O72A 4A9NA 5HRXA 5FE5A 5DYAA 4UITA 4O7EA 5FDZA 4AKIA 5CUEA 4HBYA 4LZSA 5FE1A 4MR6A 2YEKA 2YELA 4NXJA 4LDFA 4HXPA 5CTLA 5DKHA 5CU8A 1PUOA 5A81A 5A5NA 5KHMA 5C85A 3ONIA 4AI6A 4HXSA 4FLPA 1X0JA 5A5SA 5I86A 5L97A 5F36A 3SVGA 4UYFB 5FE7A 4CUPA 4QC3A 4NR4A 5A5PA 5FH8A 4ALHA 3LQJA 5BT4A 3JVKA 5CQAA 4YAXA 2RNYA 4QSQA 5FH6A 4A9MA 5I80A 4HXOA 2H60A 4CUSA 4Q0NA 4HXRA 5E3GA 5HQ7A 2E7NA 4UYHA 4CFKA 4ZC9A 3U5OA 5IGMA 4AKHA 4F3IA 1WUMA 3U5KA 3QZTA 2RFJA 3NXBA 3UV5A 3RCWA 4UIXA 5AD3A 4QYLA 5DY7A 2OUOA 4TS8A 5KTXA 3HMHA 4IR4A 3AADA 4A9FA 3LXJA 5F5ZA 5CRZA 5CUDA 4YYIA 5DBMA 5H1TA 4IOOA 3HMEA 4QEVA 4QSUA 3UVDA 4Q0OA 4O77A 5EVAA 2WP2A 5I7XA 5DX4A 5C87A 4UYFA 5HLSA 4QSRA 5CFWA 5HENA 4QR4A 5LKUA 4NS5A 2OSSA 2N9GA 5EA1A 2E3KA 3QZVA 3TLPA 4YYGA 4NR7A 5A83A 5LKTA 4BW3A 5LVRA 4QSPA 4TT2A 4GPJA 5I7YA 5G4RA 5CQTA 4A9OA 2DWWA 4QB3A 4YYMA 3G0JA 5HELA 5LJ1A 4OUFA 5D3TA 5FB1A 1EQFA 4QC1A 3JVMA 5K29A 4TT6A 5II1A 5FFVA 4NUEA 4IR3A 2RO1A 4YYDA 5L8TA 5AD2A 4N4HA 4UYEA 3ZYUA 2E7OA 4NRBA 1JM4B 5CQ4A 4YK0A 4QUTA 5EK9A 3ERRA 5EU1A 5H85A 5FE6A 4J0RA 4BW1A 5FBXA 4CUUA 4PKLA 5A82A 5IIDA 2YEMA 4QZSA 4UIYA 4OGJA 4O70A 3VKGA 5EI4A 5E0RA 4YBTA 5DLXA 5KO4A 2R0SA 4YH4A 3LQIA 5ACYA 4CFLA 3K2JA 4QNSA 5E74A 4CUTA 5DW2A 2L84A 3S91A 4LZRA 4BHWA 3MUKA 3GG3A 4O74A 5EWWA 3MB3A 5HQ5A 2I8NA 4TZ8A 5EICA 5A5OA 5D7XA 5HCLA 4MEOA 4NR9A 3MULA 4HXNA 3UV2A 3MQMA 5AMEA 5E9MA 5ENBA 4QSSA 5DYUA 2YDWA 5F60A 3U5PA 5E9LA 5KTWA 3AQAA 5A7CA 4IR5A 4N3WA 5D25A 4QR5A 4N4FA 5CPEA 4YYHA 5TCMA 3U5JA 2DVQA 2DKWA 4YBSA 5F25A 4LYSA 5HFQA 4A9JA 5FE2A 2DVRA 5E3DA 4O7BA 5J0DA 5L8UA 3O35A 5ENFA 5FFWA 5D3PA 5DFDA 4ALGA 4BW4A 5ETDA 5DKDA 5A85A 5HEMA 5ENIA 5FG5A 5CGPA 5EWCA 5F2PA 5I1QA 4YATA 5LUUA 4QYDA 5CS8A 4TT4A 3P5OA 4TU4A 5C89A 5ENCA 4YYKA 5EPRA 5CRMA 5COIA 3P1EA 5BT3A 2D9EA 5CUCA 4A9LA 4MR3A 4N4GA 4Y03A 5A5RA 4NYWA 5CY9A 2F6NA 4TZ2A 2D82A 4NQMA 2YYNA 3O33A 4J1PA 4XYAA 5EISA 5CUGA 5D0CA 5E73A 5DFBA 5EGUA 5F1HA 2L5EA 4PCIA 4KCXA 5FE3A 2F6JA 5ENGA 4OGIA 4NR8A 4YADA 4Z1SA 2GRCA 4AKNA 4Z6HA 2FSAA 4MR4A 2WP1A 3D7CA 5C4QA 4O7AA 5ENJA 4XY9A 5EPBA 4IORA 5CQ3A 5CUBA 5C8GA 5F1LA 5DKCA 3P1FA 5II2A 4A9KA 5CQ7A 5F3AA 5CUAA 5EV9A 3UVXA 5HRVA 3U5LA 2L85A 5LVQA 3D1DA 5EWVA 4BJXA 4O78A 4UYGA 5DYCA 5DW1A 5DYXA 4QEUA 4LRGA 4ZQLA 5CP5A 3I3JA 4QSTA 5IBNA 4NYVA 4RVRA 5HM0A 4Z1QA 4WIVA 3SVFA 5AMFA 5IGLA 4J3IA 4QR3A 4HBWA 4O71A 3JVLA 5H1UA 4QY4A 4DONA 4C66A 4Z93A 5CQ5A 3DAIA 4LC2A 5D3RA 5D3LA 5JWMA 5LKZA 4HXLA 3HMFA 3P1CA 2I7KA 3Q2FA 5G4SA 2KTBB 5TB6A 5ENHA 4J0SA 3O37A 5FE0A 4O7FA 4UIUA 5E9KA 5FB0A 5LJ0A 5D3NA 4ZW1A 4E96A 4NYXA 5D3JA 4KV1A 5ETBA 4LYIA 3UVWA 4N4IA 4QSXA 5D3HA 4MEPA 4XUAA 4UIWA 3P1DA 5D24A 3LJWA 4LYWA 4CL9A 5EQ1A 3UV4A 3UW9A 2RNXA 4UIZA 4MEQA 4YH3A 5EPSA 5CQ6A 1JSPB 4YYJA 4HBXA 5FG4A 5HJCA 3O34A 5E9IA 4A9HA 4CUQA 3JVJA 4TYLA 5EWDA 5HFRA 5JI8A 2YW5A 4UYDA 3U5MA 5CQ8A 5FE9A 2MJVB 5FE8A 5A5QA 4TTEA 2RI7A 5DFCA 4QUUA 5LKXA 2NXBA 4IR6A 3Q2EA 4HXMA 4XY8A 4PCEA 5L99A 4PY6A 3O36A 4LZ2A 2EJNA 3QZSA 3D1BA 5FFYA 4NRCA 3VKHA 4PTBA 4CURA 5EM3A 4O76A 4PS5A 3FKMX 5L98A 4YC9A 5HQ6A 4LR6A 2RS9B 4YY6A 3U5NA 5F61A 5F63A 4YY4A 4XUBA 4MENA 4C67A 4HXKA 5IGKA 3G0LA 4TQNA 4TU6A 4A9EA 5C7NA 2DVSA 5EP7A 5I40A 5ENEA 4A9IA 2R10A 4O75A 3S92A 5F62A 5FG6A 4YABA 2R0YA 3MXFA 5HRWA 4UIVA 5FH7A 5IG6A 5H1VA 3IU5A 4QEWA 4NRAA 5E7DA 5I29A 1N72A 4NUDA 2G4AA 4YBMA 4HBVA 3DWYA 4MR5A 2RNWA 4NUCA 4WHUA 5D3SA 1ZKRA 2OO1A 4QSVA 4QBMA 2DVVA 4QSWA 4NR5A 5E9YA 3SVHA 4KV4A 5KU3A 5E9VA 5I88A 4CLBA 4IOQA 5KTUA 2LSPB 1WUGA 4NR6A 5D26A 1ZS5A 5CZGA 4O7CA 3MB4A 3UVYA 5L96A 5LJ2A 3IU6A 2YQDA 1E6IA 4WHWA 2R0VA 4NQNA 4BW2A 2DATA 4YYNA 5DLZA 5EWHA 4AKGA 4Z6IA 5IGNA 5FE4A 1F68A 5BT5A 3LQHA 5I83A
chains in the Genus database with same CATH topology
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