5EISA

First domain of human bromodomain brd4 in complex with inhibitor 3-(4-chlorobenzyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Exploring Selective Inhibition of the First Bromodomain of the Human Bromodomain and Extra-terminal Domain (BET) Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5eisA01
1E6IA 3P1DA 5D3RA 5FH6A 2YQDA 4GPJA 5I7XA 4C67A 2L85A 5CQ8A 2DKWA 5FG5A 5D3LA 2DWWA 2R10A 4TZ2A 3MULA 4QSTA 5FE0A 5ENIA 5LJ1A 5HENA 3AADA 4C66A 4QSPA 3ONIA 2E3KA 1N72A 5ENFA 4LZRA 4YBSA 2OO1A 4A9LA 4QUUA 5A5QA 5CY9A 5E9LA 5G4SA 3P1FA 5ETBA 5IG6A 4QZSA 5II1A 4UIWA 4QYDA 2G4AA 3O34A 5F1HA 4NQMA 5C89A 5CQ6A 2YDWA 3SVHA 5HM0A 3P5OA 5FBXA 5F60A 1WUGA 5I7YA 5ENGA 5D25A 4A9MA 4QYLA 2YYNA 4YATA 4Y03A 2RNYA 2R0VA 5CUEA 5DBMA 5FFVA 2RI7A 5ENJA 4O7BA 5CZGA 5ENEA 5BT4A 3K2JA 5A5NA 5ENCA 4UYFB 3LQIA 5CQ5A 5H1VA 5TB6A 4NUDA 3SVFA 5JWMA 2I7KA 5FFWA 2E7NA 4CUSA 3U5NA 3P1EA 5FDZA 5EWHA 2RNWA 5F62A 3HMEA 5A5RA 4A9NA 4A9FA 4PKLA 4XUBA 5CS8A 5EU1A 2KTBB 5AMFA 4OGIA 4QEUA 5IGMA 4F3IA 5FB0A 2OSSA 5II2A 3JVJA 4KCXA 4MEQA 4TT6A 3U5KA 4HXNA 2F6JA 5A82A 3UV5A 3QZVA 5HCLA 4OUFA 4N4HA 5HFQA 4IR4A 3UVDA 4HBVA 4E96A 4ZC9A 4YBTA 3G0JA 5FG6A 5C85A 1ZS5A 3MXFA 4N4GA 5LJ2A 5KHMA 5ETDA 4QSQA 5CQ7A 4YY6A 2OUOA 5FE1A 4LRGA 5A5OA 4FLPA 3DAIA 4YH4A 4UYHA 5KTXA 5D7XA 3NXBA 5HLSA 4QEWA 5F1LA 2RO1A 5EVAA 2RNXA 4YC9A 5EWVA 5C8GA 4QEVA 5D3PA 5F5ZA 3U5PA 2YEKA 4NR7A 3QZTA 5DLXA 4XYAA 4HXRA 2MJVB 4IOQA 5I80A 5HELA 2L5EA 2DVQA 4NR5A 4PCIA 4TZ8A 3HMHA 4QR3A 2DVSA 2R0SA 4QNSA 5A5SA 5ACYA 5F63A 5H85A 4YK0A 5C4QA 3U5JA 4UYDA 4J0SA 4DONA 5EPSA 4NRBA 4YH3A 5EPBA 3G0LA 4QUTA 5E9MA 4A9IA 4MEOA 5F36A 4NQNA 2RS9B 5DFDA 4O77A 5CUDA 5L98A 5CQAA 4HXKA 5CTLA 3O36A 4NXJA 5E0RA 4YYKA 5DKHA 4IOOA 2YEMA 5I40A 5IGKA 4QR5A 3SVGA 4NR8A 5COIA 5KTWA 2YW5A 4BW3A 4O74A 3JVLA 4YBMA 4MR3A 1WUMA 4O7FA 3U5MA 5EWWA 5LVQA 5CRZA 4CFKA 5HRWA 4BW1A 4CURA 5I83A 5DX4A 4TTEA 4CLBA 3LXJA 3HMFA 5DKCA 4XY8A 4HXOA 5EISA 3LQHA 4UIVA 5DYAA 3UW9A 2DVRA 4A9HA 4CUPA 4XUAA 3ZYUA 4YYJA 5A85A 1JSPB 4ALHA 5DY7A 4UITA 5AD3A 4HXLA 4LYIA 5CQ4A 5F2PA 5EPRA 2H60A 4A9OA 5F3AA 4J0RA 2N9GA 1X0JA 3FKMX 5ENBA 2F6NA 4QSVA 3O35A 3JVMA 4ALGA 4J1PA 4A9JA 3I3JA 4IR3A 5FE9A 4QSWA 5IGNA 5DFBA 4A9EA 4O7EA 5DW1A 4UIZA 3MB3A 3MUKA 5D3JA 5E74A 4LYSA 5LKUA 4NR9A 4HBYA 5HFRA 4O7CA 4CL9A 5H1UA 5DYUA 5E9KA 5EWCA 3U5LA 4NRAA 5ENHA 4Z1QA 5TCMA 5A81A 3D7CA 5CUGA 4UYEA 2WP1A 5EV9A 4TU6A 5L99A 5FE4A 4YYGA 5EGUA 5EM3A 3Q2EA 4UIUA 5LVRA 5I1QA 5L96A 4XY9A 5E73A 4O76A 3LJWA 4TU4A 2D82A 3UVXA 4QB3A 5D0CA 4KV1A 4N4FA 5E3GA 4QY4A 5EI4A 4YY4A 5FB1A 4TT2A 5DYXA 5HRXA 5CUCA 5FE5A 4RVRA 2LSPB 4O78A 5IGLA 4QSSA 5CRMA 5CFWA 4TS8A 4ZQLA 5A83A 4PY6A 4HXMA 5I89A 4NRCA 4MEPA 5HQ6A 3LQJA 5FE2A 4IR6A 5CPEA 5FE7A 2GRCA 4TQNA 2D9EA 5KO4A 4BJXA 5E9VA 5L8UA 5FE6A 4NYXA 5LKZA 4MENA 4AKNA 4Z6IA 5DYCA 5LUUA 5AMEA 5E9IA 5BT5A 3S92A 4WHWA 4KV4A 5FFYA 5A5PA 4TYLA 3S91A 4IORA 4LZSA 2DVVA 5J0DA 5D24A 4UIXA 4O71A 3RCWA 2L84A 2NXBA 1F68A 5LKTA 5EWDA 4O75A 4Q0NA 5E9YA 5EQ1A 5LJ0A 4UYGA 4BW2A 5F25A 5L97A 5E7DA 3TLPA 1JM4B 4CUQA 4UIYA 4TT4A 4QSUA 5G4RA 4N3WA 3JVKA 5CP5A 4O72A 5EA1A 5C7NA 5HQ5A 3O37A 5CQTA 4YYIA 2FSAA 5HJCA 4CUTA 4HBWA 5D3SA 4NUCA 3O33A 3AQAA 3UV4A 4CUUA 4HXSA 5DKDA 4Z1SA 2YELA 3UVWA 4LZ2A 5FE3A 3Q2FA 4QC1A 4N4IA 4YAXA 4NUEA 4HXPA 4WIVA 4Z6HA 3UV2A 5D26A 4QSRA 5HEMA 5I29A 2WP2A 5K29A 5CUBA 4IR5A 5CU8A 4MR4A 3IU6A 4Z93A 5HQ7A 5FH7A 4YYHA 1EQFA 5EK9A 4MR6A 5CGPA 4UYFA 4QR4A 5FH8A 4O7AA 2E7OA 2DATA 4ZW1A 4PS5A 5EICA 2I8NA 4LR6A 4MR5A 5DFCA 5DLZA 5HRVA 4A9KA 4NR6A 4YYDA 2R0YA 3MB4A 4LYWA 4J3IA 5F61A 4NS5A 5I88A 5FE8A 4CFLA 4LC2A 3P1CA 5L8TA 5LKXA 4O70A 5KTUA 4LDFA 3MQMA 5BT3A 4BHWA 5I86A 3U5OA 4QSXA 5A7CA 4NYWA 3QZSA 5IIDA 4OGJA 4NYVA 5D3TA 5CQ3A 4Q0OA 4YADA 5D3NA 3IU5A 5KU3A 4BW4A 4QC3A 5DW2A 3GG3A 5CUAA 4NR4A 2RFJA 4X2IA 4PTBA 5E3DA 4PCEA 5D3HA 4YYNA 4YABA 4WHUA 5EP7A 5C87A 5AD2A 5JI8A 4YYMA 4QBMA 5FG4A 3DWYA 5IBNA 3UVYA 5H1TA 4HBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E6IA 3P1DA 5D3RA 5FH6A 2YQDA 4GPJA 5I7XA 4C67A 2L85A 5CQ8A 2DKWA 5FG5A 5D3LA 2DWWA 2R10A 4TZ2A 3MULA 4QSTA 5FE0A 5ENIA 5LJ1A 5HENA 3AADA 4C66A 4QSPA 3ONIA 2E3KA 1N72A 5ENFA 4LZRA 4YBSA 2OO1A 4A9LA 4QUUA 5A5QA 5CY9A 5E9LA 5G4SA 3D1DA 3P1FA 5ETBA 5IG6A 4QZSA 5II1A 4UIWA 4QYDA 2G4AA 3O34A 5F1HA 4NQMA 5C89A 5CQ6A 2YDWA 3SVHA 5HM0A 3P5OA 5FBXA 5F60A 1WUGA 5I7YA 5ENGA 5D25A 4A9MA 4QYLA 2YYNA 4YATA 4Y03A 2RNYA 2R0VA 5CUEA 5DBMA 5FFVA 2RI7A 5ENJA 4O7BA 5CZGA 5ENEA 5BT4A 3K2JA 5A5NA 5ENCA 4UYFB 3LQIA 5CQ5A 5H1VA 5TB6A 4NUDA 3SVFA 5JWMA 2I7KA 5FFWA 2E7NA 4CUSA 3U5NA 3P1EA 5FDZA 5EWHA 2RNWA 5F62A 3HMEA 5A5RA 4A9NA 4A9FA 4PKLA 4XUBA 5CS8A 5EU1A 2KTBB 5AMFA 4OGIA 4QEUA 5IGMA 4F3IA 5FB0A 2OSSA 5II2A 3JVJA 4KCXA 4MEQA 4TT6A 3U5KA 4HXNA 2F6JA 5A82A 3UV5A 3QZVA 5HCLA 4OUFA 4N4HA 5HFQA 4IR4A 3UVDA 4HBVA 4E96A 4ZC9A 4YBTA 3G0JA 5FG6A 5C85A 1ZS5A 3MXFA 4N4GA 5LJ2A 5KHMA 5ETDA 4QSQA 5CQ7A 4YY6A 2OUOA 5FE1A 4LRGA 5A5OA 4FLPA 3DAIA 4YH4A 4UYHA 5KTXA 5D7XA 3NXBA 5HLSA 4QEWA 5F1LA 2RO1A 5EVAA 2RNXA 4YC9A 5EWVA 5C8GA 4QEVA 5D3PA 5F5ZA 3U5PA 2YEKA 4NR7A 3QZTA 5DLXA 4XYAA 4HXRA 2MJVB 4IOQA 5I80A 5HELA 2L5EA 2DVQA 4NR5A 4PCIA 4TZ8A 3HMHA 4QR3A 2DVSA 2R0SA 4QNSA 5A5SA 5ACYA 5F63A 5H85A 4YK0A 5C4QA 3U5JA 4UYDA 4J0SA 4DONA 5EPSA 4NRBA 4YH3A 5EPBA 3G0LA 4QUTA 5E9MA 4A9IA 4MEOA 5F36A 4NQNA 3VKGA 2RS9B 5DFDA 4O77A 5CUDA 5L98A 5CQAA 4HXKA 5CTLA 3O36A 4NXJA 5E0RA 4YYKA 5DKHA 4IOOA 2YEMA 5I40A 5IGKA 4QR5A 3SVGA 4NR8A 5COIA 5KTWA 2YW5A 1ZKRA 4BW3A 4O74A 3JVLA 4YBMA 4MR3A 1WUMA 4O7FA 3U5MA 5EWWA 5LVQA 5CRZA 4CFKA 5HRWA 4BW1A 4CURA 5I83A 5DX4A 4TTEA 4CLBA 3LXJA 3HMFA 5DKCA 3ERRA 4XY8A 4HXOA 5EISA 3LQHA 4UIVA 5DYAA 3UW9A 2DVRA 4A9HA 4CUPA 4XUAA 3ZYUA 4YYJA 5A85A 1JSPB 4ALHA 5DY7A 4UITA 5AD3A 4HXLA 4LYIA 5CQ4A 5F2PA 5EPRA 2H60A 4A9OA 5F3AA 4J0RA 2N9GA 1X0JA 3FKMX 5ENBA 2F6NA 3D1BA 4QSVA 3O35A 3JVMA 4ALGA 4J1PA 4A9JA 3I3JA 4IR3A 5FE9A 4QSWA 5IGNA 5DFBA 4A9EA 4O7EA 5DW1A 3VKHA 4UIZA 3MB3A 3MUKA 5D3JA 5E74A 4LYSA 5LKUA 4NR9A 4HBYA 5HFRA 4O7CA 4CL9A 5H1UA 5DYUA 5E9KA 5EWCA 3U5LA 4NRAA 5ENHA 4Z1QA 5TCMA 5A81A 3D7CA 4AKGA 5CUGA 4UYEA 2WP1A 5EV9A 4TU6A 5L99A 5FE4A 4YYGA 5EGUA 5EM3A 3Q2EA 4UIUA 5LVRA 5I1QA 5L96A 4XY9A 5E73A 4O76A 3LJWA 4TU4A 2D82A 3UVXA 4QB3A 5D0CA 4KV1A 4N4FA 5E3GA 4QY4A 5EI4A 4YY4A 5FB1A 4TT2A 5DYXA 5HRXA 5CUCA 5FE5A 4RVRA 2LSPB 4O78A 5IGLA 4QSSA 5CRMA 5CFWA 4TS8A 4ZQLA 5A83A 4PY6A 4HXMA 5I89A 4NRCA 4MEPA 5HQ6A 3LQJA 5FE2A 4IR6A 5CPEA 5FE7A 2GRCA 4TQNA 2D9EA 5KO4A 4BJXA 5E9VA 5L8UA 5FE6A 4NYXA 5LKZA 4MENA 4AKNA 4Z6IA 5DYCA 5LUUA 5AMEA 5E9IA 5BT5A 3S92A 4WHWA 4KV4A 5FFYA 5A5PA 4TYLA 3S91A 4IORA 4LZSA 2DVVA 5J0DA 5D24A 4UIXA 4O71A 3RCWA 2L84A 2NXBA 1F68A 5LKTA 5EWDA 4O75A 4Q0NA 2EJNA 5E9YA 5EQ1A 5LJ0A 4UYGA 4BW2A 5F25A 5L97A 4AKHA 5E7DA 3TLPA 1JM4B 4CUQA 4UIYA 4TT4A 4QSUA 5G4RA 4N3WA 3JVKA 5CP5A 4O72A 5EA1A 5C7NA 5HQ5A 3O37A 5CQTA 4YYIA 2FSAA 5HJCA 4CUTA 4HBWA 5D3SA 4NUCA 3O33A 3AQAA 3UV4A 4CUUA 4HXSA 5DKDA 4Z1SA 2YELA 3UVWA 4LZ2A 5FE3A 3Q2FA 4QC1A 4N4IA 4YAXA 4NUEA 4HXPA 4WIVA 4Z6HA 3UV2A 5D26A 4QSRA 5HEMA 5I29A 2WP2A 5K29A 5CUBA 4IR5A 5CU8A 4MR4A 3IU6A 4Z93A 5HQ7A 5FH7A 4YYHA 1EQFA 5EK9A 4MR6A 5CGPA 4UYFA 4QR4A 5FH8A 4O7AA 2E7OA 4AKIA 2DATA 4ZW1A 4PS5A 5EICA 2I8NA 4LR6A 4MR5A 5DFCA 5DLZA 5HRVA 4A9KA 4NR6A 4YYDA 2R0YA 3MB4A 4LYWA 4J3IA 5F61A 4NS5A 5I88A 5FE8A 4CFLA 4LC2A 3P1CA 5L8TA 5LKXA 4O70A 5KTUA 4LDFA 3MQMA 5BT3A 4BHWA 5I86A 3U5OA 4QSXA 5A7CA 4NYWA 3QZSA 5IIDA 4OGJA 4NYVA 5D3TA 5CQ3A 4Q0OA 4YADA 1PUOA 5D3NA 3IU5A 5KU3A 4BW4A 4QC3A 5DW2A 4AI6A 3GG3A 5CUAA 4NR4A 2RFJA 4X2IA 4PTBA 5E3DA 4PCEA 5D3HA 4YYNA 4YABA 4WHUA 5EP7A 5C87A 5AD2A 5JI8A 4YYMA 4QBMA 5FG4A 3DWYA 5IBNA 3UVYA 5H1TA 4HBXA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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