5ENEA

Crystal structure of the second bromodomain of pleckstrin homology domain interacting protein (phip) in complex with 5-amino-2-benzyl-1,3-oxazole-4-carbonitrile (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
SMSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFATVRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALRFHKRN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A poised fragment library enables rapid synthetic expansion yielding the first reported inhibitors of PHIP(2), an atypical bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PH-interacting protein
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5eneA00
4YK0A 2G4AA 4QR4A 3IU5A 5EM3A 5E9KA 3I3JA 4O7AA 4E96A 4QEUA 5D3JA 2E7OA 5ETDA 3QZVA 4A9LA 5EPBA 2KTBB 4OUFA 4IR5A 5FE4A 3P1FA 2F6JA 3JVJA 3DWYA 2N9GA 5BT3A 5CQ6A 4YH3A 5DFDA 2RO1A 5HFQA 5CUEA 3AADA 4N4GA 1N72A 2YQDA 1WUMA 2DATA 2YELA 2RFJA 5D25A 2GRCA 3LXJA 4CURA 3MB3A 3P1CA 4A9FA 2NXBA 3HMHA 4YYNA 4PCEA 4O7CA 3JVKA 4WHWA 5HRXA 5D26A 4PKLA 5KHMA 5A5RA 4YBSA 4CUSA 4YADA 5JI8A 5EP7A 4TU6A 5AMEA 4CUTA 4TQNA 4HXMA 5LJ0A 4QSWA 4BW2A 4NRBA 5HRVA 3HMEA 5LKUA 4WHUA 5ENCA 3UW9A 3UVXA 5EQ1A 2WP2A 5ENIA 4KV4A 4C67A 4NRCA 4ZC9A 5FE1A 1WUGA 5FH6A 5I1QA 4NR7A 4CUPA 5H1TA 5H1VA 5DX4A 2L5EA 4N4IA 3U5NA 5HQ6A 4YYKA 5IGKA 4ALGA 5I88A 4QY4A 2L85A 4QC1A 5FB0A 2RNYA 5F25A 5AD2A 5LVQA 5EK9A 4MEPA 3TLPA 5FFVA 5COIA 1EQFA 4YC9A 5EPSA 5CUDA 4MR3A 4OGJA 4J0SA 4QYLA 4UYGA 5D0CA 5A85A 5D3LA 2OSSA 3D7CA 5EWVA 5KTUA 5IG6A 5EGUA 5CP5A 5CFWA 2R10A 3P1DA 5CTLA 4LZ2A 5DKHA 4QR5A 5L8UA 4O75A 5FH8A 3LQJA 3ZYUA 4Z93A 5E0RA 3SVHA 4CUUA 5I40A 4HXLA 4O7BA 4AKNA 5A5SA 3MQMA 2D9EA 5EV9A 4QC3A 5G4SA 4QR3A 2I7KA 4ZQLA 5L96A 3U5JA 1F68A 3JVLA 3O37A 4LYSA 4QSRA 2FSAA 5G4RA 5F2PA 5I89A 4NUDA 4TT2A 5F63A 5HQ7A 4QUUA 5KO4A 5CUGA 5CQ8A 4YABA 5F1HA 2DVVA 5ENJA 4YAXA 2LSPB 5FG5A 3O36A 2YYNA 4NS5A 4O71A 5A5NA 3GG3A 4ALHA 5E7DA 4TU4A 5DLZA 4YBMA 4YBTA 5CRZA 3QZSA 5F5ZA 2R0YA 4LDFA 5CUBA 5FB1A 4CL9A 5F60A 1JSPB 4NYWA 4UIVA 5CGPA 5EI4A 5FFYA 2RNWA 5AD3A 4UIUA 4Z1SA 5FE2A 5CS8A 2H60A 4NYXA 4UYHA 5ENGA 5DYAA 5H85A 3UV2A 4DONA 3LQHA 5CQ4A 4BW4A 5F3AA 3DAIA 5EWCA 4CFKA 5E3DA 4YYDA 5IGNA 4YYJA 4O76A 4QNSA 5BT5A 4MENA 5HENA 5E9IA 4BJXA 4PCIA 2L84A 4A9HA 4MR6A 4O74A 4LYIA 5EA1A 4NUCA 4C66A 5C89A 5DFBA 4BW1A 5D3PA 4HXPA 4UYDA 2RS9B 4O70A 5D3NA 5A7CA 4TS8A 4YH4A 5L97A 4IR6A 5DYCA 2MJVB 5CZGA 5CUCA 3MUKA 4O77A 4PY6A 5HCLA 3G0LA 4QSUA 4HXKA 1JM4B 3MB4A 4TT6A 4LZSA 4QSTA 3IU6A 3U5KA 3RCWA 3NXBA 4YYMA 5I29A 4NR8A 4J1PA 2DWWA 4O7EA 2E3KA 5D3RA 4ZW1A 5C8GA 5LVRA 5ACYA 5D3TA 3LQIA 4MR5A 5DW1A 5IBNA 5ETBA 5LUUA 2D82A 5D3SA 5A5QA 4NR5A 5HQ5A 3ONIA 4BHWA 4QEVA 4UYEA 2OUOA 5CPEA 4KCXA 4UIXA 5IGLA 4A9KA 3U5PA 3MXFA 4LRGA 5C7NA 4X2IA 5CU8A 5CQTA 2DVSA 4QUTA 4QYDA 5FE5A 4KV1A 4NYVA 4NQNA 4Q0OA 5CY9A 4LYWA 4QSVA 4MEQA 5KTWA 5E9VA 3JVMA 4A9OA 4XUBA 5D24A 4FLPA 2OO1A 5A81A 2DVQA 5AMFA 5HM0A 4YY4A 4N4FA 5DKCA 4NR9A 5H1UA 5BT4A 3SVGA 2DVRA 4IOOA 4TT4A 3U5OA 5LJ2A 2R0SA 4Z6IA 5I86A 3QZTA 3UVWA 5LKZA 5C87A 4NUEA 5EWHA 5CQ3A 4QSQA 5ENEA 5DYUA 3UV5A 4O78A 4Y03A 5E9YA 5EISA 5FH7A 4A9MA 5C85A 2I8NA 3U5MA 4LZRA 4HXNA 4XUAA 3SVFA 1ZS5A 4YYHA 5I7YA 5F36A 3S91A 4HBVA 5TCMA 3U5LA 4GPJA 3UV4A 3LJWA 4A9IA 4QSXA 2RNXA 2YEMA 4LR6A 4UIZA 5II2A 4LC2A 3Q2FA 5LKXA 5FE7A 4WIVA 4IORA 5FG6A 4YYIA 5C4QA 5JWMA 4TZ2A 4HXOA 4IR4A 5DYXA 2DKWA 4BW3A 5D3HA 5HFRA 5A5PA 4IOQA 1X0JA 4TTEA 4HXRA 5ENHA 5FFWA 4Z6HA 4CLBA 4J0RA 5KTXA 5I7XA 3UVDA 4A9EA 5E3GA 5FDZA 4RVRA 3O34A 4O72A 5EWWA 4MEOA 4UIYA 4HXSA 5IIDA 3O33A 4QSSA 4NRAA 5II1A 5ENBA 5L98A 5DY7A 5HLSA 5FG4A 4YY6A 4XY8A 4NR6A 3FKMX 5E74A 4YYGA 5DW2A 5EPRA 5HRWA 4A9NA 2F6NA 5EWDA 5CUAA 3HMFA 3P1EA 5HELA 5FE0A 5EICA 4N3WA 2R0VA 4CUQA 4QSPA 4NQMA 4QZSA 5KU3A 5CRMA 5DBMA 2YW5A 5DLXA 3MULA 5IGMA 5CQ7A 4QB3A 5ENFA 5F61A 4XYAA 5A83A 3S92A 5E73A 2RI7A 4PTBA 4MR4A 5EVAA 4J3IA 2YDWA 5L99A 5A82A 5FE3A 4NR4A 5DKDA 5LKTA 4F3IA 5K29A 4PS5A 4N4HA 4QEWA 4HBXA 4Z1QA 4UIWA 4XY9A 4QBMA 5LJ1A 4Q0NA 4HBWA 5TB6A 3AQAA 4TZ8A 5HJCA 4IR3A 4HBYA 5D7XA 2YEKA 5FE9A 5J0DA 5CQ5A 4UYFA 4OGIA 4YATA 1E6IA 4NXJA 4CFLA 3K2JA 3Q2EA 5EU1A 5FE8A 2E7NA 5F62A 4UYFB 5F1LA 5DFCA 3UVYA 4O7FA 3P5OA 5E9MA 5I83A 3O35A 5CQAA 4TYLA 2WP1A 5I80A 5L8TA 5FE6A 5E9LA 5FBXA 3G0JA 4UITA 4A9JA 5A5OA 5HEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YK0A 2G4AA 4QR4A 3IU5A 5EM3A 5E9KA 3I3JA 4O7AA 4E96A 4QEUA 5D3JA 2E7OA 5ETDA 3QZVA 4A9LA 5EPBA 2KTBB 4OUFA 4IR5A 5FE4A 3P1FA 3D1DA 2F6JA 3JVJA 3DWYA 2N9GA 5BT3A 5CQ6A 4YH3A 5DFDA 2RO1A 5HFQA 5CUEA 3AADA 4N4GA 1N72A 2YQDA 1WUMA 2DATA 2YELA 2RFJA 5D25A 2GRCA 3LXJA 4CURA 3MB3A 3P1CA 4A9FA 2NXBA 3HMHA 4YYNA 4PCEA 4O7CA 3JVKA 4WHWA 5HRXA 5D26A 4PKLA 5KHMA 5A5RA 4YBSA 4CUSA 4YADA 5JI8A 5EP7A 4TU6A 5AMEA 4CUTA 4TQNA 4HXMA 5LJ0A 4QSWA 4BW2A 4NRBA 5HRVA 3HMEA 5LKUA 4WHUA 5ENCA 3UW9A 3UVXA 5EQ1A 2WP2A 5ENIA 4AKGA 4KV4A 4C67A 4NRCA 4ZC9A 5FE1A 1WUGA 5FH6A 5I1QA 4NR7A 4CUPA 5H1TA 5H1VA 5DX4A 2L5EA 3VKGA 4N4IA 3U5NA 5HQ6A 4YYKA 5IGKA 4ALGA 5I88A 4QY4A 2L85A 4QC1A 5FB0A 2RNYA 5F25A 5AD2A 5LVQA 5EK9A 4MEPA 3TLPA 5FFVA 5COIA 1EQFA 4YC9A 5EPSA 5CUDA 4MR3A 4OGJA 4J0SA 4QYLA 4UYGA 5D0CA 5A85A 5D3LA 2OSSA 3D7CA 5EWVA 5KTUA 1ZKRA 5IG6A 5EGUA 5CP5A 5CFWA 2R10A 3P1DA 5CTLA 4LZ2A 5DKHA 4QR5A 5L8UA 4O75A 5FH8A 3LQJA 3ERRA 3ZYUA 4Z93A 5E0RA 3SVHA 4CUUA 5I40A 4HXLA 4O7BA 4AKNA 5A5SA 3MQMA 2D9EA 5EV9A 4QC3A 5G4SA 4QR3A 2I7KA 4ZQLA 5L96A 3D1BA 3U5JA 1F68A 3JVLA 3O37A 4LYSA 4QSRA 2FSAA 5G4RA 5F2PA 5I89A 4NUDA 4TT2A 5F63A 5HQ7A 4QUUA 5KO4A 5CUGA 5CQ8A 4YABA 5F1HA 2DVVA 5ENJA 4YAXA 2LSPB 5FG5A 3O36A 2YYNA 4NS5A 4O71A 4AI6A 5A5NA 3GG3A 4ALHA 5E7DA 4TU4A 5DLZA 4YBMA 4YBTA 5CRZA 3QZSA 5F5ZA 2R0YA 4LDFA 5CUBA 5FB1A 4CL9A 5F60A 1JSPB 4NYWA 4UIVA 5CGPA 5EI4A 5FFYA 2RNWA 5AD3A 4UIUA 4Z1SA 5FE2A 5CS8A 2H60A 4NYXA 4UYHA 5ENGA 5DYAA 5H85A 3UV2A 4DONA 3LQHA 5CQ4A 4BW4A 5F3AA 3DAIA 5EWCA 4CFKA 5E3DA 4YYDA 5IGNA 4YYJA 4O76A 4QNSA 5BT5A 4MENA 5HENA 5E9IA 4BJXA 4PCIA 2L84A 4A9HA 4MR6A 4O74A 4LYIA 5EA1A 4NUCA 4C66A 5C89A 5DFBA 4BW1A 5D3PA 4HXPA 4UYDA 2RS9B 4O70A 5D3NA 5A7CA 4TS8A 4YH4A 5L97A 4IR6A 5DYCA 2MJVB 5CZGA 5CUCA 3MUKA 4O77A 4PY6A 5HCLA 3G0LA 4QSUA 4HXKA 1JM4B 3MB4A 4TT6A 4LZSA 4QSTA 3IU6A 3U5KA 3RCWA 3NXBA 4YYMA 5I29A 4NR8A 4J1PA 2DWWA 4O7EA 2E3KA 5D3RA 4ZW1A 5C8GA 5LVRA 5ACYA 5D3TA 3LQIA 4MR5A 5DW1A 5IBNA 5ETBA 5LUUA 2D82A 5D3SA 5A5QA 4NR5A 5HQ5A 3ONIA 4BHWA 4QEVA 4UYEA 2OUOA 5CPEA 4KCXA 4UIXA 5IGLA 4A9KA 3U5PA 3MXFA 4LRGA 5C7NA 4X2IA 5CU8A 5CQTA 2DVSA 4QUTA 4QYDA 5FE5A 4KV1A 4NYVA 4NQNA 4Q0OA 5CY9A 4LYWA 4QSVA 4MEQA 5KTWA 5E9VA 3JVMA 4A9OA 4XUBA 5D24A 4FLPA 2OO1A 5A81A 2DVQA 5AMFA 5HM0A 4YY4A 4N4FA 5DKCA 4NR9A 5H1UA 5BT4A 3SVGA 2DVRA 4IOOA 4TT4A 3U5OA 5LJ2A 2R0SA 4Z6IA 5I86A 3QZTA 3UVWA 5LKZA 5C87A 4NUEA 5EWHA 5CQ3A 4QSQA 5ENEA 5DYUA 3UV5A 4O78A 4Y03A 5E9YA 5EISA 5FH7A 4A9MA 5C85A 2I8NA 3U5MA 4LZRA 4HXNA 4XUAA 3SVFA 4AKHA 1ZS5A 4YYHA 5I7YA 5F36A 3S91A 4HBVA 5TCMA 3U5LA 4GPJA 3UV4A 3LJWA 4A9IA 4QSXA 2RNXA 2YEMA 4LR6A 4UIZA 5II2A 4LC2A 3Q2FA 5LKXA 5FE7A 4WIVA 4IORA 5FG6A 4YYIA 5C4QA 5JWMA 4TZ2A 4HXOA 4IR4A 5DYXA 2DKWA 4BW3A 5D3HA 5HFRA 5A5PA 4IOQA 1X0JA 4TTEA 4HXRA 5ENHA 5FFWA 4Z6HA 4CLBA 4J0RA 5KTXA 5I7XA 3UVDA 4A9EA 5E3GA 5FDZA 4RVRA 3O34A 4O72A 5EWWA 4MEOA 4UIYA 4HXSA 5IIDA 3O33A 4QSSA 4NRAA 5II1A 5ENBA 5L98A 5DY7A 5HLSA 5FG4A 4YY6A 4XY8A 4NR6A 3FKMX 5E74A 4YYGA 5DW2A 5EPRA 5HRWA 4A9NA 2F6NA 5EWDA 5CUAA 3HMFA 3P1EA 5HELA 5FE0A 5EICA 4N3WA 2R0VA 4CUQA 4QSPA 4NQMA 4QZSA 5KU3A 5CRMA 5DBMA 2YW5A 3VKHA 5DLXA 3MULA 5IGMA 5CQ7A 4QB3A 5ENFA 5F61A 4XYAA 5A83A 3S92A 5E73A 2RI7A 4PTBA 4MR4A 5EVAA 4J3IA 2YDWA 5L99A 5A82A 5FE3A 4NR4A 5DKDA 5LKTA 4F3IA 5K29A 4PS5A 4N4HA 4QEWA 4HBXA 4Z1QA 4UIWA 4XY9A 4QBMA 5LJ1A 4Q0NA 4HBWA 5TB6A 3AQAA 4TZ8A 5HJCA 4IR3A 4HBYA 5D7XA 2YEKA 5FE9A 5J0DA 5CQ5A 4UYFA 4OGIA 4YATA 1E6IA 4NXJA 4CFLA 3K2JA 3Q2EA 5EU1A 5FE8A 1PUOA 2E7NA 5F62A 4AKIA 4UYFB 5F1LA 5DFCA 3UVYA 4O7FA 3P5OA 5E9MA 5I83A 3O35A 5CQAA 4TYLA 2WP1A 5I80A 5L8TA 2EJNA 5FE6A 5E9LA 5FBXA 3G0JA 4UITA 4A9JA 5A5OA 5HEMA
chains in the Genus database with same CATH topology
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