5F5ZA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with ma2-014
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Potent Dual BET Bromodomain-Kinase Inhibitors as Value-Added Multitargeted Chemical Probes and Cancer Therapeutics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
molecule tags Transcription/transcription inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f5zA01
4CUUA 4O7CA 5DW2A 4CUPA 4TZ8A 4QC3A 4UIYA 5HQ7A 3G0JA 4HXKA 4O72A 5DYUA 4UIXA 5EWWA 4Q0OA 2DVQA 4OGIA 5H85A 5LJ1A 3P1DA 5EPRA 3O33A 5K29A 5A85A 4TT6A 2DATA 5EWCA 2LSPB 4A9FA 5JI8A 1X0JA 4LRGA 4QSWA 4A9HA 5DKCA 5A5RA 2E7OA 5FH6A 1EQFA 4XUAA 5HQ6A 4KCXA 3UV4A 3MB3A 4NUEA 5IGLA 2L5EA 4J0SA 4IOOA 2I7KA 5DFBA 4NQMA 4WIVA 5HRVA 3SVFA 5I7YA 4WHWA 4O74A 4CUQA 4ALGA 5C7NA 4Z1QA 4O77A 4NQNA 4QEWA 5CS8A 2YEMA 3QZTA 4TQNA 5J0DA 3IU6A 5D3SA 4YC9A 4YAXA 3ONIA 3RCWA 2YYNA 4YBSA 4YYIA 5ETBA 4PTBA 5I7XA 3U5NA 4MR5A 4J3IA 4YK0A 4IR6A 2YW5A 3O36A 4TYLA 5BT3A 4NXJA 4QEVA 4LR6A 4E96A 4BHWA 4TT2A 5FB0A 4YYJA 5IG6A 5IBNA 2D82A 4YH4A 5E9YA 5EV9A 4DONA 5F1LA 4IR3A 4QSXA 4GPJA 4O7AA 3UVXA 5DLZA 5A81A 4A9NA 5FE9A 5LKXA 5JWMA 5D3HA 5E9IA 4Z6IA 5F60A 5KHMA 4HXNA 4PKLA 2RO1A 4TU4A 4TU6A 5ENHA 3MXFA 5CUBA 5E7DA 4PS5A 4YATA 3O34A 5DFCA 2I8NA 4YYHA 2RI7A 5FB1A 5E3GA 5HFRA 5CQ8A 5LJ0A 5HRXA 4F3IA 2OUOA 2L85A 5E74A 5F36A 5CUDA 3U5LA 4LZSA 5CQTA 5E9LA 3U5PA 5D24A 3U5JA 5ENEA 3U5MA 5ENCA 4YADA 5EI4A 3Q2EA 5KTUA 4YH3A 5HM0A 5IIDA 5AMFA 3TLPA 5FFYA 1WUGA 4RVRA 5DKDA 5CFWA 4O71A 5E73A 5A5QA 4HBVA 4CURA 2RNXA 4O7EA 5L99A 4ZW1A 5EICA 5A7CA 4A9IA 1E6IA 5G4RA 4J0RA 5L96A 5I89A 3MB4A 5DFDA 4YYDA 3U5OA 4Q0NA 4NYXA 5EQ1A 5ETDA 5CUCA 5HLSA 4YYMA 2DVSA 3MULA 5FE6A 5CTLA 4NRBA 4QUUA 5E9KA 5AD2A 5I83A 5D0CA 5FE7A 4QSVA 4QNSA 4LZRA 2OO1A 3K2JA 4Z93A 5II2A 4MR4A 4BW1A 4IORA 5CPEA 5A82A 4O78A 5L8UA 5F5ZA 5ENJA 5FBXA 2OSSA 3MQMA 2FSAA 4MEOA 4TTEA 5IGMA 4A9OA 4LYWA 4TS8A 4QSTA 2YELA 3U5KA 4QSQA 4UIZA 3LQJA 2YEKA 5EWHA 5FE1A 5I40A 4HBWA 5L98A 5I86A 5L8TA 3LQIA 4QUTA 3LJWA 5FG5A 3P5OA 4QY4A 5ACYA 5HQ5A 3AADA 4NR4A 4CFLA 4MEPA 3UVWA 3NXBA 5D3TA 4ALHA 5CGPA 5CP5A 4AKNA 4O70A 4FLPA 5EISA 3HMEA 5LUUA 4OGJA 5FE3A 4A9MA 4YYKA 4MENA 4Z6HA 5A5PA 5C89A 4ZC9A 3Q2FA 4HXPA 1JSPB 4NRCA 5E0RA 2F6NA 5ENGA 5EU1A 5D25A 5HRWA 3IU5A 5CQ3A 2NXBA 5EPBA 3JVMA 4UIWA 4BW3A 5G4SA 4O75A 3LXJA 3S92A 4YYGA 5A5OA 5HENA 3GG3A 5IGKA 5D3RA 5HCLA 4X2IA 4NUDA 5CRMA 4HBXA 1N72A 4YBMA 2E3KA 5DYAA 2MJVB 5C85A 5FE4A 2DWWA 2H60A 2WP2A 4MR6A 5FH8A 4HBYA 5F25A 4NR8A 5F61A 3ZYUA 5TCMA 4CL9A 5DKHA 1F68A 3UV5A 4O7FA 4NR9A 5I80A 5FFWA 5HJCA 5FH7A 5AD3A 3D7CA 5EPSA 5D26A 5II1A 5FFVA 4TZ2A 4YBTA 2R0YA 5A5NA 3P1EA 2RFJA 5F62A 4YYNA 5FE5A 5H1TA 5F3AA 4A9KA 4LZ2A 2N9GA 4QR4A 4PCEA 2D9EA 4NYWA 4QEUA 5I88A 5CU8A 5COIA 5CQ7A 4YY6A 3UW9A 4N4GA 5KTXA 5I29A 2E7NA 3O37A 5A5SA 3SVHA 4XY8A 5ENIA 5EVAA 4N3WA 5D7XA 5KTWA 3JVJA 4QSSA 4J1PA 4KV1A 4UYFB 1WUMA 3G0LA 4NYVA 4A9JA 5BT4A 4BW4A 5EK9A 4UYGA 3S91A 3QZVA 4QSUA 4O76A 4QR3A 5LVRA 5D3JA 2RNWA 4YY4A 4HXOA 5DYXA 5I1QA 3QZSA 4MR3A 4HXSA 4QSRA 4QR5A 3SVGA 4LDFA 2DKWA 5D3NA 3DAIA 4Z1SA 3UV2A 4ZQLA 4LYIA 5LKUA 5CQ4A 4QC1A 3AQAA 4QYLA 4CLBA 1JM4B 3P1CA 3I3JA 5C87A 4UIUA 2R10A 4NR7A 4CFKA 3UVDA 5CQAA 4UYHA 4LC2A 5CQ5A 5DY7A 4KV4A 4N4FA 5CZGA 5EWDA 5FDZA 3HMHA 4HXLA 2R0VA 3JVLA 4IR5A 3FKMX 2RS9B 5CQ6A 4CUTA 5E9MA 4PY6A 5AMEA 4N4IA 5LVQA 2G4AA 2R0SA 5KU3A 2L84A 3O35A 4UYFA 5CUEA 4HXMA 5IGNA 5ENFA 5FE0A 5E9VA 5F63A 5DBMA 5FE2A 4QZSA 4IOQA 4XY9A 4MEQA 4UITA 5EA1A 4TT4A 5EM3A 2YDWA 5DW1A 5LKZA 4UYDA 4Y03A 5A83A 3HMFA 5D3LA 5BT5A 5F2PA 2F6JA 5EWVA 5FE8A 5H1VA 5E3DA 5HEMA 5H1UA 3UVYA 4QBMA 4UIVA 5EP7A 4IR4A 2DVRA 5CUAA 4CUSA 2YQDA 5HFQA 2KTBB 4QYDA 4QSPA 2GRCA 3MUKA 2WP1A 4O7BA 4LYSA 5HELA 4NUCA 4XYAA 5FG4A 5CRZA 5DYCA 5DLXA 4N4HA 5LJ2A 4NR5A 4XUBA 5FG6A 4PCIA 5TB6A 3DWYA 3LQHA 4QB3A 5CUGA 5KO4A 3P1FA 5L97A 4YABA 4NR6A 5C8GA 4A9EA 5CY9A 4BW2A 1ZS5A 5D3PA 5F1HA 5EGUA 2DVVA 4UYEA 4OUFA 4NRAA 4WHUA 2RNYA 4BJXA 5DX4A 4C67A 4NS5A 4HXRA 5LKTA 4C66A 5C4QA 4A9LA 3JVKA 5ENBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CUUA 4O7CA 5DW2A 4CUPA 4TZ8A 4QC3A 4UIYA 5HQ7A 3G0JA 4HXKA 4O72A 5DYUA 4UIXA 5EWWA 4Q0OA 2DVQA 4OGIA 5H85A 5LJ1A 3P1DA 5EPRA 3O33A 5K29A 5A85A 4TT6A 2DATA 5EWCA 2LSPB 4A9FA 5JI8A 1X0JA 4LRGA 4QSWA 4A9HA 5DKCA 5A5RA 2E7OA 5FH6A 1EQFA 4XUAA 5HQ6A 4KCXA 3UV4A 3MB3A 4NUEA 5IGLA 2L5EA 4J0SA 4IOOA 2I7KA 5DFBA 4NQMA 4WIVA 5HRVA 3SVFA 5I7YA 4WHWA 4O74A 4CUQA 4ALGA 5C7NA 4Z1QA 4O77A 4NQNA 4QEWA 5CS8A 2YEMA 3QZTA 4TQNA 5J0DA 3IU6A 5D3SA 4YC9A 4YAXA 3ONIA 3RCWA 2YYNA 4YBSA 4YYIA 5ETBA 4PTBA 5I7XA 3U5NA 4MR5A 4J3IA 4YK0A 4IR6A 2YW5A 3O36A 4TYLA 5BT3A 4NXJA 4QEVA 4LR6A 4E96A 4BHWA 4TT2A 5FB0A 4YYJA 5IG6A 5IBNA 3D1BA 2D82A 4YH4A 5E9YA 5EV9A 4DONA 5F1LA 4IR3A 4QSXA 4GPJA 4O7AA 3UVXA 5DLZA 5A81A 4A9NA 5FE9A 5LKXA 5JWMA 5D3HA 5E9IA 4Z6IA 5F60A 5KHMA 4HXNA 4PKLA 2RO1A 4TU4A 4TU6A 5ENHA 3MXFA 5CUBA 5E7DA 4PS5A 4YATA 3O34A 3D1DA 2I8NA 3ERRA 5DFCA 4YYHA 2RI7A 5FB1A 5E3GA 5HFRA 5CQ8A 5LJ0A 5HRXA 4F3IA 2OUOA 2L85A 5E74A 5F36A 5CUDA 3U5LA 4LZSA 5CQTA 5E9LA 3U5PA 5D24A 3U5JA 5ENEA 3U5MA 5ENCA 4YADA 5EI4A 3Q2EA 5KTUA 4YH3A 5HM0A 5IIDA 3VKHA 5AMFA 3TLPA 5FFYA 1WUGA 4RVRA 5DKDA 5CFWA 4O71A 5E73A 5A5QA 4HBVA 4CURA 2RNXA 4O7EA 5L99A 4ZW1A 5EICA 5A7CA 4A9IA 1E6IA 5G4RA 4J0RA 5L96A 5I89A 4AKHA 3MB4A 5DFDA 4YYDA 3U5OA 4Q0NA 4NYXA 5EQ1A 5ETDA 5CUCA 5HLSA 4YYMA 2DVSA 3MULA 5FE6A 5CTLA 4NRBA 4QUUA 5E9KA 5AD2A 5I83A 5D0CA 5FE7A 4QSVA 4QNSA 4LZRA 2OO1A 3K2JA 4Z93A 5II2A 4MR4A 4BW1A 4IORA 5CPEA 5A82A 4O78A 5L8UA 5F5ZA 5ENJA 5FBXA 2OSSA 3MQMA 2FSAA 4MEOA 4TTEA 5IGMA 4A9OA 4LYWA 4TS8A 4QSTA 2YELA 3U5KA 4QSQA 4UIZA 3LQJA 2YEKA 5EWHA 5FE1A 5I40A 4HBWA 5L98A 5I86A 5L8TA 3LQIA 4QUTA 3LJWA 5FG5A 3P5OA 4QY4A 5ACYA 5HQ5A 3AADA 4NR4A 4CFLA 4MEPA 3UVWA 3NXBA 5D3TA 4ALHA 5CGPA 5CP5A 4AKNA 4O70A 4FLPA 5EISA 3HMEA 5LUUA 4OGJA 5FE3A 4A9MA 4YYKA 4MENA 4Z6HA 5A5PA 5C89A 4ZC9A 3Q2FA 4HXPA 1JSPB 4NRCA 5E0RA 2F6NA 4AKGA 5ENGA 5EU1A 5D25A 5HRWA 3IU5A 5CQ3A 2NXBA 5EPBA 3JVMA 4UIWA 4BW3A 5G4SA 4O75A 3LXJA 3S92A 4YYGA 5A5OA 5HENA 3GG3A 4AI6A 5IGKA 5D3RA 5HCLA 4X2IA 4NUDA 5CRMA 4HBXA 1N72A 4YBMA 2E3KA 5DYAA 2MJVB 5C85A 5FE4A 2DWWA 2H60A 2WP2A 4MR6A 5FH8A 4HBYA 5F25A 4NR8A 5F61A 3ZYUA 5TCMA 4CL9A 5DKHA 1F68A 3UV5A 4O7FA 4NR9A 5I80A 5FFWA 5HJCA 5FH7A 5AD3A 3D7CA 5EPSA 5D26A 5II1A 5FFVA 4TZ2A 4YBTA 2R0YA 5A5NA 3P1EA 2RFJA 5F62A 4YYNA 5FE5A 5H1TA 5F3AA 4A9KA 4LZ2A 2N9GA 4QR4A 4PCEA 2D9EA 4NYWA 4QEUA 5I88A 5CU8A 5COIA 5CQ7A 4YY6A 3UW9A 4N4GA 5KTXA 5I29A 2E7NA 3O37A 5A5SA 3SVHA 4XY8A 5ENIA 5EVAA 4N3WA 1PUOA 5D7XA 5KTWA 3JVJA 4QSSA 4J1PA 4KV1A 4UYFB 1WUMA 3G0LA 4NYVA 4A9JA 5BT4A 4BW4A 5EK9A 4UYGA 3S91A 3QZVA 4QSUA 4O76A 4QR3A 5LVRA 5D3JA 2RNWA 4YY4A 4HXOA 5DYXA 5I1QA 3QZSA 4MR3A 4HXSA 4QSRA 4QR5A 3SVGA 4LDFA 2DKWA 5D3NA 3DAIA 4Z1SA 3UV2A 4ZQLA 4LYIA 5LKUA 5CQ4A 4QC1A 3AQAA 4QYLA 4CLBA 1JM4B 3P1CA 3I3JA 5C87A 4UIUA 2R10A 4NR7A 4CFKA 3UVDA 5CQAA 4UYHA 4LC2A 5CQ5A 5DY7A 4KV4A 4N4FA 5CZGA 5EWDA 5FDZA 3HMHA 4HXLA 2R0VA 3JVLA 4IR5A 3FKMX 2RS9B 5CQ6A 4CUTA 5E9MA 4PY6A 5AMEA 4N4IA 5LVQA 2G4AA 2R0SA 5KU3A 2L84A 3O35A 4UYFA 5CUEA 4HXMA 5IGNA 5ENFA 5FE0A 5E9VA 5F63A 5DBMA 5FE2A 4QZSA 4IOQA 4XY9A 4MEQA 4UITA 5EA1A 4TT4A 5EM3A 2YDWA 1ZKRA 5DW1A 5LKZA 4UYDA 4Y03A 5A83A 3HMFA 5D3LA 5BT5A 5F2PA 2F6JA 5EWVA 5FE8A 5H1VA 5E3DA 5HEMA 5H1UA 3UVYA 4QBMA 4UIVA 5EP7A 4IR4A 2DVRA 5CUAA 4CUSA 2YQDA 5HFQA 2KTBB 4QYDA 4AKIA 4QSPA 2GRCA 3MUKA 2WP1A 4O7BA 4LYSA 5HELA 4NUCA 4XYAA 5FG4A 5CRZA 5DYCA 5DLXA 4N4HA 3VKGA 5LJ2A 4NR5A 4XUBA 5FG6A 4PCIA 5TB6A 3DWYA 3LQHA 4QB3A 5CUGA 5KO4A 3P1FA 2EJNA 5L97A 4YABA 4NR6A 5C8GA 4A9EA 5CY9A 4BW2A 1ZS5A 5D3PA 5F1HA 5EGUA 2DVVA 4UYEA 4OUFA 4NRAA 4WHUA 2RNYA 4BJXA 5DX4A 4C67A 4NS5A 4HXRA 5LKTA 4C66A 5C4QA 4A9LA 3JVKA 5ENBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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