5FE0A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with acetyllysine
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
DPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
total genus 38
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe0A00
3UV4A 4TQNA 5CP5A 4HXSA 5A5RA 3UVDA 4CFKA 3MB3A 4XY9A 4TYLA 1E6IA 1WUMA 5DW2A 3P1FA 4QSTA 5ENEA 4OGIA 3LQIA 3JVJA 3U5MA 5HRVA 4HXPA 5LKUA 2MJVB 5DFDA 5LKZA 5KHMA 2H60A 4TU4A 4UYGA 3IU6A 3MXFA 4YAXA 4YYMA 5LKTA 4QR4A 4YY4A 5EGUA 4QR5A 5FH7A 5FB1A 5I40A 4QNSA 5EPBA 5BT3A 3IU5A 4YYKA 4CUTA 5CUEA 4TZ2A 5FE9A 5ENGA 4O7EA 4OUFA 4FLPA 5KTWA 3JVKA 4A9KA 5L98A 5G4RA 2DWWA 5A5SA 5IIDA 2DVRA 4MR4A 5KTXA 4YBMA 2F6JA 4YY6A 5FE4A 3S91A 5E9MA 3O36A 5ENBA 5II1A 5FE5A 5D7XA 5FG4A 2R0VA 5HJCA 5I88A 2D82A 4C67A 2WP1A 4YYIA 3UVXA 4DONA 3U5NA 5AMFA 3DAIA 5DFCA 5L96A 4LC2A 4A9EA 5DW1A 4XY8A 5F5ZA 5LUUA 3LXJA 4NUCA 5EQ1A 5LVRA 4NYVA 5C7NA 4LZ2A 1X0JA 5D3TA 4HXLA 5I89A 3I3JA 4AKNA 2L84A 2R0SA 4GPJA 5HFRA 2E7NA 2LSPB 3SVGA 4MR3A 5EU1A 5C89A 2RNWA 4YYHA 4PS5A 5FE3A 3U5JA 5FE1A 5CQ4A 2YYNA 5CUCA 4UYHA 5FH8A 5DYXA 4LZSA 5C8GA 5FE6A 4E96A 5EV9A 3MQMA 4QYLA 3D7CA 4IR6A 4YK0A 2YQDA 5L99A 5DX4A 5CRMA 5EPRA 4A9OA 2F6NA 3S92A 2I8NA 2DVQA 4PTBA 5E3GA 4LYSA 3SVHA 5CY9A 5E9LA 5JI8A 4CL9A 5D3NA 5AD2A 4UYEA 4J0RA 4A9IA 4IR4A 3Q2FA 2YELA 5F36A 5EK9A 5EWHA 5F1HA 5D3LA 5C4QA 4TT4A 4Z6IA 4YADA 5I83A 5DLXA 5EWCA 5ETBA 5CUGA 4KV1A 4HXMA 4HBXA 2DVSA 5HCLA 2DVVA 3HMHA 5HELA 4LR6A 5HRXA 5TB6A 5A82A 2I7KA 2RFJA 5FE2A 4TT6A 4NR5A 5ACYA 4QC1A 3O37A 4CUPA 5E73A 3O33A 3P5OA 4CUSA 4QR3A 4NYXA 4O72A 4NQNA 5TCMA 4QSSA 5IG6A 4OGJA 5FFWA 4QEWA 4KV4A 5F3AA 5CGPA 2OSSA 5FE8A 3UVWA 4LZRA 4O75A 4BW2A 5JWMA 4A9LA 5CQTA 5CZGA 4TTEA 5CU8A 5HM0A 5LJ2A 4TU6A 5BT4A 5E9YA 5I1QA 5I7XA 3JVMA 5HQ5A 4NRBA 5LJ0A 5FG6A 4QSXA 5I86A 2DATA 2OO1A 3DWYA 4HXKA 3LQHA 4TS8A 5D25A 2E7OA 5AD3A 4O76A 4WHWA 2RI7A 4IR3A 4ALGA 5F25A 4MEPA 5HEMA 4O71A 4QUTA 4BHWA 1WUGA 5FE0A 4N4IA 2FSAA 4QSPA 5HENA 3MUKA 5E9IA 4A9MA 4CUUA 5D3PA 2RS9B 5E9KA 4PKLA 4N4FA 4YH3A 4KCXA 4UYDA 3U5LA 5IGLA 3HMEA 3UV2A 5CS8A 5HQ6A 4Q0OA 4Z93A 5CQ5A 4UIYA 2D9EA 5ENHA 5D3HA 5A5PA 4UIZA 4QY4A 4QSQA 5FBXA 5IGNA 4IOOA 4UYFA 5FFYA 4UIUA 5F62A 2N9GA 5H85A 4O7CA 5L8UA 5F61A 5F1LA 5I29A 4UITA 3G0JA 5DFBA 4X2IA 4A9JA 5F2PA 3HMFA 5DBMA 5C87A 4IOQA 2RO1A 3FKMX 3NXBA 4C66A 5EISA 4WHUA 5A85A 1JSPB 3LQJA 4XUAA 2R10A 4UIXA 4QEVA 2OUOA 4J1PA 3P1DA 5L8TA 4LYIA 5DKDA 4QSRA 4N4HA 4HBWA 5CQAA 4QUUA 5L97A 5EA1A 5A5QA 5D0CA 4QYDA 5AMEA 5D3RA 5EI4A 5H1VA 4Q0NA 5A7CA 5EVAA 2DKWA 5EWWA 4ZC9A 4MEOA 5KO4A 2R0YA 2RNXA 2KTBB 3U5OA 5CUDA 2G4AA 5CRZA 5DYCA 4NS5A 4PCEA 4CURA 4Z1SA 4MR6A 3AADA 4J0SA 5CUBA 4YATA 3SVFA 5K29A 4A9NA 4BW4A 4O77A 3UVYA 5IGMA 4Z6HA 4QZSA 4TZ8A 4MENA 2YEMA 5ENFA 4NR9A 5KTUA 5IGKA 5E74A 4UYFB 3MULA 5A5OA 5J0DA 3JVLA 4O70A 5HFQA 4CLBA 5CFWA 1F68A 4NQMA 2YDWA 4HBYA 5CQ7A 5E3DA 3LJWA 4J3IA 5BT5A 5C85A 3QZSA 5II2A 5EP7A 5CQ8A 4YBSA 5D24A 4YYGA 4ZQLA 3ZYUA 4TT2A 4RVRA 4Y03A 3ONIA 4CFLA 5FH6A 2YW5A 5EPSA 3K2JA 2L5EA 3U5PA 4N3WA 4MR5A 4QSWA 5H1TA 4Z1QA 5EWDA 5FB0A 2GRCA 5D3JA 1N72A 4YBTA 5I7YA 4XUBA 4QC3A 5DYUA 4NRCA 5DY7A 5FG5A 4NR4A 4NR8A 3QZVA 5CPEA 5FDZA 4ALHA 3P1CA 5A81A 4PY6A 2RNYA 4N4GA 4YYNA 5G4SA 3G0LA 4A9FA 3UW9A 3GG3A 4LDFA 4YH4A 4QSVA 4BW3A 3Q2EA 4O74A 3P1EA 5KU3A 4NR7A 5DLZA 5LKXA 5DKCA 5DKHA 4O7AA 4YYDA 4A9HA 4NYWA 5IBNA 4NUEA 5HRWA 5CTLA 5D26A 4HBVA 4LRGA 5A83A 4HXRA 4UIWA 4PCIA 5HQ7A 4QBMA 5CQ6A 4NR6A 4BW1A 1EQFA 1ZS5A 5COIA 4WIVA 4YC9A 3U5KA 5F63A 5E0RA 4HXNA 4O78A 4UIVA 4QSUA 5LJ1A 5EWVA 4QEUA 4ZW1A 4NXJA 3QZTA 3O35A 4LYWA 5A5NA 5EICA 2L85A 4IR5A 5E9VA 2YEKA 4QB3A 4MEQA 5F60A 4XYAA 5CQ3A 5FFVA 4O7FA 4NUDA 4YABA 5HLSA 5ETDA 5LVQA 4NRAA 4YYJA 5DYAA 5I80A 5D3SA 5FE7A 4BJXA 4O7BA 5H1UA 4HXOA 3RCWA 5CUAA 5ENJA 3O34A 3TLPA 2E3KA 3MB4A 3UV5A 4F3IA 5ENIA 4CUQA 5EM3A 3AQAA 4IORA 5E7DA 2WP2A 2NXBA 5ENCA 1JM4B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UV4A 4TQNA 5CP5A 4HXSA 5A5RA 3UVDA 4CFKA 3MB3A 4XY9A 4TYLA 1E6IA 1WUMA 5DW2A 3P1FA 4QSTA 5ENEA 4OGIA 3LQIA 3JVJA 3U5MA 5HRVA 4HXPA 5LKUA 2MJVB 5DFDA 5LKZA 5KHMA 2H60A 4TU4A 4UYGA 3IU6A 3MXFA 4YAXA 4YYMA 5LKTA 4QR4A 4YY4A 5EGUA 4QR5A 5FH7A 5FB1A 5I40A 4QNSA 5EPBA 5BT3A 3IU5A 4YYKA 4CUTA 5CUEA 4TZ2A 5FE9A 5ENGA 4O7EA 4OUFA 4FLPA 5KTWA 3JVKA 4A9KA 5L98A 5G4RA 2DWWA 5A5SA 5IIDA 2DVRA 4MR4A 5KTXA 4YBMA 2F6JA 4YY6A 5FE4A 3S91A 5E9MA 3O36A 5ENBA 5II1A 5FE5A 5D7XA 5FG4A 2R0VA 5HJCA 5I88A 2D82A 4C67A 2WP1A 4YYIA 3UVXA 4DONA 3U5NA 5AMFA 3DAIA 5DFCA 5L96A 4LC2A 4A9EA 5DW1A 4XY8A 5F5ZA 5LUUA 3LXJA 4NUCA 5EQ1A 3VKHA 5LVRA 4NYVA 5C7NA 4LZ2A 1X0JA 5D3TA 4HXLA 5I89A 3I3JA 4AKNA 2L84A 2R0SA 4GPJA 5HFRA 2E7NA 2LSPB 3SVGA 4MR3A 5EU1A 5C89A 2RNWA 4YYHA 4PS5A 5FE3A 3U5JA 5FE1A 5CQ4A 2YYNA 5CUCA 4UYHA 5FH8A 5DYXA 4LZSA 3ERRA 5C8GA 5FE6A 4E96A 5EV9A 3MQMA 4QYLA 3D7CA 4IR6A 4YK0A 2YQDA 5L99A 5DX4A 5CRMA 5EPRA 4A9OA 2F6NA 3S92A 2I8NA 2DVQA 4PTBA 5E3GA 4LYSA 3SVHA 5CY9A 5E9LA 5JI8A 4CL9A 5D3NA 5AD2A 4UYEA 4J0RA 4A9IA 4IR4A 3Q2FA 2YELA 5F36A 5EK9A 5EWHA 5F1HA 5D3LA 5C4QA 4TT4A 4Z6IA 4YADA 5I83A 5DLXA 5EWCA 5ETBA 5CUGA 4KV1A 4HXMA 4HBXA 2DVSA 5HCLA 2DVVA 3HMHA 5HELA 4LR6A 5HRXA 5TB6A 5A82A 3D1DA 2I7KA 2RFJA 5FE2A 4TT6A 4NR5A 5ACYA 4QC1A 3O37A 4CUPA 5E73A 3O33A 3P5OA 4CUSA 4QR3A 4NYXA 4O72A 4NQNA 5TCMA 4QSSA 5IG6A 3VKGA 4OGJA 5FFWA 4QEWA 4KV4A 5F3AA 5CGPA 2OSSA 5FE8A 3UVWA 4LZRA 4O75A 4BW2A 5JWMA 4A9LA 5CQTA 5CZGA 4TTEA 5CU8A 5HM0A 5LJ2A 4TU6A 5BT4A 5E9YA 5I1QA 5I7XA 3JVMA 5HQ5A 4NRBA 4AKIA 5LJ0A 4AI6A 5FG6A 4QSXA 5I86A 2DATA 2OO1A 3DWYA 4HXKA 3LQHA 4TS8A 5D25A 2E7OA 5AD3A 4O76A 4WHWA 2RI7A 4IR3A 4ALGA 5F25A 4MEPA 5HEMA 4O71A 4QUTA 4BHWA 1WUGA 5FE0A 4N4IA 2FSAA 4QSPA 5HENA 3MUKA 5E9IA 4A9MA 4CUUA 5D3PA 2RS9B 5E9KA 4PKLA 4N4FA 4YH3A 4KCXA 4UYDA 3U5LA 5IGLA 3HMEA 3UV2A 5CS8A 5HQ6A 4Q0OA 4Z93A 5CQ5A 4UIYA 2D9EA 5ENHA 5D3HA 5A5PA 4UIZA 4QY4A 4QSQA 5FBXA 5IGNA 4IOOA 4UYFA 5FFYA 4UIUA 5F62A 2N9GA 5H85A 4O7CA 5L8UA 5F61A 5F1LA 5I29A 4UITA 3G0JA 5DFBA 4X2IA 4A9JA 5F2PA 3HMFA 5DBMA 5C87A 4IOQA 2RO1A 1ZKRA 3FKMX 3NXBA 4C66A 5EISA 4WHUA 5A85A 1JSPB 3LQJA 4XUAA 2R10A 4UIXA 4QEVA 2OUOA 2EJNA 4J1PA 3P1DA 5L8TA 4LYIA 5DKDA 4QSRA 4N4HA 4HBWA 5CQAA 4QUUA 5L97A 5EA1A 5A5QA 5D0CA 4QYDA 5AMEA 5D3RA 5EI4A 5H1VA 4Q0NA 5A7CA 5EVAA 2DKWA 5EWWA 4ZC9A 4MEOA 5KO4A 2R0YA 2RNXA 2KTBB 3U5OA 5CUDA 2G4AA 5CRZA 5DYCA 4NS5A 4PCEA 4CURA 4Z1SA 4MR6A 3AADA 4J0SA 5CUBA 4YATA 3SVFA 5K29A 4A9NA 4BW4A 3D1BA 4O77A 3UVYA 5IGMA 4Z6HA 4QZSA 4TZ8A 4MENA 2YEMA 5ENFA 4NR9A 5KTUA 5IGKA 5E74A 4UYFB 3MULA 5A5OA 5J0DA 3JVLA 4O70A 5HFQA 4CLBA 5CFWA 1F68A 4NQMA 2YDWA 4HBYA 5CQ7A 5E3DA 3LJWA 4J3IA 5BT5A 5C85A 3QZSA 5II2A 5EP7A 5CQ8A 4YBSA 5D24A 1PUOA 4YYGA 4ZQLA 3ZYUA 4TT2A 4RVRA 4Y03A 3ONIA 4CFLA 5FH6A 2YW5A 5EPSA 3K2JA 2L5EA 3U5PA 4N3WA 4MR5A 4QSWA 5H1TA 4Z1QA 5EWDA 5FB0A 2GRCA 5D3JA 1N72A 4YBTA 5I7YA 4XUBA 4QC3A 5DYUA 4NRCA 5DY7A 5FG5A 4NR4A 4NR8A 3QZVA 5CPEA 5FDZA 4ALHA 3P1CA 5A81A 4PY6A 2RNYA 4N4GA 4YYNA 5G4SA 3G0LA 4A9FA 3UW9A 3GG3A 4LDFA 4YH4A 4QSVA 4BW3A 3Q2EA 4O74A 3P1EA 5KU3A 4NR7A 5DLZA 5LKXA 5DKCA 5DKHA 4O7AA 4YYDA 4A9HA 4NYWA 5IBNA 4NUEA 5HRWA 5CTLA 5D26A 4HBVA 4LRGA 5A83A 4HXRA 4UIWA 4PCIA 5HQ7A 4AKHA 4QBMA 5CQ6A 4AKGA 4NR6A 4BW1A 1EQFA 1ZS5A 5COIA 4WIVA 4YC9A 3U5KA 5F63A 5E0RA 4HXNA 4O78A 4UIVA 4QSUA 5LJ1A 5EWVA 4QEUA 4ZW1A 4NXJA 3QZTA 3O35A 4LYWA 5A5NA 5EICA 2L85A 4IR5A 5E9VA 2YEKA 4QB3A 4MEQA 5F60A 4XYAA 5CQ3A 5FFVA 4O7FA 4NUDA 4YABA 5HLSA 5ETDA 5LVQA 4NRAA 4YYJA 5DYAA 5I80A 5D3SA 5FE7A 4BJXA 4O7BA 5H1UA 4HXOA 3RCWA 5CUAA 5ENJA 3O34A 3TLPA 2E3KA 3MB4A 3UV5A 4F3IA 5ENIA 4CUQA 5EM3A 3AQAA 4IORA 5E7DA 2WP2A 2NXBA 5ENCA 1JM4B
chains in the Genus database with same CATH topology
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