5FE1A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment br004 (fragment 1)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
DPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe1A00
2I7KA 5FDZA 4IR6A 4IOQA 4YBTA 5CZGA 5AMEA 5D3NA 5EGUA 4ALGA 3U5JA 2WP1A 4Z93A 3IU6A 4QSSA 5DY7A 4O72A 5G4SA 5FG6A 4MR5A 4A9KA 5E9VA 5BT3A 3RCWA 5D25A 5DFCA 2OUOA 4O7BA 5FFVA 5AD3A 5E9MA 5CQ6A 5ENHA 1ZS5A 5F1HA 3U5PA 5FG4A 2YW5A 4LYSA 5LVQA 4O70A 5D3HA 5AMFA 4HXPA 2RFJA 5CQTA 5CUBA 4TQNA 1WUMA 5HQ5A 4UYEA 3QZSA 5HQ7A 5K29A 5II1A 4QSVA 4TS8A 4UYGA 4OGJA 5FH8A 5HENA 2DKWA 4BHWA 5KTWA 4Q0OA 5FH6A 3MB4A 5A81A 4J0SA 5KHMA 4MEOA 5DW1A 4O7FA 5DW2A 1JSPB 5CGPA 4FLPA 5EWHA 4QSWA 4PS5A 5JI8A 3QZVA 4QYLA 5EVAA 5FE8A 5EA1A 4HBVA 4TZ2A 5H1VA 2L84A 4NR7A 5FE4A 3D7CA 4NQNA 2E7OA 4CLBA 4QYDA 3JVMA 5CQ3A 3AQAA 4QEUA 2RS9B 4QR4A 5ENBA 2F6JA 2YELA 2DWWA 5FE0A 4PCIA 4XY9A 3U5MA 3SVHA 4UIXA 1X0JA 5H85A 5HJCA 4N3WA 5F1LA 5KTXA 5A5SA 5HRWA 5G4RA 5I1QA 5H1TA 4NQMA 4MEPA 4YYGA 5F25A 4KV4A 4Q0NA 5FE1A 5HEMA 4GPJA 5ENCA 3I3JA 4YBSA 5CTLA 3JVKA 5D3RA 3IU5A 3UVWA 4CL9A 2R0YA 5ACYA 4QSUA 4CURA 2I8NA 5L99A 4YBMA 5C4QA 5E3DA 4UITA 3UV5A 4YYIA 4O76A 4MENA 4HXSA 5CPEA 4MR4A 4LYIA 5DKHA 2DVVA 3O36A 4LR6A 5A85A 4MR3A 4NYWA 5KU3A 3HMEA 5E0RA 5EWVA 2R10A 5KTUA 2D82A 5E74A 5A5RA 4TT6A 2KTBB 4QSPA 5FB0A 5FE3A 5A5OA 2DVRA 4A9FA 4TZ8A 5F3AA 4N4IA 4QR3A 5IGNA 5FE2A 4LZ2A 5FG5A 4O71A 2R0VA 3DWYA 4YYDA 4IR3A 2E3KA 5A5NA 4HBYA 3TLPA 3GG3A 5J0DA 3P1EA 5IGLA 4YAXA 2OO1A 4J1PA 5CQ4A 5CUDA 4IORA 5HQ6A 4CUUA 4Z1QA 5E73A 1WUGA 5ENFA 5EQ1A 5EP7A 4ZW1A 5LKXA 1EQFA 3O37A 3MUKA 5CP5A 5EV9A 2FSAA 4N4GA 4CUPA 5C8GA 5II2A 5I83A 4PY6A 3O33A 2RNYA 5ENEA 5E7DA 4ZQLA 4N4FA 4Z6IA 3Q2FA 4A9EA 4N4HA 4XUAA 4CUTA 4LZRA 3MXFA 3QZTA 3DAIA 4LZSA 5CRZA 4A9OA 3P1DA 5CS8A 5D3TA 5F36A 5D3LA 4O77A 5LJ2A 5CQAA 4PCEA 5F60A 2N9GA 4A9JA 4IR4A 5LKUA 5EWWA 3P5OA 4HBXA 5C87A 2NXBA 2RI7A 4ALHA 5I7XA 3SVGA 4TU4A 5FFYA 3HMFA 5LJ0A 3LQJA 5FE6A 4WHUA 5D3JA 5JWMA 5DYUA 4NR6A 3SVFA 4X2IA 4LC2A 5FFWA 5A82A 5IIDA 4Y03A 2R0SA 4A9IA 4BJXA 4KV1A 2YQDA 2WP2A 4QSRA 5CQ7A 2RO1A 4O78A 5L8UA 4QSXA 3U5NA 5ENJA 5I88A 4Z1SA 5EU1A 5I40A 5DKDA 3UW9A 4HXLA 5C89A 5ETDA 4LRGA 5CUGA 5HCLA 4BW1A 5ETBA 4WIVA 5EM3A 5BT4A 3LQIA 1E6IA 4PKLA 5EPBA 5FE9A 5DYCA 4BW2A 3LJWA 4YYHA 5CU8A 5LKTA 2DVQA 4NUDA 4QSTA 3NXBA 4QC3A 4YH3A 5FH7A 5DLXA 4O7CA 4A9MA 5DYAA 4CFLA 1F68A 5A7CA 4NR5A 5D3PA 4NYXA 4J0RA 5FBXA 4UIVA 3K2JA 5HFQA 5CFWA 4UYDA 5C7NA 5E3GA 5D7XA 5ENGA 4C66A 5A5QA 4YK0A 5CRMA 1JM4B 5EWCA 4HXKA 5BT5A 5COIA 4A9HA 5CUAA 3P1FA 4HXOA 5LJ1A 5A83A 4CFKA 4UIZA 4UIUA 4QBMA 2YDWA 4UYFA 5L97A 4NRAA 2G4AA 5EK9A 5HRVA 5A5PA 3UV2A 3U5OA 3G0LA 5ENIA 4NXJA 4YYJA 5KO4A 2LSPB 5FE7A 4KCXA 4PTBA 5LVRA 4MR6A 4ZC9A 3Q2EA 4HXNA 4NRBA 4NS5A 4Z6HA 5HRXA 5DLZA 4WHWA 4QUTA 4TT2A 5EI4A 4BW3A 5DYXA 2E7NA 5DKCA 5D26A 3MULA 5L8TA 4O75A 4OGIA 3S91A 2RNWA 3HMHA 4UIWA 4NUEA 5F5ZA 2L85A 5EPRA 2RNXA 4A9NA 4YYKA 5TB6A 5F62A 5HLSA 4O7AA 2GRCA 5H1UA 4HBWA 3UVXA 4C67A 5IGKA 2OSSA 4TU6A 4DONA 5E9KA 5DFBA 2DATA 5L98A 4E96A 4F3IA 5LKZA 4HXMA 4TTEA 4YYMA 2YYNA 2YEKA 4XUBA 5CUEA 5F63A 4OUFA 3P1CA 5D3SA 4CUSA 1N72A 4XYAA 5DX4A 5DFDA 3LXJA 5IBNA 3ZYUA 5EPSA 5HM0A 4QZSA 5CQ8A 5AD2A 4NR4A 4LYWA 3UVDA 4QEVA 4QB3A 5I80A 2F6NA 4LDFA 4QY4A 3AADA 4O7EA 5E9IA 5IG6A 3U5KA 4YYNA 2DVSA 4YY6A 3JVJA 4IOOA 5FB1A 5DBMA 4CUQA 5EISA 4TT4A 4YATA 4AKNA 3MB3A 2MJVB 3MQMA 5HFRA 5F61A 5E9LA 5I86A 5EICA 4A9LA 3U5LA 4QEWA 5LUUA 4IR5A 4J3IA 4QSQA 4NR8A 4O74A 4HXRA 2H60A 3S92A 3UV4A 4NYVA 3UVYA 4YC9A 4YADA 3ONIA 4YABA 4MEQA 5CUCA 5TCMA 3LQHA 2L5EA 4NUCA 5L96A 2D9EA 3O34A 5F2PA 3O35A 5CQ5A 3FKMX 5HELA 4TYLA 4UYHA 4NRCA 4QR5A 4YH4A 3JVLA 4UIYA 2YEMA 5I29A 5EWDA 5D0CA 5CY9A 4QUUA 4YY4A 4UYFB 5E9YA 5I89A 4QC1A 4RVRA 5I7YA 4NR9A 5C85A 5FE5A 4BW4A 5D24A 5IGMA 4QNSA 3G0JA 4XY8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I7KA 5FDZA 4IR6A 4IOQA 4YBTA 5CZGA 5AMEA 5D3NA 5EGUA 4ALGA 3U5JA 2WP1A 4Z93A 3IU6A 4QSSA 5DY7A 4O72A 5G4SA 5FG6A 4MR5A 4A9KA 5E9VA 5BT3A 3RCWA 5D25A 5DFCA 2OUOA 4O7BA 5FFVA 3ERRA 5AD3A 5E9MA 5CQ6A 5ENHA 1ZS5A 5F1HA 3U5PA 5FG4A 2YW5A 4LYSA 5LVQA 4O70A 5D3HA 5AMFA 4HXPA 2RFJA 5CQTA 5CUBA 4TQNA 1WUMA 5HQ5A 4UYEA 3QZSA 5HQ7A 5K29A 5II1A 4QSVA 4TS8A 4UYGA 4OGJA 5FH8A 5HENA 2DKWA 4BHWA 5KTWA 3D1DA 4Q0OA 5FH6A 3MB4A 5A81A 4J0SA 5KHMA 4MEOA 5DW1A 4O7FA 5DW2A 1JSPB 5CGPA 4FLPA 5EWHA 4QSWA 4PS5A 5JI8A 3QZVA 4QYLA 5EVAA 5FE8A 5EA1A 4HBVA 4AKHA 4TZ2A 5H1VA 2L84A 4NR7A 4AI6A 5FE4A 3D7CA 4NQNA 2E7OA 4CLBA 4QYDA 3JVMA 5CQ3A 3AQAA 4QEUA 2RS9B 4QR4A 5ENBA 2F6JA 2YELA 2DWWA 1ZKRA 5FE0A 4PCIA 4XY9A 3U5MA 3SVHA 4UIXA 1X0JA 5H85A 5HJCA 4N3WA 5F1LA 5KTXA 5A5SA 5HRWA 5G4RA 5I1QA 5H1TA 4NQMA 4MEPA 4YYGA 5F25A 4KV4A 4Q0NA 5FE1A 5HEMA 4GPJA 5ENCA 3I3JA 4YBSA 5CTLA 3JVKA 5D3RA 3IU5A 3UVWA 4CL9A 2R0YA 5ACYA 4QSUA 4CURA 2I8NA 5L99A 4YBMA 5C4QA 5E3DA 4UITA 3UV5A 4YYIA 4O76A 4MENA 4HXSA 5CPEA 4MR4A 4LYIA 5DKHA 2DVVA 3O36A 4LR6A 5A85A 4MR3A 4NYWA 5KU3A 3HMEA 5E0RA 5EWVA 2R10A 5KTUA 2D82A 5E74A 5A5RA 4TT6A 2KTBB 4QSPA 5FB0A 5FE3A 5A5OA 2DVRA 4A9FA 4TZ8A 5F3AA 4N4IA 4QR3A 5IGNA 5FE2A 4LZ2A 5FG5A 4O71A 2R0VA 3DWYA 4YYDA 4IR3A 2E3KA 5A5NA 4HBYA 3TLPA 3GG3A 5J0DA 3P1EA 5IGLA 4YAXA 2OO1A 4J1PA 5CQ4A 5CUDA 4IORA 5HQ6A 4CUUA 4Z1QA 5E73A 3VKGA 1WUGA 5ENFA 5EQ1A 5EP7A 4ZW1A 5LKXA 1EQFA 3O37A 3MUKA 5CP5A 5EV9A 2FSAA 4N4GA 4CUPA 5C8GA 5II2A 5I83A 4PY6A 3O33A 2RNYA 5ENEA 5E7DA 4ZQLA 4N4FA 4Z6IA 3Q2FA 4A9EA 4N4HA 4XUAA 4CUTA 4LZRA 3MXFA 3QZTA 3DAIA 4LZSA 5CRZA 4A9OA 3P1DA 5CS8A 5D3TA 5F36A 5D3LA 4O77A 5LJ2A 5CQAA 4PCEA 5F60A 2N9GA 4A9JA 4IR4A 5LKUA 5EWWA 3P5OA 4HBXA 5C87A 2NXBA 2RI7A 4ALHA 5I7XA 3SVGA 4TU4A 5FFYA 3HMFA 5LJ0A 3LQJA 5FE6A 4WHUA 5D3JA 5JWMA 5DYUA 4NR6A 3SVFA 4X2IA 4LC2A 5FFWA 5A82A 5IIDA 4Y03A 2R0SA 4A9IA 4BJXA 4KV1A 2YQDA 2WP2A 4QSRA 5CQ7A 2RO1A 4O78A 5L8UA 4QSXA 3U5NA 5ENJA 5I88A 4AKIA 4Z1SA 5EU1A 5I40A 5DKDA 3UW9A 4HXLA 5C89A 5ETDA 4LRGA 5CUGA 5HCLA 4BW1A 5ETBA 4WIVA 5EM3A 5BT4A 3LQIA 1E6IA 4AKGA 4PKLA 5EPBA 5FE9A 5DYCA 4BW2A 3LJWA 4YYHA 3D1BA 5CU8A 5LKTA 2DVQA 4NUDA 4QSTA 3NXBA 4QC3A 4YH3A 5FH7A 5DLXA 4O7CA 4A9MA 5DYAA 4CFLA 1F68A 5A7CA 4NR5A 5D3PA 4NYXA 4J0RA 5FBXA 4UIVA 3K2JA 5HFQA 5CFWA 4UYDA 5C7NA 5E3GA 5D7XA 5ENGA 4C66A 5A5QA 4YK0A 5CRMA 1JM4B 5EWCA 4HXKA 5BT5A 1PUOA 5COIA 4A9HA 5CUAA 3P1FA 4HXOA 5LJ1A 5A83A 4CFKA 4UIZA 4UIUA 4QBMA 2YDWA 4UYFA 5L97A 4NRAA 2G4AA 5EK9A 5HRVA 5A5PA 3UV2A 3U5OA 3G0LA 5ENIA 4NXJA 4YYJA 5KO4A 2LSPB 5FE7A 4KCXA 4PTBA 3VKHA 5LVRA 4MR6A 4ZC9A 3Q2EA 4HXNA 4NRBA 4NS5A 4Z6HA 5HRXA 5DLZA 4WHWA 4QUTA 4TT2A 5EI4A 4BW3A 5DYXA 2E7NA 5DKCA 5D26A 3MULA 5L8TA 4O75A 4OGIA 3S91A 2RNWA 3HMHA 4UIWA 4NUEA 5F5ZA 2L85A 5EPRA 2RNXA 4A9NA 4YYKA 5TB6A 5F62A 5HLSA 4O7AA 2GRCA 5H1UA 4HBWA 3UVXA 4C67A 5IGKA 2EJNA 2OSSA 4TU6A 4DONA 5E9KA 5DFBA 2DATA 5L98A 4E96A 4F3IA 5LKZA 4HXMA 4TTEA 4YYMA 2YYNA 2YEKA 4XUBA 5CUEA 5F63A 4OUFA 3P1CA 5D3SA 4CUSA 1N72A 4XYAA 5DX4A 5DFDA 3LXJA 5IBNA 3ZYUA 5EPSA 5HM0A 4QZSA 5CQ8A 5AD2A 4NR4A 4LYWA 3UVDA 4QEVA 4QB3A 5I80A 2F6NA 4LDFA 4QY4A 3AADA 4O7EA 5E9IA 5IG6A 3U5KA 4YYNA 2DVSA 4YY6A 3JVJA 4IOOA 5FB1A 5DBMA 4CUQA 5EISA 4TT4A 4YATA 4AKNA 3MB3A 2MJVB 3MQMA 5HFRA 5F61A 5E9LA 5I86A 5EICA 4A9LA 3U5LA 4QEWA 5LUUA 4IR5A 4J3IA 4QSQA 4NR8A 4O74A 4HXRA 2H60A 3S92A 3UV4A 4NYVA 3UVYA 4YC9A 4YADA 3ONIA 4YABA 4MEQA 5CUCA 5TCMA 3LQHA 2L5EA 4NUCA 5L96A 2D9EA 3O34A 5F2PA 3O35A 5CQ5A 3FKMX 5HELA 4TYLA 4UYHA 4NRCA 4QR5A 4YH4A 3JVLA 4UIYA 2YEMA 5I29A 5EWDA 5D0CA 5CY9A 4QUUA 4YY4A 4UYFB 5E9YA 5I89A 4QC1A 4RVRA 5I7YA 4NR9A 5C85A 5FE5A 4BW4A 5D24A 5IGMA 4QNSA 3G0JA 4XY8A
chains in the Genus database with same CATH topology
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