5BT3A

Crystal structure of ep300 bromodomain in complex with sgc-cbp30 chemical probe
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of EP300 bromodomain in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Histone acetyltransferase p300
total genus 43
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5bt3A00
5CQAA 4O77A 4BHWA 5A5OA 1N72A 4A9FA 2YEMA 5KO4A 4UYFB 4Z6HA 3S91A 4IR3A 4YH4A 5ENIA 4YYDA 5D3PA 4YYHA 4MR6A 5LVQA 3U5JA 4LZSA 5HLSA 4UIVA 5EA1A 4TYLA 3G0LA 5E73A 4LYWA 3LJWA 5L96A 3D7CA 4J0SA 4O78A 5D26A 5FH7A 3DWYA 5A5SA 5BT5A 5KTWA 2LSPB 5A5PA 3MB4A 4QSQA 5F1HA 5FE7A 5COIA 5DW1A 2KTBB 4TZ8A 4WHWA 4A9HA 2E7NA 5IGMA 5FG5A 2DVSA 4ZW1A 4TQNA 4N4GA 4F3IA 5L8UA 4MEOA 4QC3A 4YYKA 5JI8A 4LZRA 5CRMA 5HRVA 4YK0A 5KHMA 4BW3A 4YYMA 5EWHA 5D7XA 5CUCA 5ETBA 4PY6A 5ENCA 5E9MA 4YAXA 4O76A 5C7NA 5ETDA 4IORA 4Z93A 5CRZA 3JVJA 2I8NA 3MUKA 5FFWA 5E9IA 4CUSA 5EV9A 5K29A 3IU5A 4NR5A 2RS9B 4UYEA 3P1CA 2L5EA 5F3AA 5L99A 4ZQLA 5DKCA 5H1UA 4J3IA 4MEQA 4MR4A 4HXOA 4QEUA 5A85A 5JWMA 2DVRA 3HMHA 5G4RA 2R0SA 5FE5A 5EICA 4QEWA 5CQTA 3UV4A 4QBMA 5EWVA 4QB3A 5FE0A 5CQ3A 4Y03A 1JSPB 5DW2A 4YYGA 5G4SA 5DYUA 2RI7A 4HXLA 5DFCA 5KU3A 5HQ6A 5DX4A 2RO1A 5D3HA 5CUBA 2WP1A 5EWCA 2FSAA 3SVHA 4QSPA 5CUDA 4O7FA 3JVKA 5FE8A 4QC1A 2D82A 1WUMA 5DYXA 5CUAA 5I7YA 5FE4A 5F5ZA 5LKZA 3HMFA 5FE6A 2RNXA 3I3JA 5AD2A 5CUEA 5E9VA 4TTEA 4CUUA 5I83A 4LRGA 4UYDA 4QR5A 3U5PA 4MR5A 2N9GA 4YABA 4QR3A 5HCLA 4A9EA 4UIZA 4Q0OA 5F61A 3U5MA 4YBSA 4O75A 3SVGA 2YQDA 5LVRA 4A9IA 4IR5A 4HXNA 3FKMX 4UIUA 5E9LA 4O71A 5EISA 5AMEA 3P5OA 4CLBA 5L8TA 3LQIA 3O37A 5CQ5A 3MQMA 4MR3A 1E6IA 5FE9A 4ZC9A 4CUPA 5FE1A 2YELA 2YDWA 3IU6A 4UYGA 5AMFA 2YEKA 5CQ7A 5ENEA 5F63A 2MJVB 4AKNA 4MENA 5II2A 5IIDA 5HM0A 4QSWA 5E0RA 5EPBA 5D3TA 5AD3A 5A5RA 4QZSA 2DATA 5IGLA 4X2IA 5D3LA 4UYHA 4BW4A 4HXRA 3RCWA 5FE3A 4NYWA 4NR9A 5D25A 5HELA 4UITA 5FDZA 4Z1SA 2OSSA 4O7CA 3AADA 5BT4A 3Q2EA 4NR6A 4QNSA 2OO1A 5LUUA 4PCEA 4IR6A 4OGJA 5A81A 2H60A 3UW9A 4NRAA 5EWWA 3SVFA 5DBMA 5I89A 4YBMA 4YYJA 5F60A 2RNWA 4YATA 1JM4B 5I7XA 4RVRA 5F1LA 5EQ1A 4PTBA 4YC9A 5E7DA 2DWWA 5L98A 3P1DA 5ENGA 5HJCA 3Q2FA 3K2JA 5F36A 4A9NA 5I1QA 4IR4A 5H1TA 4O74A 4J1PA 2R0VA 3DAIA 5D3SA 4WHUA 4QUUA 3UVXA 4A9LA 2E3KA 4QY4A 3U5NA 5LKXA 5DKDA 4UIXA 5A83A 4QYLA 4XYAA 1F68A 5TCMA 5I88A 4HBVA 4O7AA 4QSTA 5EPRA 4N4FA 4TU6A 5C85A 5LJ2A 5HFRA 2DVVA 4IOOA 4MEPA 2L84A 4UYFA 5H1VA 5CUGA 5E74A 4OGIA 4NUCA 4KV1A 3JVMA 5KTXA 5C89A 4OUFA 4NR7A 5ENJA 5EWDA 4HXKA 4CFKA 5I40A 5EPSA 3GG3A 5CFWA 4CURA 3LQHA 4CL9A 2GRCA 4XUBA 5IGKA 4YYIA 3UVWA 5HENA 5FE2A 4QSRA 4C67A 3O36A 5LKUA 2R0YA 3O34A 4QSVA 5C87A 3O35A 5HRXA 5CS8A 5FH6A 5IBNA 5A82A 4QUTA 2F6NA 4HBYA 2G4AA 4Z6IA 5I80A 5CQ6A 4CUQA 4NQMA 4QSXA 4J0RA 3HMEA 3G0JA 3MB3A 5D0CA 4YH3A 3LXJA 3MULA 2YYNA 2L85A 4QSUA 5CZGA 5DLXA 4HBXA 2WP2A 4NRCA 2NXBA 4ALGA 3P1EA 4CFLA 5H85A 5HRWA 4TT4A 5D3JA 2E7OA 4LYSA 5EGUA 5D24A 5LJ1A 5I86A 5DLZA 5FBXA 4O7BA 4Z1QA 5E9YA 4E96A 5EK9A 4TS8A 2RFJA 5DFDA 5FG6A 2DKWA 5CQ8A 5E3DA 4C66A 3JVLA 3UV5A 5BT3A 4YBTA 4N4HA 4WIVA 5ENBA 4TT2A 2DVQA 5EI4A 4HXMA 3QZVA 4BW2A 5DYCA 3LQJA 5F62A 4CUTA 5F2PA 4UIYA 4PS5A 4QR4A 4QEVA 3UVYA 2OUOA 5FB0A 3UV2A 4DONA 5F25A 2R10A 4TZ2A 3U5LA 3U5OA 4YY4A 4KV4A 4YYNA 3U5KA 5I29A 4BW1A 2RNYA 3QZTA 4QSSA 2I7KA 4N3WA 5DFBA 4N4IA 4NS5A 4Q0NA 5IGNA 4HBWA 5E9KA 3ONIA 5A5NA 3P1FA 5HQ7A 3UVDA 4NRBA 5HFQA 2D9EA 3ZYUA 5II1A 4A9KA 5FH8A 2F6JA 4GPJA 5TB6A 5CPEA 4HXSA 5ENFA 4O7EA 5DYAA 4A9MA 4YY6A 5DY7A 4TT6A 4NXJA 5HEMA 5LKTA 3S92A 4KCXA 4XY8A 5D3RA 5ACYA 3AQAA 5ENHA 5KTUA 4O72A 4BJXA 4TU4A 4LR6A 5CGPA 4LC2A 4PCIA 4NYVA 3O33A 4FLPA 4NQNA 5FFVA 4LYIA 5C8GA 4UIWA 5D3NA 5FFYA 1ZS5A 5HQ5A 5CTLA 4LDFA 5EM3A 3QZSA 5A5QA 4QYDA 5DKHA 4YADA 5CP5A 5EVAA 4NUDA 5L97A 4O70A 1X0JA 1WUGA 4ALHA 5CQ4A 4IOQA 5FG4A 5CY9A 1EQFA 5E3GA 5CU8A 4NR4A 4NYXA 4LZ2A 5LJ0A 5EU1A 4XUAA 4NR8A 4A9OA 3MXFA 5IG6A 4NUEA 5EP7A 5J0DA 2YW5A 4A9JA 4HXPA 3NXBA 5A7CA 3TLPA 5C4QA 4XY9A 4PKLA 5FB1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CQAA 4O77A 4BHWA 5A5OA 1N72A 4A9FA 2YEMA 5KO4A 4UYFB 4Z6HA 3S91A 4IR3A 4YH4A 5ENIA 4YYDA 5D3PA 4YYHA 4MR6A 5LVQA 3U5JA 4LZSA 5HLSA 4UIVA 5EA1A 4TYLA 3G0LA 5E73A 4LYWA 3LJWA 5L96A 3D7CA 4J0SA 4O78A 5D26A 5FH7A 3DWYA 5A5SA 5BT5A 5KTWA 2LSPB 5A5PA 3MB4A 4QSQA 5F1HA 5FE7A 5COIA 5DW1A 2KTBB 4TZ8A 4WHWA 4A9HA 2E7NA 5IGMA 5FG5A 2DVSA 4ZW1A 4TQNA 4N4GA 4F3IA 5L8UA 4MEOA 4QC3A 4YYKA 5JI8A 4LZRA 5CRMA 5HRVA 4YK0A 4AKHA 5KHMA 4BW3A 4YYMA 5EWHA 5D7XA 5CUCA 5ETBA 4PY6A 5ENCA 5E9MA 4YAXA 4O76A 5C7NA 5ETDA 4IORA 4Z93A 5CRZA 3JVJA 2I8NA 3MUKA 5FFWA 5E9IA 4CUSA 5EV9A 5K29A 3IU5A 4NR5A 2RS9B 4UYEA 3P1CA 2L5EA 5F3AA 5L99A 4ZQLA 5DKCA 5H1UA 4J3IA 1ZKRA 4MEQA 4MR4A 4HXOA 4QEUA 5A85A 5JWMA 2DVRA 3HMHA 5G4RA 2R0SA 5FE5A 5EICA 4QEWA 5CQTA 3UV4A 4QBMA 3ERRA 5EWVA 4QB3A 5FE0A 5CQ3A 4Y03A 1JSPB 5DW2A 4YYGA 5G4SA 5DYUA 2RI7A 4HXLA 5DFCA 5KU3A 5HQ6A 5DX4A 2RO1A 5D3HA 5CUBA 2WP1A 5EWCA 2FSAA 3SVHA 4QSPA 5CUDA 4O7FA 3JVKA 5FE8A 4QC1A 2D82A 1WUMA 5DYXA 5CUAA 5I7YA 5FE4A 5F5ZA 5LKZA 3HMFA 5FE6A 2RNXA 3I3JA 5AD2A 5CUEA 5E9VA 4TTEA 4CUUA 5I83A 4LRGA 4UYDA 4QR5A 3U5PA 3D1BA 4MR5A 2N9GA 4YABA 4QR3A 5HCLA 4A9EA 4UIZA 4Q0OA 5F61A 3U5MA 4YBSA 4O75A 3SVGA 2YQDA 5LVRA 4A9IA 4IR5A 4HXNA 3FKMX 4UIUA 5E9LA 4O71A 5EISA 5AMEA 3P5OA 4CLBA 3VKGA 5L8TA 3LQIA 3O37A 5CQ5A 3MQMA 4MR3A 4AKIA 1E6IA 5FE9A 4ZC9A 4CUPA 5FE1A 2YELA 2YDWA 3IU6A 4UYGA 5AMFA 2YEKA 5CQ7A 5ENEA 5F63A 2MJVB 4AKNA 4MENA 5II2A 5IIDA 5HM0A 4QSWA 5E0RA 5EPBA 5D3TA 5AD3A 5A5RA 4QZSA 2DATA 5IGLA 4X2IA 5D3LA 4UYHA 4BW4A 4HXRA 3RCWA 5FE3A 4NYWA 4NR9A 5D25A 5HELA 4UITA 5FDZA 4Z1SA 2OSSA 4O7CA 3AADA 5BT4A 3Q2EA 4NR6A 4QNSA 2OO1A 5LUUA 4PCEA 4IR6A 4OGJA 5A81A 2H60A 3UW9A 4NRAA 5EWWA 3SVFA 4AKGA 5DBMA 5I89A 4YBMA 4YYJA 3D1DA 5F60A 2RNWA 4YATA 1JM4B 5I7XA 4RVRA 5F1LA 5EQ1A 4PTBA 4YC9A 5E7DA 2DWWA 5L98A 3P1DA 5ENGA 5HJCA 3Q2FA 3K2JA 5F36A 4A9NA 5I1QA 4IR4A 5H1TA 4O74A 4J1PA 2R0VA 3DAIA 5D3SA 4WHUA 4QUUA 3UVXA 4A9LA 2E3KA 4QY4A 3U5NA 5LKXA 5DKDA 4UIXA 5A83A 4QYLA 4XYAA 1F68A 5TCMA 5I88A 4HBVA 4O7AA 4QSTA 5EPRA 4N4FA 4TU6A 5C85A 5LJ2A 5HFRA 2DVVA 4IOOA 4MEPA 2L84A 4UYFA 5H1VA 5CUGA 5E74A 4OGIA 4NUCA 4KV1A 3JVMA 5KTXA 5C89A 4OUFA 4NR7A 5ENJA 5EWDA 4HXKA 4CFKA 5I40A 5EPSA 3GG3A 5CFWA 4CURA 3LQHA 4CL9A 2GRCA 4XUBA 5IGKA 4YYIA 3UVWA 5HENA 5FE2A 4QSRA 4C67A 3VKHA 3O36A 5LKUA 2R0YA 3O34A 4QSVA 5C87A 3O35A 5HRXA 5CS8A 5FH6A 5IBNA 5A82A 4QUTA 2F6NA 4HBYA 2G4AA 4Z6IA 5I80A 5CQ6A 4CUQA 4NQMA 4QSXA 4J0RA 3HMEA 3G0JA 3MB3A 5D0CA 4YH3A 3LXJA 3MULA 2YYNA 2L85A 4QSUA 5CZGA 5DLXA 4HBXA 2WP2A 4NRCA 2NXBA 4ALGA 3P1EA 4CFLA 5H85A 5HRWA 4TT4A 5D3JA 2E7OA 4LYSA 5EGUA 5D24A 2EJNA 5LJ1A 5I86A 5DLZA 5FBXA 4O7BA 4Z1QA 5E9YA 4E96A 5EK9A 4TS8A 2RFJA 5DFDA 5FG6A 2DKWA 5CQ8A 5E3DA 4C66A 3JVLA 3UV5A 5BT3A 4YBTA 4N4HA 4WIVA 5ENBA 4TT2A 2DVQA 5EI4A 4HXMA 3QZVA 4BW2A 5DYCA 3LQJA 5F62A 4CUTA 5F2PA 4UIYA 4PS5A 4QR4A 4QEVA 3UVYA 2OUOA 5FB0A 3UV2A 4DONA 5F25A 2R10A 4TZ2A 3U5LA 3U5OA 4YY4A 4KV4A 4YYNA 3U5KA 5I29A 4BW1A 2RNYA 3QZTA 4QSSA 2I7KA 4N3WA 5DFBA 4N4IA 4NS5A 4Q0NA 5IGNA 4HBWA 5E9KA 3ONIA 5A5NA 3P1FA 5HQ7A 3UVDA 4NRBA 5HFQA 2D9EA 3ZYUA 5II1A 4A9KA 5FH8A 2F6JA 4GPJA 5TB6A 5CPEA 4HXSA 5ENFA 4O7EA 5DYAA 4A9MA 4YY6A 5DY7A 4TT6A 4NXJA 5HEMA 5LKTA 3S92A 4KCXA 4XY8A 5D3RA 5ACYA 3AQAA 5ENHA 5KTUA 4O72A 4BJXA 4TU4A 4LR6A 5CGPA 4LC2A 4PCIA 4NYVA 3O33A 4FLPA 4NQNA 5FFVA 4LYIA 5C8GA 4UIWA 5D3NA 5FFYA 1ZS5A 5HQ5A 5CTLA 4LDFA 5EM3A 3QZSA 5A5QA 4QYDA 4AI6A 5DKHA 4YADA 5CP5A 5EVAA 4NUDA 5L97A 4O70A 1X0JA 1WUGA 4ALHA 1PUOA 4IOQA 5CQ4A 5FG4A 5CY9A 1EQFA 5E3GA 5CU8A 4NR4A 4NYXA 4LZ2A 5LJ0A 5EU1A 4XUAA 4NR8A 4A9OA 3MXFA 5IG6A 4NUEA 5EP7A 5J0DA 2YW5A 4A9JA 4HXPA 3NXBA 5A7CA 3TLPA 5C4QA 4XY9A 4PKLA 5FB1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5CQA A;  4O77 A;  4BHW A;  5A5O A;  1N72 A;  4A9F A;  2YEM A;  5KO4 A;  4UYF B;  4Z6H A;  3S91 A;  4IR3 A;  4YH4 A;  5ENI A;  4YYD A;  5D3P A;  4YYH A;  4MR6 A;  5LVQ A;  3U5J A;  4LZS A;  5HLS A;  4UIV A;  5EA1 A;  4TYL A;  3G0L A;  5E73 A;  4LYW A;  3LJW A;  5L96 A;  3D7C A;  4J0S A;  4O78 A;  5D26 A;  5FH7 A;  3DWY A;  5A5S A;  5BT5 A;  5KTW A;  2LSP B;  5A5P A;  3MB4 A;  4QSQ A;  5F1H A;  5FE7 A;  5COI A;  5DW1 A;  2KTB B;  4TZ8 A;  4WHW A;  4A9H A;  2E7N A;  5IGM A;  5FG5 A;  2DVS A;  4ZW1 A;  4TQN A;  4N4G A;  4F3I A;  5L8U A;  4MEO A;  4QC3 A;  4YYK A;  5JI8 A;  4LZR A;  5CRM A;  5HRV A;  4YK0 A;  5KHM A;  4BW3 A;  4YYM A;  5EWH A;  5D7X A;  5CUC A;  5ETB A;  4PY6 A;  5ENC A;  5E9M A;  4YAX A;  4O76 A;  5C7N A;  5ETD A;  4IOR A;  4Z93 A;  5CRZ A;  3JVJ A;  2I8N A;  3MUK A;  5FFW A;  5E9I A;  4CUS A;  5EV9 A;  5K29 A;  3IU5 A;  4NR5 A;  2RS9 B;  4UYE A;  3P1C A;  2L5E A;  5F3A A;  5L99 A;  4ZQL A;  5DKC A;  5H1U A;  4J3I A;  4MEQ A;  4MR4 A;  4HXO A;  4QEU A;  5A85 A;  5JWM A;  2DVR A; 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