5F36A

Crystal structure of the bromodomain of human atad2 in complex with compound a12
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
SMQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title To be pubulished
rcsb
molecule keywords ATPase family AAA domain-containing protein 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 55
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 2015-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5f36A00
5ENGA 5C87A 5EPBA 3TLPA 3I3JA 3U5KA 4BW1A 4QY4A 4NRAA 5A5PA 4UIXA 5II2A 4HXSA 5E7DA 3G0LA 4O7BA 4O72A 4A9JA 4YH4A 2DVQA 4GPJA 2RNYA 3P1DA 5ETDA 4HBYA 3U5JA 5AMFA 2DKWA 2F6JA 4XUBA 5D3LA 3ONIA 5ENEA 2R0SA 5KTUA 2RNWA 4YK0A 5E9VA 5CUBA 4HBWA 5D3JA 5F63A 5BT4A 5FE9A 5HRVA 4TQNA 3Q2EA 4OGJA 4UYFB 5FG5A 5I88A 3LXJA 5F62A 2DVVA 5CGPA 5DKHA 4NR4A 5FFWA 5HQ6A 4IR3A 4BW4A 4QR4A 5JWMA 3LQHA 5G4SA 4YY4A 3GG3A 4Z93A 4NQMA 5LJ2A 5I80A 5D3PA 4QSSA 2R0VA 5DY7A 5FE4A 4MEQA 5FB0A 3UV4A 5E9YA 4CURA 4CL9A 5EWWA 4LZSA 4YATA 4LDFA 4A9FA 4YYHA 4TZ2A 2DVSA 5EWCA 1E6IA 2LSPB 5D0CA 5C7NA 5CUCA 3DAIA 4YABA 3UVXA 4A9KA 5ENIA 5L98A 2KTBB 4LYWA 4TT2A 5CY9A 4QB3A 5D7XA 5F3AA 5L8UA 5F61A 2WP1A 5CRMA 4YBSA 5TB6A 5DW1A 4PKLA 5CQ3A 5CUGA 2E3KA 4BW2A 3O35A 4QC1A 5F1HA 3RCWA 5JI8A 3P1EA 5HENA 4HXKA 3U5OA 2YYNA 5A5OA 3P1FA 3MUKA 5IGNA 4CLBA 5LJ1A 4CUTA 4TT6A 2NXBA 4YBTA 5F60A 4QEVA 4Z6HA 1EQFA 3IU6A 5L8TA 5E9KA 2I7KA 4ALHA 3AQAA 5CU8A 5CTLA 4PS5A 4NR7A 4NS5A 4Z1QA 3G0JA 5DX4A 3QZVA 5E9LA 5H1TA 4QEUA 4O78A 4KV1A 5LVRA 4A9MA 5CS8A 4QBMA 4CFLA 3ZYUA 4WHWA 5F2PA 4RVRA 4KV4A 4O7FA 2DWWA 5KHMA 5E3DA 5H85A 2L85A 5EVAA 3UW9A 4QUTA 3SVFA 4NR9A 5A83A 4XYAA 5DLZA 5FE8A 1X0JA 4YYKA 2R0YA 3O33A 4ZC9A 4J1PA 5I86A 5C85A 4TTEA 5CQAA 5DFDA 4C67A 4A9IA 4Q0OA 5HFQA 3LQIA 5EK9A 4QZSA 4X2IA 4MR4A 5CQ8A 4HXNA 4QNSA 4O70A 3UVWA 4LR6A 5G4RA 1WUGA 5A85A 5KTWA 4A9EA 4TS8A 4QR3A 4QYLA 5I40A 4ZW1A 4NUEA 5IGMA 3D7CA 3QZTA 5EI4A 5EM3A 5EV9A 5I89A 5A5RA 4NXJA 5DW2A 5FDZA 5LVQA 1ZS5A 5E9MA 5EPRA 4IORA 5D3SA 3LJWA 4HXOA 5FBXA 5A82A 4N4HA 3HMHA 4A9LA 3MB3A 2DATA 4NQNA 3UVDA 4N4IA 4ZQLA 5A5NA 4PCIA 4IR6A 4XY9A 5L97A 3UVYA 2E7OA 4PCEA 2OSSA 5I7XA 4CUSA 5D26A 2N9GA 4XUAA 4CUUA 4J0SA 5LUUA 5E9IA 4YADA 2RS9B 5E3GA 3HMEA 5A7CA 5H1UA 2YDWA 4HXRA 5EQ1A 1JM4B 5EPSA 4MR3A 5COIA 4YC9A 5D3NA 4O7AA 5CUAA 5EICA 2YW5A 5CQ4A 5CFWA 3U5PA 5F36A 4NR6A 4AKNA 5HQ7A 4NUCA 4NYVA 5I29A 5FB1A 4O74A 3JVLA 4CFKA 4UIYA 3O34A 5H1VA 2I8NA 1WUMA 4O77A 3U5LA 5CUDA 5FH7A 4A9HA 5D3HA 4C66A 5HRXA 3FKMX 5FE3A 3AADA 5LJ0A 5FE2A 5E0RA 3UV2A 4QSWA 1N72A 2MJVB 4IR4A 5HEMA 5HELA 5FE0A 4YYIA 5A81A 4QSQA 5AD2A 2YELA 4YYGA 4TYLA 5ENJA 5CUEA 4LZRA 4FLPA 4LZ2A 4PY6A 4Q0NA 5D24A 5CQ6A 4KCXA 4UYGA 5ENBA 5EWVA 4BJXA 2RFJA 4MENA 5DBMA 3MQMA 3JVKA 4N4GA 4WHUA 5FE5A 4HXMA 3MULA 5D3RA 5I7YA 2F6NA 5CZGA 4OUFA 5AMEA 5FE6A 3O37A 3JVJA 5HRWA 2OO1A 2RI7A 2YEMA 4ALGA 3S91A 4QUUA 4PTBA 3MXFA 4J0RA 2GRCA 5KU3A 5L99A 5C89A 4LYSA 5F25A 4Z6IA 5DYAA 5FE7A 5C8GA 5KO4A 5EP7A 5ENFA 4NYXA 4QSVA 4UYEA 5IBNA 4YAXA 4J3IA 3MB4A 4NR5A 4O7CA 5DKCA 5DFCA 3HMFA 4CUPA 5TCMA 3LQJA 4IR5A 4QYDA 4NR8A 5ENHA 4NRBA 5II1A 4UIUA 4N3WA 4UIVA 5HCLA 5EA1A 3NXBA 4TU6A 5L96A 5EGUA 1F68A 4DONA 5DLXA 2G4AA 5D25A 2FSAA 5FG6A 5HQ5A 2WP2A 5D3TA 3SVHA 5A5QA 5ACYA 5DFBA 4QEWA 3Q2FA 2OUOA 4HBXA 2YQDA 4O76A 4UIZA 2L84A 4MR6A 3SVGA 4YYJA 5EWDA 3P5OA 2YEKA 4LRGA 4LC2A 4YYDA 5E73A 2D9EA 5CPEA 2RNXA 4HXLA 5EWHA 3K2JA 3DWYA 4HBVA 5EISA 4UITA 4Y03A 4HXPA 4UYHA 4UYDA 4UYFA 5ETBA 4QR5A 4CUQA 5HM0A 5DYXA 4QSUA 5CQ5A 2RO1A 4TU4A 4E96A 5I1QA 4OGIA 4YY6A 4Z1SA 5FG4A 5K29A 4QSTA 4TZ8A 5BT5A 4MEPA 5HLSA 4QSPA 4TT4A 3O36A 4QC3A 5A5SA 4YYNA 4UIWA 5DKDA 1JSPB 4WIVA 4A9OA 2R10A 5DYUA 5CQTA 5CRZA 4XY8A 5LKUA 3U5MA 5FFYA 4O75A 5DYCA 5HJCA 5LKTA 2E7NA 3U5NA 2D82A 5EU1A 5LKZA 5ENCA 5C4QA 5LKXA 4QSRA 4O71A 4O7EA 5I83A 3UV5A 4YH3A 2H60A 5F5ZA 5FE1A 4NUDA 3IU5A 4IOOA 4YBMA 4NYWA 4NRCA 5J0DA 5F1LA 4BW3A 5IGKA 5CP5A 4IOQA 5FFVA 5IIDA 4YYMA 4N4FA 4QSXA 5HFRA 5BT3A 3P1CA 5FH6A 5IGLA 4A9NA 3JVMA 4MR5A 5IG6A 4F3IA 5CQ7A 5E74A 2DVRA 5KTXA 4BHWA 2L5EA 5FH8A 4LYIA 5AD3A 4MEOA 3QZSA 3S92A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ENGA 5C87A 5EPBA 3TLPA 3I3JA 3U5KA 4BW1A 4QY4A 4NRAA 5A5PA 4UIXA 5II2A 4HXSA 5E7DA 3G0LA 4O7BA 4O72A 4A9JA 4YH4A 2DVQA 4GPJA 2RNYA 3P1DA 5ETDA 4HBYA 3U5JA 5AMFA 2DKWA 2F6JA 4XUBA 5D3LA 3ONIA 5ENEA 2R0SA 5KTUA 2RNWA 4YK0A 5E9VA 5CUBA 4HBWA 5D3JA 5F63A 5BT4A 5FE9A 5HRVA 4TQNA 3Q2EA 4OGJA 4UYFB 5FG5A 5I88A 3LXJA 5F62A 2DVVA 5CGPA 5DKHA 4NR4A 5FFWA 5HQ6A 4IR3A 1PUOA 4BW4A 4QR4A 5JWMA 3LQHA 5G4SA 4YY4A 3GG3A 4Z93A 4NQMA 5LJ2A 5I80A 5D3PA 4QSSA 2R0VA 5DY7A 5FE4A 4MEQA 5FB0A 3UV4A 5E9YA 4CURA 4CL9A 5EWWA 4LZSA 4YATA 4LDFA 4A9FA 4YYHA 4TZ2A 2DVSA 5EWCA 1E6IA 2LSPB 5D0CA 5C7NA 5CUCA 3DAIA 4YABA 4AKGA 3UVXA 4A9KA 5ENIA 5L98A 2KTBB 4LYWA 4TT2A 5CY9A 4QB3A 5D7XA 5F3AA 5L8UA 5F61A 2WP1A 5CRMA 4YBSA 5TB6A 5DW1A 4PKLA 5CQ3A 5CUGA 2E3KA 4BW2A 3O35A 4QC1A 5F1HA 3RCWA 5JI8A 3P1EA 5HENA 4HXKA 3U5OA 2YYNA 5A5OA 3P1FA 3MUKA 5IGNA 4CLBA 5LJ1A 4CUTA 4TT6A 2NXBA 4YBTA 5F60A 4QEVA 4Z6HA 1EQFA 3IU6A 5L8TA 5E9KA 2I7KA 4ALHA 3AQAA 5CU8A 5CTLA 4PS5A 4NR7A 4NS5A 4Z1QA 3G0JA 5DX4A 3QZVA 5E9LA 5H1TA 4AI6A 4QEUA 4O78A 4KV1A 5LVRA 4A9MA 5CS8A 4QBMA 4CFLA 3ZYUA 4WHWA 5F2PA 4RVRA 4KV4A 4O7FA 2DWWA 5KHMA 5E3DA 5H85A 2L85A 5EVAA 3UW9A 4QUTA 3SVFA 4NR9A 5A83A 4XYAA 5DLZA 5FE8A 1X0JA 4YYKA 2R0YA 3O33A 4ZC9A 4J1PA 5I86A 5C85A 4TTEA 5CQAA 5DFDA 4C67A 4A9IA 4Q0OA 5HFQA 3LQIA 5EK9A 4QZSA 4X2IA 4MR4A 5CQ8A 4HXNA 4QNSA 4O70A 3UVWA 4LR6A 5G4RA 1WUGA 5A85A 5KTWA 4A9EA 4TS8A 4QR3A 4QYLA 5I40A 4ZW1A 4NUEA 5IGMA 3D7CA 3QZTA 5EI4A 5EM3A 5EV9A 5I89A 1ZKRA 5A5RA 4NXJA 5DW2A 5FDZA 5LVQA 1ZS5A 5E9MA 5EPRA 4IORA 5D3SA 3LJWA 4HXOA 5FBXA 5A82A 4N4HA 3HMHA 3D1DA 4A9LA 3D1BA 3MB3A 2DATA 4NQNA 3UVDA 4N4IA 4ZQLA 5A5NA 4PCIA 4IR6A 4XY9A 5L97A 3UVYA 2E7OA 4PCEA 2OSSA 5I7XA 4CUSA 5D26A 2N9GA 4XUAA 4CUUA 4J0SA 5LUUA 5E9IA 4YADA 2RS9B 5E3GA 3HMEA 5A7CA 5H1UA 2YDWA 4HXRA 5EQ1A 1JM4B 5EPSA 4MR3A 5COIA 4YC9A 5D3NA 4O7AA 5CUAA 5EICA 2YW5A 5CQ4A 5CFWA 3U5PA 5F36A 4NR6A 4AKNA 5HQ7A 4NUCA 4NYVA 5I29A 5FB1A 4O74A 3JVLA 4CFKA 4UIYA 3O34A 4AKHA 5H1VA 2I8NA 1WUMA 4O77A 3U5LA 5CUDA 5FH7A 4A9HA 5D3HA 4C66A 5HRXA 3FKMX 5FE3A 3AADA 5LJ0A 5FE2A 5E0RA 3UV2A 4QSWA 1N72A 2MJVB 4IR4A 5HEMA 5HELA 5FE0A 4YYIA 5A81A 4QSQA 5AD2A 2YELA 4YYGA 4TYLA 5ENJA 5CUEA 4LZRA 4FLPA 4LZ2A 4PY6A 4Q0NA 5D24A 5CQ6A 4KCXA 4UYGA 5ENBA 5EWVA 4BJXA 2RFJA 4MENA 3MQMA 3JVKA 4WHUA 4N4GA 5DBMA 5FE5A 4HXMA 3MULA 5D3RA 5I7YA 4AKIA 2F6NA 5CZGA 4OUFA 5AMEA 5FE6A 3O37A 3JVJA 5HRWA 2OO1A 2RI7A 2YEMA 4ALGA 3S91A 4QUUA 4PTBA 3MXFA 4J0RA 2GRCA 5KU3A 5L99A 5C89A 4LYSA 5F25A 4Z6IA 5DYAA 5FE7A 5C8GA 5KO4A 5EP7A 5ENFA 4NYXA 4QSVA 4UYEA 5IBNA 4YAXA 4J3IA 3MB4A 4NR5A 4O7CA 5DKCA 5DFCA 3HMFA 4CUPA 5TCMA 3LQJA 4IR5A 4QYDA 4NR8A 5ENHA 4NRBA 5II1A 4UIUA 4N3WA 4UIVA 5HCLA 5EA1A 3NXBA 4TU6A 5L96A 5EGUA 1F68A 4DONA 5DLXA 2G4AA 5D25A 2FSAA 5FG6A 2EJNA 5HQ5A 2WP2A 5D3TA 3SVHA 5A5QA 5ACYA 5DFBA 4QEWA 3Q2FA 2OUOA 4HBXA 2YQDA 4O76A 4UIZA 2L84A 4MR6A 3SVGA 4YYJA 5EWDA 3P5OA 2YEKA 4LRGA 4LC2A 4YYDA 5E73A 2D9EA 5CPEA 2RNXA 4HXLA 3ERRA 5EWHA 3K2JA 3DWYA 4HBVA 5EISA 4UITA 4Y03A 4HXPA 4UYHA 4UYDA 4UYFA 5ETBA 4QR5A 4CUQA 5HM0A 5DYXA 4QSUA 5CQ5A 2RO1A 4TU4A 4E96A 5I1QA 3VKHA 4OGIA 4YY6A 4Z1SA 5FG4A 5K29A 4QSTA 4TZ8A 5BT5A 4MEPA 5HLSA 4QSPA 4TT4A 3O36A 4QC3A 5A5SA 4YYNA 4UIWA 5DKDA 1JSPB 4WIVA 4A9OA 2R10A 5DYUA 5CQTA 5CRZA 4XY8A 5LKUA 3U5MA 5FFYA 4O75A 5DYCA 5HJCA 5LKTA 2E7NA 3U5NA 2D82A 5EU1A 5LKZA 5ENCA 5C4QA 5LKXA 4QSRA 4O71A 4O7EA 5I83A 3UV5A 4YH3A 2H60A 5F5ZA 5FE1A 4NUDA 3IU5A 4IOOA 4YBMA 4NYWA 4NRCA 5J0DA 5F1LA 4BW3A 5IGKA 5CP5A 4IOQA 5FFVA 5IIDA 4YYMA 4N4FA 4QSXA 5HFRA 5BT3A 3P1CA 5FH6A 5IGLA 4A9NA 3JVMA 4MR5A 5IG6A 4F3IA 5CQ7A 5E74A 2DVRA 3VKGA 5KTXA 4BHWA 2L5EA 5FH8A 4LYIA 5AD3A 4MEOA 3QZSA 3S92A
chains in the Genus database with same CATH topology
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