5FE6A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment zb1916 (fragment 10)
Total Genus 41

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe6A00
4QEWA 5C89A 4QSVA 4BW2A 4CL9A 4HXSA 2RFJA 3U5OA 4QSQA 4TZ8A 4TT6A 4KV1A 5HRWA 4UIYA 2R0YA 5D3NA 4YY6A 4NS5A 4HXMA 5DY7A 4ZC9A 4OGIA 4NR6A 4A9JA 2YW5A 4CUQA 3MUKA 4O76A 5A7CA 5FE8A 5EK9A 4AKNA 4PKLA 5KTWA 5D7XA 5ENCA 5IIDA 5I1QA 5CQ5A 5A5RA 5CY9A 4UYFA 2I8NA 2D9EA 5ENGA 4CUTA 5DYXA 4YH4A 4UYHA 4QSTA 2F6NA 5D3JA 3GG3A 5CUCA 3MULA 3SVGA 5EWWA 5II2A 4HBWA 3P5OA 2L5EA 4O72A 4N4HA 3SVFA 4BW3A 5I7YA 4YYNA 4CFLA 5E9LA 5IGKA 5L8TA 5DYCA 4HXLA 5FE4A 5IG6A 3O36A 5FH7A 5D3PA 5H1TA 5I86A 5LKTA 3UW9A 3U5LA 5KTXA 4HBYA 4MR3A 5DKCA 1JSPB 4J1PA 3TLPA 4BHWA 1JM4B 4YADA 4QZSA 5HM0A 5A5PA 5D25A 3JVKA 4NUCA 5AMFA 4YH3A 2DWWA 4QSWA 4NR7A 3P1EA 4LYWA 4O74A 5DFCA 3UVDA 4UIVA 4IORA 4X2IA 5EPSA 5ENEA 4O70A 5FFVA 4PCEA 2YELA 5DKHA 4TU4A 5ENJA 5FE9A 5BT4A 4PY6A 4CLBA 4OGJA 4YYMA 5BT5A 3MB3A 5CQ3A 5KO4A 5A5NA 4QY4A 2R0SA 5LVQA 4QEUA 5A85A 2RI7A 5HLSA 4MR6A 5DLZA 5CS8A 4O77A 4IR5A 4Q0NA 5FH6A 4A9KA 4LZRA 5E3DA 5A82A 4Z6HA 4Z93A 4CUPA 3Q2EA 5F60A 4BJXA 3O34A 5EU1A 5IGMA 4YYHA 3K2JA 5I83A 4GPJA 4HXPA 4LR6A 3Q2FA 5G4RA 5HELA 5LKZA 4LZ2A 5TCMA 5ENIA 4RVRA 2YEMA 5F63A 4C67A 4CURA 4O7AA 5ETBA 3AQAA 4Y03A 5LJ1A 5CP5A 5G4SA 4LC2A 5A81A 5F1HA 4N4IA 4A9NA 5CQ8A 4XY8A 4PCIA 4MR5A 4O7BA 4YBMA 3LQIA 2RNYA 1WUGA 4YABA 4A9MA 2RO1A 5DFBA 5CTLA 5EA1A 4QUUA 4QUTA 5F1LA 2DVSA 4DONA 4MENA 5DBMA 2YQDA 5A83A 4N4GA 3HMFA 4HXRA 2D82A 3IU5A 4YBTA 4A9HA 1N72A 4QR4A 5F3AA 5JI8A 5FE6A 5COIA 4J0SA 3S91A 5C8GA 4N3WA 5EWCA 5D3RA 5IBNA 5CUAA 5A5QA 4Q0OA 4ALGA 5IGNA 3U5JA 4MEOA 4O7FA 1F68A 2F6JA 5E73A 5HRVA 5LJ2A 2E7NA 5C4QA 5FE2A 2RNXA 2I7KA 2WP2A 2MJVB 5DW2A 4IR3A 5L96A 3UVWA 5FFWA 5I88A 2OSSA 2WP1A 5EWDA 4Z1QA 4KCXA 5EPRA 3P1FA 1ZS5A 4NQMA 4NR9A 5FE1A 5DYAA 5DW1A 3LJWA 5H1UA 3HMEA 4NQNA 5C85A 2YDWA 4QBMA 5FG5A 5I40A 5ENHA 5CZGA 5E9VA 4YK0A 3HMHA 4HBXA 2YYNA 4MEPA 5LKUA 4IOQA 5D3TA 3IU6A 5CRMA 5HEMA 2RNWA 3U5KA 4O75A 4BW4A 3G0JA 3O37A 5HRXA 4XUBA 4NR5A 5CQ4A 4IR6A 5FE7A 3LQJA 4J3IA 4LDFA 4QC1A 2DATA 2YEKA 5EICA 4CFKA 5FBXA 4ALHA 5CUBA 4TS8A 4Z1SA 5BT3A 4NRBA 5KHMA 4QSRA 5ENBA 5HQ5A 3U5PA 2R0VA 4QSPA 3MB4A 4A9EA 1E6IA 4LZSA 4IOOA 4UYEA 4XY9A 5FH8A 4MEQA 2E3KA 5HENA 4O78A 4A9FA 5FE5A 4YYJA 4NUDA 5F2PA 5F5ZA 4QSSA 5CQ7A 4WHUA 4HXNA 5HCLA 4QNSA 4BW1A 3U5NA 5EWHA 5FB1A 4CUUA 4J0RA 5DFDA 5AD3A 5E3GA 2DVRA 4NR8A 4E96A 4UIWA 5EISA 5FE0A 5LVRA 5LJ0A 4NRAA 3QZVA 3UVXA 5EV9A 5E7DA 4NYXA 4UIZA 1WUMA 4YY4A 5HJCA 4YC9A 3D7CA 5FG6A 3NXBA 4OUFA 5JWMA 3MXFA 4MR4A 3UV2A 5CU8A 5HFRA 4TYLA 5C7NA 4TU6A 4TQNA 4HXKA 3SVHA 4TZ2A 3QZSA 4HBVA 5E74A 3P1CA 5CUGA 3UV4A 4YYIA 4UYFB 4YATA 3O33A 5FDZA 5TB6A 5E0RA 2OO1A 3FKMX 5L8UA 3LQHA 4A9LA 5ETDA 5D3HA 5D0CA 3UV5A 5EWVA 3ONIA 4F3IA 5EI4A 4KV4A 3G0LA 4XUAA 5I29A 5AMEA 3DAIA 5A5SA 3JVMA 4QYLA 5F36A 3UVYA 2GRCA 5D24A 5HFQA 5L97A 2OUOA 5IGLA 4UYDA 5DX4A 5CGPA 3MQMA 5I80A 5EP7A 3U5MA 2RS9B 4UITA 5FB0A 5F61A 2R10A 4NYVA 2DVQA 2DKWA 5ACYA 5DLXA 5AD2A 4ZQLA 5KU3A 5FE3A 4QR5A 5A5OA 4UIUA 4YBSA 4PTBA 5F25A 4O7EA 4QYDA 4NR4A 4TT2A 4FLPA 4A9OA 4QC3A 5CRZA 3ZYUA 4QR3A 4ZW1A 5FG4A 3S92A 5C87A 4A9IA 5LKXA 4LYIA 4N4FA 5CUEA 5ENFA 5EGUA 4C66A 5E9MA 1EQFA 5K29A 2L84A 2E7OA 5D3SA 5FFYA 5CQTA 5DKDA 5H1VA 2LSPB 5EQ1A 3O35A 4PS5A 4QSUA 4TTEA 5F62A 5L98A 5I7XA 4XYAA 3QZTA 2FSAA 4IR4A 4TT4A 5L99A 4QSXA 4Z6IA 5II1A 5CPEA 3RCWA 5LUUA 3JVJA 4LYSA 3JVLA 5E9KA 2KTBB 5HQ6A 5D3LA 4WHWA 4WIVA 5DYUA 5EM3A 3AADA 5D26A 4YYGA 5E9IA 5HQ7A 4O71A 5CFWA 3DWYA 4QEVA 5I89A 4O7CA 4HXOA 4NYWA 2L85A 5E9YA 1X0JA 2N9GA 5EVAA 4YYKA 2H60A 5KTUA 4LRGA 3I3JA 5EPBA 4NXJA 4NRCA 5CUDA 5H85A 5J0DA 5CQ6A 4YYDA 4UIXA 3P1DA 2DVVA 4YAXA 3LXJA 4NUEA 4UYGA 4CUSA 2G4AA 4QB3A 5CQAA 2NXBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QEWA 5C89A 4QSVA 4BW2A 4CL9A 4HXSA 2RFJA 3U5OA 4QSQA 4TZ8A 2EJNA 4TT6A 4KV1A 5HRWA 4UIYA 2R0YA 5D3NA 4YY6A 4NS5A 4HXMA 5DY7A 4ZC9A 4OGIA 4NR6A 4A9JA 2YW5A 4CUQA 3MUKA 4O76A 5A7CA 5FE8A 5EK9A 4AKNA 4PKLA 5KTWA 5D7XA 5ENCA 5IIDA 5I1QA 5CQ5A 5A5RA 5CY9A 4UYFA 2I8NA 2D9EA 5ENGA 4CUTA 5DYXA 4YH4A 4UYHA 4QSTA 2F6NA 5D3JA 3GG3A 5CUCA 3MULA 3SVGA 5EWWA 5II2A 4HBWA 3P5OA 2L5EA 1PUOA 4O72A 4N4HA 3SVFA 4BW3A 5I7YA 4YYNA 4CFLA 5E9LA 5IGKA 5L8TA 5DYCA 4HXLA 5FE4A 5IG6A 3O36A 5FH7A 5D3PA 5H1TA 5I86A 5LKTA 3UW9A 3U5LA 5KTXA 4HBYA 4MR3A 5DKCA 1JSPB 4J1PA 3TLPA 4BHWA 1JM4B 4YADA 4QZSA 5HM0A 5A5PA 5D25A 3JVKA 4NUCA 5AMFA 4YH3A 2DWWA 4QSWA 4NR7A 3P1EA 4LYWA 4O74A 5DFCA 3UVDA 4UIVA 4IORA 4X2IA 5EPSA 5ENEA 4O70A 5FFVA 4PCEA 2YELA 5DKHA 4TU4A 5ENJA 5FE9A 5BT4A 4PY6A 4CLBA 4OGJA 4YYMA 5BT5A 3MB3A 5CQ3A 5KO4A 1ZKRA 5A5NA 4QY4A 2R0SA 5LVQA 4QEUA 5A85A 2RI7A 5HLSA 4MR6A 5DLZA 5CS8A 4O77A 4IR5A 4Q0NA 5FH6A 4A9KA 4LZRA 5E3DA 5A82A 4Z6HA 4Z93A 4CUPA 3Q2EA 5F60A 4BJXA 3O34A 5EU1A 5IGMA 4YYHA 3K2JA 5I83A 4GPJA 4HXPA 4LR6A 3Q2FA 5G4RA 5HELA 5LKZA 4LZ2A 5TCMA 5ENIA 4RVRA 2YEMA 5F63A 4C67A 4CURA 4O7AA 3VKHA 5ETBA 3AQAA 4Y03A 5LJ1A 5CP5A 5G4SA 4LC2A 5A81A 5F1HA 4N4IA 4A9NA 5CQ8A 4XY8A 4PCIA 4MR5A 4O7BA 4YBMA 3LQIA 2RNYA 1WUGA 3D1BA 4YABA 4A9MA 2RO1A 5DFBA 5CTLA 5EA1A 4QUUA 4QUTA 5F1LA 2DVSA 4DONA 4MENA 5DBMA 2YQDA 5A83A 4N4GA 3HMFA 4HXRA 2D82A 3IU5A 4YBTA 4A9HA 1N72A 4QR4A 5F3AA 5JI8A 5FE6A 5COIA 4J0SA 3S91A 5C8GA 4N3WA 5EWCA 5D3RA 5IBNA 5CUAA 5A5QA 4Q0OA 4ALGA 5IGNA 3U5JA 4MEOA 4O7FA 1F68A 2F6JA 5E73A 5HRVA 5LJ2A 2E7NA 5C4QA 5FE2A 2RNXA 2I7KA 2WP2A 2MJVB 5DW2A 4IR3A 5L96A 3UVWA 5FFWA 5I88A 2OSSA 2WP1A 5EWDA 4Z1QA 4KCXA 5EPRA 3P1FA 1ZS5A 4NQMA 4NR9A 5FE1A 5DYAA 5DW1A 3LJWA 5H1UA 3HMEA 4NQNA 5C85A 2YDWA 4QBMA 5FG5A 5I40A 5ENHA 5CZGA 5E9VA 4YK0A 3HMHA 4HBXA 2YYNA 4MEPA 5LKUA 4IOQA 5D3TA 3IU6A 5CRMA 5HEMA 2RNWA 3U5KA 4O75A 4BW4A 3G0JA 3O37A 5HRXA 4XUBA 4NR5A 5CQ4A 4IR6A 5FE7A 3LQJA 4J3IA 4LDFA 4QC1A 2DATA 2YEKA 5EICA 4CFKA 5FBXA 4ALHA 5CUBA 4AKHA 4TS8A 3ERRA 4Z1SA 5BT3A 4NRBA 5KHMA 4QSRA 5ENBA 5HQ5A 3U5PA 2R0VA 4QSPA 3MB4A 4A9EA 1E6IA 4LZSA 4IOOA 4UYEA 4XY9A 5FH8A 4MEQA 2E3KA 5HENA 4O78A 4A9FA 5FE5A 4YYJA 4NUDA 5F2PA 5F5ZA 4QSSA 5CQ7A 4WHUA 4HXNA 5HCLA 4QNSA 4BW1A 3U5NA 5EWHA 5FB1A 4CUUA 4J0RA 5DFDA 5AD3A 5E3GA 2DVRA 4NR8A 4E96A 4UIWA 5EISA 5FE0A 5LVRA 4AI6A 5LJ0A 4NRAA 3QZVA 3UVXA 5EV9A 5E7DA 4NYXA 4UIZA 1WUMA 4YY4A 5HJCA 4YC9A 3D7CA 5FG6A 3NXBA 4OUFA 5JWMA 3MXFA 4MR4A 3UV2A 5CU8A 5HFRA 4TYLA 5C7NA 4TU6A 4TQNA 4HXKA 3SVHA 4TZ2A 3QZSA 4HBVA 5E74A 3P1CA 5CUGA 3UV4A 4YYIA 4UYFB 4YATA 3O33A 5FDZA 5TB6A 5E0RA 2OO1A 3FKMX 5L8UA 3LQHA 4A9LA 5ETDA 5D3HA 5D0CA 3UV5A 5EWVA 3ONIA 4F3IA 5EI4A 4KV4A 3G0LA 4XUAA 5I29A 5AMEA 3DAIA 5A5SA 3JVMA 4QYLA 5F36A 3UVYA 3D1DA 2GRCA 5D24A 5HFQA 5L97A 2OUOA 5IGLA 4UYDA 5DX4A 5CGPA 3MQMA 5I80A 5EP7A 3U5MA 2RS9B 4UITA 5FB0A 5F61A 2R10A 4NYVA 2DVQA 2DKWA 5ACYA 5DLXA 5AD2A 4ZQLA 5KU3A 5FE3A 4QR5A 5A5OA 4UIUA 4YBSA 4PTBA 5F25A 4O7EA 4QYDA 4NR4A 4TT2A 4FLPA 4A9OA 4QC3A 5CRZA 3ZYUA 4QR3A 4ZW1A 5FG4A 3S92A 5C87A 4A9IA 4AKGA 5LKXA 4LYIA 4N4FA 5CUEA 5ENFA 5EGUA 4C66A 5E9MA 1EQFA 5K29A 2L84A 2E7OA 5D3SA 5FFYA 5CQTA 5DKDA 5H1VA 2LSPB 5EQ1A 3O35A 4PS5A 4QSUA 4TTEA 5F62A 5L98A 3VKGA 5I7XA 4XYAA 3QZTA 2FSAA 4IR4A 4TT4A 5L99A 4QSXA 4Z6IA 5II1A 5CPEA 3RCWA 5LUUA 3JVJA 4LYSA 3JVLA 5E9KA 2KTBB 5HQ6A 5D3LA 4WHWA 4WIVA 4AKIA 5DYUA 5EM3A 3AADA 5D26A 4YYGA 5E9IA 5HQ7A 4O71A 5CFWA 3DWYA 4QEVA 5I89A 4O7CA 4HXOA 4NYWA 2L85A 5E9YA 1X0JA 2N9GA 5EVAA 4YYKA 2H60A 5KTUA 4LRGA 3I3JA 5EPBA 4NXJA 4NRCA 5CUDA 5H85A 5J0DA 5CQ6A 4YYDA 4UIXA 3P1DA 2DVVA 4YAXA 3LXJA 4NUEA 4UYGA 4CUSA 2G4AA 4QB3A 5CQAA 2NXBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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