5FE7A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with fragment zb2216 (fragment 11)
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe7A00
5I1QA 5EA1A 4ZW1A 5CQ8A 3RCWA 4CFKA 5ENGA 3FKMX 5ENJA 2L85A 3G0LA 4CUUA 2DVQA 4TU4A 5TB6A 4MR3A 4NYXA 4NYWA 4NR6A 5H1VA 5ENEA 4PY6A 4MEPA 5F2PA 3U5NA 4QSUA 2OSSA 4YYHA 3SVGA 3S92A 5ETDA 5HFQA 5JWMA 5FE1A 4YY6A 4YYJA 3JVJA 4KCXA 3ONIA 5CY9A 5E7DA 5LJ1A 5ETBA 4Z6IA 5FE5A 3ZYUA 4PCIA 5A5RA 3NXBA 4O7BA 2R0VA 5D3HA 3LQIA 5II1A 4O7CA 4YYDA 5EPBA 5IG6A 5BT3A 5AMEA 3GG3A 3UW9A 4PCEA 2E3KA 3UV2A 1EQFA 3LJWA 5BT5A 5C85A 4A9OA 4QSSA 1F68A 5DKHA 4QBMA 1WUMA 3P1CA 5DFDA 5F25A 3JVLA 5KTXA 5L8TA 4UYHA 5EVAA 4HBXA 4YH3A 4IOQA 4UYDA 2DKWA 1N72A 5LUUA 5FE8A 5EGUA 5A81A 5E73A 4LZSA 4QYLA 2DATA 2RNYA 4HXMA 5C4QA 3SVHA 5FE9A 2YW5A 2RNWA 4J0RA 5EWDA 4BW3A 4J0SA 4PTBA 2RI7A 4YC9A 5D3NA 4YABA 4NR4A 2RFJA 3P1DA 5E0RA 4UYEA 3I3JA 5CUAA 4HBWA 4BW4A 5DFBA 5A5QA 5G4RA 5A83A 4AKNA 5AD2A 4LYIA 2YYNA 4O74A 5F1LA 5F61A 4N4IA 5A5PA 5G4SA 3SVFA 5CRZA 5D24A 2YQDA 5LVRA 5DX4A 3UVXA 4O70A 3P1FA 4TTEA 5A5SA 4XY8A 4CUSA 5EV9A 4LDFA 4O71A 5EU1A 5EQ1A 2RS9B 4OUFA 4QSPA 4QSVA 4YADA 5FH8A 3QZTA 5A7CA 5E9KA 5E3GA 2L5EA 5FB1A 5D7XA 3IU5A 3U5PA 5E9YA 5CUEA 2KTBB 4YYMA 5F36A 4CUTA 4NRCA 4Z1SA 5EICA 4YYGA 4NXJA 5LKTA 4ZC9A 4QB3A 5FE0A 5L96A 4CUPA 4O7AA 5HQ5A 3UVYA 4TS8A 3MUKA 2DVRA 5A85A 5D25A 5E74A 4Y03A 5D3PA 3P5OA 4O77A 4ALHA 3LXJA 2WP1A 3U5JA 2FSAA 3Q2EA 4NRBA 4TT2A 5HQ6A 4QUTA 4HBYA 5CZGA 4CL9A 3QZVA 5D3TA 5DFCA 5L98A 4NUCA 5CQ7A 4QC3A 4NQMA 5CUBA 4LYSA 5EK9A 5FFVA 5HRWA 4O7FA 3U5MA 5ENCA 5L8UA 5HELA 3LQHA 2OUOA 3O35A 5D3JA 5HRXA 5ENIA 5LKXA 3IU6A 5HLSA 4UIWA 5D3SA 5EI4A 4UYGA 4WIVA 5E3DA 5DYCA 3U5OA 4UIYA 4O78A 4A9FA 5LVQA 5FDZA 5EWVA 4RVRA 5I86A 4N4FA 4IR6A 5BT4A 4NYVA 4QSRA 3MULA 5DKDA 3O36A 5EPSA 2RO1A 5CQ4A 5D3RA 2D82A 3AADA 5CQ5A 4YBSA 5I89A 3D7CA 4WHWA 4A9KA 4A9HA 5CQ6A 4C66A 2F6JA 5H1TA 5FE4A 3LQJA 4KV4A 5FG5A 3P1EA 4BJXA 4QEVA 4YBTA 4A9EA 3QZSA 5K29A 4TU6A 4QSWA 4MEOA 4QR4A 5C8GA 5FG6A 2WP2A 2YDWA 4LZ2A 5E9LA 4TZ8A 4HXNA 4MENA 4Z6HA 3DWYA 2L84A 4UIXA 5CRMA 4CFLA 3DAIA 4TQNA 1JM4B 5ENFA 5EWCA 4TZ2A 5FFWA 5CQAA 5KU3A 5CUCA 4NUEA 4CLBA 4NR5A 4DONA 4LC2A 4HBVA 5I88A 5IIDA 4OGIA 5KHMA 4Z93A 2NXBA 3MB4A 3Q2FA 5I29A 5F62A 4Z1QA 5F1HA 5HJCA 4LRGA 5D3LA 3O34A 4J1PA 3HMHA 4QSTA 5C7NA 5LKUA 4BW1A 4YYKA 5HCLA 4IORA 3UV4A 3O37A 5L97A 5E9VA 4GPJA 5IBNA 2I7KA 5I7XA 3MQMA 5C89A 5KO4A 5CU8A 5DKCA 5FH6A 4F3IA 3TLPA 1ZS5A 4UYFB 5COIA 5F60A 3HMFA 4HXRA 4NRAA 5L99A 5ACYA 4XYAA 4QYDA 4LYWA 4HXKA 5EM3A 2F6NA 4N4GA 5I7YA 5H85A 4MR5A 4IR4A 1JSPB 4UYFA 5CQ3A 5FE3A 4PKLA 5DYXA 5CS8A 5CQTA 5I80A 5CPEA 4UIZA 4UIVA 4XUAA 4YYIA 4TT6A 5HRVA 5FE7A 4N3WA 5CP5A 4IR3A 2I8NA 5ENHA 5EISA 4QR3A 5FE2A 2D9EA 2LSPB 4FLPA 4QSXA 3UVWA 4BW2A 4CUQA 2YEMA 5ENBA 4X2IA 4BHWA 5D0CA 5EPRA 1WUGA 5I83A 4HXPA 5DLZA 4MR4A 4WHUA 2DVSA 4Q0OA 4HXOA 4YBMA 2R0YA 5DYUA 4TT4A 4MR6A 4QUUA 5IGMA 5KTUA 3U5KA 4QY4A 4ZQLA 2H60A 5HFRA 4C67A 5IGLA 4LZRA 5H1UA 4CURA 4QSQA 4A9NA 5DYAA 4NS5A 4LR6A 5CFWA 5E9MA 3AQAA 2DVVA 4A9IA 5FE6A 5FG4A 2R10A 5A82A 5JI8A 4O76A 5CGPA 4A9JA 4NR9A 4OGJA 5LJ2A 4QZSA 5HEMA 4MEQA 4UIUA 5F63A 4PS5A 5F5ZA 4YH4A 5FH7A 5CTLA 3JVKA 4HXLA 5CUGA 5DW1A 2YELA 5C87A 2N9GA 4YK0A 5DW2A 4QEUA 3O33A 4NR8A 5AMFA 5FB0A 3HMEA 2RNXA 5FBXA 1E6IA 5DLXA 2OO1A 3S91A 3MB3A 4IR5A 4NQNA 2GRCA 4TYLA 3UV5A 4A9LA 5KTWA 2E7OA 4NUDA 5HM0A 4IOOA 5E9IA 3U5LA 2DWWA 3G0JA 5A5NA 5J0DA 1X0JA 2G4AA 4N4HA 4QC1A 5II2A 4YATA 2R0SA 4XUBA 2MJVB 4NR7A 4QR5A 4O72A 5HENA 4Q0NA 4A9MA 5EWWA 4YAXA 3JVMA 4YYNA 5I40A 5DBMA 4QNSA 5IGNA 5EWHA 5D26A 5EP7A 4KV1A 2YEKA 5AD3A 4J3IA 5A5OA 4O7EA 4QEWA 3UVDA 5LKZA 4O75A 5TCMA 5F3AA 5DY7A 5LJ0A 4UITA 3MXFA 4YY4A 5CUDA 4E96A 3K2JA 4HXSA 5IGKA 5HQ7A 5FFYA 4ALGA 2E7NA 4XY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I1QA 5EA1A 4ZW1A 5CQ8A 3RCWA 4CFKA 5ENGA 3FKMX 5ENJA 2L85A 3G0LA 4CUUA 2DVQA 4TU4A 5TB6A 4MR3A 4NYXA 4NYWA 4NR6A 5H1VA 5ENEA 4PY6A 4MEPA 5F2PA 3U5NA 4QSUA 2OSSA 4YYHA 3SVGA 3S92A 5ETDA 5HFQA 5JWMA 5FE1A 4YY6A 4YYJA 3JVJA 4KCXA 3ONIA 5CY9A 5E7DA 5LJ1A 5ETBA 4Z6IA 5FE5A 3ZYUA 4PCIA 5A5RA 3NXBA 4O7BA 2R0VA 5D3HA 4AI6A 3LQIA 2EJNA 5II1A 4O7CA 4AKGA 4YYDA 5EPBA 5IG6A 5BT3A 5AMEA 3GG3A 3UW9A 4PCEA 2E3KA 3UV2A 1EQFA 3LJWA 5BT5A 5C85A 4A9OA 4QSSA 1F68A 5DKHA 4QBMA 1WUMA 3P1CA 5DFDA 5F25A 3JVLA 5KTXA 5L8TA 4UYHA 5EVAA 4HBXA 4YH3A 4IOQA 4UYDA 2DKWA 1N72A 5LUUA 5FE8A 5EGUA 5A81A 5E73A 4LZSA 4QYLA 2DATA 2RNYA 4HXMA 5C4QA 3SVHA 5FE9A 2YW5A 2RNWA 4J0RA 5EWDA 4BW3A 4J0SA 4PTBA 2RI7A 4YC9A 5D3NA 4YABA 4NR4A 2RFJA 3P1DA 5E0RA 4UYEA 3I3JA 5CUAA 4HBWA 4BW4A 5DFBA 5A5QA 5G4RA 5A83A 4AKNA 5AD2A 4LYIA 2YYNA 4O74A 5F1LA 5F61A 4N4IA 5A5PA 5G4SA 3SVFA 5CRZA 5D24A 2YQDA 5LVRA 5DX4A 3UVXA 4O70A 3P1FA 4TTEA 5A5SA 4XY8A 4CUSA 5EV9A 4LDFA 4O71A 5EU1A 5EQ1A 2RS9B 4OUFA 4QSPA 4QSVA 4YADA 5FH8A 3QZTA 5A7CA 5E9KA 5E3GA 2L5EA 5FB1A 5D7XA 3IU5A 3U5PA 5E9YA 5CUEA 2KTBB 4YYMA 5F36A 4CUTA 4NRCA 4Z1SA 5EICA 4YYGA 4NXJA 5LKTA 4ZC9A 4QB3A 5FE0A 5L96A 4CUPA 4O7AA 5HQ5A 3UVYA 4TS8A 3MUKA 2DVRA 5A85A 5D25A 5E74A 4Y03A 5D3PA 3P5OA 4O77A 4ALHA 3LXJA 2WP1A 3U5JA 2FSAA 3Q2EA 4NRBA 4TT2A 5HQ6A 4QUTA 4HBYA 5CZGA 4CL9A 3QZVA 5D3TA 5DFCA 5L98A 4NUCA 5CQ7A 4QC3A 4NQMA 5CUBA 4LYSA 5EK9A 5FFVA 5HRWA 4O7FA 3U5MA 5ENCA 5L8UA 5HELA 3LQHA 2OUOA 3O35A 5D3JA 1ZKRA 5HRXA 5ENIA 5LKXA 3IU6A 5HLSA 4UIWA 5D3SA 5EI4A 4UYGA 4WIVA 5E3DA 5DYCA 3U5OA 4UIYA 4O78A 4A9FA 5LVQA 5FDZA 5EWVA 4RVRA 3VKGA 5I86A 4N4FA 4IR6A 5BT4A 4NYVA 4QSRA 3MULA 5DKDA 3O36A 5EPSA 2RO1A 5CQ4A 5D3RA 2D82A 3AADA 5CQ5A 4YBSA 5I89A 3D7CA 4WHWA 4A9KA 4A9HA 5CQ6A 4C66A 2F6JA 5H1TA 5FE4A 3LQJA 4KV4A 3D1BA 4AKIA 5FG5A 3P1EA 4BJXA 4QEVA 4YBTA 4A9EA 3QZSA 5K29A 4TU6A 4QSWA 4MEOA 4QR4A 5C8GA 5FG6A 2WP2A 2YDWA 4LZ2A 5E9LA 4TZ8A 4HXNA 4MENA 4Z6HA 3DWYA 2L84A 4UIXA 5CRMA 4CFLA 3DAIA 4TQNA 1JM4B 5ENFA 5EWCA 4TZ2A 5FFWA 5CQAA 5KU3A 5CUCA 4NUEA 4CLBA 4NR5A 4DONA 4LC2A 4HBVA 5I88A 5IIDA 4OGIA 5KHMA 4Z93A 2NXBA 3MB4A 3Q2FA 5I29A 5F62A 4Z1QA 5F1HA 5HJCA 4LRGA 5D3LA 3O34A 4J1PA 3HMHA 4QSTA 5C7NA 5LKUA 4BW1A 4YYKA 5HCLA 4IORA 3UV4A 3O37A 5L97A 5E9VA 4AKHA 4GPJA 5IBNA 2I7KA 5I7XA 3MQMA 5C89A 5KO4A 5CU8A 5DKCA 5FH6A 4F3IA 3TLPA 1ZS5A 4UYFB 5COIA 5F60A 3HMFA 4HXRA 4NRAA 5L99A 5ACYA 4XYAA 4QYDA 4LYWA 4HXKA 3ERRA 5EM3A 2F6NA 4N4GA 5I7YA 5H85A 4MR5A 4IR4A 1JSPB 4UYFA 5CQ3A 5FE3A 4PKLA 5DYXA 5CS8A 5CQTA 5I80A 5CPEA 4UIZA 4UIVA 4XUAA 4YYIA 4TT6A 5HRVA 5FE7A 4N3WA 5CP5A 4IR3A 2I8NA 5ENHA 5EISA 4QR3A 5FE2A 2D9EA 2LSPB 4FLPA 4QSXA 3UVWA 4BW2A 4CUQA 2YEMA 5ENBA 4X2IA 4BHWA 5D0CA 5EPRA 1WUGA 5I83A 4HXPA 5DLZA 4MR4A 4WHUA 2DVSA 4Q0OA 4HXOA 4YBMA 2R0YA 5DYUA 4TT4A 4MR6A 4QUUA 5IGMA 5KTUA 3D1DA 3U5KA 4QY4A 4ZQLA 2H60A 5HFRA 4C67A 5IGLA 4LZRA 5H1UA 4CURA 4QSQA 4A9NA 5DYAA 4NS5A 4LR6A 5CFWA 5E9MA 3AQAA 2DVVA 4A9IA 5FE6A 5FG4A 2R10A 5A82A 5JI8A 4O76A 5CGPA 4A9JA 4NR9A 4OGJA 5LJ2A 4QZSA 5HEMA 4MEQA 4UIUA 5F63A 4PS5A 5F5ZA 4YH4A 5FH7A 5CTLA 3JVKA 4HXLA 5CUGA 5DW1A 2YELA 5C87A 2N9GA 4YK0A 5DW2A 4QEUA 3O33A 4NR8A 5AMFA 5FB0A 3HMEA 2RNXA 5FBXA 1E6IA 5DLXA 2OO1A 3S91A 3MB3A 4IR5A 4NQNA 2GRCA 4TYLA 3UV5A 4A9LA 5KTWA 2E7OA 4NUDA 5HM0A 4IOOA 5E9IA 3U5LA 2DWWA 3G0JA 5A5NA 5J0DA 1X0JA 2G4AA 4N4HA 4QC1A 5II2A 1PUOA 4YATA 2R0SA 4XUBA 2MJVB 4NR7A 4QR5A 4O72A 5HENA 4Q0NA 4A9MA 5EWWA 4YAXA 3JVMA 4YYNA 5I40A 5DBMA 4QNSA 5IGNA 5EWHA 5D26A 5EP7A 4KV1A 3VKHA 2YEKA 5AD3A 4J3IA 5A5OA 4O7EA 4QEWA 3UVDA 5LKZA 4O75A 5TCMA 5F3AA 5DY7A 5LJ0A 4UITA 3MXFA 4YY4A 5CUDA 4E96A 3K2JA 4HXSA 5IGKA 5HQ7A 5FFYA 4ALGA 2E7NA 4XY9A
chains in the Genus database with same CATH topology
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