5FE9A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with compound sl1122 (compound 13)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe9A00
5HM0A 4HBWA 5ENGA 5E9VA 5D3RA 5F60A 5CUGA 5F61A 4YC9A 2FSAA 5FBXA 3P1EA 4UIUA 5L97A 4C67A 4KCXA 5I40A 4HXLA 4YYDA 4QYLA 4Q0NA 3U5MA 5FE3A 5I88A 5II2A 4QC3A 3LJWA 2E3KA 5LJ0A 4QEVA 4E96A 5C87A 5A5PA 3P1DA 2LSPB 3U5KA 3O37A 2WP2A 4NR9A 2GRCA 2E7NA 5DKDA 5EWWA 3JVMA 5FFVA 5LVQA 3HMHA 2YDWA 2RO1A 5EPRA 3NXBA 2DKWA 5CPEA 3IU5A 2R0SA 4CUQA 3SVHA 2RFJA 4LZ2A 3G0JA 2D82A 5ENFA 4FLPA 5EISA 5CQTA 3P1CA 5LKUA 5I89A 3QZSA 4UIVA 5H1TA 4PKLA 5EWHA 2R10A 5FB0A 4BHWA 2YW5A 4Z1SA 5ENIA 5CQ8A 5EI4A 3JVJA 4GPJA 4XY8A 5I86A 3LQJA 5D26A 5I7YA 5FH8A 4HBYA 5D3SA 5DYXA 3P5OA 4QSXA 4TZ8A 5HRVA 4NR5A 3O36A 5CUAA 5DFCA 4QZSA 4YYMA 3UV5A 4LZRA 5DW2A 2YQDA 4NR8A 5E9IA 5ENCA 5A83A 4YBSA 5BT3A 2L85A 5AMFA 2RNXA 4N4HA 5HELA 5HFQA 4A9NA 5C89A 5HQ5A 5L8UA 4MEPA 4PTBA 5CZGA 5ETDA 3UV4A 5EPSA 5IGMA 4QYDA 3JVLA 4CURA 5HQ7A 4BJXA 5E74A 5EICA 5CGPA 5DBMA 3TLPA 2RS9B 5CQ7A 5F36A 4MEQA 5KO4A 4NQNA 4IOQA 4UYDA 4IOOA 5CQ4A 3U5LA 5KTUA 4HXRA 4QSQA 5D7XA 4QR3A 4A9MA 5DKHA 4BW3A 4BW4A 5EK9A 5FFWA 5JI8A 5CQ6A 4TU4A 4LYSA 5EP7A 5CS8A 5HRXA 4PS5A 5LJ1A 5KU3A 4YYJA 4ZW1A 4PCEA 5A5QA 4Y03A 4O7BA 4NYVA 4NYXA 4HXPA 4YYHA 4IR4A 5A81A 3O33A 4XYAA 2H60A 4AKNA 4BW2A 3RCWA 4MR4A 5DFBA 3U5JA 5F25A 4A9LA 5FFYA 5CUCA 5E0RA 2DWWA 5A5RA 5DYAA 5CQ3A 5CUEA 5A82A 4HBVA 1JM4B 5H1VA 5KTXA 4O70A 4MENA 4Z6IA 5FE5A 4LZSA 5E7DA 4XUBA 5IBNA 4CUSA 3Q2FA 5DLZA 5EVAA 4O7EA 4O78A 5CQAA 4O76A 4YADA 4A9JA 5EWVA 4OGIA 5FE6A 3IU6A 5CTLA 1EQFA 5DX4A 4YH4A 3LXJA 4HXOA 4WIVA 4QY4A 3U5NA 4J1PA 3LQHA 4KV1A 5CQ5A 4YATA 4J0SA 2F6JA 4IR5A 3MXFA 5FG4A 4QSRA 4QSSA 5CFWA 3O35A 4NYWA 2E7OA 4CLBA 5TB6A 3UVDA 5FE7A 3K2JA 3AQAA 4IR3A 5L8TA 4LDFA 5DKCA 4O77A 5I80A 4ALGA 5C4QA 3S91A 5HENA 4NQMA 3D7CA 2R0YA 4MEOA 4MR5A 4TZ2A 2DVQA 5EPBA 4J3IA 4HXMA 5D0CA 4Z1QA 5D24A 5ENJA 5A5SA 3DAIA 4HBXA 4LR6A 4OUFA 3FKMX 5FE1A 5E9YA 5LJ2A 5G4RA 4QR5A 4UYGA 5LVRA 5E73A 5D25A 4QB3A 4ZC9A 5HJCA 3HMEA 4A9IA 4QSUA 5E3DA 3JVKA 4A9HA 5C8GA 4OGJA 4QUUA 3O34A 5F1LA 4LC2A 5E3GA 4YY6A 5FE4A 4UIZA 1X0JA 1N72A 5A7CA 5JWMA 4O74A 5CUDA 4C66A 4CUPA 5EWCA 4TYLA 5F63A 5ENEA 5F62A 5FH6A 4YYIA 4CFKA 5K29A 5EGUA 2I8NA 4QSWA 4KV4A 4TU6A 4YYKA 5BT5A 4IR6A 5IIDA 2I7KA 4TT6A 4DONA 5HCLA 4QC1A 5FDZA 2WP1A 4A9FA 4UITA 5CP5A 4HXSA 2YYNA 4TT4A 5L99A 5C7NA 5DW1A 4F3IA 5FE9A 2YEKA 4Z6HA 3LQIA 5D3NA 4TS8A 2N9GA 4O71A 4YK0A 5D3LA 4BW1A 5IG6A 5HRWA 4UIWA 5H85A 5L96A 4O72A 5IGNA 4A9EA 5F1HA 5LKTA 2G4AA 4MR6A 4A9OA 5CU8A 5F5ZA 4NUDA 5F2PA 4NR7A 4NS5A 3MB3A 5HEMA 5DFDA 4YABA 4N4FA 4QSPA 5LKZA 5EV9A 3MQMA 4NUCA 4O7AA 1F68A 4NRAA 5I29A 3Q2EA 4XY9A 3SVGA 4J0RA 3AADA 5FB1A 5E9MA 4LRGA 4UYEA 5EU1A 5CY9A 4UIYA 5J0DA 4UYFB 2KTBB 4CL9A 4A9KA 5C85A 2DVVA 4LYWA 4NR6A 4CUTA 4CUUA 3UVYA 4QNSA 5A85A 5FG6A 5F3AA 3MUKA 2OSSA 5LKXA 2OUOA 4IORA 5L98A 4O7CA 2YELA 3QZTA 4XUAA 4ZQLA 5E9KA 5TCMA 2RNYA 4TQNA 4YH3A 4O75A 3ZYUA 2YEMA 4NR4A 3MB4A 4TT2A 4UYFA 2D9EA 2DATA 5CUBA 5ETBA 4N4IA 3ONIA 3UW9A 2RI7A 3UVXA 5D3JA 2F6NA 4YBMA 3DWYA 3P1FA 3MULA 5EQ1A 2L5EA 4UYHA 4WHUA 2L84A 5D3PA 5HQ6A 5FE0A 4NUEA 5KHMA 5FH7A 4QSVA 3GG3A 3SVFA 4PY6A 4YYGA 5A5OA 5KTWA 5COIA 5G4SA 5FE2A 4Z93A 5AD2A 4NRCA 1E6IA 5HLSA 1WUMA 4NRBA 2RNWA 4UIXA 3G0LA 4N3WA 2OO1A 1ZS5A 5E9LA 5LUUA 2DVRA 4QBMA 4CFLA 5IGLA 5II1A 4QEWA 5ACYA 5AMEA 5ENHA 5I1QA 4MR3A 5BT4A 5A5NA 3HMFA 4ALHA 5DLXA 3QZVA 3I3JA 4NXJA 5CRZA 4QSTA 5I7XA 4RVRA 4LYIA 3U5PA 2NXBA 5DY7A 4QUTA 2MJVB 5DYCA 3UVWA 5CRMA 5FG5A 3S92A 4N4GA 2DVSA 3UV2A 1JSPB 1WUGA 5EWDA 4HXKA 4QR4A 4X2IA 5H1UA 5I83A 5D3TA 5EM3A 5AD3A 5IGKA 4HXNA 4PCIA 4YAXA 4TTEA 4YY4A 5FE8A 5DYUA 5ENBA 2R0VA 3U5OA 5EA1A 4YBTA 5HFRA 4QEUA 4YYNA 5D3HA 4Q0OA 4O7FA 4WHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HM0A 4HBWA 5ENGA 5E9VA 5D3RA 5F60A 5CUGA 5F61A 4YC9A 2FSAA 5FBXA 3P1EA 4UIUA 5L97A 4C67A 4KCXA 5I40A 4HXLA 4YYDA 4QYLA 4Q0NA 3U5MA 5FE3A 5I88A 5II2A 4QC3A 3LJWA 2E3KA 5LJ0A 4QEVA 4E96A 5C87A 5A5PA 3P1DA 2LSPB 3U5KA 3O37A 2WP2A 4NR9A 2GRCA 2E7NA 3ERRA 5DKDA 5EWWA 3JVMA 5FFVA 5LVQA 3HMHA 2YDWA 2RO1A 5EPRA 3NXBA 2DKWA 5CPEA 3IU5A 2R0SA 4CUQA 3SVHA 2RFJA 4LZ2A 3G0JA 2D82A 5ENFA 4FLPA 5EISA 5CQTA 3P1CA 5LKUA 5I89A 3QZSA 4UIVA 5H1TA 4PKLA 5EWHA 2R10A 5FB0A 4BHWA 2YW5A 4Z1SA 5ENIA 5CQ8A 5EI4A 3JVJA 4GPJA 4XY8A 5I86A 3LQJA 5D26A 5I7YA 5FH8A 4HBYA 5D3SA 5DYXA 3P5OA 4QSXA 4TZ8A 5HRVA 4NR5A 3O36A 4AKGA 5CUAA 5DFCA 4QZSA 4YYMA 3UV5A 4LZRA 5DW2A 2YQDA 4NR8A 5E9IA 5ENCA 5A83A 4YBSA 5BT3A 2L85A 5AMFA 2RNXA 4N4HA 5HELA 5HFQA 4A9NA 5C89A 5HQ5A 5L8UA 4MEPA 4PTBA 5CZGA 5ETDA 3UV4A 5EPSA 5IGMA 4QYDA 3JVLA 1PUOA 4CURA 5HQ7A 4BJXA 5E74A 5EICA 5CGPA 5DBMA 3TLPA 2RS9B 5CQ7A 4AI6A 5F36A 4AKIA 4MEQA 5KO4A 4NQNA 4IOQA 4UYDA 4IOOA 5CQ4A 3U5LA 5KTUA 4HXRA 4QSQA 5D7XA 4QR3A 4A9MA 5DKHA 4BW3A 4BW4A 5EK9A 5FFWA 5JI8A 5CQ6A 4TU4A 4LYSA 5EP7A 5CS8A 5HRXA 4PS5A 5LJ1A 5KU3A 4YYJA 4ZW1A 4PCEA 5A5QA 4Y03A 4O7BA 4NYVA 4NYXA 3D1DA 4HXPA 4YYHA 4IR4A 5A81A 3O33A 4XYAA 2H60A 4AKNA 4BW2A 3RCWA 4MR4A 5DFBA 3U5JA 5F25A 4A9LA 5FFYA 5CUCA 5E0RA 2DWWA 5A5RA 5DYAA 5CQ3A 5CUEA 5A82A 4HBVA 1JM4B 3VKGA 5H1VA 5KTXA 4O70A 4MENA 4Z6IA 5FE5A 4LZSA 5E7DA 4XUBA 5IBNA 4CUSA 3Q2FA 5DLZA 5EVAA 4O7EA 4O78A 5CQAA 4O76A 4YADA 4A9JA 5EWVA 4OGIA 5FE6A 3IU6A 5CTLA 1EQFA 5DX4A 4YH4A 3LXJA 4HXOA 4WIVA 4QY4A 3U5NA 4J1PA 3LQHA 4KV1A 5CQ5A 4YATA 4J0SA 2F6JA 4IR5A 3MXFA 5FG4A 4QSRA 4QSSA 5CFWA 2EJNA 3O35A 4NYWA 2E7OA 4CLBA 5TB6A 3UVDA 5FE7A 3K2JA 3AQAA 4IR3A 5L8TA 4LDFA 5DKCA 4O77A 5I80A 4ALGA 5C4QA 3S91A 5HENA 4NQMA 3D7CA 3D1BA 2R0YA 4MEOA 4MR5A 4TZ2A 2DVQA 5EPBA 4J3IA 4HXMA 5D0CA 4Z1QA 5D24A 5ENJA 5A5SA 3DAIA 4HBXA 4LR6A 4OUFA 3FKMX 5FE1A 5E9YA 5LJ2A 5G4RA 4QR5A 4UYGA 5LVRA 5E73A 5D25A 4QB3A 4ZC9A 5HJCA 3HMEA 4A9IA 4QSUA 5E3DA 3JVKA 4A9HA 5C8GA 4OGJA 4QUUA 3O34A 5F1LA 4LC2A 5E3GA 4YY6A 5FE4A 4UIZA 1X0JA 1N72A 5A7CA 5JWMA 4O74A 5CUDA 4C66A 4CUPA 5EWCA 4TYLA 5F63A 5ENEA 5F62A 5FH6A 4YYIA 4CFKA 5K29A 5EGUA 2I8NA 4QSWA 4KV4A 4TU6A 4YYKA 5BT5A 4IR6A 5IIDA 2I7KA 4TT6A 4DONA 5HCLA 4QC1A 5FDZA 2WP1A 4A9FA 4UITA 5CP5A 4HXSA 2YYNA 4TT4A 5L99A 5C7NA 5DW1A 4F3IA 5FE9A 2YEKA 4Z6HA 3LQIA 5D3NA 4TS8A 2N9GA 4O71A 4YK0A 5D3LA 4BW1A 5IG6A 5HRWA 4UIWA 5H85A 5L96A 4O72A 5IGNA 4A9EA 5F1HA 5LKTA 2G4AA 4MR6A 4A9OA 5CU8A 5F5ZA 4NUDA 5F2PA 4NR7A 4NS5A 3MB3A 5HEMA 5DFDA 4YABA 4N4FA 4QSPA 5LKZA 5EV9A 3MQMA 4NUCA 4O7AA 1F68A 4NRAA 5I29A 3Q2EA 4XY9A 3SVGA 4J0RA 3AADA 5FB1A 5E9MA 4LRGA 4UYEA 5EU1A 5CY9A 4UIYA 5J0DA 4UYFB 2KTBB 4CL9A 4A9KA 5C85A 2DVVA 4LYWA 4NR6A 4CUTA 4CUUA 3UVYA 4QNSA 5A85A 5FG6A 5F3AA 3MUKA 2OSSA 5LKXA 2OUOA 4IORA 5L98A 4O7CA 2YELA 3QZTA 4XUAA 4ZQLA 5E9KA 5TCMA 2RNYA 4TQNA 4YH3A 4O75A 3ZYUA 2YEMA 4NR4A 3MB4A 4TT2A 4UYFA 2D9EA 2DATA 4AKHA 5CUBA 5ETBA 4N4IA 3ONIA 3UW9A 2RI7A 3UVXA 5D3JA 2F6NA 4YBMA 3DWYA 3P1FA 3MULA 5EQ1A 2L5EA 4UYHA 4WHUA 1ZKRA 2L84A 5D3PA 5HQ6A 5FE0A 4NUEA 5KHMA 5FH7A 4QSVA 3GG3A 3VKHA 3SVFA 4PY6A 4YYGA 5A5OA 5KTWA 5COIA 5G4SA 5FE2A 4Z93A 5AD2A 4NRCA 1E6IA 5HLSA 1WUMA 4NRBA 2RNWA 4UIXA 3G0LA 4N3WA 2OO1A 1ZS5A 5E9LA 5LUUA 2DVRA 4QBMA 4CFLA 5IGLA 5II1A 4QEWA 5ACYA 5AMEA 5ENHA 5I1QA 4MR3A 5BT4A 5A5NA 3HMFA 4ALHA 5DLXA 3QZVA 3I3JA 4NXJA 5CRZA 4QSTA 5I7XA 4RVRA 4LYIA 3U5PA 2NXBA 5DY7A 4QUTA 2MJVB 5DYCA 3UVWA 5CRMA 5FG5A 3S92A 4N4GA 2DVSA 3UV2A 1JSPB 1WUGA 5EWDA 4HXKA 4QR4A 4X2IA 5H1UA 5I83A 5D3TA 5EM3A 5AD3A 5IGKA 4HXNA 4PCIA 4YAXA 4TTEA 4YY4A 5FE8A 5DYUA 5ENBA 2R0VA 3U5OA 5EA1A 4YBTA 5HFRA 4QEUA 4YYNA 5D3HA 4Q0OA 4O7FA 4WHWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HM0 A;  4HBW A;  5ENG A;  5E9V A;  5D3R A;  5F60 A;  5CUG A;  5F61 A;  4YC9 A;  2FSA A;  5FBX A;  3P1E A;  4UIU A;  5L97 A;  4C67 A;  4KCX A;  5I40 A;  4HXL A;  4YYD A;  4QYL A;  4Q0N A;  3U5M A;  5FE3 A;  5I88 A;  5II2 A;  4QC3 A;  3LJW A;  2E3K A;  5LJ0 A;  4QEV A;  4E96 A;  5C87 A;  5A5P A;  3P1D A;  2LSP B;  3U5K A;  3O37 A;  2WP2 A;  4NR9 A;  2GRC A;  2E7N A;  5DKD A;  5EWW A;  3JVM A;  5FFV A;  5LVQ A;  3HMH A;  2YDW A;  2RO1 A;  5EPR A;  3NXB A;  2DKW A;  5CPE A;  3IU5 A;  2R0S A;  4CUQ A;  3SVH A;  2RFJ A;  4LZ2 A;  3G0J A;  2D82 A;  5ENF A;  4FLP A;  5EIS A;  5CQT A;  3P1C A;  5LKU A;  5I89 A;  3QZS A;  4UIV A;  5H1T A;  4PKL A;  5EWH A;  2R10 A;  5FB0 A;  4BHW A;  2YW5 A;  4Z1S A;  5ENI A;  5CQ8 A;  5EI4 A;  3JVJ A;  4GPJ A;  4XY8 A;  5I86 A;  3LQJ A;  5D26 A;  5I7Y A;  5FH8 A;  4HBY A;  5D3S A;  5DYX A;  3P5O A;  4QSX A;  4TZ8 A;  5HRV A;  4NR5 A;  3O36 A;  5CUA A;  5DFC A;  4QZS A;  4YYM A;  3UV5 A;  4LZR A;  5DW2 A;  2YQD A;  4NR8 A;  5E9I A;  5ENC A;  5A83 A;  4YBS A;  5BT3 A; 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