5FH7A

Crystal structure of the fifth bromodomain of human pb1 in complex with compound 18
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKYMTPMQQKLNEVYEAVKNYTDKRGRRLSAIFLRLPSRSELPDYYLTIKKPMDMEKIRSHMMANKYQDIDSMVEDFVMMFNNACTYNEPESLIYKDALVLHKVLLETRRDLEGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification and Development of 2,3-Dihydropyrrolo[1,2-a]quinazolin-5(1H)-one Inhibitors Targeting Bromodomains within the Switch/Sucrose Nonfermenting Complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein polybromo-1
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fh7A00
5CQTA 2RO1A 4O7FA 3UV2A 5IBNA 3S91A 5FE2A 4NR6A 4XY9A 5AD2A 5DY7A 5DBMA 4UIYA 2L5EA 5I80A 4J1PA 4YADA 3O35A 4CUTA 3HMEA 5D3TA 5CUAA 5E3GA 4YH4A 5D7XA 4A9FA 3U5JA 4A9HA 4NXJA 3UV4A 5ETDA 4YYNA 3GG3A 5J0DA 4HXLA 5EPBA 4YAXA 4UYFB 4O76A 3NXBA 5EWCA 5L96A 4PCEA 4Z1SA 5I83A 2WP2A 5FE0A 4WHWA 4UIVA 5I1QA 5IG6A 5EV9A 5ACYA 4QSWA 5HEMA 5CQ3A 5CUEA 4LZ2A 3DWYA 4QSSA 4N4HA 3S92A 2GRCA 5I29A 5LUUA 2E7NA 5CQAA 5EWHA 5CRMA 3UVWA 4CL9A 5A5OA 5AMEA 4A9NA 2G4AA 5ENGA 3U5NA 4MR4A 3SVHA 4IORA 5EICA 4X2IA 5LJ2A 4KV1A 5DFCA 4QSRA 5L97A 3IU5A 5EPRA 5FH6A 5F3AA 2N9GA 4O7EA 4QSXA 4ZW1A 4UYEA 5EK9A 4FLPA 5H1VA 4OGJA 4O78A 5F62A 4HXMA 5CUDA 5E7DA 5AMFA 4O72A 4HXOA 3U5OA 4NS5A 4QUTA 5KTWA 4QBMA 3U5PA 5KTXA 3SVFA 3UVYA 4XUAA 1WUMA 4A9OA 2KTBB 5LKUA 2YQDA 5FE4A 5ENCA 5KO4A 4BHWA 4LYIA 5G4SA 2MJVB 3TLPA 3P1DA 4NUEA 3MB4A 5A81A 4BW4A 3U5MA 4QEWA 5D3LA 4O7AA 5LKZA 5CQ5A 5C7NA 4IR5A 4AKNA 5DYCA 5A5NA 5HLSA 5I86A 5LVQA 4TT6A 5C8GA 1E6IA 5EWDA 4Z93A 5CRZA 5DYAA 4QR5A 2D82A 5ENHA 4QY4A 3Q2EA 4TT4A 5I40A 5E0RA 4QSVA 4A9IA 4YATA 4YC9A 4NYVA 3O37A 4UIUA 2R0YA 2LSPB 4LYSA 4TT2A 4ALGA 3O33A 4TU4A 5E3DA 5LKXA 2DWWA 5FB0A 5HQ6A 4OUFA 4CUQA 4YYGA 4HXPA 5DKHA 4YH3A 5D25A 2YW5A 4LYWA 5DFBA 4HBXA 4TYLA 4F3IA 5CP5A 4C66A 5DX4A 4NUDA 4MEPA 3MB3A 5IIDA 4QSQA 3MXFA 5F60A 5E9LA 3UVDA 5CS8A 5F1HA 4TU6A 5A5PA 5D0CA 5JI8A 4A9LA 5D26A 4UIZA 4YBMA 5A5RA 5D24A 5KU3A 3LJWA 4WIVA 5FE6A 4UYGA 5HJCA 4OGIA 2DVQA 4Z6IA 1ZS5A 2YYNA 5F61A 3ZYUA 5A82A 5ENEA 4UYFA 5II2A 4YYKA 4NR5A 3MUKA 4QB3A 5E9MA 3LQHA 4QSTA 5CQ6A 5K29A 4TZ8A 5D3PA 5IGNA 4HBWA 4DONA 5A7CA 4UYHA 5FG4A 5IGLA 5F36A 3P5OA 4QC1A 3U5LA 3U5KA 5A5QA 4NR9A 4O77A 4BJXA 4CFKA 4ZQLA 3P1FA 4A9KA 4MENA 5FE5A 5COIA 5LJ1A 4XY8A 4CURA 5EP7A 5EWVA 4E96A 5LVRA 5CQ8A 4CUUA 5FG5A 4TZ2A 4QNSA 5EQ1A 4YYJA 5BT3A 3JVMA 4QSUA 2E7OA 5C87A 5FH8A 2R0VA 1JSPB 2DVVA 5DFDA 5I7YA 3LQJA 5HFQA 5ENBA 4YYMA 5F25A 4J0SA 4HBVA 4YABA 4Z1QA 3UV5A 5HRVA 5IGMA 4WHUA 5HENA 5F5ZA 5CUCA 5HELA 4QYDA 5E9IA 5TCMA 1JM4B 5L98A 4J0RA 5AD3A 5EISA 4N4GA 5FB1A 2I8NA 2F6NA 3SVGA 4IR4A 4HXKA 4XUBA 4YBSA 2H60A 4HXRA 4CFLA 4PY6A 4PKLA 3JVKA 3Q2FA 5EI4A 4YK0A 5D3JA 4RVRA 2DVSA 2I7KA 3LXJA 2RNWA 4MR6A 5IGKA 5F2PA 5DW2A 5LJ0A 5DKDA 5A85A 4UIWA 5E9YA 3P1CA 4NUCA 5F63A 5ENFA 5H1UA 5I89A 3AADA 4NR8A 5KTUA 1N72A 5BT5A 2RI7A 5FE8A 5EWWA 4CUPA 5ENJA 2E3KA 4LDFA 4IOQA 5DW1A 2RFJA 2D9EA 5TB6A 5E9VA 5EGUA 5EVAA 3G0JA 5CUBA 4TS8A 4MEOA 3AQAA 4Y03A 4MEQA 2OO1A 3MULA 4NRCA 3FKMX 1EQFA 3ONIA 5C85A 4QR3A 4Q0NA 5A83A 5FDZA 4PS5A 5EU1A 4QUUA 4N4FA 4CUSA 4Z6HA 5HRWA 3QZVA 2DATA 5A5SA 5FBXA 3JVJA 5BT4A 4KV4A 5H1TA 3HMHA 5D3RA 2YDWA 4O75A 5DYUA 3O34A 4TTEA 4QEVA 4C67A 5C4QA 2R0SA 4Q0OA 2NXBA 5CPEA 5DLZA 1F68A 4NRBA 5CFWA 5HM0A 4LC2A 4KCXA 5ENIA 4J3IA 4N3WA 5C89A 3QZTA 2YEMA 5CQ7A 5G4RA 5HCLA 5CGPA 4PCIA 4A9MA 4HXSA 2RS9B 5CUGA 4NYWA 2FSAA 4QSPA 5F1LA 2L85A 2WP1A 4O70A 4PTBA 4UITA 3MQMA 4BW2A 4O7BA 4YBTA 4CLBA 3DAIA 5HRXA 3UVXA 3D7CA 4IR6A 5HFRA 5FG6A 5EPSA 5CQ4A 4A9EA 5FE7A 5FE1A 4NR4A 4O7CA 3IU6A 4HBYA 4ZC9A 5D3HA 4BW3A 5DLXA 5FFYA 4A9JA 5D3SA 4NQNA 4GPJA 5FE9A 2RNXA 5E73A 5FFVA 4O71A 2R10A 4YYIA 5CZGA 5HQ5A 3LQIA 4NRAA 5E9KA 2DKWA 4NQMA 5DKCA 1WUGA 5LKTA 2YELA 5ETBA 4YYHA 4QR4A 2L84A 5L8UA 4QYLA 4ALHA 4MR5A 5CU8A 4YY4A 4XYAA 3JVLA 5L99A 2RNYA 4UIXA 5D3NA 5II1A 3O36A 5I88A 5FH7A 4LZSA 5CTLA 3RCWA 4QZSA 4O74A 3P1EA 4LRGA 4TQNA 5FFWA 4MR3A 4UYDA 4LR6A 3I3JA 5H85A 5EA1A 2YEKA 2F6JA 4NYXA 4YY6A 3UW9A 4NR7A 5HQ7A 2OSSA 3K2JA 4LZRA 4QC3A 5DYXA 3QZSA 5E74A 5CY9A 4BW1A 5EM3A 2DVRA 4IOOA 4QEUA 5I7XA 4N4IA 3HMFA 4IR3A 5FE3A 5KHMA 3G0LA 5L8TA 2OUOA 1X0JA 4YYDA 5JWMA 4HXNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CQTA 2RO1A 4O7FA 3UV2A 5IBNA 3S91A 5FE2A 4NR6A 4XY9A 5AD2A 5DY7A 5DBMA 4UIYA 2L5EA 5I80A 4J1PA 1PUOA 4YADA 3O35A 4CUTA 3HMEA 5D3TA 5CUAA 5E3GA 4YH4A 5D7XA 4A9FA 3U5JA 4A9HA 4NXJA 3UV4A 5ETDA 4YYNA 3GG3A 5J0DA 4HXLA 5EPBA 4YAXA 4UYFB 4O76A 3NXBA 5EWCA 5L96A 4PCEA 4Z1SA 5I83A 2WP2A 5FE0A 4WHWA 4UIVA 5I1QA 5IG6A 5EV9A 5ACYA 4QSWA 5HEMA 5CQ3A 5CUEA 4LZ2A 3DWYA 4QSSA 4N4HA 3S92A 2GRCA 5I29A 5LUUA 2E7NA 5CQAA 5EWHA 5CRMA 3UVWA 4CL9A 5A5OA 5AMEA 4A9NA 2G4AA 5ENGA 3U5NA 4MR4A 3SVHA 4IORA 5EICA 4X2IA 5LJ2A 4KV1A 5DFCA 4QSRA 5L97A 3IU5A 5EPRA 5FH6A 5F3AA 2N9GA 4O7EA 4QSXA 4ZW1A 4UYEA 5EK9A 4FLPA 5H1VA 4OGJA 4O78A 5F62A 4HXMA 5CUDA 5E7DA 5AMFA 4O72A 4HXOA 3U5OA 4NS5A 4QUTA 5KTWA 4QBMA 3U5PA 5KTXA 3SVFA 3UVYA 4XUAA 1WUMA 4A9OA 2KTBB 5LKUA 2YQDA 5FE4A 5ENCA 5KO4A 4BHWA 4LYIA 5G4SA 2MJVB 3TLPA 3P1DA 4NUEA 3MB4A 5A81A 4BW4A 3U5MA 4QEWA 5D3LA 4O7AA 5LKZA 5CQ5A 5C7NA 4IR5A 4AKNA 5DYCA 5A5NA 5HLSA 5I86A 5LVQA 4TT6A 5C8GA 1E6IA 5EWDA 4Z93A 5CRZA 5DYAA 4QR5A 2D82A 4AI6A 5ENHA 4QY4A 3Q2EA 4TT4A 5I40A 5E0RA 4QSVA 4A9IA 4YATA 4YC9A 4NYVA 3O37A 4UIUA 2R0YA 2LSPB 4LYSA 4TT2A 4ALGA 3O33A 4TU4A 5E3DA 5LKXA 2DWWA 5FB0A 5HQ6A 4OUFA 4CUQA 4YYGA 4HXPA 5DKHA 4YH3A 5D25A 2YW5A 4LYWA 5DFBA 4HBXA 4TYLA 4F3IA 5CP5A 4C66A 5DX4A 4NUDA 4MEPA 3MB3A 5IIDA 4QSQA 3MXFA 5F60A 5E9LA 3UVDA 5CS8A 5F1HA 4TU6A 5A5PA 5D0CA 5JI8A 4A9LA 5D26A 4UIZA 4YBMA 5A5RA 5D24A 5KU3A 3LJWA 4WIVA 5FE6A 4UYGA 5HJCA 4OGIA 2DVQA 4Z6IA 1ZS5A 2YYNA 5F61A 3ZYUA 5A82A 5ENEA 4UYFA 5II2A 4YYKA 4NR5A 3MUKA 4QB3A 5E9MA 4AKHA 3LQHA 4QSTA 5CQ6A 5K29A 4TZ8A 5D3PA 5IGNA 4HBWA 4DONA 5A7CA 4UYHA 5FG4A 5IGLA 5F36A 3P5OA 4QC1A 3U5LA 3U5KA 5A5QA 4NR9A 4O77A 4BJXA 4CFKA 4AKIA 4ZQLA 3P1FA 4A9KA 4MENA 5FE5A 5COIA 4AKGA 5LJ1A 4XY8A 4CURA 5EP7A 5EWVA 4E96A 5LVRA 5CQ8A 4CUUA 5FG5A 4TZ2A 4QNSA 5EQ1A 4YYJA 5BT3A 3JVMA 4QSUA 2E7OA 5C87A 5FH8A 2R0VA 1JSPB 2DVVA 5DFDA 5I7YA 3LQJA 5HFQA 5ENBA 4YYMA 5F25A 4J0SA 4HBVA 4YABA 4Z1QA 3UV5A 5HRVA 5IGMA 4WHUA 5HENA 5F5ZA 5CUCA 5HELA 4QYDA 5E9IA 5TCMA 1JM4B 5L98A 4J0RA 5AD3A 5EISA 4N4GA 5FB1A 2I8NA 2F6NA 3SVGA 4IR4A 4HXKA 4XUBA 4YBSA 2H60A 4HXRA 4CFLA 4PY6A 4PKLA 3JVKA 3Q2FA 5EI4A 4YK0A 5D3JA 4RVRA 2DVSA 2I7KA 3LXJA 2RNWA 4MR6A 5IGKA 5F2PA 5DW2A 5LJ0A 5DKDA 5A85A 4UIWA 5E9YA 3P1CA 4NUCA 5F63A 5ENFA 5H1UA 5I89A 3AADA 4NR8A 5KTUA 1N72A 5BT5A 2RI7A 5FE8A 5EWWA 4CUPA 5ENJA 2E3KA 4LDFA 4IOQA 5DW1A 2RFJA 2D9EA 5TB6A 5E9VA 5EGUA 5EVAA 3G0JA 5CUBA 4TS8A 4MEOA 3AQAA 4Y03A 4MEQA 2OO1A 3MULA 4NRCA 3FKMX 1EQFA 3ONIA 5C85A 4QR3A 4Q0NA 3ERRA 5A83A 5FDZA 4PS5A 5EU1A 4QUUA 4N4FA 4CUSA 4Z6HA 5HRWA 3D1BA 3QZVA 2DATA 5A5SA 5FBXA 3JVJA 5BT4A 4KV4A 5H1TA 3HMHA 5D3RA 2YDWA 4O75A 5DYUA 3O34A 4TTEA 4QEVA 4C67A 5C4QA 2R0SA 4Q0OA 2NXBA 5CPEA 5DLZA 1F68A 4NRBA 5CFWA 5HM0A 4LC2A 4KCXA 5ENIA 4J3IA 4N3WA 5C89A 3QZTA 2YEMA 5CQ7A 5G4RA 5HCLA 5CGPA 4PCIA 3D1DA 4A9MA 4HXSA 2RS9B 5CUGA 4NYWA 2FSAA 4QSPA 5F1LA 2L85A 2WP1A 4O70A 4PTBA 4UITA 3MQMA 4BW2A 4O7BA 4YBTA 4CLBA 3DAIA 5HRXA 3UVXA 3VKHA 3D7CA 4IR6A 5HFRA 5FG6A 5EPSA 5CQ4A 4A9EA 5FE7A 5FE1A 4NR4A 4O7CA 3IU6A 4HBYA 4ZC9A 5D3HA 4BW3A 5DLXA 5FFYA 4A9JA 5D3SA 4NQNA 4GPJA 5FE9A 2RNXA 5E73A 5FFVA 4O71A 2R10A 2EJNA 4YYIA 5CZGA 5HQ5A 3LQIA 4NRAA 5E9KA 2DKWA 4NQMA 5DKCA 1WUGA 5LKTA 2YELA 5ETBA 4YYHA 4QR4A 2L84A 5L8UA 3VKGA 4QYLA 4ALHA 4MR5A 5CU8A 4YY4A 4XYAA 3JVLA 5L99A 2RNYA 4UIXA 5D3NA 5II1A 3O36A 5I88A 5FH7A 4LZSA 5CTLA 3RCWA 4QZSA 4O74A 3P1EA 4LRGA 4TQNA 5FFWA 4MR3A 4UYDA 4LR6A 3I3JA 5H85A 5EA1A 2YEKA 2F6JA 4NYXA 4YY6A 3UW9A 4NR7A 5HQ7A 2OSSA 3K2JA 4LZRA 4QC3A 5DYXA 3QZSA 5E74A 5CY9A 4BW1A 5EM3A 2DVRA 4IOOA 1ZKRA 4QEUA 5I7XA 4N4IA 3HMFA 4IR3A 5FE3A 5KHMA 3G0LA 5L8TA 2OUOA 1X0JA 4YYDA 5JWMA 4HXNA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5CQT A;  2RO1 A;  4O7F A;  3UV2 A;  5IBN A;  3S91 A;  5FE2 A;  4NR6 A;  4XY9 A;  5AD2 A;  5DY7 A;  5DBM A;  4UIY A;  2L5E A;  5I80 A;  4J1P A;  4YAD A;  3O35 A;  4CUT A;  3HME A;  5D3T A;  5CUA A;  5E3G A;  4YH4 A;  5D7X A;  4A9F A;  3U5J A;  4A9H A;  4NXJ A;  3UV4 A;  5ETD A;  4YYN A;  3GG3 A;  5J0D A;  4HXL A;  5EPB A;  4YAX A;  4UYF B;  4O76 A;  3NXB A;  5EWC A;  5L96 A;  4PCE A;  4Z1S A;  5I83 A;  2WP2 A;  5FE0 A;  4WHW A;  4UIV A;  5I1Q A;  5IG6 A;  5EV9 A;  5ACY A;  4QSW A;  5HEM A;  5CQ3 A;  5CUE A;  4LZ2 A;  3DWY A;  4QSS A;  4N4H A;  3S92 A;  2GRC A;  5I29 A;  5LUU A;  2E7N A;  5CQA A;  5EWH A;  5CRM A;  3UVW A;  4CL9 A;  5A5O A;  5AME A;  4A9N A;  2G4A A;  5ENG A;  3U5N A;  4MR4 A;  3SVH A;  4IOR A;  5EIC A;  4X2I A;  5LJ2 A;  4KV1 A;  5DFC A;  4QSR A;  5L97 A;  3IU5 A;  5EPR A;  5FH6 A;  5F3A A;  2N9G A;  4O7E A;  4QSX A;  4ZW1 A;  4UYE A;  5EK9 A;  4FLP A;  5H1V A;  4OGJ A;  4O78 A;  5F62 A;  4HXM A;  5CUD A;  5E7D A;  5AMF A;  4O72 A;  4HXO A;  3U5O A;  4NS5 A;  4QUT A;  5KTW A; 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