5HELA

Crystal structure of the n-terminus y153h bromodomain mutant of human brd2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
119
structure length
119
Chain Sequence
SMKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCHIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the N-terminus Y153H bromodomain mutant of human BRD2
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
total genus 39
structure length 119
sequence length 119
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5helA00
4OUFA 5DLXA 5H85A 5F25A 5IIDA 4YH3A 4UITA 5D3TA 5EK9A 2NXBA 4BW2A 4A9LA 3P1FA 5II2A 4UYGA 2DVVA 4LYWA 4PCIA 5H1UA 1F68A 4IR6A 4ALHA 5A83A 5I86A 5CTLA 5LVQA 4TZ8A 5DYUA 3QZTA 2E3KA 5F60A 5FDZA 5E0RA 4BJXA 3P1EA 4YYKA 3AQAA 4PY6A 4A9HA 5E9LA 5A5QA 5HRXA 4UIWA 4GPJA 5A5PA 4NXJA 4PKLA 3LQIA 5FE4A 5FFVA 4HXOA 4YBTA 2R0SA 4O77A 5AMEA 3SVGA 2DVRA 1JM4B 3U5OA 5ENBA 5H1VA 4MEPA 5LKZA 4QSQA 5C87A 3AADA 4CUSA 3LXJA 4NR8A 3HMEA 3P5OA 2R10A 1E6IA 3MB4A 3UVDA 5E73A 4NRAA 5I89A 3UVWA 3I3JA 5CS8A 4UYDA 2RO1A 4CURA 5D3PA 4UYHA 2YQDA 4YH4A 1EQFA 4PCEA 5EPSA 5ENHA 2RI7A 4CUUA 5TCMA 5FE0A 2R0YA 2N9GA 5BT3A 5F61A 2L5EA 5CQAA 5AD2A 5HLSA 5D7XA 5LJ1A 4NR4A 5FH6A 4QEUA 4OGJA 4UIYA 5CP5A 2E7NA 3U5PA 4QSRA 4QZSA 2F6JA 5HCLA 5A5SA 2YELA 3Q2EA 5A5RA 5A82A 3UVXA 4A9FA 4YYIA 5BT4A 5L8UA 2I8NA 4E96A 4Q0NA 4QSPA 5HRVA 4F3IA 5A5NA 3O35A 3O36A 4A9OA 5E9KA 5ENEA 4TU4A 4QSTA 5E74A 5HFQA 4Y03A 4LRGA 2DWWA 2H60A 5JWMA 3TLPA 5FE2A 5FE5A 5E9IA 5JI8A 4A9KA 2L84A 3MQMA 2DATA 2L85A 4YC9A 4HBXA 4C66A 5ACYA 5L97A 5KU3A 4WHWA 5G4SA 4CUPA 5CQ3A 2DVSA 2D9EA 4WIVA 3DWYA 5CUEA 4O7FA 5F3AA 5D24A 4A9NA 3O37A 4NYVA 5CGPA 5KHMA 5FFWA 5C85A 5DKDA 4N4GA 5LKXA 5F1HA 4CL9A 3U5JA 4O78A 5F2PA 4NRBA 3HMHA 5FH7A 5TB6A 3IU5A 4UYFB 5F1LA 3UVYA 5D3SA 2WP1A 5DY7A 4MR6A 5CUDA 5CFWA 4O72A 4UYFA 5HQ6A 4YYNA 5KTXA 5IGNA 5CQ5A 3LQJA 3P1CA 3UV5A 3UV4A 3UV2A 4X2IA 5E3GA 4KCXA 5FBXA 5ENIA 4N3WA 5DFDA 4LDFA 3MB3A 4BHWA 5I7XA 4HBWA 5DFBA 5I1QA 5LJ0A 4J0RA 2E7OA 5IGLA 4TYLA 5LJ2A 5FE1A 4XYAA 4RVRA 3U5MA 2YYNA 4IOOA 4ZW1A 4ALGA 2R0VA 3LJWA 4BW1A 5CQTA 5EISA 5ENJA 4KV4A 5CRZA 4IORA 2D82A 4N4IA 5D0CA 4O74A 3SVFA 1N72A 3LQHA 5FG4A 4O75A 4HXRA 5FE8A 4O76A 4ZC9A 5COIA 2YEKA 4YK0A 5A85A 5AMFA 5C7NA 4TU6A 3O33A 4QSWA 2DVQA 1X0JA 4QR5A 5A81A 5CU8A 5E3DA 4QR4A 5F36A 4HXLA 4CFLA 5EPBA 5HQ5A 4Q0OA 5FG5A 4QSVA 2OUOA 4LZRA 3Q2FA 5A5OA 5ETDA 5HFRA 4Z93A 5LKTA 4TT6A 5E9VA 4UIZA 3GG3A 4NUCA 5ENGA 5FG6A 4A9IA 4UYEA 4IOQA 5D3RA 5KTWA 2LSPB 4NQNA 4NYXA 5CY9A 2FSAA 4UIXA 5DYAA 5EM3A 2DKWA 5C8GA 3ONIA 4YBSA 4CFKA 2I7KA 4O7EA 5E9YA 4A9JA 3P1DA 4DONA 3HMFA 4NRCA 5CPEA 4XUBA 3G0LA 5L8TA 2RS9B 4N4HA 5FH8A 4O71A 5D3LA 4QYDA 5EWDA 5KTUA 5EWVA 4YYJA 3MXFA 5I88A 4TT2A 5CQ8A 4QEVA 4QNSA 5J0DA 4YYDA 5II1A 4NQMA 5E9MA 5F63A 4HXSA 5DW1A 4KV1A 5H1TA 4PS5A 2RNYA 5EWHA 5KO4A 5I7YA 4BW4A 5HELA 3FKMX 4IR5A 4TQNA 4O7BA 4NR5A 3D7CA 4YYGA 4C67A 5DW2A 5F5ZA 4HBVA 4NR9A 4QSXA 5CUAA 5DKHA 4XY8A 4TZ2A 5ENCA 5EGUA 4QR3A 4YBMA 4J3IA 2WP2A 4YY4A 5CQ6A 4LYSA 4HXNA 4O7AA 4TTEA 5HM0A 4NUEA 5I83A 3JVJA 4O70A 5CUBA 4BW3A 4CLBA 5I40A 2OSSA 4IR3A 4MEQA 3JVLA 2F6NA 4IR4A 1ZS5A 5LKUA 1JSPB 4FLPA 4MR4A 5CRMA 4QEWA 2G4AA 5FFYA 5HJCA 4QB3A 4YYHA 5HEMA 5EA1A 5LVRA 4QUTA 4WHUA 4CUTA 5FB1A 4MR3A 5FE6A 4LZSA 4QYLA 5EQ1A 5DKCA 2RFJA 4PTBA 5F62A 5CQ7A 3U5KA 5ENFA 5L99A 5EU1A 4YYMA 5DBMA 5EICA 5HENA 4Z1QA 5DFCA 5EVAA 4YADA 5AD3A 4ZQLA 3MULA 3U5LA 1WUGA 5DYXA 5DLZA 5C89A 4NS5A 5FB0A 5IGMA 5I80A 4AKNA 5EV9A 3S91A 4Z6IA 4NR6A 5FE7A 5CUGA 4LR6A 5L96A 5EPRA 4Z1SA 4YATA 3UW9A 5DYCA 4OGIA 5IBNA 3G0JA 5FE3A 5G4RA 3MUKA 3RCWA 3IU6A 4QUUA 4QY4A 3NXBA 4YAXA 3DAIA 3JVKA 4QBMA 5EWCA 4HXMA 4QSUA 4HBYA 3U5NA 5EI4A 2YDWA 4LC2A 5EWWA 3O34A 4NUDA 3S92A 5K29A 3JVMA 4XY9A 2YEMA 5HRWA 5ETBA 4HXPA 5D25A 5CQ4A 5D3NA 5A7CA 5LUUA 3SVHA 4Z6HA 4LYIA 4QSSA 4NR7A 4LZ2A 2MJVB 3K2JA 4NYWA 4TT4A 4QC3A 5D3HA 5FE9A 3QZVA 5IGKA 4MENA 4J1PA 4TS8A 4CUQA 4UIUA 2YW5A 5C4QA 5CZGA 5I29A 1WUMA 4QC1A 5HQ7A 4A9EA 5D3JA 3QZSA 4A9MA 4MEOA 4UIVA 3ZYUA 5CUCA 4YABA 2KTBB 5E7DA 5DX4A 2RNWA 5L98A 5D26A 2RNXA 4MR5A 4XUAA 4O7CA 4YY6A 5IG6A 4J0SA 2OO1A 4N4FA 4HXKA 2GRCA 5BT5A 5EP7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OUFA 5DLXA 5H85A 5F25A 5IIDA 4YH3A 4UITA 5D3TA 5EK9A 2NXBA 4BW2A 4A9LA 3P1FA 5II2A 4UYGA 2DVVA 4LYWA 4PCIA 5H1UA 1F68A 4IR6A 4ALHA 5A83A 5I86A 5CTLA 5LVQA 4TZ8A 5DYUA 1PUOA 3QZTA 2E3KA 5F60A 5FDZA 5E0RA 4BJXA 3P1EA 4YYKA 3AQAA 4PY6A 4A9HA 5E9LA 5A5QA 5HRXA 4UIWA 4GPJA 4AI6A 5A5PA 4NXJA 4PKLA 3LQIA 5FE4A 5FFVA 4HXOA 4YBTA 2R0SA 4O77A 5AMEA 3SVGA 2DVRA 1JM4B 3U5OA 5ENBA 5H1VA 4MEPA 5LKZA 4QSQA 5C87A 3AADA 4CUSA 3LXJA 4NR8A 3HMEA 3P5OA 2R10A 1E6IA 3MB4A 3UVDA 5E73A 4NRAA 5I89A 3UVWA 3I3JA 5CS8A 4UYDA 2RO1A 4CURA 5D3PA 4UYHA 2YQDA 4YH4A 1EQFA 4PCEA 5EPSA 5ENHA 2RI7A 4CUUA 1ZKRA 5TCMA 5FE0A 2R0YA 2N9GA 5BT3A 5F61A 2L5EA 5CQAA 5AD2A 5HLSA 5D7XA 5LJ1A 4NR4A 5FH6A 4QEUA 4OGJA 4UIYA 5CP5A 2E7NA 3U5PA 4QSRA 4QZSA 2F6JA 5HCLA 5A5SA 2YELA 3Q2EA 5A5RA 5A82A 3UVXA 4A9FA 4YYIA 5BT4A 5L8UA 2I8NA 4E96A 4Q0NA 4QSPA 5HRVA 4F3IA 5A5NA 3O35A 3O36A 4A9OA 5E9KA 5ENEA 4TU4A 4QSTA 5E74A 5HFQA 4Y03A 4LRGA 2DWWA 2H60A 5JWMA 3TLPA 5FE2A 5FE5A 5E9IA 5JI8A 4A9KA 2L84A 3MQMA 2DATA 2L85A 4YC9A 4HBXA 4C66A 5ACYA 5L97A 5KU3A 3D1BA 4WHWA 5G4SA 4CUPA 5CQ3A 2DVSA 2D9EA 4WIVA 3DWYA 5CUEA 4O7FA 5F3AA 5D24A 4A9NA 3O37A 4NYVA 5CGPA 5KHMA 5FFWA 5C85A 5DKDA 4N4GA 5LKXA 5F1HA 4CL9A 3U5JA 4O78A 5F2PA 4NRBA 3HMHA 5FH7A 5TB6A 3IU5A 3VKHA 4UYFB 5F1LA 3UVYA 5D3SA 2WP1A 5DY7A 3ERRA 4MR6A 5CUDA 5CFWA 4O72A 4UYFA 5HQ6A 4YYNA 5KTXA 5IGNA 5CQ5A 3LQJA 3P1CA 3UV5A 3UV4A 3UV2A 4X2IA 2EJNA 5E3GA 4KCXA 5FBXA 5ENIA 4N3WA 5DFDA 4LDFA 3D1DA 3MB3A 4BHWA 5I7XA 4HBWA 5DFBA 5I1QA 5LJ0A 4J0RA 2E7OA 5IGLA 4TYLA 5LJ2A 5FE1A 4XYAA 4RVRA 3U5MA 2YYNA 4IOOA 4ZW1A 4ALGA 2R0VA 3LJWA 4BW1A 5CQTA 5EISA 5ENJA 4KV4A 5CRZA 4IORA 2D82A 4N4IA 5D0CA 4O74A 3SVFA 1N72A 3LQHA 5FG4A 4O75A 4HXRA 5FE8A 4O76A 4ZC9A 5COIA 2YEKA 4YK0A 5A85A 5AMFA 5C7NA 4TU6A 3O33A 4QSWA 2DVQA 1X0JA 4QR5A 5A81A 5CU8A 5E3DA 4QR4A 5F36A 4HXLA 4CFLA 5EPBA 5HQ5A 4Q0OA 5FG5A 4QSVA 2OUOA 4LZRA 3Q2FA 5A5OA 5ETDA 5HFRA 4Z93A 5LKTA 4TT6A 5E9VA 4UIZA 3GG3A 4NUCA 5ENGA 5FG6A 4A9IA 4UYEA 4IOQA 5D3RA 5KTWA 2LSPB 4NQNA 4NYXA 5CY9A 2FSAA 4UIXA 5DYAA 5EM3A 2DKWA 5C8GA 3ONIA 4YBSA 4CFKA 2I7KA 4O7EA 5E9YA 4A9JA 3P1DA 4DONA 3HMFA 4NRCA 5CPEA 4XUBA 3G0LA 5L8TA 2RS9B 4N4HA 5FH8A 4O71A 5D3LA 4QYDA 5EWDA 5KTUA 5EWVA 4YYJA 3MXFA 5I88A 4TT2A 5CQ8A 4QEVA 4QNSA 5J0DA 4YYDA 5II1A 4NQMA 5E9MA 3VKGA 5F63A 4HXSA 5DW1A 4KV1A 5H1TA 4PS5A 2RNYA 5EWHA 5KO4A 5I7YA 4BW4A 5HELA 3FKMX 4IR5A 4TQNA 4O7BA 4NR5A 3D7CA 4YYGA 4C67A 5DW2A 5F5ZA 4HBVA 4NR9A 4AKIA 4QSXA 5CUAA 5DKHA 4XY8A 4TZ2A 5ENCA 5EGUA 4QR3A 4YBMA 4J3IA 2WP2A 4YY4A 5CQ6A 4AKGA 4LYSA 4HXNA 4O7AA 4TTEA 5HM0A 4NUEA 5I83A 3JVJA 4O70A 5CUBA 4BW3A 4CLBA 5I40A 2OSSA 4IR3A 4MEQA 3JVLA 2F6NA 4IR4A 1ZS5A 5LKUA 1JSPB 4FLPA 4MR4A 5CRMA 4QEWA 2G4AA 5FFYA 5HJCA 4QB3A 4YYHA 5HEMA 5EA1A 5LVRA 4QUTA 4WHUA 4CUTA 5FB1A 4MR3A 5FE6A 4LZSA 4QYLA 5EQ1A 5DKCA 2RFJA 4PTBA 5F62A 4AKHA 5CQ7A 3U5KA 5ENFA 5L99A 5EU1A 4YYMA 5DBMA 5EICA 5HENA 4Z1QA 5DFCA 5EVAA 4YADA 5AD3A 4ZQLA 3MULA 3U5LA 1WUGA 5DYXA 5DLZA 5C89A 4NS5A 5FB0A 5IGMA 5I80A 4AKNA 5EV9A 3S91A 4Z6IA 4NR6A 5FE7A 5CUGA 4LR6A 5L96A 5EPRA 4Z1SA 4YATA 3UW9A 5DYCA 4OGIA 5IBNA 3G0JA 5FE3A 5G4RA 3MUKA 3RCWA 3IU6A 4QUUA 4QY4A 3NXBA 4YAXA 3DAIA 3JVKA 4QBMA 5EWCA 4HXMA 4QSUA 4HBYA 3U5NA 5EI4A 2YDWA 4LC2A 5EWWA 3O34A 4NUDA 3S92A 5K29A 3JVMA 4XY9A 2YEMA 5HRWA 5ETBA 4HXPA 5D25A 5CQ4A 5D3NA 5A7CA 5LUUA 3SVHA 4Z6HA 4LYIA 4QSSA 4NR7A 4LZ2A 2MJVB 3K2JA 4NYWA 4TT4A 4QC3A 5D3HA 5FE9A 3QZVA 5IGKA 4MENA 4J1PA 4TS8A 4CUQA 4UIUA 2YW5A 5C4QA 5CZGA 5I29A 1WUMA 4QC1A 5HQ7A 4A9EA 5D3JA 3QZSA 4A9MA 4MEOA 4UIVA 3ZYUA 5CUCA 4YABA 2KTBB 5E7DA 5DX4A 2RNWA 5L98A 5D26A 2RNXA 4MR5A 4XUAA 4O7CA 4YY6A 5IG6A 4J0SA 2OO1A 4N4FA 4HXKA 2GRCA 5BT5A 5EP7A
chains in the Genus database with same CATH topology
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