5HJCA

Brd3 second bromodomain in complex with histone h3 acetylation at k18
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
KLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPPDHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular Coupling of Histone Crotonylation and Active Transcription by AF9 YEATS Domain
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein/peptide
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain-containing protein 3
total genus 41
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5hjcA00
5FE5A 4NR8A 5AMFA 3JVMA 4A9LA 3UVYA 3AADA 4MR5A 4Q0OA 5CFWA 3G0JA 5HEMA 4PKLA 3QZTA 5ENBA 5H1TA 3P1CA 5IG6A 4MEOA 5FE3A 4YH4A 2RS9B 5FG6A 4DONA 4LC2A 5DW1A 4QEWA 1E6IA 3UV4A 2DWWA 4HXNA 5DKDA 4UIZA 4NRBA 5FE6A 4MR6A 1ZS5A 5FFYA 4BJXA 4IORA 5DYCA 2OO1A 2RNXA 5CQ6A 4XY8A 5A85A 3NXBA 2YW5A 5TCMA 5DBMA 4IR6A 4J0SA 2YELA 4LR6A 5DYXA 4PS5A 4O7FA 2R0YA 2E3KA 2L84A 5D0CA 4YABA 5DKHA 3MUKA 5EWWA 5C87A 5A82A 4TU6A 4Z1QA 4UYGA 3S91A 4A9OA 5F60A 4ZC9A 4BW3A 4PCIA 4QSUA 5E9VA 3IU5A 4UITA 4X2IA 4N4FA 1F68A 4YYHA 5FE7A 5A5NA 3UV2A 2I8NA 3JVLA 1WUGA 3U5JA 4CUTA 3FKMX 4A9FA 5F36A 4C66A 5E9YA 4IR4A 4O7AA 3P5OA 5I29A 2N9GA 5ENJA 5FE9A 5CUBA 4N4HA 5ETBA 4IR3A 4O7BA 4HBYA 4YC9A 5DKCA 4QNSA 4CUUA 5HFQA 2L5EA 2DVQA 5CUDA 4HBWA 4ZQLA 5DYUA 5L99A 4PY6A 4YYMA 5LKZA 3MULA 5F1LA 5CY9A 5HRXA 5H1UA 4XUAA 3O37A 5ACYA 3UVDA 5F61A 4YADA 5FE4A 5A5OA 5F2PA 4QC1A 5I7XA 2H60A 4N4IA 4XUBA 4TT2A 5CQ8A 5I88A 3LQJA 5EPSA 4QR5A 4TZ8A 3AQAA 5KTXA 3LQIA 4LYIA 4YATA 1WUMA 5JI8A 4ALGA 5I7YA 5CUGA 4OGJA 4QUUA 5CUEA 2L85A 3SVHA 4HXKA 3Q2FA 4LYSA 5EU1A 4NR5A 4TT6A 4MENA 3QZVA 4YAXA 3SVGA 5EICA 3JVJA 4WHWA 4PCEA 3UVWA 4O77A 2G4AA 5C85A 5E9KA 5DYAA 5FG5A 3K2JA 5FFVA 4UYFB 4IR5A 4MR4A 4QZSA 3O34A 4YYJA 5C8GA 5E3DA 3MXFA 4O71A 4YYDA 4Y03A 5EP7A 3I3JA 5COIA 2RFJA 4WHUA 5FE2A 5DFDA 5G4SA 2NXBA 5D25A 4YYKA 4QYLA 3UW9A 4ZW1A 4NXJA 5A81A 4QSPA 4QSXA 4TU4A 4J0RA 4NR7A 5CQTA 4QY4A 2WP1A 4BW4A 3S92A 5D26A 4YYIA 4RVRA 4CFLA 4GPJA 5KU3A 2RNWA 4LRGA 5A5RA 5D7XA 5H85A 5FFWA 5LJ0A 5E74A 5ENIA 4NR4A 4NUDA 4QR4A 5KO4A 5K29A 5EI4A 4QSSA 5IIDA 4NRAA 3Q2EA 4NS5A 4UYEA 5I40A 5ENFA 4CLBA 4J1PA 4NR9A 5FE0A 4NQNA 4LZRA 5HCLA 5EA1A 3IU6A 2YYNA 4QYDA 3ZYUA 5D3NA 4NYWA 5E9LA 5AD2A 3LQHA 4KCXA 5EGUA 5TB6A 5A83A 4NYVA 3U5NA 3U5KA 3UVXA 5J0DA 5CQ7A 5DFCA 5KHMA 4O7CA 5DLXA 5EVAA 5FH7A 5D24A 5A7CA 5BT4A 5D3PA 2R0VA 3QZSA 4TZ2A 5EQ1A 4A9KA 2KTBB 4O70A 5II1A 5ENGA 5DW2A 4Z93A 3JVKA 3LXJA 5CQAA 2D9EA 4YY6A 5CGPA 5DY7A 4QSWA 4MEQA 5D3LA 4XY9A 4NYXA 2OSSA 2F6JA 2OUOA 5DFBA 3U5LA 2YDWA 4TS8A 5JWMA 5EM3A 5BT3A 5E0RA 4LZSA 4NR6A 5E3GA 4KV4A 2MJVB 5FG4A 4Q0NA 3MB3A 4BHWA 1EQFA 2DVRA 4PTBA 5HQ6A 4IOOA 5L97A 4BW2A 2GRCA 4HXOA 3P1FA 5ETDA 5HFRA 5II2A 5HQ7A 5FH8A 5KTUA 4YH3A 5CQ3A 4UIYA 5D3HA 5EWHA 5D3TA 4QUTA 4UYHA 4HXRA 4QEUA 4YK0A 5DX4A 5HELA 5C4QA 4TQNA 2DVSA 3ONIA 3DWYA 2FSAA 4QSQA 3HMFA 3O36A 4MEPA 4TYLA 5AD3A 4UIWA 1X0JA 4AKNA 4QSRA 5F25A 4TTEA 5AMEA 4A9MA 2DATA 5FE8A 4NUCA 5EPRA 5FB1A 3P1EA 3MQMA 3HMHA 2R10A 5FE1A 4NRCA 5FH6A 4CUSA 1N72A 3LJWA 5HRVA 4QEVA 4UYDA 3UV5A 4YY4A 5EISA 5A5PA 5F63A 4ALHA 4WIVA 5G4RA 4N3WA 3DAIA 2WP2A 2DKWA 4HXSA 2LSPB 5I89A 2E7NA 5HRWA 5I1QA 2R0SA 4LZ2A 2YEKA 4YBSA 4O76A 5BT5A 5L96A 5CU8A 5IGKA 5EWDA 5D3JA 4UIVA 5IGMA 4BW1A 2F6NA 4A9IA 5LJ1A 3P1DA 5E7DA 5LKTA 4KV1A 4MR3A 5EWVA 5KTWA 4O78A 5HJCA 5F3AA 4UYFA 5ENEA 4HBXA 5C7NA 5CP5A 4UIUA 5FBXA 5L8UA 4CURA 4O74A 5LUUA 5D3SA 2E7OA 2RO1A 5ENCA 4IOQA 5CS8A 1JSPB 3TLPA 4A9EA 5EK9A 4CUQA 3O33A 5CRZA 3RCWA 5I80A 5E9MA 4Z6HA 5CZGA 5L98A 2YQDA 4QR3A 5IGNA 3MB4A 3U5MA 4C67A 2RNYA 5I86A 5HM0A 5HLSA 5H1VA 2RI7A 5CTLA 3SVFA 5EWCA 4A9HA 4OUFA 4QB3A 5L8TA 5FB0A 4HXPA 5CRMA 5F5ZA 4QC3A 5CPEA 5HQ5A 5EV9A 5CUAA 4A9NA 5LVRA 5LKUA 4NQMA 5I83A 4HXLA 4YYGA 3HMEA 3D7CA 4O72A 5LKXA 4NUEA 5FDZA 4QBMA 4TT4A 5IGLA 4YBMA 5F1HA 5LVQA 4LDFA 4HXMA 4QSTA 3U5OA 4YBTA 4Z1SA 5DLZA 5CUCA 4OGIA 4CL9A 4N4GA 1JM4B 4F3IA 4A9JA 4J3IA 4HBVA 5HENA 5IBNA 5C89A 2DVVA 4CUPA 4Z6IA 5LJ2A 3O35A 5A5SA 5EPBA 4UIXA 5CQ4A 5F62A 4XYAA 3GG3A 4FLPA 5E9IA 4LYWA 3G0LA 4O7EA 2I7KA 5E73A 2D82A 4CFKA 4O75A 5ENHA 4YYNA 4E96A 5A5QA 5D3RA 5CQ5A 3U5PA 2YEMA 4QSVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FE5A 4NR8A 5AMFA 3JVMA 4A9LA 3UVYA 3AADA 4MR5A 4Q0OA 5CFWA 3G0JA 5HEMA 4PKLA 3QZTA 5ENBA 5H1TA 3P1CA 5IG6A 4MEOA 5FE3A 4YH4A 2RS9B 5FG6A 4DONA 4LC2A 5DW1A 4QEWA 1E6IA 3UV4A 2DWWA 4HXNA 5DKDA 4UIZA 4NRBA 5FE6A 4MR6A 1ZS5A 5FFYA 4BJXA 4IORA 5DYCA 2OO1A 2RNXA 5CQ6A 4XY8A 5A85A 3NXBA 2YW5A 5TCMA 5DBMA 4IR6A 4J0SA 2YELA 2EJNA 4LR6A 4PS5A 5DYXA 4O7FA 2R0YA 2E3KA 2L84A 5D0CA 4YABA 5DKHA 3MUKA 5EWWA 5C87A 5A82A 4TU6A 4Z1QA 4UYGA 3S91A 4A9OA 5F60A 4ZC9A 4BW3A 4PCIA 4QSUA 5E9VA 3IU5A 4UITA 4X2IA 4N4FA 1F68A 4YYHA 5FE7A 5A5NA 3UV2A 2I8NA 3JVLA 1WUGA 3U5JA 4CUTA 3FKMX 4A9FA 5F36A 4C66A 5E9YA 4IR4A 4O7AA 3P5OA 5I29A 2N9GA 5ENJA 5FE9A 5CUBA 4N4HA 5ETBA 4IR3A 4O7BA 4HBYA 4YC9A 5DKCA 4QNSA 4CUUA 5HFQA 2L5EA 2DVQA 5CUDA 4HBWA 4ZQLA 5DYUA 5L99A 4PY6A 4YYMA 5LKZA 3MULA 5F1LA 5CY9A 5HRXA 5H1UA 4XUAA 3O37A 5ACYA 3UVDA 5F61A 4YADA 5FE4A 5A5OA 5F2PA 4QC1A 5I7XA 2H60A 4N4IA 4XUBA 4TT2A 5CQ8A 5I88A 3LQJA 5EPSA 4QR5A 4TZ8A 3AQAA 5KTXA 3LQIA 4LYIA 4YATA 1WUMA 5JI8A 3D1BA 4ALGA 5I7YA 5CUGA 4OGJA 4QUUA 5CUEA 2L85A 3SVHA 4HXKA 3Q2FA 4LYSA 5EU1A 4NR5A 4TT6A 4MENA 3QZVA 4YAXA 3SVGA 5EICA 3JVJA 4WHWA 4PCEA 3UVWA 4O77A 2G4AA 5C85A 5E9KA 5DYAA 5FG5A 3K2JA 5FFVA 4UYFB 4AI6A 3D1DA 4IR5A 4MR4A 4QZSA 3O34A 4YYJA 5C8GA 1ZKRA 5E3DA 3MXFA 4O71A 4YYDA 4Y03A 5EP7A 3I3JA 5COIA 2RFJA 4WHUA 5FE2A 5DFDA 5G4SA 2NXBA 5D25A 4YYKA 4QYLA 3UW9A 4ZW1A 4NXJA 5A81A 4QSPA 4QSXA 4TU4A 4J0RA 4NR7A 5CQTA 4QY4A 2WP1A 4BW4A 3S92A 5D26A 4YYIA 4RVRA 4CFLA 4GPJA 5KU3A 2RNWA 4LRGA 5A5RA 5D7XA 5H85A 5FFWA 5LJ0A 5E74A 5ENIA 4NR4A 4NUDA 4QR4A 5KO4A 5K29A 5EI4A 4QSSA 5IIDA 4NRAA 3Q2EA 4NS5A 4UYEA 5I40A 5ENFA 4CLBA 4J1PA 4NR9A 5FE0A 4NQNA 4LZRA 5HCLA 5EA1A 3IU6A 2YYNA 4QYDA 3ZYUA 5D3NA 4NYWA 5E9LA 5AD2A 3LQHA 4KCXA 5EGUA 5TB6A 5A83A 4NYVA 3U5NA 3U5KA 3UVXA 5J0DA 5CQ7A 5DFCA 5KHMA 4O7CA 5DLXA 5EVAA 5FH7A 5D24A 5A7CA 5BT4A 5D3PA 2R0VA 3QZSA 4TZ2A 5EQ1A 4A9KA 2KTBB 4O70A 5II1A 5ENGA 5DW2A 4Z93A 3JVKA 3LXJA 5CQAA 2D9EA 4YY6A 5CGPA 5DY7A 4QSWA 4MEQA 5D3LA 4XY9A 4NYXA 2OSSA 2F6JA 2OUOA 5DFBA 3U5LA 2YDWA 4TS8A 5JWMA 5EM3A 5BT3A 3VKGA 5E0RA 4LZSA 4NR6A 5E3GA 4KV4A 2MJVB 5FG4A 4Q0NA 3MB3A 4BHWA 1EQFA 2DVRA 4PTBA 5HQ6A 4IOOA 5L97A 4BW2A 2GRCA 4HXOA 3P1FA 5ETDA 5HFRA 5II2A 5HQ7A 5FH8A 5KTUA 4YH3A 5CQ3A 4UIYA 5D3HA 5EWHA 5D3TA 4QUTA 4AKGA 4UYHA 4HXRA 4QEUA 4YK0A 5DX4A 5HELA 5C4QA 4TQNA 4AKIA 2DVSA 3ONIA 3DWYA 2FSAA 4QSQA 3HMFA 3O36A 4MEPA 4TYLA 5AD3A 4UIWA 1X0JA 4AKNA 4QSRA 5F25A 4TTEA 5AMEA 1PUOA 4A9MA 2DATA 5FE8A 4NUCA 5EPRA 5FB1A 3P1EA 3MQMA 3HMHA 2R10A 5FE1A 4NRCA 5FH6A 4CUSA 1N72A 3LJWA 5HRVA 4QEVA 4UYDA 3UV5A 4YY4A 5EISA 5A5PA 5F63A 4ALHA 4WIVA 5G4RA 4N3WA 3DAIA 2WP2A 2DKWA 4HXSA 2LSPB 5I89A 2E7NA 4AKHA 5HRWA 5I1QA 2R0SA 4LZ2A 2YEKA 4YBSA 4O76A 5BT5A 5L96A 3ERRA 5CU8A 5IGKA 5EWDA 5D3JA 4UIVA 5IGMA 4BW1A 2F6NA 4A9IA 5LJ1A 3P1DA 5E7DA 5LKTA 4KV1A 4MR3A 5EWVA 5KTWA 4O78A 5HJCA 5F3AA 4UYFA 5ENEA 4HBXA 5C7NA 5CP5A 4UIUA 5FBXA 5L8UA 4CURA 4O74A 5LUUA 5D3SA 2E7OA 2RO1A 5ENCA 4IOQA 5CS8A 1JSPB 3TLPA 4A9EA 5EK9A 4CUQA 3O33A 5CRZA 3RCWA 5I80A 5E9MA 4Z6HA 5CZGA 5L98A 2YQDA 4QR3A 5IGNA 3MB4A 3U5MA 4C67A 2RNYA 5I86A 5HM0A 5HLSA 5H1VA 2RI7A 5CTLA 3SVFA 5EWCA 4A9HA 4OUFA 4QB3A 5L8TA 5FB0A 4HXPA 5CRMA 5F5ZA 4QC3A 5CPEA 5HQ5A 5EV9A 5CUAA 4A9NA 5LVRA 5LKUA 4NQMA 5I83A 4HXLA 4YYGA 3HMEA 3D7CA 4O72A 5LKXA 4NUEA 5FDZA 4QBMA 4TT4A 5IGLA 4YBMA 5F1HA 5LVQA 4LDFA 4HXMA 4QSTA 3U5OA 4YBTA 4Z1SA 5DLZA 5CUCA 4OGIA 4CL9A 4N4GA 1JM4B 4F3IA 4A9JA 4J3IA 4HBVA 5HENA 5IBNA 5C89A 2DVVA 4CUPA 4Z6IA 5LJ2A 3O35A 5A5SA 5EPBA 4UIXA 5CQ4A 5F62A 4XYAA 3GG3A 4FLPA 5E9IA 3VKHA 4LYWA 3G0LA 4O7EA 2I7KA 5E73A 2D82A 4CFKA 4O75A 5ENHA 4YYNA 4E96A 5A5QA 5D3RA 5CQ5A 3U5PA 2YEMA 4QSVA
chains in the Genus database with same CATH topology
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