5I29A

Taf1(2) bound to a pyrrolopyridone compound
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
139
structure length
139
Chain Sequence
DDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAALEEAELESLDPMT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords Transcription initiation factor TFIID subunit 1
publication title Diving into the Water: Inducible Binding Conformations for BRD4, TAF1(2), BRD9, and CECR2 Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 54
structure length 139
sequence length 139
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i29A00
5CU8A 5CQAA 4YH3A 5F36A 5EVAA 5CUBA 5CY9A 4QSVA 3MB4A 3ONIA 2OO1A 4QZSA 5AMFA 5F5ZA 4Z1QA 4LYIA 4OGIA 5EV9A 2WP2A 5E9KA 4TT2A 4F3IA 2DATA 2DVSA 4UITA 5DY7A 3UVWA 5L8UA 4YYMA 1JM4B 5DW1A 3G0JA 3JVKA 4YABA 2H60A 3HMFA 5E74A 4LDFA 5D3NA 4TS8A 4YK0A 4QR4A 4O7BA 5CQ3A 5BT3A 5H1VA 2RNYA 4GPJA 5FE8A 4NR7A 5CUDA 4QEUA 5F60A 5I80A 5LJ2A 3DAIA 5TCMA 4YBSA 5FE9A 5CS8A 2YDWA 2DVVA 4HBVA 4MR4A 4TTEA 5EICA 4QB3A 4YADA 5F1HA 5FG4A 5FB0A 4ZW1A 3P1DA 2KTBB 5D3HA 5ENJA 5F2PA 4HXNA 2G4AA 5C8GA 3O36A 2MJVB 5A5RA 5D3RA 4YYKA 4PY6A 5DKDA 4KCXA 4O7CA 5H1UA 2YELA 3AADA 5E3DA 2RFJA 3QZSA 4Z93A 5EP7A 4QSXA 5DKHA 5E9VA 4J0SA 4CFLA 5FE1A 5D3JA 4OUFA 5IGNA 5ENIA 5EWCA 4YY4A 4LYSA 5FE5A 4XY8A 5CQ6A 5L97A 4YH4A 4IOQA 4NR6A 5HEMA 5A7CA 5D25A 5C4QA 5E73A 5A81A 5A5PA 4O7FA 4O7AA 4BW1A 5FE6A 1WUGA 4QUUA 4O74A 4QSUA 4TQNA 4UIZA 4UYHA 5E7DA 5CQ7A 4X2IA 5HQ6A 5II2A 4A9MA 3UVDA 4NYVA 5FBXA 4YC9A 5FE3A 2GRCA 3IU6A 4TZ2A 2DVQA 4HBWA 4YBMA 3U5NA 4YBTA 3UV2A 5EWDA 5I7YA 5EM3A 3HMHA 5C85A 5A85A 3LQJA 4NUCA 5I86A 4N3WA 5L8TA 2L85A 4NS5A 5FH7A 5HRWA 4J3IA 2YEMA 3S91A 3DWYA 3U5MA 4Q0OA 5ENHA 3G0LA 2I8NA 5TB6A 5F63A 5C87A 4NR5A 3S92A 5L96A 5HELA 5FH6A 4UIWA 4N4IA 5DBMA 4TZ8A 4A9NA 2RNWA 4QC1A 4IR4A 5F61A 5E9YA 4QC3A 5CZGA 4O71A 5KTUA 5DX4A 4J0RA 2RI7A 4QR5A 5KO4A 5CPEA 3MB3A 5HM0A 4MR6A 5CQ8A 4A9KA 4HXPA 4PTBA 2I7KA 4WHWA 4Z6HA 4YYDA 4NUEA 3K2JA 4TT6A 3UV4A 5KU3A 2OSSA 5DFBA 5I89A 5E9MA 3P1EA 5ENFA 4YYJA 4A9FA 5HRVA 4QUTA 3ZYUA 5D24A 5FG5A 1ZS5A 4MEOA 5D7XA 4NRBA 5DFDA 5I83A 5EU1A 4IOOA 3LJWA 5LKTA 5DLZA 4CL9A 2YW5A 5IBNA 5FE0A 5K29A 3QZTA 2D82A 4WIVA 3LXJA 4FLPA 3NXBA 5F62A 5HLSA 5EQ1A 2D9EA 5EWVA 4QR3A 5DYXA 4YATA 4A9LA 4PKLA 3U5LA 4IR5A 2F6JA 3Q2FA 5EGUA 5LVRA 5CQ4A 4CUTA 2LSPB 3SVHA 3Q2EA 5ENEA 5E3GA 4A9IA 4BW4A 3D7CA 4MR3A 5DKCA 5HRXA 2R0YA 4UIYA 2YYNA 4RVRA 3MXFA 4KV4A 2WP1A 2N9GA 4QBMA 5ENGA 5F25A 1E6IA 4MENA 3U5KA 3O33A 5F3AA 3U5OA 5CP5A 5A5QA 4NXJA 5G4RA 3IU5A 4A9HA 4HXLA 3UV5A 3JVMA 5FE7A 4PS5A 3O37A 4ZQLA 5ENBA 5A82A 4DONA 5E9IA 5FE4A 5BT4A 4LR6A 4NRCA 5C7NA 5CUEA 3U5PA 3GG3A 4ALHA 3UVYA 5ETBA 5FFYA 1F68A 4NR8A 5L98A 5COIA 4MR5A 5BT5A 3JVLA 3P1CA 5ENCA 5LJ1A 3LQIA 5I1QA 5HCLA 5F1LA 4UIVA 5DW2A 4CUUA 3MQMA 5CUAA 4Y03A 5D3SA 2YQDA 5JI8A 5DLXA 5FB1A 4ALGA 5HFRA 3MULA 4HXKA 3RCWA 5FFVA 4WHUA 2RO1A 4UIUA 5LKUA 4Z6IA 5CQ5A 4CLBA 5HENA 5IGLA 4PCEA 5E0RA 4LC2A 3I3JA 4UIXA 5II1A 4AKNA 3UW9A 5LJ0A 5DFCA 2FSAA 3O35A 2YEKA 4O78A 4BW3A 5G4SA 3HMEA 3SVGA 5I7XA 5HQ7A 5EPBA 2RNXA 2DVRA 4XY9A 4LZRA 4A9OA 5AMEA 4QEWA 4BHWA 4YY6A 4LRGA 4O77A 4HBXA 1N72A 4YYHA 5CRMA 4MEQA 4A9EA 5I29A 4O75A 4N4HA 5IG6A 5JWMA 4UYFA 5EPRA 4TT4A 4HXOA 4TU4A 5D26A 3TLPA 4NYXA 4O72A 3FKMX 4HBYA 5KHMA 4C67A 5CUCA 5HJCA 5A5NA 4HXRA 2NXBA 4XYAA 3LQHA 5AD3A 5DYAA 5CQTA 4E96A 4LZSA 2L5EA 5EA1A 4QSPA 5FE2A 4QSRA 5H85A 4MEPA 3AQAA 5D3PA 5EWHA 3QZVA 4O70A 4HXSA 5DYUA 5D3TA 4C66A 2OUOA 4HXMA 4YAXA 5IGMA 1WUMA 4LYWA 5IGKA 4YYGA 4NQMA 5EISA 4QSQA 4QYDA 5HQ5A 5LKZA 4UYGA 4NR9A 3P5OA 4UYEA 4YYNA 2R10A 5D0CA 4QY4A 5CRZA 2DKWA 1X0JA 5EI4A 5ETDA 5CFWA 4QNSA 4XUBA 4O7EA 5I88A 2E7NA 4NRAA 5L99A 5CGPA 3MUKA 5FG6A 4CUSA 4ZC9A 5I40A 5DYCA 5HFQA 5D3LA 4CURA 4Q0NA 5A83A 4NR4A 5LVQA 1EQFA 4O76A 4NUDA 4A9JA 4UYFB 4BJXA 5KTXA 4NYWA 4LZ2A 3UVXA 4IR3A 3JVJA 4OGJA 5E9LA 5EWWA 5IIDA 2R0SA 2E7OA 5KTWA 3SVFA 5FDZA 2F6NA 4TU6A 4UYDA 4N4GA 4CUPA 3U5JA 5LKXA 3O34A 4QYLA 4QSSA 4NQNA 5H1TA 4QEVA 4CUQA 4PCIA 2E3KA 2R0VA 5AD2A 5ACYA 5A5OA 4IR6A 3P1FA 4XUAA 5CUGA 2RS9B 4IORA 5C89A 4Z1SA 4BW2A 4QSWA 5FH8A 4YYIA 5EK9A 5J0DA 2L84A 5EPSA 2DWWA 4J1PA 5A5SA 4CFKA 4TYLA 5FFWA 1JSPB 4KV1A 5CTLA 4QSTA 5LUUA 4N4FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CU8A 5CQAA 4YH3A 5F36A 5EVAA 5CUBA 5CY9A 4QSVA 3MB4A 3ONIA 2OO1A 4QZSA 5AMFA 5F5ZA 4Z1QA 4LYIA 4OGIA 5EV9A 2WP2A 5E9KA 4TT2A 4F3IA 2DATA 2DVSA 4UITA 5DY7A 3UVWA 5L8UA 4YYMA 1JM4B 5DW1A 3G0JA 3JVKA 4YABA 2H60A 3HMFA 5E74A 4LDFA 5D3NA 4TS8A 4YK0A 4QR4A 4O7BA 5CQ3A 5BT3A 5H1VA 2RNYA 4GPJA 5FE8A 4NR7A 5CUDA 4QEUA 5F60A 5I80A 5LJ2A 3DAIA 5TCMA 4YBSA 5FE9A 5CS8A 2YDWA 2DVVA 4HBVA 4MR4A 4TTEA 5EICA 4QB3A 4YADA 5F1HA 5FG4A 5FB0A 4ZW1A 3P1DA 2KTBB 5D3HA 5ENJA 5F2PA 4HXNA 2G4AA 5C8GA 3O36A 2MJVB 5A5RA 1ZKRA 5D3RA 4PY6A 4YYKA 5DKDA 4KCXA 4O7CA 5H1UA 2YELA 3AADA 5E3DA 2RFJA 3QZSA 4Z93A 5EP7A 4QSXA 5DKHA 5E9VA 4J0SA 4CFLA 5FE1A 5D3JA 4OUFA 5IGNA 5ENIA 5EWCA 4YY4A 4LYSA 5FE5A 4XY8A 5CQ6A 5L97A 4YH4A 4IOQA 4NR6A 5HEMA 5A7CA 5D25A 5C4QA 5E73A 5A81A 5A5PA 4O7FA 4O7AA 4BW1A 5FE6A 1WUGA 4QUUA 4O74A 4QSUA 4TQNA 4UIZA 4UYHA 5E7DA 5CQ7A 4X2IA 5HQ6A 5II2A 4A9MA 3UVDA 4NYVA 5FBXA 4YC9A 5FE3A 2GRCA 3IU6A 4TZ2A 2DVQA 4HBWA 4YBMA 3U5NA 4YBTA 3UV2A 5EWDA 5I7YA 5EM3A 3HMHA 5C85A 5A85A 3LQJA 4NUCA 5I86A 4N3WA 5L8TA 2L85A 4NS5A 5FH7A 5HRWA 4J3IA 2YEMA 3S91A 3DWYA 3U5MA 4Q0OA 5ENHA 3G0LA 2I8NA 5TB6A 5F63A 5C87A 4NR5A 3S92A 5L96A 5HELA 5FH6A 4UIWA 4N4IA 5DBMA 4TZ8A 4A9NA 2RNWA 4QC1A 4IR4A 5F61A 5E9YA 4QC3A 5CZGA 4O71A 5KTUA 5DX4A 4J0RA 2RI7A 4QR5A 5KO4A 5CPEA 3MB3A 5HM0A 4MR6A 5CQ8A 4A9KA 4HXPA 3D1BA 4PTBA 4AKGA 2I7KA 4WHWA 4Z6HA 4YYDA 4NUEA 3K2JA 4TT6A 3UV4A 5KU3A 2OSSA 5DFBA 5I89A 5E9MA 3P1EA 5ENFA 4YYJA 4A9FA 5HRVA 4QUTA 3ZYUA 5D24A 5FG5A 1ZS5A 4MEOA 5D7XA 4NRBA 5DFDA 5I83A 5EU1A 4IOOA 3LJWA 5LKTA 5DLZA 4CL9A 2YW5A 5IBNA 5FE0A 5K29A 3QZTA 2D82A 4WIVA 3LXJA 4FLPA 3NXBA 5F62A 5HLSA 5EQ1A 2D9EA 5EWVA 4QR3A 5DYXA 4YATA 4A9LA 4PKLA 3U5LA 4IR5A 2F6JA 3Q2FA 5EGUA 5LVRA 5CQ4A 4CUTA 2LSPB 3SVHA 3Q2EA 5ENEA 5E3GA 4A9IA 4BW4A 3D7CA 4MR3A 5DKCA 5HRXA 2R0YA 4UIYA 2YYNA 4RVRA 3MXFA 3D1DA 4KV4A 2WP1A 2N9GA 4QBMA 5ENGA 5F25A 1E6IA 4MENA 3U5KA 3O33A 5F3AA 3U5OA 5CP5A 5A5QA 4NXJA 5G4RA 3IU5A 4A9HA 4HXLA 3UV5A 3JVMA 5FE7A 4PS5A 3O37A 4ZQLA 5ENBA 5A82A 4DONA 5E9IA 5FE4A 1PUOA 5BT4A 4LR6A 4NRCA 5C7NA 5CUEA 3U5PA 3GG3A 4ALHA 3UVYA 5ETBA 5FFYA 1F68A 4NR8A 5L98A 5COIA 4MR5A 5BT5A 3JVLA 3P1CA 5ENCA 5LJ1A 3LQIA 5I1QA 5HCLA 5F1LA 4UIVA 5DW2A 4CUUA 3MQMA 5CUAA 4Y03A 5D3SA 2YQDA 5JI8A 5DLXA 5FB1A 4ALGA 5HFRA 3MULA 4HXKA 3RCWA 5FFVA 4WHUA 2RO1A 4UIUA 5LKUA 4Z6IA 5CQ5A 4CLBA 5HENA 5IGLA 4PCEA 5E0RA 4LC2A 3I3JA 4UIXA 4AKIA 5II1A 4AKNA 3UW9A 5LJ0A 5DFCA 2FSAA 3O35A 2YEKA 4O78A 3VKHA 4BW3A 5G4SA 3HMEA 3SVGA 5I7XA 5HQ7A 5EPBA 2RNXA 2DVRA 4XY9A 4LZRA 4A9OA 5AMEA 4QEWA 4BHWA 4YY6A 4LRGA 4O77A 4HBXA 1N72A 4YYHA 5CRMA 4MEQA 4AI6A 4A9EA 5I29A 4O75A 4N4HA 5IG6A 5JWMA 4UYFA 5EPRA 4TT4A 4HXOA 4TU4A 5D26A 3TLPA 4NYXA 4O72A 3FKMX 4HBYA 5KHMA 4C67A 5CUCA 5HJCA 5A5NA 4HXRA 2NXBA 4XYAA 3LQHA 5AD3A 5DYAA 5CQTA 4E96A 4LZSA 2L5EA 5EA1A 4QSPA 5FE2A 4QSRA 5H85A 4MEPA 3AQAA 5D3PA 5EWHA 3QZVA 4O70A 4HXSA 5DYUA 5D3TA 4C66A 2OUOA 4HXMA 4YAXA 5IGMA 1WUMA 4LYWA 5IGKA 4YYGA 4NQMA 5EISA 4QSQA 4QYDA 5HQ5A 5LKZA 4UYGA 4NR9A 3P5OA 4UYEA 4YYNA 2R10A 5D0CA 4QY4A 5CRZA 2DKWA 1X0JA 5EI4A 5ETDA 5CFWA 4QNSA 4XUBA 4O7EA 5I88A 2E7NA 4NRAA 5L99A 5CGPA 3MUKA 5FG6A 4CUSA 4ZC9A 5I40A 5DYCA 5HFQA 5D3LA 4CURA 4Q0NA 5A83A 4NR4A 5LVQA 1EQFA 4O76A 4NUDA 2EJNA 4A9JA 4UYFB 4BJXA 5KTXA 4NYWA 4LZ2A 3UVXA 4IR3A 3JVJA 4OGJA 5E9LA 5EWWA 5IIDA 2R0SA 3ERRA 2E7OA 5KTWA 3SVFA 5FDZA 2F6NA 4TU6A 4UYDA 4N4GA 4CUPA 3U5JA 5LKXA 3O34A 4QYLA 4QSSA 4NQNA 5H1TA 4QEVA 4AKHA 4CUQA 4PCIA 2E3KA 2R0VA 5AD2A 5ACYA 5A5OA 4IR6A 3P1FA 4XUAA 5CUGA 2RS9B 4IORA 5C89A 4Z1SA 4BW2A 4QSWA 5FH8A 4YYIA 5EK9A 5J0DA 2L84A 5EPSA 2DWWA 4J1PA 5A5SA 4CFKA 4TYLA 5FFWA 1JSPB 4KV1A 5CTLA 4QSTA 5LUUA 4N4FA 3VKGA
chains in the Genus database with same CATH topology
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