5I80A

Brd4 in complex with cpd2 (n,n-dimethyl-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1h-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide)
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
STNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
publication title Diving into the Water: Inducible Binding Conformations for BRD4, TAF1(2), BRD9, and CECR2 Bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 43
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i80A01
5KTXA 5G4RA 5E73A 5KTWA 5FB0A 2MJVB 3DWYA 4PTBA 4XUAA 5D3LA 3UVXA 5CQTA 4UIUA 5IG6A 5FE4A 5CQ4A 5C89A 3ZYUA 5DFCA 4NR9A 5J0DA 5E9IA 4HXOA 5ENCA 5HQ7A 5CUDA 5CUAA 3P1DA 4NQMA 4NUEA 4C66A 3MB3A 4IOQA 3DAIA 5F62A 4MR4A 4CL9A 4NR7A 3O37A 4UIZA 4A9LA 5C87A 5DKHA 5HQ5A 5HELA 5H1UA 3P1EA 4TZ2A 4O71A 3ONIA 3JVKA 5FB1A 5IGMA 4LZRA 2RNXA 4NYXA 5FH8A 4GPJA 5F3AA 5L97A 4CFLA 4TZ8A 4BJXA 5A85A 4QBMA 5F1HA 5ENGA 5IIDA 5ENEA 5LKXA 4YH3A 5EVAA 5EWDA 3D7CA 5DFDA 5AMFA 5I29A 5DYXA 4CUSA 5FFWA 5D3HA 5FE8A 4O7AA 4NYWA 4OGJA 4J1PA 4Q0NA 4QSVA 4YABA 4TT6A 4UIVA 2F6NA 4NS5A 2OUOA 3S91A 4UYDA 3UVYA 4QSRA 4MEQA 4HXSA 3G0JA 1ZS5A 3UV2A 2OO1A 3LXJA 4HXMA 4OUFA 3RCWA 4YYKA 4O7EA 5ETDA 2H60A 4QZSA 2YEMA 5EWHA 5D3JA 4UIXA 4DONA 2KTBB 5II1A 4BW1A 4HXRA 3Q2EA 4QSXA 3QZTA 4LDFA 2DATA 5AD3A 4YH4A 5DW1A 4MEOA 4N4IA 5D3NA 5CUBA 5CUCA 2R0YA 4F3IA 4O75A 5A82A 4PS5A 4CUPA 4C67A 4HBYA 4YYIA 5EICA 5DFBA 4XYAA 4CURA 5K29A 5EK9A 4TU6A 4QSTA 5LJ1A 5FH7A 4IR6A 3O36A 2RNWA 4MENA 4J0RA 4O7BA 3U5JA 4YYNA 5CY9A 4LYSA 5FG5A 4O76A 5CQ5A 5ACYA 5HJCA 5I7XA 5I1QA 2YEKA 5DLXA 5E74A 5BT3A 1F68A 3O35A 5LVRA 3UVWA 4LRGA 4O7FA 4ALGA 5F1LA 3P1CA 4HXPA 4CUQA 3MUKA 3MQMA 5KO4A 5E0RA 5ENBA 5FG4A 3U5KA 5LVQA 5HQ6A 5HEMA 1EQFA 4UYFA 4O78A 5I83A 4NUDA 3LQHA 5AD2A 4LYIA 5F25A 5F60A 5A5RA 4QSSA 5EWCA 2YDWA 2YELA 5DYUA 4AKNA 5E9MA 4YYGA 4QUTA 5CQ7A 5FDZA 5LJ2A 5L96A 2N9GA 4YC9A 5DLZA 4WIVA 4NRCA 4NQNA 4IR4A 5G4SA 4QSWA 3O34A 4TU4A 5DW2A 5CS8A 4XY9A 4LZSA 5FFVA 5IGKA 4ZC9A 5FE3A 5F61A 5II2A 4Q0OA 5FG6A 4NRAA 2DKWA 5I86A 5HRVA 4TQNA 4XY8A 3UV4A 4O7CA 5CP5A 3I3JA 4LYWA 5EQ1A 2D9EA 2E7NA 1E6IA 4YYJA 5L99A 5EM3A 4N4HA 4X2IA 4YYHA 5FE7A 5JWMA 4ALHA 4UYEA 3JVJA 3O33A 5IGNA 4A9JA 4BW2A 3HMEA 4QSPA 2YYNA 2DVVA 3IU5A 2DVQA 3U5PA 5E9LA 5I7YA 5E9YA 5CGPA 2RNYA 2R10A 4YATA 5AMEA 5CUGA 5HLSA 4YYDA 3U5LA 4QEWA 5LUUA 5DKCA 4TT4A 4UYFB 4KV4A 3FKMX 5H85A 4HBWA 5FE6A 5L98A 5DBMA 4QB3A 3GG3A 1X0JA 5E3GA 4PCEA 4TYLA 5ENIA 3G0LA 5FE1A 4YBMA 5KTUA 2FSAA 5F2PA 4BW3A 2WP1A 4NR6A 4YBSA 4NXJA 4YAXA 3U5NA 5H1TA 5I89A 5EGUA 5EPSA 5D26A 5FE9A 5FFYA 4Y03A 5F63A 4O70A 5EU1A 5EPBA 4A9OA 3SVGA 4O77A 2WP2A 4UYGA 5ENHA 5BT5A 4Z1QA 5ENJA 5D3TA 4PKLA 5CU8A 5TCMA 1JM4B 2OSSA 5LKTA 4LC2A 1JSPB 4QNSA 4NRBA 5BT4A 4BHWA 5D3SA 3P5OA 5I88A 4Z6IA 5E9VA 4YK0A 4NR8A 4KV1A 5FE0A 4MR3A 4J3IA 5DYAA 5C7NA 2DVSA 5EWVA 5C8GA 4UIWA 4IR5A 3QZSA 2RS9B 5IGLA 4IR3A 4MEPA 5A5SA 4YYMA 5E9KA 4IOOA 5KU3A 4Z93A 5DX4A 4MR5A 5DKDA 5HCLA 2RFJA 5DYCA 5E3DA 4PY6A 5CRMA 5L8UA 4QEUA 3K2JA 4CLBA 2R0SA 5LKUA 4QC3A 4UITA 4IORA 1WUMA 4NR5A 4O74A 3IU6A 4TTEA 2GRCA 4Z6HA 4A9MA 3UW9A 5D24A 4ZW1A 5TB6A 5LKZA 2LSPB 4KCXA 4N3WA 2L84A 5CUEA 2RI7A 5DY7A 5FE2A 4HXKA 5I80A 5CQ3A 3JVLA 4HBVA 4QR5A 4HXLA 4A9HA 5FE5A 3S92A 2DWWA 4QSQA 4ZQLA 4UIYA 5A5QA 2G4AA 5HRWA 4QSUA 5CFWA 5FBXA 5C85A 5ENFA 5CQAA 3LJWA 3HMFA 4OGIA 5EISA 4A9KA 5COIA 3TLPA 5JI8A 5HM0A 4N4FA 4TS8A 3U5MA 4HXNA 2YQDA 1WUGA 4LZ2A 5EWWA 4YY4A 3SVFA 4QEVA 4PCIA 4CUUA 5L8TA 3UV5A 2R0VA 5A81A 4A9FA 5F36A 5FH6A 4QC1A 2DVRA 5CTLA 2I8NA 4QR3A 5EA1A 3Q2FA 5IBNA 2L85A 3MXFA 4CFKA 5E7DA 5EI4A 5D3PA 5A7CA 4WHUA 4MR6A 4LR6A 5EPRA 4CUTA 3U5OA 5HRXA 5CQ8A 5CRZA 5F5ZA 5HFQA 3LQIA 1N72A 4QY4A 3HMHA 4NUCA 4A9NA 3LQJA 5KHMA 3AADA 4NYVA 4O72A 5D25A 5LJ0A 5CPEA 5D0CA 5A5PA 5A5NA 4QYLA 3MB4A 5CQ6A 4QUUA 2F6JA 4N4GA 4J0SA 5H1VA 5HFRA 3P1FA 5EV9A 4QR4A 5CZGA 5D7XA 4UYHA 4NR4A 5C4QA 4YADA 3MULA 5HENA 5I40A 5D3RA 3JVMA 4TT2A 3SVHA 3AQAA 3UVDA 5A83A 3NXBA 2D82A 4HBXA 4YY6A 4A9IA 4E96A 2I7KA 2E7OA 5EP7A 4Z1SA 2L5EA 2NXBA 4XUBA 4YBTA 2E3KA 4BW4A 4FLPA 2RO1A 2YW5A 4QYDA 4A9EA 5ETBA 4WHWA 3QZVA 5A5OA 4RVRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KTXA 5G4RA 5E73A 5KTWA 5FB0A 2MJVB 3DWYA 4PTBA 4XUAA 5D3LA 3UVXA 5CQTA 4UIUA 5IG6A 5FE4A 5CQ4A 5C89A 3ZYUA 5DFCA 4NR9A 5J0DA 5E9IA 4HXOA 5ENCA 5HQ7A 3VKGA 5CUDA 5CUAA 3P1DA 4NQMA 4NUEA 4C66A 3MB3A 4IOQA 3DAIA 5F62A 4MR4A 4CL9A 4NR7A 3O37A 1PUOA 4UIZA 4A9LA 5C87A 5DKHA 5HQ5A 5HELA 5H1UA 3P1EA 4TZ2A 4O71A 3ONIA 3JVKA 5FB1A 5IGMA 4LZRA 2RNXA 4NYXA 5FH8A 4GPJA 5F3AA 5L97A 4CFLA 4TZ8A 4BJXA 5A85A 4QBMA 5F1HA 5ENGA 5IIDA 5ENEA 5LKXA 4YH3A 5EVAA 5EWDA 3D7CA 5DFDA 5AMFA 5I29A 5DYXA 4CUSA 5FFWA 5D3HA 5FE8A 4O7AA 4NYWA 4OGJA 4J1PA 4Q0NA 4QSVA 4AKHA 4YABA 4TT6A 4UIVA 2F6NA 4AI6A 4NS5A 2OUOA 3S91A 4UYDA 3UVYA 4QSRA 4MEQA 4HXSA 3G0JA 1ZS5A 3UV2A 2OO1A 3LXJA 4HXMA 4OUFA 3RCWA 4YYKA 4O7EA 5ETDA 2H60A 4QZSA 2YEMA 5EWHA 5D3JA 4UIXA 4DONA 2KTBB 5II1A 4BW1A 4HXRA 3VKHA 3Q2EA 4QSXA 3QZTA 4LDFA 2DATA 5AD3A 4YH4A 5DW1A 4MEOA 4N4IA 5D3NA 5CUBA 5CUCA 2R0YA 4F3IA 4O75A 5A82A 4PS5A 4CUPA 4C67A 4HBYA 4YYIA 5EICA 5DFBA 4XYAA 4CURA 5K29A 5EK9A 4TU6A 4QSTA 5LJ1A 5FH7A 4IR6A 3O36A 2RNWA 4MENA 4J0RA 4O7BA 3U5JA 4YYNA 5CY9A 4LYSA 5FG5A 4O76A 5CQ5A 5ACYA 5HJCA 5I7XA 5I1QA 2YEKA 5DLXA 5E74A 5BT3A 1F68A 3O35A 5LVRA 3UVWA 4LRGA 4O7FA 4ALGA 5F1LA 3P1CA 4HXPA 4CUQA 3MUKA 3MQMA 5KO4A 5E0RA 5ENBA 5FG4A 3U5KA 5LVQA 5HQ6A 5HEMA 1EQFA 4UYFA 4O78A 5I83A 4NUDA 3LQHA 5AD2A 4LYIA 5F25A 5F60A 5A5RA 4QSSA 5EWCA 2YDWA 2YELA 5DYUA 4AKNA 5E9MA 4YYGA 4QUTA 5CQ7A 5FDZA 5LJ2A 5L96A 2N9GA 4YC9A 5DLZA 4WIVA 4NRCA 4NQNA 4IR4A 5G4SA 4QSWA 3O34A 1ZKRA 4TU4A 5DW2A 5CS8A 4XY9A 4LZSA 5FFVA 5IGKA 4ZC9A 5FE3A 5F61A 5II2A 4Q0OA 5FG6A 4NRAA 2DKWA 5I86A 5HRVA 4TQNA 4XY8A 3UV4A 4O7CA 5CP5A 3I3JA 4LYWA 5EQ1A 2D9EA 2E7NA 1E6IA 4YYJA 5L99A 5EM3A 4N4HA 4X2IA 4YYHA 5FE7A 5JWMA 4ALHA 4UYEA 3JVJA 3O33A 5IGNA 4A9JA 4BW2A 3HMEA 4QSPA 2YYNA 2DVVA 3IU5A 2DVQA 3U5PA 5E9LA 5I7YA 5E9YA 5CGPA 2RNYA 2R10A 4YATA 5AMEA 5CUGA 5HLSA 4YYDA 3U5LA 4QEWA 5LUUA 5DKCA 4TT4A 4UYFB 4KV4A 3FKMX 5H85A 4HBWA 5FE6A 5L98A 5DBMA 4QB3A 3GG3A 1X0JA 5E3GA 4PCEA 4TYLA 5ENIA 3G0LA 5FE1A 4YBMA 5KTUA 2FSAA 5F2PA 4BW3A 2WP1A 4NR6A 4YBSA 4NXJA 4YAXA 3U5NA 5H1TA 5I89A 5EGUA 5EPSA 5D26A 5FE9A 5FFYA 3D1BA 4Y03A 5F63A 4AKGA 4O70A 5EU1A 5EPBA 4A9OA 3SVGA 4O77A 2WP2A 4UYGA 5ENHA 5BT5A 4Z1QA 5ENJA 5D3TA 4PKLA 5CU8A 5TCMA 1JM4B 2OSSA 5LKTA 4LC2A 1JSPB 4QNSA 4NRBA 5BT4A 4BHWA 5D3SA 3P5OA 5I88A 4Z6IA 5E9VA 4YK0A 4NR8A 4KV1A 5FE0A 4MR3A 4J3IA 5DYAA 5C7NA 2DVSA 5EWVA 5C8GA 4UIWA 4IR5A 3QZSA 2RS9B 5IGLA 4IR3A 4MEPA 5A5SA 4YYMA 5E9KA 4IOOA 5KU3A 4Z93A 5DX4A 4MR5A 5DKDA 5HCLA 2RFJA 5DYCA 5E3DA 4PY6A 5CRMA 5L8UA 4QEUA 3K2JA 4CLBA 2R0SA 5LKUA 4QC3A 4UITA 4IORA 1WUMA 4NR5A 4O74A 3IU6A 4TTEA 2GRCA 4Z6HA 4A9MA 3UW9A 5D24A 4ZW1A 5TB6A 5LKZA 2LSPB 4KCXA 4N3WA 2L84A 5CUEA 2RI7A 5DY7A 5FE2A 4HXKA 5I80A 5CQ3A 3JVLA 4HBVA 4QR5A 4HXLA 4A9HA 5FE5A 3S92A 2DWWA 4QSQA 4ZQLA 4UIYA 5A5QA 2G4AA 5HRWA 4QSUA 5CFWA 5FBXA 5C85A 5ENFA 5CQAA 3LJWA 3HMFA 4OGIA 3D1DA 5EISA 4A9KA 5COIA 3TLPA 5JI8A 5HM0A 4N4FA 4TS8A 3U5MA 4HXNA 2YQDA 1WUGA 4LZ2A 5EWWA 4YY4A 3SVFA 4QEVA 4PCIA 4CUUA 5L8TA 3UV5A 2R0VA 5A81A 4A9FA 5F36A 5FH6A 4AKIA 4QC1A 2DVRA 2EJNA 5CTLA 2I8NA 4QR3A 5EA1A 3Q2FA 5IBNA 2L85A 3MXFA 4CFKA 5E7DA 5EI4A 5D3PA 5A7CA 4WHUA 4MR6A 4LR6A 5EPRA 4CUTA 3U5OA 5HRXA 5CQ8A 5CRZA 5F5ZA 5HFQA 3LQIA 1N72A 4QY4A 3HMHA 4NUCA 4A9NA 3LQJA 5KHMA 3AADA 4NYVA 4O72A 5D25A 5LJ0A 5CPEA 5D0CA 5A5PA 5A5NA 4QYLA 3MB4A 5CQ6A 4QUUA 2F6JA 4N4GA 4J0SA 5H1VA 5HFRA 3P1FA 5EV9A 4QR4A 5CZGA 5D7XA 4UYHA 4NR4A 5C4QA 4YADA 3MULA 5HENA 5I40A 5D3RA 3JVMA 4TT2A 3SVHA 3AQAA 3UVDA 5A83A 3NXBA 2D82A 4HBXA 4YY6A 4A9IA 3ERRA 4E96A 2I7KA 2E7OA 5EP7A 4Z1SA 2L5EA 2NXBA 4XUBA 4YBTA 2E3KA 4BW4A 4FLPA 2RO1A 2YW5A 4QYDA 4A9EA 5ETBA 4WHWA 3QZVA 5A5OA 4RVRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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