5I83A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to the benzodiazepinone g02773986
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Fragment-Based Discovery of a Selective and Cell-Active Benzodiazepinone CBP/EP300 Bromodomain Inhibitor (CPI-637).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i83A00
3D7CA 5L8UA 5CFWA 2LSPB 4QUTA 5D3LA 3ZYUA 3MB4A 3MQMA 5HLSA 4HXSA 5L98A 5E9KA 5DKCA 5CRMA 5BT5A 4CLBA 3P1DA 5I40A 4HXOA 1N72A 2I8NA 5FG6A 4HBVA 4YY4A 4PCIA 5F25A 5F61A 2OO1A 5EPRA 5FDZA 4A9FA 4UYEA 5A5PA 5EVAA 5EPBA 5DW2A 3U5PA 4J0SA 4YATA 5FE2A 3QZSA 5EU1A 4A9NA 4HXNA 5FE6A 3UV2A 5I1QA 5LVRA 4IOQA 4MEPA 5D3NA 4HXKA 3P5OA 3UV4A 3G0LA 4YYJA 5HQ6A 4O7BA 5FH7A 4N4IA 5FE3A 3ONIA 5JI8A 5LKTA 4J1PA 3U5MA 5CUGA 3U5LA 5A5QA 2L85A 3LJWA 2DKWA 5G4RA 3MXFA 4LZSA 5F1HA 3MUKA 5G4SA 4TYLA 3SVHA 2L84A 4O77A 5E7DA 3AQAA 5ETBA 5CRZA 2YW5A 5FB1A 5EWVA 5LUUA 3O36A 2RS9B 4BJXA 2WP1A 3NXBA 4UYGA 5HQ7A 5IGMA 5D3JA 5HRXA 4O72A 5FE9A 2L5EA 4MENA 4CUPA 5A83A 4TU6A 5C87A 4MEQA 4NRBA 4CUTA 5DY7A 4HXRA 4UIVA 4UITA 1E6IA 3UW9A 4QY4A 2MJVB 3Q2FA 3JVJA 4CUQA 5IG6A 4YYMA 4Y03A 4HBXA 4LYIA 3UVDA 4YYHA 3GG3A 5BT3A 5I7YA 5CU8A 5FFYA 5CUBA 5EK9A 3LQJA 3JVKA 4QSTA 4O74A 4O7CA 5EQ1A 2DVVA 5CY9A 4N4GA 4QYLA 4HXLA 4QC1A 4NUEA 4O7AA 3MB3A 4YC9A 4NR6A 4TS8A 4QUUA 4NXJA 4UYDA 5C8GA 5K29A 4CURA 4YYIA 4LYWA 5CS8A 1ZS5A 5FE7A 5D3HA 2R0SA 4ZC9A 5HRWA 5EISA 4TU4A 5ENHA 5FE4A 4PTBA 4OGJA 5I29A 4QSVA 5A81A 3UVXA 5BT4A 3P1EA 4IR6A 4MR5A 4YAXA 5ENCA 2DVSA 5EWWA 2RO1A 4YYGA 5CQ3A 3S92A 4A9EA 5ENFA 4Z93A 4GPJA 3O35A 4MR3A 5JWMA 4IR3A 2DVQA 4KV1A 4MEOA 4WIVA 5DKDA 5DLZA 4J3IA 5ENIA 4QEVA 4CUSA 4MR6A 3P1CA 5E73A 3U5JA 3DWYA 4YBMA 2GRCA 4TZ2A 3JVMA 5ENEA 4QZSA 4UIUA 4Q0OA 2WP2A 4CFKA 3SVFA 5D26A 5HCLA 4UYHA 5F3AA 5CPEA 5LJ2A 4WHWA 5D24A 4UIZA 4YY6A 5CQ7A 5CUAA 5IGNA 3U5OA 4NQMA 3RCWA 5H85A 4XUAA 5EICA 5EPSA 4TTEA 5CTLA 5DX4A 5LJ1A 4XYAA 4NR7A 4YBTA 2E7OA 5COIA 2R0YA 4UYFA 5DFCA 5HFRA 5A5OA 5LKZA 3HMEA 5FG4A 5D3TA 4TT4A 2DVRA 4FLPA 5FE8A 5EI4A 5HELA 4YABA 2F6JA 2G4AA 2OSSA 4QNSA 4IORA 4TQNA 4A9KA 5H1VA 4OGIA 3QZTA 3FKMX 3O37A 5C85A 4NUCA 5FG5A 5FBXA 5EWHA 4TZ8A 5DKHA 2N9GA 4QSSA 5E3GA 5EP7A 4Z6IA 5KTUA 4NS5A 3SVGA 4F3IA 5E3DA 1JSPB 4YYNA 3IU6A 4NR5A 5HENA 4X2IA 2R10A 1WUMA 5E9YA 4CUUA 4YYDA 3G0JA 5I86A 5LKXA 4QBMA 4BW4A 2FSAA 5CUDA 4UYFB 4HBWA 4IR5A 5CP5A 5EWCA 4PCEA 5LVQA 4O70A 3TLPA 4LR6A 4PS5A 3U5KA 2RI7A 5CQ4A 4E96A 4WHUA 5DYCA 5ENGA 5DFBA 4AKNA 4A9IA 4Z1QA 4QYDA 4QR5A 2RNXA 2RNWA 4LC2A 5A5RA 4N4FA 4ALHA 5CQ5A 5I83A 3I3JA 4YBSA 2OUOA 2RNYA 2YYNA 5FE1A 3S91A 4DONA 3DAIA 4YADA 3JVLA 3LQHA 5E0RA 5A85A 4A9OA 5L8TA 4QSWA 4O7FA 2YQDA 4BW2A 4BHWA 4NRAA 4NQNA 4A9MA 5I89A 4O75A 4LRGA 4LYSA 5A82A 5IGLA 5ETDA 2YDWA 2E3KA 3K2JA 2DWWA 2DATA 5LJ0A 5F60A 5A7CA 4QSPA 3MULA 3U5NA 5DLXA 4NRCA 5FE0A 4IR4A 5IGKA 2R0VA 5TB6A 4ZW1A 3LQIA 4KCXA 4QSXA 4QR3A 5ENBA 5DYXA 5I80A 5CQAA 3UVWA 4Z1SA 5CQTA 4XY9A 2YEKA 4A9LA 5EWDA 4UIXA 4NR4A 1EQFA 4N4HA 5FFVA 4NYXA 3O34A 4BW3A 2D9EA 4TT2A 4TT6A 5CGPA 4J0RA 2E7NA 4PY6A 5ENJA 5FH8A 4XUBA 4QSUA 4KV4A 5E74A 3Q2EA 5KHMA 2F6NA 5CUCA 5EM3A 4YH3A 5DYAA 2YEMA 3UVYA 5ACYA 3HMFA 5DYUA 5HEMA 2D82A 5AD3A 4OUFA 5L99A 4PKLA 1WUGA 2I7KA 5F1LA 4Z6HA 4Q0NA 5D3PA 5HJCA 4NYVA 5II2A 5KTXA 5C7NA 5A5SA 4HBYA 4ALGA 4QB3A 5I88A 5A5NA 5AMEA 1X0JA 4NUDA 5TCMA 4C66A 5CQ6A 5KU3A 4O71A 4O76A 5II1A 4NYWA 5F62A 4YYKA 1JM4B 5E9IA 4A9HA 3UV5A 4QSQA 4O7EA 5L97A 5D0CA 5F36A 5D3SA 4UIWA 5L96A 5IBNA 5AD2A 5I7XA 5C89A 4HXMA 3O33A 4CL9A 4QEWA 1F68A 4CFLA 5LKUA 5FB0A 4IOOA 5D7XA 4QR4A 4XY8A 5H1TA 3P1FA 5CZGA 5F5ZA 5DW1A 5HFQA 4HXPA 5D25A 5EA1A 4LZ2A 2KTBB 3QZVA 5C4QA 5E9VA 5DFDA 4BW1A 4C67A 5D3RA 4QSRA 4YH4A 5KO4A 5E9LA 5F63A 5FE5A 5DBMA 4LZRA 3IU5A 2NXBA 5CQ8A 5EV9A 4N3WA 4NR9A 4O78A 3LXJA 5F2PA 5H1UA 2RFJA 4A9JA 5E9MA 5HQ5A 5EGUA 5FH6A 2H60A 3HMHA 5HRVA 4YK0A 5HM0A 5KTWA 3AADA 5AMFA 4ZQLA 2YELA 4QC3A 4RVRA 4QEUA 4NR8A 5IIDA 4UIYA 4MR4A 5CUEA 5FFWA 4LDFA 5J0DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3D7CA 5L8UA 5CFWA 2LSPB 4QUTA 5D3LA 3ZYUA 3MB4A 3MQMA 5HLSA 4AKHA 4HXSA 5L98A 5E9KA 5DKCA 5CRMA 5BT5A 4CLBA 3P1DA 5I40A 3ERRA 4HXOA 1N72A 3D1BA 2I8NA 5FG6A 4HBVA 4YY4A 4PCIA 5F25A 5F61A 2OO1A 5EPRA 5FDZA 4A9FA 4UYEA 5A5PA 5EVAA 5EPBA 5DW2A 3U5PA 4J0SA 4YATA 5FE2A 3QZSA 5EU1A 4A9NA 4HXNA 5FE6A 3UV2A 5I1QA 5LVRA 4IOQA 4MEPA 5D3NA 4HXKA 3P5OA 3UV4A 3G0LA 4YYJA 5HQ6A 4O7BA 5FH7A 4N4IA 5FE3A 3ONIA 5JI8A 5LKTA 4J1PA 3U5MA 5CUGA 3U5LA 5A5QA 2L85A 3LJWA 2DKWA 5G4RA 3MXFA 4LZSA 5F1HA 3MUKA 5G4SA 4TYLA 3SVHA 2L84A 4O77A 5E7DA 3AQAA 5ETBA 5CRZA 2YW5A 5FB1A 5EWVA 5LUUA 3O36A 2RS9B 4BJXA 2WP1A 3NXBA 4UYGA 5HQ7A 5IGMA 5D3JA 5HRXA 4O72A 5FE9A 2L5EA 4MENA 4CUPA 5A83A 4TU6A 5C87A 4MEQA 4NRBA 4CUTA 5DY7A 4HXRA 4UIVA 4UITA 1E6IA 3UW9A 4QY4A 2MJVB 3Q2FA 3JVJA 4CUQA 5IG6A 4YYMA 4Y03A 4HBXA 4LYIA 3UVDA 4YYHA 3GG3A 5BT3A 5I7YA 5CU8A 5FFYA 5CUBA 5EK9A 3LQJA 3JVKA 4QSTA 4O74A 4O7CA 5EQ1A 2DVVA 5CY9A 4N4GA 4QYLA 4HXLA 4QC1A 4NUEA 4O7AA 3MB3A 4YC9A 4NR6A 4TS8A 4QUUA 4NXJA 4UYDA 5C8GA 5K29A 4CURA 4YYIA 4LYWA 5CS8A 1ZS5A 5FE7A 5D3HA 2R0SA 4ZC9A 5HRWA 5EISA 4TU4A 5ENHA 5FE4A 4PTBA 4OGJA 5I29A 4QSVA 5A81A 3UVXA 5BT4A 3P1EA 4IR6A 4MR5A 4YAXA 5ENCA 2DVSA 5EWWA 2RO1A 4YYGA 5CQ3A 3S92A 4A9EA 5ENFA 4Z93A 4GPJA 3O35A 4MR3A 5JWMA 4IR3A 2DVQA 4KV1A 4MEOA 4WIVA 5DKDA 5DLZA 4AKIA 4J3IA 5ENIA 4QEVA 4CUSA 4MR6A 3P1CA 5E73A 3U5JA 3DWYA 4YBMA 2GRCA 4TZ2A 3JVMA 5ENEA 4QZSA 4UIUA 4Q0OA 2WP2A 4CFKA 3SVFA 5D26A 5HCLA 4UYHA 5F3AA 5CPEA 5LJ2A 4WHWA 5D24A 4UIZA 4YY6A 5CQ7A 5CUAA 5IGNA 3U5OA 4NQMA 3VKGA 3RCWA 5H85A 4XUAA 5EICA 5EPSA 4TTEA 5CTLA 5DX4A 5LJ1A 4XYAA 4NR7A 4YBTA 2E7OA 5COIA 2R0YA 4UYFA 5DFCA 5HFRA 5A5OA 5LKZA 3HMEA 5FG4A 5D3TA 4TT4A 2DVRA 4FLPA 5FE8A 5EI4A 5HELA 3D1DA 4YABA 2F6JA 2G4AA 2OSSA 4QNSA 4IORA 4TQNA 4A9KA 5H1VA 4OGIA 3QZTA 3FKMX 3O37A 5C85A 4NUCA 5FG5A 5FBXA 5EWHA 4TZ8A 5DKHA 2N9GA 4QSSA 5E3GA 5EP7A 4Z6IA 5KTUA 4NS5A 3SVGA 4F3IA 5E3DA 1JSPB 4YYNA 3IU6A 4NR5A 5HENA 4X2IA 2R10A 1WUMA 5E9YA 4CUUA 4YYDA 3G0JA 5I86A 5LKXA 4QBMA 4BW4A 2FSAA 5CUDA 4UYFB 4HBWA 4IR5A 5CP5A 5EWCA 4PCEA 5LVQA 4O70A 3TLPA 4LR6A 4PS5A 3U5KA 2RI7A 5CQ4A 4E96A 4WHUA 5DYCA 5ENGA 5DFBA 4AKNA 4A9IA 4Z1QA 4QYDA 4QR5A 2RNXA 2RNWA 4LC2A 5A5RA 4N4FA 4ALHA 5CQ5A 5I83A 3I3JA 4YBSA 2OUOA 2RNYA 2YYNA 5FE1A 3S91A 4DONA 3DAIA 4YADA 3JVLA 3LQHA 5E0RA 5A85A 4A9OA 5L8TA 4QSWA 4O7FA 2YQDA 4BW2A 4BHWA 4NRAA 4NQNA 4A9MA 5I89A 4O75A 4LRGA 4LYSA 5A82A 5IGLA 5ETDA 2YDWA 2E3KA 3K2JA 2DWWA 2DATA 5LJ0A 5F60A 5A7CA 4QSPA 3MULA 1PUOA 3U5NA 1ZKRA 5DLXA 4NRCA 5FE0A 4IR4A 5IGKA 2R0VA 5TB6A 4ZW1A 3LQIA 4KCXA 4QSXA 2EJNA 4QR3A 5ENBA 5DYXA 5I80A 5CQAA 3UVWA 4Z1SA 5CQTA 4XY9A 2YEKA 4A9LA 5EWDA 4UIXA 4NR4A 1EQFA 4N4HA 5FFVA 4NYXA 3O34A 4BW3A 2D9EA 4TT2A 4TT6A 5CGPA 4J0RA 2E7NA 4PY6A 5ENJA 5FH8A 4XUBA 4QSUA 4KV4A 5E74A 3Q2EA 5KHMA 2F6NA 5CUCA 5EM3A 4YH3A 5DYAA 2YEMA 3UVYA 5ACYA 3HMFA 5DYUA 5HEMA 2D82A 5AD3A 4OUFA 5L99A 4PKLA 1WUGA 2I7KA 5F1LA 4Z6HA 4Q0NA 5D3PA 5HJCA 4NYVA 5II2A 5KTXA 5C7NA 5A5SA 4HBYA 4ALGA 4QB3A 5I88A 5A5NA 5AMEA 1X0JA 4NUDA 5TCMA 4C66A 5CQ6A 5KU3A 4AKGA 4O71A 4O76A 5II1A 4NYWA 3VKHA 5F62A 4YYKA 1JM4B 5E9IA 4A9HA 3UV5A 4QSQA 4O7EA 5L97A 5D0CA 5F36A 5D3SA 4UIWA 5L96A 5IBNA 5AD2A 5I7XA 5C89A 4HXMA 3O33A 4CL9A 4QEWA 1F68A 4CFLA 5LKUA 5FB0A 4IOOA 5D7XA 4QR4A 4XY8A 5H1TA 3P1FA 5CZGA 5F5ZA 5DW1A 5HFQA 4HXPA 5D25A 4AI6A 5EA1A 4LZ2A 2KTBB 3QZVA 5C4QA 5E9VA 5DFDA 4BW1A 4C67A 5D3RA 4QSRA 4YH4A 5KO4A 5E9LA 5F63A 5FE5A 5DBMA 4LZRA 3IU5A 2NXBA 5CQ8A 5EV9A 4N3WA 4NR9A 4O78A 3LXJA 5F2PA 5H1UA 2RFJA 4A9JA 5E9MA 5HQ5A 5EGUA 5FH6A 2H60A 3HMHA 5HRVA 4YK0A 5HM0A 5KTWA 3AADA 5AMFA 4ZQLA 2YELA 4QC3A 4RVRA 4QEUA 4NR8A 5IIDA 4UIYA 4MR4A 5CUEA 5FFWA 4LDFA 5J0DA
chains in the Genus database with same CATH topology
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